I.

UNIVERSIDAD AUTONOMA METROPOLITANA

UNIDAD ETAPALAPA

'División de Ciencias Biológicas y de la Salud

Departamento de Hidroblologia

&IVERSITY", Programa para el cálculo de hdicer, de Diversidad,

para Windows 95

/Rodriguez Salazar María Elena

93230649

J
Para la obtención de grado de Licenciatura
H 1 DL0 BIOL041R

ASESOR
/NI. en B. E. Sergio h a n u Hemández
 "DIVERSITY", PROGRAMA
PARA EL CÁLCULO DE ÍNDICES
DE
DIVERSIDAD,
PARA WINDOWS 95.

Existen tres razones por las cuales los ecólogos manifiestan un gran interés por la
diversidad ecológica y su medición. Primera, a pesar de que el cambio fascina y
preocupa, la diversidad sigue siendo un tema central en ecología. Los modelos
bien documentados de variación espacial y temporal en diversidad, que intrigaron
a los primeros investigadores naturalistas continúan aún hoy estimulando las
mentes de los ecólogos. Segundo, las medidas de diversidad frecuentemente
aparecen como indicadores del buen funcionamiento de los ecosistemas. Tercero,
la existencia de notables debates sobre la medición de la diversidad (Magurran,
1989).

Magurran (1989) afirma que es importante que los ecólogos puedan entender cómo
medir la diversidad y qué dan a entender con ella. La diversidad yace en el eje de
algunas de las cuestiones teóricas y prácticas fundamentales y más excitantes de la
ecología.

Este programa tiene como propósito servir como herramienta para las UEA's de
Ecología de Comunidades que se imparten en la UAM-I, permitiendo el
conocimiento y el cálculo de los diversos índices de diversidad existentes en la
literatura.

Así mismo el programa provee de información acerca de las características de cada

índice para U M mejor elección e interpretación de las medidas de diversidad
propuestas desde 1949 por Simpson; tomando en cuenta también los índices
basados en la teoría de la información de Shannon y Weaver (1949); el índice de
equitatividad propuesto por Heip (1974); las propuestas a la notación de los indices
hecha por Hi11 (1973) y el índice de diversidad propuesto por McIntosh (1967) entre
otros.

Por s u contenido se considera que "Diversity" es un software de gran importancia

como herramienta de apoyo a los curso-. de Ecología de Comunidades de la UAM-
I; así como para todo aquel que desee un método rápido y sistematizado de
localizar y calcular la gran gama de índices de diversidad.

Los primeros lenguajes de programación fueron diseñados en los años 50 y se

crearon, fundamentalmente, para resolver complejos problemas matemáticos
(Nelson, 1993). El lenguaje original Basic fue creado por John G. Kemeny y Thomas
E. Kurtz, en 1963, en el Dartmount College (Halvorson, 1996), (Basic es acrónimo

2
de Beginner’s All-purpose Simbolic Instruction Code) y era un lenguaje muy
simple, diseñado especialmente para hacer que resultase sencillo aprender a
programar (Nelson, 1993).

Rápidamente se convirtió en un lenguaje muy popular en la enseñanza, en las

universidades y colegios y fue adaptado para uso en computadoras personales por
Bill Gates, a mediados de los años setenta. Desde aquellos primeros días se han
creado muchas versiones distintas de Basic para computadoras personales, entre
otras Microsoft QuickBasic y MSDOS Qbasic (Halvorson, 1996).

Se eligió Visual Basic ya que a pesar de que el entorno de desarrollo gráfico de

Visual Basic y su lenguaje de programación son, con diferencia, mucho menores
que los primeros intérpretes de Basic, la elegancia y simplicidad del Basic original
está presente en el lenguaje. La potencia de Visual Basic y su facilidad de uso son
las razones principales por las que ha sido elegido como lenguaje de programación
para aplicaciones de Windows como Excel (Halvorson, 1996).

Visual Basic es también uno de los primeros lenguajes de programación que

admite la programación llamada “orientada a eventos”,un estilo de programación
especialmente adaptado a las interfaces gráficas de usuario. Tradicionalmente, la
programación ha estado muy orientada al proceso, al paso a paso, de manera muy
similar al de una receta, lo que no permite al usuario salir del orden determinado.
La programación orientada a eventos o a objetos tiene la característica de que el
programador escribe un programa que responde a las acciones del usuario
(Nelson, 1993).

La diversidad de especies (en ocasiones llamada heterogeneidad), es una de las

cinco características emergentes del nivel de organización correspondiente al de las
comunidades bióticas (Bravo-Núñez, 1991); por lo que se considera como una
expresión de la estructura de la comunidad (Brower y Zar, 1979). Es así que
Margalef (1991) define a la diversidad como la expresión del número de especies y
sus abundancias relativas.

Casi todo lo concerniente a la diversidad ha sido estudiado, al menos parece estar

claramente definida, y al enfocar el problema desde distintos ángulos, pueden
obtenerse diferentes percepciones de lo que implica. El problema se complica por
el hecho de que los ecólogos han diseñado una extensa gama de índices y modelos
para medir la diversidad. Como resultado de ello, la diversidad tiene la cualidad
de no ser definida con exactitud, hasta el punto en que Hurlbert (1971) la define
como “un no concepto” (Magurran, 1989).

3
Brower y Zar (1979) afirman que una comunidad tiene una alta diversidad de
especies si están presentes muchas especies igual o cercanamente igual de
abundantes. Si una comunidad está compuesta de muy pocas especies, o si unas
pocas especies son abundantes, entonces la diversidad de especies es baja. Una alta
diversidad de especies indica una comunidad altamente compleja, para una gran
variedad de especies que permite una gran gama de interacciones entre ellas, de
esta forma, la población interactúa involucrando transferencia de energía (redes
tróficas), predación, competencia, y la repartición del nicho y este conjunto de
características son teóricamente más complejas y variadas en una comunidad con
una alta diversidad de especies.

El propósito de cuantificar la diversidad ecológica es usualmente el valorar 5 u

relación con las propiedades de una comunidad como son la estabilidad y la
productividad o las condiciones ambientales a las que la comunidad está expuesta
(Pielou, 1975).

ANTECEDENTES

Entre los programas relacionados con los índices de diversidad se encontraron vía
internet:

ALPHA.LST (Clifford G. Rice, 52 Kb)

Dado un cierto número de individuos (N), número de especies (S) y un número de
individuos menos el número de especies (N-S) en una muestra, provee de los
valores para el índice de diversidad alfa de Fisher.

General Statistics
http://www/general-stats.html

CALIBRATE
Genera modelos de conjuntos de datos ambientales y de especies.

Field Biology Software Checklist, part 1: Ecology software

http:/ / www.euronet.nl/ users/ mbleeker/ prog/ swecolst.htmi

MVSP21K.ZIP (Warren L. Kovach, 307 Kb, v 2.1, para Intel basado en PC)
Es un paquete estadístico multivariado que permite el cálculo de análisis de
correspondencia, análisis de Cluster (con ocho diferentes medidas de distancia y
similitud) y el cálculo de tres índices de diversidad.

4
General Statistics
http:/ /www/ general-stats.hhnl

BioDiversity
Es un paquete que permite el cálculo de índices de diversidad, rarefacción y
modelos de abundancia de especies.

Field Biology Software Checklist, part 1: Ecology software

http:// www.euronet.ni/ users/mbleeker/ prog/swecolst.html

Species Diversity and Richness

Permite la aplicación y el cálculo de índices de diversidad y estima la riqueza total
de especies para un hábitat. Los índices de diversidad son los recomendados por
Magurran (1988), como es el índice de Shannon-Wiener, índice de Simpson,
número de especies, índice de Margalef, Equitatividad J, Dominancia de Berger-
Parker y el índice de McIntosh.
Field Biology Software Checklist, part 1: Ecology software
http:/ / www.euronet.nl/ users/ mbleeker/ prog/ swecolst.htm1

0 DIVERS.FOR(6 Kb, v 1.1)

Este programa permite el cálculo de índices de diversidad y equitatividad
incluyendo los índices de Shannon-Wiener, Simpson y Brillouin.

Ecological Methodology
http:/ / www/ krebs.html

LOGNORM.FOR(11 Kb, v 1.0)

Permite el cálculo del modelo lognormal de los modelos de especies-abundancia.

Ecological Methodology
http:/ / www/ krebs.html

LOGSERIE.FOR(6 Kb, v 1.0,1987)

Permite la estimación de la serie logarítmica de los modelos de especies-
abundancia.

5
Ecological Methodology
http://www/ krebs.html

RAREFACT.FOR(4 Kb, v 1.0)

Calcula el número esperado de especies en muestras de N individuos, siguiendo el
método de Rarefacción.

Ecological Methodology
http:// www/krebs.html

RICHNESS.FOR(5Kb, v 1.0)
Calcula la riqueza de especies de los cuadrantes muestreados utilizando el método
Jackknife.
Ecological Methodology
http:/ /www/ krebs.htmi
Ecological Methodology, (Charles J. KrebsJ989)
Este programa está copilado en FORTRAN77, y posee datos de muestreos.
Incluyendo algunos errores y correcciones de la primera edición.

Ecological Methodology
http://www/krebs.html

Statistical Ecology, (Ludwig y Reynolds, 1988)

Este programa permite llevar a cabo los siguientes análisis:
* Análisis de cluster
* Análisis de correspondencia
* Ajusta una distribución de frecuencias a una distribución lognormal
* Análisis de asociación normal
* Prueba de Chi-cuadradacontra la distribución negativa binomial
* Prueba de Chi-cuadrada contra la serie de Poisson
* Calcula el número de especies esperado por el método de rarefacción
* Análisis de discriminación simple
* Pruebas de asociación de especies
* Correlación producto-momentode Pearson y de Spearman
* Indices de riqueza, diversidad y equitatividad
* Sobrelapamiento de especies
* Coeficientes de distancia

Statistical Ecology
http:/ /www/ludwigand-reynolds.html

6
De La Cruz y Páez (1992) describen un programa integrado de computadora para
el análisis integrado de datos ecológicos escrito en BASIC.

OBJETIVO

El objetivo fue desarrollar un software que permitiera el cálculo de Índices de

Diversidad, utilizando entorno de programación Visual Basic versión 4.0 para
Windows 95.

METODOLOGÍA

El proyecto inició con la investigación bibliográfica de los índices de diversidad.

Posteriormente se utilizó el entorno de programación dirigido a objetos Visual
Basic 4.0 programado en lenguaje C.

Se continuó con la puesta a punto del programa y con pruebas preoperativas, para
hacer las correcciones necesarias.

MANUAL DEL USUARIO

Se presenta el siguiente manual para apoyar la utilización del programa

"Diversity", explicando tanto su estructura y funcionamiento, como la entrada de
datos y la posterior impresión de los resultados.

SOPORTE COMPUTACIONAL

El programa requiere para su correcta ejecución el siguiente Hardware:

-Computadora personal con procesador Pentium I, 8 MB de memoria RAM y un

disco duro de 26 MB como mínimo.

-Manejador de discos flexibles de 3%".

-Monitor.

-Impresora.

-Mouse.

-Windows 95/ 98/ NT.

 INICIALIZAR EL PROGRAMA "Diversity"

Una vez que ha cargado Windows 95 en s u computadora, podrá insertar el

diskette en el manejador de discos flexibles, puede utilizar el explorador de
Windows para abrir el contenido del disco y poderlo instalar en su disco duro.
Esto es con la finalidad de ejecutarlo desde ahí y que no presente problemas por
falta de espacio en el disco flexible.

Una vez instalado puede hacer doble click en el ícono del software y aparecerá una
pantalla de bienvenida, posteriormente iniciará el programa "Diversity".

MANEJO POR MENUS

En la pantalla inicial encontrará un Menú general con los tipos de índices de

diversidad que puede usted calcular, con el mouse usted puede elegir alguna de
las opciones haciendo click en la caja de confirmación, por ejemplo:

Cada una de las opciones lo llevará a un submenú, en el cual también puede elegir
entre diversas opciones la que mejor se adapte a sus requerimientos, para
proveerle una mejor ayuda, cada vez que usted teclea una opción y lo lleva a un
submenú, usted puede regresar a la pantalla anterior utilizando el botón que dice
Regresar.

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Si por ejemplo, usted elige la opción Riqueza de especies, esta lo llevará a la
siguiente pantalla:

Usted P‘iede optar P‘3r alguno de los índices que aparecen en la pantalla o bien
regresar al Menú principal.

Tomemos el Indice de Margalef como ejemplo, cuando usted selecciona este índice
aparecerá la siguiente pantalla:

En esta pantalla encontrará en la parte superior como es que se calcula dicho

índice, esto con la finalidad de proporcionarle como es que se está llevando a cabo
el cálculo y con ello usted esté seguro que dicho índice le es o no benéfico.

Usted encontrará en dicha pantalla una rejilla donde usted deberá llenar la primer
columna con los nombres de sus especies y en las columnas subsecuentes el
número de muestra a la que pertenecen, por ejemplo, en la primer columna se
anotaron spl, sp2, sp3, etc., para facilitar el trabajo, en la columna de MUESTRAI,
se llenó con las cantidades en que fueron encontradas dichas especies en el campo;

I
puede seguir llenando las muestras que desee o bien trabajar solo con la columna
de MUESTRA1.

Posteriormente usted puede elegir de cual muestra quiere calcular el índice, por
ejemplo, si usted desea conocer el índice de diversidad de Margalef de la
MUESTRAl, solo tiene que posicionarse con ayuda del mouse en el espacio que
dice "Número de muestra" y teclear 1:

Después de haber tecleado el número de muestra, puede oprimir el botón Calcular

para obtener el resultado en el espacio correspondiente:

Hay que hacer notar que cuando usted calcula el índice de diversidad de alguna
muestra, dicho número se borra automáticamente para permitirle una nueva
entrada o bien puede enviar a impresión su cálculo.

IO
Si se diera el caso de que usted introduzca una letra o símbolo diferente de un
número en el espacio correspondiente a Número de muestra, el programa le
mostrará un mensaje como el que se muestra a continuación:

Cuando usted aprieta el botón OK del mensaje automáticamente borra el símbolo

que usted haya tecleado erróneamente permitiéndole teclear un número válido de
muestra.

Este flujo de programa se aplica para todos los índices que el software calcula, los
cuales se encuentran divididos de acuerdo a su tipo:

INDICES DE RIQUEZA DE ESPECIES

Proporción directa simple
Indice de Odum
Indice de Margalef
Indice de Menhinick
Indice de Gleason
Indice de Yule

ABUNDANCIA DE ESPECIES
Indice de Shannon-Wiener
Indice de Simpson
Números de Hill
Indice de Hurlbert
Indice de Gini
Indice de McIntosh
Indice de redundancia

INDICES DE DIVERSIDAD MAXIMA

Indice de Shannon-Wiener
 Indice de Simpson
Indice de Hurlbert
Indice de McIntosh

INDICES DE DIVERSIDAD MINIMA

Proporción directa simple
Indice de Shannon-Wiener
Indice de Simpson
Indice de Hurlbert
Indice de McIntosh

INDICES DE EQUITATIVIDAD
Indice de Shannon-Wiener
0 Indice de Simpson
Indice de Hurlbert
Indice de McIntosh

INDICE DE DOMINANCIA
Indice de Shannon-Wiener

Los tipos de índices se localizan en el Menú Principal del Software.

DISCUSION

PUESTA A PUNTO

Se llevaron a cabo un promedio de 40 corridas del programa para comprobar su

utilidad y buen funcionamiento. Antes de la puesta a punto se detectaron errores
en cuanto a la aceptación de números y no de letras en la entrada de número de
muestra, si es tecleado un carácter diferente al de un número, el programa le
llamará a que corrija el error por medio de un mensaje que se encontrará en medio
de la pantalla y dejando en blanco el espacio provisto para el número.

PRUEBAS PREOPERATIVAS

Se realizaron cálculos con matrices de diversos tamaños entre los cuales destacan
una matriz de 6 muestras por 15 especies, en donde los resultados obtenidos por
un índice de diversidad fueron comparados con un análisis hecho en Excel, la
siguiente tabla ilustra la matriz y los resultados obtenidos en Excel de las diversas
muestras:
N, número de individuos 80 80 80 40 1O0 150
S, número de especies 8 10 8 8 15 15

Proporciión directa simple

Tomando el conjunto hipotético de datos, se calcula la proporción directa simple
dividiendo el número de especies entre el número total de individuos de la colecta
8,de la forma:

Pds=S/N
Pds = 10 / 80 = 0.125

Indice de Margalef

13
Considerando los datos hipotéticos de la colecta B, tenemos que el índice de
Margalef se obtiene de la siguiente manera:

D M=~(Sl)
/ In N
D M=~(10-1) / In 80 = 4.73

Indice de Menhinick

D,,,, = S I J N

D,, = IO/& = 1.12

Indice de Gleason
DG=S/InN

DG= 10 / In 80 = 2.28
Indice de Yule modificado
El índice de Yule utiliza a n como el número total de especies en la muestra:

Esto es, se llevaron a cabo cálculos con matrices de diversos tamaños y con
diferente número de muestras, cada uno de los cuales se comparó con un análisis
manual para corroborar su veracidad, incluyendo una matriz de 10 muestras por
50 especies y una de 10 muestras por 100 especies.

Los resultados obtenidos del software muestran que es un programa que puede ser
utilizado con una matriz de 10 muestras por 100 especies sin que presente
problema alguno, y con la facilidad de poder hacer los cálculos de una forma
rápida y ordenada.

El tiempo promedio de realización del cálculo es de aproximadamente medio

minuto cuando son matrices de 50 especies por 5 muestras.

14
 CONCLUSION

Con base en los objetivos del proyecto, se establece que el software cumple con los
requerimientos necesarios para poder ser utilizado por cualquier tipo de usuario
en el cálculo de Indices de Diversidad tomando en cuenta la velocidad con que
pueden ser calculados divers<>.índices y diversas matrices de datos.

Las ventajas son importantes, ya que se ahorra tiempo evitando los cálculos que
suelen ser largos y tediosos, lo que en ocasiones conlleva a cometer errores en los
mismos. La aplicación del software es amplia, ya que puede ser utilizado tanto por
estudiantes como por investigadores por su sencillez, rapidez, efectividad y
confiabilidad.

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