CLASE 2

Environmental Microbiology PROBLEMAS DE INOCUIDAD ALIMENTARIA

 Clostridium botulinum: genera entdoesporas, toxinas
 Microbiología de suelos: bioremedacion
bacterianas, difícil de eliminar. A través de la comida.
usa componentes orgánicos e inorgánicos
 Salmonella enterica: infección por salmonela
de suelo que potencialmente pueden ser
inactivados, convertidos en otros
compuestos menos tóxicos por VIRUS QUE GENERAN PROBLEMAS
microorganismos del suelo. GATROINTESTINALES
 Aeromicrobiologia: transmisión de
enfermedades a través del aire, este es un
fluido que transporta largas distancias
compuestos como las esporas de los
hongos, endoesporas de bacterias.
 Microbiología acuática: calidad de agua,
presencia de microorganismos pueden ser
indicadores de contaminación de agua. Las
bacterias indicadoras son :
ENTEROBACTERIAS(bacterias del
sistema gastrointestinal)
 Microbiología industrial y biotecnología:
producción de compuestos biológicos y
microbiológicos.
 Seguridad inocuidad alimentaria:
garantizarían que los alimentos sean
saludables, sin carga patógena.
 Microbiología diagnostica: Salud.

Microbbial influences on our daily lives

 E.coli / salmonella

Actividad: tratamiento de aguas municipales

Matrix ambiental: aguas residuales

 Actividades:
Actividades:
interiores
Respiración
Impacto:
Impacto: neumonía
problemas
respiratorios

BIOREMEDACION
Resistente a
antibióticos, se Existen 2 especies:
encuentran en los Aeroginosa y cutida se
hospitales encargan de la
bioremediacion de suelo
por hidrocarburos

Hongos que están en el suelo y se unen a la raíz, hacen una red para que el
hongo le de nutrientes (fosfatos ) a la planta, y en retribución la planta le
proporciona aminoácidos orgánicos, azucares simples para que el hongo siga
viviendo. Relación de simbiosis

Protozoos que causan

problemas
Virus que causa gastrointestinales se
problemas convierte un problema
respiratorios, cuando está en contacto
gastrointestinales con el agua

Proteínas que alteran Protozoo que se

su conformación y encuentra el agua el cual
generan problemas causa enfermedades en el
en humas y vacas, cerebro fatales a través
sin ADN , se logra de los cuerpos de agua y
reproducir agua bebible
Lo nuevo de técnicas y métodos en la detección de
microorganismos:
Secuenciamiento de ADN de alto rendimiento: Aplicación
de técnicas genómicas, enzimáticas para que porciones de la
.
información del Adn de la bacteria sea amplificada y
detectada a través de matrices o algún software.
1. Biosensores: se puede tomar un pedazo de un gen de
una bacteria para que detecte la presencia de algún
elemento a escalas mayores.
2. Omicas: una serie de procedimientos en 4 estapas:
 Genomicas: estudio del ADN
 Trsncriptomicas: Estudio del ARN, transcricion se
genera una proteína
 Proteomicas: de una proteína se producen
metabolitos que se emplean para las industrias.
 Metabolomica: metalitos. Lo más actual.
3. PCR cuantitativa: reacción en cadena de la
polimerasa cuantitativa: Se realiza adiciones del ARN
mensajero+ ADN polimeraza+Buffers + primers (Usados
para el secuenciamiento) para obtener información de un
microorganismos.
Sensores de aptameros : detección de cierto tipo de
microorganismos. Un inmunocleotido o proteína tiene afinidad
con la bacteria. Receptor se comunica con la protina viral.
Entran en contacto con un virus viable. Este virus activo entra
en contacto con el aptamero y da una señal en el equipo si
existe (b) presencia o no (c).
Seguimiento de fuente microbiana: determinación de
patógenos. La muestra de agua contaminada de fuentes
humanas o animales se le extrae el ADN con PCR cuantitativo
y marcadores asociados dando como resultado el origen de la
contaminación.
Evaluación cuantitativa de riesgo microbiológico: industrial
alimenticia. Evaluación de microorganismos en los alimentos
Superficies auto desinfectante: la superficie evita que el
microorganismo quede en la superficie que tenga contacto con
las personas.
Comunidades microbiana sintéticas: crean comunidades
microbianas que no existen en la naturaleza que cumplan un
fin.
 Catálisis
 Síntesis
 Remediación

DOMINIOS DE VIDA

Y CARACTERÍSTICAS

1970: Análisis del ARN

ribosómico (su función

es síntesis de proteínas)

4. Sensores en tiempo real: a partir de muestras Reinos:

bacterianas + proceso correspondiente, esto se inyecta en
una matrix, la cual tiene un biosensor que emite un señal  Bacteria
en presencia y ausencia de la bacteria estudiada.  Archaea
 Eucaria
Procariotas-- ARN ribosomal 16 s

El 16s permite que exista una clasificación enorme de

microorganismos.

Componentes bacterianos: el cromososna generalmente es único,

sin núcleo suelto en el citoplasma. Siempre ribosoma presente.
Pared celular ayuda a clasificar a las gram positivas o gram
negativas. No todas la celular bacterianas tienen flagelo. La
mayoría vibran.

Citoplasma: En su estructura se encuentra el cromosoma de la

bacteria, los plasmidos (moléculas de ADN extracromosomal) no
todas las bacterias los tienen solo los que tienen la posibilidad de
reproducirse sexualmente, ribosomas (síntesis de proteínas)

Parsimonia biológica: indica que la bacteria no va a producir más

de lo que necesita.
 Diferencia de componentes: debajo
de la membrana se encuentra el
citosol con el and y los ribosomas

 Proteínas de membrana:
función de señalización , permite
el ingreso y salida de compuestos
del citosol al exterior o viceversa
 Lípidos: permiten la fluidez
de la membrana
 Membrana celular
 Espacio periplasmico:
espacio entre la pared celular y la
mebrana plasmática, sirve para el
intercambio de compuestos
 Peptidoglucano: capa
profunda en las gram +
 Porinas: proteínas de
transporte
 LIpopolisacaridos:
Las gram negativas tienen la presencia de una membrana externa señalización y contacto.
mientras las + no.

Especialistas vs generalistas de bacterias en la Generalista

naturaleza:
Gram – muy versátil quimiheterotrofo,
Generalista: capacidad de adaptarse a ciertas ubicada en todos lados
condiciones ambientales

Especialista: limitados, viven ambientes Especialista

complicados en condiciones particulares, más
especializadas
 Existen más genes en los generalistas
utilizadas para su adaptación
Gram – quimiautotrofa, especilizada en la
oxidación del amoniaco a nitrito (cumple una
funcionen el ciclo del nitrógeno)
 FLAGELOS: especie de apéndice. Permite la movilización
TIPOS DE PLASMIDOS
de la bacteria.
Compuesto adicional al genoma de la bacteria. No
fundamental pero si cumple una función.

 Plásmidos de número de copias

 Plásmidos de alto número de copias
 Plásmidos relajados
 Plásmidos estringentes
 Plásmidos conjugativos: permite a la bacteria cumplir
otra función, este por conjugación cede una copia
desde una positiva a una negativa. Transfiere
información adicional que no es de su propio
cromosoma sino un compuesto extra.
 Plásmidos no conjugativos : complicado que se
trasladen del donante al receptor.
 Plásmidos incompatibles: evitan que existan otros
CONUGACION BACTERIANA: pili
plásmidos en la célula.
La donante le transmite a la receptora el plásmido por
FUNCIONES
ejemplo, esta va a generar otro pili conjugando el plásmido a
 Plásmidos de resistencia: resistencia a antibióticos. la siguiente.
 Plásmidos que interactúan con plantas: estos inducen
a las plantas a tumores. Genera alteraciones celulares
a la planta.
 Plásmidos col : producción de colicina y evita la
producción de bacterias en el medio
 Plásmidos virulencia: hace que la enfermedad sea más
activa.

SUPERFICIE BACTERIANA: GLUCOCALIX tiene 2

formas

 Capa mucosas: capa que se pega lo que genera que

hallan bacterias que sean muy difíciles de eliminar
 Capsula: tiene otra capa que la convierte más
impermeable, más resistente a cualquier compuesto
que lo quiera atacar a la bacteria. Forma de
protección , es mucho más resistente
 Biofilms: usado en el campo industrial
TRANSFORMACION
Interacción entre bacterias de manera más pasiva.La célula
donante muere y libera su adn y sus fragmentos de adn y las
células receptoras toman ese adn
TRANSDUCCION

Interacción entre bacterias y virus. Fagos (no se reproduce

solo) introducen su material genético a una bacteria huésped,
entonces esta produce fragmentos del adn o arn viral, con
toda la maquinaria de ribosomas producir las partículas viral
y ponerlo al interior de la celular. Luego esta entra en lisis,
se revienta y salen las partículas virales al medio para infectar
a otras bacterias
MULTIPLICACION DE VIRUS ARQUEAS: HOW DO THEY SURVIVE??

Mecanismo de reconocimiento a través de receptores que
permiten el ingreso de la partícula viral o material genético, al
ingresar a la bacteria , el virus libera su información genetica
luego se produce el arn mensajero, después se produce
proteínas, estas van a convertirse en partes del virus, y este
virus se libera para atacar a otras bacterias.
INTERACCION
FAGO/HUESPED
Las archeas hipertermofilas pueden crecer en temperaturas
mayores a 80ºC.Por ejemplo Pyrococcus furious puede crecer
en temperaturas entre 73ºC a 100ºC esto se permite porque
tiene enzimas y material genético que se lo permite. Bacterias
anaeróbicas. Su hábitat puede ser en sedimentos marinos
calientes. Membranas con alta concentración de ácidos
grasos saturados, lo cual le proporciona estabilidad a la
membrana. El adn cromosomal de los hipertermifiicas
previene que se derritan a altas temperaturas.
HONGOS (EUCARIAS)

 Filamentosos
 Levaduriformes

CLASIFICACION METABOLICA DE BACTERIAS

 Metabolismo en función a presencia de oxigeno o no /

a la presencia de compuestos orgánicos o no
(Fermentación ). Su fuente de carbono son los
compuestos orgánicos.
 Quimiolitotrofico: Su fuente de carbono es el co2
 Autótrofos: hacen fotosíntesis. Su fuente de carbono es
el co2
 Fotoheterotrofos. Su fuente de carbono son
compuestos orgánicos.
HONGOS DE LA PUDRICION BLANCA Redes troficas pelágicas y flujo de carbono mediado por
virus.
Estos hongos tiene la capacidad para degradar tnt, pesticidas,
DDT, hidrocarburos poliaromaticos, bencenos, pigmentos
sintéticos, etc. Estos se pueden producir en los laboratorios
en condiciones indicadas.

PROTOZOOS

 Base de las redes tróficas de los sistemas acuáticos.

 Control poblacional
 Parásitos en humanos y vertebrados, contaminación
de alimentos, enfermedades causadas por el agua
 Degradación de materias orgánicas complejas como
la celulosa.
 Simbiosis con algunos animales como las termitas y
los rumiantes.

MICROALGAS

Eutrofización (exceso de nutrientes) en cuerpos de agua.

Principalmente exceso de nitrógeno, necesitan co2 +
nutrientes se produce los Bloom salgales. Las consecuencias
de estos es que se reduce el oxígeno disuelto, evita que los
organismos del agua puedan obtener el oxígeno. La red
trófica colapsa.

COMPRACION DEL TAMAÑO DE DIFERENTES VIRUS

CON RESPECTO A DISTINTAS CELULAS
BACTERIANAS

Roles de los fagos en microbiología ambiental

 Control de poblaciones de bacterias

 Control de patógenos de bacterias especificas
 Control de ciano bacterias marinas
 Interacción con procesos de redes tróficas
 Interacción en ciclos biogeoquímicos
 Favorece la diversidad procariota a través de la
transferencia horizontal de genes