Ortólogo Ortólogo Ortólogo Ortólogo Ortólogo

Motivo AOS
AOS CEV1 CEV1 MYC2 MYC2 OPR2 OPR2 LOX2 LOX2
3-AF1 binding site 
5UTR Py-rich
stretch      
ABRE    
ACE      
ARE       
AT-rich element    
Box 4        
Box-W1    
CAAT-box          
CAT-box    
CGTCA-motif       
G-Box    
LTR   
MBS        
GARE-motif     
O2-site 
Skn-1_motif        
TC-rich repeats      
TCA-element    
TGACG-motif      
circadian        
AACA_motif 
Box CCGTCC 
ERE 
HSE       
MSA-like 
P-box 
WUN-motif 
MBSI  
AE-box  
ATCC-motif 
CCAAT-box  
as-2-box 
ATCT-motif  
TA-rich region  
TGA-element  
GCN4_motif 
 AT1-motif 

Clase Elementos cis

Elementos básicos de
transcripción 5UTR Py-rich stretch, AT-rich element, CAAT-box, TA-rich region.
Elementos sensibles a la luz 3-AF1 binding site, ACE, Box 4, G-Box, AE-box.
Elementos sensibles a ABRE, CGTCA-motif, GARE-motif, TCA-element, TGACG-motif, ERE
fitohormonas GARE, P-box, TGA-element.
Elementos sensibles a la
defensa y estrés LTR, MBS, TC-rich repeats, HSE, MBS.
Elementos sensibles a heridas
y patógenos Box-W1, WUN-motif, TC-rich.
Se establece la preferencia del ácaro verde de ovipositar en el genotipo CMC
40 y no en el genotipo ECU-72.
No hay mayores diferencias entre las regiones reguladores de los genes de
Arabidopsis y los ortólogos en yuca, además, todos están fuertemente
relacionados a estreses bióticos/abióticos y en general a la defensa de la
planta, a excepción del ortólogo MYC2.
Cuatro de los genes evaluados (AOS, MYC2, LOX y OPR2) mostraron una
regulación positiva tanto en el ataque del ácaro como en el de la mosca, CEV1
no se expresó notoriamente durante la interacción mosca-yuca.
G3PDH no presenta una expresión estable durante el ataque del ácaro y la
mosca a la yuca y por consiguiente se recomienda no usarlo como control
interno. El gen UBQ10 aunque mostró una expresión estable, la intensidad de
las bandas obtenidas no garantiza su rol como gen de referencia.
El ácido jasmónico está fuertemente asociado a la respuesta de defensa de la
yuca frente al ataque de un artrópodo plaga y lo hace interaccionando con otras
fitohormonas como el etileno, ácido salicílico, ácido abscísico, auxinas y
giberelinas.
Del mismo modo la predicción de un gran número de secuencias promotoras y su
contribución ha crecido últimamente debido auge de las tecnologías transcriptomicas
y la secuenciación de genomas completos de plantas (como la yuca). No obstante, la
demostración de la función del elemento cis dentro de la actividad promotora permitirá
confirmar las secuencias reguladoras, ya que las secuencias reguladoras predichas
pueden ser funcionales o no.
Se identificaron elementos cis que están fuertemente relacionados con la respuesta
de la yuca ante estreses bióticos y abióticos. (Se identificaron elementos reguladores de
la respuesta al desarrollo, hormonales y al estrés) ARTICULO Análisis in silico de
elementos reguladores que actúan en cis en regiones reguladoras 5 'de familias de
genes transportadores de sacarosa en arroz ( Oryza sativa Japonica) y Arabidopsis
thaliana