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ALIMENTACION, NUTRICION Y SALUD ALIM. NUTRI. SALUD
Copyright © 2007 INSTITUTO DANONE Vol. 14, N.º 4, pp. 89-101, 2007

Genómica nutricional

D. Corella
UNIDAD DE EPIDEMIOLOGÍA GENÉTICA Y MOLECULAR. DEPARTAMENTO DE MEDICINA
PREVENTIVA Y SALUD PÚBLICA, CIENCIAS DE LA ALIMENTACIÓN, TOXICOLOGÍA Y MEDICINA
LEGAL. FACULTAD DE MEDICINA. UNIVERSIDAD DE VALENCIA

RESUMEN ABSTRACT

L a revolución genómica ha impulsado el desarrollo


de nuevas tecnologías que pueden integrarse en las cien-
T he genomic revolution has catapulted the develop-
ment of several new technologies that can be applied in
cias de la nutrición. Genómica, transcriptómica, proteómi- nutritional sciences. Genomic, transcriptomic, proteomic,
ca, metabolómica y bioinformática están comenzando a metabolomic, and bioinformatic techniques are already
aplicarse para facilitar el estudio de las denominadas inte- beginning to facilitate the study of gene-diet interactions at
racciones gen-dieta, tanto a nivel celular, individual como the cell, individual, and population level. Although the
poblacional. Aunque los mecanismos responsables de las mechanisms responsible for the interindividual differences
frecuentemente observadas diferencias interindividuales en in dietary response are far from being fully understood,
la respuesta a la dieta no son conocidos, la influencia ge- the presence of a genetic component has been proposed
nética en los mismos ha sido propuesta durante varias dé- for several decades. Propelled by these new technologies
cadas. Impulsada por estas nuevas tecnologías, se ha in- and paradigms, nutrition science has introduced the new
troducido en investigación nutricional el término de term of “nutritional genomics”. Nutritional genomics in-
“Genómica Nutricional”. La Genómica Nutricional investi- vestigates the interaction of food and its components with
ga la interacción entre los componentes de los alimentos the genome at the molecular, cellular, and systemic level;
con el genoma, tanto a nivel molecular, como celular y sis- the goal is to use personalize diet to prevent or treat dis-
témico, con el objeto de conseguir un mejor conocimiento ease. Understanding the interrelationships among genes,
sobre la personalización de las dietas para prevenir o tra- gene products, and dietary habits is fundamental to identi-
tar la enfermedad. El conocimiento de estas interrelacio- fying those who will benefit most from or be placed at risk
nes entre dieta y genes será fundamental para identificar a by nutritional interventions. To understand these interac-
aquellas personas que más se beneficien por determinadas tions there is a need for additional research in the “omics”
intervenciones nutricionales. Sin embargo, para alcanzar of nutrition.
este conocimiento todavía es necesaria mucha más inves-
tigación en las ómicas aplicadas a la nutrición.

Palabras clave: Genómica. Nutrición. Polimorfismos. Key words: Genomics. Nutrition. Polymorphisms. Omics.
Ómicas.

En febrero de 2001, se publicaron durante la misma


INTRODUCCIÓN semana dos borradores del genoma humano en dos
de las revistas científicas internacionales más presti-
giosas. En Nature, se publicó la versión preliminar
El siglo XXI comenzó con la publicación de los re-
del genoma humano a la que había llegado el deno-
sultados de uno de los proyectos de mayor enverga-
minado consorcio público internacional (Internatio-
dura, colaboración internacional y potenciales reper-
nal Human Genome Sequencing Consortium,
cusiones sobre la salud que se hayan realizado en
2001); y en Science, se publicó la versión prelimi-
todos los tiempos, el Proyecto Genoma Humano.
nar del genoma que había obtenido una empresa

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privada denominada CELERA genomics (Venter y cas, legales y sociales derivadas de la secuenciación
cols., 2001), fundada por Craig Venter y que repre- del genoma humano. Con estos antecedentes, el 1
sentaba la competencia del consorcio público. Tras de octubre de 1990 se inicia oficialmente el Proyec-
la publicación de estos borradores se siguió trabajan- to Genoma Humano como proyecto público de in-
do en la secuenciación del genoma, localización de vestigación internacional al que se suman otros paí-
genes, corrección de errores y gestión de datos, has- ses, con los objetivos que se resumen en la tabla I
ta que en abril de 2003, se dio por finalizado oficial- (Watson y cols., 1990; Collins y cols., 2001). Aun-
mente el Proyecto Genoma Humano según sus ob- que inicialmente se fijó el año 2005 como fecha de
jetivos iniciales, realizando una publicación finalización del Proyecto Genoma Humano, gracias
conmemorativa (Collins y cols., 2003). Esta fecha se al espectacular desarrollo de la biotecnología y de la
hizo coincidir con los 50 años transcurridos desde bioinformática, así como de la competencia privada,
que en abril de 1953 Watson y Crick describieran la la finalización oficial del Proyecto pudo llevarse a ca-
estructura de la doble hélice del ADN, descubrimien- bo mucho antes.
to por el que fueron galardonados con el Premio
Nobel de fisiología y medicina en 1962.
¿Cuáles fueron los objetivos iniciales del Proyecto TABLA I
Genoma Humano y cuál puede ser la repercusión de OBJETIVOS INICIALES (1990) DEL PROYECTO
los conocimientos obtenidos por este proyecto en GENOMA HUMANO
las Ciencias de la Alimentación y Nutrición? Aunque
antes de los años 80 ya se había realizado la secuen- 1. Identificar y localizar los 30.000-100.000 genes
ciación de genes aislados de algunos organismos, así que se estimaba que podrían existir en el ADN
como de genomas de entidades subcelulares (algu- humano
nos plásmidos y virus), el conocimiento del genoma
humano era tremendamente limitado. Sólo unos po- 2. Determinar la secuencia de las bases
cos grupos en todo el mundo trabajaban en el hallaz- nitrogenadas que constituyen el ADN humano
go de marcadores cromosómicos para estudios de li-
gamiento en el marco de la epidemiología genética. 3. Mantener a resguardo la información anterior
Ante esta precariedad de conocimientos y siendo ca- construyendo y administrando bases de datos de
da vez más reconocida la importancia de la dotación acceso público
genética en los procesos de salud-enfermedad, no es
de extrañar que en 1985 surgiera la iniciativa de se- 4. Proveer de herramientas multimedia para el
cuenciar el genoma humano (Watson, 1991). análisis de datos
Fue Robert Sinsheimer, rector de la University of 5. Supervisar los temas éticos, legales y sociales
California, en Santa Cruz, Estados Unidos, quien que se puedan derivar del Proyecto
en 1985 organizó el primer congreso para discutir
los aspectos técnicos de la secuenciación del geno-
ma. Este congreso no tuvo unos resultados inmedia-
tos, pero sí sirvió para que la idea de crear un gran
proyecto multi-institucional destinado a aportar nue-
vo conocimiento sobre la estructura del genoma hu- De acuerdo con la visión de Collins (Collins y
mano, fuera madurando en las mentes de prestigio- cols., 2003) en la publicación conmenorativa de la
sos científicos, entre ellos el premio Nobel Walter finalización del Proyecto Genoma Humano, la se-
Gilbert, profesor de biología en la Universidad de cuenciación del genoma humano tan sólo constituye
Harvard, quien tomó parte muy activa en la difusión los cimientos de un edificio sobre el cual se tienen
de la iniciativa. Tal es así que en la prestigiosa Gor- que levantar distintas plantas que suponen las distin-
don Conference de computación y biología molecu- tas aplicaciones de la información generada por el
lar de 1986, se dedicó una sesión completa a discu- mismo en varios ámbitos con creciente nivel de
tir sobre la oportunidad de aunar esfuerzos para complejidad. Así, el primer nivel del edificio sería la
realizar un proyecto de gran envergadura destinado genómica para la biología; el segundo nivel, la genó-
a la secuenciación del genoma (Watson, 1991). mica para la salud; y el tercer nivel, la genómica pa-
ra la sociedad. Seis pilares básicos soportarían estos
Tras superar algunos enfrentamientos iniciales
niveles: financiación, desarrollo de nuevas tecnologí-
entre investigadores del Departamento de Energía
as, avances en computación, formación en estas
(DOE) y los institutos nacionales de la salud (NIH) de
nuevas tecnologías, educación y estudio de las impli-
los Estados Unidos acerca del liderazgo en el pro-
caciones éticas, legales y sociales de dichos descubri-
yecto, en 1990, los NIH y el DOE presentan al Con-
mientos.
greso una propuesta conjunta para su financiación.
En esta propuesta, plantean la creación de grupos En la actualidad, no sólo se ha determinado la se-
de trabajo para la secuenciación, mapeo, creación cuencia de varios miles de millones de pares de ba-
de bases de datos, y estudio de las implicaciones éti- ses en el genoma humano, sino que se han desarro-

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llado instrumentos y técnicas que permiten obtener


resultados de análisis genéticos cada vez más rápi- Genómica nutricional
dos y económicos. Incluso recientemente se han he-
cho públicas las secuencias completas de genomas
diploides individuales, el primero de ellos en junio de Nutrigenética
2007, perteneciente a James Watson, y el segundo Nutrigenómica
de ellos, en septiembre de 2007, perteneciente a Ciencias de
Genómica Interacciones
la nutrición
Craig Venter (Levy y cols., 2007). Aunque incial- gen-dieta
mente estos análisis de genomas completos estaban Nutrición
personalizada
presupuestados en más de un millón de dólares, se
estima que en poco tiempo se podrán obtener por
menos de 10.000 dólares, abaratándose mucho
más paulatinamente. Toda esta ingente cantidad de
información tendrá que ser integrada en las distintas Fig. 1. Genómica nutricional como integración de la genómica
ciencias de la salud, incluyendo las ciencias de la ali- en las ciencias de la nutrición.
mentación y nutrición, para obtener un mejor cono-
cimiento, no sólo del riesgo de enfermedad determi-
nado por el genoma, sino también para conocer
como los factores ambientales, entre los que se in-
cluyen los componentes de los alimentos, pueden trigenética, nutrigenómica, nutrición molecular, etc.
interaccionar con dicho genoma para modificar el Sin embargo, en los tres últimos años se está empe-
riesgo de enfermedad. zando a observar un mayor consenso en la delimita-
ción del alcance de estos conceptos (Ordovás y
Además, desde el punto de vista de las posibles cols., 2004; Corella y cols., 2005; Mariman, 2006;
interacciones y modulaciones ambientales de la sus- Vakili y cols., 2007). Así, el concepto de genómica
ceptibilidad genética, existe otro aspecto importante nutricional supone una mayor generalización, hace
que contribuye a resaltar su relevancia. Actualmente referencia al estudio conjunto de la nutrición y el ge-
se estima que tan sólo existen unos 30.000 ó noma incluyendo todas las demás ómicas derivadas
35.000 genes en el genoma humano, muchos de de la genómica (Tabla II), y que dependiendo de su
los cuales todavía faltan por localizar o conocer su nivel de actuación, se han denominado: transcriptó-
función (Guttmacher y cols., 2003; Sebal, 2007). mica (estudio del ARN), proteómica (estudio del pro-
Sin embargo, esta cantidad de genes es muchísimo teoma) y metabolómica (estudio del metaboloma).
menor a la esperada inicialmente en base al número Un nivel similar de generalización se expresa cuando
de proteínas conocidas (3 ó 4 veces más), ya que ac- se hace referencia al concepto de interacción gen-
tualmente se sabe que cada gen puede codificar más dieta. Este concepto, ampliamente utilizado por su
de un producto funcional y estructuralmente diferen- analogía con las interacciones gen-ambiente
te al existir importantes sistemas de regulación pos- (Khoury y cols., 2005; Corella y cols., 2005), se
transcripcional y postraduccional (que pueden ser aplica para expresar la idea del estudio de una in-
fuertemente modulados por la concentración de dis- fluencia conjunta de la susceptibilidad genética y un
tintos componentes de los alimentos), que contribui- comportamiento ambiental (no genético), en este ca-
rían a esta variabilidad. Aunque todavía queda mu- so la dieta, en la etiología de una determinada enfer-
cho trabajo por hacer para conocer mejor nuestro medad.
genoma y su contribución como determinante de la
salud, la repercusión del Proyecto Genoma humano Dentro del marco amplio del concepto de genó-
ya es evidente en todas las ciencias de la salud, sien- mica nutricional, podemos destacar dos sub-concep-
do considerado como uno de los mayores hitos his- tos denominados nutrigenética y nutrigenómica. En
tóricos para el avance de la investigación biomédica sus antecedentes remotos, el término nutrigenética
(Pennisi, 2007). fue empleado por primera vez en 1975 por el Dr.
R.O. Brennan en su libro titulado Nutrigenetics:
New Concepts for Relieving Hypoglycemia (Bren-
CONCEPTO DE GENÓMICA NUTRICIONAL nan, 1975); mientras que el término nutrigenómica
fue utilizado en 1999 por DellaPenna (DellaPenna,
1999) aplicado a denominar la disciplina científica
La integración de los conocimientos y herramien- dedicada a estudiar el genoma de las plantas con ob-
tas derivadas de la genómica en el ámbito de las jeto de producir en las mismas un óptimo contenido
ciencias de la nutrición, ha dado lugar a la nueva dis- en micronutrientes para mejorar su aplicación en la
ciplina denominada genómica nutricional (Fig. 1). La protección de la salud humana. Actualmente, existe
genómica nutricional es una disciplina muy reciente amplio consenso en considerar la nutrigenética co-
y todavía existe cierta confusión en la delimitación mo la disciplina que estudia la distinta respuesta fe-
de sus conceptos. Muchas veces se utilizan como si- notípica a la dieta en función del genotipo de cada
nóminos los términos de genómica nutricional, nu- individuo (Ordovás y cols., 2004; Chadwick, 2004;

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TABLA II

NIVEL DE ANÁLISIS, DEFINICIÓN Y DISCIPLINAS INTEGRADAS


EN LA GENÓMICA NUTRICIONAL

Nivel de análisis Definición Disciplina Integración Denominación


(Genómica nutricional
Genoma Conjunto completo Genómica Dieta Nutrigenética
de genes de un
organismo

Transcriptoma Conjunto completo Transcriptómica Dieta Nutrigenómica


de moléculas de ARN
mensajero presentes en
una célula, tejido u órgano

Proteoma Total de moléculas Proteómica Dieta Nutrigenómica


proteicas presentes en
una célula, tejido u órgano

Metaboloma Conjunto completo de Metabolómica Dieta Nutrigenómica


metabolitos en una célula,
tejido u órgano

Corella y cols., 2005; Mutch y cols., 2005; Milner desde hace muchos años, numerosos grupos de in-
2007. El término nutrigenómica está sujeto a una vestigadores han insistido en destacar que la res-
mayor variabilidad en su delimitación (Muller y cols., puesta a una misma dieta no es homogénea en to-
2003; Ordovás y cols., 2004; Trujillo y cols., 2006; dos los individuos, sino que existen importantes
Bergmann et al 2006; Busstra y cols., 2007), y, difierencias interindividuales (Schaeffer y cols.,
aunque ha sido muy utilizado en sentido amplio en- 1997). Estos estudios han clasificado a los individuos
globando también el ámbito de la nutrigenética, ac- en normo-respondedores, hipo-respondedores o hi-
tualmente parece que existe una tendencia a consi- per-respondedores en función de si su respuesta fe-
derar la nutrigenómica como la disciplina que notípica a la dieta era la esperada, menor a la espe-
estudia los mecanismos moleculares que explican la rada o superior a la esperada, respectivamente. En
distinta respuesta fenotípica a la dieta en función del la figura 2 se presenta un ejemplo típico en el que se
genotipo. La nutrigenómica por tanto se centraría puede observar la variabilidad del porcentaje de dis-
más en estudiar cómo los nutrientes regulan la ex- minución en las concentraciones de colesterol en
presión de los genes, cómo afectan las polimorfis- cien individuos de similares características fenotípi-
mos en la expresión y regulación, y cómo se interre- cas sometidos durante el mismo tiempo a la misma
lacionan estos cambios con aspectos proteómicos y dieta hipolipemiante. En unos de ellos se produce
metabolómicos. una gran disminución (hiper-respondedores), mien-
tras que en otros, la disminución en muchísimo más
pequeña (hipo-respondedores). Sin embargo, a pe-
sar del conocimiento de esta distinta respuesta, los
mecanismos que la explican no se conocen. Por
APLICACIONES DE LAS DISTINTAS ello, se piensa que el conocimiento del genoma hu-
ÓMICAS EN GENÓMICA NUTRICIONAL mano y de sus variaciones interindividuales en genes
candidatos clave puede ser muy importante para
ayudar a descifrar los mecanismo moleculares que
determinan la respuesta inter-individual y generar así
El primer nivel de aplicación de la genómica en una serie de bio-marcadores de respuesta que per-
nutrición sería en términos de nutrigenética, es de- mitan conocer con antelación a la intervención die-
cir, estudiar cómo las variaciones en la molécula de tética, el éxito de la misma.
ADN de cada individuo pueden relacionarse con una
Sin embargo, la búsqueda de estos marcadores
distinta respuesta a la dieta. Aunque los estudios po-
genéticos de respuesta no es fácil, y requiere dis-
blacionales se han realizado considerando la media
tintas aproximaciones. Hasta ahora, la aproxima-
de la respuesta de los distintos individuos a la dieta,
ción que ha sido más seguida es identificar los ge-

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Porcentaje de disminución del colesterol (%)


-10

Hipo-respondedores
-20

-30 Normo-respondedores

-40

-50

-60
Hiper-respondedores
-70

Fig. 2. Variabilidad interindividual de la respuesta a la dieta. Ejemplo del % de disminución del colesterol plasmático en 100 indivi-
duos sometidos a la misma dieta durante el mismo tiempo.

nes candidatos que codifican proteínas relaciona- con rasgos fenotípicos. De esta manera aconsejan
das con el fenotipo que se está estudiando. Es de- descartar polimorfismos no funcionales y centrar-
cir, si estamos estudiando la diabetes como fenoti- se sólo en polimorfismos funcionales. El motivo de
po final, para buscar marcadores genéticos que esta elección es claro. Un polimorfismo no funcio-
puedan utilizarse como indicadores para predecir nal tan sólo es un marcador del efecto del verda-
la distinta respuesta de los individuos a la dieta, dero polimorfismo funcional todavía no caracteri-
mediante la aproximación de genes candidatos, se zado. Los resultados con este marcador resultan
estudiará en primer lugar la variabilidad genética significativos porque ambos polimorfismos están
en aquellos genes que codifiquen proteínas cono- asociados. Lo que ocurre es que el grado de aso-
cidas que participen en las ditintas rutas metabóli- ciación o desequilibrio de ligamiento, puede ser di-
cas relacionadas con la glucemia. En el estudio de ferente en distintas poblaciones y dar lugar a ses-
esta variabilidad genética, nos podemos encontrar gos y a falta de replicación de resultados cuando
con distintos tipos de variantes entre individuos. ocurre este fenómeno, explicando gran cantidad
Estas variaciones incluyen cambios de base, inser- de resultados contradictorios o poco coincidentes
ciones, delecciones, diferencias en el número de obtenidos en los estudios de asociaciones con al-
copias de determinados fragmentos de ADN, etc. gunas variantes genéticas en los diferentes estu-
(Guttmacher y cols., 2003; Pollex y cols., 2007). dios publicados.
Sin embargo, las variaciones que están siendo más Precisamente el desequilibrio de ligamiento o aso-
estudiadas actualmente son los denominados poli- ciación de varios polimorfismos formando el deno-
morfismos de un sólo nucleótido o SNPs por sus minado haplotipo que puede ser distinto en distintas
siglas en inglés correspondientes a single nucleo- poblaciones, llevó a iniciar un nuevo proyecto para
tide polymorphisms ). Estos polimorfismos pue- determinar haplotipos en los cinco continentes de-
den ser funcionales, es decir, que afectan a la ex- nominado HapMap (International HapMap Con-
presión del ARN o proteína, o no funcionales, en sortium, 2004), cuyos resultados se están integran-
cuyo caso tan sólo actuarían como meros marca- do ya en nutrigenética. Aunque hace una década el
dores del verdadero cambio funcional (cambio de análisis de polimorfismos en el ADN resultaba lento
aminoácido en la proteína, variaciones en promo- y bastante caro, con el cual el número de variantes
tores, etc.). Debido al masivo número de variacio- genéticas a incluir en los estudios con un gran tama-
nes genéticas en la secuencia de ADN que se es- ño de muestra era muy reducido y limitado a una o
tán encontrando, diversos autores insisten en dos, actualmente, el rapidísimo desarrollo de toda la
probar o demostrar la funcionalidad de un poli- tecnología paralela ha puesto a nuestra disposición
morfismo antes de realizar estudios de asociación modernas técnicas de alto rendimiento de genotipa-

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do (Wang y cols., 2007) que permiten analizar cien- plicados en la respuesta inmune. Además, el con-
tos de polimorfismos en miles de muestras en poco sumo de un desayuno rico en carbohidratos pro-
tiempo y a un coste no tan elevado. vocó una mayor expresión de genes implicados en
Esta revolución en las tecnologías de genotipado, el metabolismo de la glucosa, mientras que el de-
ha dado lugar a que actualmente se emplee otra sayuno rico en proteínas se asoció con una expre-
aproximación para la búsqueda de variantes genéti- sión diferencial de genes relacionados con la bio-
cas relevantes que pueden actuar como marcadores. síntesis proteica. Mediante la proteómica se puede
En lugar de la aproximación de los denominados ge- realizar un estudio en profundidad de todas las
nes candidatos referida anteriormente, se está utili- proteínas expresadas en determinadas condicio-
zando la aproximación de barrido genómico. A dife- nes y relacionarlas con los distintos fenotipos de
rencia de la aproximación anterior, no se parte de interés. Un mayor detalle de los fundamentos y de
un conocimiento previo de la funcionalidad de un las técnicas aplicadas en proteómica nutricional se
gen y se rastrean sus variaciones, sino que mediante pueden encontran en la revisión publicada por
microarrays que permiten el análisis simultáneo de Schweigert y cols. (2007). También se pueden en-
100.000 polimorfismos (denominados microarrays contrar más detalles del estado actual de la meta-
de 100 K), o de 500.000 polimorfismos (denomina- bolómica y su aplicación en nutrición en la revi-
dos de 500 K), se estudian miles de variantes genéti- sión publicada por Goodacre (2007). Sin
cas en cada uno de los cromosomas, y, posterior- embargo, aunque se han hecho progresos indivi-
mente, mediante análisis estadísticos, se buscan las duales en cada uno de estas ómicas, su nivel de in-
asociaciones entre cada una de las variantes genéti- tegración todavía es muy bajo, y son necesarios
cas determinadas y un fenotipo de interés. Reciente- muchos más estudios y financiación para conse-
mente se han publicado decenas de estos análisis guir aplicaciones prácticas en genómica nutricio-
identificando nuevos genes y variantes genéticas nal (Kussmann y cols., 2006).
asociadas a diabetes, obesidad, dislipemias, etc.
(Scott y cols., 2007; Ionita-Laza y cols., 2007; Fray-
ling y cols., 2007; Rampersaud y cols., 2007). Tras
estos estudios de identificación de nuevas variantes GENÓMICA NUTRICIONAL Y NUTRICIÓN
genéticas y su replicación de asociación con los fe- PERSONALIZADA
notipos intermedios correspondientes en distintas
poblaciones, es necesario realizar estudio de interac-
ción gen-dieta para conocer su posible modulación Una de las principales aplicaciones de la genómi-
dietética y su posible impacto en genómica nutricio- ca nutricional que se está resaltando por los medios
nal. de comunicación, es la posibilidad de conseguir a
El siguiente nivel en las ómicas aplicadas a la través de ella dietas más personalizadas. Recorde-
nutrición, tenemos la transcriptómica. La identifi- mos que en la era pre-genómica las investigaciones
cación de las variantes genéticas relevantes men- de la asociación entre la dieta y los distintos estados
cionadas anteriormente tan sólo posee un papel de salud se han realizado sin tener en cuenta las dife-
indicador, sin embargo, para conocer mejor los rencias interindividuales. En la figura 3 se resume es-
mecanismos moleculares que pueden explicar la ta situación a través de dos paneles (A y B). En el pa-
distinta respuesta observada en función de las va- nel A, se muestra cómo se han realizado las
riante genética de interés es necesario seguir inte- investigaciones en las que se fundamentan las reco-
grando ómicas que nos ayuden a conseguir dicha mendaciones nutricionales actuales para prevenir o
información. A través de los análisis de expresión tratar las enfermedades. En esta situación se parte
de ARN podremos conocer si la variante genética del supuesto de que la misma dieta tendrá el mismo
analizada actúa provocando un mayor nivel de ex- efecto para cada individuo. Sin embargo, en el panel
presión o menor nivel de expresión, y de qué ma- B, se plantea la situación de la investigación de la
nera los distintos nutrientes de la dieta pueden asociación entre la dieta y la salud en la era post-ge-
modular estos niveles de expresión, neutralizando nómica. En estas investigaciones se parte de la base
o incrementando el efecto genético. Existen algu- de que el efecto de la misma dieta en distintos indivi-
nos estudios en los que se ha demostrado diferen- duos puede ser diferente, por lo que una determina-
cias en el nivel de expresión de distintos genes en da recomendación general podrá ser beneficiosa pa-
función de los nutrientes consumidos, entre ellos ra mejorar el estado de salud de unas personas
podemos citar el publicado por van Erk y cols. según sus características genéticas, pero no para
(2006) en el que estudiaron cómo un desayuno al- otras. Si conocemos de antemano a través de una
to en proteínas o alto en carbohidratos influía en serie de marcadores genéticos lo que determina tales
la expresión genética en hombres sanos. Conclu- respuestas interindividuales, podremos realizar reco-
yeron que estos desayunos de distinta composi- mendaciones dietéticas más personalizadas y conse-
ción en macronutrientes provocaban una diferente guir una mayor eficacia y efectividad en la preven-
expresión en 141 genes. En este conjunto de ge- ción y tratamiento de la enfermedad (Ordovás y
nes se encontraban sobre-representados genes im- cols., 2004).

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A Estudio de la asociación entre dieta y salud


antes de la genómica nutricional
Se aceptaba que una
misma dieta producía
los mismos efectos
en todos los individuos

B Estudio de la asociación entre dieta y salud


en la era de la genómica nutricional

Se admite la variabilidad
en la respuesta a la dieta
en función del genotipo de
cada individuo

Fig. 3. Investigación de las relaciones entre dieta y estado de salud bajo dos perpectivas: a) clásica; b) genómica nutricional.

sino que contribuye notablemente la modulación


DISTINTOS NIVELES DE COMPLEJIDAD ambiental (Guttmacher y cols., 2003). Por ello, en
EN LAS BASES GENÉTICAS DE LAS la era post-genoma todas las enfermedades son
ENFERMEDADES Y SU MODULACIÓN consideradas como el resultado de la interacción
NUTRICIONAL entre el genoma de cada individuo y el ambiente,
lo que varía es la contribución relativa de cada uno
de ellos (Corella y cols., 2005). El ambiente o fac-
El Proyecto Genoma Humano ha dejado ya ob- tores ambientales estaría constituido por todos
soleta la antigua clasificación de las enfermedades aquellos factores no genéticos (dieta, ejercicio físi-
en genéticas y no genéticas. Actualmente, salvo co, consumo de tabaco, alcohol, estrés, contami-
los traumatismos, todas las enfermedades pueden nantes químicos, contaminantes físicos, microor-
considerarse que tienen un componente genético. ganismos, fármacos, intervenciones quirúrgicas,
Incluso en las enfermedades infecciosas, no sólo etc). De todos estos factores ambientales, la ali-
es necesaria la acción de un microorganismo, sino mentación sería cuantitativametne la más impor-
que la susceptibilidad genética del individuo es fun- tante ya que todos estamos expuestos continua-
damental en el desarrollo del proceso infeccioso. mente a este factor desde el primer momento de
Lo que varía en las enfermedades es el número de la vida. Para algunas enfermedades será cuantitati-
genes implicados en las mismas. Así por ejemplo, vamente más importante la influencia genética,
se habla de enfermedades monogénicas clásicas, mientras que para otras lo será la ambiental, pero
en las que existe un gen o un número reducido de en ambas tiene que producirse dicha interacción
genes implicados. Frente a ellas tenemos las en- para llegar al resultado final (Khoury y cols.,
fermedades poligénicas complejas en las que pue- 2005). Por ello, las denominadas interacciones
den existir decenas o cientos de genes implicados, gen-ambiente, y particularmente las interacciones
todavía no bien conocidos. Además, se sabe que gen-dieta, están resultando cruciales en la denomi-
en pocas ocasiones existe determinismo genético, nada era post-genoma. El estudio de estas interac-

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ciones es lo que más oportunidades ofrecerá para una serie de compuestos tóxicos para las neuronas
la prevención, ya que permitirán modular el riesgo que ocasionarán retraso mental. Si un bebé nace
de enfermedad sin modificar el genoma, y, por con una mutación funcional en el gen de la fenila-
tanto, reviste un interés prioritario para la salud lanina hidroxilasa, no significa que de manera de-
pública. Permitirá recomendar la mejor dieta en terminista vaya a sufrir retraso mental, sino que
función del genotipo, y evitar así el determinismo debido a la existencia de una interacción gen-die-
genético. De manera general se puede definir la ta, la composición de la dieta puede modular la
interacción gen-ambiente como la existencia de un susceptibilidad genética. Ya que debido a la muta-
comportamiento ambiental que es capaz de modu- ción genética, el enzima fenilalanina hidroxilasa
lar una susceptibilidad genética, modificando el no puede convertir la fenilalanina en tirosina, para
riesgo inicial de enfermedad conferido por la mu- evitar la posterior toxicidad de los productos deri-
tación genética. vados de la fenilalanina, la solución estriba en limi-
En el ámbito de la genómica nutricional son tar la fuente de fenilalanina. La principal fuente de
bien conocidas algunas interacciones gen-dieta en fenilalanina es la dieta, concretamente las proteí-
las denominadas enfermedades congénitas del me- nas de origen animal. Por lo tanto, la restricción
tabolismo. De ellas, la mejor estudiada es la fenil- temprana de proteínas de origen animal (leche)
cetonuria (Cederbaum, 2002), enfermedad que se posibilitará la reducción del riesgo de retraso men-
suele ilustrar como ejemplo clásico de interacción tal en las personas con la anomalía genética. Por
gen-dieta con capacidad para modificar el genoti- este motivo, la detección temprana de estas altera-
po de enfermedad. La fenilcetonuria está produci- ciones enzimáticas se ha instaurado en los países
da por determinadas mutaciones en el gen que co- desarrollados como parte de los programas de cri-
difica para la enzima fenilalanina hidroxilasa bado neonatal, ya que en caso de detectarlas, se
(Zschocke, 2003), que transforma la fenilalanina puede actuar rápida y eficazmente sobre la ali-
en tirosina (Fig. 4). Si dicha transformación no mentación del recién nacido para adecuarla y mi-
puede realizarse por defectos en su funcionalidad, nimizar el impacto de la mutación genética en el
entonces la fenilalanina se acumula y resulta en fenotipo final. Este ejemplo de interacción gen-

Fenilcetonuria
Fenilcetonuria

Fenilalanina Retraso mental


Fenilalanina hidroxilasa
(Gen localizado en cromosoma 12; q24.1)

Retraso
Retraso Mental
Retraso Mental
mental

Dieta normal

No
Noretraso
No retraso
retraso
Dieta Dieta baja
Mutación genética en fenilalanina
en el gen de la
fenilalanina hidroxilasa

Fig. 4. Ejemplo de interacción gen-dieta clásico en el caso de la fenilcetonuria.

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dieta en la fenilcetonuria quiere extenderse a la in- pos que podemos encontrar en la población son:
vestigación en prevención y tratamiento de otras CC, CT y TT. En el primer caso, tanto el alelo
enfermedades, incluyendo enfermedades cardio- procedente del padre como el de la madre poseen
vasculares y cáncer. Sin embargo, la mayor com- la base C en posición 677. El genotipo CT se de-
plejidad de las mismas hace que sea necesario nomina heterocigoto porque un alelo procedente
abordar su estudio desde fenotipos intermedios de un progenitor es normal, mientras que el otro
más sencillos, y a partir de su conocimiento, se- está mutado. Por último, el genotipo TT sería la
guir integrando y avanzando en grado de dificul- situación de un homocigoto con los dos alelos mu-
tad. tados. La variación 677C>T en el gen de la
MTHFR es bastante frecuente en la población,
aunque su prevalencia varía mucho según las zo-
nas geográficas. Así por ejemplo, en un estudio
ALGUNOS EJEMPLOS DE realizado por nuestro grupo (Guillén y cols., 2001)
INTERACCIONES GEN-DIETA EN en una muestra de población general mediterrá-
ENFERMEDADES COMPLEJAS nea española, encontramos que la prevalencia de
personas CC, CT y TT fue de 32, 52 y 16%, res-
pectivamente. Esta frecuencia tan elevada del ale-
lo T coincide con otros estudios realizados en po-
En los últimos años, el número de publicaciones blaciones del sur de Europa y contrasta con la
que describen alguna interacción gen-dieta entre un menor frecuencia de dicho alelo en los países del
determinado gen y alguno de los macro- o micro- norte de Europa. La interacción que se ha descrito
mutrientes de la dieta tanto en modelos animales co- con esta variación concreta ha sido con el ácido
mo en humanos, ha experimentado un crecimiento fólico de la dieta determinando las concentracio-
exponencial. Así, se han descrito interacciones gen nes de homocisteína plasmática (Fig. 5) Así, en
dieta determinando un mayor riesgo de diabetes, personas con una baja ingesta de ácido fólico, se
obesidad, riesgo de osteoporosis, hiperhomocistei- detectarían mayores concentraciones séricas de
nemia, hipertensión, alteraciones del metabolismo homocisteína en los homocigotos TT en compara-
lipídico, riesgo de enfermedades cardivoasculares, e ción con los demás genotipos, que les conferiría
incluso cáncer (Corella y cols., 2001; Ordovás y un mayor riesgo de enfermedad cardiovascular
cols., 2002; Brown y cols., 2003; Ordovás y cols., (Christensen y cols., 1997; Russo y cols., 2003).
2004; Lai y cols., 2005; Corella y cols., 2006; Ber- Sin embargo, cuando la ingesta de ácido fólico en
quin y cols., 2007; Moreno-Luna y cols., 2007; la dieta es más elevada, esta mayor cantidad de
Cornelis y cols., 2007) . Dada lo exhaustivo de esta ácido fólico, compensaría el defecto en el ADN y
lista, a continuación se describirá un ejemplo con- las concentraciones séricas de homocisteína en las
creto de interacción gen-dieta para comprender su personas TT, no alcanzarían valores tan elevados
concepto y su potencial impacto en la aplicación en y no manifesterían hiperhomocisteinemia. De
el diseño de dietas más personalizadas. acuerdo con este ejemplo de interacción gen-am-
biente, una aplicación práctica de estas investiga-
Como ejemplo concreto podemos referirnos al
ciones para la prevención cardiovascular, sería el
gen de la 5-10-metilentetrahidofolato reductasa
recomendar un mayor consumo diario de alimen-
(MTHFR). La MTHFR es un enzima que cataliza la
tos ricos en ácido fólico especialmente para aque-
reducción del 5,10 metileno tetrahidrofolato
llas personas con el genotipo TT para el SNP
(THF) a 5-metilTHF, la forma primaria de folato
677C>T en el gen de la MTHFR, ya que, debido a
sérico co-sustrato para la remetilación de homo-
su susceptibilidad genética, estos individuos po-
cisteína a metionina. Si falla este enzima, se pro-
seen mayores requerimientos que los estimados en
duce un aumento de homocisteína en la sangre
promedio para la población en general.
que puede dar lugar a mayor riesgo de enferme-
dad cardiovascular (Nakai y cols., 2001). El gen de Con este ejemplo resulta más fácil de entender
la MTHFR se encuentra en el cromosoma 1, y que la nutrigenética sea la disciplina que estudia la
consta de 11 exones. En el exón 4, en posición distinta respuesta fenotípica de los individuos a la
677, existe un polimorfismo que involucra un dieta en función de su genotipo. Además, desde
cambio de C por T (677C>T) en el ADN. Este un punto de vista amplio, la nutrigenómica estu-
cambio en el ADN se traduce en un cambio alani- diaría también cómo los nutrientes regulan la ex-
na por valina en el aminoácido 222 de la pro- presión de los genes, cómo afectan las polimorfis-
teína. La alteración produce una versión termolá- mos en la expresión y regulación, y cómo se
bil de la enzima que presenta menor actividad, con interrelacionan estos cambios con aspectos prote-
lo que aumentarían las concentraciones séricas de ómicos y metabolómicos. Todo ello con el objeti-
homocisteína y aumentaría el riesgo cardiovascu- vo que obtener un mejor conocimiento que permi-
lar. Cada persona posee dos copias del mismo ta una mejor prevención y tratamiento de las
gen, denominadas alelos. En el caso de la varia- enfermedades a través de recomendaciones dieté-
ción 677C>T en el gen de la MTHFR, los genoti- ticas más individualizadas.

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D. CORELLA ALIM. NUTRI. SALUD

–C677T (exón 4): cambio alanina por valina Interacción gen-dieta entre el polimorfismo C677T en el gen de la
(aa 222) metilentetrahidrofolato reductasa (MTHFR) y el consumo de ácido fólico
–El cambio origina una versión termolábil del determinando las concentraciones plasmáticas de homocisteína.
enzima que pr esenta menor actividad, y se Sólo ocurren situaciones de hiperhomocisteinemia cuando la mutación
r elaciona con mayores concentraciones de se produce junto con una baja ingesta de folatos
homocisteína

Ingesta baja
Ingesta
Ingestaalta de
de ácido f ólico
Ingesta baja
ácido fólico
de
de ácido
ácido ffólico
ólico
alta

Homocisteína plasmática Hiperhomocisteinemia P<0.05


p < 0,05

CC CT TT CC CT TT

GENOTIPO C677T MTHFR

Fig. 5. Ejemplo de interacción gen-dieta en una enfermedad compleja. La ingesta de ácido fólico puede modular el riesgo genético
de hiperhomocisteinemia conferida por el polimorfismo C677T en el gen de la MTHFR.

cional con grandes poblaciones en los que se mi-


RECOMENDACIONES DIETÉTICAS EN da la dieta con suficiente validez y precisión (Or-
GENÓMICA NUTRICIONAL dovás y cols., 2004). Además, es necesario inte-
grar muchas disciplinas y conocimientos diversos
(Fig. 7) que no siempre confluyen en los mismos
En la figura 6 se presenta un esquema de cómo profesionales y resulta complejo y costoso de
proceder en el ámbito de la genómica nutricional. abordar. Además, para que la genómica nutricio-
En primer lugar, se extraería una muestra biológi- nal tenga aplicación en la sociedad es necesario
ca de un individuo, a partir de la cual se extraería realizar mayor formación en esta disciplina entre
su ADN. Mediante modernos sistemas de análisis los profesionales de la salud relacionados con la
genético se determinaría su perfil genético en los nutrición (Busstra y cols., 2007), así como pro-
genes de interés. Una vez conocido su perfil ge- porcionar conocimientos básicos del genoma a la
nético, se accedería a potentes bases de datos de población general. También la industria alimenta-
conocimiento conteniendo resultados de estudios ria tiene que colaborar en este proceso partici-
que indicaran qué tipo de combinación de alimen- pando en el desarrollo de nuevos alimentos adap-
tos sería la más adecuada según su perfil genético tados a las necesidades genéticas específicas de
para prevenir o tratar la enfermedad de interés en los diferentes grupos de individuos. En la actuali-
el individuo, según estos alimentos indicados y las dad, se están creando diversos centros e institutos
preferencias del individuo se le recomendaría la de investigación en genómica nutricional en mu-
mejor dieta personalizada. Sin embargo, este pro- chos países de los cinco continentes y se está in-
ceso todavía no es una realidad, ya que si bien se tegrando la investigación genómica en los centros
dispone de la tecnología necesaria para realizar de nutrición clásica. Los conocimientos genera-
análisis genéticos rápidos y fiables, no se dispone dos tan sólo se encuentran a un nivel preliminar,
de la información necesaria para saber cuál es la sin embargo dadas las crecientes inversiones, se
dieta más indicada en función del perfil genético, espera que en plazo medio se puedan obtener los
ya que todavía falta por realizar muchos estudios. resultados esperados para que las actuales prome-
En esta etapa se está en una fase muy incipiente sas de la genómica nutricional puedan convertirse
debido a las grandes dificultades metodológicas pronto en realidades y contribuir así a mejorar el
de llevar a cabo estudio de epidemiología nutri- nivel de salud de la población G

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Extracción de ADN de un paciente (a partir de sangre o saliva)


y realización de análisis genéticos para conocer las variaciones
en su genoma

Perfil
genético
Caracterización fenotípica

Dieta
personalizada
según su
perfil
genético
Bases de
datos de
conocimiento

Fig. 6. Esquema del proceso de determinación del genotipo, búsqueda de información relacionada y realización de consejo dietético
con dieta personalizada en los estudios de genómica nutricional.

Transcriptómica Genómica

Psicología

Bioinformática
INTEGRACIÓN Economía

Genómica nutricional
Educación
nutricional Medicina
clínica
CORRESPONDENCIA:
Metabolómica Dolores Corella
Nutrición Departamento de Medicina Preventiva
Medicina preventiva Facultad de Medicina
Tecnología alimentaria Avda. Blasco Ibáñez, 15
Salud pública 46010 Valencia
Fax: 963 864 166
e-mail: dolores.corella@uv.es
Fig. 7. Necesidad de integración de diversas disciplinas para
avanzar en el desarrollo de la genómica nutricional.

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