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  • Taller 7

    Cargado por

    Claudia Alvarez Marroquin
    24 vistas1 página
    Este documento proporciona instrucciones para limpiar y ensamblar secuencias de ADN obtenidas de electroferogramas utilizando los programas Bioedit y CAP3. También recomienda explorar varios sitios web para análisis de secuencias. Las instrucciones incluyen limpiar las secuencias eliminando regiones erróneas, ensamblar las secuencias limpias utilizando CAP3 y comparar los resultados con Bioedit.

    Descripción original:

    111

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    de 1

    BIR92 – BIOINFORMÁTICA MOLECULAR

    Taller Nº7
    Ensamblaje y secuenciación

    Nombre y Apellidos Código

    ______________________________________ __________
    ______________________________________ __________

    Descargue los electroferogramas con el programa Bioedit-Geneus

    Limpieza de las secuencias.


    • Para cada uno de los cinco electroferogramas identifique las regiones erróneas y
    elimínelas de la secuencia. Indique en dónde encuentra los principales
    problemas en las secuencias analizadas.
    • Abrir un solo archivo en Bioedit e ir a la ventana de accesory aplication (oprimir
    CAP, CONTIG)
    • Guardar la secuencia consenso en formato TXT.
    • Abrir el siguiente link: http://doua.prabi.fr/software/cap3
    • Copie las secuencias reportadas por cada electroferograma
    • Ingrese las secuencias en el formato Fasta a la página Cap3
    • Haga CLICK en submit.
    • Realice el análisis de lo que obtuvo.
    • Compare la secuencia obtenida por bioedit con la reportada por el servidor
    Cap3.

    Explore los siguientes servidores:


    https://nucleobytes.com/4peaks/index.html
    http://technelysium.com.au/wp/chromas/
    http://genestudio.com/
    http://en.bio-soft.net/dna/BioLign.html.

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