Instructivo para el procesamiento de micrografías SEM usando ImageJ
1. Por seguridad realizar una copia de seguridad de las imágenes.
2. Abrir la pestaña "File" y luego "Open...". 3. Seleccionar micrografía. 4. Con la herramienta "Straight" trazar una línea a lo largo de la barra de escala (usar la tecla Shift para ayudarse a que sea totalmente recta). 5. Ir a la pestaña "Analyze" luego "Set scale". 6. Dejar el casillero "Distance in pixels" tal y como está porque ya automáticamente se rellenó. 7. En "Known distance" colocar 50. 8. En "Unit of length" colocar um y dar OK. Ahora la imagen tendrá escalas reales de distancia. 9. Ahora con la herramienta "Rectangle" encerrar el área de trabajo que vamos a analizar, la mayor parte de la dentina que nos interesa. 10. Ir a la pestaña "Image" y luego hacer click en "Crop". La imagen se recortará sólo en el área de interés. 11. Ahora ir a la pestaña "Image" y luego en "Type" seleccionar "8 bits". 12. Nuevamente volvemos a "Image" y ahora en "Adjust" escogemos "Threshold..." 13. Seleccionamos la zona oscura de la curva de grises (de izquierda a derecha) hasta llenar de rojo sólo las zonas negras de túbulos. 14. Hacer click en "Apply". 15. Ir a la pestaña "Analyze" y luego a "Analyze Particles..." dar directamente a OK. 16. Aparecerá una ventana "Summary" con los resultados. De esta ventana tomar los valores "Average Size" y "%Area" en una tabla Excel. 17. Cerrar todo sin guardar cambios y comenzar con la siguiente micrografía.