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CONTEXTO
Como resultados del aprendizaje asociado a este tema, se adquieren las siguientes
competencias:
ÍNDICE
4.1. Nucleótidos y ácidos nucleicos
4.2. Ácidos nucleicos y genética molecular
4.2.1. Replicación y transcripción de DNA
4.2.2. Traducción. Biosíntesis de proteínas
4.2.3. El código genético
4.2.4. Regulación de la expresión genética
4.3. Alteración del DNA celular
4.4. Tecnología del DNA recombinante
4.5. Crecimiento y reproducción de una célula
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2. Una pentosa:
ribosa desoxirribosa
Los componentes principales de los DNA son cuatro desoxirribonucleótidos diferentes que
difieren entre sí sólo en las bases nitrogenadas que contienen (los derivados purínicos adenina
y guanina o pirimidínicos citosina y timina), de las que reciben el nombre. Análogamente, los
componentes principales de los RNA son cuatro ribonucleótidos que se diferencian en la base
nitrogenada (purínica: adenina o guanina, o pirimidínica: citosina o uracilo (figura 4.2).
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Así, los ocho nucleótidos principales presentan la estructura que se muestra en la figura 4.3.
Además, existe otro tipo de nucleótidos que se caracterizan porque tienen el grupo fosfato en
otras posiciones diferentes.
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La estructura residual que se forma cuando el grupo fosfato del nucleótido se separa por
hidrólisis recibe el nombre de nucleósido.
Figura 4.4. Enlaces fosfodiéster del esqueleto covalente del DNA y el RNA
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La estructura covalente y la secuencia de bases de las cadenas polinucleotídicas se
esquematizan frecuentemente de la manera que se ilustra en las figuras 4.5 y 4.6. Se suele
utilizar una convención internacional para indicar las secuencias de nucleótidos, en la que los
ribonucleótidos se simbolizan por A, U, G y C y los desoxirribonucleótidos por dA, dT, dG y dC.
En la figura 4.5, la letra p representa un grupo fosfato terminal y el guion un grupo fosfato
interior.
Figura 4.6. Representación esquemática de una molécula de RNA. Los pares de bases G-U no
son de Watson y Crick y se forman solamente cuando cadenas de RNA presintetizadas se
pliegan sobre sí mismas (no hay RNA polimerasas que inserten un U enfrente de un molde de G
o viceversa durante la síntesis del RNA)
La estructura tridimensional del DNA fue establecida por Watson y Crick en 1953 (figura 4.7),
que propusieron un modelo en el que dos cadenas polinucleotídicas dextrógiras se hallaban
arrolladas en forma de hélice alrededor del mismo eje, constituyendo así una doble hélice.
Ambas cadenas o hebras son antiparalelas, es decir, sus puentes fosfodiéster 3'.5'-
internucleotídicos van en sentidos opuestos. El arrollamiento de ambas cadenas es tal que no
pueden ser separadas sin desenrollarlas. Las bases purínicas y pirimidínicas de cada una de las
hebras están apiladas en el interior de la duplohélice, con sus planos paralelos entre sí, y
perpendiculares al eje de la hélice. Las bases de una de las hebras están apareadas en los
mismos planos con las bases de la otra hebra y el apareamiento de las bases con que
contribuyen las dos hebras es tal que solo encajan en la estructura determinados pares de
bases que pueden unirse por enlaces de hidrógeno. Los pares permisibles son A-T y G-C. El
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Figura 4.7. Artículo de Watson y Crick en el que propusieron el modelo de doble hélice para el
DNA
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Figura 4.8. Formación de puentes de hidrógeno entre los pares de bases de Watson y Crick
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Los virus animales se adsorben en las células huésped, penetran a través de la pared celular y
se despojan de sus subunidades proteicas, exponiendo así el ácido nucleico viral. Así, suprimen
los procesos dirigidos por los requerimientos de la célula huésped y dirigen el metabolismo
hacia la formación de los constituyentes de los virus. Para los fagos, la reproducción es similar
a la de los virus animales, con la excepción de que en la célula huésped sólo entra el ácido
nucleico del fago.
Los hongos se reproducen por extensión de las hifas y división asexual del núcleo. Según se van
elongando las hifas, las partes más viejas del micelio se van convirtiendo en inactivas para la
absorción de nutrientes. En todos los hongos, excepto en Oomycetes y Zigomycetes, se forman
paredes que contienen un poro a través del cual el citoplasma y el núcleo pueden pasar de una
célula a otra. Las esporas asexuales brotan de la parte superior de las hifas y pueden ser uni- o
multinucleares.
En la figura 4.9 se muestran diferentes modelos en los que se aprecia el acoplamiento de las
bases A-T y G-C, que proporcionan las mejores posibilidades en cuanto a acoplamiento y
estabilidad de la doble hélice. Dado que las dos hebras del DNA son estructuralmente
complementarias entre sí y, por tanto, contienen información complementaria, durante la
división celular, cada cadena progenitora sirve de patrón especificador de la secuencia de
bases de una nueva hebra complementaria. El resultado final de este proceso consiste en la
formación de dos moléculas hijas de DNA duplohelicoidal, cada una de ellas idéntica a la del
DNA progenitor y contenedora de una hebra de este último (figura 4.10). Este proceso recibe
el nombre de replicación.
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RNA puede almacenar información genética, que puede ser transferida del RNA al DNA según
un proceso de transcripción inversa.
La replicación del DNA tiene efecto por la acción de unas enzimas (polimerasas), que catalizan
la adición de unidades mononucleotídicas al extremo con el hidroxilo 3’ libre de una cadena
del DNA (figura 4.11). Por tanto, la dirección de la síntesis es 5’-3’. Además, la polimerasa I
también tiene actividad de exonucleasa 3’-5’ y de exonucleasa 5’-3’ (hidrólisis de restos
nucleotídicos de los extremos 3’ y 5’, respectivamente: figura 4.12). Las DNA-polimerasas
requieren algo de DNA preexistente con un hidroxilo 3’ libre al que se adicionan los nuevos
restos nucleotídicos y que, por tanto, actúa como hebra cebadora. Además, la hebra cebadora
debe estar apareada en bases con una larga hebra de DNA que funciona como patrón o molde.
Esta estructura se le llama patrón-cebadora (figura 4.11). La notación 3'→5' o 5'→3' indica el
sentido en el que se produce la eliminación de nucleótidos.
Cadena de DNA en
crecimiento
(Cebador)
Cadena de DNA
molde
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Figura 4.12. Ejemplo de corrección de errores por la actividad exonucleasa 3'→5' de la DNA
polimerasa I
Se dice que una hebra de DNA tiene una mella cuando presenta un grupo 3’-hidroxilo libre y
otro 5’-fosfato libre en posiciones adyacentes (figura 4.13). Varias mellas seguidas dan lugar a
huecos o brechas en la cadena. Existe otra enzima, denominada DNA-ligasa, que puede unir
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los extremos de cadenas de DNA y que permite la reparación de mellas de las hebras sencillas
del DNA dúplex, la unión de los extremos de los dúplex lineales del DNA para formar círculos,
el enlace de segmentos de DNA durante la recombinación y la cooperación con las DNA-
polimerasas en la replicación de DNA. La integridad de la información contenida en el DNA está
protegida en gran parte por enzimas capaces de reparar con exactitud defectos en las hebras
de DNA, siempre que la otra hebra se encuentre intacta.
(mella)
(mella)
donde NTP representa a los ácidos 5’-trifosfóricos de los nucleósidos y (NMP)n es la cadena de
monofosfatos de nucleósidos del RNA. Para que la reacción tenga lugar el DNA y los cuatro
ribonucleósido-5-trifosfatos han de estar presentes simultáneamente. La prolongación del RNA
continúa a lo largo del DNA patrón hasta que se alcanza una señal de terminación en la
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cadena. Los dúplex híbridos RNA-DNA son mucho menos estables que los DNA-DNA y la nueva
cadena de RNA tiende a separarse del DNA.
Modificación de Corte y
bases empalme
El proceso por el cual se descifra la información contenida en una molécula de RNA, de forma
que se lleve a cabo la síntesis de cadenas polipeptídicas con la secuencia adecuada de
aminoácidos recibe el nombre de traducción. Tiene lugar en cuatro etapas principales, en cada
una de las cuáles se requieren enzimas y cofactores específicos:
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(a)
Brazo del
aminoácido
Brazo D
Brazo TC
Brazo del
anticodón
Estructura general
Posiciones de los aminoacil
de nucleótidos -tRNA
en los tRNA Posiciones
Estrcutura de nucleótidos
general en -los
de los aminoacil tRNA
tRNA
( tRNA Ala de levadura)
reconocidas por las aminoacil -tRNA reconocidas por las aminoacil- tRNA sintetasas
sintetasas
(b)
Figura 4.15. Estructura general de los aminoacil-tRNA. El brazo por donde tiene lugar la unión
con el aminoácido (brazo aceptor) posee una secuencia CCA, que es común para todos los
tRNA. representa a la seudouridina y T a la ribotimidina
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Factores de iniciación
Subunidad ribosómica
tRNA
Ribosoma funcional
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En la figura 4.18 se muestra un esquema del proceso completo de transcripción del DNA y
traducción del RNA.
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contener, por lo menos, otros dos lugares específicos, de reconocimiento de la enzima, por el
que el tRNA se una a la enzima activadora y el sitio o lugar de fijación al ribosoma.
Figura 4.19. Estructura secundaria general en hoja de trébol de los tRNA. representa a la
seudouridina, D a la dihidrouridina y T a la ribotimidina. El brazo TC (TFIC) interviene en el
reconocimiento del ribosoma. El brazo D o DHU interviene en el reconocimiento de las
aminoacil-tRNA sintetasas
Una vez terminada la construcción de un polipéptido por parte de un ribosoma, puede ser
necesaria alguna modificación (fosforilación, metilación, hidroxilación o unión de coenzimas o
de grupos prostéticos) para obtener la forma biológicamente activa. Además, determinadas
sustancias (antibióticos, cloranfenicol, cicloheximida y ciertos alcaloides, toxinas y proteínas)
son capaces de inhibir la síntesis de proteínas.
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Tres
codones de
terminación
Codón de inicio
La regulación de le expresión genética tiene por objeto que se sinteticen las clases de
proteínas correctas y en el número adecuado para el mantenimiento de las actividades
celulares. Además, constituye el vehículo de diferenciación entre las células.
El gen que porta el mensaje codificador de la secuencia aminoácida de una proteína específica
recibe el nombre de gen estructural. Además, hay genes reguladores que funcionan como
inhibidores y que determinan si un gen estructural será o no transcrito. El gen regulador
codifica la secuencia de aminoácidos de una proteína específica, denominada represora, que
difunde desde los ribosomas para unirse a una zona específica del DNA, próxima al gen
estructural de la enzima cuya síntesis controla, desde donde impide la transcripción de este
gen.
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No todas las mutaciones puntuales del DNA son necesariamente letales. Se dice que una
mutación es silenciosa cuando la proteína sintetizada, defectuosa, sigue siendo funcional. Una
mutación de este tipo puede ser relativamente benignas. Los rayos y X son mutágenos
especialmente poderosos, así como la radiación UV, que producen mutaciones que son una de
las causas de los cánceres de piel.
Aunque en una población bacteriana normal suele aparecer un mutante por cada 106 células,
la velocidad de mutación suele ser mayor ya que muchas mutaciones son letales y no se
detectan, mientras que otras implican cambios de bases que no modifican la lectura de
aminoácidos a partir del codón del mRNA. Esta baja velocidad de mutación no es deseable
cuando se está buscando la mejora de cepas. En estos casos pueden usarse agentes
mutágenos que permiten la producción de mutantes de una manera más fácil.
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utilizando antimetabolitos, que son tóxicos análogos al metabolito en cuestión. Las células
normales no crecerán en un medio que contenga el antimetabolito debido a que éste reprime
o inhibe la biosíntesis del metabolito necesario y, al mismo tiempo, no es capaz de servirle
como sustituto en las rutas metabólicas subsiguientes.
Al final de la década de 1970 se puso a punto una tecnología que hizo posible el desarrollo de
la ingeniería genética, a través de la cual las herramientas del DNA recombinante proporcionan
la posibilidad de introducir DNA completamente nuevo en células, para crear microorganismos
únicos que permiten la síntesis de determinadas proteínas a escala industrial.
Un clon es una copia idéntica. La clonación del DNA supone la separación de un gen específico
o de un fragmento de DNA de un cromosoma mucho mayor y su unión a una pequeña
molécula de DNA portador, para después replicar este DNA modificado miles o millones de
veces, como consecuencia tanto del aumento de la población celular como por la creación de
múltiples copias del DNA clonado en cada célula. El resultado es la amplificación selectiva de
un gen o un segmento de DNA particular. Los métodos que permiten llevar a cabo este
proceso se denominan colectivamente "tecnología del DNA recombinante" o, más
informalmente, "ingeniería genética".
4. Traslado del DNA del tubo de ensayo a una célula huésped. Este proceso recibe el nombre
de transformación.
5. Selección e identificación de las células huésped que contiene el DNA recombinante ya que
en la clonación del material genético de la célula donadora se generan multitud de
fragmentos, pero solo unos pocos son de interés para la transformación.
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Capacidad para acomodar DNA extranjero de varios tamaños sin dañar las funciones
de replicación
Facilidad de inserción en la célula huésped después de las manipulaciones in vitro del
DNA
Contener un marcador que facilite la selección rápida y positiva de las células que
contienen el vector
Contener un único sitio específico para una o más endonucleasas diferentes
Se utilizan dos tipos de vectores, plásmidos (moléculas de DNA que portan sólo unos pocos
genes) y bacteriófagos.
Una vez se ha seleccionado el clon deseado entre todos los clones transformados, se
identifican, se reproducen y se aíslan. A continuación, debe comprobarse que el DNA clonado
permite la expresión de la proteína recombinante, ya que puede ocurrir que la célula huésped
tenga mecanismos para impedirlo. Finalmente, una vez que se ha comprobado que el DNA
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El estudio del ciclo de vida en las células puede representarse como un mapa lineal o circular,
donde el punto en el que tiene lugar la división de la célula es la cota principal (punto D en la
figura 4.22). Las otras cotas son los puntos donde se inicia (punto A en la figura 4.22) y cesa la
síntesis del DNA. La edad o ciclo de edad de la célula, a, que varía entre cero, para las células
recién nacidas, hasta tD, que es el tiempo que se tarda en alcanzar la división celular, o lo que
es lo mismo, el tiempo de generación o de duplicación del organismo.
D
A
D A D
O tA tD
Figura 4.13. Eventos que tienen lugar entre el nacimiento de una nueva célula y la división
celular representados en forma circular (a) y de diagrama lineal (b). "D" indica división celular y
"A" indica punto de iniciación de la síntesis de DNA para esta célula hipotética
RESUMEN
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En este tema se describen de manera cualitativa los procesos a través de los cuáles tiene lugar
la transmisión de la información genética en las células: se establecen las diferencias entre los
RNA mensajero y de transferencia y se definen los conceptos de replicación, transcripción y
traducción. Se establecen las bases en que se fundamenta la biosíntesis de proteínas y la
expresión y regulación del código genético, que establece la secuencia de aminoácidos de los
polipéptidos. También se introduce al alumno en los conceptos fundamentales relacionados
con los mecanismos a través de los cuáles se producen alteraciones del DNA celular, en la
recombinación genética y en la tecnología del DNA recombinante. Finalmente, se define qué
se entiende por crecimiento celular y se establece el concepto de edad celular.
Bibliografía
Aiba, S., Humphrey, A.E., Millis, N.F., Biochemical Engineering, 2nd Ed., Academic Press, 1973.
Bailey, J.E., Ollis, D.F., Biochemical Engineering Fundamentals. Ed. McGraw-Hill, 1977 y Tata
McGraw-Hill Edition, 2010.
Gòdia Casablancas, F. y López Santín, J (Eds.), Ingeniería Bioquímica. Ed. Síntesis 1998.
Nelson, D.L. y Cox, M.M., Lehninger. Principios de Bioquímica, 5ª Edición, Ed. Omega, 2009.
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