BIOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA

Semana 3

TALLER 3: BÚSQUEDA DE SECUENCIAS NUCLEARES

Integrantes:

Realice la búsqueda de la información solicitada utilizando la base de datos del National Center for
Biotechnology Information – NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/), Ensembl
(https://www.ensembl.org/index.html) y usar la herramienta Translate del portal Expasy
(https://web.expasy.org/translate/)

1. Ejemplo: INS en caninos (insulin)

Especie de interés
Nombre científico de la especie
Nombre del gen
N° cromosomas de la especie
Información del gen ID
Símbolo oficial
¿En qué cromosoma se
encuentra?
N° exones
Tamaño del gen
Secuencia FASTA del ARNm:

Ensembl
Código Uniprot
N° exones
N° exones codificantes
Tamaño de ARNm
Longitud de CDS
Tamaño de la proteína
Gráfico del gen:

A partir de la secuencia FASTA del ARNm, usar ‘Translate’ (ExPasy) para traducir la secuencia y
colocar la secuencia FASTA de la proteína traducida:

Ejemplo: Secuencia completa del gen en formato fasta (extraído de Ensembl, indicando UTR, seq.
codificante e intrones) (Ir)

2. Ejercicio 1: GLRA1 en bovinos (glycine receptor Alpha 1)

Especie de interés
Nombre científico de la especie
Nombre del gen
N° cromosomas de la especie
 BIOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA
Semana 3
Información del gen ID
Símbolo oficial
¿En qué cromosoma se
encuentra?
N° exones
Tamaño del gen
Secuencia FASTA del ARNm:

Ensembl
Código Uniprot
N° exones
N° exones codificantes
Tamaño de ARNm
Longitud de CDS
Tamaño de la proteína
Gráfico del gen:

A partir de la secuencia FASTA del ARNm, usar ‘Translate’ (ExPasy) para traducir la secuencia y
colocar la secuencia FASTA de la proteína traducida:

Ejercicio 1: Secuencia completa del gen en formato fasta (extraído de Ensembl, indicando UTR, seq.
codificante e intrones) (Ir)

3. Ejercicio 2: CLCN1 en caninos (chloride voltaje-gated channel 1)

Especie de interés
Nombre científico de la especie
Nombre del gen
N° cromosomas de la especie
Información del gen ID
Símbolo oficial
¿En qué cromosoma se
encuentra?
N° exones
Tamaño del gen
Secuencia FASTA del ARNm:

Ensembl
Código Uniprot
N° exones
N° exones codificantes
Tamaño de ARNm
Longitud de CDS
Tamaño de la proteína
Gráfico del gen:
 BIOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA
Semana 3
A partir de la secuencia FASTA del ARNm, usar ‘Translate’ (ExPasy) para traducir la secuencia y
colocar la secuencia FASTA de la proteína traducida:

Ejercicio 2: Secuencia completa del gen en formato fasta (extraído de Ensembl, indicando UTR, seq.
codificante e intrones) (Ir)

4. Ejercicio 3: MYBPC3 en gatos (myiosin-binding protein C3)

Especie de interés
Nombre científico de la especie
Nombre del gen
N° cromosomas de la especie
Información del gen ID
Símbolo oficial
¿En qué cromosoma se
encuentra?
N° exones
Tamaño del gen
Secuencia FASTA del ARNm:

Ensembl
Código Uniprot
N° exones
N° exones codificantes
Tamaño de ARNm
Longitud de CDS
Tamaño de la proteína
Gráfico del gen:

A partir de la secuencia FASTA del ARNm, usar ‘Translate’ (ExPasy) para traducir la secuencia y
colocar la secuencia FASTA de la proteína traducida:

Ejercicio 3: Secuencia completa del gen en formato fasta (extraído de Ensembl, indicando UTR, seq.
codificante e intrones) (Ir)

5. ANEXO: PEGAR LAS SECUENCIAS DE GENES COMPLETOS EN FASTA EN CADA CASO

6. Anexo Ejemplo 1: Secuencia completa del gen INS de caninos, en formato fasta (volver)

7. Anexo Ejercicio 1: Secuencia completa del gen GLRA1 en bovinos, en formato fasta (volver)

8. Anexo Ejercicio 2: Secuencia completa del gen CLCN1 en caninos, en formato fasta (volver)
 BIOLOGÍA MOLECULAR Y GENÉTICA
Semana 3

9. Anexo Ejercicio 3. Secuencia completa del gen MYBPC3 en gatos, en formato fasta (volver)