Ácidos Nucleicos

ácidos nucleicos
• Macromoléculas complejas de suma importancia biológica,
ya que todos los organismos vivos contienen ácidos
nucleicos en forma de ácido desoxirribonucleico (ADN) y
ribonucleico (ARN). Sin embargo; algunos virus sólo
contienen ARN, mientras que otros sólo poseen ADN.

• Se les denomina así porque fueron aislados por primera vez

del núcleo de células vivas.

• Son las sustancias fundamentales de los seres vivos, y se

cree que aparecieron hace unos 3.000 millones de años,
cuando surgieron en la Tierra las formas de vida más
elementales.

• dos funciones fundamentales de los ácidos nucleicos:

transmitir las características hereditarias de una generación
a la siguiente y dirigir la síntesis de proteínas específicas.
 DNA Y RNA

• Cada monómero de ácido nucleico es

un nucleótido formado por la unión del
ácido fosfórico + azucar (ribosa,
desoxiribosa) + base nitrogenada
 NH2
N
O N
-
O P O CH2 N
O N
O- H H
H
OH OH

Pentosa Base

Fosfato Nucleósido

Nucleótido
 DNA Y RNA
Pentosas

la diferencia es la pérdida del grupo OH de la posición #2

 Base Nitrogenada
• Purinas: (A, G)
– Formadas por dos
anillos

• Pirimidinas: (T, C, U)
– Formadas por un
anillo básico que
contiene dos
moléculas de
nitrógeno.
 DNA Y RNA
• Ácido fosfórico

- Une los nucleótidos entre sí asociando las

pentosas de dos nucleótidos consecutivos

- La unión se produce con el carbono 3’ de un

nucleósido con el carbono 5’ del siguiente

- unido al azúcar por enlace (covalente)

fosfodiéster
• En consecuencia, el eje de ácido nucleico está formado
por fosfatos y pentosas alternados. Las bases
nitrogenadas están unidas a los azúcares de este eje.

• El ácido fosfórico utiliza dos de sus tres grupos ácidos

en las uniones 3´, 5´- diéster.

• El grupo restante confiere al poli nucleótido sus

propiedades ácidas y permite que la molécula forme
uniones iónicas con proteínas básicas.

• Éste grupo ácido libre hace también que los ácidos

nucleicos sean intensamente basófilos, es decir, que se
colorean fácilmente con colorantes básicos.
 Polinucleótido
NH2
N
N
O P O CH2 N
O N
-
O NH2
N
O N
OH
O P O CH2 N
O N
-
O NH2
N
O N
OH
Enlace O P O CH2 N
O N
-
fosfodiéster O

O OH Enlace
β-glicosídico
 Existen dos tipos de ácidos nucleicos
• Polímero de nucleótidos.
– RNA (ácido ribonucleico)
– DNA(ácido desoxirribonucleico)
• Molécula larga filamentosa, estable y con capacidad de
autoreplicación.
 • RNA • DNA

– Hebra sencilla – Hebra doble

– Azúcar ribosa – Azúcar desoxiribosa

– Uracilo – Timina

– Cadenas cortas por lo – Cadenas bien largas.

general.
 Ácido desoxirribonucleico o ADN:
• fue descubierto por el químico suizo Friedrick Miescher
en 1868.

• Sin embargo, esta macromolécula no logró identificarse

químicamente hasta muchos años más tarde, en la
década del 50.

• Hoy sabemos que el ADN está formado por la unión de

muchos desoxirribonucleótidos, cuya secuencia actúa
como un alfabeto molecular almacenando toda la
información genética del individuo.
 Experimentode F. Griffithen
Streptococcus pneumoniae(1928).
• Existen cepas letales para ratones y otras cepas
menos virulentas.

• Cepas virulentas: cepas S con envoltura de

polisacáridos.

• Cepas no virulentas (mutantes): cepas R sin envoltura

de polisacáridos.

• Las cepas virulentas se mueren por calor (después de

hervirlas).

• Las cepas S inactivadas por calor transforman las

cepas R haciéndolas virulentas.
 Propiedades del material
genético.

• Debe ser replicado en cada división

celular.
• Debe poseer toda la información
genética.
• Debe ser capaz de cambiar para que
pueda haber evolución sin embargo, en
general debe ser estable.
 Conocimiento previo al descubrimiento
de la estructura del DNA por Watson y
Crick
• Los genes (factores hereditarios de Mendel) se
asociaban con caracteres específicos, pero su
naturaleza física no era conocida. Se sabía que las
mutaciones alteraban la función de los genes, pero no
lo que eran.

• La teoría un gen -una proteína postulaba que los

genes controlaban la estructura de las proteínas.

• Los genes se encuentraban en los cromosomas.

• Los cromosomas están constituidos por DNA y

proteínas.
Modelo de la estructura en doble hélice del DNA
(Watsony Crick, 1953)
Modelo De WATSON-CRICK
Apareamiento del DNA.
 DNA
Las Bases Nitrogenadas
 Modelo De WATSON-CRICK

• Cada molécula de DNA está formada por dos largas cadenas de

polinucleótidos que corren en direcciones opuestas formando una
hélice doble alrededor de un eje imaginario central. De esta forma la
polaridad de cada cadena es opuesta
• Cada nucleótido está en un plano perpendicular al de la cadena
polinucleótida
• Las dos cadenas se encuentran apareadas por uniones de hidrógeno
establecidas entre los pares de bases
• El apareamiento es altamente específico. Existe una distancia física de
11 A entre dos moléculas de desoxirribosa en las cadenas opuestas
(sólo se pueden aparear una base púrica con una pirimídica. A-T G-C
entre A y T hay dos puentes de hidrógeno y entre G-C hay tres. Son
imposibles otras uniones)
• La secuencia axil de bases a lo largo de una cadena de polinucleótidos
puede variar considerablemente, pero en la otra cadena la frecuencia
debe ser complementaria
Estructura secundaria del ADN:
Características Principales
• Dos cadenas polinucleotídicas
enrrolladas en una doble
hélice dextrógira

• Las hebras son antiparalelas

• Pares de base separados 3.4

A. Una vuelta de hebra (3.4
nm) tiene aprox. 10 pares de
base

• La posición de los esqueletos

azucar-fosfato definen surco
mayor y menor.
 Otras propiedades del DNA
• Las hélices son antiparalelas
5’→→→→3’
3’←←←←5’
• Medidas
– Distancia entre una base nitrogenada y otra –
3.4 A°
– Diámetro de la hélice – 20 A°
– Vuelta de espiral (10 bases nitrógenadas) –
34 A°
PROPIEDADES DE LOS ACIDOS
NUCLEICOS
 Acidos nucleicos: propiedades
• Monomeros:
– 4 nucleotidos
– Anfoteros
• Pi anionico
• Bases ionizables
• Propiedades
– Espectroscopicas
• Adsorcion a 260 nm (A,U)
– Acido-base
• Anfoteros
• Carga neta depende del pH
– Solubilidad
• Solubles en agua. (insolubles en acido)
• Insolubes en solventes organicos. (precipita en
etanol)
– Estabilidad;
• Desnaturalizacion (separacion de cadenas)
• Hidrolisis (RNA>>DNA)
 Absorbancia de los nucleotidos
• Los acidos nucleicos absorben maximamente a 260 nm
 Propiedades acido-base
• El grupo fosfato es fuertemente acido
– Fosfatos totalmente ionizados a pH fisiologico
(pKa~1.0)
– Carga neta negativa
– Repulsion entre cadenas dependiendo de la
Ionizacion
 Desnaturalización de los ácidos nucleicos

• Desnaturalización
Parcial del ADN
necesaria para
procesos de copiado
experimental por
temperatura
Renaturalización del ADN
 Organización del material
hereditario

•Necesidad de compactación
•Volumen limitado
•Neutralización de cargas del ADN
• Organización funcional del ADN
•mecanismos de segregación en duplicación
•accesibilidad de proteínas reguladoras de la expresión génica
El núcleo eucariota
• El genoma nuclear
humano comprende
• 46 moléculas de ADN
lineales
• El largo sumado de
este ADN es mas de
1.5 metros
• El diámetro del núcleo
es aprox. 10 nm
 Niveles de condensación del DNA
• Doble hélice
• Nucleosoma – unidades de nucleoproteínas
formadas cada una por un octámero de histonas en
forma de disco envuelto en ácido nucléico. El
octámero de histonas se compone de: 8 moléculas
de histonas conocidas como H2A, H2B, H3 y H4( 2
de cada una).
• Solenoide – anillos circulares y continuos formados
cada uno por seis nucleosomas.
• Cromatina – filamento de DNA y proteínas.
• Cromosoma – Mayor nivel de condensación.
La estructura de los ácidos
nucleicos no es rígida
• el ADN es una molécula dinámica, que
puede adoptar diversas formas.
• Así, se reconoció la existencia de otras
dos ordenaciones tridimensionales,
conocidas como ADN-A y ADN-Z
• Las que tienen algunas diferencias con el
ADN-B son más anchas y al forma Z más
angosta que la B.
• Finalmente el ADN-Z se enrolla hacia la
izquierda, mientras que las formas A y B
lo hacen hacia la derecha.
 Topología y función
• Superenrrollamiento necesario para la compactación
del ADN y su función

• In vivo la mayoría del ADN está superenrrollado

negativamente

• Esto favorece la disociación local de las hebras,

importantes durante la duplicación y transcripción

• Enzimas topoisomerasas regulan los niveles de

superenrrollamiento celular

• Es posible que se formen estructuras alternativas

debido a desenrrollamientos locales generados por
superrollamiento
 Torsión y superenrrollamiento
• Al superenrrollar el ADN se genera tensión, que se expresa en un
desenrrollamiento local del ADN (variando la torsion).
• Al separar las hebras, se genera tensión que se resuelve enrrollando
sobre si misma la molécula de ADN (variando el superenrrollamiento).
 Niveles de condensación del DNA
• Doble hélice
• Nucleosoma – unidades de nucleoproteínas
formadas cada una por un octámero de histonas en
forma de disco envuelto en ácido nucléico. El
octámero de histonas se compone de: 8 moléculas
de histonas conocidas como H2A, H2B, H3 y H4( 2
de cada una).
• Solenoide – anillos circulares y continuos formados
cada uno por seis nucleosomas.
• Cromatina – filamento de DNA y proteínas.
• Cromosoma – Mayor nivel de condensación.
 Las histonas
• Proteínas básicas pequeñas
• Altamente conservadas
• Centro globular y colas ricas en Lys y Arg
• Sitios de acetilación de Lys en colas N terminales (+)
• Sitios de fosforilación en Ser en colas de H1
 El nucleosoma
•Sobre el octámero se enrrolla el ADN
•Cada octámero organiza 145 pb en 1 ¾ vuelta
•48 nm ADN en un disco de 6x11nm
•Sitios distantes en el ADN se aproximan (accesibilidad)
•Otros sitios quedan cubiertos (en la cara interna)
 Las colas de las
histonas del core

• Cargadas positivamente
• Pasan entre las vueltas de ADN
• Contactan con el ADN adyacente y del
octámero próximo
 La histona H1
• No forma parte del
octámero
• Organiza el ADN a la
entrada y salida del
octámero
El solenoide
 Correlación estructura función
• La modificación de histonas es VITAL en la expresión génica
• La acetilación y desacetilación de histonas es cíclica
 Bucles como dominios de
cromatina
• Cada bucle fijado al scaffold puede presentar una
estructura diferente, mas o menos condensada.
• Pueden ser dominios funcionalmente independientes
 El andamiaje (scaffold)
Igual tratamiento en cromosomas metafásicos revela un esqueleto
proteico del cromosoma (scaffold) del que salen bucles de ADN de
30 a 100 Kb
La matriz nuclear proteica es el scaffold durante la interfase
 Dominios condensados
Los bucles de ADN fijados al scaffold se pliegan formando una
superhélice
 Cromosomas
• Estructuras de varias
formas y tamaños
formada por
nucleoproteínas.
• Nucleoproteínas –
combinación de ácido
nucléico y proteínas
(histonas)
• Formada por una ó dos
cromátidas (hermanas),
unidas por un centrómero
(DNA no está contraído).
 El cromosoma
• Unidad funcional de la información hereditaria
• Telómeros
Regiones terminales de los cromosomas
Secuencias repetidas particulares
Mecanismo de duplicación particular
Función = Integridad cromosómica

• Orígenes de replicación
ARS (secuencias de replicación autónomas)
Varios por cromosoma
Función = replicación

• Centrómero
Constricción primaria
Rico en secuencias repetidas
Sitio de unión de proteínas que forman
Función = segregación
 Plegamiento de RNA
El apilamiento de bases hace que el RNA forme también,
como el DNA, una hélice dextrógira. No obstante cuando
existen secuencias complementarias la estructura que
predomina es la de doble hélice interrumpida por bucles en
zonas que no presentan complementariedad de bases.
 Composición de bases de DNA
• Existen algunas generalizaciones importantes,
en los patrones de composición de bases
nitrogenadas en el DNA independientemente de
su origen (excepto DNA virales). Estas
generalidades son:

1) El número de bases púricas (A +G) está en

equilibrio con el numero de bases pirimidícas (T
+ C)

2) El número de residuos de adenina esta

equilibrado con el número de residuos de timina

3) El número de residuos de guanina esta en

equilibrio con el número de residuos de citosina.
La estructura de doble helice del
ADN
• Con el apareamiento de bases limitado (A-T; G-C)

• Implica que el orden o secuencia de bases de una de

las cadenas delimita automaticamente el orden de la
otra

• Una vez conocida la secuencia de las bases de una

cadena, Se deduce inmediatamente la secuencia de
bases de la complementaria
• Regla de Apareamiento de Chargaff
– Dice que las bases nitrogenadas se aparean de tal
manera que el número total de purinas es igual al
número total de pirimidinas. Sin embargo, la cantidad
de A+T no es necesariamente igual a la cantidad de
C+G.
A+G / C+T = 1
(Purinas) (Pirimidinas)
Ej. 5’ AAATTTCGGCGT 3’
3’ TTTAAAGCCGCA 5’

7+5/5+7=1
A+T= 14 C+G= 10
La estructura de un determinado
ADN
• Está definida por la “Secuencia” de las bases nitrogenadas
en la cadena de nucleótidos

• En esta secuencia de bases está la información genética

del ADN

• El orden en el que aparecen las cuatro bases a lo largo de

una cadena en el ADN, es crítico para la célula, ya que
este orden es el que constituye las instrucciones del
programa genético de los organismos.

• Conocer esta secuencia de bases, es decir, secuenciar un

ADN, equivale a descifrar su mensaje genético.
 Genética Molecular
El DNA es el portador del mensaje genético
• La cantidad de DNA en las células de
individuos de la misma especie es constante
• Cuanto más compleja es la especie mayor
cantidad de DNA contiene
• Las proteínas encontradas en especies muy
diferentes son parecidas y de estructura muy
simple
• Las células reproductoras contienen la mitad
de DNA
 Base molecular de la herencia
• Genes: son unidades hereditarias
que se transmiten de una generación
a otra, estos contienen información
codificada para una característica.
 Gen
• Un gen es un fragmento de ácido nucleico que
tiene información para un determinado carácter
• Un gen ocupa una posición fija en el hilo de DNA
(LOCUS)
• Para un mismo locus puede haber más de un
tipo de información. Cada información que hay
en un mismo locus se le llama ALELO
• Por cada gen hay una enzima que transporta las
sustancias
 DOGMA CENTRAL
• El ADN en el genoma de un organismo podría dividirse
conceptualmente en dos, el que codifica las proteínas y
el que no codifica.

• En el proceso de elaborar una proteína, el ADN de un gen

se lee y se transcribe a ARN. Este ARN sirve como
mensajero entre el ADN y la maquinaria que elaborará las
proteínas y por eso recibe el nombre de ARN mensajero.

• El ARN mensajero instruye a la maquinaria que elabora

las proteínas, para que ensamble los aminoácidos en el
orden preciso para armar la proteína.

• El dogma central de la biología molecular plantea que el

flujo de actividad y de información es: ADN → ARN →
proteína
DOGMA CENTRAL
 excepciones
• Este dogma es cierto en la mayoría de los
casos, pero se conocen importantes
excepciones:
• En algunos organismos (virus de ARN) la
información fluye de ARN a ADN, este proceso
se conoce como "transcripción inversa o
reversa".
• Adicionalmente, se sabe que existen secuencias
de ADN que se transcriben a RNA y son
funcionales como tales, sin llegar a traducirse a
proteína nunca.
 La Expresión del Mensaje
Genético
Las instrucciones para construir las proteínas están
codificadas en el DNA y las células tienen que traducir
dicha información a las proteínas. El proceso consta de
dos etapas:

1.- En el núcleo se pasa de una secuencia de bases

nitrogenadas de un gen DNA a una secuencia de bases
nitrogenadas complementarias que pertenecen a un
mRNA (TRANSCRIPCIÓN)

2.- En los ribosomoas se pasa de una secuencia de

ribonucleótidos de mRNA a una secuencia de
aminoácidos (TRADUCCIÓN)