Inicio: 8:08 Esta parte se muestra de un video-tutorial de la página en YouTube de

Descarga: https://www.slicer.org/ 3dSlicer, https://www.youtube.com/watch?v=GGgP89uTOLo&t=266s

Versión 4.10 Los ejercicios los estoy realizando con los DICOM ofrecidos por el mismo
Fin descarga: 8:14 programa. Luego lo realizaré con los DICOM que tenemos disponibles para
ver qué tan diferentes son a los del programa.
Fin instalación: 8:17
Tiempo estimado de instalación: 10 minutos
Características del computador:

(Slicer requires a minimum of 2 GB of RAM and a dedicated graphic

accelerator with 64 MB of on-board graphic memory.)

Inicio tutorial: 9:17

Training and tutorials
Unidad 1 y 2 (Para conocer el funcionamiento general del programa).
A pesar de que el tutorial es para versiones anteriores del software, la
interfaz no cambia, así el tutorial es totalmente válido para cualquier
versión.

Fin tutorial: 10:22

Tiempo estimado Tutorial introductorio: 1 hora
Inicio segmentación tutorial 10:23
Final 11:26

Tiempo estimado tutorial de segmentación ósea: 1 hora

Inicio 13:30

Después de varios intentos, para realizar la segmentación de una sola

vértebra es necesario hacerla manualmente, y solo es posible hacerla si en
la tomografía se distingue el hueso lo suficiente. Por lo general hay mucho
ruido. El problema se presenta cuando las vértebras se encuentran muy
unidas, ya que no es posible distinguir bien la separación entre estas y
posiblemente se introduce mucho error la separarlas (Es lo que verificaré
después).
Procedimiento:

Se carga el ejemplo, CTchest

Luego, en el buscador, digitamos crop volumen y aplicamos, tal como se

muestra automáticamente.

Una vez cargado, en la barra desplegable de herramientas, entramos a

Volumen Rendering, el cual permite programar el tipo de caso que estamos
estudiando para realizar una segmentación rápida, que para este caso es la
segunda opción CT-AAA2. Aparte, es necesario limitar el área de análisis
mediante el ROI (Region of interest), en este caso la vértebra, teniendo
cuidado en no recortar partes de interés. Para ellos es necesario ayudarse
de las vistas auxiliares.

Para diferenciar mejor las vértebras en las vistas auxiliares, en la barra de

herramientas, Volumes, en Display seleccionamos CT-abdomen, que es una
configuración automática para secciones de estudio.

De aquí en adelante, tal como se muestra en la parte final del video
https://www.youtube.com/watch?v=GGgP89uTOLo&t=266s , es necesario
realizar una segmentación manual muy tediosa y poco efectiva para el
proceso de separar una única vértebra, situación poco favorable para el
estudio que estoy realizando.
Fin. 3:30pm
Tiempo estimado segmentación: 2 hora
Segmentación General con DICOM diferente
(Estimación del tiempo necesario después de realizados los tutoriales)
Tiempo Estimado Segmentación: 1 hora
Según el video de YouTube sobre el tutorial de segmentación de la vértebra,
El DICOM ofrecido para análisis cardiaco muestra de mejor forma el sistema
óseo. Así que este tutorial lo realicé con este formato.
Para este caso, la selección es CTACardio (3ª opción). Se sigue el mismo
procedimiento anterior.
Una particularidad de esta opción de DICOM es que el ruido disminuye
bastante, además de que el espacio entre vértebras es más grande, así la
segmentación se da un poco más fácil, pero de igual manera, al ser manual,
es bastante tediosa, y necesité de más de un intento para que la pieza se
pareciera a una vértebra, ya que no conocía la forma de ésta.
Intenté realizar la segmentación manual para el tejido trabecular, pero
definitivamente no es así. Le mostré a un estudiante de medicina la
segmentación y me dijo que la vértebra en general si se parecía pero que la
pared de la vértebra suele ser mucho más delgada, es decir, el tejido
segmentado cortical estaba mal seleccionado, y pues ahí encuentro otro
problema, porque la segmentación es manual. Aunque en el programa
existe una herramienta semiautomática que intenta localizar el área para
segmentarla, pero no es capaz de distinguirlo siempre y es necesario realizar
constantes arreglos (El contraste entre tejidos no siempre es suficiente para El programa ofrece unas opciones de suavizado de la pieza para evitar el
que el programa los reconozca, por este motivo, la segmentación del liasing(Problemas superficiales debido a superficie tipo escalon o pixelada).
anterior DICOM fue más demorada). Queda pendiente revisar exactamente en qué situaciones se puede usar
cada una, ya que existen varios tipos.
INTENTO FALLIDO TEJIDO TRABECULAR.
Este lo intenté diferenciado las paredes de la vértebra mediante el contraste
que muestran los TACs, pero no es la mejor opción cuando no se tiene la
experiencia.