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Inteligencia Artificial Aplicada A La Biomedicina
Inteligencia Artificial Aplicada A La Biomedicina
ciclo de
conferencias y debates en
ciencias
11.ª edición
FUNDACIÓN RAMÓN ARECES
SPRINGER NATURE
INTELIGENCIA ARTIFICIAL
APLICADA A LA BIOMEDICINA
Lo que nos depara el futuro
ARTIFICIAL
INTELLIGENCE
IN BIOMEDICINE
What the future
holds for us
monografía
ciclo de
conferencias y debates en
ciencias
11.a edición
FUNDACIÓN RAMÓN ARECES
SPRINGER NATURE
INTELIGENCIA ARTIFICIAL
APLICADA A LA BIOMEDICINA
Lo que nos depara el futuro
ARTIFICIAL INTELLIGENCE
IN BIOMEDICINE
What the future holds for us
introducción
Erika Pastrana __________________________________________________________________________ 11
conferencias
Inteligencia artificial y ciencia de datos: mirando hacia el futuro
Prof. José Hernández-Orallo ________________________________________________________________ 17
debate
Prof. José Hernández-Orallo, Dr. Tarek R. Besold, Dra. Jamie Paik, Dra. Kara L. Davis _______________________ 39
introduction
Erika Pastrana __________________________________________________________________________ 51
lectures
Artificial intelligence and data science: looking ahead
Prof. José Hernández-Orallo ________________________________________________________________ 57
Building ethical Artificial Intelligence and technology for the health sector
Dr. Tarek R. Besold_______________________________________________________________________ 63
discussion
Prof. José Hernández-Orallo, Dr. Tarek R. Besold, Dr. Jamie Paik, Dr. Kara L. Davis _________________________ 79
3
presentación
Soledad Santos
Directora Editorial de España y Portugal
de Springer Healthcare
5
Presentación
E
n esta undécima edición de “Ciclos de conferencias y debates”, organizada
conjuntamente con Springer Nature, y bajo el título Inteligencia Artificial
Aplicada a la Biomedicina. Lo que nos depara el futuro, nos acercamos a
temas de gran actualidad, con la participación y colaboración de personalidades de gran
notoriedad. No cabe duda del progreso extraordinario que ha experimentado la informá-
tica aplicada a la Biomedicina en los últimos años y de la inmensa repercusión que puede
tener su aplicación, no solo en el análisis de datos, sino también en el establecimiento del
diagnóstico y la decisión del tratamiento, así como en el aumento de las capacidades de las
técnicas quirúrgicas, con aplicaciones que hace algunos años eran inimaginables.
Siguiendo la misma trayectoria, el siglo xxi será el siglo de la atención personalizada
en Medicina. Hoy en día ya disponemos de sistemas de acumulación de datos (Big data)
que permiten recopilar gran cantidad de información, no solo respecto a los síntomas de
los pacientes, sino también para valorar la repercusión genética y epigenética, y que nos
permiten, además, combinar estos datos a gran velocidad y establecer, sobre esta base,
la mejor decisión terapéutica. Por tanto, vale la pena invertir en todo lo relacionado con la
computación, la informática y la salud.
Hemos de ser conscientes de que solo algunas personas pueden disfrutar de estos
avances. Hoy quiero recordar la importancia de que aspectos como la salud, el agua y
una educación de calidad, señalados como prioritarios por las Naciones Unidas, deberían
extenderse a todo el mundo.
Mediante la aplicación de estos avances a la salud, el futuro nos puede deparar algo
mucho mejor desde el punto de vista de la solidaridad humana. Por tanto, una vez más
me alegra dar la bienvenida a los representantes de Springer Nature y espero que sigan
considerando la Fundación Ramón Areces como su casa. ❙
7
INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
B
ienvenidos a la undécima conferencia-debate fruto de la colaboración entre
la Fundación Ramón Areces y el grupo Springer Nature dedicada a la
Inteligencia Artificial Aplicada a la Biomedicina.
Para todo el equipo de Springer Nature en España es una gran satisfacción poder
continuar, año tras año, esta interesante colaboración con la Fundación Ramón Areces
y con ello contribuir a su importante misión de acercar la vanguardia científica de
fuera y dentro de nuestras fronteras, no solo a nuestra comunidad científica local, sino
también al público en general. Es para nosotros un honor contribuir a la organización
de una de las actividades de divulgación de ciencias de la vida de mayor trayectoria en
la Fundación Ramón Areces.
Este año celebramos el 150 aniversario de la revista Nature y nos llena de orgullo
saber que, a lo largo de estos años, aunque las formas han cambiado desde el papel
hasta “la nube”, nuestro objetivo sigue siendo el mismo: ayudar a nuestros lectores a
entender y comprender el avance de la ciencia; asistirles en su trabajo y en la progre-
sión de su carrera profesional; y ayudarles a evaluar la trascendencia que cada avance
científico tiene en el contexto de la sociedad. Todos estos valores coinciden con la
misión de la Fundación Ramón Areces, a la que agradecemos que nos brinde esta estu-
penda oportunidad de colaborar en la organización de estas conferencias.
Agradecemos especialmente al Comité Científico, representado en esta mesa por
los Profesores Federico Mayor Zaragoza y José María Medina, que escogen cada año
un tema de gran relevancia científica e interés para el público en general. Al Director
General de la Fundación, el Sr. Raimundo Pérez-Hernández y Torra, y al Sr. Manuel
Azcona, Director de Comunicación, les agradecemos su compromiso para organizar
estas jornadas cada año.
“¿Será mi doctora sustituida por un robot?” “¿Predecirá una máquina si voy a pade-
cer cáncer?” Estas preguntas, que hasta hace poco solo se entendían en el entorno de
las películas o de las novelas de ciencia ficción, hoy en día están en la mente de muchos
de nosotros y son los retos que se han planteado los ponentes de esta tarde. La com-
binación de cantidades enormes de información médica, en particular imágenes, y
el desarrollo de algoritmos para extraer patrones de información y tomar decisiones
“inteligentes” a partir de los datos, han hecho avanzar rápidamente el diagnóstico, y ya
se ha observado que estos algoritmos aportan resultados tan buenos o incluso mejores
que los estándares establecidos por expertos.
Como nos explicará la Dra. Kara L. Davis, estos algoritmos inteligentes también
pueden ayudar a predecir los resultados de un medicamento en un paciente a nivel
individual, evitando así tratamientos innecesarios y mejorando la atención sanitaria.
Presentación
Además, escucharemos a la Dra. Jamie Paik describir cómo en su laboratorio cada día
desafían a la imaginación para desarrollar robots y otro tipo de herramientas capaces
de interaccionar con el ser humano de forma segura y eficiente, con el objetivo de ayu-
dar, entre otras situaciones, en tratamientos de rehabilitación.
Como con todos los avances tecnológicos, la implantación de herramientas de
inteligencia artificial en el campo de la Medicina y la automatización de muchos pro-
cesos nos plantean cuestiones éticas sobre qué se puede y se debe hacer dentro de este
campo. El Prof. Hernández-Orallo y el Dr. Tarek R. Besold nos ayudarán a entender
y plantearnos hasta dónde queremos llegar al “ceder” algunas de nuestras tareas a las
máquinas, y más concretamente, dentro del delicado campo de la Biomedicina y de los
datos de pacientes, nos ayudarán a comprender en qué nos pueden beneficiar todas
estas herramientas de inteligencia artificial y qué debemos exigirles a estas para ase-
gurar que incluyen valores éticos que permitan un desarrollo equitativo de nuestra
sociedad.
José, Tarek, Jamie y Kara, es para nosotros un honor que hayáis aceptado participar
en estas conferencias. Os estamos muy agradecidos y esperamos que disfrutéis de esta
experiencia tanto como nosotros.
Por último, quisiera dar las gracias a Erika Pastrana, Directora Editorial de las
revistas Nature, por la moderación de este evento. Tu gran profesionalidad y tu entu-
siasmo por la ciencia son parte del éxito de estas jornadas.
Muchas gracias a todos. Espero que disfruten de las conferencias y su debate
posterior. ❙
Soledad Santos
Directora Editorial España y Portugal
Springer Healthcare
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introducción
Erika Pastrana
Directora Editorial de Nature Research,
Nueva York, EE.UU.
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Introducción
E
n primer lugar, me gustaría reiterar nuestro ¿Por qué tiene ahora tanta importancia la inteli-
agradecimiento a la Fundación Ramón gencia artificial aplicada a la Biomedicina cuando sus
Areces. Muchos de los aquí presentes, al principios surgieron hace muchos años?
igual que yo, os dedicáis a la labor científica, y el papel Puede asociarse a que hoy en día la acumulación de
de una fundación como esta es de vital importancia, datos es una tarea fácil y barata, el poder de cómputo
ya que trae la ciencia presentada por investigadores de las máquinas está alcanzando, gracias al desarrollo
internacionales a nuestra ciudad, a nuestras calles y a del software y del hardware, unos niveles mucho más
nuestras universidades, promoviendo de esta forma el altos y todo ello lleva a que en este momento estemos
diálogo no solo de los expertos con la sociedad, sino asistiendo a un punto de inflexión.
también de la sociedad con los expertos. En la Biomedicina, como en otras ciencias, la
En esto consiste el acto de esta tarde. Podremos cantidad de información que obtenemos actual-
disfrutar de presentaciones de investigadores inter- mente es mucho mayor. Si pensáis en los disposi-
nacionales muy importantes en el campo de la inteli- tivos que lleváis con vosotros, todos los días están
gencia artificial y la Biomedicina. Primero asistiremos acumulando datos sobre vuestros comportamientos
a cuatro presentaciones de unos veinte minutos y y, en algunos casos, también sobre aspectos fisio-
luego escucharemos vuestras preguntas y opiniones lógicos. Los médicos tienen actualmente una gran
sobre la materia. capacidad para obtener detalles muy refinados sobre
Quiero agradecer a los ponentes que hayan venido cada célula y cada elemento de vuestro cuerpo. Por
desde tan lejos para presentar aquí sus trabajos y la gran ejemplo, como nos explicará la Dra. Davis, hoy en
importancia de la labor de divulgación científica que día se puede recopilar información de un tumor
desempeñan, probablemente ahora más que nunca. hasta un nivel mucho más sofisticado y detallado de
¿Por qué hemos elegido este año el tema del uso de la lo que se podía hace años.
inteligencia artificial en Biomedicina? Por último, el ejercicio de la práctica clínica está
Hoy en día es indudable la relevancia que la inteli- cambiando de un modelo basado en un soporte de
gencia artificial tiene en nuestras vidas, tanto por sus papel a un modelo digital. Todos los registros clínicos
aspectos positivos como por los posibles efectos nega- e información clínica están pasando a convertirse
tivos asociados a un mal uso de la misma. Es impor- en información digital. Con todo ello, un médico o
tante resaltar que el avance que estamos viendo a nivel un científico se encuentran con las manos atadas, ya
científico y su aplicación clínica son el resultado de que disponen de mucha información que no pueden
una inversión en ciencia básica de muchos años. Los manejar sin la ayuda de soportes informáticos, ya
principios básicos en los que se fundamenta lo que que la mente humana, por sí sola, no puede analizar
hoy denominamos inteligencia artificial, como el deep e interpretar tanto volumen de información. Es aquí
learning, se establecieron el siglo pasado. Ha sido la donde las ciencias del deep learning y la informática
financiación y la perseverancia de grupos de investiga- aportan su capacidad de interpretar gran cantidad de
dores, centrados en desarrollar esas ciencias básicas, lo información y dar claridad a esa nube de datos que
que ha permitido que hoy podamos hacer uso de ellas. de otra forma no podríamos entender.
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INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
Al igual que en otros campos, es importante hacer El Dr. Tarek R. Besold es Director de Inteligencia
un uso muy delicado de estas técnicas. Cabe resaltar que Artificial @ Telefónica Innovación Alpha Health y
en Biomedicina este uso seguro de los datos es de vital tiene una trayectoria diferente, ya que es experto en
importancia. Los datos que se manejan son de carácter ciencias cognitivas y ha estudiado cómo los humanos
muy sensible como, por ejemplo, datos médicos, perso- entendemos el conocimiento. Desde esa perspectiva,
nales y/o de comportamiento, y como sociedad debemos ha llegado a la inteligencia artificial, aportando el
tener cuidado de no usarlos de una manera que infrinja conocimiento del cerebro humano, y nos va a hablar
principios básicos de consentimiento y de privacidad. de la aplicación que está haciendo de las técnicas de
Otro reto lo constituye el hecho de que muchos inteligencia artificial y del conocimiento humano
de los algoritmos que analizan dicha información para desarrollar herramientas reales en el campo de la
se basan en los propios datos que les aportamos y, si Biomedicina. El Dr. Besold tiene mucho que decirnos
dichos datos no son representativos de la sociedad respecto a cómo desarrollarlas de forma ética, regu-
o están sesgados por representar solo a una parte, es lada y asegurando que la técnica conviva con nosotros
posible que tomemos decisiones que no puedan apli- de una forma segura.
carse a todos los individuos por igual. En tercer lugar, tendremos a la Dra. Jamie Paik, que
Por último, también hay un problema real, y es que nos visita desde Lausanne (Suiza), donde ejerce como
en ocasiones no entendemos cómo esos algoritmos Directora del Laboratorio de Robótica Reconfigurable
llegan a las conclusiones a las que llegan. El deep en la Universidad Politécnica. La robótica es un campo
learning, en particular, nos da una respuesta después muy importante de la inteligencia artificial porque
de haber observado cómo los informáticos son inca- los algoritmos y los datos por sí mismos no pueden
paces de explicar cómo un algoritmo ha sido capaz de avanzar si no van acompañados de un desarrollo del
llegar a una cierta conclusión. hardware. La Dra. Paik se ha especializado en el campo
Todos estos aspectos son los retos sobre los cuales de soft robotics (robótica flexible) y en la ciencia de los
nos van a hablar los ponentes de hoy, así como de la materiales y va a presentar los últimos avances sobre
importancia de desarrollar unos marcos científicos qué se puede hacer para convertir robots basados en
éticos y legales. origami en entes inteligentes.
Es un enorme placer para mí presentar a los cuatro Finalmente, vamos a tener la perspectiva clínica
ponentes de hoy. Cada uno de ellos ha llegado al de la Dra. Kara L. Davis, que aplica estas técnicas en
campo de la inteligencia artificial desde ámbitos muy el desarrollo de su profesión médica. La Dra. Davis
distintos que hoy van a compartir con nosotros. nos visita desde Stanford, California, donde lidera el
En primer lugar, vamos a escuchar al Profesor José Centro Bass del Instituto de Investigación en Salud
Hernández-Orallo, Catedrático de la Universidad Poli- y donde, además, ejerce como médica pediatra en la
técnica de Valencia, experto en ciencias de datos y de especialidad de Oncología infantil, concretamente
sistemas informáticos. Nos va a presentar una visión en el tratamiento de leucemias. Nos hablará de los
general y amplia sobre qué entendemos hoy en día retos y oportunidades del uso de la inteligencia
por inteligencia artificial, qué técnicas implica y los artificial para analizar datos a nivel molecular de
conceptos de inteligencia artificial de las máquinas tumores y, de esta manera, poder establecer cuáles
en relación con lo que conocemos de la inteligencia son las células responsables de que recaigan los
humana y cuáles son los parámetros más relevantes que pacientes y contribuir a diseñar mejores opciones
debemos entender para poder aplicar estas técnicas. de tratamiento para ellos. ❙
conferencias
• Inteligencia artificial y ciencia de datos: mirando
hacia el futuro
Prof. José Hernández-Orallo
Catedrático del Departamento de Sistemas Informáticos y Computación,
Universidad Politécnica de Valencia, Valencia, España
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Inteligencia artificial y ciencia de datos:
mirando hacia el futuro
Prof. José Hernández-Orallo
Catedrático del Departamento de Sistemas Informáticos y Computación, Universidad Politécnica de Valencia,
Valencia, España
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INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
han desarrollado particularmente estos últimos cinco son muy diferentes. No obstante, hoy en día todavía
años. Es tan falso pensar que podemos tener inteli- quedan muchos aspectos que desconocemos del
gencia artificial sin aprendizaje como pensar que solo propio funcionamiento cerebral.
es aprendizaje.
También hay que diferenciar el aprendizaje auto- ¿Por qué la importancia de las redes
mático del deep learning o aprendizaje profundo, que neuronales justo ahora, y no hace
en realidad es uno de los distintos tipos de aprendizaje 20 o 30 años cuando se empezó a hablar
automático. de ellas en el ámbito académico o las
universidades?
Además del avance que se ha producido en el algo
«A la hora de conjugar la
ritmo que subyace bajo las redes, hay tres componen-
inteligencia artificial y la ciencia tes fundamentales que han marcado su importancia en
de datos observamos muchos la actualidad. El primer componente es la gran capa-
elementos comunes, aunque cidad de almacenamiento de datos. En otras técnicas
se emplean más procesos de de aprendizaje automático, los resultados no mejoran,
aprendizaje en el caso de la aunque se les proporcionen más datos. Por el contra-
inteligencia artificial y más procesos rio, en las redes neuronales profundas, cuantos más
datos se proporcionen mejor resultado se obtiene y,
inductivos en la ciencia de datos.»
además, con un margen de saturación muy elevado.
El segundo componente es el desarrollo de chips es-
¿Por qué este boom del deep learning peciales en las tarjetas gráficas que permiten hacer gran
en estos momentos? cantidad de cálculos de forma mucho más eficiente que
A muchas técnicas de aprendizaje automático es nece- los chips convencionales. Por último, el concepto de
sario proporcionarles las características más relevantes modelos grandes, un aspecto poco intuitivo que se basa
sobre el problema que han de solucionar. Esto requiere en el principio de parsimonia, según el cual un modelo
un conocimiento manual, reconocer el dominio, y en muy grande se sobreajusta a los datos, dado que tiene
determinadas áreas, como la visión, esto es todavía muchos grados de libertad y necesita muchos ejemplos
muy complicado. para poder generalizar.
A partir de ejemplos, el sistema infiere automáti-
camente representaciones de distintas características
de la imagen, llegando incluso a distinguir entre dos «El deep learning está constituido
caras diferentes. La denominación de redes neuro-
por redes neuronales artificiales
nales artificiales se atribuye al paradigma conexio-
nista del sistema, con millones de conexiones entre
con numerosas capas, las cuales
dichas redes que se asemeja a las redes neuronales
van aprendiendo progresivamente
cerebrales, aunque hasta la fecha todavía son mucho representaciones cada vez más
más simples. Los mecanismos de estas redes pueden abstractas y en las capas más
parecerse en muchos aspectos a los mecanismos del profundas.»
cerebro, pero en otros modos de funcionamiento
Inteligencia artificial y ciencia de datos: mirando hacia el futuro | Prof. José Hernández-Orallo
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INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
cocineros, etc. Sin embargo, hace dos años se publicó una Papel de la inteligencia artificial
lista de la Universidad de Oxford en la cual la conclusión en la Biomedicina
era justo la opuesta; según esta lista, las profesiones mani- El potencial de la inteligencia artificial en la Bio
pulativas que no necesitan razonamiento a largo plazo medicina es muy claro. No hay ningún área en la cual
son aquellas que se van a reemplazar más rápidamente. sean más claros, tanto los beneficios como los riesgos.
Es un área que precisa de datos humanos y que, me-
¿Qué queremos que haga la inteligencia diante la aplicación del método científico, genera co-
artificial? nocimiento a partir de la evidencia acumulada. Las
En la Conferencia Asilomar (California) que se celebró posibles aplicaciones en genómica, técnicas de ima-
en 1975 para regular el tema de la investigación gené- gen, robótica, etc., son muchas y favorecen aspectos
tica y el ADN se sentaron las bases de la investigación como la prevención, el diagnóstico, el tratamiento y el
durante muchos años. Hace dos años asistimos a una manejo de muchas patologías; y también el cuidado de
conferencia en Asilomar para desarrollar una labor pa- los pacientes, la gestión de la salud y muchos más. Es
recida con el tema de la inteligencia artificial. En esta probablemente el ámbito de mayor interés, ya que se
conferencia hablamos de temas de seguridad, privaci- traduce en la obtención de claros beneficios, pero para
dad, confianza, inclusión, estándares, regulaciones, etc., ello los datos deben fluir de manera sencilla y segura.
y se mostró una voluntad, por parte de la comunidad
científica y personas responsables de la toma de decisio- Biomedicina: retos y riesgos
nes sobre inteligencia artificial, de establecer una regu- Los principales retos para una adecuada aplicación de la
lación y, además, se constató un deseo de proceder de inteligencia artificial en Biomedicina incluyen aspectos
forma correcta en el uso de la misma. éticos como la igualdad, la privacidad, la responsabi-
Por otro lado, hay una visión negativa de la inte- lidad, la seguridad o la sostenibilidad. Por ejemplo, la
ligencia artificial actual y su necesidad constante de aplicación del deep learning en grupos poblacionales
recopilar datos, particularmente en lo que respecta a pequeños, como en el caso de las enfermedades raras,
los datos humanos. Dentro del campo de la Medicina, estaría limitada por los escasos datos, que no permiti-
se incentiva cada día más la recolección de datos y rían desarrollar modelos predictivos precisos. En este
la realización de test. Esto puede relacionarse con el sentido, un reto importante es la integración del cono
hecho de que es relativamente barato y tiene la ventaja cimiento previo en Medicina en los modelos que se de-
de que en muchas ocasiones los datos recogidos para sarrollan.
solucionar un problema concreto pueden servir más Es fundamental resaltar que la inteligencia artificial
tarde para resolver otro. Sin embargo, para ello el está cambiando, pero el ser humano también. Ante este
manejo de datos debe realizarse de forma adecuada, continuo cambio, los modelos de tratamiento deben
solicitando el consentimiento del usuario impli- adaptarse y actualizarse. Hay que tener en cuenta
cado. De hecho, el que podamos confiar en la inteli- que en el futuro la inteligencia artificial también va a
gencia artificial, en el aprendizaje automático y en la modificar nuestras capacidades en muchos aspectos y
ciencia de datos depende de que realmente haya una puede proporcionarnos la posibilidad de suplir ciertas
regulación y de que todos los implicados, desde la habilidades, como corregir la pérdida de habilidades
investigación académica hasta las empresas y orga- cognitivas propias de la edad, de modo que será una
nismos públicos, actúen correctamente. alternativa a tratamientos más agresivos.
Inteligencia artificial y ciencia de datos: mirando hacia el futuro | Prof. José Hernández-Orallo
Entre los aspectos negativos del desarrollo de la Como resumen, cabe destacar que la inteli-
inteligencia artificial cabe mencionar la dependencia gencia artificial se puede aplicar en cualquier ámbito
cada vez mayor de estas tecnologías, lo cual favo- (personal, empresarial, en las administraciones
rece la atrofia mental y un estado más pasivo que públicas, etc.), al igual que la inteligencia, pero en
hay que cuidar particularmente en los niños. Otros el caso de la Biomedicina la aplicación es particu-
posibles riesgos en ámbitos médicos incluyen la falta larmente útil y sencilla, ya que comparten aspectos
de responsabilidad y confianza en su uso, la protec- como la metodología científica, el personal cuali-
ción de la identidad y el control que se realiza de estas ficado, el uso de protocolos, etc., que facilitan esta
herramientas. El uso creciente de la inteligencia artifi- implementación. Para ofrecer buenos resultados, la
cial puede favorecer que el siglo xxi se convierta en el inteligencia artificial precisa de la recopilación de
tiempo del “cerebro sedentario” y es importante cana- gran cantidad de datos humanos y es importante
lizar qué aspectos delegamos en estas tecnologías y valorar el posible impacto y asegurar un adecuado
cuáles seguimos desarrollando. manejo de estos.
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Desarrollo de la inteligencia artificial y
tecnologías éticas para el sector de la salud
Dr. Tarek R. Besold
Director de Inteligencia Artificial @ Telefónica Innovación Alpha Health, Barcelona, España
C
omienzo esta charla al hilo de lo comentado
por el Profesor Hernández-Orallo, y voy
a tratar de aclarar algunos de los aspectos
mencionados. Mi punto de vista es que no hay que
tener miedo al desarrollo e implementación de la inte-
ligencia artificial, ya que hay personas interesadas en
construir inteligencia artificial de una manera ética,
particularmente dentro del sector de la salud.
Justo ayer se publicó un informe de la Academy
of Medical Royal Colleges, disponible en internet, que
resume bastante bien el funcionamiento, las posibili-
dades, las oportunidades y los riesgos de la inteligencia
artificial en el campo de la salud. En la tercera y cuarta
página de los contenidos de este informe figuran diez
Dr. Tarek R. Besold
recomendaciones, la primera de las cuales señala que “los
responsables políticos deben evitar pensar que la inteli-
gencia artificial va a resolver todos los problemas a los certificarse su exactitud y calidad. Es responsabilidad
que se enfrentan los sistemas de salud del Reino Unido del gobierno decidir hasta qué punto se comparten los
(y del resto del mundo). La inteligencia artificial todavía datos de los usuarios. Muchas personas, cuando leen el
está en sus comienzos y su aplicación dentro de la aten- documento, solo leen que “los datos deben estar dispo-
ción sanitaria, a pesar de las afirmaciones de algunos de nibles”, pero la frase continúa “…para aquellos que
los líderes de opinión, es aún muy incipiente”. cumplen con el manejo de la información y los están-
En segundo lugar, en relación con los estándares, dares establecidos por el gobierno…”, por lo que son
como ya mencionó el Prof. Hernández-Orallo al los representantes electos de la ciudadanía los que
hablar de la ciencia de datos, cabe comentar que para deciden quién tiene acceso a los datos.
aquellos que cumplen con el manejo correcto de la En tercer lugar, es necesaria una evaluación crítica
información y con los estándares establecidos por el externa y transparencia por parte de las compañías
gobierno, debería facilitarse que dispongan de datos tecnológicas para que los clínicos estén seguros de que
provenientes del sector público y privado y debería las herramientas que les brindan son de uso seguro.
23
INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
Estos son los principales mensajes de mi presentación, medades infecciosas; y se han reducido enormemente las
que trataré de explicar en detalle a continuación. muertes por esta causa, por lo menos hasta el momento,
ya que han empezado a detectar cepas de microorga-
Propuesta de desarrollo de la inteligencia nismos con hiperresistencia que podrían cambiar la
artificial en el sector salud de Alpha Health tendencia de esta curva. Sin embargo, aún no hemos
En primer lugar, ¿quién soy y cuál es la organización descubierto cómo tratar las enfermedades crónicas, lo
para la que trabajo? Formamos parte del universo de que en la práctica se traduce en que vivimos más tiempo,
Telefónica, pero de alguna manera somos como los pero nuestra vida saludable no se extiende tanto como
inadaptados de la familia, porque nuestra misión sería nuestra esperanza de vida. Hoy en día vivimos entre cinco
la equivalente a fabricar naves espaciales con destino o diez años más que nuestros antepasados, pero solo dos
a la luna. Apuntamos hacia algún objetivo loco, pero de estos años son años saludables, por lo que durante
que sea plausiblemente posible. Si funciona, es genial los otros ocho años estamos básicamente tratando de
y realmente resolvemos un problema. Si no funciona, controlar las enfermedades típicas del envejecimiento. Al
nadie se sorprenderá. Asumimos grandes retos como, analizar cuáles son las principales causas de mortalidad
por ejemplo, aspectos relacionados con los 28 Objeti- podemos observar que el 70% de ellas se debe a enfer-
vos de Desarrollo Sostenible de las Naciones Unidas. La medades crónicas como el cáncer, los accidentes cerebro-
consecución de estos objetivos requiere que se busquen vasculares, la diabetes o los trastornos mentales. De este
soluciones radicales, por lo que, si son posibles, po- 70% de mortalidad asociado a enfermedades crónicas,
drían cambiar la manera que tenemos de ver el m
undo. alrededor del 75% se relaciona con los hábitos o el estilo
Requiere, además, tecnología avanzada, y cuando habla- de vida. El otro 25% está relacionado con la predisposi-
mos de tecnología de vanguardia nos referimos a plau- ción genética y factores ambientales.
sible. No se trata de viajes intergalácticos, no se trata de Por tanto, si modificamos nuestro estilo de vida
transmitir personas de A a B, sino de desarrollar proyec- podríamos influir sobre el 75% implicado en el
tos que creemos que deberían funcionar, para los cuales desarrollo de enfermedades crónicas. Si lo desglo-
hay pruebas académicas de que podrían funcionar, pero samos más, vemos que hay un total de entre cinco y
que todavía no han sido abordados a nivel industrial. La ocho comportamientos o conductas claves, entre los
combinación de estos tres aspectos constituye, básica- que destacan el ejercicio, el uso de sustancias (ya sean
mente, nuestro criterio para participar en un proyecto. drogas o medicamentos) o la calidad de las relaciones
La siguiente pregunta sería: ¿por qué estoy aquí interpersonales. Dentro de la salud mental, la calidad
hoy? Para explicarlo podemos analizar los datos de de las relaciones interpersonales puede darnos mucha
mortalidad de los Estados Unidos, desde el año 1900 información sobre la probabilidad de sufrir una depre-
hasta el año 2000. De estos datos se deduce que, por sión o una afección similar en el futuro.
un lado, se pueden ver buenas noticias, ya que hoy Teniendo esto en consideración, y añadiendo el
en día mueren menos personas que en el siglo xx. avance de estos últimos 30 años sobre el conocimiento
Por otro lado, las malas noticias son que en la actua- de cómo se forma y cómo funciona la conducta
lidad mueren aproximadamente la misma cantidad de humana, mi trabajo se centra en fomentar cambios de
personas que en el año 1960. comportamiento que reduzcan radicalmente la carga
¿Cuál es la diferencia? Sencillamente, tras el descu- de las enfermedades crónicas a nivel mundial centrán-
brimiento de la penicilina, se sabe cómo tratar las enfer- donos en las ocho conductas mencionadas. Para ello,
Desarrollo de la inteligencia artificial y tecnologías éticas para el sector de la salud | Dr. Tarek R. Besold
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INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
razonables y valores de peso para las pruebas presen- ingresos. Un ejemplo claro sería optar por un enfoque
tadas. Pero en ambos casos, de forma ideal, se requiere de aprendizaje automático tradicional que no preserva
que el médico contextualice toda la información de tal la privacidad, así también recogen datos de los usuarios
forma que pueda explicársela al paciente en términos (edad, sexo, salario) al tiempo que se proporciona un
comprensibles. Para ello, debe tener conocimiento servicio. A continuación, se introducen los datos en la
sobre su entorno de vida y sobre las relaciones causales red neuronal artificial, que aprende cómo la edad, el
entre las distintas partes. Esto mismo deberíamos sexo y el salario se correlacionan entre sí. Finalmente, la
exigir a los sistemas de inteligencia artificial, en espe- red neuronal entrenada se constituye como un modelo
cial, a aquellos aplicados al campo de la salud. que puede predecir el salario según la edad y el sexo o
viceversa, la edad en función del salario y el sexo, etc.
En esta situación podemos encontrarnos con dos pro-
«Dentro del campo de la salud,
blemas fundamentales; el primero sería que los usua-
podrían equipararse los sistemas rios no quieran compartir sus datos, y el segundo se
de aprendizaje automático relaciona con el hecho de que las empresas pueden usar
a los médicos. Los médicos modelos capacitados para revelar información de usua-
deben convertirse en modelos rios individuales, sin preservar la privacidad.
comprensibles para los pacientes Para evitarlo se han desarrollado técnicas que
y entregar el diagnóstico permiten aprender de una población sin poseer/revelar
información individual. Entre estas técnicas se encuen-
proporcionando indicadores bien
tran la encriptación o cifrado homomórfico total, el
conocidos de alto nivel revelados
aprendizaje federado, la computación multipartidista
en las pruebas (es decir, símbolos segura o los enclaves seguros. Muchas de estas técnicas
del sistema) sin dar información han demostrado teóricamente que funcionarían, pero
sobre cómo funcionan las pruebas aún no se han implementado. Desarrollaré un poco
médicas y las evaluaciones.» más el concepto de cifrado homomórfico total.
Dado que la idea del usuario no es compartir sus
datos, sino tener un proveedor de servicios, la pregunta
Inteligencia artificial y privacidad es: ¿Por qué no simplemente cifro mis datos antes de
Respecto al tema de la privacidad, actualmente la enviarlos? La respuesta es clara, si se envían datos
mayoría de las empresas de sistemas de datos propor- cifrados, el aprendizaje automático ya no funciona con
cionan sus servicios a cambio de obtener los datos de los la mayoría de los métodos actuales. No se obtienen
usuarios. De hecho, la mayoría de la tecnología actual datos, sino una versión encriptada de los mismos. En
necesita la información de las manos de los provee el ejemplo anterior se perdería, por ejemplo, la iden-
dores de servicios a los usuarios. Esta es la razón por tificación de sexo, salario y edad. Cuando se envían
la que estos modelos se denominan gratuitos, o mejor datos encriptados, el proveedor de servicios tiene que
dicho f reemium, ya que los datos son básicamente parte descifrar, entrenar el modelo, hacer una predicción y
del pago al proveedor de servicios al desarrollador de cifrar la predicción de nuevo para enviárselo al usuario
la aplicación. De tal forma que, posteriormente, el pro- y que él lo descifre. En los últimos diez años, las mate-
veedor de servicios puede utilizar información analítica máticas nos han permitido hacerlo y ahora ya es
adicional extraída de estos datos para obtener más factible debido a las mejoras en la computación que, a
27
INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
día de hoy, hace posible aprender de los datos cifrados, diversidad que está subrepresentada, aunque estamos
dado que existe una subcategoría de mecanismos de trabajando para solucionarlo con una buena perspec-
encriptación que lo permite. Es decir, estos meca- tiva de futuro.
nismos permiten realizar una clasificación o cualquier Por otro lado, cuando hablamos de datos, además
otro servicio de aprendizaje automático. La ventaja del propio dato, necesitamos etiquetarlos, de tal
es que podemos hacer un aprendizaje automático de forma que nos permita distinguir qué conjunto de
vanguardia sin ver los datos, y la desventaja es que, datos representa a un paciente sano y qué conjunto
desde la perspectiva de la empresa, estamos realizando de datos representa a un paciente poco saludable. Para
un aprendizaje automático de última generación sin obtener estos conjuntos de datos lo más frecuente es
poder disponer de los datos. recurrir a uno de los grandes proveedores en línea
que realizan una subasta entre personas que están
Inteligencia artificial y ética dispuestas a etiquetarlos y, dentro del entorno capita-
Para las personas involucradas en este campo, es ele- lista que trata de venderlo lo más barato posible. Así,
mental, además de considerar las diferentes opciones la mayoría del etiquetado de datos se realiza efecti-
éticas, comprometerse con alguna. Es importante valo- vamente en regiones económicamente pobres por
rar si el problema de salud que se quiere solucionar se grupos insuficientemente representados y vulnerables.
puede llevar a cabo respetando las limitaciones éticas; Ante esta situación, ¿se puede hacer esto y afirmar
ya que el problema que se desea solucionar y las priori- que se es ético? Y si no se hace, ¿qué significa eso para
dades éticas entran en conflicto con frecuencia. el flujo de ingresos ya que los costes aumentan?
Hay varias preguntas que plantearse y sobre las que Y, finalmente, ¿estamos dispuestos a someter una
reflexionar antes de desarrollar las herramientas de idea, producto, modelo de negocio y equipo a un
inteligencia artificial: ¿queremos ser éticos?, ¿queremos escrutinio público? El sector sanitario tiene la ventaja,
preservar la privacidad?, ¿queremos ser confiables?, al menos desde el punto de vista del paciente, de
¿queremos solucionar dolencias y queremos acceder a que está bastante regulado. El escrutinio público es
espacios como el cuidado de la salud donde las personas una necesidad, porque de lo contrario no se obtiene
son muy vulnerables? la aprobación de la Food and Drug Administration
Es importante determinar cuáles son las supo- estado
unidense, de las instituciones europeas o
siciones básicas subyacentes a la solución prevista nacionales correspondientes. Aun así, ¿cuántas de las
y determinar la necesidad de datos, de información grandes empresas de inteligencia artificial y aprendi-
confidencial, plantearse si será posible servir a todos zaje automático presentan de manera completamente
los grupos de clientes por igual, el modelo de negocio abierta al público sus principios y están dispuestas a
que se va a desarrollar y con quién se quiere asociar. aceptar totalmente el escrutinio público sobre ellos?
Un ejemplo clásico, que todavía sigue sucediendo, es En conclusión, como se comenta en el informe ante-
la baja representación de ciertos tonos de piel para riormente mencionado, tenemos una oportunidad real
el reconocimiento visual de las personas de color. con esta tecnología para ganar en tiempo y eficiencia,
La mayoría de los sensores de vídeo actuales tienen pero debe implementarse de forma segura y confiable.
todavía más dificultades para captar bordes en la piel Debemos estar juntos usuarios, médicos y proveedores
oscura que en la piel clara. En este sentido, hay que en este viaje de transformación. Es en parte una obliga-
ser conscientes de que hay al menos una dimensión de ción y en parte una invitación.
Robótica flexible para interaccionar
de manera intuitiva con los robots
Dra. Jamie Paik
Directora del Laboratorio de Robótica Reconfigurable, École Polytechnique Fédérale de Lausanne,
Lausanne, Suiza
A
ctualmente estamos viviendo un cambio de
paradigma en el diseño de los robots. Los
robots de nueva generación no se van a
limitar a estar en las fábricas o empresas, sino que van
a convivir e interaccionar con nuestra vida cotidiana.
El desarrollo de los robots industriales precisó de una
optimización del rendimiento mecánico.
Hoy en día dichos robots hacen un trabajo total-
mente programado y predecible y, en muchos casos,
son más rápidos, más precisos y más fuertes que sus
homólogos humanos. Los ingenieros y los especialistas
en robótica están trabajando actualmente para opti-
mizar las características de interactividad de los robots
con el fin de acercarlos a nuestra vida cotidiana, donde
el entorno es muy variable e impredecible, por lo que es
preciso desarrollar su adaptabilidad y seguridad.
Dra. Jamie Paik
29
INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
Mango
Modo 2D/3D
Modelo blando/rígido
Modo DoF adicional
31
INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
Aplicaciones del robot origami en salud presiones de aire, y con diferentes grados de libertad, se
Entre las aplicaciones en las que se está trabajan- simula el funcionamiento de los grupos musculares que
do actualmente se encuentra la cirugía de próxima se inflan si se bombea más sangre. Para crear un sistema
generación. Esto significa que se podrá perforar un muscular con microprocesadores individuales, como
orificio muy pequeño (en el estómago o para hacer en este caso, cada módulo se diseña con tres grados de
una biopsia en el cáncer de próstata o en diferentes libertad, lo que significa que se mueve en tres direc-
tipos de cáncer) con estos robots. Hoy en día, este tipo ciones en el espacio. Se pueden colocar cuatro de esos
de procedimiento ya lo realizan robots, el más cono módulos juntos como un bloque de Lego® y hacer
cido de ellos es el robot Da Vinci. Básicamente, el ciru- que funcione como los robots tradicionales. Lo que es
jano permanece detrás de la consola y dispone de un impresionante de estos sistemas es que, dependiendo
robot que está preajustado y que hace las incisiones. de cuántos grados de libertad se definan, se pueden
Utilizando una plataforma de origami, si es necesario, modificar los robots origami para que realicen otras
se puede añadir un nuevo instrumento simplemente funciones. Por ejemplo, el día de mañana se necesita
reconfigurando la forma. que el robot recoja un objeto más lejano, que sea más
Como se muestra en la imagen, en el robogami para fuerte o que tenga otro radio de curvatura adicional,
operar tenemos tres secciones diferentes: la sección esto es algo que normalmente no se puede hacer con los
origami 1, la sección giratoria y la sección origami 2, robots tradicionales; sin embargo, con el robot origami
que permiten cambiar el radio de curvatura. Al modi- sí se lograría porque cada bloque es como una pieza de
ficar el radio de curvatura, se puede tener una sola Lego® que nos permite agregar más acciones.
herramienta que realiza múltiples tareas, de tal forma Respecto a la “modularidad”, se puede disponer
que los cirujanos ya no tienen que perder tiempo de estos módulos para cubrir las diferentes partes
cambiando los instrumentos y se reducen los costes del cuerpo. En enfermos con Alzheimer o que se
generales de los procedimientos quirúrgicos. También están recuperando de un derrame cerebral se pueden
disponemos de “joystick hápticos plegables”, robots emplear módulos que cubran la parte superior de
muy pequeños con tres grados de libertad en la punta sus dedos, de tal forma que fuercen a los dedos del
de los dedos que permiten sentir el objeto, como en la paciente a moverse para coger mejor la cuchara o
realidad virtual. En el entorno de la realidad virtual cortar mejor. La ventaja es que se usa una acción muy
puede haber varios objetos y, si se usan las gafas de suave sin materiales duros o con armazones perso-
realidad virtual, no se sabe lo que realmente se toca, nalizados. Pero se puede ir aún más lejos y disponer
solo se ve. En el caso de una bola azul, una roja y una de accionadores más grandes que soporten incluso
negra, es posible diferenciarlas por el color, pero con decenas de kilogramos de peso. En este caso, el robot
el joystick que se ha desarrollado se podrían distin- no se desarrolla para rehabilitación o para pacientes
guir también en función de la textura o rigidez, de tal paralizados, sino para pacientes con dolor de espalda
forma que lo que se ve coincide con lo que se siente. Se crónico o trabajadores de la construcción que tienen
trata de una realidad tangible que combina lo que se ve que levantar una gran cantidad de peso durante
con lo que se percibe y se siente. mucho tiempo, perforar agujeros o usar martillos en
Y eso no es todo, esta plataforma basada en placas una posición incómoda, lo que puede acabar afec-
de origami varía en función de cómo se diseñe cada tando a su espalda. Estos dispositivos son una medida
placa. Si tiene un material diferente, en este caso preventiva para este tipo de trabajadores para mejorar
estamos usando goma de silicona y aplicando distintas sus condiciones de trabajo.
Robótica flexible para interaccionar de manera intuitiva con los robots | Dra. Jamie Paik
33
Potencial de la inteligencia artificial/
deep learning para mejorar el tratamiento
oncológico
Dra. Kara L. Davis
Departamento de Pediatría, Centro Bass del Instituto de Investigación en Salud y del Cáncer y Leucemias
Pediátricos, Universidad de Stanford, Stanford, Estados Unidos
E
n este ciclo de conferencias hemos descu-
bierto varios aspectos realmente emocio-
nantes y atractivos sobre el uso del deep
learning en diferentes ámbitos de nuestra sociedad.
En esta presentación se expone la experiencia de la
aplicación de la inteligencia artificial en el cuidado de
niños con leucemia.
Hace cien años la leucemia en la infancia era una
enfermedad fatal, tal y como refleja un informe de un
médico de Estados Unidos que describió el curso de
estos pacientes, los cuales sucumbían a la enferme-
dad en muy pocos meses. Pero en el transcurso de los
últimos 50 a 60 años se han llevado a cabo avances real-
mente increíbles en el manejo de los niños con leucemia
y, de hecho, casi se ha convertido en un claro ejemplo de
la importancia de la colaboración multidisciplinar para Dra. Kara L. Davis
35
INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
criterio Roma NCI, que se determina en el momento lución. Hoy por hoy se sabe que a los 7-10 años, un 80%
del diagnóstico según las características del paciente de los pacientes se curarán y un 20% recaerán.
cuando llega al hospital. Lo segundo que se analiza son Las preguntas que nos planteamos en la actualidad
los cambios genéticos generales, y de los cromosomas son, en el momento del diagnóstico, cuando el paciente
en particular, cuyos resultados tardan en saberse entre ingresa en el hospital por primera vez, ¿se puede prede-
1-2 semanas desde la llegada del paciente. Por último, se cir quién va a recaer y quién no?, ¿es posible distinguir
revisa la respuesta al tratamiento inicial que se valora al realmente qué células causarán la recaída y cómo tratar
mes o dos meses después de iniciar el tratamiento. al paciente más eficazmente?
El conjunto de esta información constituye lo que se Para responder a estas preguntas diseñamos un
denomina evaluación final del riesgo, en función de la estudio con una cohorte de 60 pacientes con leucemia
cual se tomarán las decisiones más adecuadas de trata- desde el momento en que fueron diagnosticados y un
miento para estos pacientes. Sin embargo, hay dos limi- grupo control con médula ósea sana. Determinamos
taciones principales en este enfoque; la primera es que a través de estudios de estimulación de células aisladas
hay cierta demora en conocer el riesgo, por lo que no se de alta dimensión qué proteínas tenían a nivel de células
puede saber el riesgo total de los pacientes hasta un par individuales de estos pacientes. Para ello, analizamos los
de meses después de su primer ingreso; la segunda limi- distintos tipos de proteínas mediante citometría de m
asas
tación es que no se trata de una predicción informativa, en cada una de las células extraídas de los p
acientes y los
se puede saber que el paciente corre un alto riesgo de controles. El primer problema que se nos p
lanteó en este
recaída, pero realmente no se sabe qué células no están estudio de células tumorales individuales fue la gran
respondiendo o qué hace que no respondan para poder heterogeneidad de las células estudiadas y la dificultad
adaptar el tratamiento de manera inteligente. para analizarlas. El objetivo entonces fue o
rganizarlas en
Ese ha sido el objetivo de nuestros estudios. Tra- bloques y tratar de obtener un modelo.
tamos de encontrar las poblaciones de células clínica
mente relevantes dentro de un tumor individual para ¿Cómo pasar de este conglomerado de
poder actuar lo antes posible. Por ejemplo, la pauta de información a un modelo de aprendizaje?
actuación actual en el diagnóstico de un paciente con Para ello, aplicamos el mismo enfoque a células B
cáncer es someterle a un tratamiento y evaluar su enfer- sanas de la médula ósea y analizamos en detalle cómo
medad mínima residual o la respuesta a la terapia en el era su proceso de maduración. Evaluamos los com-
curso de las siguientes semanas y esperar a ver su evo- ponentes principales de las poblaciones de células
normales y cómo las células de la leucemia se sitúan
en dicho rango de fenotipos, y comprobamos que los
«El paradigma de la recaída en patrones de las células B sanas y de las cancerígenas se
la leucemia es que las células que superponían. A partir de ahí desarrollamos un clasifi-
causan la recaída están presentes cador de desarrollo de células únicas, y en cada una de
desde el inicio de la enfermedad, las distintas etapas de poblaciones de células B sanas
escondidas, y se debe intentar analizamos la expresión de 11 proteínas principales.
detectarlas en los estadios Realizamos también este tipo de análisis en pacientes
tomando como base la expresión de estos marcadores, Pudimos observar que, tanto en nuestra cohorte de
qué poblaciones eran más similares a la población sana. entrenamiento como en la cohorte de validación, tenía
Por último, organizamos nuestros datos normali- mos un excelente poder predictivo basado en las áreas
zándolos según la progresión normal del desarrollo de bajo las curvas. Cuando comprobamos la curva de
células B y pudimos observar que, en comparación con Kaplan-Meier que valoraba el riesgo de tener o no una
las células sanas, las células B de pacientes con leucemia recaída según nuestro modelo, obtuvimos una fantás-
se expandían en la transición entre células pro-B y pre-B. tica separación entre los pacientes que efectivamente
Analizamos también otras características de las células, sufrían recaída y aquellos que no.
como la genética de pronóstico, y pudimos comprobar
que no había una gran diferencia, según la genética, en ¿Cómo funciona la aplicación de la
cómo se asentaban estas células en esta clasificación de inteligencia artificial/deep learning
desarrollo. Comprobamos también que para predecir la en la predicción del riesgo de recaída en
recaída no bastaba únicamente con tener en cuenta las comparación con lo que solemos hacer
diferencias observadas en la clasificación de desarrollo. cuando un paciente llega a la consulta?
En este punto recurrimos al aprendizaje automá- El criterio Roma NCI se ha utilizado durante décadas
tico. Disponíamos de datos de parámetros diferentes en la predicción del riesgo de recaída, al aplicar nuestro
medidos en 600.000 células de cada uno de los 60 modelo DDPR junto con el criterio Roma NCI mejorá-
pacientes. Para ello, extrajimos las características de bamos la separación entre los pacientes con alto riesgo de
dichos datos (proteínas fenotípicas, señal basal y señal recaída frente a la utilización exclusiva del criterio tradi-
inducida) en el momento del diagnóstico y las situa- cional. Obtuvimos la misma conclusión cuando analiza-
mos en un algoritmo de aprendizaje automático. Divi- mos la enfermedad mínima residual para valorar la velo-
dimos nuestra cohorte en un grupo de entrenamiento cidad de remisión de la leucemia después de comenzar el
con el 80% de las muestras y un grupo de prueba con tratamiento, confirmando que el modelo DDPR mejora
el 20% de las muestras. Lo llevamos al modelo reali- la predicción de manera estadísticamente significativa.
zando un total de 10 veces una validación cruzada y
obtuvimos la selección de las características celulares ¿Qué sucede realmente en la recaída?
que podían predecir con precisión una futura recaí- Una vez identificadas las características de señalización
da, denominando a este modelo predictor de recaída que predicen una futura recaída, nos preguntamos qué
dependiente del desarrollo (DDPR). podía suceder realmente en la recaída. Para ello obtu-
El modelo DDPR identificó seis características de vimos una muestra de los pacientes en el momento del
señalización presentes en el momento del diagnóstico diagnóstico y una muestra emparejada del paciente en
que podían predecir una futura recaída; dichas carac- el momento de la recaída y las clasificamos en pacientes
terísticas estaban básicamente confinadas a dos células que no recaen (muestra del diagnóstico y recaída) y
en particular (células pre-B y pro-B), presentes una a pacientes que sufren recaída (muestras del diagnóstico
continuación de la otra en el proceso de desarrollo de y momento de recaída).
las células B. La conclusión de estos hallazgos es que los Cuando analizamos las características de predic-
pacientes que van a recaer presentan altos niveles de ción, pudimos comprobar que estaban aumentadas
señalización al inicio y no pueden continuar activando significativamente en el momento de la recaída y que
esa señalización con nuestras estrategias de tratamiento. estaban ya presentes, aunque sin aumento s ignificativo,
37
INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
en el momento del diagnóstico. Esto significa que en DDPR podemos determinar el riesgo en una semana
los pacientes con recaída estas características de pre- desde que el paciente llega al hospital. Además, este
dicción no habían cambiado sustancialmente. Al pro- modelo permite realizar una predicción informativa.
fundizar en la biología comprobamos que en realidad Sabemos que alguien está en riesgo de recaída y pode-
se estaba produciendo una señalización dentro de la mos intensificar la terapia o realizar un trasplante de
misma red. Tres de las proteínas que habíamos identi- médula ósea. También se puede diseñar alguna célula
ficado son proteínas de señalización que aumentaban T mediante ingeniería genética que pueda unirse a la
entre el momento del diagnóstico y la recaída en algu- superficie de estas células y usar el sistema inmunoló-
nos pacientes. Empleamos una métrica diferente para gico para erradicarlas.
medir la fuerza de relación entre estas tres moléculas
y observamos que la fuerza de interacción se hace más ¿Cómo funciona la inteligencia artificial/
fuerte en la recaída; la población se hace más homogé- deep learning en el tratamiento del cáncer?
nea y se observa una conexión más estrecha entre estas En nuestro caso, lo que destacó fue la precisión para
moléculas. En este modelo de leucemia linfoblástica identificar pacientes en riesgo de recaída y poder acer-
aguda, algunas células están destinadas a la supervi- carnos a ellos clínicamente. Usando este tipo de téc-
vencia, por lo que en el momento en que el paciente nicas podemos profundizar en la biología y tratar de
llega por primera vez a la consulta, entre sus miles de preguntarnos qué tienen estas células que las hace resis-
millones de células, hay algunas que son las responsa- tentes y por qué sobrevivieron a la quimioterapia, para
bles de la recaída y quizás todas las otras medidas de así tratar de integrar todo este conocimiento con otros
estratificación del riesgo que empleamos pueden ser tipos de información. La secuenciación, por ejemplo,
indicadores de estas características. es algo que se está haciendo en la leucemia linfoblás-
tica para obtener información adicional y entender
¿Cómo nos ayudará la aplicación del modelo mejor la biología de estas células y cómo se relacionan
en la práctica clínica? entre sí. Clínicamente es importante plantearse cómo
Hemos mencionado, al inicio de esta presentación, las integramos esta técnica en los hospitales para que un
limitaciones de las medidas que empleamos actual- niño que vaya a cualquier hospital pueda hacerse esta
mente para la estratificación del riesgo. La primera es prueba y su médico le informe de los resultados. Debe-
la demora de meses en asignar el riesgo; con el modelo mos descubrir la manera de dirigirnos a estas células
para aprender más sobre ellas, entender cómo son y
cuáles son sus puntos débiles para atacarlas mejor y,
«Hemos identificado las células con suerte, que ningún niño recaiga.
Mesa redonda:
Prof. José Hernández-Orallo, Dr. Tarek R. Besold,
Dra. Jamie Paik y Dra. Kara L. Davis
39
Debate
El especialista en inteligencia arti- posgrado que estaba realizando estoy muy agradecida por haber
ficial, Prof. José Hernández-Orallo, un trabajo de aprendizaje automá- llegado a una respuesta a partir
ha afirmado que una de las limita- tico ejecutó muchas herramientas de los datos que hemos manejado
ciones de las actuales redes neuro- diferentes y empleó muchos tipos en nuestra investigación y tengo
nales profundas es que en muchas distintos de modelos de aprendi- que comentar que los resultados
ocasiones no entendemos cómo zaje automático para obtener resul- están en consonancia con lo publi-
llegan a determinadas conclusio- tados. Le comenté que no podía cado por otros investigadores. Las
nes. Asimismo, la Dra. Kara L. entender algo que tiene 100 carac- características que encontramos
Davis ha señalado algunos ejem- terísticas diferentes, que necesitaba tienen sentido; sin embargo, es un
plos realmente interesantes de cómo algo que me proporcionara una problema cuando se es consciente
la aplicación de esos algoritmos serie limitada de características de que los datos están en una caja
puede aportar nueva información que sean interpretables para mí negra y obtenemos resultados,
a los métodos tradicionales. Para como médico y biólogo. Creo que pero no sabemos interpretar lo que
iniciar el debate, la primera pre- eso es algo que hay que pensar. Es pasa. Esto constituye una limita-
gunta dirigida a todos los miembros posible que haya cientos de carac- ción en Biología y en la aplicación
de la mesa es que, si tenemos en terísticas que sean informativas, en Medicina, donde se precisan
cuenta estas limitaciones y el des- muchas aplicaciones distintas métodos transparentes e interpre-
conocimiento en muchas ocasiones con diferentes herramientas, pero tables.
de cómo los algoritmos llegan a esas debemos centrarnos en aquellos
conclusiones, ¿cómo podrían ser datos y en aquellas herramien- Prof. Hernández-Orallo: Creo que
las aplicaciones para la Biología?, tas que nos lleven a descubrir la esa es básicamente la idea funda-
¿existen limitaciones en la forma en respuesta que estamos buscando. mental: no hay solución para todos
que plantearemos nuevas preguntas Como con la mayoría de las cosas, los problemas. Se necesitan diferen-
en Medicina Clínica? puedo ir a pescar y encontrar tes herramientas para los distintos
muchas respuestas diferentes que problemas, y el deep learning no
Dra. Davis: Creo que es una pre- podrían estar respaldadas por los es la solución de todos los proble-
gunta excelente. Puedo darle un datos, pero en nuestro caso busca- mas. Incluso con la misma técnica
ejemplo: mientras trabajábamos mos información clínicamente sig- se pueden obtener diferentes resul-
en este asunto, una estudiante de nificativa e interpretable. Por ello, tados. Pero con 10 características
41
INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
o agregando más y ampliando el tras tanto, este conocimiento es lo que no sabemos por qué la inclu-
número de datos, se pueden obtener suficientemente bueno como para yen entre las personas desafor-
modelos más comprensibles. Sin considerarlo válido y emplearlo. tunadas. Pero hay un 8% que, en
embargo, hay algo que solemos Por otro lado, hay un cuestiona- comparación con la situación ante-
olvidar, y es que para muchas apli- miento social muy profundo que rior, no está en el lado malo. Este es
caciones hay muchas pruebas, sostiene que todo aquello que se el debate actual, se trata del efecto,
pero cuando preguntamos por qué demuestra es más científico, pero se trata de estar incluido o no. Si
lo ha clasificado como A o B, los en la actualidad afirma que puede le preguntas a un médico por qué
propios humanos no saben cómo basarse en uno de estos mecanis- hizo lo que hizo, estaremos ante un
explicar cómo han hecho la clasifi- mos de decisión. ¿Qué paciente análisis posracionalización. Hará
cación. Disponemos de herramien- tiene una mayor probabilidad de lo mejor dentro de lo que sean sus
tas que pueden interaccionar con recaída y qué paciente tiene una razones y esto puede extenderse o
esa persona, hacerle preguntas y mayor probabilidad de estar salu- no a las máquinas.
gracias a esas preguntas encontrar dable durante un tiempo más pro-
explicaciones. Hay muchas maneras longado? Teniendo en cuenta los Quiero preguntarles su opinión
de saber qué hay dentro de la caja recursos limitados, presumible- teniendo en cuenta la experiencia
negra, pero la principal consiste en mente la información determinará en los hospitales de Boston, en la
convertir la caja negra en reglas que esta decisión tan difícil sobre qué que se emplearon archivos de datos
puedan entenderse. paciente puede tratarse, y es pro- extensos para cada uno de los
bable que pongamos en desventaja pacientes. En esta experiencia cada
Dr. Besold: En mi opinión, hay a los que tienen menor probabi- médico disponía de una historia
por lo menos dos dimensiones lidad de supervivencia. La pre- clínica completa de cada paciente,
en la pregunta. Una tiene que ver gunta que tenemos que hacer a la pero la recopilación de tal canti-
con la filosofía de la ciencia, ¿qué sociedad no es solo respecto a los dad de datos resultó ser contrapro-
tipo de conocimiento se está pro- tratamientos contra el cáncer, sino ducente, en el sentido de que los
duciendo en este momento? No es para el trasplante de órganos, para médicos no podían manejar tanta
un conocimiento mecánico, pero cualquier decisión entre la vida y información y dejaron de propor-
presumiblemente puede añadirse la muerte. La sociedad estará feliz cionar datos sobre los pacientes. En
al conocimiento humano actual. si le decimos que antes de aplicar la práctica, y ante esta abundancia
Hay muchas ciencias que se basan estos métodos la tasa de mortali- de datos, ¿cuál es la mejor manera
en principios elementales, particu dad asociada a malas decisiones de ayudar a los médicos?, ¿creen
larmente las ciencias empíricas era del 10% y desde la implemen- que es positivo recopilar tanta
que miden un efecto y tratan de tación de estos métodos es del 2%. información y tendríamos, en tal
predecir la ruta hasta dicho efecto. Por otro lado, antes de aplicar estos caso, que reemplazar a aquellos
Y quizás nosotros estamos en el métodos podíamos preguntarle al médicos que no estén de acuerdo?
extremo opuesto de la ruta, en médico por qué recomendó una
un punto en que la respuesta está acción que resultó ser la equivo- Dra. Davis: Espero que no reem-
en algún lugar y tal vez alguien la cada. En el escenario del 2% vamos placemos a los médicos, aunque
descubra casualmente, pero mien- a tener que decirles a las personas estoy totalmente de acuerdo con
Debate
esa observación. En la mayoría de sé si realmente la gente sabe las años ochenta, no son un invento
los sistemas de salud se integran limitaciones de las personas que del año 2012. Los sistemas exper-
registros médicos electrónicos, por trabajaban en esta tarea ya en los tos de uso médico llevan desde
lo que hay una enorme cantidad de años ochenta y noventa, particu- los años ochenta y ahora están en
datos disponibles de cada paciente larmente en el área de la Medicina, nuestro entorno. Esto muestra las
y debo decir que suele estar que es distinta al resto de las áreas. limitaciones en su aplicación y en
mal organizada. Es complicado Los datos médicos están llenos de su incorporación al mercado. La
acceder, es difícil de interpretar y conocimiento muchas veces inútil, mayoría de los avances en tecnolo-
es difícil poder dar una respuesta interpretaciones e incertidumbre. gía de los años ochenta y noventa
al paciente. A veces, tanta informa- Teniendo en cuenta todos estos se aplican actualmente en el deep
ción no es la mejor opción, aunque problemas y limitaciones, no sé si learning. Lo que realmente ha cam-
en otras ocasiones desempeña la inteligencia artificial va a entrar biado es que ahora disponemos de
un papel importante. Tal y como de nuevo en un proceso de estan- nuevos avances en computación y
hemos comentado hoy, pueden camiento. en memoria. Una de las cosas que
desarrollarse aspectos para que el estamos haciendo actualmente es
sistema sea más inteligente, que Prof. Hernández-Orallo: Algunas volver a los años ochenta y rein-
se pueda realizar una “digestión” de de las cuestiones que se plantean vertir en técnicas que no se habían
los datos de tal forma que se agre- en este momento ya las habíamos aplicado. Estamos hablando de
guen sin que el médico tenga que visto en el pasado, y dentro de hacer las redes de comunicación
incorporarlos a través de cientos este campo hay muchas personas interpretables o aplicar métodos
y cientos de informes, y cientos y jóvenes brillantes que piensan que para extraer árboles de decisión
cientos de resultados de pruebas. van a salvar el mundo. Todas las de las redes. Creo que podemos
Realizarlo de forma que le permita áreas científicas tienen sus altos y mantenernos en este progreso
obtener los datos que necesita rápi- bajos, y no es solo la tecnología, y que disponemos de herramientas
damente y acceder a ellos fácil- sino también el contexto, lo que que lo facilitan.
mente sin tener que volver atrás hace que algo vaya más o menos
y leer todos los informes de los deprisa. El desarrollo que se ha Quiero hacer una pequeña aporta-
pacientes, que le llevaría mucho producido en estos últimos cinco ción a la discusión sobre las redes
tiempo. años no es sostenible. Los avances profundas como cajas negras. El
He trabajado en esta área de computación que se han apli- deep learning es una parte del
durante 33 años, soy doctor en cado a la inteligencia artificial, en aprendizaje con inteligencia artifi-
Medicina y profesor de inteli estos últimos años, no creo que se cial. Uno de los métodos es el análi-
gencia artificial. He trabajado con mantengan. sis de componentes principales y el
personas que llevan en esta área árbol de decisiones. Estos métodos
desde hace 50 años. Y lo que he Dr. Besold: En estos últimos años nos permiten observar las carac-
escuchado hoy aquí es algo que la tecnología se ha extendido terísticas más relevantes, e incluso
llevo escuchando en los últimos mucho más que anteriormente. en las redes profundas hay inves-
años respecto al conocimiento de Los primeros coches con sistema tigaciones que nos permiten retro-
las limitaciones en esta área. No de autoconducción son de los ceder y ver qué características son
43
INTELIGENCIA ARTIFICIAL APLICADA A LA BIOMEDICINA
las más importantes y disponer de una historia causal y las personas un feedback háptico real. El robot
métodos que permitan encontrar generalmente piden una explica- origami le permite tener un contacto
esas variables. ción que les permita comprender directo con los tejidos. En la reali-
tal conexión y saber cómo poder zación de las biopsias, y durante la
Dr. Besold: Este es el tipo de cosas llegar hasta ella. sutura, la razón fundamental para su
que estamos haciendo dentro de aplicación es el tamaño, ya que con
la inteligencia artificial explicable. Dra. Paik, me preguntaba si podría este robot podemos reducir la exten-
Estos métodos están aún en sus darnos un poco más de informa- sión y el diámetro de la sutura o la
etapas iniciales. En ocasiones, si ción sobre la aplicación del robot punción. Esto se debe a que dispone
intentamos hacer que las redes pro- origami en cirugía. ¿Es realmente de uniones controlables. Cuantas
fundas sean explotables, no fun- capaz de reproducir una biopsia? más juntas tenga, mayor será su
cionan tan bien y seguro que una ¿Sabe cómo hacer la punción en grado de libertad, y si tiene múlti-
máquina de vectores de soporte es el tejido? ¿Cómo lo haría y cómo ples uniones controlables significa
un componente principal. Todas sacaría el tejido del cuerpo? que necesita múltiples motores,
estas opciones están ahí, pero por lo que en otros tipos de herra-
muchas de las aplicaciones geniales Dra. Paik: Ya se han usado herra- mientas se necesitan muchos cables.
actualmente no se utilizan. mientas de este tipo en cirugía. La En nuestro caso, el poder modi-
Uno de los problemas principa- novedad de esta herramienta, en ficar selectivamente la rigidez de
les, incluso con estos métodos, es comparación con las otras, es que las juntas individuales nos permite
que pueden mostrar cuáles fueron el cirujano puede sostenerlo direc- controlar los grados de libertad sin
los factores que influyeron en tamente en sus manos sin tener que tener que incorporar motores direc-
cierta clasificación o resultado de manejar un sistema de mandos por tamente en el dispositivo, que es
automatización, pero no se obtiene separado, lo que le impediría tener extremadamente pequeño.
presentation
Soledad Santos
Editorial Director for Spain and Portugal,
Springer Healthcare
Artificial intelligence in biomedicine
45
Presentation
I
n this 11th edition of “Conferences and Debates on Science”, jointly organised
with Springer Nature, and under the title “Artificial Intelligence in
Biomedicine. What the future holds for us”, we address current major topics
thanks to the participation and collaboration of renowned personalities. There is no
doubt of the extraordinary progress that computer science applied to biomedicine has
experienced in recent years and the extraordinary impact that its implementation may
have, not only on data analysis, but also on favouring the diagnosis and decision-
making in treatment, as well as on increasing the capabilities of surgical techniques
with uses that were unimaginable some years ago.
Following the same trajectory, the 21st century will be the century of personalized
medicine. Today, we have data accumulation systems (Big data) that allow collecting
a huge amount of information, not only on patients’ symptoms, but also to assess the
impact of genetics and epigenetics, which, in addition, allow us to combine these data
at high speed and make the best therapeutic decision on this basis. Therefore, it is
worth investing in everything related to computing, computer science and health.
We must be aware that only some people can get the most out of these advances.
Today I want to recall the importance that aspects such as health, water and quality
education, considered as a priority by the United Nations, should be extended to
everyone.
By implementing these health advances, the future will bring something much
better from the perspective of human solidarity. Therefore, once again I am pleased to
welcome those representing Springer Nature and I hope they continue considering the
“Fundación Ramón Areces” as their home.
❙
47
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
W
elcome to the 11th Conference-debate, which is the result of the
collaboration between the “Fundación Ramón Areces” and
Springer Nature, will address the topic “Artificial Intelligence in
Biomedicine”.
For the whole team of Springer Nature in Spain, it is a great satisfaction to continue
this interesting collaboration with the “Fundación Ramón Areces” year after year and to
contribute thereby with its important mission of bringing state of the art science from
outside and within our borders, not only to our local scientific community, but also
to the public in general. It is an honour for us to contribute to the organization of one of
the longest dissemination activities in life science in the “Fundación Ramón Areces”.
This year we are celebrating the 150th anniversary of the Nature Journal and it
makes us proud to know that, throughout these years and despite changing from
hardcopy to digital format “the cloud”, our goal remains the same: to help our readers
to understand scientific progress; to help them in their work and career progression;
and to help them assess the relevance that every scientific advance has to society.
All these values are consistent with the mission of the “Fundación Ramón Areces”,
to whom we are thankful for giving us this great opportunity to collaborate in the
organisation of these conferences.
We especially thank the Scientific Committee, represented in this table by
Professors Federico Mayor Zaragoza and José María Medina, who each year choose a
topic of great scientific relevance and interest to the public in general. We also want to
thank Mr. Raimundo Pérez-Hernández y Torra, General Manager of the Foundation,
and Mr. Manuel Azcona, Director of Communications for their commitment in
organising this Conference every year.
Will my doctor be replaced by a robot? Will a machine predict if I get cancer? These
questions, that until recently were only seen in science fiction films or novels, nowadays
are in the mind of many of us and are the challenges faced by the speakers we will have
this afternoon. The combination of huge amounts of health information, particularly
images, and the development of algorithms to extract information patterns and make
“smart”, decisions based on data, have allowed a faster diagnosis. These algorithms
have already proved to provide results as good as, or even better than, the standards
set by experts.
As Dr. Kara L. Davis will tell us, these intelligent algorithms can also help us to
predict the outcome of a drug on a particular patient, thus avoiding unnecessary
treatments and improving healthcare. In addition, we will hear Dr. Jaime Paik telling
us how they defy imagination in their lab every day by developing robots and other
devices that safely and efficiently interact with the human being in order to help,
among other situations, in rehabilitation treatments.
Presentation
Soledad Santos
Editorial Director for Spain and Portugal
Springer Healthcare
49
introduction
Erika Pastrana
Editorial Director for Nature Research,
New York, USA.
51
Introduction
A
t the outset, I would like to reiterate our as deep learning, were established last century. The
gratitude to the “Fundación Ramón Areces”. funding and perseverance of groups of researchers
Many of the attendees, like me, are dedi- focused on developing these basic sciences is what
cated to scientific work, and the role of a foundation have allowed us to make use of them today.
such as this one is vitally important, since it brings sci- Why is artificial intelligence applied to biomedicine
ence presented by international researchers to our city, relevant nowadays if it began so many years ago?
our streets and our universities, thus promoting dia- It may be associated with the fact that today data
logue not only from experts to society, but also from collection is an easy and cheap task, the mechani-
society to experts. cal calculation power is reaching much higher levels
And this is the purpose of tonight’s event. We will – thanks to the development of software and hard-
enjoy lectures given by very important international ware – and this leads to the turning point at which
researchers in the field of artificial intelligence and we find ourselves nowadays.
biomedicine. You will listen to four presentations of In biomedicine, as in other sciences, the amount
around twenty minutes each and then we want to hear of information we currently collect is much greater.
your questions and opinions on the topic. If you think about the devices you carry with you,
I want to thank the lecturers for coming from so they are accumulating data about your behaviour
far away to show their work and the importance of the and, sometimes about your physiological aspects, on
dissemination of science they conduct, probably now a daily basis. Currently, physicians have increased
more than ever. their ability to obtain very refined details about each
Why have we chosen a topic such as the use of artifi- cell and each element of your body. For example, as
cial intelligence in biomedicine this year? Dr. Davis will explain, nowadays a lot of information
Today, the relevance of artificial intelligence in our on a tumour can be collected in a much more sophis-
lives, both for its positive aspects and the potential ticated and detailed way than some years ago.
negative effects associated with its misuse, is unques- The exercise of clinical practice is changing from
tionable. It is important to highlight that the progress a hardcopy-based model to a digital one. All clinical
that we are seeing at the scientific level and its clini- records and health information are becoming digital.
cal application is the result of an investment in basic With all this, a doctor or a scientist has his/her hands
science for many years. The basic principles on which tied, since he/she has a lot of information that cannot
what we call artificial intelligence today is based, such be handled without a computer aid. The human mind,
53
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
by itself, cannot analyse and interpret such a huge vol- we know of human intelligence and what the relevant
ume of information. It is here where the deep learning parameters are that we need to understand to be able
and computing sciences contribute with their ability to apply these techniques.
to interpret a lot of information and give clarity to that Second, Dr. Tarek R. Besold is Artificial Intel-
cloud of data that we would not otherwise understand. ligence Lead at Telefónica Innovation Alpha Health
As in other fields, it is important to make sensitive Lab. who has a different area of experience since he
use of these techniques. In biomedicine, the safe use is an expert in cognitive science and has studied how
of these data is paramount. Medical, personal and/or humans understand knowledge. From this perspec-
behavioural data are very sensitive, and as a society we tive, he has come to artificial intelligence providing
must be careful not to use them in a way that infringes his knowledge of the human brain, and he will talk
basic principles of consent and privacy. about the implementation of artificial intelligence and
Another challenge is the fact that many of the algo- human knowledge techniques to develop real tools in
rithms that analyse such information are based on the biomedicine. Dr. Besold has much to tell us about how
data we provide them with and, if such data are not to develop them in an ethical, regulated manner and to
representative of the society or are biased for repre- ensure that technology coexists safely with us.
senting only a part, we could make decisions that may Third, Dr. Jamie Paik, who comes from Lausanne
not apply to all individuals alike. (Switzerland) where she is the Director of the Reconfigu-
Finally, there is also a real problem, since some- rable Robotics Laboratory at the Polytechnic University,
times we do not understand how those algorithms will speak. Robotics is a very important field of artificial
reach the conclusions they do. Deep learning, in par- intelligence because algorithms and data cannot progress
ticular, gives us an answer after having observed how by themselves if not accompanied by the development of
computer scientists are unable to explain how an algo- hardware. Dr. Paik is specialized in the field of soft robot-
rithm has been able to reach a certain conclusion. ics (flexible robotics) and materials science and will pres-
All these aspects are the challenges our speak- ent the latest developments about what can be done to
ers will talk about today, as well as the importance of turn origami-based robots into intelligent entities.
developing scientific, ethical and legal frameworks. Finally, we will have the clinical perspective of
It is for me a great pleasure to introduce the four Dr. Kara L. Davis who applies these techniques in
speakers we will have today. Each of them has come her medical profession. Dr. Davis visits us from Stan-
to the field of artificial intelligence from very different ford, California, where she leads the Bass Centre of
areas that they will share with us today. the Health Research Institute and where she works as
First, we will listen to Professor José Hernández- paediatrician specialising in children’s oncology, spe-
Orallo, Professor at the Polytechnic University of cifically in the treatment of leukaemia. She will talk
Valencia, who is an expert on data science and infor- about the challenges and opportunities artificial intel-
mation systems. He will present a general and broad ligence offers when analysing tumour data at a molec-
vision about what we mean today by artificial intelli- ular level, determining which cells are responsible for
gence, what techniques are involved and the concept patient relapse and thus, designing better treatment
of machine artificial intelligence in relation to what options for these patients. ❙
• Artificial
lectures
intelligence and data science:
looking ahead
Prof. José Hernández-Orallo
Professor, Department of Computer Systems and Computation,
Polytechnic University of Valencia, Valencia, Spain
55
Artificial intelligence and data science:
looking ahead
Prof. José Hernández-Orallo
Professor of Data Science and Information Systems at the Polytechnic University of Valencia, Valencia, Spain
P
erhaps there is an idea that academics prefer
not to talk about the future. However, I do
because I have a license to be wrong. When
we talk about the present or the past we need to be
very strict, but when we talk about the future we
understand that we may be wrong.
In this talk I am going to give you the current and
future view of artificial intelligence and its relevance.
We can ask ourselves: why is artificial intelligence so
transformative and why do we think it can change
everything? From my viewpoint, we are talking about
intelligence, and the aim is that these artificial systems
will become intelligent. Intelligence is the basis of all
technologies; it has allowed our species to dominate
Prof. José Hernández-Orallo
the planet and has created culture and sciences such
as medicine. When we talk about new technologies,
we have to consider that many of them are based on
artificial intelligence. (which limits their use); however, there are others that
In turn, this relates to another area, such as data do bring knowledge and provide a new view on the use
science, which is able to generate evidence based of these techniques.
on the data collected, as we humans have done in Data science could be considered a “squared
different areas in a more or less conscious way over science”, particularly in those areas where knowledge
the centuries. is obtained from these data.
Data science will be a factory of knowledge that The view we have now is still very simplistic, since
will enable rational decision-making. We still do not it only considers artificial intelligence as machine
know how many of the tools used by data science, such learning. However, each day it is more evident that
as deep learning mentioned by Erika Pastrana, work artificial intelligence covers many more aspects, which
57
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
have been developed particularly in the last five years. networks may resemble the mechanisms of the brain
It is as false to think we can have artificial intelligence in many ways, but in other aspects of functioning they
without learning as to think that it is just learning. are very different. Nevertheless, many aspects of brain
In addition, we must also differentiate machine function are still currently unknown.
learning from deep learning, which is really one of the
various types of machine learning. Why are neural networks relevant now,
and not twenty or thirty years ago when
academics or universities started to talk
about them?
«When it comes to combining
In addition to the progress that has occurred in the
artificial intelligence and data algorithm that lies behind the networks, there are
science we see many common three fundamental components that have marked its
elements, although in artificial importance today. The first component is the great
intelligence more learning capability of data storage. In other machine learning
processes are used whereas in techniques, the results do not improve, even if you
data science the processes are give them more data. On the contrary, in deep neural
networks, the more data you provide, the better result
more inductive.»
is obtained and with a very high saturation margin.
The second component is the development of spe-
cial chips in graphic cards that allow a great number
Why is deep learning so relevant
of much more efficient calculations than conventional
these days?
chips. Lastly, is the concept of large models, which is a
Many machine learning techniques require providing
poor intuitive aspect. It is based on the principle of par-
them with the most relevant characteristics of the
simony by which a very large model is over-adjusted to
problem to solve. This requires a manual knowledge
data, since it has many degrees of freedom and needs
and recognition of the domain, and, in certain areas
many examples to be able to generalize.
(such as vision) this is still very complicated.
From examples, the system automatically infers
representations of different characteristics of the image, «Deep learning contains artificial
being able to distinguish even between two different neural networks with many
faces. The designation of artificial neural networks layers, which are progressively
is attributed to the system connectionist paradigm, learning increasingly abstract
with millions of connections amongst these networks representations and in the deeper
that resemble brain neural networks, although to date
layers.»
they are still much simpler. The mechanisms of these
· Building ethical
Artificialartificial
intelligence
intelligence
and data
andscience:
technology
Looking
for the
ahead | Prof.
health sector | Dr.
José Hernández-Orallo
Tarek R. Besold
59
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
What do we want artificial intelligence to do? diagnosis, treatment and management of many
The Asilomar Conference (California) that took place diseases, plus patient care health management and
in 1975 to regulate the issue of genetic and DNA many more. It is probably the area of greatest interest
research laid the foundations of research for many since it translates into clear benefits; however, for this
years. Two years ago we had a conference at Asilomar to happen, data must flow easily and safely.
to carry out similar work with the topic of artificial
intelligence. At this Conference we talked about safety, Biomedicine: challenges and risks
privacy, trust, inclusion, standards, regulations, etc. The main challenges for the adequate implementation
and the scientific community, and those responsible for of artificial intelligence in biomedicine include ethical
decision-making about artificial intelligence showed a aspects such as equality, privacy, responsibility, safety
willingness to create regulations. Furthermore, they and sustainability. For example, the implementation of
stated their desire to proceed correctly in its use. deep learning in small populations, as in rare diseases,
On the other hand, there is a negative perception would be limited by scant data that would not allow
of current artificial intelligence and its constant need the development of accurate predictive models. In this
for data collection, particularly human data. Within regard, an important challenge is the integration of
the medical field, data collection and test making is previous knowledge in medicine into models that are
being increasingly encouraged. This may be related to being developed.
the fact that it is relatively cheap and has the advantage It is important to highlight that artificial intelligence
that the data collected to solve a specific problem may is changing, as human beings are too. Before this
be useful in solving another one later on. However, continuous change, treatment models must be adapted
this data management must be adequately performed, and updated. It must be taken into account that,
requesting the consent of the involved user. In fact, the in the future, artificial intelligence is also going to
possibility of relying on artificial intelligence, machine change our abilities in many ways and can provide us
learning and data science depends on having a with the possibility of replacing certain skills, such as
regulation and that all those involved, from academic correct age-related cognitive decline, thus providing an
researchers to companies and public bodies, behave alternative to more aggressive treatments.
adequately. The negative aspects of the development of artificial
intelligence include the increasing dependence on
Role of artificial intelligence in biomedicine these technologies, which favours mental atrophy
The potential of artificial intelligence in biomedicine and a more passive state that must be taken care of,
is very clear. There is no area in which both benefits particularly in children. Other potential risks in
and risks are clearest. It is an area that requires human medical areas include the lack of responsibility and
data, and by applying the scientific method it generates trust in its use, identity protection and the control of
knowledge from accumulated evidence. Potential these tools. The increased use of artificial intelligence
applications in genomics, image techniques, robotics, can help the 21st century to become the century of
etc. are many and favour aspects such as prevention, the “sedentary brain” and it is important to decide
· Artificial intelligence and data science: Looking ahead | Prof. José Hernández-Orallo
which aspects we delegate in these technologies and biomedicine) share aspects such as scientific
and which we continue developing. methodology, skilled personnel, the use of protocols,
In summary, artificial intelligence can be etc., which facilitates this implementation.
applied in any field (personal, business, public To provide good results, artificial intelligence
administrations, etc.) as human intelligence, but requires the collection of large amounts of human
in biomedicine, its implementation is particularly data; it is important to assess the potential impact
useful and simple, since they (artificial intelligence and to ensure adequate management of these data.
61
Building ethical artificial intelligence
and technology for the health sector
Dr. Tarek R. Besold
Artificial Intelligence Lead @ Telefónica Innovation Alpha Health, Barcelona, Spain
I
will start this talk following what Professor
Hernández-Orallo has stated, and I will try
to clarify some of the aspects mentioned. My
viewpoint is that the development and implementation
of artificial intelligence must not be feared, since there
are people interested in building artificial intelligence
ethically, particularly in the health sector.
In February 2019, the Academy of Medical Royal
Colleges published a report, which is available on
the Internet, that sums up quite well the functioning,
possibilities, opportunities and risks of artificial
intelligence in the health sector. The third and fourth
pages of this report contain ten recommendations, the
first of which states: “politicians should avoid thinking Dr. Tarek R. Besold
63
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
Proposal of Alpha Health for building chronic diseases, which in practice means that we
artificial intelligence in the health sector live longer, but our healthy lifestyle does not extend
So who am I, and what does the organization I work as far as our expectancy of life. Today we live five to
for do? We are part of the Telefónica universe, but ten years longer than our ancestors, but only two of
somehow we are the misfits of the family, since our these years are healthy years, so in the other eight years
mission would be the equivalent of manufacturing we are basically trying to control the typical aging-
moonshots. We aim towards some crazy goal but it associated diseases. When analysing the leading causes
is one that is plausibly possible. If it works, it will be of mortality, we can see that 70% of them are due to
awesome and we will really solve a problem. If it fails, chronic diseases such as cancer, strokes, diabetes, or
no one will be surprised. We assume big challenges mental disorders. Out of this 70%, around 75% relates
such as, for example, aspects related to the twenty- to habits or lifestyle; the other 25% is related to genetic
eight United Nations sustainable development goals. predisposition and environmental factors.
The achievement of these goals requires seeking for Therefore, if we change our lifestyle we could
radical solutions so that, if they are possible, they influence the 75% involved in the development of
could change the way we see the world. In addition, it chronic diseases. If we break it down even more,
requires advanced technology and when we talk about we will see that there is a total of five to eight key
cutting-edge technology we refer to plausible tech. We behaviours or attitudes of which exercise, the use
are not talking about intergalactic travelling; it is not of substances (either drugs or medication) or the
about transporting people from A to B, but developing quality of interpersonal relationships, stand out.
projects that we believe could work, for which there Regarding mental health, the quality of interpersonal
is academic evidence that they may work; however, relationships can give us a lot of information about
they have not been addressed at the industrial level the probability of suffering depression or a similar
yet. The combination of these three aspects basically condition in the future.
constitutes our criteria for participating in a project. Therefore, taking this into consideration along with
The next question would be, why am I here the advances of the last thirty years in the knowledge
today? To explain it, we can analyse the US mortality of how behaviours are formed and how they work,
data between 1900 and 2000. From these data it can my work focuses on promoting behaviour changes
be deduced that, on the one hand, nowadays fewer that will dramatically reduce the burden of chronic
people die compared with the 20 century, which is
th
diseases worldwide centred on the eight behaviours/
good news. On the other hand, approximately the attitudes mentioned. Since we belong to Telefónica, the
same number of people who died in 1960 are dying intention is to build “a personal health assistant” that
nowadays, which is bad news. provides the patient with an effective way of improving
What’s the difference? Simply, since the discovery his/her health-related behaviours and of living a
of penicillin, we know how to treat infectious diseases, happier and healthier life. In this sense, we want to go
and deaths from this cause have been greatly reduced, a little further since we do not intend the assistant to
at least until now, since hyper-resistant strains of guide the patient, but the patient him/herself to be the
microorganisms are now being detected, which is leader, helping him/her effectively and efficiently to
something that could change the trend of this curve. feel the best health possible, increasing his/her healthy
However, we have not yet discovered how to treat life expectancy beyond the current one.
· Building ethical artificial intelligence and technology for the health sector | Dr. Tarek R. Besold
65
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
Artificial intelligence and privacy the machine learning no longer works with most
On the issue of privacy, most of the data system of the current methods. Only an encrypted version
companies are currently providing their services in of data are obtained. In the above example, the
exchange for obtaining data from users. In fact, most identification of gender, salary and age would be
of the current technology needs information from lost. When sending encrypted data, the service
the service providers to the users. This is the reason provider has to decrypt, train the model, make a
why these models are called free, or rather freemium, prediction and, again, encrypt the prediction to
since data are basically part of the payment of send it to the user who, in turn, will decode it. In
the service provider to the application developer. the last ten years, mathematics has allowed us to do
Subsequently, the service provider can use additional this, and it is now feasible due to improvements in
analytical information extracted from these data computing that, nowadays, make it possible to learn
to obtain more income. A clear example would be to from encrypted data since there is a subcategory
choose a traditional machine learning approach that of encryption mechanisms that allow it. That is to
does not protect privacy, but does collect data from say, these mechanisms allow a classification or any
users (age, sex, salary) while providing a service. other machine learning function. The advantage is
Then, these data are entered in the artificial neural that we can create cutting-edge machine learning
network that learns how age, sex and salary are without seeing data, and the disadvantage, from the
correlated to each other. Finally, the trained neural company’s viewpoint, is that we are making cutting-
network becomes a model that can predict salary edge machine learning without having data.
according to age and sex, or vice versa, the age based
on the salary and sex, etc. In this situation, we can Artificial intelligence and ethics
find two fundamental problems. The first is that users For the people involved in this field, besides
don’t want to share their data. The second relates considering the various ethical choices, it is essential
to the fact that companies can use models capable to comply with one of them. It is important to assess
of disclosing information of the individual users, if the health problem I want to solve can be done
without preserving their privacy. following the ethical limitations, since the problem
To avoid this, techniques that allow learning from to be solved and the ethical priorities often come into
a population without owning/disclosing individuals´ conflict.
information have been developed. These techniques There are several questions to ask and to reflect on
include encryption or fully homomorphic encryption, before developing artificial intelligence tools: Do we
federated learning, secure multi-party computation want to be ethical? Do we want to preserve privacy?
or secure enclaves. Many of these techniques Do we want to be reliable? Do we want to cure illness
have theoretically shown that they could work, and do we want to enter areas such as healthcare where
but have not yet been implemented. I will further people are very vulnerable?
develop the concept of fully homomorphic encryption. It is important to determine the basic assumptions
Since the user’s intention is not to share his/her underlying the expected solution and the need for data
data but to have a service provider, the question is: and confidential information; to consider whether
Why don’t I simply code my data before sending it will be possible to serve all customer groups alike;
it? The answer is clear: if encrypted data are sent, decide on the business model to develop; and decide
67
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
who to partner with. A classic example, which is still In this situation, can you do this and say you’re
happening, is the under-representation of certain skin ethical? And if you don’t do this, how would it affect
tones for visual recognition of people of colour; most your income flow since costs would increase?
of the current video sensors still have more difficulty And finally, are you ready to submit your idea,
capturing edges on dark skin than on fair skin. In product, business model and equipment to public
this sense, we must be aware that there is at least one scrutiny? The health sector has the advantage, at least
dimension of diversity that is underrepresented, from the patient viewpoint as it is strongly regulated.
although we are working to solve it with good prospects Public scrutiny is a necessity because otherwise the
for the future. approval of the US Food and Drug Administration
Also, when we talk about data, in addition to and similar European or national institutions would
the data themselves, we need to label them, which not be obtained. Even so, how many large companies
will allow us to distinguish between data sets that of artificial intelligence and machine learning openly
represent a healthy patient and data sets representing show their principles to the public and are willing to
an unhealthy patient. To obtain these data sets, we fully accept public scrutiny?
frequently go to one of the big online providers who In conclusion, as stated in the aforementioned
perform an auction among people who are willing report, we have a real opportunity to gain time and
to label them and, within the capitalist context, tries efficiency with this technology, but it should be
to sell them as cheaply as possible. Just like that, implemented safely and reliably. Users, physicians
most of the data labelling is performed effectively in and providers must be together in this journey of
economically poor regions by inadequately repre transformation. It is partly an obligation and partly an
sented and vulnerable groups. invitation.
Soft robotics for intuitive human robot
interaction
Dr. Jamie Paik
Director of Reconfigurable Robotics Laboratory at École Polytechnique Fédérale de Lausanne,
Lausanne, Switzerland
C
urrently we are experiencing a paradigm
shift in robotic design. New generation robots
won’t just be in factories or companies, they
are going to live with us and interact in our daily lives.
The development of the robotic industry required an
optimization of mechanical performance. Today these
robots perform a fully programmed and predictable
task and, in many cases, are faster, more precise and
stronger than their human counterparts.
Robotic engineers and specialists are now working
to optimize robot interaction features in order to
bring them closer to our everyday lives where the
environment is extremely variable and unpredictable,
so their adaptability and safety requires development.
69
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
Reconfigurable robots which the movement of one side of the face does
At this point, we considered whether it would not match the other side. Although it may seem
be possible to design a robot that can, and have futuristic, this type of device can be adapted to the
flexibility to develop various tasks. This robot could person’s facial muscles, so he/she can recover his/her
not have a single shape or develop a single task, smile and expressions.
and this is how we developed origami robots. To do The manufacturing process is similar to the
this, we used materials such as silicone, rubber and current mass production system, using a conveyor
sponge-like materials, which are the materials that belt where multiple components are incorporated
new generation robots are made of, which allow the and assembled to build the final product. The various
design to meet the four aforementioned features for an materials are taken, and depending on the shape of
ideal design. The materials deform when receiving a the device, the outer layer and the rest of the layers
stimulus, but they subsequently return to their original are cut and assembled in a sandwich shape. Various
shape. components, such as the microprocessor and sensors,
The composition of these robots is modular, are incorporated into each layer.
with multiple layers in a sandwich shape that can be This way, an origami robot can be built
assembled or disassembled depending on the task depending on its application. For example, the
or the environment, so they can change form and origami robots can fall from the sky and then the
become a walking robot or a surface that balances multi-agents can communicate among them to
a ball on its top. In addition, each of the layers find a missing person or various devices when the
is equipped with intelligent sensors that interact GPS does not work and the tracking is done in
with both the environment and the people. More darkness. During the process, devices may be lost
specifically, the modular structure allows the robot to or damaged, but this would not have much impact
adapt to the human body in a flexible way. You can since there are hundreds of them. In the traditional
carry it around your body and when required, the robot, depending on the tasks it performs,
robot may become autonomous. In addition, this engineers have to design various communication
modular structure allows it to be customized, and modes or different types of motion, and if any
the manufacturing is much cheaper, since even the additional new function is required, they have to
logo is reconfigurable. start all over again.
Handle
2D/3D mode
SOFT/STIFF mode
Extra DoF mode
71
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
which allow the radius of curvature to be changed. Regarding “modularity”, you can use these modules
When changing the radius of curvature, you can to cover different parts of the body. In patients with
have a single tool that develops multiple tasks, so Alzheimer disease or who are recovering from a
that surgeons no longer have to waste time changing stroke, we can place these modules on the top of their
instruments, and the overall costs of surgical fingers, so the patient’s fingers are forced to move
procedures are reduced. We also have “foldable and the way they grab the spoon or cut with a knife
haptic joysticks”, which are very small robots with is improved. The advantage is that a very mild action is
three degrees of freedom at the tip of the fingers that used without using hard or custom-framed materials.
allow you to feel the object, as in virtual reality. In the We can go even further and have larger actuators,
environment of virtual reality there may be several which can withstand even tens of kilograms of weight.
objects, and if you are using virtual reality goggles, In this case, we don’t develop it for rehabilitation or for
you don’t know what you are really touching, you just paralyzed patients, but for patients with chronic back
see it. If a blue ball, a black ball and a red ball are pain or for construction workers who have to lift heavy
shown, you can differentiate them by colour, but with weights for too long or to drill holes or use hammers in
the joystick you can also differentiate them by their an awkward position, which will eventually affect their
texture or stiffness, so what you see matches what you back. These devices are a preventive measure for these
feel; it is a tangible reality. And that is not all: this workers and help to improve their working conditions.
origami module-based platform varies depending on Another application of this technology is for
how you design each module. If you have a different mechanical feedback in virtual work. In a situation where
material (in this case we are using silicone rubber) you are working with a virtual environment to climb a
and you apply different air pressures and different mountain, these systems would allow you to change the
degrees of freedom, it may simulate the functioning user´s (your) rigidity and make you feel as if you were
of muscle groups that inflate if more blood is pumped. carrying a heavy weight or that weight was pushed by
If we want to create a muscle system with individual someone else. You would feel that someone is touching
microprocessors in this case, each module has three you or you are moving different objects. In addition,
degrees of freedom, which means that it moves in the interesting thing is to combine static feedback with
three directions in space, and we can assemble four of virtual reality goggles; then, an additional sense can be
these modules like a Lego® block and make it operate added – a smaller sense like texture – allowing you to
as traditional robots do. experience a completely different way of communicating.
What is impressive about these systems is that, The device can help the user to maintain balance. Thus,
depending on how many degrees of freedom are if somebody needs someone else to assist him/her or it
defined, the origami robots can be modified to perform is winter and he/she has to walk on snow, this device
other functions. For example, tomorrow you need the will give him/her immediate assistance (e.g. if he/she is
robot to pick up a more distant object or you want it to about to fall), but when the device is not needed, it will
be stronger or to have an additional bending radius; this be passive. These devices also help with gait recovery if
is something you cannot usually do with the traditional you have been without activity for a long time due to a
robots. However, with the origami robot you can leg break or, if you are a completely healthy person, it can
because each block is like a piece of Lego that allows
®
help you to correct form and posture in sports training,
you to add more actions. and to correct your swing in golf or tennis, for example.
· Soft robotics for intuitive human robot interaction | Dr. Jamie Paik
73
Potential of artificial intelligence/deep
learning methods to improve cancer care
Dr. Kara L. Davis
Pediatric Cancer and Blood Diseases Stanford Child Health Research Institute. Bass Center for Childhood
Cancer and Blood Disorders, Stanford University, Stanford, USA
I
n this cycle of lectures, we have found several
really exciting and challenging aspects on the
use of deep learning in various areas of our so-
ciety. This presentation describes the experience of the
application of artificial intelligence in the care of chil-
dren with leukaemia.
A hundred years ago, infant leukaemia was a
universally fatal disease, as stated by a report from
a US physician, which described the course of the
disease in these patients who succumbed to it within a
few months. But in the last fifty to sixty years, amazing
advances have been made in the care of children
with leukaemia and, in fact, it has almost become a
clear example of the importance of multidisciplinary
collaboration for cancer treatment. The progress
has been such that in the 1960s only around 20%
Dr. Kara L. Davis
of patients survived leukaemia and nowadays we
are curing more than 90% of the children with this
condition. However, the real problem of this disease
is the patient’s relapse because when the disease How do we clinically address relapse and
reappears after the initial treatment, it is very difficult its prediction when a patient comes to
to treat. the hospital?
These are studies of the 1980s and early 2000, and in When a patient arrives at the hospital it is important
a clinical trial in which Dr. Kara L. Davis participated to be able to inform his/her family of what the child’s
last year, genetic engineering of T cells was used in chances are. To do this, different types of information
patients who failed the initial treatment. The outcomes must be collected. The first information corresponds to
of all these studies show that more than half of those clinical data based on NCI Rome criteria determined
whose treatment failed die as a result of this disease. at the time of diagnosis according to the characteristics
75
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
of the patient upon hospital admission. The second known that in seven to ten years, 80% of patients will
type of information analysed are general genetic be cured and 20% will relapse.
changes, and chromosomal changes in particular, the The questions we ask ourselves nowadays are, at
results of which take between one and two weeks from the time of diagnosis when the patient is admitted
the date of the patient’s hospitalization. to the hospital for the first time, can I predict who
Finally, the patient´s response to the initial will relapse and who will not? Is it really possible
treatment is reviewed, one or two months after to determine which cells are causing relapse and
starting treatment. All this information constitutes how to treat the patient more effectively?
what it is called final risk assessment on the basis of To answer these questions, we designed a study
which the most appropriate treatment decisions will with a cohort of sixty patients with leukaemia from
be made for these patients. However, there are two the time they were diagnosed and a control group
main limitations in this approach. with healthy bone marrow, and we conducted a
The first limitation is that there is some delay in high dimension isolated cells approach in which we
getting to know the risk, so I don’t know what the total determined proteins of single cells in these patients.
risk of my patients will be until a couple of months To do this, we analysed the various types of proteins
after their hospitalization; the second limitation is in each of the cells extracted from the patients using
that it is not an informative prediction, so I know that mass cytometry. The first problem we encountered in
the patient has a high risk of relapse, but I don’t really this study of individual cells in cancer was the great
know which cells are not responding or what makes heterogeneity of tumour cells and the difficulty in
them unresponsive as to be able to intelligently adapt analysing them. Then, the objective was to organize
treatment. them into blocks and try to obtain a model.
This has been the goal of our studies. We try to
find clinically relevant cell populations within a single How can I turn this conglomerate of
tumour to be able to act as soon as possible. For information into a learning model?
example, the current course of action in the diagnosis For this purpose, we applied the same approach, first
of a patient with cancer is giving him/her a treatment to healthy bone marrow B cells and analysed in detail
and evaluating its minimal residual disease or the what their maturation process was. We assessed the
response to therapy in the course of the following main components of normal cell populations and
weeks, and then wait for its evolution. Today it is how leukaemia cells are located in this phenotyping
space, confirming that both cancer and healthy B
cells overlapped. Starting from there, we developed a
Finally, we organized our data normalizing them risk of having a relapse or not according to our model,
according to the normal development of B cells and we obtained a clear distinction between the patients
we could see that, compared to healthy cells, B cells who actually had relapsed and those who did not.
from patients with leukaemia expanded across the
pro-B to pre-B transition. We also analysed other cell How does the implementation of
features, such as the prognosis genetics, and we saw artificial intelligence/deep learning work
that there was not a great difference on how these cells in predicting the risk of relapse when
fell into this developmental classification according compared to what we usually do when a
to genetics. We also noted that the differences seen patient comes to the office?
in developmental classification was not enough to NCI Rome criteria have been used for decades to
predict relapse. predict the risk of relapse and we saw that when
At this point we used machine learning. We DDPR was added to these criteria, the distinction
had data from different parameters measured in between patients with a high or low risk of relapse
600,000 cells from each of the sixty patients. To do compared with the use of NCI Rome criteria alone
this, we extracted the characteristics of such data was improved. We reached the same conclusion when
(phenotypic proteins, basal signaling and induced we looked at the minimal residual disease to assess
signaling) at the time of diagnosis and entered them the remission rate for leukaemia after treatment had
in a machine learning algorithm. We divided our begun, confirming that the DDPR model statistically
cohort into two groups: a training group with 80% of significantly improves the prediction.
the samples and a test group with 20% of the samples.
We took it to the model performing a ten-fold cross- What does really happen at relapse?
validation, and obtained the selection of cellular Once the signaling features that can predict a future
features that could accurately predict a future relapse, relapse are identified, we wondered what could really
naming this model the developmentally dependent happen in the relapse. To this end we obtained a
predictor of relapse (DDPR). sample from each patient at the time of diagnosis and
The DDPR model identified six signaling features a matched sample at the time of relapse, and classified
present at the time of diagnosis that could predict a them as patients who do not relapse (diagnosis and
future relapse; these features were basically confined relapse sample) and patients who relapse (diagnosis
into two cells in particular (pre-B and pro-B cells), and time of relapse samples).
which were one after the other in the development When analysing prediction features, we saw that
process. The conclusion from these findings is that they were significantly increased at the time of relapse
patients who are going to relapse have high levels of and were already present, although without significant
signaling to start with and cannot continue activating increase, at the time of the diagnosis, which means
this signaling when we are trying to disturb such that in relapsing patients these prediction features had
activating signaling. We saw that we had excellent not substantially changed. Delving into biology we
predictive power based on the area under the curves in confirmed that a signaling within the same network
both the training and the validation groups. When we was occurring. Three of the proteins we identified were
checked the Kaplan-Meier curve, which assessed the signaling proteins that increased between the times
77
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
of diagnosis and relapse in some patients. We used Some T cells can be synthesized by genetic
a different meter for measuring the strength of the engineering that can attach to the surface of the cells
relationship among these three molecules and noted responsible for relapse and use the immune system to
that the strength of interaction becomes stronger in the eradicate them.
relapse, the population becomes more homogeneous
and the connection among these molecules is closer. How does artificial intelligence/deep
In this model of acute lymphoblastic leukaemia, some learning work in the treatment of cancer?
cells are intended for survival, so when the patient In our case, the precision to identify patients at
comes to the clinic for the first time, among the billions risk of relapse and the possibility to approach them
of cells there are some that are responsible for relapse. clinically stood out. Using these types of techniques
Perhaps all other measures of risk stratification we use can delve into biology and we can ask ourselves,
can be indicators of these features. what do these cells have that makes them resistant?
Why did they survive chemotherapy? We can then
How do we think that the implementation try to integrate all this knowledge with other types of
of the model will help in clinical practice? information. Sequencing, for example, is something
We have mentioned the limitations of the measures that is being done in lymphoblastic leukaemia in
that we currently use for risk stratification at the order to acquire additional information and to be
beginning of this presentation. The first is the delay (in able to better understand the biology of these cells
months) in assigning a risk, whereas we can determine and how they relate to each other.
the risk within a week from the time the patient Clinically, it is important to consider how we
arrives at the hospital using this model. In addition, integrate this technique in hospitals so that any child
this model allows an informative prediction. We know who is admitted in any hospital can have this test done
that someone is at risk of relapse and we can intensify and his/her doctor can inform them of the results. We
treatment or perform a bone marrow transplant. must find a way to target these cells so we can learn
more about them, and to understand how they work
and what their weaknesses are in order to attack them
«We have identified the cells better; hopefully then, no child will relapse.
responsible for relapse and the This is the approach we have used for this
proteins involved, so now we particular disease, but it can be extended to many other
diseases. Specifically, in our Lab we are applying these
can target the treatment to any
techniques to other types of leukaemia and to solid
molecule that acts as an inhibitor
tumours. The main objective is to manage the most
of this signaling process.» important aspects of the disease to ensure the healing
of the patient.
discussion
Moderator:
Erika Pastrana
Round table:
Prof. José Hernández-Orallo, Dr. Tarek R. Besold,
Dr. Jamie Paik and Dr. Kara L. Davis
79
Discussion
The specialist in artificial intelli- rent tools and employed many other researchers. The features we
gence, Prof. José Hernández-Orallo, different types of machine learning find make sense; however, it is a
has affirmed that one of the limita- models to get results. I told her that problem when you are aware that
tions of current deep neural networks I could not understand something the data are in a black box and we
is that many times we do not unders- that has a hundred different featu- do get results, but do not know
tand how they reach certain conclu- res. I need something that can give how to interpret what happens.
sions. Dr. Kara L. Davis has also me a limited set of features that This is a limitation in biology and
pointed out some really interesting are interpretable for me as a physi- in the implementation in medicine
examples of how implementing these cian and a biologist. I think that is where transparent and interpreta-
algorithms can bring new informa- something to consider. There may ble methods are required.
tion to the traditional methods. To be hundreds of informative featu-
start the debate, the first question to res, and many different applica- Prof. Hernández-Orallo: I think
ask to all the members of the panel tions with different tools, but we that’s basically the main idea: t here
discussion is: If we consider these must think about focusing on the is no solution for all problems.
limitations and many times the lack data and the tools that can take us Different problems require diffe-
of knowledge on how algorithms to the answer we’re looking for. As rent tools, and deep learning is not
reach those conclusions, how can with most things, I can go fishing the solution to all problems. Even
they be applied in biology? Are there and find many different answers with the same technique, different
limitations in the way we ask new that may be supported by data, results may be reached. But with ten
questions in clinical medicine? but in our case we are looking for features or by adding more featu-
clinically meaningful and inter- res and increasing the number of
Dr. Davis: I think it is an excellent pretable information. Therefore, I data, more understandable models
question. I can give you an example. am very grateful to have been able may be obtained. However, there
While we were working on this to reach an answer from the data is something we tend to forget,
issue, a post-graduate student who we have handled in our research, which is that for many applications
was doing work on machine and I must add that the results are there are many tests, but when we
learning implemented many diffe- consistent with those published by ask why it has been classified as A
81
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
or B, even humans do not know which patient has a better chance I would like to ask your
how to explain how this classifi- of being healthy for a longer time? opinion taking into account the
cation was done. We have tools Given the limited resources, presu- experience in Boston hospitals
that can interact with that person, mably, the information will deter- where extensive data files were
ask questions, and thanks to these mine this difficult decision about used for each patient. In this
questions find explanations. There which patient can be treated; thus experience, each physician had a
are many ways of knowing what’s those who have less chance of complete history for each patient,
inside the black box, but the main survival may be at a disadvan- but the collection of such a huge
one consists of turning the black tage. The question that we have to amount of data proved to be
box into understandable rules. ask society is not only regarding counterproductive since physi-
treatments against cancer, but cians were not able to handle
Dr. Besol: In my opinion, there also for organ transplantation or that much information and they
are at least two dimensions in for any decision between life and stopped giving patient informa-
the question. One has to do with the death. Society will be happy if we tion. In practice, do you believe
philosophy of science: What kind say that before implementing these that the best way to help physi-
of knowledge is currently being methods, mortality associated with cians is by providing them with
produced? It is not a mechani- poor decisions was 10% and from such a large amount of data? Do
cal knowledge, but presumably the time we implemented these you think that it is positive to
it may be added to the current methods, it has come down to gather so much information and,
human knowledge. There are many 2%. However, before implemen- in that case, would we have to
sciences based on elementary ting these methods we could ask replace those physicians who do
principles, particularly empirical the physician why he/she recom- not agree?
sciences that measure an effect and mended an action that turned out
try to predict the path to this effect. to be wrong. In the 2% scenario Dr. Davis: I hope we do not replace
And perhaps we are at one end we will have to tell people that we physicians, although I totally
of the path, at a point where the don’t know why they are included agree with that observation. In
answer is somewhere and someone among the unfortunate individuals. most health systems that integrate
may discover it eventually; but But there is an 8%, compared with electronic medical records, there is
meanwhile, this knowledge is good the previous situation, which is not an enormous amount of data availa-
enough to consider it valid and on the bad side. This is the current ble on each patient and I must say
to use it. However, there is a very debate: it’s about the effect, it’s that it tends to be poorly organised.
profound social questioning that about being included or not. If you It is difficult to access, difficult to
says that everything that is proven ask a physician, why did you do interpret, and thus, it is difficult
is more scientific, but currently that? This is a post-rationalisation to give an answer to the patient.
states that it can be based on one of analysis. He/she will do the best to Sometimes, so much information is
these decision mechanisms. Which his/her knowledge and this can be not the best option, although other
patient is more likely to relapse and extended or not to machines. times it plays an important role, as
Discussion
we have discussed today, and some will become a standstill process 1980s and reinvesting in techniques
aspects may be developed to make once more. that were never implemented. We
the system more intelligent and Prof. Hernández-Orallo: Some of are talking about making commu-
able to “digest” data in such a way the issues we currently contem- nication networks interpretable
that they can be added without the plate have already been seen in or applying methods to retrieve
physician entering them through the past and, in this field there are decision trees from networks. I
hundreds and hundreds of reports many bright young people who think that nowadays we can conti-
and hundreds and hundreds of test think they are going to save the nue in this progress and we have
results. It should be done in such world. All scientific areas have tools to make it easier.
a way that it allows the physician their ups and downs and not only
to quickly and easily access and technology, but also the context, I want to make a small contri-
retrieve the information he/she make something go faster or bution to the discussion on
needs without having to go back slower. The development that has deep networks as black boxes.
and read all the patients’ reports, occurred over the past five years is Deep learning is a part of artifi-
which is something that would not sustainable. I do not think that cial intelligence learning. One
take him/her forever. the advances in computing applied of the methods is the analysis of
I have worked in this area for to artificial intelligence in recent the main components and the
thirty-three years, I am a Doctor years will be maintained. decision tree. These methods
of Medicine and Professor of allow us to observe the most
Artificial Intelligence. I’ve worked Dr. Besold: In recent years, techno- rele
vant features, and even in
with people who have been in this logy has spread much more than deep networks there are investi-
area for fifty years, and what I have previously. The first driverless cars gations that allow us to go back
heard here today regarding the appeared in the 1980s; they are and see what features are the most
knowledge of limitations in this not an invention of the year 2012. important and have methods that
field is something I’ve been liste- Medical expert systems have been allow us to find these variables.
ning to over the last few years. I used since the 1980s and are now
don’t know if people really know in our environment. This shows the Dr. Besold: These are the sort of
the limitations of the people who limitations in their implementation things we are doing within the
worked in this area in the 1980s and incorporation into the market. explainable artificial intelligence.
to 1990s, particularly in the field Most of the advances in techno- These methods are still in their
of medicine, which is different logy of the 1980s and 1990s are early stages. Sometimes, if we try
from other areas. Medical data currently applied in deep learning. to make deep networks exploita-
are full of knowledge, and are What has really changed is that we ble, they don’t work as well, and
often useless, uninterpretable and now have new advances in compu- surely a support vector machine
uncertain. Taking into account all ting and memory. is a major component. All these
these problems and limitations, I One of the things we are options are there, but many great
don’t know if artificial intelligence currently doing is going back to the applications are currently unused.
83
ARTIFICIAL INTELLIGENCE IN BIOMEDICINE
One of the main problems, even how would it do it and how would when performing biopsies and
with these methods, is that they can it extract the tissue sample from suturing, the size of the diame-
show what the factors were that in- the body? ter of the puncture or suture is
fluenced some classification or au- smaller. This is because it has
tomation result, but a causal history Dr. Paik: Such tools have already controllable joints. The more
is not obtained and people usually been used in surgery. The novelty joints it has, the greater the degree
ask for an explanation that allows of this tool, compared to the of freedom; having multiple
them to understand such a connec- others, is that the surgeon can controllable joints means having
tion, and to know how to reach it. hold it directly in his/her hands multiple motors, and other types
without having to manage a of tools require many wires. In our
Dr. Paik, I was wondering if you control system separately, which case, by selectively modifying the
could give us a little more informa- would prevent her/him from stiffness of the individual joints,
tion about the application of the having real haptic feedback. The we can control the degrees of
origami robot in surgery. Is it really origami robot allows you to have freedom without having to embed
capable of replicating a biopsy? If direct contact with tissues. The motors directly on a device that is
it knows how to puncture a tissue, main reason for its use is its size; extremely small.
INTELIGENCIA ARTIFICIAL
APLICADA A LA BIOMEDICINA
Lo que nos depara el futuro
El campo de la inteligencia artificial, llamado deep learning o machine learning, ha
evolucionado de forma exponencial en los últimos años y está revolucionando el campo
de la Biomedicina. La disponibilidad de cantidades enormes de información médica
(big data), en particular imágenes, y el desarrollo de algoritmos para extraer patrones
de información y tomar decisiones “inteligentes” a partir de los datos, están haciendo
avanzar de forma muy rápida el diagnóstico y la estratificación de pacientes. Estudios
recientes han demostrado la utilidad de aplicar inteligencia artificial para el diagnóstico
de enfermedades como el cáncer, las enfermedades cardiovasculares y las retinopatías.
En estos casos, los algoritmos han aportado resultados tan buenos o incluso mejores
que los estándares establecidos por expertos. En este sentido, la agencia reguladora
del medicamento americana (Food and Drug Administration, FDA) ha aprobado el uso
de la inteligencia artificial en varios campos de la Medicina y es de esperar que estas
técnicas tengan un efecto significativo en la práctica de la Medicina en el siglo xxi.
En esta 11.ª edición del ciclo de conferencias y debates en ciencias se cubren aspectos
básicos de la inteligencia artificial y su aplicación a la Biomedicina. También se discute el
futuro potencial de esta técnica en el campo clínico y los aspectos socioeconómicos que esta
revolución tecnológica puede tener en la sociedad actual y futura.
ARTIFICIAL INTELLIGENCE
IN BIOMEDICINE
What the future holds for us
The field of artificial intelligence, called “deep learning” or “machine learning”, has evolved
exponentially in recent years and is revolutionizing the Biomedicine field. The availability
of huge amounts of medical information (“big data”), in particular images, and the
development of algorithms to extract information patterns and make intelligent decisions
from data are rapidly advancing the diagnosis and stratification of patients. Recent studies
have demonstrated the usefulness of a rtificial intelligence for the diagnosis of diseases such
as cancer, cardiovascular disease and retinopathies. In these cases, the algorithms have
yielded results as good or even better than the standards set by experts. The US Food and
Drug Administration (FDA) has approved the use of artificial intelligence in several Medicine
fields; the hope is that these techniques will have a significant effect on the practice of
Medicine in the 21st century. The 11th edition of these conferences and debates describes
basic concepts in artificial intelligence and its application to Biomedicine, as well as
discussing its potential for the future of Medicine and the socio-economic consequences
that this technological revolution may have in current and future society.