a aels PRINCIPIOS DE BIOQUIMICA % DAVID L. NELSON St lMUlde "MICHAEL M. COXINTRODUCCION LA LOGICA MOLECULAR DE LOS ORGANISMOS VIVOSINTRODUCCION La légica molecular de los organismos vivos Los seres vivos estan integrados por moléculas inanimadas. Cuando se examinan individualmente, estas moléculas aisladas se ajustan a todas las leyes fisicas y quimicas que rigen el comportamiento de la materia inerte. Sin embargo, los orga- nismos vivos poseen, ademas, unos atributos extraordinarios que no exhiben cimulos de materia inanimada. Si examinamos algunas de estas propiedades especiales, podremos acercarnos al estudio de la bioquimica con una mejor comprensién de los problemas fundamentales que trata de explicar. Caracteristicas que identifican a la materia viva EI atributo mas sobresaliente de los seres vivos es, quiza, su complejidad y su alto grado de organizacién. Poseen estruc- turas internas intrincadas que contienen muchas clases de moléculas complejas. Se presentan, ademas, en una variedad asombrosa de especies diferentes. Por contraste, la materia inanimada de su entorno, representada por el suelo, el agua y las rocas, esta constituida habitualmente por mezclas for- tuitas de compuestos quimicos sencillos, de organizacién estruc- tural mas bien escasa. En segundo lugar, cada una de las tres partes componentes de la materia viva cumple un propésito o funcién especificos. Ello es cierto no solamente en lo referente a estructuras visi- bles como alas, ojos, flores u hojas, sino también a estruc- turas intracelulares tales como el niicleo y la membrana, Ade- mas los compuestos quimicos individuales de la célula, tales como los lipidos, las proteinas y los acidos nucleicos, poseen también funciones especificas. En los organismos vivos es completamente legitimo pregun- tarse cual es la funcién de una molécula determinada. En cambio, carece de sentido plantear dicha pregunta con relacién a la materia inerte. En tercer lugar, los organismos vivos presentan Ja capaci- dad de extraer y transformar la energia de su entorno a partir de materias primas sencillas, y de emplearla para edificar y mantener sus propias e intrincadas estructuras. Pueden reali- zar, ademas, otras formas de trabajo util, como, por ejemplo, el esfuerzo mecanico de la locomocién. La materia inanimada no posee esta capacidad de emplear la energia externa para 3INTRODUCCION LA LOGICA MOLECULAR DE LOS ORGANISMOS VIV¢ S mantener su propia organizaci6n estructural. De hecho, habi- tualmente se degrada a un estado mas desordenado cuando absorbe energia externa, ya sea en forma de calor o de luz. Pero el atributo mas extraordinario de los organismos vivos consiste en su capacidad de producir una réplica exacta de si mismos, propiedad que puede considerarse la verdadera quin- taesencia de la vida. El conjunto de la materia inanimada que nos es familiar no muestra la capacidad de reproducirse de «generacién» en «generacién» en formas idénticas en masa, forma y estructura interna. Bioquimica del estado vital Podemos preguntarnos ahora: si los organismos vivos estan compuestos por moléculas intrinsecamente inanimadas, ;como es que la materia viva se diferencia de modo tan radical de la inerte, que también esta constituida por la misma clase de moléculas inanimadas? ;Por qué los organismos vivos son algo mas que la suma de sus partes inanimadas? Los filésofos medievales habrian contestado que los organismos vivos estan dotados de una fuerza vital misteriosa y divina. Pero esta doctrina, que recibe el nombre de «vitalismo», es una supers- ticion y ha sido descartada por la ciencia moderna. La meta basica actual de la bioquimica es determinar de qué modo el conjunto de moléculas inanimadas que constituyen los orga- nismos vivos se influyen mutuamente para constituir, mante- ner y perpetuar el estado de vida. La bioquimica es una ciencia muy joven. Hasta hace unas pocas décadas solamente un reducido niimero de univer: des la reconocian como una ciencia por su propio derecho. En la genealogia de la bioquimica actual existen dos lineas matrices. Una de ellas procede de la medicina y de la fisio- logia, como subproducto de las primeras investigaciones acerca de la composicién quimica de la sangre, la orina y los tejidos, y sus variaciones con los estados de salud y de enfermedad. La otra linea deriva de la quimica organica, desde los estu- dios iniciales acerca de la estructura de los compuestos orga- nicos que existen en la naturaleza. Durante mucho tiempo, la bioquimica fue considerada simplemente como una rama de la fisiologia o de la quimica. Realmente no surge como ciencia adulta por derecho propio con poderosos métodos experimen- tales y visién de prediccién de los fenomenos biolégicos hasta el ultimo cuarto de siglo. Son dos los hechos principales que lo han ocasionado. Uno de ellos es el reconocimiento de los sistemas multienzimaticos como unidades cataliticas en las rutas metabélicas principales, y el desarrollo de una hipétesis unitaria para la transferencia de energia en las células vivas. El otro, que ha ejercido una profunda y muy penetrante in- fluencia, fue el reconocimiento de que la herencia, uno de los aspectos mas fundamentales de la biologia, descansa sobre una base molecular racional. En la actualidad, la bioquimica esta realizando interesantes pruebas en cierto numero de areas fundamentales de la biologia —la diferenciacién de las célu- las y de los organismos, el origen de la vida y la evolucién, el comportamiento y la memoria y las enfermedades humanas— pruebas que han demostrado que estos problemas basicos pueden ser abordados con provecho mediante los métodos bioquimicos. 4Introduccion La logica molecular de los organismos vivos Realmente, el éxito de la bioquimica en la explicacién de muchos fenémenos celulares ha sido tan grande, que muchos cientificos han Hegado a la conclusién de que la biologia es quimica. Algunos bidélogos no comparten este punto de vista; mantienen gue la esencia de los organismos vivos complejos no puede reducirse, ni ahora ni nunca, al nivel de moléculas y de interacciones moleculares. Pero éste es un punto de vista minoritario. En la actualidad es quizds mas légico admitir, como filosofia de trabajo, que todos los fenémenos biolégicos descansan, en tltimo término, sobre una base molecular y abandonar este punto de vista solamente cuando no se mues- tre util para plantear experimentos criticos o para explicar los datos experimentales. Esto no quiere decir que la biolo- gia sea simplemente otro campo de la quimica, comparable a la quimica organica, la quimica fisica o la quimica inorga- nica. Si la biologia es quimica, es una especie de superquimica que comprende, pero al mismo tiempo trasciende, los campos tradicionales de la quimica. Y ello se debe a que las moléculas que integran los organismos vivos no solamente se rigen por todos los principios fisicos y quimicos que gobiernan el com- portamiento de todas las moléculas, sino que, ademas, ejercen acciones mutuas de acuerdo con otro conjunto de principios a los cuales nos referiremos de modo colectivo como la légica molecular de la vida, Estos principios no incluyen necesaria- mente ninguna ley o fuerza fisica nueva o todavia por des- cubrir. Deben considerarse mas bien un conjunto inico de «reglas fundamentales» que gobiernan Ja naturaleza, la fun- cién y las interacciones de los tipos especificos de moléculas presentes en los organismos vivos, y les dotan de la capacidad de organizarse y replicarse por si mismos. No se han identifi- cado todavia todos los principios que comprende la logica molecular de la vida, y algunos de ellos sélo se perciben débil- mente. En realidad, resulta quiza mas apropiado hablar de estos principios como axiomas, puesto que varios de ellos son intuitivos y atin no comprobables. ‘Veamos ahora si podemos identificar alguno de los axiomas importantes de la logica molecular de la vida. Comenzaremos con una breve visién de la estructura y funcién de las molé- culas halladas en la materia viva, a las que denominaremos biomoléculas. Biomoléculas La composicién quimica de los seres vivos es, cualitativamen- te, muy diferente de la del entorno fisico en que viven. La mayor parte de los componentes quimicos de los organismos son compuestos organicos de carbono en los que el elemento se halla relativamente reducido o hidrogenado.. Muchas bio- moléculas organicas contienen también nitrégeno. Por el con- trario, los elementos nitrégeno y carbono no son abundantes en la materia inerte y se encuentran en la atmésfera y en la corteza terrestre en formas inorganicas sencillas, tales como didxido de carbono, nitrégeno molecular, carbonatos y nitratos, Los compuestos organicos presentes en la materia viva muestran enorme variedad, y la mayor parte de ellos son extraordinariamente complejos, Aun Jas mas sencillas de las células, las bacterias, contienen gran nimero de distintas mo- 5INTRODUCCIGN LA LOGICA MOLECULAR DE LOS ORGANISMOS VIVOS léculas organicas. Se calcula que la bacteria Escherichia coli contiene alrededor de 5000 compuestos organicos diferentes, entre ellos unas 3000 clases diferentes de proteinas y 1000 tipos distintos de Acidos nucleicos. Ademas, la mayor parte de la materia organica en las células vivas esta constituida por macromoléculas, de pesos moleculares muy grandes, que incluyen no solamente a las proteinas y a los acidos nucleicos sino también a sustancias polimeras tales como el almidén y la celulosa. Si consideramos ahora organismos mayores y mas com- plejos, como son los animales y las plantas superiores, halla- remos que también contienen proteinas y acidos nucleicos, en mayor variedad. En el organismo humano, por ejemplo, puede haber hasta 100 000 clases de proteinas diferentes, en compa- racién con las 3000 distintas de E. coli. Aunque algunas de las proteinas de las células de E. coli actiian de modo muy semejante al que lo hacen determinadas proteinas de las célu- las humanas, ninguna de las moléculas proteicas de E. coli es idéntica a cualquiera de las proteinas encontradas en el hombre. De hecho, cada especie de organismo posee su propio conjunto de moléculas proteicas y de acidos nucleicos quimi- camente diferentes. Puesto que es probable que existan alre- dedor de 1,5 millones de especies de organismos vivientes, puede calcularse que el conjunto de las especies vivientes debe de contener entre 10 y 10” tipos distintos de moléculas pro- teicas y unas 10” clases diferentes de acidos nucleicos. Si comparamos estas cifras con la totalidad de compuestos orga- nicos cuya estructura sea conocida por los quimicos organicos actuales, y que alcanza solamente un millén, o 10°, aparece claro que nada mas conocemos la estructura precisa de una fraccién trivialmente pequefia del conjunto total de moléculas organicas que se cree existen en la materia viva. Por todo ello, pareceria una empresa sin esperanza que los bioquimicos intentaran aislar, identificar y sintetizar todas las diferentes moléculas organicas presentes en la materia viva. Constituye una paradoja, sin embargo, que la inmensa di- versidad de moléculas organicas de los organismos vivos se. pueda reducir, en ultimo término, a una casi absurda simpli- cidad. Sabemos ahora que las macromoléculas de la célula se hallan formadas por muchas moléculas sencillas, pequefias unidades estructurales que se hallan ligadas constituyendo largas cadenas. El almidén y la celulosa estan constituidos por hebras muy largas de moléculas de glucosa unidas covalente- mente. Los diferentes tipos de proteinas estan formados por largas cadenas de aminoacidos, pequefios compuestos organ cos de estructura conocida, unidos covalentemente. En las proteinas sdlo se encuentran 20 tipos de aminoacidos diferen- tes, pero estan ordenados en muchas secuencias distintas, de modo que forman numerosos tipos de proteinas. Asi, las 3000 proteinas o mas que existen en la célula de &. coli estan integradas tan sélo por 20 pequefias moléculas diferentes. Analogamente, los 1000 o mas acidos nucleicos de la célula de E. coli, de los que existen dos clases, acido desoxirribonucleico (DNA) y acido ribonucleico (RNA), estan constituidos a par- tir de un total de ocho sillares diferentes, los nucledtidos, cuatro de los cuales son los constituyentes del DNA y los restantes del RNA. Ademas, los 20 aminoacidos distintos, constituyentes de las proteinas, y los ocho nucleétidos dife- 6Introduccién La légica molecular de los organismos vivos rentes que integran los acidos nucleicos son idénticos en todas las especies vivientes. Aunque en la actualidad solamente poseemos un conocimiento preciso de la estructura covalente de unas 100 proteinas, las técnicas de Ja quimica de las pro- teinas se han desarrollado lo suficientemente bien para que, por lo menos en principio, se halle dentro de las posibilidades de Ia bioquimica aclarar la estructura de cualquier proteina de todo tipo de organismo. E! reducido niimero de moléculas sencillas, sillares estruc- turales con que estan construidas todas las macromoléculas, poseen otra sorprendente caracteristica: cada una de ellas desempefia mas de una funcién en las células vivientes, y algunas son tan extremadamente versatiles que realizan buen numero de funciones. Los aminodcidos no sélo acttan como sillares de construccién de las moléculas proteicas, sino tam- bién como precursores de las hormonas, los alcaloides, las porfirinas, los pigmentos y otras muchas biomoléculas. Diversos mononucleétidos no sélo constituyen las unidades fundamen- tales de los acidos nucleicos, sino que acttian también como coenzimas y moléculas transportadoras de energia. Por todo ello, parece probable que las biomoléculas fundamentales de las estructuras complejas fuesen seleccionadas en el curso de la evolucién biolégica, precisamente por su capacidad de desempefiar diversas funciones. Por lo que sabemos hasta ahora, los organismos vivos no contienen normalmente com- puestos sin una funcién definida, aunque existen algunas bio- moléculas las funciones de las cuales atin no se comprenden. Ahora se pueden deducir algunos de los axiomas de la légica molecular de la vida. Ya que los millares de macromo- léculas presentes en las células estén construidas con sélo unas pocas moléculas sencillas, que son los sillares de su es- tructura, puede formularse el primer axioma: En la organi- zacién molecular de la célula existe una simplicidad funda- mental, Puesto que estas biomoléculas sencillas son idénticas en todas las especies conocidas, podemos deducir que todos los organismos vivos proceden de un antepasado comin. De- bido a que cada organismo posee su propio conjunto distintivo de acidos nucleicos y de proteinas surge otro axioma: La identidad de cada una de las especies de organismos esta preservada por su posesién de un conjunto distintivo de acidos nucleicos y de proteinas. En la versatilidad funcional de esas biomoléculas basicas podemos percibir, ademas, la existencia de un principio fundamental de economia molecular. Quiza las células vivas sdlo contienen las moléculas mas sencillas posibles en el minimo ntimero de tipos diferentes, nada mas las indispensables para dotarlas del atributo de la vida y de la identidad de especie en las condiciones ambientales en que viven. Transformaciones energéticas en las células vivas La complejidad molecular y la ordenacién estructural de los organismos vivos, en contraposicién al azar que reina en la materia inerte, tienen unas implicaciones profundas para el cientifico fisico. La segunda ley de la termodinamica, rama de la fisica que trata de la energia y sus transformaciones, establece que los procesos fisicos y quimicos tienden a aumen- tar el desorden, o el caos, en el mundo; es decir, su entropia. 7INTRODUCCION LA LOGICA MOLECULAR DE LOS ORGANISMOS VIVOS Por qué, entonces, los organismos vivos pueden crear y man- tener su complicada ordenacién en un entorno que esta relati- vamente desordenado, y que lo esta cada vez mas con el trans- curso del tiempo? Los organismos vivos no constituyen excepciones de las leyes de la termodinamica. A su elevado grado de ordenacién molecular debe contribuirse de alguna manera, puesto que no puede surgir del desorden espontaneamente. La primera ley de la termodinamica establece que la energia no puede crearse ni destruirse. Por tanto, los organismos vivos no pueden con- sumir © crear energia; solamente pueden transformar una for- ma de energia en otra. De su entorno absorben una forma de energia que les es util en las condiciones especiales de temperatura y presién en que viven, y entonces devuelven al ambiente una cantidad equivalente de energia, en alguna otra forma menos utilizable. La forma util de energia que las célu- las toman se denomina energia libre, y puede definirse sim- plemente como el tipo de energia capaz de realizar trabajo a temperatura y presién constantes. El tipo de energia menos util que las células devuelven a su entorno consiste en calor y otras formas que rapidamente se distribuyen al azar en el entorno, de modo que aumenta su desorden o entropia. Pode- mos establecer ahora un axioma extremadamente importante en la logica molecular de la vida: los organismos vivos crean y mantienen su ordenacién esencial a expensas de su entorno, al que transforman haciéndolo cada vez mas desordenado y cadtico. El entorno de los organismos vivos resulta para ellos abso- lutamente esencial, no sdlo como fuente de energia libre sino también de materias primas. Ultilizando el lenguaje termodina- mico, los organismos vivos son sistemas abiertos porque inter- cambian materia y energia con su entorno y, al hacerlo, lo transforman. La caracteristica de los sistemas abiertos es que no se hallan en equilibrio con su entorno. Aunque puede pa- recer que los organismos vivos se hallan en equilibrio, ya que no cambian visiblemente al observarlos durante un periodo dado de tiempo, lo cierto es que se hallan en Jo que se deno- mina estado estacionario, condicién que cumple un sistema abierto cuando la velocidad de transferencia de materia y de energia desde el entorno al sistema se halla compensada exac- tamente por la velocidad de transferencia de materia y ener- gia hacia el exterior del sistema. Constituye, por tanto, una _ parte de la légica molecular de Ja vida que la célula es un sistema abierto que no esta en equilibrio, es una maquina de extraer energia libre del medio, en el cual origina un aumento de entropia. Ademas, y éste es otro reflejo del principio de maxima economia, las células vivas son muy eficaces en la manipulacién de la energia y de la materia. La eficacia con que convierten la energia absorbida en trabajo efectuado es muy superior a la de las maquinas construidas por el hombre. La maquinaria de transformacién de energia de las células vivas esta construida por entero con moléculas organicas rela~ tivamente fragiles e inestables, incapaces de resistir tempera- turas elevadas, corrientes eléctricas intensas 0 concentraciones extremas de acidos o de bases. La célula viva es, por tanto, esencialmente isotérmica; en un instante determinado todas sus partes tienen practicamente la misma temperatura. Ade- mas, no existen diferencias importantes de presién de una 8Introduccién La légica molecular de los organismos vivos parte a otra de la célula. Por estas razones las células son incapaces de utilizar el calor como fuente de energia, ya que aquél sélo puede transformarse en trabajo a presién constante_ si se transfiere desde una zona de temperatura superior a otra de menor temperartura. Las células no se parecen, por tanto, a las maquinas térmicas o eléctricas, que son los tipos de maguinaria con que estamos mas familiarizados. Por el con- trario, y esto constituye otro axioma importante de la légica molecular de la vida, la célula viva es una maquina quimica isotérmica, La energia que las células absorben de su entorno se recupera en forma de energia quimica, la cual se transforma después para realizar el trabajo quimico implicito en la biosin- tesis de los componentes celulares, el trabajo osmético nece- sario para el transporte de los materiales al interior de la célula, 0 el trabajo mecanico de la contraccién 0 la locomocién; todas estas transformaciones suceden, esencialmente, a tem- peratura constante, Entre las maquinas construidas por el hombre existen muy pocas que sean capaces de utilizar la energia quimica para realizar trabajo a temperatura constante. En la actualidad, la ingenieria tecnologica atin tiene que producir una maquina utilizable que pueda convyertir isotérmicamente la energia quimica en mecanica, tipo de conversién que, por otra parte, nos es familiar a todos en la contraccién muscular. Reacciones quimicas en las células vivas Las células pueden actuar como maquinas quimicas porque poseen enzimas, catalizadores capaces de aumentar mucho la velocidad de reacciones quimicas especificas. Los enzimas son moléculas proteicas muy especializadas, elaboradas por las cé- lulas a partir de aminoacidos sencillos. Cada enzima solamen- te puede catalizar un tipo especifico de reaccién quimica. Se conocen en la actualidad casi 2000 enzimas diferentes. Los en- zimas superan notablemente a los catalizadores confecciona- dos por el hombre en su especificidad reactiva, su eficacia catalitica y su capacidad de actuacién en condiciones suaves de temperatura y de concentracién de iones hidrégeno. En unos segundos pueden catalizar secuencias de reacciones muy complejas, las cuales requeririan dias, semanas o meses de trabajo en el laboratorio quimico. Existe, sin embargo, una propiedad especialmente notable de las reacciones quimicas en las células vivas, que en ultimo término es la que hace posible y eficaz su actuacion como maquinas térmicas: las reacciones catalizadas enzimaticamen- te tienen lugar con un rendimiento del 100%, y no hay subproductos. En cambio, Jas reacciones de la quimica orga- nica realizadas en el laboratorio mediante catalizadores pro- ducidos por el hombre van, casi siempre, acompafiadas por Ja formacién de uno o mas subproductos; por ello los rendi- mientos suelen ser inferiores al 100 %, y es precisa una puri- ficacién intensiva del producto en cada etapa. Debido a que los enzimas pueden acelerar una sola transformacién de una molécula determinada, sin inducir ninguna otra de sus posibles reacciones, los organismos vivos pueden llevar a cabo, de modo simultaneo, muchas reacciones individuales diferentes sin perderse en un mar de subproductos inttiles. Este elevado grado de especificidad de los enzimas es consecuencia del 9INTRODUCCION LA LOGICA MOLECULAR DE LOS ORGANISMOS VIVOS funcionamiento de otro axioma fundamental de la légica mo- lecular de la vida, a saber: La especificidad de las interaccio- nes moleculares en las células es el resultado de la comple- mentaridad estructural de las células interactivas. Las molécu- Jas enzimaticas se combinan con sus sustratos durante el ciclo catalitico, de tal modo que el centro activo de la molécula del enzima se adaptara al substrato con una complementaridad casi perfecta, como la de una Ilave y su cerradura. Veremos que sobre el principio de complementaridad estructural des- cansa la especificidad de muchos de los diferentes tipos de interacciones moleculares en las células. Los centenares de reacciones quimicas, catalizadas enzima- ticamente, que tienen lugar en la célula no se realizan de modo independiente unas de otras, sino que, por el contrario, estan relacionadas entre si y constituyen muchas secuencias dife- rentes de reacciones consecutivas que poseen intermediarios comunes, de modo que el producto de la primera reaccién se convierte en el sustrato o reactante de la segunda, y asi suce- sivamente. Tales secuencias, que pueden poseer de 2 a 20 6 mas etapas de reacci6n, se hallan ligadas a su vez formando reticulos de esquemas convergentes o divergentes. Esta orde- nacién determina diversas consecuencias biolégicas importan~ tes. Una de ellas consiste en que tales sistemas de reacciones consecutivas determinan que las reacciones quimicas se cana- licen por rutas especificas. La otra es que las reacciones se- cuenciales hacen posible la transferencia de energia quimica, La transferencia de energia entre dos reacciones en condicio- nes de presién y temperatura constantes no puede tener lugar, a menos que ambas reacciones posean un intermediario comin. Si dos reacciones independientes, tales como A—B c—bD se producen en un mismo recipiente a presién y temperatura constantes, cada una transcurrira con idéntica disminucién de energia libre, independientemente de la presencia de la otra. Por el contrario, en dos reacciones consecutivas tales como A—>B B—>C cierta cantidad de energia quimica de A puede transferirse hasta C a través del intermediario comin B. Las células vivas pueden dividirse en dos grandes clases segiin el tipo de energia que obtienen de su entorno. Las células fotosintéticas utilizan la luz solar como principal fuente de energia; la energia radiante es absorbida por el pigmento clorofila y transformada en energia quimica. Las células hete- rotréficas aprovechan la energia de moléculas organicas muy reducidas, ricas en energia, como la glucosa y que obtienen de su entorno. La mayor parte de las células del reino animal son heterotréficas; en ellas la glucosa es oxidada a anhidrido carbénico y agua, proceso en que se conserva algo de la ener- gia libre de la molécula de glucosa, la cual se emplea poste- riormente para realizar diversos tipos de trabajo celular. Aunque ambas clases de organismos vivientes obtienen energia de su entorno en formas distintas, Jas dos la recuperan 10Introduccién La légica molecular de los organismos vivos y la utilizan ampliamente en forma del compuesto Ilamado trifosfato de adenosina, (ATP). Este actiia como el transpor- tador de energia quimica mas importante en las células de todas las especies vivientes. A medida que el ATP transfiere su energia a otras moléculas, pierde su grupo fosfato terminal y se transforma en difosfato de_adenosina, (ADP), que es la forma descargada o pobre de energia, es decir, la contrapartida del ATP. Por su parte, el ADP puede, a su vez, aceptar. energia quimica y récuperar un grupo fosfato para transfor- marse de nuevo en ATP, ya sea a expensas de la energia solar (en las células fotosintéticas) o de energia quimica (en las células heterotréficas). El ATP actta como un interme- diario comin 0 nexo de unién entre dos grandes redes de reacciones catalizadas enzimaticamente en la célula. Una de dichas redes conserva la energia quimica obtenida del entorno al producir la fosforilacién del ADP pobre en energia y trans- formarlo en ATP de elevado contenido energético, La otra red utiliza la energia del ATP para realizar la biosintesis de componentes celulares a partir de precursores sencillos, con la degradacién simultanea del ATP, que se transforma en ADP. Podemos establecer ahora otro axioma en la légica molecular de las células: Las secuencias consecutivamente ligadas de las reacciones catalizadas enzimaticamente proporcionan los me- dios para transferir la energia quimica desde los procesos que la liberan, hasta los que la requieren. Autorregulacién de las reacciones celulares Del hecho de que todas las reacciones quimicas de la célula se hallan catalizadas por enzimas y conectadas por interme- diarios comunes se deduce otro resultado importante. Una célula bacteriana sencilla, tal como la de £. coli, sintetiza simultaneamente sus miles de componentes moleculares com- plejos a partir de sélo tres precursores sencillos: glucosa, amoniaco y agua. Esta célula emplea una clase de légica quimica que trasciende los conocimientos actuales de la qui- mica sintética en el laboratorio, Si un quimico se enfrentase con el problema de sintetizar dos productos, tales como un aminoacido y un lipido, no sofiaria nunca en sintetizarlos a partir de unos mismos precursores, simultaneamente y en un mismo recipiente de reaccién. Iniciaria cada una de las sin- tesis partiendo de precursores diferentes y utilizaria distintas secuencias reaccionales. Llevaria a cabo ambas sintesis por separado, en recipientes distintos, y, probablemente, en mo- mentos diferentes. Pero en las células vivas la sintesis de centenares o millares de moléculas muy distintas se realiza de modo simultaneo, literalmente en un mismo recipiente, y partiendo de unos pocos precursores comunes. La conexién de reacciones catalizadas por enzimas, en secuencias de reac- ciones consecutivas, hace posible canalizar ordenadamente los millares de reacciones quimicas que se suceden en las células, de modo que todas las biomoléculas especificas necesarias para la estructura y funci6n celulares se produzcan en canti- dades y velocidades adecuadas. Una célula bacteriana sintetiza simultaneamente 3000 o mas clases de moléculas proteicas en relaciones molares especificas entre si. Cada una de estas moléculas contiene un minimo de 100 unidades de aminoacidos por cadena; la mayoria contie- 11INTRODUCCION LA LOGICA MOLECULAR DE LOS ORGANISMOS VIVOS nen muchas mas. Y, sin embargo, a 37 °C la célula bacteriana s6lo necesita unos pocos segundos para completar la sintesis de cualquier molécula proteica sencilla. En cambio, la sintesis de una proteina por el hombre en el laboratorio, hecho que s6lo se ha conseguido por vez primera en 1969 requiere el trabajo de quimicos altamente especializados, muchos reacti- vos caros, centenares de operaciones separadas, un equipo automatico complejo y un periodo de meses para su prepara- cin y ejecucién. Las células bacterianas no sélo pueden pro- ducir moléculas de proteinas individuales con rapidez, sino que son capaces de construir 3000 0 mas clases de proteinas simultaneamente, y en la relacién molar precisa para constituir una célula viva y que funcione. La conexién en secuencias consecutivas de las reacciones enzimaticas permite la regulacién del metabolismo y le dota de capacidad para auto-ajustarse. En el caso mas sencillo, la acumulacién de un producto final del metabolismo, tal como un aminoacido, puede inhibir la etapa determinante de la velocidad en la secuencia de reacciones mediante las cuales se formé, tipo de control conocido como inhibicion «feed-back». Las células vivas poseen, ademas, la capacidad de regular la sintesis de sus propios catalizadores. Asi, la célula puede «interrumpir> la sintesis de los enzimas necesarios para la produccién de un producto determinado a partir de sus pre- cursores cuando tal producto puede obtenerlo, ya fabricado, del entorno. Surge entonces otro principio importante: Las células son capaces de regular sus reacciones metabélicas y las biosintesis de sus enzimas para obtener el maximo de efi- cacia y de economia. Autorréplica de los organismos vivos La propiedad mas notable de las células vivas es su capaci- dad de reproducirse con fidelidad casi perfecta, no solamente una o dos veces, lo que ya seria bastante notable, sino por centenares y millares de generaciones. Tres caracteristicas re- saltan inmediatamente. En primer lugar, algunos organismos vivos son tan complejos que la cantidad de informacién gené- tica que se transmite parece desproporcionada al pequefio ta- mafio de las células que la deben transportar, concretamente, la célula espermatica y el huevo. Sabemos hoy dia que virtual- mente toda la informacién genética se halla presente en los cromosomas, codificada en forma de secuencia especifica de los nucleétidos constituyentes de una pequefia cantidad de DNA, la cual, en el esperma humano o en el évulo, pesa no més que unos 6 picogramos (I pg = 1 x 10” g). La investi- gacién moderna de los aspectos bioquimicos de la genética ha conducido, de este modo, a otro axioma de la légica mole- cular del estado vital: Los simbolos en los que se halla codi- Ficada la informacion genética en el DNA, son de dimensiones sub-moleculares. La segunda caracteristica notable de la propiedad de autorreplicacién de los organismos vivos, consiste en la extra- ordinaria estabilidad de la informacién genética almacenada en el DNA. Muy pocas de las primitivas inscripciones histé- ricas realizadas por el hombre han sobrevivido tanto tiempo, a pesar de que fueron labradas en piedra o en cobre y preser- vadas de la accién de los elementos. Los manuscritos del Mar 12Introduccion La logica molecular de los organismos vivos Muerto y la piedra de Rosetta. por ejemplo, tienen sélo unos pocos miles de afios. Pero existen buenas razones para creer que las bacterias actuales poseen, aproximadamente, una mis- ma forma, tamafio y estructura interna, y contienen idéntica clase de moléculas estructurales, asi como unos mismos tipos de enzimas, que las que vivieron hace cientos de millones de afios, a pesar de que las bacterias, como todos los organismos, han experimentado una evolucién constante. La informacién genética no se conserva en planchas de cobre o grabada en piedra, sino en forma de DNA, una molécula organica tan fragil que cuando se aisla en disolucién se escinde en muchos fragmentos con sdlo agitar la disolucién o pipeteandola. La capacidad de las células vivas para preservar su infor- macién genética es el resultado de la complementaridad es- tructural. Una hebra de DNA actita como patrén para la réplica enzimatica de otra hebra de DNA estructuralmente complementaria. En realidad, los enzimas de la célula que sintetizan el DNA no pueden confeccionarse sin el concurso de un patrén. Se tiene ahora la certidumbre de que, incluso en la célula intacta, la molécula de DNA puede escindirse con frecuencia, pero es reparada con rapidez y automatica- mente por enzimas especificos, No es frecuente que se produz- can errores 0 mutaciones, pero incluso éstos no siempre son perjudiciales, y pueden resultar ventajosos al permitir a una especie determinada de organismo modificar gradualmente su identidad con objeto de adaptarse mejor a los cambios de su entorno durante el curso de la evolucién. Existe atin una tercera caracteristica digna de menci6n en la transferencia de la informacién genética en los organismos vivos. Tal informacién esta codificada en forma de una se- cuencia especifica de cuatro mononucleétidos basicos, sillares estructurales de la molécula lineal del DNA. Pero las células vivas poseen una estructura tridimensional y constan de partes © componentes también tridimensionales. Se llega, con ello, a un axioma muy crucial en la légica molecular de la vida, el que proporciona el nexo de unién entre la sencilla quimica lineal del DNA y todos los atributos tridimensionales de la gran variedad de organismos multicelulares: La informacion unidimensional del DNA es transferida a la informacién tridi- mensional inherente a los componentes macromoleculares y supramacromoleculares de los organismos, gracias a la tras- lacién de la estructura del DNA a la estructura proteica. La secuencia lineal de bases especifica del DNA se transcribe a la correspondiente secuencia lineal de aminoacidos de una ca- dena polipeptidica durante el proceso de sintesis de las pro- teinas. Sin embargo, a diferencia de la molécula de DNA, una cadena polipeptidica no es estable en forma lineal exten- dida. Espontaneamente se enrosca y se pliega en una estruc- tura tridimensional estable, especifica, cuya precisa geometria esta determinada por Ja secuencia aminoacida en su cadena polipeptidica. Cada tipo de cadena polipeptidica adoptara su propia conformacién especifica tridimensional, la cual le con- fiere, a su vez, un tipo especifico de actividad biolégica. Ade- mas, las muy diversas clases de moléculas proteicas, que son componentes de bioestructuras tales como las membranas, los ribosomas y los organulos, se agrupan entre si de manera automatica originando conjuntos tridimensionales, reproduci- bles con precisién porque solo se adaptan entre ellas de una 13INTRODUCCION LA LOGICA MOLECULAR DE LOS ORGANISMOS VIVOS manera determinada, de acuerdo también con el principio de la complementariedad estructural. Acabamos de describir cierto ntimero de interacciones e in- terrelaciones caracteristicas de las biomoléculas que constitu- yen, en conjunto, la logica molecular de la vida. Podemos resumir estos principios mediante la siguiente aseveracién: Una célula viva es un sistema abierto isctérmico de moléculas. organicas que se ensambla, ajusta y perpetia por si mismo y opera segiin el principio de maxima economia de partes y procesos; promueve muchas reacciones organicas ligadas con- secutivamente, destinadas a la transferencia de energia y a la sintesis de sus propios componentes por medio de catalizado- res organicos que ella misma produce. En ningiin momento de nuestro examen de la légica molecular de las células vivas hemos encontrado violacién alguna de las leyes fisicas co- nocidas, ni hemos necesitado definir ninguna ley nueva. La maquinaria de las células vivas actiia dentro del mismo con- junto de leyes que rigen la actuacién de las maquinas cons- truidas por el hombre, pero las reacciones quimicas y los procesos de las células se han perfeccionado mucho mas de las posibilidades presentes de la ingenieria quimica. En esta revision orientadora hemos esbozado el objetivo central y mas fundamental de la bioquimica actual, a saber, el determinar detalladamente la Iégica molecular de la célula viva. No es éste, sin embargo, el tnico objetivo de la bio- quimica ni tan siquiera el ultimo. La bioquimica de Ja célula, tema de este libro, no constituye sino el punto de partida para el estudio molecular de otros muchos problemas de la biologia. Lo mas fundamental es quiza deducir cémo en la oscura historia inicial de la Tierra ciertos compuestos in- organicos inanimados «se encontraron» primero y HCN + 3H, a GH, + HCN — CH,CH,CN (2) Un altcito CH,CH,CN + 2H,O —> CH,CH,COOH + NH, (3) Acido propiénico CH,CHOHCN + NH, —* CH,CHNH,CN + H,0 (4) Ua aminonitrilo CH,CHNH,CN + 2H.O —> CH,CHNH,COOH + NH; (6) Alanina 26 Ficura 1-4 Aparato de descargas eléctricas para mostrar la formacién abiética de compuestos organicos en las condiciones de la atmésfera primitiva. Distancia de chispa 10 cm Electrodos Mezcla de NH,, CH. Hi y HO a 80°CCapitulo 1 Biomoléculas y células Todos los aminoacidos corrientes presentes en las proteinas, las bases nitrogenadas adenina, guanina, citosina, uracilo y timina, que son las unidades estructurales de los acidos nu- cleicos, y muchos acidos organicos de significacién biolégica, asi como también azticares, se han detectado entre los produc- tos de las experiencias de simulacién de la tierra primitiva. Parece razonable suponer que el océano primitivo fue rico en compuestos organicos disueltos y que éstos podian incluir, si no todas, la mayor parte de las moléculas sillares estructurales basicas que reconocemos en las células en la actualidad. Idoneidad de las biomoléculas {Por qué seleccionaron los organismos vivos los tipos especi- ficos de moléculas organicas que actualmente poseen? ;Por qué deben ser 20 a-aminodcidos los sillares estructurales de las proteinas? ;Por qué no son tnicamente 10? jPor qué no son 40? ;Por qué son todos «-aminoacidos? ;No podriamos igualmente construir grandes moléculas de «proteina» a partir de aminoacidos que tuviesen sus grupos amino en posicién f? {Por qué fueron seleccionadas las purinas adenina y guanina y las pirimidinas citosina y timina, entre las docenas de deri- vados purinicos y_pirimidinicos, conocidos, como sillares de construccién del DNA de todas las especies? La evidencia experimental corriente sostiene el concepto de que las biomo- léculas que conocemos en la actualidad se seleccionaron entre un numero mucho mayor de compuestos organicos asequibles, a causa de su especial idoneidad para conferir a las células que los contienen una capacidad de supervivencia superior. En realidad se han aislado varios centenares de compuestos organicos a lo largo de los experimentos de simulacién de las condiciones primitivas de la tierra sobre el origen abidtico de las moléculas organicas, y ya que solamente pueden haberse necesitado un pequefio ntimero de compuestos organicos dife- rentes para formar las primeras bioestructuras, parece muy probable que tuvo lugar un proceso de seleccién. Otro argumento a favor del concepto de idoneidad puede derivarse del hecho de que, a pesar de la existencia biolégica de 150 aminodcidos, las proteinas de todas las especies se hallan construidas por el mismo conjunto de 20 aminodcidos primordiales. Si cualquiera de los otros aminoacidos hubiera demostrado ser mas «adecuado» como componente de las moléculas proteicas que los aminoacidos primordiales, ha trans- currido un amplio tiempo de evolucién disponible para que los organismos hubieran adquirido la capacidad de utilizarlo. Dimensiones y formas de las biomoléculas En la Parte 1 examinaremos las estructuras y propiedades de las principales clases de biomoléculas. Trataremos en espe- cial sobre los tamajios y las formas de las biomoléculas, puesto que estos atributos son muy significativos en bioquimica y en biologia molecular. Ya hemos visto (en la Introduccién) que el encaje complementario entre el sustrato y el centro activo de un enzima es tan grande que hace posible la selectividad de la catalisis enzimatica y la ausencia de subproductos. Tan sélo con que se produzca un pequefio cambio en alguna dimension critica de una molécula de sustrato, puede ocurrir que ésta 27PARTE 1 COMPONENTES MOLECULARES DE LAS CELULAS pueda no acoplarse al centro activo y no resultar ya posible el ser alterada por el enzima. Ademas, la gran exactitud con la-que se replica la informacién genética del DNA, depende también de la precisién del acoplamiento mutuo de biomolé- culas especificas. Por ello, resulta esencial familiarizarse con las dimensiones y la forma de las biomoléculas, y como se relacionan con las dimensiones de las diversas estructuras in- tracelulares. La tabla 1-7 muestra las unidades de masa y de Jongitud utilizadas corrientemente en relacién con las dimen- siones moleculares y de la célula. Las dimensiones moleculares se dieron, en un_princi- pio, en unidades angstrom, Jas dimensiones celulares en micras y las longitudes de onda en milimicras siendo 1 micra = 10° mm. Sin embargo, debido a un acuerdo in- ternacional, se recomiendan ahora las unidades métricas: na- németros, micrémetros y milimetros. De acuerdo con ello, en este libro daremos las longitudes de onda y las dimensiones moleculares en nanémetros (nm) y las dimensiones de la célu- Ja en nanémetros (nm) o en micrémetros (um). La tabla 1-8 muestra los prefijos estandar empleados para indicar las potencias de 10 en el sistema métrico. En el apén- dice se repiten los prefijos, por conveniencia, ya que se alistan otras abreviaturas del SI (Sistema Internacional de Unidades). Las proyecciones planas bidimensionales, en las que nece- sariamente aparecen las estructuras de las moléculas orga- nicas en las paginas impresas, son insuficientes para describir la verdadera configuraci6n tridimensional de las biomoléculas. Por dicha razén los bioquimicos construyen con frecuencia modelos tridimensionales de las biomoléculas cuando se en- frentan con problemas de especificidad molecular. Existen dos clases de modelos moleculares (fig. 1-5). Los modelos crista- lograficos muestran el esqueleto covalente, los angulos de las valencias y las longitudes, pero no indican el espacio real ocupado por la molécula. Los modelos espaciales compactos, (figs. 1-5 y 1-6) por otra farte, proporcionan poco detalle con respecto a los angulos de los enlaces y las distancias en el esqueleto, pero muestran el contorno de van der Waals o superficie de la molécula. Aunque ambos tipos de modelos son utiles para el estudio de la estructura de las biomoléculas, el modelo espacial es el que representa la molécula tal como es, «vista» por la célula o por uno de sus componentes espe- cificos, por ejemplo un enzima. Pero un enzima «ve» mucho mas que la mera forma tridimensional de su sustrato. Ve la localizacién y el signo de sus cargas eléctricas y la distancia precisa entre los grupos con carga. Ve las posiciones de los grupos polares sin carga, tales como los grupos hidroxilo, carbonilo y amida que pueden interyenir potencialmente en la formacién de enlaces de hidrégeno. Percibe los tamafios y las formas de las zonas hidrocarbonadas no polares de la super- ficie de la biomolécula que pueden proporcionar zonas de contacto importantes con otras moléculas. La forma tridimensional y la topografia superficial son muy importantes en el caso de las macromoléculas. Las moléculas de proteina slo poseen habitualmente una conformacién tri- dimensional especifica en las condiciones normales intracelu- lares, denominada conformacién nativa, la cual es indispensa- ble para su actividad biolégica. Por ejemplo, solamente la conformacién nativa de una molécula enzimatica posee acti- 28 Tapia 1-7. Algunas unidades de masa y de longitud. Masa 1 dalton © = masa de un atomo de hidrégeno = 1,68 X 10g =1X 10g 1 picogramo Longitud 1 nanémetro (am) = 10° m 10 angstroms (A) 1 micrémetro (um) = 10% m= * 1000 am 10.000 angstroms (A) Tapia 1-8. Prefijos para las potencias de 10, para uso con las unidades SI * Valor —_Prefijo Abreviatura 10° mega M 10° kilo k 10* deci d 107 centi c 10% * mili m 10* micro # 10° nano n 10? pico Pp 1078 femto f io-* atto a * Las combinaciones de prefijos ya no se permiten, de modo que se em- plea n- en lugar de mu y p- en lugar de py.Figura 1-5 Diferentes representaciones de a estructura de la alanina, en forma no ionizada, Formula empirica C3H,0.N Formula estructural H cu.—¢—coon Mu, Modelos cristalograficos Bolas y varillas De armazén Modelo espacial compacto Capitulo 1 Biomoléculas y células Ficura 1-6 Modelos espaciales de atomos (a escala) de algunos atomos biolégicamente importantes. oom — Carbono Hidrégeno Oxigeno Nitrégeno Azufre Fésforo 29PARTE 1 COMPONENTES MOLECULARES DE LAS CELULAS vidad catalitica. La conformacién tridimensional de una gran biomolécula no puede extrapolarse de la estructura bidimen- sional de una pagina impresa, ni tampoco puede Ilegarse a ella facilmente mediante modelos espaciales ordinarios. Es necesario un método fisico muy complejo, el andlisis por di- fraccién de rayos X, para establecer la conformacién precisa de Tas macromoléculas biolégicas. Realmente, el Jograr el dia- grama tridimensional de la estructura de las macromoléculas mediante andlisis por rayos X y el establecer la correlacién entre su estructura y su actividad biolégica constituyen los principales objetivos de la bioquimica y de la biologia molecular, Biomoléculas, estructuras supramoleculares y organulos celulares El tamafio y la forma de las biomoléculas son de crucial importancia en otro aspecto. Hemos visto que en las células hay una jerarquia de organizacion molecular (fig. 1-1); las biomoléculas sencillas son los sillares de las macromoléculas y éstas son los componentes de los complejos supramacromo- leculares; a su vez, estos ultimos se ensamblan para constituir los organulos de la célula. Los organulos y otras estructuras se organizan en células, Esta claro que las dimensiones, forma y propiedades fisicas de las biomoléculas sillares sencillas, deben determinar las dimensiones y las propiedades de las macromoléculas, cuya forma y topografia superficial debe, a su vez, determinar cémo se adaptan conjuntamente para for- mar estructuras supramoleculares; éstas ultimas determinan la estructura de los orgénulos celulares y por tltimo, la de la propia célula. “Un ejemplo espectacular de cémo el tamafio, la forma y las propiedades de una biomolécula sillar, relativamente pequefia, pueden influir en el tamafio, la forma y. el comportamiento biolégico de una célula entera, lo proporciona la enfermedad genética humana, llamada anemia falciforme. Las células rojas de la sangre de lo& pacientes que sulren de esta enfermedad poseen una composicién bioquimica normal, excepto en la hemoglobina, protetha transportadora del oxigeno. La pro- teina esta constituida por, aproximadamente, 600 restos ami- noacidos unidos en cuatro cadenas polipeptidicas. Las molé- culas de hemoglobina de estos pacientes difieren muy ligera- mente en su composicién de la hemoglobina normal, como resultado de una mutacién genética: en la hemoglobina fal- ciforme, dos moléculas de acido glutamico de la hemoglobina normal se hallan substituidas por dos moléculas del amino- acido valina. Este ligero cambio, que afecta solamente a dos de los casi 600 restos aminoacidos, altera la estructura de la molécula de hemoglobina falciforme, de modo que se «apila> de una manera inadecuada con las moléculas vecinas. El de- fecto provoca, a su vez, un cambio profundo en la forma de todo el glébulo rojo sanguineo, el cual adopta la forma de una hoz o media luna, mientras que los eritrocitos normales son discos planos. Como consecuencia, las células rojas falcifor- mes tienden a agregarse en los vasos sanguineos pequefios, bloqueando la circulacién y provocando otras serias altera- ciones. Asi, solamente una diferencia muy pequefia en la estructura de una pequefia y simple molécula de un amino- 30Capitulo 1 Biomoléculas y células Tapia 1-9. Dimensiones y pesos aproximados de algunas biomoléculas y componentes celulares. Peso Longitud, nm Daltones Picogramos Alanina 05 89 Glucosa 07 180 Fosfolipido 35 750 Mioglobina (una proteina pequefia) 3.6 16900 Hemoglobina (una proteina de ta- mafio medio) 68 65.000 Miosina (una proteina grande en forma de bastén) 160 470.000 Ribosoma de E. coli 18 2.800.000 Bacteri6fago ¢X174 de E. coli 25 6 200 000 Virus del mosaico del tabaco (un bastén) 300 40 000 000 6.68 x 10* Mitocondria (célula hepatica) 1500 15 Célula de E. coli 2000 2 Cloroplasto (hoja de espinaca) 8000 60 Célula hepatica 20.000 8000, Acido (cttyo peso es de alrededor de 100 daltones y cuya lon- gitud es de unos 0,7 nm) puede dar por resultado un cambio profundo no solamente en la molécula de hemoglobina de Ja cual es un componente, sino también en la estructura, mucho mayor, de toda la célula roja sanguinea (peso de aproxima- damente 1 x 10% daltones; didmetro 7000 nm). Para aportar alguna orientacién con respecto al tamaiio relativo de varias bioestructuras, la tabla 1-9 ofrece algunos datos sobre el peso y las dimensiones de las moléculas sillares representativas, de las macromoléculas celulares, de los con- juntos supramoleculates, y de los organulos, virus y células. . Organizaci6n estructural de las células A lo largo del libro relacionaremos la estructura y funcién dinamica de cada tipo de biomolécula con la estructura y papel biolégico de los diversos componentes celulares, por ejemplo, paredes celulares, membranas, ribosomas, cloroplastos, siste- mas contractiles, reticulo endoplasmatico y nucleo celular. Por ello, antes de que comencemos el estudio detallado de las biomoléculas, es importante revisar los rasgos estructurales principales de los diferentes tipos de células, las dimensiones y composicién molecular de sus organulos internos y la com- partimentacién y divisién de las funciones celulares vitales entre dichas estructuras internas. Esta visién panoramica se presenta esquematicamente en las figuras 1-7 a 1-9, que re- presentan tres tipos de células, La primera, la bacteria Esche- richia coli, el miembro mejor conocido, bioguimica y genét camente hablando, de la gran clase de células procariéticas, (fig. 1-7), La segunda es el hepatocito, o célula hepatica, de la rata, ejemplo bien estudiado de la otra gran clase de célu- las, las eucarioticas (fig. 1-8). Tanto la célula de E. coli como el hepatocito obtienen su energia de la oxidacién de las molé- culas organicas nutrientes adquiridas del entorno. La figu- ra 1-9 muestra un ejemplo de una célula fotosintética que obtiene energia de la luz solar.’ La célula escogida procede de la hoja verde de una planta superior y es también una célula eucariética. 31PARTE | COMPONENTES MOLECULARES DE LAS CELULAS Ficura 1-7 Organizacién estructural de las células procariéticas. Las células procariéticas son células sencillas y muy pequefias; poseen una membrana unica, la membrana celular, la cual se halla rodeada, habitualmente por una pared celular rigida. Puesto que no poseen otras membranas no contienen nucleo ni otros orgénulos membranosos tales como mitocondtrias o reticulo endoplasmatico. Los procariotas comprenden las eubacterias, las algas cianoficeas, las espiroquetas, las rickettsias y el micoplasma u organismos simil- pleuroneumoniales. Solamente contienen un cromosoma, formado por una molécula de DNA de doble hélice y densamente arrollado para formar la zona nuclear. Los procariotas se reproducen en gtan parte por divisién asexuada. Fueron las primeras células que surgieron de la evolucion bioldgica. Células en divisisn de E, coli, teftidas, mostrando la pared celular y la membrana, asi como el DNA filamentoso en la zona nuclear. (G. Decker.) Lud 1,8 «zm ° * Superficie de una célula en division de E. coli, teftida, para mostrar los numerosos pili. (A. Riter.) bo 1,0 wm bo Célula de E. coli, tefiida, mostrando 0,5 um los ribosomas. (L. D. Simon.) Micrografias electrénicas de la bacteria E. coli. Este organismo aerobio es un miembro del grupo coliforme de bacterias, que se encuentra tipicamente en el tracto intestinal del hombre. La célula madura es una varilla cilindrica de 2 #m de longitud y 1 pm de didmetro, y su peso es de alrededor de 2 pg. Las cétulas de E. coli se desarrollan con rapidez en un medio sencillo que contenga solamente glucosa como fuente de carbono e iones amonio como fuente nitrogenada. El tiempo de divisién puede abarcar sdlo 20 minutos a 37°C. La mayor parte de nuestro conocimiento sobre la base molecular de la genética procede del estudio de diversas razas y mutantes de E. coli y bacteridfagos de E. coli. Aunque se conoce mas de la bioquimica y de la genética de E. coli que de cualquier otra célula, nos hallamos todavia muy lejos de una descripcién molecular completa. 32Capitulo 1 Biomoléculas y células Dibujo esquematico Composicién molecular Propiedades y funciones Pared celular y membrana Membrana_ Pared. celular celular proteica Bicapa’ lipidica Ribosomas Pepe Granulos de reserva La pared celular contiene una ar- madura rigida constituida por ca- denas polisacaridas entrecruzadas con cadenas peptidicas cortas. Su superficie exterior est4 recubierta con lipopolisacéridos, Los pili, que no se encuentran en todas las bacterias, son extensiones de Ja pared celular. La membrana celular contiene aproximadamente un 45% de lipido y un 55% de proteina: los lipides forman una fase no polar continua. Los repliegues de la membrana celular se llaman mesosomas. El material genético es un cromo- soma nico, constituido por un DNA duplo-helicoidal de 2 nm de didmetro y 1,2 mm de longi- tud, con enrollamiento compacto. Cada célula de E. coli contiene cerca de 15000 ribosomas; cada uno de ellos pose una subunidad principal y otra menor. Cada sub- unidad contiene cerca del 65. % de RNA y un 35 % de proteina. El E. coli y otras muchas bacte- rias contienen grénulos de reserva que son polimeros de azticares. Algunas bacterias contienen gra- nulos de acido poli-f-hidroxibu- tirico. La porcién soluble del citoplasma es muy viscosa; la’ concentracion de proteina es muy elevada, su- perando el 20 %. La pared celular protege a la bac- teria contra el hinchamiento en medios hipoténicos. Es porosa y permite el paso de la mayoria de moléculas pequefias. Algunos de Jos pili son huecos y pueden ser- vir para transferir el DNA du- rante la conjugacion sexual, La membrana es una zona selec- tivamente permeable que permite que la atraviesen libremente el agua, ciertos nutrientes e iones metalicos. Los enzimas responsa- bles de Ja conversién de la ener- gia de los alimentos en ATP, se hallan localizados en la membrana. EI DNA es el portador de la in- formacién genética. Durante la division cada hebra se replica ori- ginando dos moléculas hijas du- plo-helicoidales. Los ribosomas son los centros de sintesis proteica. El "RNA men- sajero se une a Jas ranuras entee Jas subunidades y especifica la secuencia de los aminodcidos en Jas cadenas polipeptidicas en cre- cimiento. Cuando se necesitan combustibles, estos polimeros se degradan enzi- maticamente produciendo glucosa © acido B-hidroxibutirico libre. La mayor parte de las proteinas del citosol son enzimas que se precisan en el metabolismo. El ci- tosol contiene también intermedia- rios metabélicos y sales inorgé- nicas. 33PARTE 1 COMPONENTES MOLECULARES DE LAS CELULAS Figura 1-8 Organizacién estructural de las células eucariéticas. Las células eucariéticas son mucho mayores y mucho més complejas de las células procariéticas. El volumen celular de la mayor parte de las eucaristicas es de 1000 a 10000 veces mayor que el de las tipicas procariotas. Casi todas las células de los organismos superiores, tanto del mundo animal como del vegetal. son eucariéticas, y también lo son las de los hongos, los protozoos y la mayor parte de las algas. Las eucariotas contienen una membrana que rodea el nicleo, El material genético se halla dividido entre varios 0 muchos cromosomas, los cuales sufren la mitosis durante la divisién de la célula. Las eucariotas también contienen organulos membranosos tales como las mitocondrias y los cuerpos de Golgi, asi como un reticulo endoplasmético, Muchas de sus reacciones metabélicas se hallan separadas en compastimientos estructurales. Las eucariotas son de origen evolutivo més reciente que las procariotas; presumiblemente, derivan de estas tiltimas. ee x Micrografia electrénica de una seccién delgada de una célula aislada de higado de rata (hepatocito) jada con tettéxido de osmio. Los hepatocitos de higado de rata son poliédricos y poseen un didmetro de alrededor de 20 wm. Son células mefabdlicamente versatiles, cuya funcién mas importante es la transformacién bioquimica y la distribucién de las moléculas de los alimentos que Megan al higado procedentes del tracto intestinal, Almacenan glucosa en forma de glucégeno, preparan los residuos nitrogenados para la excrecién y sintetizan las proteinas del plasma sanguineo y los lipidos. Los hepatocitos son capaces de realizar todas las principales «rufas esenciales» representativas de las actividades metabdlicas de las células. Son quizés las células animalés mejor estudiadas a causa de su facil asequibilidad en cantidad y de que pueden fraccionarse con facilidad, después de homogeneizacién para dar nicleos, mitocondrias, reticulo endoplasmético (la fraccién microsomal) y otras fracciones subcelulares mediante centrifugacién diferencial. 34Capitulo 1 Biomoléculas y células La pared celular de los hepatoci- | Las propiedades adhesivas de las tos es flexible y pegajosa. Esta for- | cubiertas celulares son especificas mada por mucopolisacaridos aci- | y desempefian un papel impor- dos, glucolipidos y glucoproteinas. | tante en el reconocimiento célula~ célula y, por tanto, en la organi- zacién del tejido. La membrana plasmatica es se- lectivamente permeable. Contiene sistemas de transporte activo para Nat y K*, glucosa, aminodcidos y otros nutrientes, asi como cier- to namero de enzimas importantes. Membrana celularMembrana celular El espesor de la membrana plas- matica es de unos 9 nm y con- tiene aproximadamente las mis- mas cantidades de lipides y pro- teinas. Los lipides van dispuestos en bicapa. Contiene una mayor variedad de lipidos que las mem- branas Wacterianas. Molécula~' proteica Cubierta celular Bicapa Tia? Gabi Durante la mitosis los cromosomas experimentan replicacién de su DNA y separacién en cromoso- mas hijos. EI niicleo, de unos 4-6 nm de dia- metro, esté rodeado de una envol- tura perinuclear. El DNA del in- terior esta combinado con histo- nas y organizado en cromosomas. El nucléolo es rico en RNA. Envoltura perinuclear Las mitocondrias son las fabricas de energia en la célula, donde los glicidos, los lipidos y los amino- acidos se oxidan a CO, y H;O por el oxigeno molecular, y Ia energia liberada se transforma en energia del ATP, Los enzimas del transporte electrénico y de la conversion de energia estén loca- lizados en la membrana interna. En cada hepatocito hay unas 800 mitocondrias, Son de forma glo- bular y poseen un didmetro algo superior a 1 am, y ocupan cerca del 20 % del volumen citoplas- matico, Sus membranas externa e interna difieren en composicién lipidica. La matriz es rica en en- zimas. Crestas Complejo de Golgi: consta de ve- siculas aplanadas con una sola membrana, a veces apiladas, que por estrangulamiento producen otras menores. Algunas se con- vierten en vacuolas que-concen- tran productos de secrecién. El aparato de Golgi actiéia en la secrecién de los productos de la célula tales como las proteinas, hacia el exterior. También cola- bora a formar la membrana del plasma y las membranas de los lisosomas. Microcuerpos (peroxisomas) Los microcuerpos son vesiculas con membrana sencilla, de unos 0,5 um de diémetro. Contienen ca- talasa, D-aminoacido-oxidasa ura- to-oxidasa y otros enzimas de oxi- dacién frecuentemente presentes en ordenacién cristalina. Los microcuerpos participan en la oxidacién de algunos nutrientes. EI peréxido de hidrégeno, pro- ducto de reduccién del oxigeno en estos organulos, se descompo- ne y forma agua y oxigeno. cristalina io Ordenacion Los lisosomas actian en la diges- tién de materiales introducidos en la célula por fagocitosis 0 pino- citosis. Sirven también para dige- rir los componentes celulares des- pués de la muerte de las células. Lisosomas Los lisosomas son vesiculas de membrana sencilla (de 0,25 a 0,5 gum de diametro) que contienen enzimas hidroliticos como ribonu- cleasa y fosfatasa. El reticulo endoplasmatico esta constituido por vesiculas aplana- das de una sola membrana, cuyos compartimientos internos, Ilamados cisternas, se interconectan for- mando canales a través del cito- plasma. La superficie rugosa del reticulo endoplasmatico esté ta- chonada con los ribosomas, que son mayores que en los proca- riotas. Las proteinas sintetizadas por Jos ribosomas adheridos atraviesan la membrana y aparecen en el espa- cio intracisternal, que forma un canal muy ramificado para el transporte intracelular hacia la periferia de Ia célula. La sintesis proteica por ribosomas no ligados se produce también, igual que en los procariotas. Reticulo endoplasmatico y ribosomas Ribosomas 35