“Año del fortalecimiento de la Soberanía Nacional”

UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR

DE SAN MARCOS
(Universidad del Perú, DECANA DE AMÉRICA)
FACULTAD DE INGENIERÍA GEOLÓGICA,
MINERA, METALÚRGICA Y GEOGRÁFICA.
E.P. INGENIERÍA GEOLÓGICA

BIOMARCADORES
PALEONTOLOGÍA GENERAL

DOCENTE: ELESCANO YUPANQUI, JUAN MANUEL

ALUMNO: FIERRO LOYOLA, OMAR CESAR
CICLO ACADÉMICO: 2022-2
CÓDIGO: 21160066

LIMA – PERÚ

2022
 Biomarcadores / UNMSM

ÍNDICE
INTRODUCCIÓN ............................................................................... 1
DESARROLLO ................................................................................... 2
1. ¿QUÉ ES UN BIOMARCADOR? ............................................ 2
2. APLICACIONES DE LOS BIOMARCADORES ..................... 2
3. PALEONTOLOGÍA MOLECULAR .........................................5
4. FORMACIÓN DE LOS BIOMARCADORES .......................... 5
5. IMPORTANCIA DE LOS BIOMARCADORES ...................... 6
6. PRINCIPALES BIOMARCADORES........................................6
7. TECNICAS DE ANALISIS PARA BIOMARCADORES ........7
BIBLIOGRAFÍA ................................................................................. 8
 Biomarcadores / UNMSM

INTRODUCCIÓN
La Paleontología es la ciencia que se ocupa del estudio de los fósiles bajo todos los puntos
de vista y, a través de ellos, de la reconstrucción de la vida en el pasado geológico. El
paleontólogo cuenta con una importante ventaja de cara al estudio de la evolución de la
biota, a diferencia del neontólogo, al disponer del registro fósil para acceder a su
dimensión histórica, pero la propia naturaleza de este registro (que representa sólo una
pequeña muestra no aleatoria de la vida en el pasado) ha impuesto una serie de
limitaciones a los trabajos que se efectúan en nuestra disciplina. Tal y como indicara
Efremov, los fósiles representan el resultado de una transferencia de materia desde la
biosfera hasta la litosfera, que en la mayor parte de los casos suele ir acompañada de una
pérdida sustancial de información. Una de las consecuencias más importantes de dichos
procesos es que normalmente sólo se conservan los tejidos esqueléticos mineralizados,
por lo que el estudio de los fósiles se ha visto estrechamente limitado al de su morfología.
No obstante, durante las dos últimas décadas se han abierto nuevas perspectivas con la
incorporación de técnicas de la Biología Molecular en los estudios paleontológicos y
arqueológicos, que posibilitan el análisis de la información preservada en las
biomoléculas del pasado.

Dos han sido los enfoques seguidos con vistas a recuperar esta información bioquímica:
la amplificación de secuencias de DNA fósil, mediante la técnica de la, y el análisis de la
especie-especificidad de proteínas fósiles, usando métodos inmunológicos. Su aplicación
a través de las biomarcadores ha permitido recuperar información sobre diversas especies
fósiles o extinguidas en tiempos históricos por el hombre

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Paleontología General
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➢ ¿QUÉ ES UN BIOMARCADOR?
Los biomarcadores son evidencias de compuesto orgánicos presentes en la geosfera, sus
estructuras químicas están íntimamente relacionadas con la estructura de las sustancias
precursoras depositadas en el sedimento. Son moléculas fósiles de lípidos y otros
productos orgánicos, que se han preservado en los sedimentos, tal como los fósiles
clásicos conocidos.

Las sustancias orgánicas que escapan del proceso de mineralización se reducen

químicamente a esqueleto; estos pueden permanecer intactos durante ciento de millones
de años. Provienen de una inmensa variedad de metabolitos primarios y secundario de
origen vegetal y animal (hongos, alitas, líquenes y bacterias, etc). Proporcionan huellas
dactilares científicas de los depósitos de petróleo, que ayudan a los científicos y los
exploradores de petróleo a descifrar donde, cuando y como se formaron dicho depósitos.

Son atribuidas a las eucariotas mas antiguas, se informan desde estratos de 2,700 millones
de años en Australia Occidental. El eucariota más antigua determinado por moléculas
fósles es Grypani espiralis con 1890 millones de años.

➢ APLICACIONES DE LOS BIOMARCADORES

Noviembre 2012: Geoscientist Dr. Juliane Müller recibe el Premio Alemán de
Estudio por su investigación pionera climático.

Bremerhaven, 2 de noviembre de 2012. El Dr. Juliane Müller será premiado con un

segundo lugar en el Premio Alemán de Estudio 6 de noviembre en Berlín. La Fundación
Körber honra el geo científico del Instituto Alfred Wegener de Investigación Polar y
Marina en la Asociación Helmholtz de su tesis doctoral pionera en la distribución del
hielo marino. Los resultados de su investigación facilitarán mejoras fundamentales en la
predicción del clima.

Premios de la Fundación Körber el Premio Alemán de Estudio a jóvenes científicos que

realizan investigaciones en temas de actualidad y de relevancia social. Tres primeros
premios y seis segundos premios se otorgan anualmente bajo el patrocinio del presidente
Federal a investigadores de todas las disciplinas que han completado doctorados
pendientes. Con un valor total superior a los 100.000 euros, el Premio de Estudio es una
de la mayoría altamente dotado para jóvenes científicos en Alemania.

Juliane Müller recibe el premio por su tesis doctoral en la que se muestra cómo la
distribución del hielo marino ha alterado en el Ártico. Gracias a sus descubrimientos, las
condiciones del hielo marino de los últimos 30.000 años se pueden regional reconstruido.
Así pues, el objetivo geo científico en el punto de muchos modelos climáticos débil. "Los

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modelos climáticos existentes con frecuencia encuentran dificultades en lo que refleja de

manera realista los cambios en la cobertura de hielo marino. También lo general no tienen
los datos del pasado de manera que, por ejemplo, la fusión del hielo en la última década
ha sido muy subestimado ", explica Juliane Müller. Sin embargo, es importante hacer las
estimaciones correctas debido a que el retroceso del hielo marino afecta no sólo el
ecosistema del Ártico, pero a largo plazo altera las corrientes oceánicas y las circulaciones
de aire que también influyen en el sistema meteorológico europeo. La imprecisión de los
modelos, por tanto, hace que sea difícil para los científicos a predecir cómo el hielo se
derrite actuales tendrán un impacto en el clima. Estas son lagunas que Juliane Müller le
gustaría cerrar a través de su investigación.

El geo científico utilizar biomarcadores en sus experimentos para la tesis doctoral para
determinar la distribución del hielo marino del pasado. Los científicos pueden interpretar
un biomarcador, también conocida como molécula de fósiles, como la huella digital de
los organismos muertos. Cuando las algas mueren, por ejemplo, sus restos se hunden
hasta el fondo del mar donde depositan en capas en el transcurso de los años. Estos
depósitos se denominan sedimentos. Los investigadores pueden analizar los marcadores
biológicos de un organismo vivo en muestras de sedimentos y determinar por medio de
la estratificación cuando un tipo específico de algas proliferaron.

En 2007 investigadores de la Universidad de Plymouth ya estaban usando un

biomarcador diatomea para sacar conclusiones acerca de la distribución del hielo
marino.

La diatomea crece exclusivamente en el hielo marino. Por lo tanto, los científicos

asumieron que los biomarcadores de diatomeas indicarían si y cuando un área estaba
cubierta por el hielo marino. Sin embargo, si el biomarcador estaba ausente esto podría
significar dos cosas. O bien la zona estaba libre de hielo o el hielo marino era
extraordinariamente gruesa porque si la masa de hielo es demasiado compacta sin luz
penetrará y las algas diatomeas no puede crecer.

Esta ambigüedad fue el motivo de Juliane Müller para ampliar el enfoque de la

investigación de biomarcadores. "Decidí usar un segundo biomarcador en lugar de
concentrarse únicamente en la diatomea. El fitoplancton marino demostrado ser
adecuados para este propósito. Crece preferentemente en agua libre de hielo y reacciona
de forma muy sensible a la deficiencia de luz. Esto me permitió establecer tres supuestos:
si los biomarcadores tanto de la diatomea y el fitoplancton estaban ausentes, el hielo del
mar era muy gruesa en el momento dado. Si la molécula fósil de la diatomea estaba
ausente, pero la del fitoplancton evidente, el área debe haber sido libre de hielo. Por el
contrario, si solo me encontré con el biomarcador de la diatomea, puede inversamente
concluir que el hielo marino existía, pero no era inusualmente gruesa.

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Paleontología General
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Los largos núcleos de sedimentos y los sedimentos superficiales para su tesis doctoral
vinieron del estrecho de Fram, el nombre de la vía marítima entre el Atlántico Norte y el
Océano Ártico. Ella primero se analizaron los primeros centímetros de las muestras. "Los
sedimentos superficiales son como una instantánea de las condiciones ambientales y
climáticas de una región determinada y mapa el pasado más reciente. Examiné las
muestras y luego comparé mis resultados con las mediciones del hielo marino existentes
de grabaciones satélite. Ya que mis suposiciones estuvieron de acuerdo con los valores
reales, deduje que mi método en el estrecho de Fram proporciona los resultados correctos
al menos por sedimentos más jóvenes. Ahora incluso he sido capaz de hacer declaraciones
cuantitativas sobre el alcance de la cobertura de hielo marino en el pasado. Esto me ha
animado a probar depósitos de sedimentos de edad para los que no existen registros sobre
la distribución del hielo marino”, explico Juliane Muller.

Empleando compuestos preservados en rocas sedimentarias de más de 635 millones de

años de antigüedad, varios investigadores han encontrado algunas de las evidencias más
antiguas de la existencia de vida animal en nuestro planeta. Las demosponjas proliferaron
en las aguas costeras superficiales de lo que hoy es Omán, según el investigador Gordon
Love de la Universidad de California en Riverside, y sus colegas del MIT y de otras
instituciones.

Las demosponjas aparecieron durante la Era Neoproterozoica, hace entre 1.000 y 542
millones de años, una era de extremos climáticos y desarrollos evolutivos biológicos que
culminaron con el surgimiento de especies animales y nuevos ecosistemas. Estas esponjas
representan actualmente la evidencia más antigua de animales en el registro fósil.Los
compuestos preservados, llamados esteranos, que Love y sus colegas han descubierto en
tales fósiles de esponjas, existen en una gran variedad de configuraciones bioquímicas.

Estos compuestos también son llamados "biomarcadores", dado que pueden indicar la
existencia de organismos vivientes. Los biomarcadores que Love y sus colegas han
identificado se encuentran actualmente en las demosponjas vivientes. Los investigadores
los han detectado en las rocas de 635 millones de años de antigüedad, pero no han podido
encontrarlos en muestras más antiguas de la misma formación geológica. El que tales
biomarcadores hayan sido encontrados en muestras asociadas con rocas sedimentarias
formadas en aguas superficiales, brinda apoyo a la hipótesis de que las demosponjas
surgieron en aguas costeras cálidas y poco profundas. Alimentándose de desechos
orgánicos disueltos o desmenuzados en el agua, estos animales acabaron emigrando hacia
el mar profundo. Hoy residen allí, y también en aguas costeras menos profunda.

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➢ PALEONTOLOGÍA MOLECULAR
Es aquella parte de la Paleontología que se encarga de investigar y estudiar moléculas
orgánicas complejas que se encuentran en restos, huellas o fósiles que han sido dejados
por organismos, pues cuando las moléculas orgánicas complejas se encuentran en
asociación con los organismos precursores que las produjeron, pueden dar información
importante sobre su edad, forma de vida y relaciones evolutivas de los organismos El
campo de la paleontología molecular ha proporcionado importantes conocimientos sobre
los eventos evolutivos, el descubrimiento y la caracterización de especies extintas; para
ello ha realizado investigaciones sobre mineralización y geoquímica, y utiliza técnicas de
análisis molecular al ADN de los fósiles, donde se puede cuantificar el nivel de parentesco
entre dos organismos para los que se ha recuperado el ADN.

➢ FORMACIÓN DE LOS BIOMARCADORES

En Geoquímica, los biomarcadores más estudiados son lípidos procedentes de pigmentos
de la pared celular y de membranas de constituyentes celulares esenciales para la
integridad y fisiología celular. Al contrario de lo que ocurre con los carbohidratos,
proteínas y ácidos nucleicos, que no perduran después de la muerte celular, los lípidos
resisten al paso del tiempo ya que sus restos hidrocarbonados hidrofóbicos son difíciles
de degradar, especialmente en ausencia de oxígeno

Las tres divisiones principales (dominios) del mundo viviente son Arquea, Eubacteria y
Eucariota. El árbol de la vida, basado en relaciones filogenéticas, propone un origen
común de los tres grupos. Mientras que los eucariotas se clasifican principalmente
atendiendo a la morfología, los procariotas lo hacen de acuerdo con su bioquímica y los
hábitats en los que se desarrollan. Los tres grupos tienen una representación muy
significativa en lo que a biomarcadores involucra. Los biomarcadores ofrecen
información interesante sobre el origen de la vida y su evolución constituyen
prácticamente el único registro durante buena parte del Precámbrico, periodo en el que
carecemos de fósiles macroscópicos significativos. Recoge los principales eventos
biológicos y geológicos en la historia de la Tierra y los registros de biomarcadores
asociados.

Para que los restos orgánicos de los organismos constituyan una fracción importante en
los sedimentos se requiere la existencia de productividad primaria y la preservación de la
materia orgánica. Estas condiciones generalmente son complementarias, por lo que el
peso relativo de cada una de ellas es una cuestión difícil de dilucidar en muchos casos.

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➢ IMPORTANCIA DE LOS BIOMARCADORES

a. Indicadores del origen de la materia orgánica

Los biomarcadores identificados en sedimentos pueden ser específicos de un origen
biológico único o múltiple, tales como algas (principalmente en sedimentos con gran
aporte terrestre) o bacterias (en todo tipo de sedimentos). La mayoría de los marcadores
biológicos presentes en los sedimentos pueden adscribirse a uno de estos orígenes. Sin
embargo, un determinado biomarcador puede ser específico de una especie, género o
clase de organismo, o bien estar ampliamente distribuido en diferentes familias y tener
un origen menos específico.

b. Indicadores del medio ambiente de deposición

La diagénesis o evolución de los compuestos bioquímicos presente en la Geósfera
depende, en gran parte, del medioambiente deposicional, por lo que una importante
aplicación del estudio de biomarcadores es la reconstrucción del paleo ambiente
sedimentario de una cuenca.

Como hemos visto anteriormente, en muchos casos la presencia de un biomarcador

característico puede atribuirse a organismos específicos que crecen o se desarrollan en
unas condiciones medioambientales peculiares, por lo que se podría inferir el paleo
ambiente deposicional del sedimento. Así, por ejemplo, la presencia del hidrocarburo
isoprenoide Botriococano, característico del alga de agua dulce Botryococcus braunii,
sería indicativo de un ambiente de deposición lacustre.

➢ PRINCIPALES BIOMARCADORES
Los biomarcadores más estudiados y comunes son los lípidos, estos provienen de la
membrana celular, los pigmentos de la pared celular y forman parte fundamental de los
constituyentes celulares. Resisten al paso de tiempo ya que sus restos hidrocarburos
hidrofóbicos son difíciles de degradar a diferencia de lo que sucede con la carbohidratos,
proteínas y ácidos nucleicos, pues estos no perduran la luego de la muerte celular.

a. N-Alcanos
Son hidrocarburos saturados de composición orgánica constituidos de carbono e
hidrogeno que presenta una estructura de cadena lineal con un rango de quince a cuarenta
carbonos. Forma parte de los sedimentos y son utilizados para diferenciar el tipo de origen
de la materia orgánica, debido a que estos permanecen casi inalterables a través del
tiempo. En su composición presenta un solo grupo funcional, gracias a ello son menos

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susceptibles a la degradación bacteriana y microbiana durante la diagénesis, pues no

presentan una alta reactividad química.

b. Esteranos
Son derivados de los esteroles, en su composición presenta enlaces dobles que durante la
diagénesis se enlazan con hidrógenos y forman una mezcla estereoquímica, estas se
emplean como parámetro de madurez y para detectar la biodegradación de crudos.

c. Isoprenoides
Son compuestos químicos formados por combinaciones de varias unidades de
isopropeno, se encuentran en una menor concentración en los extractos de crudo, son
utilizados en estudios de exploración, identificación de fuente, medidas e índices de
maduración y correlación.

d. Porifirinas
Fue la primera clase de compuestos usados como marcadores biológicos, permitieron
conjeturar la hipótesis acerca del origen del petróleo y sus remanentes de animales y
plantas, provienen de la degradación de plantas y bacterias. Provee información sobre el
material fuente y es empleado en exploración y explotación de petróleo.

TÉCNICAS PARA EL ANÁLISIS DE BIOMARCADORES

Los biomarcadores se encuentran presentes en concentraciones mínimas en las muestras,
estas forman parte de mezclas complejas con otros compuestos de diversas clases
químicas. Para poder estudiarlos se requiere extraer la materia orgánica contenida en los
sedimentos, para ello se utilizará disolventes orgánicos. El resultado obtenido se procesa
mediante cromatografía en columna, para obtener fracciones más sencillas y concentradas
en biomarcadores, posteriormente se procede a realizar un análisis, entre las diversas
técnicas utilizadas destaca la Cromatografía de Gases y Espectrometría de Masas.

.1. Espectrometría de masas:

Esta técnica se basa en la ruptura de las moléculas del compuesto aislado en las fases
anteriores y la obtención de la masa de los fragmentos que se producen, de acuerdo
con un patrón de comportamiento químico acorde con su estructura. La mayor parte
de las moléculas se romperán por los enlaces más débiles, dando lugar a una gran
cantidad de fragmentos con una relativa estabilidad que permiten medir su masa y
serán los fragmentos más comunes y características de cada molécula. Algunas
moléculas quedarán intactas, y se detectarán como un fragmento, cuya masa coincide
con la masa molecular del compuesto, denominado ion molecular. Todo ello queda

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registrado en un espectro de masas, considerado como la huella dactilar del compuesto

ya que es único para cada estructura. Esta técnica combinada permite identificar,
generalmente con la ayuda de bases de datos, la estructura y composición química de
los compuestos realizados.

.2. Cromatografía de gases:

Esta técnica tiene su base en la separación de conjunto de moléculas por sus propiedades
como tamaño, afinidad con distintos disolventes, composición, etc; de modo que cada
grupo de mezclas se separan en grupos de compuesto afines o individuales que
generalmente para su posterior análisis se emplearan técnicas complementarias.

BIBLIOGRAFÍA
Strimbu, K., & Tavel, J. A. (2010). What are biomarkers?. Current Opinion in HIV and
AIDS, 5(6), 463.

Griffiths, H. R., Møller, L., Bartosz, G., Bast, A., Bertoni-Freddari, C., Collins, A., ... &
Astley, S. B. (2002). Biomarkers. Molecular aspects of medicine, 23(1-3), 101-
208.

Mayeux, R. (2004). Biomarkers: potential uses and limitations. NeuroRx, 1(2), 182-188.

Jain, K. K., & Jain, K. K. (2010). The handbook of biomarkers (p. 200). New York:
Springer.

Waples, D. W., & Machiharia, T. (1991). Biomarkers for geologists.

Briggs, D. E., Evershed, R. P., & Lockheart, M. J. (2000). The biomolecular paleontology
of continental fossils. Paleobiology, 26(S4), 169-193.

Hoover, R. B., & Rozanov, A. Y. (2005). Microfossils, biominerals, and chemical

biomarkers in meteorites. NATO SCIENCE SERIES SUB SERIES I LIFE AND
BEHAVIOURAL SCIENCES, 366, 43.

Pérez-Crespo, V. A., ARROYO-CABRALES, J. O. A. Q. U. Í. N., & Polaco, O. J. (2012).

Uso de marcadores biogeoquímicos para el estudio de la dieta y el hábitat de los
mamutes de México. Arqueología Mexicana, 19, 76-79.

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Paleontología General