Biotecnología industrial

Enzimas, descubrimiento de enzimas e ingeniería

¿Cómo descubrimos las enzimas paras aplicaciones en biotecnología?
Dado a que las enzimas son catalizadores, que desarrollan reacciones químicas, estas son buenas
candidatas para romper o sintetizar químicos de acuerdo a lo que se requiera. Desde una perspectiva
biotecnológica, los ejemplos deben incluir la modificación de compuestos tóxicos, dañinos, e
incluso explosivos, que contaminan el medio ambiente, así como la remoción o introducción de
ciertos químicos en el cuerpo como parte de una intervención médica.
Las enzimas también pueden utilizarse como biocatalizadores para reemplazar o complementar
procesos existentes en la industria química que generaría menores impactos ambientales. En ese
sentido, estas pueden ser usadas para construir químicos y moléculas de drogas valiosas desde
materias primas más baratas.
Asimismo, hay un gran interés en intentar seleccionar la enzima correcta para una aplicación
particular. Una enzima candidata es usualmente requerida para ser, no sólo especifica en la reacción
deseada, sino también fácil de manipular. La enzima necesita funcionar bajo las condiciones
adecuadas por un período de tiempo razonable, y también en una escala de tiempo factible.
Identificar una enzima que cumpla con todos los requerimientos puede ser un reto.
Esto se debe al largo número de enzimas que existen en la naturaleza. Mientras que muchas de estas
enzimas tienen propiedades similares, no siempre es fácil identificarlas o acertar cual funcionaría
mejor para dicha aplicación particular. Sin embargo, podemos ver algunas pistas de que función una
enzima puede desempeñar en la naturaleza buscando la secuencia de aminoácidos que la componen.
Las proteínas con secuencias suficientemente similares pueden ser asumidas como provenientes de
un ancestro común. Estas proteínas son conocidas como homologas entre ellas. De forma similar
que ocurre con las palabras que con un origen común cambiaron a través de la historia cuando se
aislaron en idiomas separados pero relacionados, también los genes divergen en su secuencia
durante el tiempo evolutivo cuando se separan en diferentes organismos.
No obstante, con las secuencias de proteínas es generalmente un poco más complicado que con los
idiomas, debido a que la longitud de las secuencias y la vasta cantidad de tiempo evolutivo entre los
eventos de divergencia. Los eventos de divergencia son puntos en los que dos genes empiezan a
separarse en organismos diferentes. Pese a ello, el principio puede ser utilizado para identificar
enzimas parecidas para presentar funciones similares, basados en la similitud de las secuencias.
Al identificar patrones de secuencia que son esenciales en la función de la enzima, es posible, al
menos en la teoría, buscar en una secuencia y decir que hace probablemente. Estos patrones de
secuencia son improbables que cambien en el tiempo evolutivo si estos son necesarios o esenciales
para que la enzima sea viable. Y estos serán conservados frecuentemente a través de las diferentes
secuencias de diferentes organismos.