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Tema 2: Enzimas
Bioquímica I
Universidad Nacional de Río Negro
Ingeniería en Biotecnología
Sede Alto Valle y Valle Medio
2019
Los detalles de la
conformación de una
proteína determinan sus
propiedades químicas
La comparación de la secuencia de las proteínas revela regiones
conservadas (motivos conservados) que son cruciales para la
actividad y/o interacción con diferentes ligandos
Las proteínas interaccionan con sus ligandos a través
de diferentes tipos de interfaces.
Enzimas
Enzimas
Conocemos como catalizador a
cualquier sustancia que acelera la
velocidad de una reacción, pero sin
participar químicamente en ella.
Por ejemplo, la descomposición del
peróxido de hidrógeno a agua y
oxígeno es extremadamente lenta,
pero la adición de ión férrico acelera Reacción del peróxido de hidrógeno con la sangre
la reacción, con la formación
observable de burbujas de oxígeno. ➢ La acción catalítica depende de la
integridad de su conformación
proteica nativa.
➢ Si su enzima se desnaturaliza o se
disocia en sus subunidades, la
Las reacciones de los sistemas actividad catalítica suele
biológicos suceden en tiempos desaparecer.
apreciables debido a que están ➢ Si se descompone una enzima en sus
catalizadas por agentes, en su gran aminoácidos constituyentes, siempre
mayoría de naturaleza proteica, se destruye su actividad catalítica.
llamados enzimas. Así las estructuras primaria,
secundaria, terciaria y cuaternaria
de las proteínas enzimáticas son
Las enzimas son los catalizadores esenciales para su actividad
de los sistemas biológicos. catalítica.
➢ No se degrada, ni se trasnforma.
Las enzimas son catalizadores biológicos
➢ Catalizan reacciones químicas necesarias para la sobrevivencia
celular.
➢ Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan lentos que las
células no podrían existir.
E + S→ ES→EP → E + P
E E E E
➢ Tanto la enzima como el catalizador aceleran la velocidad de una
reacción química.
E + S→ ES→EP → E + P
E E E E
Componentes de una Enzima
➢ Sitio Activo:
Sitio de la enzima al cual se unen el o
Sitio
los sustratos y ocurre la reacción. Activo
(tamaño,forma,union,interaccion,
especificidad).
Sitio
Alostérico
➢ Sitio Alostérico:
Sitio distinto al sitio activo, a este
se une una sustancia llamada
"regulador alostérico"
regulación de las enzimas por el que la unión de una molécula en
una ubicación (sitio alostérico) modifica las condiciones de unión
de otra molécula, en otra ubicación (sitio catalítico) de la enzima
distante de la primera
Características de los sitios activos
• Tridimensional, formado por AA de diferentes partes de
la secuencia polipeptídica.
ENZIMAS
➢ Conjugadas: contienen por lo menos
un grupo no proteico enlazado a la
cadena polipeptídica.
Componentes de una Enzima
➢ En las proteínas conjugadas podemos distinguir dos partes:
Molécula
Ión inorgánico
orgánica
Coenzima Grupo
(unión no covalente) Prostético
(enlace covalente)
Cofactores
Los cofactores pueden ser:
➢ Iones metálicos: Favorecen la actividad catalítica general de la enzima. Si no
están presentes, la enzima no actúa.
➢ Estos iones metálicos se denominan activadores. Ejemplos: Fe2+, Mg2+, Cu2+,
K+, Na+ y Zn2+
Iones Enzimas
Cu2+ Citocromo oxidasa
Fe2+ o
Citocromo oxidasa, catalasa, peroxidasa
Fe3+
K+ Piruvato quinasa
Hexoquinasa., glucosa 6-fosfatasa,
Mg2+
piruvato quinasa
Mn2+ Arginasa, ribonucleotido reductasa
Mo Dinitrogenasa
Ni2+ Ureasa
Se Gluta peroxidasa
Carbónico anhidrasa, carboxipeptidasas A
Zn2+
y B, alcohol deshidrogenasa.
Generalidades de enzimas. Componentes de una enzima
Coenzima
➢ FAD (flavín-adenín dinucleótido): transferencia de electrones y
protones.
➢ FMN (Flavín mononucleótido): transferencia de electrones y protones.
➢ NAD+
➢ Coenzima A
Algunas coenzimas que actúan como portadores transitorios de átomos o grupos
funcionales específicos
NAD: coenzimas en reacciones de óxido - reducción
Generalidades de enzimas. Componentes de una enzima
Coenzima
➢ Deshidrogenasa alcohólica
➢ Deshidrogenasa del glicerol
➢ Oxidasas de la glucosa
2-Transferasas
➢ Transaminasas
➢ Transacetilasas
3.
Hidrolasas
✓Esterasas
✓Fosfatasas
✓glicosidasas
4. Liasas
✓Descarboxilasas
✓Aldehído-ligasas
✓Cetoácido-ligasa
5. Isomerasas
✓Racemasas
✓epimerasas
✓Isomerasas cis-trans
✓Oxidoreductasas intramoleculares
✓Transferasas intramoleculares
6. Ligasas
✓AcetilCoA sintetasa
✓Enzimas activadoras de aminoácidos
Clasificación de las enzimas
Nomenclatura de Enzimas
• El sustrato preferentemente
• El tipo de reacción catalizada
• Terminación «asa»
ATP + D-glucosa ➔ ADP + D-glucosa 6-fosfato
glucosa fosfotransferasa
EC 2.7.1.2
Sustratos:
Clase:
D-glucosa
Transferasa
como aceptor
Subclase: del fosfato
Sub-subclase:
Fosfotransferasa Grupo hidroxilo
como aceptor
Modelos enzimáticos
Modelo de la "llave-cerradura"
2. Especificidad de
sustrato
3. Especificidad isomérica
Propiedades de las enzimas
• Orientando el S de la forma
adecuada para que reacciones
• Estabilizando cargas en un ET
inestable
• Facilitando reacciones de
oxidoreducción gracias al paso
reversible de su estado de
oxidación
• Cambiando la polaridad de
ciertos enlaces para hacerlos
más susceptibles a ciertos
reactivos.
Principios de catálisis enzimática
Reacción enzimática: Recordar: un catalizador
incrementa la velocidad de la
reacción
No modifican equilibrios de
reacción
G vs progreso de la reacción
Hay una barrera energética entre S y P que se debe superar y es la necesaria para el alineamiento
de los reactivos, los formación de cargas inestables
transitorias, los reordenamientos de enlaces
y otras transformaciones
En el pico máximo, es igualmente
probable que la reacción caiga para
S o P.
Consideraciones:
➢ Diferencia entre los niveles de energía del estado basal y el del estado de
transición se llama energía de activación
La enzima:
Aplicación:
- Mejor comprensión de las rutas metabólicas
- Diseño de tratamientos más adecuados
Vmax s
v=
Km + s
Cinética Michaelis-Menten
Inducen una nueva constante: Km (Constante de Michaelis)
K-1 + K2
Km=
K1
Ecuación de Michaelis-Menten:
Donde
Vmax s
v= Vmax= velocidad máxima
Representa la Ecuación de
Michaelis-Menten
Efecto de la concentración de
sustrato sobre la velocidad
inicial
de una reacción catalizada por
un enzima
➢ La velocidad inicial máxima de la
reacción catalizada (Kmax) se
observará cuando virtualmente todo el
enzima esté en forma de complejo ES
y la concentración de E sea
extremadamente pequeña.
1 KM 1 1
v0 V max S V max
Inhibición enzimática
Alostérica
Inhibición competitiva
Aumenta el Km,
disminuye Vmáx y
mantiene Km/Vmáx
Inhibición no competitiva
Mantiene el Km
disminuye Vmáx y
aumenta Km/Vmáx
Normalmente, un inhibidor mixto afecta tanto
a como a Km como a Vmax.
Tabla resumen del efecto de inhibición sobre
Km y Vmáx
1. Concentración de sustrato
2. Concentración de enzima
3. pH
4. Temperatura
5. Efectores (Activadores e
Inhibidores)
Factores que afectan la actividad enzimática
[E] Temperatura
pH
Reacciones multisustrato
Mecanismo secuencial
Mecanismo doble desplazamiento o ping pong