La disolución de la República Federal de Centroamérica, se debió a una serie de
sucesos que se iniciaron con la caída del gobierno liberal del Dr. Mariano Gálvez en el Estado de Guatemala en 1837 durante la segunda administración de Francisco Morazán como presidente de la Federación. Tras estos sucesos resurgió la guerra civil y Nicaragua se separó de la República el 30 de abril de 1838. El Congreso federal aceptó que se constituyera un nuevo Estado, Los Altos, cuya capital era Quetzaltenango, con las tierras occidentales de Guatemala. Honduras se separó de la unión el 5 de noviembre y el 14 de noviembre Costa Rica la imitó. Guatemala se separó el 17 de abril de 1839 y a principios de 1840 las tropas del capitán general Rafael Carrera y Turcios reincorporaron Los Altos. Con la contundente victoria que Carrera logró sobre las fuerzas federales de Morazán en 1840, quien trató de retomar Guatemala para los liberales tras la derrota de Los Altos en un desesperado intento por mantener la Federación, la República Federal que ansiaban los criollos liberales dejó de existir.
¿Por qué Guatemala perdió Chiapas?
Chiapas se encontraba dividido sobre si mantenerse unido a México o a Centroamérica. En 1823, Filisola llega a San Cristóbal de las Casas, maniobra que no fue muy bien vista por los chiapanecos, quienes se levantaron en armas y expulsaron al Ejército mexicano de su territorio. Con ello, se proclaman como Chiapas Libre, sin depender políticamente de ninguno de los dos territorios. En 1824, todavía con la incertidumbre política vigente, se llevó a cabo una consulta para decidir si se anexaban a México o a Centroamérica, o se mantenían independientes. El 12 de septiembre de ese año, se llevó a cabo la votación, cuyos resultados fueron: 56% a favor de anexarse a México, 35% a favor de Guatemala, y 9% querían ser independientes. Sin embargo, la región de Soconusco no se encontraba a gusto con esa decisión. Pese a ello, dos días después, el 14 de septiembre de 1824, se instauró a Chiapas -incluido Soconusco- como parte de México. Entre 1842 y 1882, Guatemala y México disputaron el territorio de Soconusco, pero fue hasta 1882 que se delinearon los límites.
¿Por qué Guatemala perdió Belice?
En 1884, debido al incumplimiento del tratado por parte de los británicos, Guatemala reclamó la recuperación del territorio de Belice; y en 1940, Guatemala indicó el carácter nulo del tratado de 1859 porque los británicos no cumplieron con la ayuda económica que prometieron en la cláusula VII del tratado. Más tarde, Belice, tras su independencia en 1981, afirmaría que el tratado no los obligaba a ellos ya que no lo firmó y demandó a la Corte Internacional de Justicia y las leyes internacionales que Guatemala respetó los límites en el tratado de 1859, aunque el Reino Unido nunca construyó la carretera prometida.