UNIVERSIDAD DE ANTIOQUIA

Laboratorio de Bioestadística II

Nombre:Deisy Carolina Gomez Serna

Lab 1 – Prueba binomial

La asistencia al laboratorio es obligatoria y por lo tanto un requisito para presentar

este taller Recuerde plantear tanto sus hipótesis científicas como las estadística (Ho y
Ha) en cada caso. Las respuestas de los ejercicios deben incluir el estadístico de
prueba así como el Valor-P y el nivel de significancia que se va a usar. Además debe
incluir los comandos utilizados.

1. [1.0 puntos] con el fin de revelar evidencia de señales de evolución proteica

adaptativa. En linajes relacionados con sapos en cuanto a la toxicidad en un
sistema presa-depredador, se obtuvo que 22 de 29 sustituciones independientes de
aminoácidos ocurren en linajes asociados con sapos.

Hipótesis científica: El nivel de sustitución de los aminoácidos que causa

producción de compuestos tóxicos puede deberse a procesos como la selección
natural y el grado de depredación a la que están expuestas las especies.Este tipo de
presiones selectivas promueven el aumento de la toxicidad en los compuestos para
asegurar la supervivencia, es por ello que aquellos linajes que están más expuestos
a este tipo de presiones van a tener mas sustituciones de aminoácidos y como
consiguiente mayor producción de compuestos tóxicos.

H0: El nivel de toxicidad en los compuestos no está relacionado con la cantidad de

sustituciones de los aminoácidos (P=0.5)

Ha: El nivel de toxicidad en los compuestos está relacionado con la cantidad de

sustituciones de los aminoácidos (P≠0.5)

a. Basándose en la muestra, estime la proporción de sustituciones independientes de

aminoácidos que ocurren en linajes asociados con sapos.

Comandos:

Proporcion_aa=x/n

Proporcion_aa=22/29
 La proporción de sustituciones independientes de aa en los linajes seria de
0.7586207

b. Calcule el intervalo de confianza al 99%. Y haga una breve explicación

con los resultados.

Comandos:

binom.test(22,29,0.5,conf.level=0.99)

Observando la proporción de éxito encontrada anteriormente (0.7586) nos

damos cuenta que es mayor (0.5), esto quiere decir que hay más
probabilidad de sustitución que la esperada.Ahora, al obtener el valor P
(0.00813) con un intervalo de confianza al 99% (α=0.01), nos damos cuenta
que el valor p es menor que el alfa que hemos establecido, por lo tanto se
rechaza la hipótesis nula.Así pues, podemos concluir que la proporción de
las sustituciones de aminoácidos está relacionada con la toxicidad de los
compuestos, estos responden a la dinámica de predador-presa y a la
selección natural, no a la azarosidad.

2. [2 puntos] Alrededor del bosque Tulenapa de la Universidad de Antioquia hay dos

morfos de una mariposa, es posible distinguirlos por sus respectivos colores:
negro-rojo y azul rojo. Un estudio preliminar fue llevado a cabo y probó la
hipótesis de que la relación entre mariposas negro-rojo y azul-rojo es de
3:1respectivamente en la población. Un pequeño censo encontró 160 mariposas
negro-rojo y 15 azul-rojo. ¿Puede afirmarse que en este muestreo la relación 3:1 se
mantiene? De su respuesta teniendo en cuenta un alfa de 0.05 y luego uno de 0.01.
 ¿Cuál es el valor crítico para cada caso?

Hipótesis científica: Las mariposas negro-rojo se encuentran en mayor proporcion que

las azul-rojo al rededor del bosque de Tunelapa.

H0: La proporcion de mariposas negro-rojo y azul-rojo es 3:1 respectivamente

(P=0.75)

Ha: La proporcion de mariposas negro-rojo y azul-rojo es diferente a 3:1 (P≠0.75)

Para un alfa de 0.05 Comandos: binom.test(160,175,0.75,conf.level=0.95)

Observamos que la probabilidad de encontrar mariposas negro-rojo y azul-rojo es mayor

de 0.75 ya que encontramos que la probabilidad de que ocurra este suceso es de 0.91, lo
que quiere decir que la proporcion de mariposas no es 3:1.Teniendo en cuenta el valor P=
3.827e-08 y un alfa de 0.05 (intervalo del 95%) se puede observar que el valor p es menor
que el alfa que hemos establecido, es por esto que rechazamos la hipotesis nula.Esto quiere
decir que la proporcion de los morfos de mariposas es mayor que el esperado.Observado el
intervalo de confianza (0.8625688 a 0.9512316) vemos que es estrecho y nuestra
probabilidad se enuentra en el, esto nos indica que podemos confiar en estos resultados.

Para un alfa de 0.01 Comando: binom.test(160,175,0.75,conf.level=0.99)

Tenemos el mismo valor p (3.82) bajo un alfa de 0.01, la hipótesis nula se continúa
rechazando ya que difiere del nivel de significancia.Sin embargo el intervalo de
confianza es diferente, va de 0.8450892 a 0.9597799, podemos observar que es más
amplio que el anterior y por lo tanto menos veraz. Aun así se mantiene la premisa de
que la proporción de morfotipos de mariposas no es 3:1 (P=0.75) si no 0.91, es decir,
más alto de lo esperado.

Valor crítico: 0.95

binom.test(160,175,0.75,conf.level=0.95)
Valor crítico: 0.95
Intervalo confianza: 0.8625688 0.9512316
V_criticoL95=(0.8625688*175)
V_criticoF95=(0.9512316*175)
V_criticoL95
V_criticoF95

150.9495 para la cola de la derecha y 166.4655 para la cola de la izquierda

valor crítico:0.99

binom.test(160,175,0.75,conf.level=0.99)
Valor crítico 0.99
Intervalo confianza: 0.8450892 0.9597799
V_criticoL99=(0.8450892*175)
V_criticoF99=(0.9597799*175)
V_criticoL99
V_criticoF99

147.8906 para la cola de la derecha y 167.9615 para la cola de la izquierda

3. [1 punto] en la guía realizamos gráficos usando la función dbinom, ahora realice 4

plots con función pbinom (0:10,10, P̂)y le va a modificar la probabilidad de éxito en
cada ensayo (0.05,0.2,0.5 y 0.8). Pegue los gráficos e interpretarlos correctamente.

Comandos: par(mfcol=c(2,2))

plot(0:10,pbinom(0:10,10,0.05),type="l",ylab="Probabilidad",xlab="Éxitos",sub="P=0.05")

plot(0:10,pbinom(0:10,10,0.2),type="l",ylab="Probabilidad",xlab="Éxitos",sub="P=0.2)

plot(0:10,pbinom(0:10,10,0.5),type="l",ylab="Probabilidad",xlab="Éxitos",sub="P=0.5)

plot(0:10,pbinom(0:10,10,0.8),type="l",ylab="Probabilidad",xlab="Éxitos",sub="P=0.8)
En las gráficas podemos observar que la curva se eleva a medida que las probabilidad
de éxito disminuye, a su vez la curva decrece a medida que aumenta la probabilidad de
éxito.También se evidencia que cuando esto último ocurre la distribución de las
probabilidades se desplaza cada vez más a la derecha aumentando asi la probabilidad
de exito.

4. [ 1.0 Punto] Se conoce que la concentración de Nitrógeno es un inhibidor de la

productividad en plantaciones de una especie cualquiera de planta. Se realiza un
experimento con un tipo de fertilizante orgánico para regular las concentraciones de
nitrógeno en una plantación. Se encontró una efectividad del fertilizante en los primeros
experimentos del 83%. Suponga que se tienen 20 parcelas del mismo tamaño y bajo las
mismas condiciones. Indique

Hipótesis científica: El fertilizante orgánico ayuda a controlar las concentraciones de

nitrógeno en las plantaciones al impedir la absorción desmedida del mismo y por
consiguiente ayudará a obtener una producción óptima en la plantación.

Ho: Las concentraciones de nitrógeno serán las mismas luego de aplicar el fertilizante
orgánico, por lo que las plantaciones no tendrán una producción óptima (P=0.5)

Ha:Las concentraciones de nitrógeno serán diferentes luego de aplicar el fertilizante

orgánico,por lo que las plantaciones tendrán una producción óptima (P≠0.5)

a) ¿Cuál es la probabilidad de que exactamente 3 parcelas no pierdan su cosecha?

Expréselo en porcentaje.

3 exitos

Comandos:

dbinom(3,20,0.83)
dbinom
La probabilidad de que 3 parcelas no pierdan su cosecha es de 5.39226e-11%

b) ¿Cuál es la probabilidad de que exactamente 3 parcelas pierdan su cosecha?

Expréselo en porcentaje.

20-3=17 exitos

Comandos

dbinom(17,20,0.83)
dbinom

La probabilidad de que 3 parcelas pierdan su cosecha es de 23.58192%