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Tema 2 - Estructura y Función de Ácidos Nucleicos
Tema 2 - Estructura y Función de Ácidos Nucleicos
1
▪ INTRODUCCIÓN. CONCEPTOS GENERALES ✓ DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
▪ COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS
ÁCIDOS NUCLEICOS: ✓ COMPOSICIÓN
✓ ESTRUCTURA PRIMARIA
✓ PROPIEDADES
▪ DNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL DNA
✓ MODELOS CONFORMACIONALES DEL DNA
✓ PROPIEDADES DEL DNA
✓ NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
✓ DNA MITOCONDRIAL
▪ RNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL RNA
✓ TIPOS DE RNA
2
▪ INTRODUCCIÓN. CONCEPTOS GENERALES ✓ DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
▪ COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS
ÁCIDOS NUCLEICOS: ✓ COMPOSICIÓN
✓ ESTRUCTURA PRIMARIA
✓ PROPIEDADES
▪ DNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL DNA
✓ MODELOS CONFORMACIONALES DEL DNA
✓ PROPIEDADES DEL DNA
✓ NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
✓ DNA MITOCONDRIAL
▪ RNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL RNA
✓ TIPOS DE RNA
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DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
Transcripción Traducción
Replicación DNA mRNA PROTEÍNAS
DNA
Moléculas RNA
Polipéptido Replicación
Transcripción
Procesos Retrotranscripción
Traducción
Enzimas
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DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
6
▪ INTRODUCCIÓN. CONCEPTOS GENERALES ✓ DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
▪ COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS
ÁCIDOS NUCLEICOS: ✓ COMPOSICIÓN
✓ ESTRUCTURA PRIMARIA
✓ PROPIEDADES
▪ DNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL DNA
✓ MODELOS CONFORMACIONALES DEL DNA
✓ PROPIEDADES DEL DNA
✓ NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
✓ DNA MITOCONDRIAL
▪ RNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL RNA
✓ TIPOS DE RNA
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COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
COMPOSICIÓN
BN BN BN BN BN
Polímeros de nucleótidos
5’…P-Azucar-P-Azucar-P-Azucar-P-Azucar-P-Azucar… 3’
Azúcar
Nucleósido
Purinas (A, G) Pirimidinas (C, U, T)
BN
NH2 O NH2 O O
CH3
N N HN N N HN HN
N N H2 N N N O N O N O N
H H H H H
8
COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
COMPOSICIÓN
Nucleósidos: Enlace N-glicosídico
- Covalente
Principales Desoxirribonucleósidos
NH2 O NH2 O
N CH3
N N NH N NH
N N N N NH2 N O N O
HO CH2 HO CH2 HO CH2 HO CH2
O O O O
H H H H
OH H OH H OH H OH H
Desoxiadenosina Desoxiguanosina Desoxicitidina Desoxitimidina
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COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
COMPOSICIÓN
Nucleótidos: Enlace Fosfoéster
- Enlace covalente
- Fosfórico + grupo hidroxilo (alcohol) +
Principales Ribonucleótidos
BN
Principales DexosirribonucleótIdos
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COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
ESTRUCTURA PRIMARIA
Enlace
Fosfodiester
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COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
ESTRUCTURA PRIMARIA
Dirección 5’ → 3’
5’ AGTC 3’
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COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
PROPIEDADES
▪ Carácter hidrófilo de la cadena polinucleotídica (enlaces de hidrógeno con el agua)
✓ Compuestos polares (fosfato y –OH de las ribosas) vs. Bases nitrogenadas
▪ Rigidez
✓Enlace fosfodiester
▪ Viscosidad
✓ Longitud vs. Diametro (Solo DNA-Doble hélice)
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▪ INTRODUCCIÓN. CONCEPTOS GENERALES ✓ DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
▪ COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS
ÁCIDOS NUCLEICOS: ✓ COMPOSICIÓN
✓ ESTRUCTURA PRIMARIA
✓ PROPIEDADES
▪ DNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL DNA
✓ MODELOS CONFORMACIONALES DEL DNA
✓ PROPIEDADES DEL DNA
✓ NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
✓ DNA MITOCONDRIAL
▪ RNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL RNA
✓ TIPOS DE RNA
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DNA
FUNCIONES CARACTERÍSTICAS
• PORTAR DE LA INFORMACIÓN GENÉTICA ✓ Desoxirribosa
✓ A, G, C y T
• PROGRAMAR EN EL TIEMPO Y ESPACIO ✓ Gran tamaño (H: 3,2x109 pb)
BIOSÍNTESIS ORDENADA DE LOS ✓ Núcleo
COMPONETES DE LA CÉLULA ✓ Mitocondria y Cloroplastos
✓ Molécula bicatenaria
• DEFINIR LA INDIVIDUALIDAD DE UN ✓ Doble hélice (dextrógira)
ORGANISMO
replicación
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DNA: ESTRUCTURA
WATSON Y CRICK
✓ Molécula Bicatenaria
✓ Catracter hidrofílico – hidrofóbico B. Nitrogenadas hacia el interior
✓ Cadenas antiparalelas
CLAVES ESTRUCTURALES:
Análisis químico
Características hidrofóbicas e hidrófilas
Difracción Rayos X
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DNA: ESTRUCTURA
▪ ANÁLISIS QUÍMICO
▪ Reglas de Chargaff
✓ A/T y C/G = 1 SE CUMPLEN PARA CUALQUIER MÓLECULA
✓ Pirimidinas / Purinas o C+T / A+G = 1 “BICATENARIA” DE DNA
✓ aminobases / oxobases o A+C / T+G = 1
✓A+T / G+C ≠ 1
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DNA: ESTRUCTURA
MODELOS CONFORMACIONALES. B-DNA
REGLAS DE CHARGAFF
A/T y C/G = 1
Pirimidinas / Purinas = 1
CONSECUENCIAS
Molécula bicatenaria
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DNA: ESTRUCTURA
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DNA: ESTRUCTURA
Citosina
Guanina
Adenina Timina
Enlaces de hidrógeno
- Perpendiculares al eje
-Distancia entre los átomos del enlace
- Distancia entre los componentes (PIR:PUR)
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DNA: ESTRUCTURA
MODELOS CONFORMACIONALES. B-DNA
Estructura de doble cadena antiparalela y helicoidal con
doble periodicidad a lo largo del eje de 0.34 y 3.4 nm
Periodicidad de 0.34 nm
Periodicidad de 3.4 nm
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DNA: ESTRUCTURA
MODELOS CONFORMACIONALES
DOBLE HÉLICE DE DNA OTRAS
CONFORMACIONES
DNA con estructura
cruciforme o de
horquilla.
H-DNA
G4-DNA
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DNA: ESTRUCTURA
MODELOS CONFORMACIONALES. B-DNA
Surco Mayor y Surco Menor
Surco mayor
ángulo mayor
Pur Pyr
ángulo menor
Surco menor
Propiedades
1. Giro de hélice: Dextrógiro
2. Unidad repetida: 1 par de bases
3. Enlaces de hidrógeno perpendiculares
4. Rotación de las bases: 34.6°
5. Pares de bases por vuelta: 10.4
6. Avance de las bases: 0.34 nm
7. Paso de Hélice: 3.40 nm
8. Diámetro: 2.37 nm
9. Enlace N-glicosídico: Anti
10. Azucar: C2’ Endo
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DNA: ESTRUCTURA
MODELOS CONFORMACIONALES. VARIANTES DEL B-DNA
Propiedad B-DNA A-DNA Z-DNA
Giro de Hélice Dextro Dextro Levo
Unidad repetida 1 par de BN 1 par de BN 2 pares de BN
Rotación entre bases 34,6° 32,7° 30°
PB por vuelta 10 11 12
Distancia entre BN 0,34 nm 0,23 nm 0,38 nm
Paso de Hélice 3,40 nm 2,46 nm 4,56 nm
Diámetro 2,37 nm 2,55 nm 1,84 nm
Anti para C
Enlace Glicosídico Anti Anti
Sin para G
Desoxirribosa C2' endo C3' endo C2' endo
DNA-DNA rico
Hebras DNA-DNA DNA-RNA RNA-RNA
en CG
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DNA: ESTRUCTURA
MODELOS CONFORMACIONALES. OTRAS CONFORMACIONES
DNA con estructura cruciforme (RNA: Horquilla)
Región palindrómica o palíndromo: Región de DNA en la que la secuencia de una hebra leída
de izquierda a derecha se lee que igual que la de la otra hebra leída de derecha a izquierda.
Además, la región debe tener un eje de simetría binaria (Puntual o Discontinuo).
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DNA: ESTRUCTURA
MODELOS CONFORMACIONALES. OTRAS CONFORMACIONES
H-DNA
▪ Triple hélice formada en una región de DNA rica en CT
▪ Tres hebras de DNA se unen mediante enlaces de hidrógeno de Hoogsteen
y la cuarta hebra forma un bucle.
▪ Función: regulación de la expresión génica – Represión de la transcripción.
WyC
C:G
(4,3,2: 6,1,2)
T:A
(4,3:6,1)
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DNA: ESTRUCTURA
MODELOS CONFORMACIONALES. OTRAS CONFORMACIONES
G4-DNA
▪ Región del DNA rico en secuencias CG.
▪ 4 Guaninas de una misma hebra se unen entre si mediante enlaces de hidrógeno de
Hoogsteen.
▪ Estructuras muy estables
▪ Se encuentran cerca de regiones promotoras y en los telómeros de los cromosomas.
▪ Función reguladora de la meiosis y procesos de recombinación.
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▪ INTRODUCCIÓN. CONCEPTOS GENERALES ✓ DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
▪ COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS
ÁCIDOS NUCLEICOS: ✓ COMPOSICIÓN
✓ ESTRUCTURA PRIMARIA
✓ PROPIEDADES
▪ DNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL DNA
✓ MODELOS CONFORMACIONALES DEL DNA
✓ PROPIEDADES DEL DNA
✓ NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
✓ DNA MITOCONDRIAL
▪ RNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL RNA
✓ TIPOS DE RNA
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DNA: PROPIEDADES
Estabilidad y Accesibilidad
Interacciones de apilamiento
- Bases hacia el interior (Protección de la secuencia)
- Apilamiento: interacciones de van der waals entre los anillos
- Interacciones inespecíficas
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DNA: PROPIEDADES
Estabilidad y Accesibilidad Surco
mayor
▪ Accesibilidad
ángulo mayor
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▪ INTRODUCCIÓN. CONCEPTOS GENERALES ✓ DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
▪ COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS
ÁCIDOS NUCLEICOS: ✓ COMPOSICIÓN
✓ ESTRUCTURA PRIMARIA
✓ PROPIEDADES
▪ DNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL DNA
✓ MODELOS CONFORMACIONALES DEL DNA
✓ PROPIEDADES DEL DNA
✓ NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
✓ DNA MITOCONDRIAL
▪ RNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL RNA
✓ TIPOS DE RNA
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DNA: NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
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DNA: NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
▪ Superenrollamiento
Enrollamiento o giro sobre si misma de la doble hélice de DNA (Topoisomerasas)
Condensación
del DNA
▪ Empaquetamiento:
Plegamiento del DNA a través de la interacción con proteínas
SUPERENROLLAMIENTO EMPAQUETAMIENTO
Histonas (H1, H2A, H2B, H3, H4)
Proteínas no histónicas
DNAs plasmídicos
Eucromatina
680 veces
300 nm
Fibra de 30 nm
40 veces
30 nm Fase S -
Replicación
Fibra de 10 nm
6 veces
10 nm
B-DNA
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DNA: NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
Estados de Condensación DNA Eucariota
Fase S -
Replicación Ciclo Celular Interfase (G1 (G0)-S-G2) - Mitosis
Mitosis
Heterocromatina
50000 veces
1 mm
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DNA: NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
37
DNA: NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
ESTRUCTURA NUCLEOSOMAL o FIBRA DE 10 nm
Empaquetamiento
38
DNA: NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
OCTÁMERO DE HISTONAS
Nucleosoma
Octámero DNA
histonas
39
DNA: NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
SOLENOIDE O FIBRA DE 30 nm
Superenrollamiento
40
DNA: NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
EUCROMATINA
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DNA: NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
HETEROCROMATINA Y CROMOSOMA METAFÁSICO
HETEROROMATINA
CROMOSOMA
METAFÁSICO
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▪ INTRODUCCIÓN. CONCEPTOS GENERALES ✓ DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
▪ COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS
ÁCIDOS NUCLEICOS: ✓ COMPOSICIÓN
✓ ESTRUCTURA PRIMARIA
✓ PROPIEDADES
▪ DNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL DNA
✓ MODELOS CONFORMACIONALES DEL DNA
✓ PROPIEDADES DEL DNA
✓ NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
✓ DNA MITOCONDRIAL
▪ RNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL RNA
✓ TIPOS DE RNA
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DNA: MITOCONDRIA
Único cromosoma
Bicatenario y circular.
Varias copias (menos de 10) No repetitivo y codificante (93%)
200-2000 copias por célula 37 genes (2 rRNA y 22 tRNA)
Matriz mitocondria anclado a la MMI 13 Proteínas cadena respiratoria
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▪ INTRODUCCIÓN. CONCEPTOS GENERALES ✓ DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
▪ COMPONENTES Y ESTRUCTURA DE LOS
ÁCIDOS NUCLEICOS: ✓ COMPOSICIÓN
✓ ESTRUCTURA PRIMARIA
✓ PROPIEDADES
▪ DNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL DNA
✓ MODELOS CONFORMACIONALES DEL DNA
✓ PROPIEDADES DEL DNA
✓ NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE ORDEN SUPERIOR
✓ DNA MITOCONDRIAL
▪ RNA: ✓ FUNCIÓN
✓ ESTRUCTURA DEL RNA
✓ TIPOS DE RNA
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RNA: Funciones y Características
▪ MOLÉCULA INTERMEDIA ENTRE DNA Y PROTEÍNAS: Intermediarios de la expresión génica
✓ Transmisión de la información génica: mRNA y tRNA
✓ Soporte estructural de orgánulos: rRNA-Ribosomas
✓ Regulación: miRNA y siRNA, ribointerruptores
✓ Actividad Enzimática: Ribozimas
▪ CARACTERÍSTICAS:
✓ Ribosa
✓ A, G, C y U
✓ Menor tamaño y variable
✓ Molécula monocatenaria y lineal
Posible apareamiento intracatenario – C3’endo y doble hélice A
✓ Diferentes funciones y organización 3D
✓ Distintas localizaciones
✓No cumplen las leyes de Chargaff
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RNA: Tipos
RNA Mensajero (mRNA) RNA Transferente (tRNA) RNA Ribosómico (rRNA)
600-3000 nt 75-95 nt 120-4700 nt
Precursor
RNA heterogéneo nuclear hnRNA
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RNA: Tipos
mRNA
5´ 3´
DNA mARN
Codón
Transcripción
hnRNA Cola de
Caperuza 5’ poliadenosina
Procesamiento 5' Cap AAAA···············AAA 3'
mRNA
mRNA maduro y funcional,
con ambos extremos protegidos
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RNA: Tipos
tRNA
Interacción específica
Codón (mARN)–anticodón (tARN)
Anticodón
5´ Codón mARN 3´
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RNA: Tipos
tRNA
Brazo aceptor
Ribotimidina y Pseudouridina
Conservados
3 a 5 nucleótidos no emparejados
Dihidrouridina
Unión Ribosoma
Anticodón
50
RNA: Tipos
rRNA
rRNA: Soporte estructural de los ribosomas
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RNA: Tipos
rRNA
sitio P sitio A
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RNA: Tipos
Otros
RNA Tamaño Localización Función Características
miRNA 21-25 nt Citoplasma Inhibición de la Corta mRNA
expresión génica
siRNA 21-25 nt Citoplasma Inhibición de la Bloquea el mRNA
expresión génica
snRNA 100-300 nt Núcleo Procesamiento del Forma parte de
hnRNA ribonucleoproteínas
scRNA Variable Citoplasma Traslocación de Forma parte de
proteínas ribonucleoproteínas
Ribozimas Variable Núcleo / Actividad Distintos
Citoplasma Catalítica procesos
Ribointerruptores Variable Núcleo / Regulación de la Se unen a
Citoplasma expresión del mRNA biomoléculas
mtRNA: De los tres tipos mensajero, transferente y ribosómico
cpRNA: De los tres tipos mensajero, transferente y ribosómico
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LOS ÁCIDOS NUCLEICOS
DNA RNA
Composición
▪ Ribosas Desoxirribosa Ribosa
▪ Bases Nitrogenadas A, G, C, T A, G, C, U
Estructura
▪ Hebras Doble hebra Hebra sencilla
▪ Estructura Doble hélice* Lineal**
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