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Orthocoronavirinae

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Este artículo trata sobre la subfamilia de virus. Para la pandemia actual, véase Pandemia de
enfermedad por coronavirus de 2019-2020.

Para la nueva especie de coronavirus causante de la pandemia, véase SARS-CoV-2.

Symbol question.svg Orthocoronavirinae

Electron micrograph of two coronaviruses.jpg

Clasificación de los virus

Dominio: Acytota

Grupo: IV (Virus ARN monocatenario positivo)

Reino: Riboviria

Filo: incertae sedis

Clase: incertae sedis

Orden: Nidovirales

Suborden: Cornidovirineae

Familia:Coronaviridae

Subfamilia: Orthocoronavirinae

Géneros1

Alphacoronavirus

Betacoronavirus

Gammacoronavirus

Deltacoronavirus

Sinonimia

Coronavirus

Orthocoronavirinae, comúnmente conocidos como coronavirus, es una subfamilia de virus ARN


monocatenario positivos perteneciente a la familia Coronaviridae. Se subdivide en los géneros
Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus y Deltacoronavirus.23 Estos incluyen
genogrupos filogenéticamente similares de virus con una nucleocápside de simetría helicoidal con
envoltura cuyos viriones pueden medir entre aproximadamente 50 y 200 nm de diámetro. Su
material genético es el de mayor tamaño dentro de los virus de ARN, con genomas que van desde
los 26 a 32 kilonucleótidos.45 Se les llama coronavirus por la corona de puntas que se ve alrededor
de la superficie del virus.
Los coronavirus pueden infectar aves y mamíferos produciendo una serie de enfermedades
respiratorias y digestivas, muchas de ellas letales trayendo como consecuencia serios perjuicios en
la avicultura y la ganadería; también pueden infectar al ser humano causando enfermedades que
van desde el resfriado común hasta enfermedades más graves, como bronquitis, bronquiolitis,
neumonía, el síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS), síndrome respiratorio agudo grave
(SARS), entre otras. La mayoría de las personas se infectan con estos virus en algún momento de
su vida.2637

Hasta la fecha se han registrado treinta y nueve especies de coronavirus.1 Varias especies son de
reciente investigación7 debido a que varias cepas particulares no habían sido identificadas
previamente en humanos.8 Existe poca información sobre la transmisión, gravedad e impacto
clínico8 y no existen tratamientos aprobados hasta la fecha,7 sin embargo se pueden tratar varios
de los síntomas, las opciones terapéuticas dependen del estado clínico de cada paciente.7

El género Alphacoronavirus —anteriormente conocido como Coronavirus grupo 1 (CoV-1)—


incluye los subgrupos 1a y 1b, cuyos integrantes más representativos son el coronavirus humano
229E (HCoV-229E) y HCoV-NL63, así como la nueva especie alfacoronavirus 1 —incluyendo virus
de la gastroenteritis transmisible porcina (TGEV)—, respectivamente. El género Betacoronavirus —
anteriormente Betacoronavirus grupo 2 (Cov-2)— incluye varios subgrupos. Los más prominentes
(subgrupos 2a y 2b) tienen como especies tipo las especies de coronavirus murino —incluido el
virus de la hepatitis de ratón (MHV)– y el SARS-CoV, respectivamente. Los géneros
Alphacoronavirus y Betacoronavirus provienen del pool genético que tiene a murciélagos como
huésped. El género Gammacoronavirus incluye todos los coronavirus aviares identificados hasta el
año 2009.910

Índice

1 Historia natural

2 Estructura

3 Replicación

4 Humanos

4.1 Síndrome respiratorio agudo grave

4.2 Síndrome respiratorio de medio oriente

4.3 SARS-CoV-2

5 Veterinaria
5.1 Listado de los coronavirus de animales domésticos

6 Taxonomía

7 Véase también

8 Bibliografía

9 Referencias

10 Enlaces externos

Historia natural

El ancestro común más reciente del coronavirus se ha encontrado en el siglo IX a. C. Estudios


realizados durante 1990 lograron datar los ancestros comunes más recientes de los géneros:

Betacoronavirus: 3300 a. C.

Deltacoronavirus: 3000 a. C.

Gammacoronavirus: 2800 a. C.

Alphacoronavirus: 2400 a. C.

De acuerdo a estos estudios, en ese entonces el factor principal de la fuente del coronavirus era la
sangre caliente, particularmente de los murciélagos y pájaros. El coronavirus bovino se separó de
la especie equina coronavirus al final del siglo xviii. El coronavirus bovino y el coronavirus humano
OC43 se separaron en 1899. Otra estimación sugiere que el coronavirus humano OC43 divergió del
coronavirus bovino en 1890. El coronavirus bovino y el canino respiratorio con el coronavirus
divergieron de un ancestro común en 1951. El ancestro común más reciente del coronavirus
humano OC43 ha sido fechado en la década de 1950. El síndrome respiratorio coronavirus de
Oriente Medio, aunque relacionado con varias especies de murciélagos, parece haber divergido de
estos hace varios siglos. El coronavirus de murciélago está más estrechamente relacionado con el
coronavirus del SARS, del que se separó en 1986.1112131415161718192021

Estructura

Animación de un virión representativo de Orthocoronavirinae, la sección transversal indica los


componentes y proteínas que pueden ser parte de su estructura

Las partes que conforman la estructura general de los coronavirus son, como en todos los virus
animales, la envoltura y la nucleocápside. En el caso de los coronavirus, en la envoltura se
encuentra una glucoproteína de membrana (M) de 20 a 35 kDa, que forma una matriz en contacto
con la nucleocápside. Además se encuentra en la envoltura la glucoproteína S, de 180 a 220 kDa22
, que forma las espículas, espigas o peplómeros responsables de la adhesión a la célula huésped.
En el caso específico del coronavirus SARS, en sus espículas un dominio de unión para receptores
definidos dirigen la adherencia del virus a su receptor celular, la enzima convertidora de
angiotensina 2 (ACE-2).23 Algunos coronavirus (específicamente los miembros de Betacoronavirus
subgrupo A, también llamado subgénero Embecovirus24) tienen también en la superficie una
proteína adicional más corta llamada esterasa-hemaglutinina.25

Replicación

La replicación de los coronavirus comienza con la entrada en la célula, momento en que pierde su
envoltura, y el genoma de ARN se libera en el citoplasma. El genoma del coronavirus tiene un
caperuza metilada en el extremo 5' (extremo cap'), y una cola poliadenilada (poly A) en el extremo
3', dándole un gran parecido al ARN mensajero eucariota. Esto permite que al ARN se le adhieran
los ribosomas citoplasmáticos para su traducción. Los coronavirus tienen también una proteína
replicasa codificada en su código genético, que le permite generar nuevas copias de su ARN sin
necesidad de transcribirse a ADN, usando los recursos de la célula huésped. Esta replicasa es la
primera proteína que se sintetiza ya que una vez que el gen que codifica la replicasa es traducido
(síntesis proteica), el proceso se detiene por un codón de parada.26 Esto se conoce como una
transcripción anidada. Cuando el transcrito de ARNm solo codifica un gen, se conoce como
monocistrónico. El genoma de ARN se replica a cadena negativa y de ésta se forman copias
positivas de la que se traduce una larga poliproteína, que deberá ser escindida en las distintas
proteínas funcionales del virus. Los coronavirus tienen para ello una proteasa denominada Mpro o
3CLpro27 que corta la poliproteína para dar lugar a las proteínas víricas (maduración de la
poliproteína). Esta es una estrategia vírica para la economía genética, ya que le permite codificar
un buen número de proteínas con un número pequeño de transcritos a la vez que mejora la tasa
de fallos durante la ejecución de la ARN polimerasa.2826 Dicha proteasa es un objetivo de
fármacos para impedir la replicación del virus.29

Humanos

Los coronavirus humanos fueron descritos por primera vez en la década de 1960 en cavidades
nasales de pacientes con un resfriado común. Estos virus fueron nombrados posteriormente
coronavirus humano 229E y OC43. Otros dos miembros de esta familia han sido identificados, el
HCoV-NL63 en 2004 y HKU1 en 2005. Los cuales circulan globalmente en la población humana y
causan aproximadamente un tercio de los casos de resfriado común. Al igual que otros tipos de
virus pueden causar enfermedades más graves del sistema respiratorio como bronquilitis o
neumonía especialmente en personas con factores de riesgo, ancianos, niños y pacientes
inmunodeprimidos. Además de afecciones respiratorias también pueden causar enfermedades
intestinales y neurológicas.30

Existen registros de siete cepas de coronavirus relacionados con enfermedades respiratorias en


humanos (HCoV):
Coronavirus humano 229E

Coronavirus humano OC43

SARS-CoV

Coronavirus humano NL63

Coronavirus humano HKU1

Coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV).

SARS-CoV-2 (2019-nCoV).3132

Después de la publicación del perfil de los brotes de SARS en 2003, resucitó entre los virólogos un
interés por los coronavirus. Durante muchos años, los científicos sabían de solo dos coronavirus
humanos (HCoV-229E y OC43-HCoV). El descubrimiento de SARS-CoV añadió un tercer coronavirus
humano. A finales de 2004, tres laboratorios de investigación independientes informaron del
descubrimiento de un cuarto coronavirus humano, nombrado NL63, NL, y coronavirus de New
Haven simultáneamente por varios grupos de investigación. Los tres laboratorios siguen
discutiendo sobre cuál de ellos descubrió el virus en primer lugar y por tanto tiene derecho a
nombrarlo. A principios de 2005, un equipo de investigación de la Universidad de Hong Kong
informó del hallazgo de un quinto coronavirus humano en dos pacientes con neumonía. Lo
llamaron coronavirus humano HKU1. El brote de neumonía 2019-20 en Wuhan, China, llevó al
hallazgo de un coronavirus nuevo, catalogado como 2019-nCoV por la OMS.33343132

Síndrome respiratorio agudo grave

Artículo principal: Síndrome respiratorio agudo grave

En 2003, tras el brote del SARS (síndrome respiratorio agudo grave), que había comenzado en el
año 2002 en Asia, y luego en otras partes del mundo, la Organización Mundial de la Salud (OMS)
emitió un comunicado de prensa indicando que un coronavirus de nueva identificación por parte
una serie de laboratorios era el agente causante del SARS. El virus fue nombrado oficialmente
como coronavirus del SARS (SARS-CoV). Más de 8.000 personas resultaron infectadas, alrededor
del 10% de los cuales murieron.35

Síndrome respiratorio de medio oriente

Artículo principal: Coronavirus del síndrome respiratorio de Oriente Medio

En septiembre de 2012, se identificó un nuevo tipo de coronavirus, llamado inicialmente


coronavirus nuevo 2012, y ahora con el nombre oficial coronavirus del síndrome respiratorio de
Oriente Medio (MERS-CoV). La Organización Mundial de la Salud emitió una alerta mundial poco
después. La actualización de la OMS el 28 de septiembre 2012 declaró que no parecía que el virus
se transmitiese fácilmente de persona a persona. Sin embargo, el 12 de mayo de 2013, un caso de
transmisión de humano a humano en Francia fue confirmado por el Ministerio de Asuntos Sociales
y de Salud de Francia. Además, los casos de transmisión de humano a humano han sido
reportados por el Ministerio de Salud de Túnez. Dos casos confirmados parecen haber contraído la
enfermedad de su difunto padre, quienes se enfermaron después de una visita a Qatar y Arabia
Saudita. A pesar de esto, parece que el virus tiene problemas para la difusión de humano a
humano, ya que la mayoría de las personas que están infectadas no transmiten el virus.36373839
4041

Para el 30 de octubre de 2013, había en Arabia Saudita 124 casos y 52 muertes. Después de que el
Centro Médico Erasmus holandés secuenció el virus, le dio un nombre nuevo, coronavirus
humano-Centro Médico Erasmus (HCoV-CEM). El nombre final para el virus es coronavirus del
síndrome respiratorio de Oriente Medio (MERS-CoV). En mayo de 2014 se registraron los dos
únicos casos de infección con MERS-CoV en los Estados Unidos, ocurrieron en trabajadores de la
salud que trabajaron en Arabia Saudita y luego se desplazaron a Estados Unidos. Ambos individuos
fueron hospitalizados temporalmente y luego dados de alta. En mayo de 2015, un brote de MERS-
CoV se produjo en Corea del Sur, cuando un hombre que había viajado a Oriente Medio, visitó 4
hospitales diferentes en el área de Seúl para tratar su enfermedad. Esto provocó uno de los
mayores brotes de MERS-CoV fuera del Medio Oriente. En diciembre de 2019, 2.468 casos de
infección MERS-CoV habían sido confirmados por medio de pruebas de laboratorio, casos de los
cuales 851 fueron mortales, una tasa de mortalidad de aproximadamente el 34,5%.42434445

SARS-CoV-2

Esta sección es un extracto de SARS-CoV-2

Micrografía electrónica de transmisión de viriones de SARS-CoV-2 aislados desde un paciente y


mejorado el color

El coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave (SARS-CoV-2)46 es un tipo de coronavirus


causante de la enfermedad por coronavirus (COVID-19).474849 Fue inicialmente llamado 2019-
nCoV (en inglés 2019-novel coronavirus). Fue descubierto y aislado por primera vez en Wuhan,
China, tras provocar la pandemia de enfermedad por coronavirus de 2019-2020. Parece tener un
origen zoonótico, es decir, que pasó de un huésped animal a uno humano.50

El genoma del virus está formado por una sola cadena de ARN, y se clasifica como un virus ARN
monocatenario positivo. Su secuencia genética se ha aislado a partir de una muestra obtenida de
un paciente afectado por neumonía en la ciudad china de Wuhan.5152535455 Fue detectado por
primera vez en diciembre de 2019. No se conoce el mecanismo exacto de transmisión, pero se
cree que puede producirse el contagio de una persona a otra mediante las gotas de saliva
expulsadas a través de la tos y el estornudo o al espirar.56 Puede provocar enfermedad
respiratoria aguda y neumonía grave en humanos.
Actualmente, no hay ningún tratamiento específico aprobado oficialmente, pero es posible que se
puedan utilizar los antivirales existentes.57

Veterinaria

Los coronavirus han sido reconocidos como causantes de condiciones patológicas en veterinaria
desde principios de 1970. A excepción de la bronquitis infecciosa aviar, las principales
enfermedades relacionadas tienen principalmente una ubicación intestinal.

Los coronavirus infectan principalmente el tracto respiratorio y gastrointestinal superior de


mamíferos y aves. Actualmente se conocen siete cepas del coronavirus que infectan a los
humanos. Se cree que los coronavirus causan un porcentaje significativo de todos los resfriados
comunes en personas adultas y niños. Los coronavirus causan resfriados con síntomas
importantes; por ejemplo, fiebre, inflamación de las adenoides de la garganta, en los seres
humanos principalmente en las temporadas de invierno y primavera temprana. Los coronavirus
puede causar neumonía, ya sea neumonía viral directa o una neumonía bacteriana secundaria, y la
bronquitis, ya sea bronquitis viral directa o una bronquitis bacteriana secundaria. El coronavirus
humano más conocido fue descubierto en 2003, SARS-CoV que causa el síndrome respiratorio
agudo grave (SARS), tiene una patogénesis única porque causa que infecciones de las vías
respiratorias tanto superior como inferior. La importancia económica y el impacto de los
coronavirus como agentes causantes del resfriado común son difíciles de evaluar debido a que, a
diferencia de los rinovirus (otro virus del resfriado común), los coronavirus humanos son difíciles
de cultivar en el laboratorio.5859

Los coronavirus también causan una serie de enfermedades en los animales de granja y mascotas
domesticadas, algunos de los cuales pueden ser graves y son una amenaza para la industria
agrícola. En los pollos, el virus de la bronquitis infecciosa (IBV), es un coronavirus que afecta no
solo las vías respiratorias, sino también el tracto urogenital. El virus puede propagarse a los
diferentes órganos del cuerpo de la gallina. Los que tienen consecuencias económicamente
significativas en los animales de granja incluyen el coronavirus porcino (coronavirus de la
gastroenteritis transmisible, TGE) y el coronavirus bovino, el cual causa diarrea en los animales
jóvenes. Coronavirus felino: existen dos formas, el coronavirus entérico felino es un patógeno de
importancia clínica menor, pero la mutación espontánea de este virus puede provocar una
peritonitis infecciosa felina (FIP), una enfermedad asociada con una alta mortalidad. Del mismo
modo, hay dos tipos de coronavirus que infectan a los hurones: el coronavirus entérico de hurón
causa un síndrome gastrointestinal conocido como epizoótica catarral enteritis (ECE), y una
versión sistémica más letal del virus (como FIP en los gatos), conocido en hurones como
coronavirus sistémico de hurón (FSC). Hay dos tipos de coronavirus canino (CoVC), uno que causa
la enfermedad gastrointestinal leve y uno que causa enfermedad respiratoria. El virus de la
hepatitis del ratón (MHV) es un coronavirus que causa una enfermedad epidémica murina con una
mortalidad alta, especialmente entre las colonias de ratones de laboratorio.606162El virus de la
sialodacrioadenitis (sialo saliva, dacrio lágrima) es un coronavirus altamente infeccioso de ratas de
laboratorio, que puede transmitirse entre individuos por contacto directo o indirectamente por las
secreciones en aerosol. Las infecciones agudas tienen una alta morbilidad y tropismo para las
glándulas salivales, lacrimales y harderiana.63

Uno relacionado con el coronavirus murciélago Rinolophus HKU2 llamado coronavirus del
síndrome de diarrea aguda porcina (SADS-CoV) (del inglés swine acute diarrhea syndrome) causa
diarrea en cerdos.64

Antes del descubrimiento de SARS-CoV, MHV había sido estudiado tanto in vivo como in vitro, así
como a nivel molecular. Algunas cepas de MHV causaron una encefalitis desmielinizante
progresiva en ratones a los que se ha utilizado como modelo murino para la esclerosis múltiple.
Importantes esfuerzos de investigación se han centrado en dilucidar la patogénesis viral de estos
coronavirus de animales, especialmente por los virólogos interesados en las enfermedades
zoonóticas y veterinarios.65

Ciclo de infección del Coronavirus66

Listado de los coronavirus de animales domésticos

Virus de la bronquitis infecciosa (IBV) causas infecciosa aviar bronquitis.

Porcino coronavirus (transmisible gastroenteritis coronavirus de cerdos, TGEV).

Coronavirus bovino (BCV), responsable de la profusa enteritis grave en los terneros jóvenes.

Coronavirus felino (FCoV) provoca enteritis leve en los gatos, así como graves peritonitis infecciosa
felina (otras variantes del mismo virus).

Los dos tipos de canino coronavirus (CoVC) (una enteritis causando, la otra que se encuentra en las
enfermedades respiratorias).

Coronavirus aviar provoca enteritis en aves.

Ferret entérica coronavirus provoca enteritis catarral epizoótica en hurones.

Ferret sistémica coronavirus causa FIP-como el síndrome sistémico en hurones.

Pantrópicas coronavirus canino.

Coronavirus canino

Otra enfermedad veterinaria nueva, virus de la diarrea epidémica porcina (PED o PEDV), ha
surgido en todo el mundo. Su importancia económica es aún poco clara, pero muestra una alta
mortalidad en los lechones.676869
Taxonomía

Los géneros, subgéneros y especies incluidas en Orthocoronavirinae son:70

Alphacoronavirus

Colacovirus

Coronavirus de murciélago CDPHE15

Decacovirus

Coronavirus de murciélago HKU10

Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013

Duvinacovirus

Coronavirus humano 229E

Luchacovirus

Coronavirus de rata Lucheng Rn

Minacovirus

Hurón coronavirus

Mink coronavirus 1

Minunacovirus

Miniopterus murciélago coronavirus 1

Miniopterus murciélago coronavirus HKU8

Myotacovirus

Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011

Nyctacovirus

Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013

Pedacovirus

Virus de la diarrea epidémica porcina

Scotvilus murciélago coronavirus 512

Rinacovirus

Coronavirus murciélago Rhinolophus HKU2


Setracovirus

Coronavirus humano NL63

Cepa de coronavirus de murciélago relacionada con NL63 BtKYNL63-9b

Tegacovirus

Alphacoronavirus 1 - especie tipo

Betacoronavirus

Embevirus

Betacoronavirus 1

Coronavirus humano OC43 (miembro sin rango o subespecie)7130

Coronavirus Rattus de China HKU24

Coronavirus humano HKU1

Coronavirus murino - especie tipo

Hibecovirus

Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013

Merbecovirus

Erizo coronavirus 1

Coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio de Oriente Medio

Coronavirus murciélago Pipistrellus HKU5

Coronavirus murciélago Tyronycteris HKU4

Nobecovirus

Rousettus murciélago coronavirus GCCDC1

Coronavirus murciélago Rousettus HKU9

Sarbecovirus

Coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio agudo grave

Coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave (variedad o subespecie)72

Deltacoronavirus

Andecovirus

Coronavirus Wigeon HKU20

Buldecovirus
Bulbul coronavirus HKU11 - especie tipo

Coronavirus HKU15

Coronavirus Munia HKU13

Coronavirus de ojo blanco HKU16

Herdecovirus

Coronavirus de garza nocturna HKU19

Moordecovirus

Coronavirus de la polla de agua común HKU21

Gammacoronavirus

Cegacovirus

Coronavirus de ballena Beluga SW1

Igacovirus

Coronavirus aviar - especie tipo

Véase también

Virus ARN

Coronavirus humano OC43

Bibliografía

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