en deuda con el Dr. Jerry Donohue para el asesoramiento constante y crítica, especialmente en las distancias interatomicas. Tambien hemos sido estimulado por el conocimiento de la naturaleza general de los resultados experimentales publicados y las ideas del Dr. MHF Wilkins, el Dr. RE Franklin y sus companeros de trabajo en el Kings College, Londres. Uno de nosotros (JDW) ha sido ayudado por una beca de la Fundacion Nacional para la Paralisis Infantil.
referencias
1. Pauling, L., y Corey, RB,
Naturaleza, 171, 346 (1953); Proc. Nat Estados Unidos. Acad. Sci., 39, 84 (1953). 2. Furberg, S., Acta Chem. Scand., 6, 634 (1952). NATURALEZA descritos aquí (cf. Astbury) muestran Abril 25, 1953 que la configuración molecular básica Kings College, Londres. Uno de nosotros (J. D. W.) recibió ayuda de una beca de la Fundación Nacional para la Parálisis Infantil. J. D. WATSON F. H. C. CRICKConsejo de Investigación Médica para el Estudio de la Estructura Molecular de Sistemas Biológicos, Laboratorio Cavendish, Cambridge. Abril 2. Pauling, L., y Corey, R. B., Nature, 171, 346 (1953); Proc. EE.UU. nat. Acad Sci., Fig. 3. Diagrama de fibra del ácido nucleico de 39, 84 (1953). la desoxipentosa de B. coli. Eje de fibra Furberg. S ,. Acta Chem. Scand., 6, 634 vertical. tiene una gran simplicidad. El (1952). propósito de esta comunicación es Chargaff, E ,. para referencias sec describir, de manera preliminar, parte Zamenhof, S., Brawerman, G., y de la evidencia experimental de que la Chargaff, E., Biochim, et Biophys, Acta, configuración de la cadena del 9, 402 (1952). polinucleótido es helicoidal y existe en esta forma cuando se encuentra en Wyatt, G. R., J. Gen. Physiol, 36, 201 estado natural. Una versión más (1952). completa de la obra se publicará en Astbury, W. T., Symp. Soc. Exp. Biol. 1, breve. ácido nucleico. 66 (Camb. Univ. Press, La estructura del ácido nucleico de la 1947). desoxipentosa es la misma en todas Wilkins, M. H. F., y Randall, J. T., las especies (aunque las relaciones de Biochim. et biophys. Acta. 10, 192 base de nitrógeno se alteran (1953). considerablemente) en las nucleoproteínas, extraídas o en las células, y en el nucleado purificado. El ESTRUCTURA MOLECULAR DE LOS mismo grupo lineal de cadenas ÁCIDOS NUCLEICOS DE LA polinucleotídicas puede agruparse en DESOXIPENTOSA paralelo de diferentes maneras para dar material cristalino, semicristalino Si bien las propiedades biológicas del o paracristalino. En todos los casos, la ácido nucleico de la desoxipentosa fotografía de difracción de rayos X sugieren una estructura molecular consta de dos regiones, una que contiene gran complejidad, los determinada en gran parte por el estudios de difracción de rayos X espaciado regular de los nucleótidos a Se puede trazar una línea recta lo largo de la cadena, y la otra por la aproximadamente los máximos más separación más larga de la internos de cada función de Bessel y el configuración de la cadena. La origen. El ángulo que forma esta línea secuencia de diferentes bases de con el ecuador es aproximadamente nitrógeno a lo largo de la cadena no es igual al ángulo entre un elemento de la hecho visible. hélice y el eje de la hélice. Si una unidad se repite n veces a lo largo de El ácido nucleico paracristalino deoxipentosa orientado (estructura B en la siguiente comunicación de Franklin y Gosling) proporciona un diagrama de fibra como se muestra en la Fig. 1 (ver ref. 4). Astbury sugirió que el fuerte 3.4-A. La reflexión correspondió a la repetición del internucleótido a lo largo del eje de la fibra. Sin embargo, las líneas de la capa - 34 A. no se deben a la repetición de Fig. 2. Patrón de difracción del sistema de hélices una composición polinucleotídica, correspondiente a la estructura del ácido sino a la repetición de la configuración nucleico desoxipentosa. Los cuadrados de las de la cadena, que causa una fuerte funciones de Bessel se trazan alrededor de 0 en difracción, ya que las cadenas de el ecuador y en las líneas de la primera, segunda, nucleótidos tienen una densidad más tercera y quinta capa para la mitad de la masa de alta que el agua intersticial. La nucleótidos a 20 A. de diámetro y el resto ausencia de reflexiones en o cerca del distribuidos a lo largo de un radio, siendo meridiano sugiere inmediatamente proporcional la masa en un radio dado al radio. una estructura helicoidal con un eje Sobre C en la línea de la décima capa se paralelo a la longitud de la fibra. representan funciones similares para un diámetro exterior de 12 A. DIFRACCIÓN POR HELICES La hélice, habrá una reflexión Puede mostrarse (también en stokes, meridional (J02) en la línea de la capa no publicado) que la distribución de la n. La configuración helicoidal sobre el intensidad en el patrón de difracción origen alrededor del nuevo origen, en de una serie de puntos igualmente la línea de la capa c, correspondiente a espaciados a lo largo de una hélice está C en la Fig. 2. dada por los cuadrados de las funciones de Bessel. Una hélice Ahora analizaremos brevemente en continua uniforme proporciona una términos físicos algunos de los efectos serie de capas de líneas de espaciado de la forma y el tamaño de la unidad de correspondientes al paso de hélice, repetición o del nucleótido en el siendo la distribución de intensidad a patrón de difracción. Primero, si el lo largo de la línea de la capa nth nucleótido consiste en una unidad que proporcional al cuadrado de Jn, la tiene simetría circular alrededor de un función de Bessel de orden n. eje paralelo al eje helicoidal, todo el patrón de difracción se modifica por el factor de forma del nucleótido. INTERPRETACIÓN DE LA Segundo, si el nucleótido consiste en FOTOGRAFÍA DE RAYOS X una serie de puntos en un radio en Primero debe decidirse si la ángulos rectos con respecto al eje estructura consiste esencialmente en helicoidal, las fases de radiación una hélice que da una distribución de dispersadas por las hélices de intensidad a lo largo de las líneas de diferente diámetro que pasan por cada capa correspondientes a J1, J2, J3 ..., o punto son las mismas. La suma de las dos hélices coaxiales similares del funciones de Bessel correspondientes doble del tamaño anterior y refuerza el interior. relativamente desplazadas a lo largo La mayoría de los máximos y, en del eje una distancia igual a la mitad general, debido a la diferencia de fase, del paso que da J2, J4, J5 ..., o tres la cancelación de todos los demás hélices, etc. El examen del ancho de las máximos. Dicho sistema de hélice (que líneas de capa sugiere que las corresponde a una escalera de caracol intensidades se corresponden más con el núcleo retirado) difracta estrechamente con J1, J2, J3 que con J2, principalmente en un rango angular J4, J5 ... limitado, comportándose, de hecho, Por lo tanto, la hélice dominante tiene como una disposición periódica de un paso de - 34 A., y, desde el ángulo placas planas inclinadas en un ángulo de la hélice, su diámetro se encuentra fijo al eje. en - 20 A. La fuerte reflexión ecuatorial En tercer lugar, si el nucleótido se en - 17 A. sugiere que las hélices tienen extiende como un arco de un círculo un diámetro máximo de - 20 A. y se en un plano en ángulo recto al eje empaquetan hexagonalmente con helicoidal, y con el centro en el eje, se poca interpenetración. Además del modifica la intensidad del sistema de ancho de las rayas de la función de líneas de capa-línea de la función de Bessel, la posibilidad de que las hélices Bessel que emana del origen debido a tengan el doble de las dimensiones las diferencias de fase de la radiación anteriores es también improbable por de las hélices dibujadas a través de la ausencia de una reflexión ecuatorial cada punto en el nucleótido. El factor en -34 A. Para obtener un número de forma es el de la serie de puntos en razonable de nucleótidos por unidad que las hélices se intersecan con un de volumen en la fibra, dos o hay diez plano dibujado a través del eje nucleótidos en una vuelta de cada helicoidal. Esta parte del patrón de hélice. difracción se repite entonces como un La ausencia de reflexiones en o cerca diente con origen en C (Fig. 2). Por lo del meridiano (una región vacía AAA tanto, este aspecto de la forma del en la Fig. 2) es una consecuencia nucleótido afecta a las regiones directa de la estructura helicoidal. En central y periférica de cada línea de la fotografía también hay una región capa de manera diferente. relativamente vacía en y cerca del ecuador, correspondiente a la región BBB en la Fig. 2. Como se discutió anteriormente, esta líneas de capa undécima, duodécima y ausencia de la función secundaria de decimotercera que en la novena, Bessel puede producirse mediante octava y séptima. Por esta razón, las una distribución radial de la forma del reflexiones en las líneas de capa de nucleótido. Para hacer que las estrías orden superior serán menos visibles. de la línea de la capa sean lo El factor de forma del nucleótido suficientemente estrechas, es también es probable que cause una necesario colocar una gran fracción de disminución de la intensidad en esta la masa de nucleótidos en un diámetro región. La inclinación de las bases de de 20 A. En la Fig. 2, los cuadrados de nitrógeno podría tener tal efecto. las funciones de Bessel se representan Las reflexiones en el ecuador son para la mitad de la masa a 20 A. de bastante inadecuadas para la diámetro, y el resto se distribuye a lo determinación de la distribución largo de un radio, siendo la masa en un radial de la densidad en el sistema radio dado proporcional al radio. helicoidal. Sin embargo, hay En la línea de capa cero parece haber indicaciones de que una cubierta de un J10 marcado, y en las líneas de la alta densidad, como se sugirió primera, segunda y tercera capa, J9 + anteriormente, tiene un diámetro de - J11 + J8, etc., respectivamente. Esto 20 A. significa que, en la proyección en un Aparentemente, el material no es plano en regiones de densidad completamente paracristalino, ya que derecha espaciadas c. 6 A. aparte aparecen puntos afilados en la región alrededor de la circunferencia de a. central de la segunda línea de capa, lo Círculo de 20 A. de diámetro. En la que indica un grado parcial de orden línea de la quinta capa, dos funciones de las unidades helicoidales entre sí en J5 se superponen y producen una la dirección del eje helicoidal. Se han fuerte reflexión. En las líneas de la obtenido fotografías similares a la Fig. sexta, séptima y octava, los máximos 1 de sodio, esperma de arenque, tejido corresponden a una hélice de humano y bacteriófago T2. La diámetro - 12 A. Aparentemente, es correspondencia más marcada con la solo la región central de la estructura Fig. 2 se muestra en la fotografía de hélice la que está bien dividida por excepcional obtenida por nuestros la separación 3, 4 - A, las partes colegas, R. E. Franklin y R. G. Gosling, externas de El nucleótido se de nucleótido de desoxipentosa de superpone para formar una hélice timo de ternera (consulte la siguiente continua. Esto sugiere la presencia de comunicación). bases de nitrógeno dispuestas como una pila de monedas en las regiones Se debe enfatizar que parte de la centrales del sistema helicoidal. discusión anterior no es sin ambigüedad, pero en general parece Hay una marcada ausencia de existir un acuerdo razonable entre los reflexiones en las líneas de capa más datos experimentales y el tipo de allá del décimo. La desorientación en modelo descrito por Watson y Crick el espécimen causará más extensión a (ver también la comunicación lo largo de las líneas de capa de las anterior). rayas de la función de Bessel en las Es interesante observar que, si hay Esto confirma las ideas actuales de la diez grupos fosfato dispuesto en cada estructura del fago. hélice de diámetro 20A y paso 34A, la Principio transformador (en cadena principal del éster de fosfato se colaboración con H. encuentra en un estado casi Ephrussi.Thaylor). La nucleación de completamente extendido. Por lo desoxipentosa activa que se deja secar tanto, cuando las fibras nucleadas de a un 60% de humedad tiene la misma sodio se estiran, la hélice se extiende estructura cristalina que ciertas evidentemente en longitud como un muestras de timonucleato de sodio. resorte espiral en tensión. ESTRUCTURA EN VIVO Se ha observado el significado biológico de una unidad de ácido nucleico de dos cadenas (ver la comunicación anterior). La evidencia de que la estructura helicoidal discutida anteriormente, de hecho, existe en sistemas biológicos intactos es brevemente como sigue: Cabezas de esperma. Se puede mostrar que la intensidad de los espectros de rayos X de las cabezas de esperma cristalinas se determina por la función de forma helicoidal en la Fig. 2- El semen de trucha centrifugado da el mismo patrón que las cabezas de esperma secas y rehidratadas o lavadas utilizadas anteriormente. El diagrama de fibra de la cabeza del esperma también se administra mediante nucleoprotamina sistémica o extraída o nucleohistona extraída del timo de ternera. Bacteriófago. Los gránulos húmedos centrados en fagos T2 fotografiados con rayos X mientras estaban sellados en una celda con ventanas de mica brindan un patrón de difracción que contiene las características principales del nucleado de sodio paracristalino, a diferencia del de la nucleoproteína cristalina. Deseamos agradecer al Profesor J. T. CONFIGURACIÓN MOLECULAR EN Randall por su aliento; Profs. E. TIMONUCLEATO DE SODIO Chargaff, R. signer, J. A. V. Butler y los Las fibras de timonucleato sódico dan Dres. J. D. Watson, J. D. Amith; L. dos tipos distintos de diagrama de Hamilton, J. C. white y G. R. wyatt para rayos X. El primero corresponde a una material de apoyo sin el cual este forma cristalina, estructura A, trabajo hubiera sido imposible; obtenida a aproximadamente 75% de también los Dres. J. D. Watson y Mr. F. humedad relativa; un estudio de esto H. C. crick para el estímulo, y nuestros se describe en detalle en otra parte. colegas R. E. Franklin, R. G. Gosling, G. En humedades más altas, una L. Brown y W. E. Seeds para discusión. estructura diferente, la estructura B, Uno de nosotros (H. R. W.) desea que muestra un grado de orden reconocer el otorgamiento de una inferior, aparece y persiste en un beca de la Universidad de Gales. amplio rango de humedad ambiental. M. H. F. WILKINS El cambio de A a B es reversible. El contenido de agua de las fibras de la Consejo de investigación médica estructura B que experimentan este biofísica Unidad de investigación cambio reversible puede variar de 40 A. R. STOKES a 50 por ciento a varios cientos de por ciento del peso seco. Además, algunas H. R. WILSON fibras nunca muestran la estructura A, Laboratorio de Física de Wheatstone, y en estas estructuras B puede universidad de los reyes, Londres obtenerse con un contenido de agua incluso más bajo. 2 de Abril 1. Astbury. W. T., Symp. Soc. Exp. Biol., 1, nucleica cid (Cambridge univ. Press, 1947). 2. Riley, D. P., and Oster, G., Biochim, et Biophys, Acta, 7 526 (1951). 3. Wilkins; M. H. F., Gosling, R. G., and Seeds, W. E. , Nature. 167, 759 (1951). 4. Astbury, W. T., and Bell, F. O., Cold Spring Hard. Symp. Quant. Biol., 6, 109 (1938). 5. Cochran, W., Crick, F. H. C., and Vand, V., Acta Cryst., 5, 581 (1952). 6. Wilkins, M. H. F., and Randall, J. El diagrama de rayos X de la T., Biochim. Et Biophys. Acta, 10, 192 ( estructura B (ver fotografía) muestra 1953). de manera sorprendente los rasgos característicos de las estructuras Diagrama de la estructura B, para helicoidales, que se elaboraron por hacer ciertas deducciones en cuanto a primera vez en este laboratorio la naturaleza y dimensiones de la mediante stokes (sin publicar) y con hélice. crick, cochran y vand. stokes y wilkins Los máximos más internos en las fueron los primeros en proponer tales líneas de la primera, segunda, tercera estructuras para las fibras de ácido y quinta capa se encuentran nucleico, aunque Furberg (tesis, aproximadamente en las líneas rectas Londres, 1949) había sugerido que irradian desde el origen. Para una previamente una estructura helicoidal hélice de un solo calibre suave, el sobre la base de estudios de rayos X de factor de estructura en la línea de la nucleósidos y nucleótidos. capa n es dado por: Mientras que la evidencia de rayos X Donde Jn (u) es la función de bessel de no puede, en la actualidad, ser tomada orden n de u, r es el radio de la hélice como una prueba directa de que la y R y ¥ son las coordenadas radiales y estructura es helicoidal, otras acimutales en el espacio recíproco; consideraciones discutidas a esta expresión conduce a una matriz continuación hacen que la existencia aproximadamente lineal de intensidad de una estructura helicoidal sea máxima del tipo observador, altamente probable. correspondiente a la primera máxima La estructura B se deriva de la en las funciones J1, J2, J3, etc. estructura cristalina a cuando las Si, en lugar de una hélice suave, fibras de timonucleato de sodio consideramos una serie de residuos absorben cantidades de agua en equidistantes a lo largo de la hélice, la exceso de aproximadamente el 40 por transformación en el caso general ciento de su peso. El cambio se tratado por crick, cochran y vand es acompaña de un aumento de más complicada. Pero si hay un alrededor del 30% en la longitud de la número entero, m, de residuos por fibra y de una reorganización turno, la forma de la transformación es sustancial de la molécula. Por lo tanto, una para una hélice suave con la suma, parece razonable suponer que en la solo, del mismo patrón repetido con su estructura B las unidades origen en alturas mc *, 2m * ... etc. (c es estructurales de timonucleato de el período del eje de la fibra). sodio (moléculas en grupos de moléculas) están relativamente libres En el presente caso, el período de ejes de la influencia de las moléculas de fibra es 34 A. y la reflexión muy vecinas, cada unidad está protegida fuerte a 3.4 A. se encuentra en la línea por una capa de agua. Cada unidad es de la décima capa. además, líneas de libre de tomar su configuración de máximos que irradian desde el 3.4-A. mínima energía independientemente La reflexión desde el origen es visible de sus vecinos y, en vista de la en las líneas de la quinta y la capa naturaleza de las moléculas de cadena inferior, teniendo un máximo de j5 larga involucradas, es muy probable coincidente con el de la serie de origen que la forma general sea helicoidal, es en la línea de la quinta capa. (Sin inmediatamente posible, desde la X - embargo, las estrías externas fuertes que aparentemente se irradian desde el 3.4-A. máximo no se explican tan fácilmente). Esto sugiere fuertemente que hay exactamente 10 residuos por giro de la hélice. si esto es así, entonces, a partir de una medición de Rn, la posición del primer máximo en la línea de la capa n (para n 5 ≤), se puede obtener el radio de la hélice. En el presente caso, las mediciones de r1, R2, R3 y R5 conducen a valores de r de aproximadamente 10 A.