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Concepto de protenas
La palabra protena viene del griego protos que significa
"lo ms antiguo, lo primero.
Las
protenas
son
biopolmeros
(macromolculas
orgnicas) de elevado peso molecular; compuestos
qumicos muy complejos que se encuentran en todas las
clulas vivas.
Hay ciertos elementos qumicos que todas ellas poseen,
pero los diversos tipos de protenas los contienen en
diferentes cantidades.
Estn constituidas bsicamente por carbono (C),
hidrgeno (H), oxgeno (O) y nitrgeno (N); aunque
pueden contener tambin azufre (S) y fsforo (P) y, en
menor proporcin, hierro (Fe), cobre (Cu), magnesio (Mg),
yodo (Y).
2
O H
CC=
N N
O H
H H
=
H
R
+ H2O
O
H
CONDENSACIN
Enlace peptdico
1. En un enlace peptdico, los tomos del grupo carboxilo y del
grupo amino se sitan en un mismo plano, con distancias y
ngulos fijos.
2. Los grupos de aminocidos unidos por este enlace se
denominan residuos para resaltar la prdida de una molcula
de agua en cada enlace.
3. El amino libre de un extremo y el carboxilo libre del otro
extremo de la cadena reciben el nombre de N-terminal y Cterminal respectivamente. Por convenio, los aminocidos se
numeran desde el N-terminal.
Enlace peptdico
4. El enlace peptdico tiene un comportamiento similar al de un
enlace doble, es decir, presenta una cierta rigidez que
inmoviliza en un plano los tomos que lo forman.
5. Adems es un enlace ms corto que otros enlaces C-N. Esto le
impide girar libremente, los nicos enlaces que pueden girar
son los C-C y los C-N que no corresponden al enlace
peptdico.
Tyr
Ser
Gly
Leu
Ala
PM entre
5.000 y 700.000
pueden
La secuencia de
aminocidos de una
protena estn
determinadas
genticamente
estructura espacial
funcin
mutaciones
alteraciones genticas
dipolo elctrico
posicin trans
Estructura de una
Protena?
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ESTRUCTURA
ESTRUCTURA
ESTRUCTURA
ESTRUCTURA
PRIMARIA
SECUNDARIA
TERCIARIA
CUATERNARIA
14
La conformacin
se puede
describir en trminos de niveles
estructurales
Ordenamiento tridimensional
Estructura primaria
La estructura primaria es la secuencia de aminocidos de la
protena.
Nos indica qu aminocidos componen la cadena polipeptdica y
el orden en que dichos aminocidos se encuentran.
La secuencia de una protena se escribe enumerando los
aminocidos desde el extremo N-terminal hasta el C-terminal.
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Estructura primaria
17
Estructura primaria
Serina
Leucina
Glicina
Tirosina
Alanina
18
Estructura primaria
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Estructura secundaria
La estructura secundaria es la disposicin de la secuencia de
aminocidos o estructura primaria en el espacio.
Los aminocidos, a medida que van siendo enlazados durante
la sntesis de las protenas, y gracias a la capacidad de giro de
sus enlaces, adquieren una disposicin espacial estable, la
estructura secundaria.
Son conocidos tres tipos de estructura secundaria: la -hlice,
la hlice de colgeno y la conformacin o lmina plegada .
La estructura secundaria de la cadena polipeptdica depende de
los aminocidos que la forman.
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Estructura
secundaria
Las interacciones no covalentes entre los restos laterales de los aminocidos dan origen a la
estructura secundaria.
Esta conformacin viene dada por puentes de hidrgeno intercatenarios.
La estructura secundaria puede ser:
Conformacin (Hlice)
Conformacin (Hoja plegada)
Si bien las conformaciones anteriores son las ms usuales, existen otras menos frecuentes.
Existen sectores de los polipptidos cuya estructura no est bien definida: los
enroscamientos aleatorios o ad-random.
Conformacin
Conformacin
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-hlice
22
-hlice
23
Hlice de colgeno
El
colgeno
posee
una
disposicin en hlice especial,
mas alargada que la -hlice,
debido a la abundancia de
prolina e hidroxiprolina.
Estos
aa
poseen
una
estructura que dificulta la
formacin de enlaces de
hidrgeno, por lo que se forma
una hlice ms extendida, con
slo tres aminocidos por
vuelta.
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Hlice de colgeno
Hay
algunas
alteraciones
del
colgeno que provocan
sndromes como el de
el hombre de goma o el
sndrome de Marfn
que padeca Paganini y
que
explicaba
sus
dedos
largos
e
hiperextensibles
25
Hlice de colgeno
26
Conformacin-
Conformacin-
28
Conformacin-
ANTIPARALELA
PARALELA
29
Conformacin-
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Conformacin-
Caractersticas de la Hoja plegada (beta-lamina):
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Giros
Secuencias de la cadena polipeptdica con
estructura o a menudo estn
conectadas entre s por medio de los
llamados giros . Son secuencias
cortas,
con
una
conformacin
caracterstica que impone un brusco giro
de 180o a la cadena principal de un
polipptido.
AA como Asn, Gly y Pro (que se acomodan
mal en estructuras de tipo o ) aparecen
con frecuencia en este tipo de estructura.
La conformacin de los giros b est
estabilizada generalmente por medio de un
puente de hidrgeno entre los residuos 1 y
4 del giro
Sirven para que la protena adopte
estructuras ms compactas
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Estructura terciaria
La conformacin terciaria de una
protena globular es la conformacin
tridimensional del polipptido plegado.
Las interacciones que intervienen en el
plegamiento de la estructura secundaria
son:
Interacciones hidrofbicas entre
restos laterales no polares.
Uniones de Van der Waals.
Puentes de Hidrgeno.
Interacciones salinas.
Puentes Disulfuro.
Las funciones de las protenas dependen
del plegamiento particular que adopten.
Esta estructura est altamente
influenciada por la estructura primaria.
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Estructura terciaria
Hlice
34
Residuos
hidrofbicos
Residuos
polares
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CH2
Aceptores
HN
CH2
S,T
HO CH
R
C,M
H
CH2
E,G,N,Q
C
R
N CH2
H
H
Donadores
N
H
NH
NH2+
H
N C
H
N,Q
K
R
CH2
NH3
CH2 NH NH2
C
NH2
CH2
NH
HN
D,E
OOC CH2
S
S
H N
D,E
O C
N H
R
C O
H N
R
H N
C O
N H
O
O C
R
H N
C O
Interacciones que
intervienen en el
plegamiento de la
estructura terciaria
40
41
42
Estructura cuaternaria
1. La estructura cuaternaria es la unin
mediante enlaces dbiles (no covalentes) de
varias cadenas polipeptdicas con estructura
terciana, idnticas o no, para formar un
complejo proteico.
2. Cada una de estas cadenas polipeptdicas
recibe el nombre de protmero (subunidad
o monmero)
3. Segn el nmero de protmeros que se
asocian. las protenas que tienen estructura
cuaternaria se denominan:
Dmeros, como la hexoquinasa.
tetrmero como la hemoglobina.
Pentmeros, como la ARN-polimerasa.
Polmeros, cuando en su composicin
intervienen gran nmero de protmeros.
(cpsida del virus de la poliomielitis, que
consta de 60 subunidades proteicas, los
filamentos de actina y miosina de las
clulas musculares, etc).
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Estructura cuaternaria
Interacciones hidrofbicas.
Puentes de hidrgeno.
Interacciones salinas.
Fuerza de Van der Waals.
En algunas ocasiones puede haber
enlaces fuertes tipo puentes
disulfuro, en el caso de las
inmunoglobulinas.
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Heterotpicas:
diferentes.
Las
subunidades
poseen
estructuras
muy
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Primaria
Cuaternaria
Secundaria
Terciaria
Combinaci
n ilimitada
de
aminocido
s.
Hlice
Globular
Subunidades iguales
Hoja Plegada
Fibrosa
Subunidades distintas
Unin
Peptdica
Puente de
Hidrgeno
Puente de Hidrgeno,
Interacciones hidrofbicas,
salinas, electrostticas.
Secuencia
Conformacin
Fuerzas diversas no
covalentes.
Asociacin
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48
Propiedades
de las
protenas
Solubilidad
Desnaturalizac
in y
renaturalizaci
n
Especificidad
De funcin
Capacidad
amortiguadora
De especie
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Solubilidad
Las protenas globulares poseen un elevado tamao
molecular, por lo que al disolverse, dan lugar a disoluciones
coloidales.
La solubilidad de estas molculas se debe a los radicales R
que, al ionizarse, establecen puentes de hidrgeno con las
molculas de agua. As, la protena queda recubierta de una
capa de molculas de agua que impide que se pueda unir a
otras protenas, lo que provocara su precipitacin.
La solubilidad depende del pH,
temperatura,
concentracin
inica... A pesar de ser
solubles, la mayora de las
membranas
biolgicas
son
impermeables al paso de
protenas.
Capa de molculas de agua
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Desnaturalizacin y
renaturalizacin
Consiste en la prdida de todas las estructuras de orden
superior (secundaria, terciaria y cuaternaria) quedando la
protena reducida a un polmero con estructura primaria.
Consecuencias inmediatas son:
- Disminucin drstica de la solubilidad de la
protena, acompaada frecuentemente de
precipitacin
- Prdida de todas sus funciones biolgicas
- Alteracin de sus propiedades hidrodinmicas
Agentes desnaturalizantes
I. Fsicos
1. Calor. La mayor parte de las protenas experimentan
desnaturalizaciones cuando se calientan entre 50 y 60 C;
otras se desnaturalizan tambin cuando se enfran por debajo
de los 10 a 15 C.
2. Radiaciones
II. Qumicos: todos los agentes que rompen interacciones
o enlaces presentes en la estructura nativa de la protena:
1.
2.
3.
4.
Detergentes
Urea y guanidina a altas concentraciones
Altas concentraciones de sal y extremos de pH
Reactivos de grupos -SH
Agentes desnaturalizantes
HOCH2 CH2 SH
2-mercaptoetanol
CH2 SH
HOCH
HCOH
CH2 SH
Ditiotreitol (DTT)
NH2
C O
Urea
NH2
NH2
C NH Guanidina
NH2
O
O S OO
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Especificidad
La especificidad es doble:
de especie
de funcin.
Especificidad de especie:
En su secuencia de aminocidos, las protenas presentan dos tipos
de sectores:
Sectores estables
Sectores variables: Algunos aminocidos pueden ser
sustituidos por otros distintos sin que se altere la
funcionalidad de la molcula.
Ello ha dado lugar, durante la evolucin, a una gran variabilidad de
protenas, lo que permite que cada especie tenga sus protenas
especficas y que, incluso, aparezcan diferencias entre individuos
de la misma especie (rechazo en trasplantes de tejidos).
Las diferencias entre protenas homologas, es decir, con la misma
funcin, son grandes entre especies alejadas evolutivamente y
escasas entre especies emparentadas.
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Especificidad de funcin.
La especificidad tambin se refiere a la funcin.
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Capacidad amortiguadora
Las protenas, al estar constituidas por aminocidos, tienen
un comportamiento anftero. Tienden a neutralizar las
variaciones de pH del medio, ya que pueden comportarse
como un cido o una base y, por tanto, liberar o retirar
protones (H+) del medio
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CLASIFICACIN DE PROTENAS
Se clasifican en:
Holoprotenas: Formadas solamente por aminocidos.
Heteroprotenas:
Formadas
por
una
fraccin
protenica y por un grupo no protenico, que se
denomina "grupo prosttico. Se clasifican segn la
naturaleza del grupo prosttico.
Protenas filamentosas
Holoprotenas
Protenas globulares
Cromoprotenas
Glucoprotenas
PROTENAS
Heteroprotenas
Lipoprotenas
Nucleoprotenas
Fosfoprotenas
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HOLOPROTENAS
HOLOPROTENAS
Fibrosas:
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HETEROPROTENAS
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1. Estructural
2. Enzimtica
3. Hormonal
4. Defensiva
5. Transporte
6. Reserva
7. Funcin
homeosttica
8. Anticongelante
9. Actividad
contrctil
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Estructural
Es una de las funciones ms caractersticas:
1. Algunas glucoprotenas forman parte de las membranas
celulares. Intervienen en el transporte selectivo de iones
(bomba de Na-K)
2. Otras protenas forman el citoesqueleto de las clulas, las
fibras del huso, de los cilios y flagelos.
3. Otras, como las histonas forman parte de los cromosomas
eucariotas.
4. El colgeno, que mantiene unidos los tejidos animales y
forma los tendones y la matriz de los huesos y cartlagos.
5. La elastina, en el tejido conjuntivo elstico (ligamentos
paredes de vasos sanguneos).
6. La queratina, que se sintetiza en la epidermis y forma parte
de pelos, uas, escamas de reptiles, plumas, etc.
7. La fibrona, que forma la seda y las telas de araas. Es una
disolucin viscosa que solidifica rpidamente al contacto
con el aire.
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Enzimtica
Es la funcin ms importante.
Hormonal
Insulina y glucagn
Hormona del crecimiento segregada por la
hipfisis
Calcitonina
Defensiva
Inmunoglobulina, trombina y fibringeno
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Transporte
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Reserva
En general, las protenas no se utilizan para la obtencin
de energa. No obstante, algunas como la ovoalbmina
de la clara de huevo, la casena de la leche o la
gliadina de la semilla de trigo, son utilizadas por el
embrin en desarrollo como nutrientes.
Funcin homeosttica
Las protenas intracelulares y del medio interno
intervienen en el mantenimiento del equilibrio
osmtico en coordinacin con los tampones.
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Funcin contrctil
El movimiento y la locomocin en los organismos unicelulares y
pluricelulares dependen de las protenas contrctiles:
la dinena, en cilios y flagelos,
la actina y miosina, responsables de la contraccin muscular.
Anticongelante
Presentes en el citoplasma de ciertos peces antrticos.
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