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Escuela Tecnología Medica

Facultad de Medicina
Universidad de Chile

Morfometría Geométrica

Curso Fotografía Médica


Prof. Alejandra García
Prof. Karina Palma
Morfometría Geométrica (MG)
Métodos relacionados con la descripción y análisis de objetos
geométricos basado en las relaciones angulares entre estructuras
homólogas más que en las distancias lineales entre ellos.

Muchos estudios de historia natural son principalmente morfológicos.


Permite cuantificar y medir el tamaño de un tumor en una determinada
zona del organismo.
En morfometría, un punto de referencia (landmark o hitos) marca
la forma de un objeto.

Existen tres tipos principales:

1. Un landmark anatómico es un punto de referencia


biológicamente significativo en un organismo.

2. Los landmarks matemáticos son puntos en una forma


situados de acuerdo a alguna propiedad matemática o
geométrica.

3. Los pseudo-landmarks se encuentran entre los landmarks


anatómicos y los matemáticos.
Esta metodología es una
herramienta robusta que permite
cuantificar la "forma pura" de
cualquier objeto geométrico,
descontando los efectos del
tamaño, rotación y traslación.
Los datos deben ser suficientes
para reconstruir gráficamente
las estructuras.
Tradicionalmente las variables usadas en morfometría
convencional son distancias lineales entre hitos.
Sin embargo, tales medidas usualmente dan información
incompleta de la forma de la estructura.
Mediciones de Distancia Lineal

Cuantifica la distancia lineal entre puntos anatómicos o


estructuras (e.g., longitud de la aleta pectoral)
• Son mediciones intuitivas
• El tamaño es un factor que confunde
• La homología es difícil de evaluar
• No sirve para reconstruir imágenes gráficas desde los
datos.
Morfometría Geométrica

Los métodos preservan información acerca de las


ubicaciones espaciales relativas de los datos, lo cual
permite visualizar diferencias individuales y grupales.
El tamaño de los objetos se estima de las distancias entre
hitos. Este valor representa el tamaño geométrico de un
objeto, el cual no se correlaciona con errores de medición
de los hitos.
Tipos de Análisis
Contornos
Hitos

• Adquisición de imágenes
• Procesamiento de imágenes
• Landmarks (hitos)
• Curvas
• Detección de bordes
• Edición de datos
Análisis de Bordes
Cuantifican la periferia de un objeto usando coordenadas
(x,y) ó (x,y,z).

Definiciones generales
• Contornos abiertos: polinomiales, splines cúbicos,
curvas de Bezier
• Contornos cerrados simples: análisis de Fourier de
radios espaciados
• Contornos cerrados complejos: Análisis de Fourier
elíptico
Contornos abiertos: curvas que comienzan y terminan en puntos
distintos.
• Contornos cerrados: curvas que comienzan y terminan en el mismo
punto.

cerrado
abierto

Los métodos de contornos incluyen una variedad de estrategias


usadas para cuantificar la forma de líneas curvas.
La ubicación, orientación y tamaño deben ser ignorados.
Es difícil identificar homologías en contornos porque
cualquier cambio en la forma del objeto cambia la
estructura biológica.

Contornos similares pueden representar distintas formas


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1 4 1

2
3
2 3
Análisis de Hitos
• Tipo 1: En intersecciones de tejidos o puntos anatómicos discretos.
• Tipo 2: En puntos de máxima curvatura o puntas de estructuras.
• Tipo 3: Definidos por constructos matemáticos extrínsecos al objeto,
extremos de la estructura, o centro de estructuras
En general: Var Tipo 3 > Var Tipo 2 > Var Tipo 1
Forma
La forma de un objeto
puede ser interpretada
como una configuración
de hitos que no dependen
de la traslación, rotación,
ni tamaño del objeto
geométrico
• Esta definición es central
a la morfometría
geométrica
Es posible representar las diferencias como un vector que
liga los hitos.
Este vector puede apuntar en cualquier dirección y ser de
cualquier magnitud.
Superposición Procrustes
EJEMPLOS:
Parametrización de la curvatura κ(t):

κ(t) = 1/R(t)
¿Cómo realizo mediciones en una
fotografía Digital Simple?
Fotografía Digital:
Lo más simple es tomar una estructura de medida
conocida, Ej. Regla, Camara Neubauer.

Consideraciones:
• Distancia de la toma de la foto (Macro, Infinito).
• Zoom (Óptico, Digital).
Reticulado Cámara de Neubauer (1 mm2 tamaño real)
Para calibración y medición en microscopio directo y fotografía digital:

•Determinación de
Aumentos.
•Determinación de
campo visual.
1 mm
•Determinación de (1000 um)
áreas.
•Determinación de
perímetros.
•Etc.
200 um 50 um
Para un uso correcto de esta herramienta, debe fotografiarse tanto, el espécimen, como el reticulado de la
cámara de Neubauer, en las mismas condiciones, entre las que se deben considerar el aumento del objetivo,
del ocular y el zoom digital, entre otros. De esta manera, el incremento que se observe en el tamaño real del
reticulado corresponderá a las veces que se incrementó la estructura fotografiada.
Por ejemplo: Si el reticulado intermedio (200 um) en la pantalla de un computador mide 2 cm (o sea 20.000
um), fue aumentado 200 veces (200x).

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