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www.sciencemag.org/cgi/content/full/340/6136/1086/DC1
Materiales y métodos
higos. S1 a S4
Tablas S1 y S3 a S6
Leyenda de las referencias
de la tabla S2 (27–61)
Tabla S2
Materiales y métodos
Sistema estudiado y sitios de muestreo:
El tamaño de la semilla deEuterpe edulis(Arecaceae) se estudió en 22 poblaciones: siete bosques defaunados y 15 no
defaunados de dos tipos de bosques, semicaducifolios y pluviselva (tabla S1). Vea a continuación una definición del estado de
defaunación para cada área. Hemos elegido estas áreas (i) para cubrir grandes precipitaciones y variaciones de elevación, (ii)
para muestrear diferentes tipos de bosques (semicaducifolios y ombrófilos, aquí selva tropical), (iii) para muestrear áreas en
las que la comunidad de aves es bien conocida y (iv) para asegurar que los sitios tuvieran suficientes semillas para medir. Los
bosques semicaducifolios tienen marcada estacionalidad pluviométrica y están ubicados en el bosque atlántico de altura,
mientras que los sitios de selva tropical no tienen estacionalidad pluviométrica y se ubican a lo largo de las zonas costeras (27
). Históricamente, todos los sitios compartieron un conjunto similar de dispersores de semillas (28), pero la fragmentación del
bosque (particularmente en los bosques semicaducifolios) y la caza (tanto en los bosques semicaducifolios como en las selvas
tropicales) han empobrecido el ensamble de grandes frugívoros en muchos sitios (29, 30).
Para cada especie que se alimenta deE. edulisfrutas, definimos una “puntuación frugívora”, con el
objetivo de caracterizar su dependencia de las frutas. Los valores fueron 1 (esporádico), 2 (moderado) y 3
(frugivoría extensa), basados en relatos publicados y en nuestros propios datos sobre la frecuencia de
aparición de frutas en la dieta y la contribución proporcional relativa de las frutas a la dieta ( tabla S2).
1
la abundancia de grandes aves frugívoras que en áreas defaunadas, y la abundancia de tucanes es casi
cinco veces mayor (tabla S3).
Según nuestra definición, un área está "desfaunada" cuando las aves frugívoras de boca grande (es decir, con
un tamaño medio de boca >12 mm), como los tucanes (Ramphastos dicolorusyR. vitelinus), tucanes (Pteroglossus
aracari,P. bailloni, ySelenidera maculirostris) y grandes cotingas (Procnias nudicollis, Carpornisspp., yPyroderus
scutatus), están localmente extintos o presentes con abundancias muy bajas (funcionalmente extintos). La evidencia
de extinción local proviene de la falla en la detección de dispersores de semillas de gran tamaño durante
observaciones focales extensas en frutos de palma, cuando el área es demasiado pequeña para albergar frugívoros de
cuerpo grande.29), o la falta de detección de estas aves en los censos de aves realizados por nosotros o en la
información proporcionada por ornitólogos de campo que han trabajado extensamente en estos sitios (tablas S1, S2).
Zorzales (turdusspp.) y pavas (penélopespp.) son los principales dispersores de semillas que pueden prosperar en
algunos bosques defaunados. Los zorzales pueden dispersarseE. edulissemillas por regurgitación, pero sólo semillas <
12 mm. Las pavas defecan semillas significativamente más pequeñas (ancho promedio de 11,43 mm) que las semillas
regurgitadas por los tucanes y cotingas (11,94 mm) (F1,240= 23,3,PAG< 0,0001) aunque son capaces de dispersar semillas
de hasta 13,88 mm. Además, las pavas entregan grupos de semillas junto con materia orgánica en descomposición
(principalmente pulpa de fruta) (Fig. S2D) y este patrón de deposición tiene dos efectos perjudiciales en el
establecimiento de plántulas. En primer lugar, la presencia de pulpa inhibeE. edulis germinación(dieciséis).En segundo
lugar, la acumulación de semillas puede aumentar la mortalidad dependiente de la densidad debido a un mayor
aumento en la incidencia de patógenos y la competencia entre las plántulas establecidas, un efecto evidenciado
experimentalmente en estudios previos.(25). Además, la frugivoría de las pavas es muy baja en los sitios defaunados y,
de hecho, no se registraron visitas durante las observaciones focales en las áreas defaunadas (tabla S4). Esto indica que
su contribución a la remoción de semillas en sitios defaunados es muy limitada. El tucán toco (Ramphastos toco)
pueden visitar ocasionalmente algunas áreas defaunadas, pero son colonizadores recientes de áreas abiertas (33) y no
se alimentan en los bosques de dosel cerrado paraE. edulisfrutas
El análisis de clasificación de la avifauna basado en la disimilitud en la composición entre las 22 áreas estudiadas
(Fig. S1) mostró una asignación consistente del estado del área con dos excepciones: el área #3 (Jurupará, SP) y el área
#7 (Caraguatatuba, SP). ) (tabla S1). Estas áreas fueron agrupadas con las áreas no defaunadas cuando en realidad
fueron asignadas como defaunadas. La razón por la que mantuvimos estas dos áreas como defaunadas es que su
avifauna está severamente empobrecida en relación con otros sitios de selva tropical.(34), tienen una baja abundancia
de tucanes (índice de abundancia de conteo puntual, IPA= 0.01 para Caraguatatuba; 0.26 para Jurupará) y muy baja
riqueza de especies de frugívoros grandes con puntaje de frugivoría= 3. En comparación con las otras áreas
defaunadas, que son todas semidúcidas, la avifauna de Caraguatatuba y Jurupará parece estar mejor conservada, sin
embargo, estas dos áreas muestran claros signos de defaunación en comparación con otros sitios de selva tropical
(tablas S2, S3, Fig. S1), lo que sugiere una situación de extinción funcional de los grandes frugívoros. Se sabe que estas
dos áreas tienen un alto impacto de caza ilegal.(35). Por lo tanto, las palmas en áreas defaunadas tienen una dispersión
deficiente, con semillas de > 12 mm de diámetro que no logran dispersarse exitosamente debido a una combinación
de ausencia de grandes dispersores legítimos o su extinción funcional.
Medidas de la fruta :
Registramos el diámetro del eje más pequeño de la redondez.E. edulissemillas (norte= 9359 semillas; tabla S1).
Esta medida define si una semilla puede ser tragada por un ave dependiendo del tamaño de su boca (36) porque la
mayoría de los frugívoros aviares tienen un espacio limitado. El diámetro medio del fruto (± 1 DE) deE. edulisfrutos es
de 12,72 ± 1,40 mm (rango de 6,70 a 16,62 mm) y el diámetro medio de la semilla (± 1
2
SD) es de 11,17 ± 1,15 mm (rango de 6,25 a 14,61 mm). Estos dos rasgos de la fruta están significativamente correlacionados (
r= 0.8884,t= 139,6,d.f.=5201,PAG< 0,0001). Usamos el diámetro de la semilla como indicador del tamaño de la semilla.
Luego probamos la hipótesis de que la defaunación pone en peligro la dispersión exitosa de semillas grandes ajustando
un modelo aditivo generalizado con una variable de respuesta binaria (semillas dispersas/no dispersadas) y el diámetro de la
semilla (covariable) y el estado del sitio (desfaunada/no defaunada) como factores principales. . Usamos GLM con una
distribución de error gamma y una función de enlace de registro para determinar si las diferentes especies de aves
dispersaron semillas de diferentes tamaños. Todos los análisis estadísticos se realizaron en R (41).
Experimentos de germinación:
las semillas deE. edulisson altamente recalcitrantes y comienzan a perder viabilidad cuando el contenido de humedad
de sus semillas es menor al 39%, con la pérdida completa de viabilidad cuando el contenido de agua de las semillas es
menor al 21% (42). Este comportamiento recalcitrante da como resultado una rápida desecación cada vez que las semillas se
exponen a condiciones secas. Los ambientes húmedos también pueden reducir la viabilidad; las tasas de respiración
aceleradas causan deterioro fisiológico y los ataques de hongos son comunes. Tenemos datos adicionales sobreE. edulis
ensayos de germinación que confirman esta suposición.
Comparamos la viabilidad de la germinación entre semillas sin pulpa (frutos enteros) y semillas limpias (realizadas en
condiciones de cámara sobre sustrato de arena; 90 % de humedad del aire y 25 °C) para evaluar el efecto de eliminar la pulpa
de las semillas, que podría, por ejemplo, liberar semillas. de inhibidores de la germinación (43). Todas las semillas descarnadas
germinaron dentro de las ocho semanas posteriores a la siembra, mientras que las semillas que quedaron dentro de los frutos
no germinaron. En algunas especies, las semillas pueden permanecer latentes durante años, incluso cuando todavía están
rodeadas por la pulpa (44). Para asegurar que las semillas no fueran viables al final del
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experimento, analizamos todas las semillas no germinadas presentes en el sustrato para la integridad del embrión con
una prueba de cloruro de tetrazolio. Esta prueba indicó que los embriones estaban muertos.
Modelos ambientales:
Para probar si los factores ambientales y el estado de defaunación estaban asociados con el tamaño de la
semilla, realizamos análisis de modelos de efectos mixtos lineales utilizando el estimador de máxima verosimilitud con
elbbmlepaquete dentro del lenguaje R (41, 45). El conjunto de covariables explicativas incluía lo siguiente: clima
(estacionalidad de la precipitación, estacionalidad de la temperatura, precipitación media anual, temperatura media
anual y temperatura del trimestre más lluvioso), paisaje (porcentaje de cubierta forestal y tipo de bosque), elevación,
longitud y latitud, textura del suelo, fertilidad del suelo, complejidad del relieve y estado de defaunación. Los datos
climáticos fueron extraídos utilizando Worldclim 1.4, con 900 m de resolución espacial (46). El modelo de paisaje
incluyó la cantidad de bosque estimada a escala de subcuenca, que utilizó una cobertura forestal disponible con una
resolución espacial de 50 m (47). La textura del suelo, la fertilidad del suelo y la complejidad del relieve se obtuvieron
de la base de datos oficial del IBGE (http://mapas.ibge.gov.br /), y los datos se volvieron a muestrear a una resolución
espacial de 900 m para que coincidieran con la escala de los datos climáticos. Los datos de elevación se obtuvieron de
la base de datos de la misión topográfica del radar del transbordador (srtm, http://www-radar.jpl.nasa.gov/srtm/).
Para seleccionar el mejor modelo competitivo, utilizamos el enfoque basado en el criterio de información de
Akaike (AICc) para la comparación de múltiples hipótesis (48). El modelo con el AICc más bajo se considera el mejor
entre todos los modelos definidos, y los modelos con ΔAICc < 2 se consideraron igualmente plausibles para explicar los
patrones observados. Para garantizar que los modelos no fueran buenos por casualidad, se incluyó en la lista de
modelos en competencia un modelo neutral que considera la ausencia de efectos (49). Pesos para AIC (wAIC) se
estimaron para cada modelo para evaluar su apoyo en relación con todos los modelos. Los resultados (tabla S5)
sugieren que los tres modelos que incluyeron la defaunación y el tipo de bosque fueron los mejores para explicar la
variación del tamaño de las semillas. el acumulativowLuego, el AIC se calculó como la suma dewAIC de estos mejores
modelos igualmente plausibles (tabla S5). En conjunto, tenían un 85 % de probabilidad de explicar mejor el tamaño de
la semilla en relación con el conjunto de modelos de la competencia, dados los datos. Las variables bioclimáticas,
cantidad de bosque, textura del suelo y relieve no mejoraron el ajuste de estos modelos (tabla S5).
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Población de la selva tropical en 2009 (tabla S6). Por lo tanto, no se evidenció compensación entre el tamaño de la semilla y el número
a nivel de la población. Estas variables tampoco se correlacionaron con la edad estimada de la palma dentro de una población (tabla
S6).
Para desacoplar los efectos de la migración y el tiempo transcurrido desde el aislamiento, utilizamos un modelo
de coalescencia (54). Los parámetros demográficosθ =4μNe(parámetro coalescente o de mutación para el genoma
diploide),METRO = 4Nellos/θ(parámetro de migración) ygramo(tasa de crecimiento exponencial,θt= θahoraexp[-gt], dóndet
es el tiempo de coalescencia en la unidad mutacional (55)) se estimaron utilizando el método de Markov Chain Monte
Carlo (MCMC) (56) implementado en el software LAMARC 2.0.2 (57). Los análisis se realizaron con 10 cadenas iniciales
de 10 000 y dos cadenas finales de 100 000 pasos, y se tomaron muestras de las cadenas cada 100 pasos después de
un proceso de quemado de 10 000 pasos. Utilizamos la configuración predeterminada para la estimación inicial deθ.
Además, para mejorar el rendimiento de la ejecución, agregamos calefacción (MCMC acoplado a metrópolis), con una
cadena calentada y una temperatura de 1,2. El programa se ejecutó cuatro veces para evaluar la convergencia y validar
los análisis. Luego, generamos resultados combinados utilizando Tracer v1.4.1 (58) y consideró los resultados sólo
cuandoESS≥ 200 (tamaño de muestra efectivo). Se obtuvieron las estimaciones más probables (MPE), es decir, el punto
más alto de la curva de probabilidad posterior para un parámetro dado, que es la mejor solución encontrada por una
corrida bayesiana, y también se obtuvo el intervalo de credibilidad alrededor de la estimación de cada parámetro (55).
El tiempo hasta el ancestro común más reciente (TMRCA) se estimó a partir del totalθusando la tasa de mutación más
baja reportada para un marcador microsatélite en plantas, 2.4 × 10−4mutaciones por alelo por generación (IC del 95 %
= [1,4 × 10−4; 4,2 × 10−4]) (59), que a menudo se cita en el rango de 10-3a 10-4por locus por generación y un tiempo de
generación de 18,7 años (20).
El análisis de coalescencia realizado con el software LAMARC 2.0.2 mostró un crecimiento poblacional
constantegramo=0.280 (IC 95% -1.019-2.183) y un parámetro de mutación alto (θ=7,905 [IC del 95%:
1,714-10,000]), lo que indica un tamaño de población efectivo históricamente grande. El TMRCA estimado a
partir del parámetro de coalescencia para la población general data de 32 937 generaciones o 615 921 años
AP (IC del 95 % = 76 313,80 – 1 335 714 años AP).
El número de migrantes por generación entre pares de población osciló entre 0,43 y 7,93 eventos
migratorios. Aunque el tiempo de coalescencia data del Pleistoceno, el ancestro común más reciente
(MRCA) de los haplotipos (su coalescencia) no corresponde necesariamente a la división temporal real de
las poblaciones, pero puede preceder a la divergencia real de las poblaciones.
5
(60). De hecho, la alta migración entre las poblaciones mostró que las poblaciones deE. eduliscompartieron una historia
evolutiva común hasta hace muy poco y, por lo tanto, la diferencia en las características del tamaño de las semillas
probablemente se deba a cambios recientes causados por el aumento del aislamiento en un paisaje progresivamente
fragmentado. Estos cambios pueden estar impulsando la divergencia de la población debido a la combinación de la deriva y
una fuerte selección divergente.
Modelos fenotípicos de las tendencias del tamaño de las semillas a lo largo del tiempo después de la defaunación:
Modelamos los cambios evolutivos en el tamaño de las semillas comozt+1= zt+h2(P - zt), en el cualztes el tamaño de la
semilla en la generaciónt,h2es la heredabilidad del tamaño de la semilla,PAGes el tamaño medio de la semilla dispersada con
éxito por las especies de frugívoros que quedan en los sitios defaunados, yh2(P - zt) es la respuesta a la selección en la
generaciónt. Estimamos la heredabilidad (h2) de tamaño de semilla enE. edulisbasado en la varianza de la relación genética
entre palmas con datos fenotípicos de frutas disponibles (verHeredabilidad del tamaño de la semilla y estimación de la
coalescencia ). Usamos el valor informado previamente de 18.7 años para el tiempo de generación de la palma (20). Las
simulaciones examinaron las trayectorias esperadas para el tamaño de la semilla, zt, dado el tiempo de generación de la
palma, la estimada empíricamenteh2valor y selección diferencial por frugívoros de boca pequeña en ausencia de especies de
boca grande de áreas perturbadas. Ejecutamos dos modelos, uno para las condiciones iniciales de tamaño de semilla similar a
los bosques semicaducifolios no defaunados y un segundo con la condición inicial similar a la selva tropical no defaunada. Los
tamaños iniciales de las semillas se extrajeron de nuestros datos sobre el tamaño de las semillas para cada tipo de bosque.
EstimamosPAGutilizando información sobre el tamaño de las semillas regurgitadas únicamente, porque los defecadores
(guans) son menos efectivos como dispersores de semillas, como se discutió anteriormente (Definición de estado de
difamación ). Por lo tanto, los resultados de nuestras simulaciones se mantienen en dos situaciones: (i) si los defecadores no
son relevantes como dispersores en relación con las especies que regurgitan semillas; (ii) si los defecadores seleccionan
semillas del mismo tamaño que las especies que regurgitan las semillas. De hecho, los defecadores movieron una cantidad
relativamente pequeña de semillas en este sistema, como lo revelan los datos de la Tabla S4 sobre las visitas y el componente
cuantitativo de la efectividad de la dispersión de semillas, y su frecuencia de visitas a las palmas en áreas defaunadas es de
hecho muy baja (índice de abundancia puntual, IPA , depenélope superciliarisen áreas defaunadas es 27 veces menor que en
áreas no defaunadas; la tasa de visita de los crácidos es de 0,29 visitas/10 h, frente a los tucanes y cotingas con 3,2 visitas/10
h). Además, las pavas defecan semillas significativamente más pequeñas que las semillas regurgitadas por los tucanes y
cotingas (verDefinición de estado de difamación ).
Reducción del tamaño de la semilla y vulnerabilidad a la desecación: PorqueE. edulislas semillas son
recalcitrantes (es decir, semillas que no sobreviven al secado o la congelación) (42), su desecación es una de las
principales limitantes para la supervivencia de las plántulas durante periodos prolongados e intensificados de sequía,
tal como predicen los escenarios futuros de cambio climático (61). Con base en esta suposición, estudiamos cómo la
reducción del tamaño de las semillas afectaría la vulnerabilidad deE. edulissemillas a la desecación. Medimos el
diámetro de semilla individual y la masa de semilla de 200 semillas escogidas al azar de 50 palmas en 2012. Teniendo
en cuenta queE. edulislas semillas son esféricas, usamos el diámetro medio de la semilla para calcular la superficie de
la semilla usando la fórmulaSuperficie = 4πr2, dónderes el radio medio de la semilla. Al dividir la superficie de la
semilla por su masa, obtuvimos su superficie específica (mm2/mg). La superficie específica de los organismos vivos ha
sido ampliamente reportada en la literatura como un determinante de su propensión al intercambio de agua y
temperatura con el ambiente, de manera que cuanto mayor sea la superficie específica, mayor será el intercambio.
Luego evaluamos la asociación entre elE. edulisdiámetro de la semilla (que oscila entre 8,1 y 12,9 mm) y su superficie
específica, un predictor de la vulnerabilidad a la desecación de la semilla, y encontró una fuerte asociación negativa
(regresión lineal:R2= 0,39;PAG< 0,0001).
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Usando el diámetro promedio de semilla observado en remanentes de bosque no defaunados (11.9 mm) y
defaunados (10.0 mm) (tabla S1) en el modelo de regresión, observamos un aumento del 16.3% en la superficie
específica de semillas en sitios defaunados, lo que indica mayor vulnerabilidad a la desecación. Esta observación es
un factor añadido a la posible menor aptitud de las semillas pequeñas en condiciones naturales (25). La combinación
de un menor éxito en la dispersión de semillas para semillas más grandes y un tamaño reducido de plántulas debido
a semillas más pequeñas (lo que podría aumentar la mortalidad) en áreas defaunadas es consistente con el patrón de
una estrecha asociación entre el tamaño medio de semillas y la riqueza de especies de frugívoros en todas las áreas
(Fig. S4). ).
Efecto del tamaño de la semilla en el crecimiento de las plántulas: Para evaluar los efectos del tamaño de la semilla en el tamaño de las plántulas, se realizó una
siembra directa en mayo de 2008, siete días después de la cosecha de la semilla, para evitar la pérdida de viabilidad deE. edulissemillas Se establecieron ocho parcelas a
lo largo de dos senderos diferentes para cada tipo de bosque (cuatro parcelas por sendero) (sitios 12 y 21, tabla S1). Se sembraron noventa semillas en cada parcela (tres
semillas de cada una de las treinta palmas madre), y todas las semillas se midieron y pesaron individualmente. Usamos semillas de las mismas palmas madre en todas
las parcelas. La ubicación exacta de las semillas de cada palma madre se marcó con una etiqueta plástica de color. Las parcelas se protegieron con jaulas de exclusión
para evitar la eliminación de semillas por parte de los mamíferos y la deposición de semillas por parte de los agentes de dispersión. Las jaulas fueron construidas con
varillas de hierro de 110 cm de largo x 70 cm de ancho x 15 cm de alto y cubiertas por una malla de alambre con aberturas redondas de 1 cm de diámetro. La mitad de
las semillas se enterraron en el suelo, y la otra mitad de cada semilla quedó expuesta. El paso de la etapa de plántula a retoño, que se indica por el agotamiento
completo del endospermo, se evaluó para determinar la duración del experimento. Observamos que el agotamiento del endospermo ocurrió ca. 270 días después de la
siembra. Debido a que nuestro objetivo era evaluar el efecto del tamaño de la semilla en el establecimiento temprano y el crecimiento de las plántulas, eliminamos los
brotes de las plántulas de las parcelas 270 días después de la siembra. Estos brotes se secaron en una estufa a 72 °C durante 48 h para la evaluación de la masa seca de
los brotes. Los resultados indicaron que el tamaño de semilla más grande se correlacionó con brotes de plántulas más pesados tanto en la selva tropical atlántica
(correlación de Pearson: retiramos los brotes de las plántulas de las parcelas 270 días después de la siembra. Estos brotes se secaron en una estufa a 72 °C durante 48 h
para la evaluación de la masa seca de los brotes. Los resultados indicaron que el tamaño de semilla más grande se correlacionó con brotes de plántulas más pesados
tanto en la selva tropical atlántica (correlación de Pearson: retiramos los brotes de las plántulas de las parcelas 270 días después de la siembra. Estos brotes se secaron
en una estufa a 72 °C durante 48 h para la evaluación de la masa seca de los brotes. Los resultados indicaron que el tamaño de semilla más grande se correlacionó con
brotes de plántulas más pesados tanto en la selva tropical atlántica (correlación de Pearson:r= 0,22;PAG= 0.0006) y bosque semideciduo (r=0,22;PAG= 0,0012). Las
plántulas de semillas de >12 mm de diámetro fueron 1,5 veces más grandes (masa seca) que las que emergieron de semillas de <12 mm de diámetro (t=
- 8.2,gl= 67,PAG< 0,0001). A los 270 días después de la siembra, la emergencia de plántulas fue más del doble en la
selva atlántica (75,8 %) en comparación con la selva semicaducifolia (35,1 %), donde se observa una estación seca más
fuerte. Por lo tanto, la variación del tamaño de la semilla es un rasgo crítico que determina el tamaño temprano de las
plántulas y aumenta las probabilidades de establecimiento en condiciones más secas.
7
Figura S1.
Clasificación de áreas basada en un análisis de conglomerados de cuatro rasgos de aves frugívoras que describen cada especie de
ave ponderada por su presencia/ausencia en cada área. Las características de las aves incluyeron el componente de cantidad de la
efectividad de la dispersión (es decir, el producto de la tasa de visitas, el número de frutos manipulados por visita y la probabilidad
de dispersar una semilla manipulada), la masa corporal (g), el tamaño de la abertura (mm) y la puntuación de frugivoría (tabla S4).
Los números son códigos de área (ver tabla S1, Fig. 1).
8
Figura S2.
(A) Tucanes y tucanetas (comoSelenidera maculirostris) son los principales dispersores legítimos de semillas de
Euterpe edulisen la selva atlántica. (B) Al descarnar los frutos, las semillas regurgitadas por los tucanes (y los
zorzales) germinaron mejor que las semillas no regurgitadas que se dejan caer debajo de la palma (nótese las
marcas del pico), (C) En el suelo del bosque, las semillas regurgitadas y las no dispersadas las frutas (es decir,
con las marcas de pico de las aves de boca pequeña) se pueden muestrear y medir fácilmente. (D) Semillas
defecadas por crácidos (p. ej.,penélope superciliaris) se unen a una masa de pulpa y se diseminan en un patrón
muy agrupado. (E) Junto con los frutos no dispersados que caen debajo de la palma madre, sus semillas son
fuertemente atacadas por patógenos o depredadores de semillas posteriores a la dispersión (Fotos A y B de
Edson Endrigo, y C, D y E de Marina C. Côrtes, con permiso).
9
Funciones de selección fenotípica para semillas de palma con diferentes diámetros de semilla en tres fragmentos de
bosque defaunado (naranja; sitios 2, 5 y 7, tabla S1) donde las grandes aves frugívoras están funcionalmente extintas y
en cuatro bosques vírgenes (azul; sitios 12, 14, 20 , y 22, tabla S1; para facilitar la visualización, se muestra una spline
agrupada). Las líneas verticales en el gráfico rugoso indican el tamaño de semilla individual de las semillas no
dispersadas (frutos con marcas de pico) y semillas dispersas (regurgitadas).
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Figura S4.
Relación entre la riqueza de especies de frugívoros (todas las especies de dispersores legítimos de semillas agrupadas, tabla
S2) y el tamaño medio de las semillas (diámetro máximo, mm) deEuterpe edulisen las áreas estudiadas (r= 0,6971;PAG=
0,00031). Los números corresponden a los códigos de área enumerados en la tabla S1 y la Fig. 1. Los colores de los símbolos
indican el estado de defaunación: el naranja está defaunado y el azul no está defaunado. Los números en cursiva
representan áreas de bosque semideciduo y los números de tipo normal son áreas de selva tropical.
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Tabla S1.
Ubicación, estado de defaunación y diámetro medio (±DE) (mm) deEuterpe edulissemillas en el Bosque
atlántico en Brasil.norte, tamaño de la muestra. (*) sitios donde se realizaron observaciones focales.
diámetro de la semilla
Sitio
Nombre del sitio y ubicación (Estado brasileño) norte (mm) Estado tipo de bosque
Código
Media ± DE
1 Faz. Boa Esperanza, Silva Jardim (RJ) 85 9,03 ± 0,60 defaunado Selva
5 Faz. São José, Río Claro (SP)* 258 9,75 ± 1,02 defaunado Semideciduo
6 Mata Santa Genebra, Campinas (SP)* 480 10,23 ± 1,03 defaunado Semideciduo
10 EE Poço das Antas, Silva Jardim (RJ) 242 10,61 ± 1,00 No difunto Selva
11 Morro São João, Cananéia (SP)* 135 11,13 ± 0,87 No difunto Selva
15 Serra do Piloto, Río Claro (RJ) 2250 11,24 ± 0,92 No difunto Selva
12
diámetro de la semilla
Sitio
Nombre del sitio y ubicación (Estado brasileño) norte (mm) Estado tipo de bosque
Código
Media ± DE
PE = Parque Estadual (Parque Estatal), ReBio = Reserva Biológica (Reserva Biológica), EE=Estação Ecológica (Estación
Ecológica), PESM=Parque Estadual da Serra do Mar (Parque Estatal Serra do Mar), Faz. = Fazenda (granja).
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Tabla de datos adicionales S2 (archivo separado)
Presencia de todas las especies conocidas de frugívoros que se alimentan deEuterpe edulisfrutos en las 22 poblaciones de
palmeras muestreadas. [Documento de hoja de cálculo]
14
Tabla S3.
Tabla de resumen de los datos de presencia de dispersores de aves en las 22 áreas de estudio (riqueza de especies;
siete defaunadas, 15 no defaunadas; tabla S2) y datos de abundancia (cuatro defaunadas y seis no defaunadas). La
abundancia se da como el valor total del índice de abundancia puntual sumado (IPA) para los dispersores de grandes
boquetes y los tucanes.
* riqueza media de especies, con la ocurrencia de cada especie ponderada por su puntaje de frugivoría. Para los tucanes, la
ocurrencia fue ponderada por el componente cuantitativo de la efectividad de la dispersión de semillas (tabla S4).
†soloRhamphastos tocose ha registrado en áreas defaunadas, ya que la especie entra con poca frecuencia en pequeños
fragmentos.
15
Tabla S4.Resumen de datos de visitas y comportamiento de alimentación de frutas para aves frugívoras que se alimentan deEuterpe edulisfrutos en bosques
atlánticos defaunados y no defaunados en Brasil. Los datos incluyen información para cada especie a partir de observaciones focales en diferentes áreas de los
sitios defaunados y no defaunados, totalizando 2326 h de observación. Frugívoros pequeños, de boca pequeña (≤ 12 mm); Frugívoros grandes, de gran abertura
(> 12 mm).
defaunación
Abertura media No sin frutas sin frutas Dispersión Cuantitativo
estado/ave Familia Especies Nombre común Comportamiento
tamaño (mm) visitas/10h manejado/visita1 disperso/visita2 probabilidad3 componente4
tamaño
defaunado
bariftengo De cabeza rufa
Grande Momotidae regurgitar 17.2 0,60 0.83 0.83 1.00 0.50
ruficapillus momoto
cola blanca
Grande trogónidos Trogón viridis regurgitar 19.6 0.10 1.00 1.00 1.00 0.10
Trogón
Miodinastas Rayado
Grande tiranidos regurgitar 17.0 0.24 1.00 1.00 1.00 0.24
maculatus Mosquero
cuello blanco
Pequeño turdidae Turdus albicollis regurgitar 11.2 0.51 1.27 1.18 0.93 0,60
Tordo
patas amarillas
Pequeño turdidae Turdus flavipes regurgitar 12.1 19.00 1.67 1.63 0.97 31.00
Tordo
Pecho pálido
Pequeño turdidae Turdus leucomelas regurgitar 11.9 1.28 1.21 1.21 1.00 1.55
Tordo
vientre rufo
Pequeño turdidae Turdus rufiventris regurgitar 12.0 1.20 1.29 1.21 0,94 1.45
Tordo
dieciséis
vientre granate semilla
Grande psitácidos Pyrrhura frontalis 11.2 0.10 70.00 0.00 0.00 0.00
Perico depredador
No difunto
Carpornis Encapuchado
Grande Cotingidae regurgitar 14.4 0.30 2.97 2.12 0.71 0,64
cucullata comedor de bayas
canela ventilado
Grande Cotingidae Lipaugus lanioides regurgitar 18.7 0.83 2.10 2.10 1.00 1.74
Piha
Cresta rubia
Grande Picidae Celeus flavescens regurgitar 12.9 0.03 2.00 2.00 1.00 0.06
Pájaro carpintero
pterogloso
Grande Ramphastidae Regurgitado de Tucancito Azafrán 23.6 0,45 3.60 3.60 1.00 1.64
bailón
Ramphastos Pecho rojo
Grande Ramphastidae regurgitar 30.7 0.14 4.44 4.37 0.98 0,63
dicoloro Tucán
Selenidera
25.2 0.51 6.28 6.02 0.96 3.05
Facturado al contado
Grande Ramphastidae regurgitar
maculirostris tucancito
cola negra
Grande titiridae titira cayana regurgitar 18.7 0.04 2.25 2.00 0.89 0.08
Tityra
cola blanca
Grande trogónidos Trogón viridis regurgitar 19.6 1.22 1.09 0,55 0.50 0,66
Trogón
17
cuello blanco
Pequeño turdidae Turdus albicollis regurgitar 11.2 1.57 1.99 1.42 0.71 2.22
Tordo
patas amarillas
Pequeño turdidae Turdus flavipes regurgitar 12.0 2.69 1.41 1.07 0.76 2.87
Tordo
Pecho pálido
Pequeño turdidae Turdus leucomelas regurgitar 11.9 1.52 0.97 0.71 0.73 1.08
Tordo
vientre rufo
Pequeño turdidae Turdus rufiventris regurgitar 12.0 0.20 1.75 1.50 0.86 0.30
Tordo
pizarroso oriental
Pequeño turdidae Turdus subalaris regurgitar 12.0 0.11 3.00 3.00 1.00 0.33
Tordo
Miodinastas Rayado
Grande tiranidos regurgitar 17.0 0.06 2.00 2.00 1.00 0.12
maculatus Mosquero
Pitangus
Grande tiranidos Gran Kiskadee regurgitar 15.5 0.05 1.50 1.50 1.00 0.07
sulfurato
frente negra
Grande Crácidos Aburria jacutinga defecar 24.0 0.18 30.09 30.09 1.00 5.46
Tubería-Guan
Patas oscuras
Grande Crácidos penélope oscura defecar 23.4 0.12 8.91 8.27 0.93 0.97
pava
cianocorax pulpa
Grande córvidos arrendajo azul 17.2 0.12 2.38 1.13 0.47 0.14
caeruleus consumidor
Violaceoso pulpa
Pequeño Fringílidos Eufonía violacea 6.5 0.10 4.00 0.00 0.00 0.00
Eufonía consumidor
pulpa
Pequeño Thraupidae Dacnis cayana Dacnis azul 7.0 0.11 3.00 0.00 0.00 0.00
consumidor
Ortogonías Verde oliva pulpa
Pequeño Thraupidae 9.8 0.05 2.67 0.00 0.00 0.00
clorictero tangara consumidor
18
Taquifonía corona de rubí pulpa
Pequeño Thraupidae 9.1 0.05 1.00 0.40 0.40 0.02
coronado tangara consumidor
dorado-chevroned pulpa
Pequeño Thraupidae Tangara ornata N/A 0.43 1.00 0.00 0.00 0.00
tangara consumidor
semilla
Pequeño psitácidos Brotogeris tirica periquito llano 9.9 0.07 3.50 0.00 0.00 0.00
depredador
1. Las frutas manipuladas son todas las frutas tocadas por las aves, e incluyen frutas que fueron tragadas, caídas, llevadas en el pico, depredadas y cuya pulpa se consumió.
2. Las frutas dispersas incluyen solo las frutas que fueron tragadas por las aves.
3. Probabilidad de dispersión = Total frutos dispersados / Total frutos manipulados
4. Componente cuantitativo = (Número de visitas/10 horas) x (Número de frutas manipuladas/visita) x (Probabilidad de dispersión)
19
Tabla S5.
Selección de modelos basada en AICc con un conjunto de modelos candidatos para predecir laEuterpe edulistamaño
de semilla considerando defaunación, tipo de bosque, textura del suelo, relieve, estructura del paisaje y datos
climáticos. Los modelos se clasifican de mejor a peor ajuste según el AICc. Para cada modelo, el número de
parámetros (k), la puntuación AIC corregida por tamaño de muestra pequeño (AICc), la diferencia AICc del mejor
modelo (Δ AICc) y el peso de Akaike (wAIC) se muestran. Los modelos con ΔAICc<2 son igualmente plausibles para
explicar los patrones observados. Los modelos más plausibles, que juntos tienen una probabilidad del 85%
(acumulativawAIC) que mejor explican el tamaño de la semilla dados los datos y en relación con todos los modelos de
la competencia, se muestran en negrita.
Modelo Acumulativo
Modelo k ΔAICc wAIC
rango wAIC
1 Defaunación dentro del tipo de bosque 5 0 0.4180 0.4180
20
Tabla S6.
Correlaciones de Pearson entreEuterpe edulismasa seca de semilla de palma, número de semillas por infrutescencia,
número de infrutescencias por palma y perímetro a la altura del pecho (pbh) (proxy de la edad de la palma) en cada
año y tipo de bosque.
21
referencias y notas
1. AD Barnoskyy otros., ¿Ya llegó la sexta extinción masiva de la Tierra?Naturaleza 471,
51 (2011).doi:10.1038/nature09678 Medline
2. F.Isbelly otros., Se necesita una alta diversidad de plantas para mantener los servicios de los ecosistemas.
Naturaleza 477, 199 (2011).doi:10.1038/nature10282 Medline
6. SR Palumbi, Los humanos como la mayor fuerza evolutiva del mundo.Ciencia293, 1786
(2001).doi:10.1126/science.293.5536.1786 Medline
7. CT Darimonty otros., Los depredadores humanos superan a otros agentes de cambio de rasgos en la
naturaleza.proc. nacional Academia ciencia EE.UU106, 952 (2009). doi:10.1073/pnas.0809235106
Medline
8. SAB Roels, JK Kelly, Evolución rápida causada por la pérdida de polinizadores enMimulus
guttatus.Evoluciónsesenta y cinco, 2541 (2011).doi:10.1111/j.1558-5646.2011.01326.x
Medline
9. El palmito o palmito (E. edulis, Arecaceae) es una especie de palma dominante endémica del
bosque atlántico y depende de las aves para la dispersión exitosa de semillas. También
ocupa masas forestales fragmentadas originadas en los últimos 200 años desde el
establecimiento de extensos cafetales en el estado de São Paulo (21,22).
10. Señor Leishmany otros., enSemillas: la ecología de la regeneración en las comunidades vegetales,
M. Fenner, Ed. (CAB International, Wallingford, Reino Unido, 2000), págs. 31 a 57.
11. DJ Levey, Tamaño de la semilla y técnicas de manipulación de frutos de frugívoros aviares.Soy. Nat.
129, 471 (1987).doi:10.1086/284652
15. Los materiales y métodos están disponibles como materiales complementarios enCienciaEn línea.
1
16. A. de Barros Leite, PHS Brancalion, R. Guevara, M. Galetti, Germinación diferencial de
semillas de una palma trapezoidal (Euterpe edulis) dispersada por aves frugívoras.J.
Trop. Ecol.28, 615 (2012).doi:10.1017/S0266467412000594
17. DMS Matos, RP Freckleton, AR Watkinson, El papel de la dependencia de la densidad en la
dinámica de población de una palmera tropical.Ecología80, 2635 (1999).
doi:10.2307/177246
22. Los bosques semideciduos defaunados están ubicados en el corazón de las plantaciones
tradicionales de café en Brasil. Por ejemplo, Río Claro, una ciudad típica de nuestra defaunada
región, tenía 65 fincas cafetaleras para 1855.
23. En lunaresy otros., Una breve historia del tamaño de la semilla.Ciencia307, 576 (2005).
doi:10.1126/science.1104863 Medline
24. MA Pizo, C. von Allmen, LPC Morellato, Variación del tamaño de la semilla en la palma Euterpe
edulisy los efectos de los depredadores de semillas sobre la germinación y la supervivencia
de las plántulas.Acta Oecol.29, 311 (2006).doi:10.1016/j.actao.2005.11.011
2
30. MB Christiansen, E. Pitter, Pérdida de especies en una comunidad de aves forestales cerca de
Lagoa Santa en el sureste de Brasil.Biol. Conservar80, 23 (1997).doi:10.1016/
S0006-3207(96)00073-0
31. A. Aguirre, R. Guevara, M. García, JC López, Destino de epífitas sobre forófitas con diferentes
características arquitectónicas a lo largo del gradiente de perturbación desabal
mexicanabosques en Veracruz, México.J. Veg. ciencia21, 6 (2010). doi:10.1111/
j.1654-1103.2009.01131.x
32. JH Ward Jr., Agrupación jerárquica para optimizar una función objetivo.Mermelada.
Estadística Asoc.58, 236 (1963).doi:10.1080/01621459.1963.10500845
33. L. Short, J. Horne,Tucanes, Barbudos y Mieleros(Universidad de Oxford. Press, Nueva
York, 2001).
35. M. Galettiy otros., Áreas prioritarias para la conservación de los grandes mamíferos del bosque
atlántico. Biol. Conservar142, 1229 (2009).doi:10.1016/j.biocon.2009.01.023
36. NT Wheelwright, Tamaño de la fruta, ancho de la abertura y las dietas de las aves frugívoras.
Ecología 66, 808 (1985).doi:10.2307/1940542
37. ER de Castro, tesis, Universidade Estadual Paulista, Rio Claro, Brasil (2003).
38. RR Laps, tesis, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, Brasil (1996).
39. DC Rother, tesis, Universidade Estadual Paulista, Rio Claro, Brasil (2010).
40. EW Schupp, P. Jordano, JM Gómez, Revisión de la efectividad de la dispersión de semillas:
una revisión conceptual.Fitol nuevo.188, 333 (2010).doi:10.1111/j.1469-
8137.2010.03402.x Medline
44. AW Robertson, A. Trass, JJ Ladley, D. Kelly, Evaluación de los beneficios de la frugivoría para
la germinación de semillas: La importancia del efecto de desinhibición.Función Ecol.20,
58 (2006).doi:10.1111/j.1365-2435.2005.01057.x
3
46. RJ Hijmans, SE Cameron, JL Parra, PG Jones, JA Jarvis, Superficies climáticas interpoladas de
muy alta resolución para áreas terrestres globales.En t. J. Climatol.25, 1965 (2005).
doi:10.1002/joc.1276
50. K. Ritland, Un método basado en marcadores para inferencias sobre la herencia cuantitativa en
poblaciones naturales.Evolución50, 1062 (1996).doi:10.2307/2410647
51. K. Ritland, Relación inferida por marcadores como herramienta para detectar la heredabilidad en la
naturaleza. mol. Ecol.9, 1195 (2000).doi:10.1046/j.1365-294x.2000.00971.x Medline
53. FA Gaiotto, RPV Brondani, D. Grattapaglia, Microsatellite markers for palm of palm
-Euterpe edulisyE. oleraceaMercado. (Arecáceas).mol. Ecol. notas1, 86 (2001).
doi:10.1046/j.1471-8278.2001.00036.x
54. JFC Kingman, El coalescente.Stoch. proc. aplicación13, 235 (1982).
55. MK Kuhner, LP Smith, Comparación de probabilidad y estimación coalescente bayesiana de
parámetros de población.Genética175, 155 (2007). doi:10.1534/genetics.106.056457
Medline
56. P. Beerli, J. Felsenstein, Estimación de máxima verosimilitud de una matriz de migración y tamaños
efectivos de población ennortesubpoblaciones utilizando un enfoque coalescente. proc.
nacional Academia ciencia EE.UU98, 4563 (2001).doi:10.1073/pnas.081068098 Medline
4
61. JC Tweddle, JB Dickie, CC Baskin, JM Baskin, Aspectos ecológicos de la sensibilidad a
la desecación de semillas.J. Ecol.91, 294 (2003).doi:10.1046/
j.1365-2745.2003.00760.x