16/09/2019

BQM-4 Aminoácidos

Funciones generales de las proteínas:

- Estructurales
- Reguladoras
- Catálisis (enzimas)
- Motoras

Diabetes: falta de una enzima (insulina)

Propiedades de los aminoácidos:

- Hay 20 aminoácidos (unidades monoméricas)

- Cada aminoácido tiene una cadena lateral
- Cada aminoácido tiene una estructura común: 1 carbono alfa (4 enlaces
sustituidos), cadena lateral R que hace con que los aminoácidos sean diferentes
- Aminoácido en solución acuosa tiene la capacidad de perder o ganar un protón
- Carbono con estructura tetraédica (tridimensional)

Clasificación de los aminoácidos en base al grupo R:

- Aminoácidos alifáticos apolares (R: hidrocarbonados)

Ejemplos: gliclina, alanina, valina, leucina, isoleucina, metionina (el azufre no
participa de las puntes de sulfuro) , prolina
Carácter hidrofóbico (eses aminoácidos constituyen el centro de la proteína)

- Aminoácidos aromáticos (R: aromáticos)

Ejemplos: fenilalanina, tirosina, triptófano
Más hidrofóbicos que las cadenas hidrocarbonadas, por cuente del apilamiento
de las cadenas
Pueden absorber ultravioleta

- Aminoácidos polares sin carga (R: átomo electronegativo)

Ejemplos: serina, treonina, cisteína, asparragina, glutamina
Tiene capacidad de perder el protón, importante para la formación de la puente
del sulfuro

- Aminoácidos con carga positiva

Ejemplos: lisina, arginina, histidina
Altamente hidrofílicos, mucha capacidad de formar puente

- Aminácidos con carga negativa (R: ácidos)

Ejemplos: aspartato, glutamato
En médio fisiológico están cargados negativamente
Propiedades físico-químicas de los aminoácidos

- Absorción de la luz ultravioleta

- Estereoquímica de los aminoácidos y actividad óptica
- Comportamiento ácido-base

Importancia de las cadenas laterales

- Grupos R apolares hacen que los aa sean hidrofóbicos

- Todos los aa de las proteínas son :-esteroisómeros

Clasificación de los aminoáciodos: abreviaturas

Aminoácidos modificados (cumplen funciones fisiológicas o son intermediarios

importantes)

Aminoácidos no proteicos (su estructura química es de un aminoácido, compuestos que

derivan de aminoácidos)

Un aminoácido especial: selenocisteína (se codifica en el ARNm mediante un triplete

UGA)

 Punto isoeléctrico (pI): punto de pH que el aminoácido tiene pKa igual a zero.

 Cáculo de pI

Propiedades de los aminoácidos

- Hidrofílicos o hidrofóbicos, según su polaridad

- Propiedades óptidas: isómeros D y L, y + y –
- Naturaleza anfoterica
- Los de carácter aromáticos pueden absorber la luz ultravioleta
- Todos tienen propiedades ácido-base
- El pI es el pH al que los aa son dipolos con carga neta igual a cero
- (…)
17/09/2019

BQM-

Enlace peptídico

- enlace covalente que une aa en péptidos y proteínas

- los átomos son coplanares (en un mismo plano)
- El enlace tiene un carácter parcial de doble enlace (El oxígeno es más
electronegativo que el nitrógeno)
- El enlace tiene carácter polar (Oxígeno con carga parcial negativa y el nitrógeno
con carga parcial positiva)
- El enlace peptídico es plano (trans: extremos opuestos, cis: extremos más
cercanos)
- El enlace tiene poca capacidad de giro
- Diagrama de Ramachandran

Péptido

- Una cadena poliptídica tiene direecionalidas (se escribe de la izquierda hacia la

derecha)

Puentes disulfuro

- Enlace covalente entre los azufres

Ejemplos: insulina

Enlace peptídico

- Es muy difícil romper en condiciones fisiológicas

- Proteasas o enzimas proteolíticas: romper el enlace peptídico
- Solo aminoácidos que están dentro de las proteínas que son residuos

Ionización de los péptidos

- Grupo amino y carboxi y cadenas laterales de algunos aa terminales contribuyen

para la carga neta

pI

- Punto isoeléctrico (pI) es el valor de pH al cual la proteína tiene carga neta

Proteínas

- Un polipétido: proteína monomérica

- Vários polipétidos (subunidades): proteína multimérica
Ejemplo: hemoglobina A

Clasificación de las proteínas

Según su función:

- Enzimas
- De transpore
- De reserva
- Contraciles: actina, miosina
- Estructurales: queratina, colágeno
- De defenda: hemoglobina
- Reguladoras: hormonas

Según su forma:

- Fibrosas: estructura secundária (general función estructural)

- Globulares

Según su composición:

- Simples: solo aminoácidos

- Conjugadas: parte proteína y grupo prostético (Ejemplo: hemoglobina)

Estructura primária

- Secuencia de aminoácidos
- Una proteína sin estructura no tiene función

Relación entre estructura primaria y función

- Proteínas homólogas: proceden evolutivamente y la secuencia se mantiene

o Proteínas parálogas: homólogos presentes en la misma especie
o Proteínas ortólogas: homólogos presentes en distintas especies

Secuenciación de proteínas

- Métodos bioquímicos para determinar la secuenciación de una proteína

- Degradación de Edman (disociar proteínas en trocitos más pequeños utilizando
las enzimas proteolíticas – proteasas por ejemplo)
BQM-

Estructura secundaria, terciaria y cuaternaria de las proteínas

Estructura secundaria

- Plegamiento tridimensional mantenida por puentes de hidrógeno

- Estables
- Tipos: hélices alfa, lámina, giros, hélice de colágeno

Hélice alfa

- Se mantiene por la formación de puentes de hidrógenos (entre el primer oxigeno

del grupo carboxilo y el cuarto aminoácido)
- Es la más estable enérgicamente
- Desplazamiento
- Paso de rosca
- Phi = 60 y psi= -45 a 50
- El giro más común es a la derecha (dextrógira)
- Cadenas laterales perpendiculares al eje de la hélice
- Tipos:
o Anfipática (Ejemplo: flavodoxina)
o Apolar (Ejemplo: citrato sintasa)
o Polar (Ejemplo: calmodulina)
- Diagrama de Ramachandran

Lámina u hoja plegada beta

- Cadena polipeptídica que se dispone en zig-zag (una lámina beta que se

relaciona con la otra lámina beta)
- Se estabiliza por puentes de hidrógeno intercartenarios
- Paralelas: en la misma dirección (amino con amino)

Estructura secundaria de las proteinas

- Giros beta (giro de 180 que hay 4 aa)

- Bucles

Hélice única del tropocolágeno

- Proteína fibrosa
- Estructura secundaria pero más estirada que la hélice alfa
- Repetición de Gly-X-Y

Estructuras supersecundarias

- Hélice alfa
- Hojas beta
- Mixtas
Estructura terciaria

- Plegamiento tridimensional del polipéptido o proteína

- Depende de la estructura primaria
- Se estabiliza entre enlaces di-sulfuro (puentes di-sulfuro), atracción
electrostática, puentes de hidrógeno
- Dominio

Estructura cuaternaria

- Asociación no covalente de subunidades polipeptídicas

- De dímeros a enormes complejos (asociación de muchas proteínas)

Plegamiento de proteínas

- Desnaturalización de la proteína: pérdida de la función de la proteína

Ejemplo: Enfermedad de Alzheimer

18/09/2019

Estructura cuaternaria de las proteínas. Estudio de la mioglobina y hemoglobina I y

II

- Intercambio de gases
- Proteinas que son importantes: Mioglobina y hemoglobina
- Mioglobina: es una hemoproteína y monomérica (que solo tiene una cadena)
- Hemoglobina: es una homoproteína y tetramérica (tiene cuatro cadenas)

Mb y Hb: proteínas globulares

- Forma esférica
- Pueden realizar muchas funciones

Funcionalidad de las proteínas globulares

- Flexibilidad (enlaces débiles)

- Cambios conformacionales (cambio pequeño y variación en la estructura
terciaria, para regular la actividad)
- Interacciones

El grupo hemo

- Grupo protéstico conjugada de las proteínas

- El grupo hemo tiene una estructura compleja que hay 4 nitrógenos que
entrelazan un átomo de hierro, y ese por su vez puede hacer 2 enlaces
- El anillo no es plano (sin oxígeno) a nivel del hierro, pero si tiene oxígeno es
plano
- El anillo tiene movimiento
Mioglobina

- Aminoácidos hidrófobos al centro y aminoácidos hidrofílicos al exterior

- Histerina 94 es la que estabiliza

Curva de saturación por oxígeno de la Mb

Mb + O2  MbO2

Deduccion de la ecuación: (cuaderno)

pO2
Y=
pO2+ P 50

p50: valor de presión de oxígeno en que se encuentra saturado

Hemoglobina

- 4 cadenas

Sistema de transporte de oxígeno

- une O2 en los pulmones y lo transporta

Curva de saturación por oxígeno de la Hb

Hb + nO2  Hb (O2)n

Deducción de la ecuación:

Y=❑
❑

Curvas de unión del oxígeno a la Mb y Hb

- Curva hiperbólica
- Curva sigmoidal (la afinidade de la Hb por el O2

Hb: dos conformaciones cuaternarias

Modelos para describir la transición entre T y R

- Secuencial (Koshland-Némethy-Filmer – KNF)

20/09/2019

Hb: proteínas alostérica

- Proteínas alostérica
- Efector alostérico
- Su afinidad con en O2 puede ser afectado por algunos factores

Los iones de hidrógeno y el dióxido de carbono promueven la liberación del oxígeno

- La acumulación de protones provoca una reducción del pH

Fundamento químico del efecto Bohr

- Cuando el pH es alto la histerina no es protonada, favoreciendo la forma R (alta

afinidad por oxígeno)
- Cuando el pH es bajo la histerina es protonada, no favoreciendo la forma R (baja
afinidad por oxígeno)

La Hb transporta CO2

- Formación de carbamatos (estabilización del estado T)

La hemoglobina humana se encuentra en varias formas

- El cambio de la hemoglobina depende del período de desarrollo

Derivados de la hemoglobina

- Carboxihemoglobina
- Metahemoglobina
- Hemoglobina A1c

Hemoglobinas anormales

- Talasemias: enfermedades genéticas

- Talasemias alfa
- Talasemias beta
- HbS
23/09/2019

Enzimas

- Llevan a cabo reacciones químicas en las células

- No se puede tener vida sin la presencia de las enzimas
- Enzimas están relacionadas con las rutas metabólicas
- Del punto de vista médico, enzimas son importantes porque es posible mesurar
un diagnostico y es posible seren administradas a un paciente. Es posible
también hacer fármacos con las proteínas expresadas

Enzimas:

- Catalizador biológico (aumentar a velocidad reacción de transformación, de

reacción, sin modificar el equilibrio de esa reacción y tampoco cambian el nivel
energético de ese sustrato y de ese producto)
S (sustrato) > P (producto)
Keq nivel E
- La mayoría tienen naturaleza proteína (una pequeña parte está representada por
ácido ribonucleico)
- En general, está vinculado a un sustrato (compuesto que va a ser transformado)
- Compuesto binario: enzima (E) + sustrato (S)
- La enzima puede reaccionar después en otro ciclo catalítico, o sea, es posible la
regeneración del catalizador, favoreciendo la velocidad que ese sustrato va a ser
modificado

Propiedades de los enzimas:

- Aumentan la velocidad de las reacciones químicas (hasta10ˆ17 veces)

- Funcionan en condiciones definidas de temperatura, pH, presión,
concentraciones sales
- Presentan una elevada especificidad (permiten reconocer ese compuesto que es
un sustrato y suelen formar productos secundarios adicionales)
- Son capaces de seren reguladas (habrá que regular a las enzimas para que
funcionen en ciertas reacciones y no en otras)

Especificidad:

- Es especifica cuanto al sustrato y cuanto al tipo de reacción

- Encrucificada metabólica (depende del estado de la vía, depende de las
concentraciones que haya y de la constante de afinidad, y depende del poder
catalítico)
-
G6pasa
Glc 6P > Glc
> fosfato
- Glucosa-6-fosfato (según la situación metabólica, puede transformar en 6-
fosfoglucono-delta-lactona, fructosa-6-fosfato o glucosa-1-fosfato)
Especificidad de sustrato:

- Especificidad baja
Ejemplo: enlace peptídico
- Especificidad de grupo
- Especificidad absoluto
- Actividades correctoras (proofreading)

Estereoespecificidad:

- Ogston (1948)

Interacción Enzima-Sustrato:

- Interacciones débiles
- Participa del reconocimiento de aminoáciods y otros de la catálisis
- Es tridimensional
- Parte pequeña

Modelo para interacción enzima-sustrato:

- Modelo llave-cerradura (Fisher) – insuficiente

- Modelo de encaje inducido (Koshland) – resulta algo insuficiente

25/09/2019

Especificidad de sustrato

- Interacción entre el sustrato y la enzima para favorecer el complejo enzima-

sustrato
- El ligamiento del sustrato al sitio activo se excluye agua
- Los grupos R tiene valores de pKs (puede ser modificado por el microentorno de
ese centro activo)
- La distribución de cargar en el centro activo, siendo mayor entre el centro activo
y el estado de transición

Especificidad de alguna proteasas

- Endoproteasas: quimotripsina (secretada en el páncreas, entre el duodeno y el

intestino, tiene la función de cortar las proteínas para formar pequeños
aminoácidos para que puedan ser absorbidos)
- Quimotripsina: reconoce Trp, Phe, Tyr
- Tripsina: reconoce Lys, Arg
- Elastasa: reconoce Ala, Gly
Clasificación de los enzimas

- 1. Oxireductasas: transfer de electrones, catalizan reacción de óxido-reducción

- 2. Transferasas: catalizan reacción de transferencia, transfieren un grupo de um
compuesto a otro compuesto
- 3. Hidrolasas: rompe algunos compuestos mediante la incorporación de una
molécula de agua
- 4. Liasas: rompe la molécula sin incorporar agua, estableciendo un doble enlace
- 5. Isomerasas: catalizar la formación de compuestos
- 6. Ligasas: formación de enlaces covalentes que implica en reacción de
condensación, y está relacionada con un sistema que permite que la reacción
pueda ocurrir termodinámicamente

Nomenclatura de los enzimas

- Nomenclatura alternativa (de uso común)

- Reglas (forma sistemática): identificar el sustrato y el tipo de reacción que
desarrollan, y hay un número para poder identificar

Enzimas: algunas definiciones

- Isoenzimas o isozimas: diferentes formas moleculares de un mismo enzima y

que realiza la misma actividad enzimática, pero están codificados en genes
distintos, Por lo tanto no tiene la misma secuencia de aminoácidos (estructura
primaria)
- Sistemas multienzimáticos: está formado por distintos enzimas, cadenas
polipeptidicas, que se asocian para formar un complejo multienzimático. Hace
con que el sustrato se transforme en producto rápidamente
- Enzimas multifuncionales: cadena polipeptídica que tiene muchos centros
activos que realizan actividades distintas, tiene por lo tanto la misma función

Tema 10: Mecanismos de acción de las enzimas 26/09/2019

- Reacción catalizada

Cambio de energía libre

- De un sustrato S a un producto P: termodinámicamente tiene que ser favorable

(señal negativo)

S›P
G’0 = negativo

- Energía de activación
 Acción de una enzima

- Aceleran una reacción porque disminuye la energía de activación

Estado de transición

- Sin enzima
- Enzima complementaria al sustrato
- Enzima complementaria al estado de transición

Mecanismos de acción enzimática

- Efecto de proximidad y orientación

S1 + S2 > P

G≠ = H≠ - T S≠

dism. Dism. más dism.

Mecanismos de catálisis enzimática

- Ácido-base general
- Covalente
- Por iones metálicos

Tema 11.

Reacciones catalizadas por enzimas

E + S >< ES >< E + P

- Reacciones tipo reversibles

- Hasta un 5% de la concentración de sustrato no modifica la velocidad
- La transformación de ES es depreciable (es muy baja) porque transcurre con el
resto que podemos eliminar
- L etapa limitante es la que va desde el complejo ES

ES >< E + P

Es muy muy baja (podemos quitar el <)

- Modelo MM

E + S >< ES

V1 = k1 [E] [S]10
V1 = k2-1 [ES]
V1 = V1
K1 y k-1

27/09/2019

Significado de la constante Km

- Km: concentración de sustrato a la cual se puede alcanzar la mitad de la

velocidad
- Unidades: M, mM, M, nM
- Se define para una pareja enzima-substrato

Significado de la Vmax

- Se mide en U (unidades/min)
- Depende de la concentración de enzima (es directamente proporcional)
- Es necesario saber la cantidad de enzima utilizada

Parámetros cinéticos

- Kcat (constante catalítica):

 unidades seg-1
 número de moléculas de sustratos transformadas por unidad de tiempo

- Constante de especificidad: permite relacionar la Kcat con la KM

 Unidades: M-1 x seg-1 (conc-1 x tiempo-1)
 Cuanto mayor la Kesp, mayor la eficiencia
 El mayor valor (límite máximo) que se puede atingir la Kesp es la capacidade
de difusión de E y S

Determinación Km y Vamx
30/09/2019 Clase 105 – atrasada

Inhibición enzimática

-
- Puede ser reversible cuando desaparece la acción del inhibidor, o irreversible
cuando ocurre un enlace covalente)
-

Inhibición competitiva

- Sustrato y inhibidor compiten

- Se forma un complejo enzima y sustrato al principio (disminuindo la cantidad de
enzima disponible, habiendo menos enzima libre, formando así el complejo
enzima sustrato)
- E + I >< EI
v+3 = k+3 [E] [I]
v-3 = k-3 [EI]
k-3/k+3 = [E][I]/[EI]

kI = [E][I]/[EI]

kM’ o kM app > kM

Vmax (no varia)

- kM’= kM (1+ [I]/KI]

1+ [I]/KI = 

- y = ax + b
a = vM’/vmax = kM . /vmax

- En ese tipo de inhibición multiplicamos por 

Inhibición acompetitiva

- El complejo solo se une al inhibidor

- kI = kI’= [ES] [I] / [ESI]
kM’ = kM/
vmax’= vmax/

- En ese tipo de inhibición se produce una disminución de la kM

- Siempre parte del sustrato va a ser capturado para el inhibidor y para dar parte
de la reacción
- En ese tipo de inhibición dividimos por 
 -  = kM’/vmax’= kM/ / vmax/

Inhibición no competitiva

- kI es igual a kI’(el inhibidor tiene la misma afinidad)

kI = kI’
kI = kI’ = [E][I]/[EI] = [ES][I]/[ESI]
kM = no varia
vmax’ = vmax/

a = vM / vmax’
a = kM . /vmax

Inhibición mixta

- no va a preguntar nada

Inhibición irreversible

- lleva a la inactivación de la enzima

- utilización de inhibidores irreversibles
- Clasificación:
 Reactivos específicos de grupo no específico
 Reactivos dirigidos al centro activo

01/09/2019 Clase 105

Unidades de medida de la actividad enzimática

- Importancia del papel biológico de las enzimas

- La actividad de una enzima representa los micro moles de un sustrato formados
por minuto a un producto
Mole/min U

- Actividad para un volumen dado

Actividad/mL

- Controles internos :
Actividad específica
AE = U/mg de proteína

- Actividad referida a el número de céclulas

Actividad/n de células

- Actividad referida al gramo de tejido

Actividad/g de tejido
Actividad específica

- Actividad es una velocidad (condiciones de velocidad máxima, máximas

capacidad de la enzima)
- Actividad específica = unidades de enzimas/mg proteína
- La actividad específica debe aumentar

Variación de la actividad específica durante el proceso de purificación de un

enzima

- Grado purificación = AEe/AE0

- Rendimento = Act totale/Act total0 x 100

Unidades de medida de la actividad enzimática

- Actividad molecular (kcat o número de recambio): poder catalítico de una

enzima, hace referencia al numero de moléculas de sustrato que sao transferidas
por segundos, no se habla sobre la pureza de una solución
Actividad molecular = kcat = n de recambio/seg
Actividad moledular = U/mg proteína
U = moles/min (transformar min en seg)
g/mol = 1 dalton

Variables que influen en la velocidad de las enzimas

- Temperatura
- pH

Efecto de la concentración de enzima

v = vmax . [S]/kM + [S]

vmax = k2 . [E]T

Efecto de la temperatura

- La velocidad de la reacción aumenta

- Desnaturalización de la proteína

Efecto del pH
 - Curvas bifásicas (máxima actividad en el pH biológico)
Origen:
 Ionización del sustrato
 Cambios conformaciones del enzima
 Ionización de grupos del centro activo que favorecen la transformación de un
sustrato a un producto

Reacciones bisustrato

- Con formación de un complejo ternario (al azar u ordenadas)

- Sin formación de un complejo ternario

Mecanismos de regulación de los enzimas

- Disponibilidad de sustratos
- Regulación de la actividad catalítica
 Cambios conformacionales (cooperatividad, sitio alostérico, modificaciones
covalentes reversibles, modificaciones irreversibles por proteólisis específica)
- Regulación de la cantidad de proteína enzimática (síntesis y degradación)

02/09/2019 Clase 105

Ecuación de velocidad para enzimas cooperativos

Extrapolación del modelo de Hill a cinéticas enzimáticas

- E + n S >< E Sn > E + n P
k2

v = vmax . [S]n/[S]n + (S0,5)n

n S = n moléculas de sustrato
k2 = constante catalítica
n = número de sitios para ese sustrato
S0,5 = concentración del sustrato el cual alcanza la mitad de la velocidad

 Si n = 1, pasa a ser la ecuación de Michaelis y Menten

 Esa ecuación del modelo de Hill sirve para modelos hiperbólicos y sigmóide

 En la ecuación del modelo de Michaelis y Menten, se puede hablar sobre

S0,5

- E + n S >< E Sn > E + n P
k2

v = vmax . [S]nH/[S]nH + (S0,5)nH

 nH = mide la cooperación entre las los centro activos de las subunidades, mide el
cambio conformacional, cuanto fuerte es ese cambio conformacional

nH o número de Hill
nH < n (número de sitios)
nH = 1: no hay cooperación (curva hiperbólica)
nH <1: la cooperación es negativa (para nosotros no existe)

Alosterismo

- Unión de un ligante en un sitio diferente al centro catalítico y que modula su

actividad
- Permite adecuar una ruta catalítica

Modelos para regulación alostérica

- Concertado (Manod-Wyman-Changeux, MWC)

- Secuencial (más complejo, KNF)

Modelo Concertado

- Las dos formas están en equilibrio, y hay el predominio de la forma T

- Cuando interacciona con el sustrato, tenemos que añadir otro equilibrio para
formar el complejo enzima-sustrato. Ocurre el desplazamiento del equilibrio
para la formación del complejo enzima-sustrato
- En presencia de un activador (alostérico), se une a un sitio distinto. Al equilibrio
inicial, favorece las interacciones de forma R, desplazando el equilibrio hasta la
izquierda
- En presencia de un inhibidor, ese se une a la forma T, desplazando el equilibrio
hasta la derecha a la forma R

Modelo secuencial

- Las interacciones entre las subunidades no son equivalentes

- Se genera diferentes estados conformacionales según las constantes específicas

Enzimas cooperativos

- La variación de la velocidad implica en el cambio del metabolito más pequeño

Regulación por modificación covalente

- Añadir algún grupo al enzima

 Fosforilación: adicción de fosfato
 Adenilación/uridilación
 ADP-ribosilación
 Metilación
 Acetilación
 Miristoilación

Amplificación de la señal

- Cascadas de señalización: un determinado compuesto hace cambios para llegar a

un efecto determinado (Ejemplo: adrenalina – secretada en una situación de
stress y libera a nivel del hepatocito una glucosa libre. Efecto de amplificación,
en que la adrenalina puede producir muchas moléculas de glucosa)
- Modificación reversible: se puede revertir la situación
- Amplificación de las señales

Regulación por proteólisis específica

- Algunos enzimas activados por proteólisis limitada

- Zimógeno: precursor inactivo de una enzima que se activa por proteólisis
(irreversible)
- Ejemplo: Activación del tripsinógeno (a nivel de páncreas) a tripsina (capaz de
activar el tripsinógeno en quimiotripsina, proelastase, procaboxipeptidasa)

Cofactores enzimáticos

- Hay enzimas que necesitan una porción no proteica (cofactor) para activar su
función
- Cofactores: componentes no proteicos
 Iones esenciales (pueden estar unidos de forma débil o de forma fuerte)
 Coenzimas: compuestos orgánicos (también pueden estar unidos de forma débil
o de forma fuerte)
- Cosustratos: unión débil, se modifican durante la reacción y son regenerados por
otro enzima (Ejemplo: ATP)
- Grupos protésticos: unión fuerte, permanecen unidos al enzima durante la
reacción (Ejemplo: el grupo hemo)

04/09/2019 Clase 105

- Coenzima metabolito: ATP, S-adenosilmetionina (SAM o AdoMet)

Introducción al Metabolismo y Bioenergética

- Metabolismo: series de reacciones químicas catalizadas por enzimas que permite

a la célula realizar sus funciones vitales, y permite la obtención de energía, y la
 biosíntesis de macromoléculas, permite a la célula sintetizar a partir de eses
compuestos químicos algunos derivados propios de la célula
- Rutas metabólicas importantes
- Su constancia en las especies

Ciclo del carbono y del nitrógeno

- Ciclo del caborno:

 Heterotróficos > CO2
 Autotroficos > O2

- Ciclo del nitrógeno

 N2 (nitrógeno molecular en la atomosfera)
 El nitrogeno tiene que ser reducido a amonio (amoniaco)
 Bacterias fijadoras de nitrógeno (fijación)
 Desasimilación del nitrógeno
 El amonio puede pasar a nitrito o a nitrato

Catabolismo y anabolismo

- Catabolismo:
 Degradación a compuestos mas sencillos que implica en una oxidación de los
mismos, liberando su energía interna que es posible utilizar en la formación de
ATP, que a su vez puede ser utilizado en procesos anabólicos. Tambien se
genera sustratos anabólicos
 “Lisis”
 En el proceso oxidativo, origina metabolitos para dar compuestos reducidos que
podrán ser utilizados como energía química para procesos anabólicos
- Anabolismo:
 Síntesis
 Procesos reductivo
 Utiliza ATP para dar a cabo a ese proceso
 Los productos finales son utilizados en el catabolismo
 “génesis”

Energia libre o energía de Gibbs (G)

- Energía: la capacidad de realizar trabajo

- (-): espontanea
- (+): no espontanea
- 0 = equilibro
- No proporciona información sobre la velocidad de la reacción
- Energía total = energía utilizable + energía no utilizable
- Energia total = entalpia (H)
- Energia utilizable = energía libre (G)
- Energia no utilizable = Entropia
- H = G + T. S
- G=H–T.S
- G = H – T . S
- Sistema cerrado: para que sea espontanea, hay que tener una tendencia de
entropía
- Sistemas biológicos no se pueden ser considerados como sistemas cerrados
- aA + bB >< cC + dD
- Keq = [C]ˆc . [D]ˆd / [A]ˆa . [B]ˆb
- G’0 = variación de energía libre en condiciones estándar
- G’0 = - RT ln K’eq
- K’ eq = condiciones químicas de pH 7
- K’eq < 1 G’0 (+): de R a P
- K’eq > 1 G’0 (-): de P a R

Relación entre G’0 y G

- G’0: es una CONSTANTE

- G: depende de las concentraciones de reactivos y productos, y de la temperatura
- G = G’0 + RT ln productos/reactivos
- G’0 son adictivas

Reacciones acopladas

- Se tenemos la energía de cada etapa/reacción, es posible sumar las

etapas/reacciones
- Se produce gracias al acoplamiento un incremento en la constante de equilibrio
- Las constantes de equilibrio son multiplicativas

Reacciones redox

- Par redox: un compuesto determinado se reduce al paso que otro se oxida,

relaciona la forma reduzida con la forma oxidada
- Reduccion: agente oxidante
- Oxidacion: agente reductor
- NAD, FAD NADP: transportadores electrónicos
- O2: transportado de electrones (aceptor final de electrones)

Tipos de transferencia de electrones

- Directamente: citocromos
- Combinación con el O2
- Forma de átomos de H
- Forma de ión hidruro

Potencial de reducción

- Potencial de reducción (E): mide la capacidad que se tiene un reductor de ceder

electrones
- E0 = 0 V (en condiciones estándar)
- Condiciones estándar: 25 C, 1 atm presión, [reductor] = 1 M
- E = E0 + RT/nF ln [aceptor de electrones/donador de electrones]
 - n = numero de electrones cedidos
- F = constante de Faraday
- Condiciones fisiológicas: pH = 7 (E’0)

07/10/2019 Clase 105

Potencial de reducción

- G’0 = - n F E’0

Donantes y receptores de electrones

- ATP y NADP: recibe y cede dos electrones a la vez

- Flavina: recibe un electrón y cede un electrón, pero no los dos a la vez

Reacciones ixodacion-reduccion

- El NADH es un agente fuetemente reductor y cede electrones

- El O2 es el un agente fuertemente oxidante y capta electrones, es el receptor
final de electrones

ATP

- Síntesis de ATP
 Procesos catabólicos: ADP + Pi > ATP
 Procesos anabólicos: ATP > ADP + Pi
- Hidrólisis de ATP
 Como los grupos están desprotonados, favorece la posibilidad que una molécula
de agua rompa el enlace, formando el ADP. El fosfato forma un hibrido de
resonancia, y se estabiliza. Uno de los grupos OH del fosfato pasa a ADP2-,
 La energía liberada es de -30,5 kJ/mol

Potencial de transferencia del grupo fosfato por el ATP

- Hidrólisis del ATP

- ATP + H2O > ADP + Pi
- En células, G’0 es diferente de G, G real es igual a GP

Glúcidos

- Son polihidroxialdehidos
- Fuente de energía
- Forman parte dos esqueletos carbonatos de muchas moléculas
- Se puede clasificar conforme el número de H

Monosacáridos, oligosacáridos y polisacáridos

- Glucosa: fuente energía

- Almidón, sacarosa, glucógeno, dextranos: reserva energética
- Celulosa, quitina, peptidoglicano: soporte estructural y de protección
- Información;
 Reconocimiento, adhesión y información
 Señal de localización
 Median interacciones específicas
- Protección contra la degradación proteolítica

Las dos familias de monosacáridos: aldosas y cetosas

- Gliceraldehido
- Desidrixicetosa
- Aldosa: grupo aldehído
- Cetosa: grupo cetona
- Los monosacáridos tienen centros asimétricos, contiene centro quiral (isomería
óptica)

09/10/2019 Clase 105

Estructura de los carbohidratos

- Formas cíclicas e la glucosa e la fructosa (anómeros0

- va a ser alfa o beta dependiendo donde esta el OH
- azucares representados por la perspectiva de Haworth
 diastereoisomeros: isómereoa que no forman espejos
 epímeros: uno de los carbonos asimétricos de un grupo es diferente entre un
compuesto y otro
 anómeros: difieren en el carbono asimétrico que se forma al ciclarse

Derviados de azúcares

- grupo OH posición 2 puede estar sustituido por grupo amino

 ácido muramic: sustituyente en la posición 3
 Deoxy azúcares: derviados de la reducción de amino azúcares
 Derivados fosforilados de los aúcares
 Deriavdos de la oxidación de los azúcares
 Ácidos de azúcares

Características

- Los monosacáridos son agentes reductores

- Esta capacidad es utilizada también para detectar la glucemia
Disacáridos

- Resultados de un enlace éter entre dos carbonos y la eliminación de una

molécula de agua
- Azúcares más comunes: maltosa (1 -4), sacarosa (1 - 2), lactosa (1- 4)

Polisacáridos

- Clasificacion:
 Homopolisacáridos: mismas subunidades de monómeros (Ejemplo: amilosa –
azúcar de reserva de las plantas, amilopectina, glucógeno – cadenas lineares por
enlaces 1-4, dextranos, inulina, celulosa, quitina)
 Heteropolisacárido: diferentes de subunidades de monómeros (Ejemplo:

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Glicolisis

- Degradacio de glucosa para formar dos moléculas de lactato en la ausencia de

oxígeno
- No interviene el oxigeno en ninguna de las reacciones de glicólisis
- Producción neta de ATP (autentico producto/objetivo final de la glicolisis)
- Via universal, está en todas las células
- Forman productos que van para otra ruta
- C6H12O6 > 2 CH3 – HOCH – COO- (lactato)
- Glucosa > glucosa 6-P > > > piruvato > lactato
V
V
2 Etanol + 2CO2
- Ni siempre el piruvato se convierte en el lactato
- La glucosa 6P también puede converterse en glucógeno
- Glucogénesis: ruta al revés para producir glucosa
- Cruzo de caminos de la ruta metabolica: Glucosa 6P, piruvato, acQA, cAC
- Proceso de oxido-reduccion: de transferencia de electrones
- Eduard Buchner (1860-1917)
- Sin ATP la glicolisis no funciona
- Se gasta 2 ATP y se produce 4 ATP
- Destinos de la glucosa 6P: formación de glucógeno u otros destinos
- Hay una imposición de la termodinámica para la realización de una ruta
metabólica
- Ruta metabólica: una o mas reacciones
Primera reacción

- Conversión de glucosa en dos triosas fosfato

- Requiere magnesio (Mg2+)
- Delta G = -16,7 kJ/mol (en condiciones fisiológicas)
- La reacción de la hexokinasa
- Rotura de ATP (exergónica)

- Glucosa + Pi > glucosa 6P + H2O (mucho endeergónica) delta G = +138 kJ/mol

- ATP + H2O > ADP + Pi -30
- _____________________________________
- Glucosa + ATP > Glucosa 6P + ADP 16,7 kJ/mol

Segunda reacción

- Glucosa 6-fosfato se convierte en fructosa 6-fosfato

- Delta G = 1,7 kJ/mol
- La rotura tiene que ser entre la posición 1 y 3

Tercera reacción

- Fructosa 6-fostato se convierte en fructosa 1,6-bifosfato

- Delta G = -14,2 kJ/mol
- Reacción extremamente irreversible

Cuarta reacción

- Fructorsa 1,6-P2 se convierte en dihidroxiacetona-P y gliceraldehido 3-P

- Delta G = 23,8 kJ/mol

Última reacción

- También de isomerización
- Dihidroxiacetona-P se convierte en gliceraldehido 3-P
- Delta G = 7,5 kJ?mol

Segunda parte

- Fabricación de ATP

II producción de ATP
- Gliceraldehido 3-P oxida el NAD+
- Perfectamente reversible
- Delta G = 6,1 kJ/mol
- Gliceraldehido 3-P se convierte a 1,3-bifosfoglicerato

Próxima reacción

- Formación de una molécula de ATP

- 1,3 Bisfosfoglicerato se cconvierte a 3-fosfogliceato
- Delta G = -18,8
- Ecuación en la foto

Próxima reacción

- 3-fosfoglicerato se convierte a 2-fosfogliceato

- Delta G = 4,4 kJ/mol

Próima reacción

- 2-fosfoglicerato se convierte a fosfoesnolpiruvato

- Delta G = 1,7

Próxima reacción

- Piruvato kinasa: enzima motor de esa ruta

- Fosfoenolpiruvato se convierte a piruvato
- Delta G = -31,4

Próxima reacción

- Lactato deshidrogenasa: enzima

- NADH se oxida a NAD+
- Esa reacción es muy negativa
- Piruvato se convierte a lactato
- Delta G = -25,1

Balance global de la glucolisis

- Glucosa + 2 ADP + 2 Pi > 2 Lactato + 2 ATP + 2 H2O

- Delta G = -135 kJ/mol
- Extremamente exergónico

- Reacción parando en la
- Glucosa + 2 ADP > 2Pi + 2NAD+ > 2 Piruvato + 2ATP + 2H2O + 2NADH +
2H+
- Delta G = - 110 kJ/mol
Balance global de la fermentación alcohólica

- Glucosa +