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La sistemática es definida como el estudio de la diversidad biológica y de las relaciones entre organismos, y la
taxonomía es la parte de la sistemática biológica, que proporciona los principios, reglas y procedimientos para la
clasificación de los sistemas vivos. Los criterios aplicados a dichas clasificaciones biológicas han variado
notablemente a lo largo de la historia, en función de las creencias, religión o cosmovisión en el caso de los
naturalistas, o de acuerdo con las concepciones de la especie y sus atributos, a las teorías acerca de la historia
evolutiva de los organismos, al reconocimiento de patrones bióticos y a las características de los seres; esto ya en
tiempos más "modernos". En todos los casos, las filosofías prevalecientes han sido importantes, como marcos de
referencia de la clasificación. Actualmente, hay un conocimiento mayor de la sistemática y taxonomía de las
especies, lo que significa que hay un mejor entendimiento de los atributos biológicos de los organismos o grupos de
ellos y de su historia evolutiva (filogenia).
● Tres Dominios
En 1977, Carl Woese y sus colaboradores encontraron que dentro de los procariotas se habían incluido organismos
que, a nivel genético, eran muy diferentes. Por lo que construyó un árbol filogenético en función de las similitudes
entre los ARN procedentes de estas especies que diferían, tanto de los procariotas como de los eucariotas. Esto
aunado a la comparación de la estructura de los lípidos de la membrana y la sensibilidad a los antibióticos planteó la
necesidad de definir un nuevo taxón, el de Dominio, que estaría por encima del Reino y reagruparía en tres grandes
dominios a todos los seres vivos.
A la vez propone la existencia de una célula que fuera un antepasado común de todos los seres vivos denominado
progenote y que originó a tres tipos diferentes de células Archaea (Arqueobacterias), Bacteria (Eubacteria) y Eucarya
(Eucariotas).
● Cinco reinos
En 1969, Robert Whittaker propone el sistema de los cinco reinos, basándose principalmente en las diferencias entre
procariotas y eucariotas.
- Amebas