LAS ENZIMAS COMO CATALIZADORES MOLECULARES

M s C . N at h a l y L p e z B u s t a m a n t e

CATABOLISMO

ANABOLISMO

Funcin de las Protenas

LAS ENZIMAS

ENZIMAS
Los enzimas son catalizadores muy potentes y eficaces, qumicamente son protenas.

Que es un catalizador?
Un catalizador es una sustancia que acelera una reaccin qumica, hasta hacerla instantnea o casi instantnea. Un catalizador acelera la reaccin al disminuir la energa de activacin.

ENZIMAS
SON PROTEINAS:
EFICIENTES ESPECIFICAS REGULABLES

PROTEINAS EFICIENTES

como catalizadores biolgicos al igual que los

qumicos aceleran reacciones y no se alteran durante la misma, por lo que pueden intervenir muchas veces catalizando la misma reaccin.
una enzima es capaz de catalizar la conversin

de alrededor de mil molculas de sustrato en producto, por segundo.

 Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular.

Especficas para un substrato particular (Estereo especificidad). Catalizadores biolgicos. Protenas de forma globular.

Aceleran reacciones especficas qumicas(103 - 1020).

Actan en disolucin acuosa, a pH y temperatura ptimos.

PROTEINAS ESPECIFICAS
el interior de la clula es denso y aunque los

sustratos y las enzimas estn en nmero pequeo, se pueden encontrar y dar lugar al complejo enzima sustrato porque estn en continuo movimiento. esta es la base de la especificidad.
algunas

enzimas presentan absoluta, otras relativa.

especificidad

PROTEINAS REGULABLES
EN EL METABOLISMO EL PRODUCTO DE LA ACCIN DE

UNA ENZIMA ES EL SUSTRATO DE LA SIGUIENTE Y AUNQUE LAS REACCIONES TIENDEN AL EQUILIBRIO, NO LLEGAN NUNCA A L PORQUE LOS SUSTRATOS Y PRODUCTOS ESTN EN CONTINUA TRANSFORMACIN.
El conjunto de reacciones que forman una va metablica,

est CONTROLADO por enzimas cuya estructura es sensible a las variaciones de concentracin de sustratos, productos, compuestos intermedios o de productos finales de las cadenas metablicas. LAS ENZIMAS SON POR LO TANTO REGULABLES.

CARACTERSTICAS DE LA ACCIN ENZIMTICA La caracterstica ms sobresaliente de las enzimas es su elevada especificidad. Esta es doble y explica que no se formen subproductos: Especificidad de sustrato. El sustrato (S) es la molcula sobre la que la enzima ejerce su accin cataltica.

Especificidad de accin. Cada reaccin est catalizada por una enzima especfico.

"el sustrato se adapta al centro activo de una enzima como una llave a una cerradura".

Clasificacin de Enzimas:
1. Oxidorreductasas 2. Transferasas 3. Hidrolasas

4. Liasas
5. Isomerasas

6. Ligasas

Enzimas:
No.

Clase

Tipo de reaccin que catalizan

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas

Oxidorreductasas De xido reduccin (transferencia de e-)

Reduccin: ganancia de electrones (hidrgeno o prdida de oxgeno)

Oxidacin: prdida de electrones (hidrgeno o ganancia de oxgeno). La Oxidacin y la Reduccin son reacciones acopladas (REDOX)

1. Oxido-reductasas ( Reacciones de oxido-reduccin).

Si una molcula se reduce, tiene que haber otra que se oxide

Enzimas:

No.

Clase

Tipo de reaccin que catalizan

De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas

Oxidorreductasas

Transferasas

Transferencia de grupos

Kinasas Transaminasas

2. Transferasas

(Transferencia de grupos funcionales)

grupos aldehdos gupos acilos grupos glucosilos grupos fosfatos (kinasas)

Succinato Deshidrogenasa Citocromo c oxidasa.

Enzimas:

No.

Clase

Tipo de reaccin que catalizan

De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas

Oxidorreductasas

Transferasas

Transferencia de grupos

Hidrolasas

Hidrlisis, con transferencia Pirofosfatasa de grupos funcionales del Tripsina agua Aldolasa

3. Hidrolasas (Reacciones de hidrlisis)

Transforman polmeros en monmeros. Actan sobre: enlace ster enlace glucosdico enlace peptdico enlace C-N

Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin que catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa

Oxidorreductasas

Transferasas

Transferencia de grupos Hidrlisis, con transferencia de grupos funcionales del agua

Hidrolasas

Liasas

Lisis de un substrato, generando (Sintasas) un doble enlace, o Descarboxilasa Adicin de un substrato a un doble enlace de un 2do. substrato pirvica

4. Liasas (Adicin a los dobles enlaces)

Entre C y C
Entre C y O Entre C y N

Enzimas:
No. Clase Tipo de reaccin que catalizan
De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa (Sintasas) Descarboxilasa pirvica

Oxidorreductasas

Transferasas

Transferencia de grupos Hidrlisis, con transferencia de grupos funcionales del agua Lisis de un substrato, generando un doble enlace, o Adicin de un substrato a un doble enlace de un 2o. substrato (Sintasa)

Hidrolasas

Liasas

Isomerasas

Transferencia de grupos en el interior de las molculas para dar formas ismeras

Mutasas Epimerasas Racemasas

5. Isomerasas (Reacciones de isomerizacin)

Enzimas:
No
1

Clase
Oxidorreductasas

Tipo de reaccin que catalizan

De xido reduccin (transferencia de e-)

Ejemplo
Deshidrogenasas Peroxidasa Oxidasas Oxigenasas Reductasas Kinasas Transaminasas Pirofosfatasa Tripsina Aldolasa (Sintasas) Descarboxilasa pirvica Mutasas Epimerasas Racemasas

2 3

Transferasas Hidrolasas

Transferencia de grupos Hidrlisis, con transferencia de grupos funcionales del agua Lisis de un substrato, generando un doble enlace, o Adicin de un substrato a un doble enlace de un 2do. substrato Transferencia de grupos en el interior de las molculas para dar formas ismeras

Liasas

Isomerasas

Ligasas

Formacin de enlaces C-C, C-S, C-O y C-N mediante reacciones Sintetasas de condensacin, acopladas a la ruptura del ATP

6. Ligasas (Formacin de enlaces, con aporte de ATP)

Entre C y O Entre C y S Entre C y N Entre C y C

EC
Accepted name:
Reaction: Other name(s):

1.1.1.2 alcohol dehydrogenase (NADP ) an alcohol + NADP = an aldehyde + NADPH + H

+ + +

aldehyde reductase (NADPH2); NADP-alcohol dehydrogenase; + + NADP -aldehyde reductase; NADP -dependent aldehyde reductase; NADPH-aldehyde reductase; NADPH-dependent aldehyde reductase; nonspecific succinic semialdehyde reductase; ALR 1; low-Km aldehyde reductase; high-Km aldehyde reductase; alcohol + dehydrogenase (NADP )

Systematic name: alcohol:NADP oxidoreductase

Comments: A zinc protein. Some members of this group oxidize only primary alcohols; others act also on secondary alcohols. May be identical with EC 1.1.1.19 (L-glucuronate reductase), EC 1.1.1.33 [mevaldate reductase (NADPH)] and EC 1.1.1.55 [lactaldehyde reductase (NADPH)]. A-specific with respect to NADPH. Links to other BRENDA, ERGO, EXPASY, IUBMB, KEGG, PDB, CAS databases: registry number: 9028-12-0

En una reaccin catalizada por enzima (E), los reactivos se denomina sustratos (S) , es decir la sustancia sobre la que acta la enzima. El sustrato es modificado qumicamente y se convierte en uno o ms productos (P). Como esta reaccin es reversible se expresa de la siguiente manera:

La enzima se encuentra en la misma forma qumica al comienzo y al final de la reaccin.

Las molculas del sustrato se unen a un sitio particular en la superficie de la enzima, denominado centro activo, donde tiene lugar la catlisis. La estructura tridimensional de este centro activo, donde solo puede entrar un determinado sustrato es lo que determina la especificidad de las enzimas.

Algunas enzimas actan con la ayuda de estructuras no proteicas. En funcin denominan: de su naturaleza se

Cofactor. Cuando se trata de iones o molculas inorgnicas. Coenzima. Cuando es una molcula orgnica. Se puede sealar, que muchas vitaminas funcionan como coenzimas.

COFACTORES (MOLCULAS INORGNICAS)

PAPEL EN LA REACCIN CATALIZADA

Hierro:

Fe2+ o Fe3+

Oxidacin / reduccin

Cobre:

Cu+ o Cu2+

Oxidacin / reduccin

Zinc:

Zn2+

Ayuda a unir el NAD

Coenzimas (molculas orgnicas)

VITAMINAS C (acido ascsrbico) B1 (tiamina) B3 (acido pantotinico) B5 (niacina) B6 ( piridoxina) B12 (cobalamina) FUNCIONES Coenzima de algunas peptidasas. Interviene en la sntesis de colgeno Coenzima de las descarboxilasas y de las enzima que transfieren grupos aldehdos Constituyente de la CoA (coenzima A) Constituyente de las coenzimas NAD y NADP Interviene en las reacciones de transferencia de grupos aminos. Coenzima en la transferencia de grupos metilo.

Las altas temperaturas, por lo general desnaturalizan las enzimas: destruyen las uniones de sus estructuras terciarias o cuaternarias, en forma irreversible. Las bajas temperaturas las inactivan.

Enzima Pepsina

pH ptimo 1.5

Tripsina
Catalasa

7.7
7.6

Arginasa
Fumarasa

9.7
7.8

Ribonucleasa

7.8

Enzima

Temperatura ptima (oC)

Mamferos

37
aprox.
aprox.

Bacterias y algas
Bacterias rticas

100
0

Bacterias en muestra de hielo antigua

Enzima:
1800s

fermento
fermentacin del azcar por levaduras

Vitalistas Mecanicistas 1926, James B. Summer 1930s Ureasa

Pepsina Tripsina Quimotripsina Carboxipeptidasa Enzima Amarillo viejo (flavoprotena NADPH)

Estructura globular

Hervir con HCl

Tripsina Temperatura elevada pH extremo Funcionalidad Inactiva

Apoenzima

Holoenzima

Enzimas que requieren elementos inorgnicos

Citocromo oxidasa Catalasa, peroxidasa Fe2+, Fe+,

Citocromo oxidasa
DNA polimerasa Anhdrasa carbnica Alcohol deshidrogensa Hexoquinasa Glucosa 6-fosfatasa Arginasa Piruvato quinasa Ureasa Nitrato reductasa

Cu2+
Zn2+ Mg2+ Mn2+ K+, Mg2+ Ni2+ Mo2+

Coenzimas: Actan como transportadores eventuales de tomos especficos o de grupos funcionales Coenzimas Pirofosfato de tiamina.
Dinucletido de flavina y adenina.
Dinucletido de nicotinamida y de adenina

Entidad transferida Aldehdos tomos de hidrgeno Ion hidruro (H-)

Coenzima A.
Fosfato de Piridoxal.
5-Desoxicobalamina (Coenzima B12)

Grupos acilo
Grupos amino tomos de H y grupos alquilo CO2 Otros grupos monocarbonados

Biocitina. Tetrahidrofolato.

Coenzimas

Adenosine Triphosphate (ATP) Coenzyme A (CoA)

Nicotinamide Adenine Dinucleotide (NAD+)

Nicotinamide Adenine Dinucleotide Phosphate (NADP+)

Flavin Adenine Dinucleotide (FAD)

Cmo detectar una enzima?

1. 2.

Actuacin global de la reaccin catalizada. Utilizar un procedimiento analtico para la determinacin de S que desaparece o los productos de la reaccin que aparecen. Si la enzima requiere cofactores (ines metlicos o coenzimas). La dependencia de la actividad enzimtica con la [S] o sea KM del S. El pH ptimo. Un intervalo de temperatura en la que la enzima es estable y muestra actividad elevada.

3.

4.

5. 6.

1.0 Unidad de Actividad Enzimtica

Es la cantidad que transforma 1,0 mM (10-6 M) de sustrato/minuto a 25oC, en las condiciones de medida ptima.
La Actividad Especfica

Es el No. de Unidades de enzima / mg de protena. Es una medida de la pureza de la enzima.

Catalasa de Aspergillius niger 4000-8000 U/mg de protena 100 mg $ 209,80 USD. Catalasa de hgado de bisonte 2000-5000 U/mg de prot. 1 g $ 768,50 USD.

El Nmero de Recambio de una Enzima

Es el No. de molculas de sustrato transformadas / unidad de tiempo, por una molcula de enzima. (o por un slo sitio cataltico, cuando la E, es el limitante).

Enzima.
Anhidrasa carbnica -Amilasa -Galactosidasa Fosfoglucomutasa

Moles de S, transf./ min. a 20-38 oC. 36 000 000 1 000 000 12 000 1 240