Estructura, funcion y replicaci6n de macromoléculas informacionales Nucledtidos Victor W. Rodwell, PhD Escribir formulas estructurales para representar los amino-tautémeros y ‘oxo-tautémeros de una purina y de una pirimidina y declarar cul tautémero ppredomina en condiciones fisiolégicas. Reproducir las férmulas estructurales para los principales nuclestidos presentes ten el DNA yen el RNA, y los nucleétidos menos comunes 5-metilctosina, S-hidroximetictosina, y eudouridina (y). 1 Representarla o-ibosa © 2-desoxi-o-ribosa enlazada como un conformador sin ‘anti de una purina, nombrar el enlace entte el azar y la base, e indicarcusl conformador predomina en casi todas las condiciones fsiol6gicas. ‘= Numerar los Stomos C y N de un nuclestido pirimidina y de un nucleésido purina, incluso el empleo de un nmero con una prima para Stomos de C delos azdicares = Comparar el potencial de transferencia de grupo fosforilo de cada grupo fosforilo, de un nucledsido trifosfato Esbozar as funciones fisioldgicas de los fosfodiésteresciclicos cAMP y cGMP. ‘Apreciar que los polinucleétides son macromoléculas direccionales compuestas ‘de mononuclestidos enlazados por enlaces 3" 5'fosfodiéster. = Entender que en las representaciones abreviadas de estructuras de polinuclestido ‘como pTpGpT o TGCATCA, el extrema 5’ siempre se muestra ala izquierda y todos los enlaces fosfodiéster son 3” 5’. Para analogos sintéticos especificos de bases pur 2 yPiimidina y sus derivados ue han servido como farmacos anticancer, indicar de qué maneras estos compuestos inhiben el metabolism, IMPORTANCIA BIOMEDICA Aclemas de servir como precursores de dcidos nucleicos, los na le6tidos parina y pirimidina participan en funciones metabo cas tan diversas como el metabolismo de energia a sintesis de proteina, la regulacin del actividad enzimética,yla ransduc- cidn de seRal. Cuando se enlazan a vitaminas o derivados de wi taminas, los nucledtidos forman parte de muchas coenzimas, ‘Como los principales donadoresy eceptores de grupos fosfoi- Jo en el metabolismo, los nucedsidos trifostatos y difostatos, ‘como el ATP y ADP, son los principales elementos en las trans- dacciones de energia que acompafan a las interconversiones 33324 4 , beg ue wed, oe Begtnn’ ad de na Prine FIGURA 32-1 Purinay pirimidina Los stomosestin numerados cde acuerdo con elsstema internacional -metabslicasy la fosforilacin oxidativa, Enlazados a axtcares 0 lipidos, los nucledsidos constituyen intermediarios biosintéticos clave. Los derivados del anicar UDP-glucosa y UDP galactosa patcipan en interconversiones de azar y en la biosintesis de almidén y glucégeno. De modo similar, los derivados nucled ddo-ipido, como el CDP acilglicerol, son intermediarios en la biosintesis de ipidos. Las funciones de los nucletidos en laze aulacién metabélica son fosfoilacion (dependiente de ATP) de cenzimas metabslicas clave, regulaciin alostérica de enzimas por ATR, ADP, AMP y CTE. y control por el ADP del indice de fos- forilacibn oxidativa, Los nuclestidos cichicas cAMP y cGMP si vven como los segundos mensajeros en eventos regulados por hhormonas, y el GTP y GDP desempesan funciones clave en la cascada de eventos que caracterizan a las vias de transduccién {de sedi Las aplicaciones especficamente médicas son el uso de anilogos de puna y pirimidina sintélicoe que contienen bal6- _genos,tioles, otomos de nitrogeno adicionales en la quimiote rapia de cincer y SIDA, y como supresores de la respuesta innmunitaria durante trasplante de érganos PROPIEDADES QUIMICAS DE LAS PURINAS, LAS PIRIMIDINAS, LOS NUCLEOSIDOS Y LOS NUCLEOTIDOS Las purinas y pi inas son compuestos heterociclicos ‘Las purina y pirimidinas son heterociclos que contienen nite ‘geno, estructuras ciclicas que contienen, ademis de carbono, otros (hetero) étomos, como nitrégeno. Note que la molécula de SECCIONIV. Exacta func yrepleen de macomolebsiemacoae Ne ° on Ss = FIGURA 32-2 Tautomerismo de ‘yamine de purinasypirimidinas rmolécula de purina de mayor tamaio tiene el nombre mas corto, ¥y que #02 anllos de seis tomos estin numerados en direcco- ret opuestas (figura 32-1). Las purinas o pirimidinas con un ‘grupo -NH, son bases débiles (valores de pK, de 3 a4), aunque ¢l protin presente a pH bajo esta asociado, nd como podria es- pperarse con el grupo amino exocicico sino con un nitrdgeno de anillo,tipicamente NI de adenina, N7 de guanina yN3 de cito- sina Lanaturaleza planar delas purinasy la primidinas facta su asociacién estrecha, o “spllamiento’, que establiza el DNA bicatenario (cap. 34). Los grupos oxo y amino de purinas y pi imidinas muestran tautomerisme ceto-enol y amina-imina (figura 32-2), aunque las condiciones fsioldgicas favorecen fuer- temente las formas amino oxo, Los nucleésidos son N-glucésidos Los nucleésidos son derivadoe de purinasy pirimidinas que te- nen un anicar enlazado a un nilrégeno de anilo de wna purina o pirimidina. Los nimeros con una prima (pe), 20 3) distinguen entre los stomos del azar y los del heterociclo. El azicar en los ribonucleésidos ela n-ribosa, yen los desoxirribonucledsidos sla 2-desoxi-v-ribosa, Ambos azdcatesestin unidos al hetero- ciclo por medio de un enlace B-N-glucosidico, cai siempre al [Nel de una pirimidina o aN de una purina (figura 32-3) Los nucledtidos son nucleésidos fosforilados Los mononucledtides son nucledsides con un grupo fosforila esterficado a un grupo hidroxilo del andar, Los nuclestidos 3" ¥.5” son nudledsidos con un grupo fosforilo en el grupo 3-0 5'-hidroxilo del azicar, respectivamente. Dado que casi todos los nuclestidos son 5, el prefjo “5” por lo general se omite ‘cuando se les ita. As el UMP y el dAMP representan aucledt «dos con un grupo fosforlo en el C-5 de la pentosa, Los grupos fosforilo adicionales,ligados por enlaces anhidrido de Acido al _Erupo fosforilo de un mononuclestido, forman nucleéside di- o a ne N. HN i 0 wo Adenosine " citiding Guanosine ~ ‘Uridineott (ANP) v 4 + ‘anosna S-Saro ADP) FIGURA 32-4 arp, su diforfatey su moneforfate, Los N-glucésidos heterociclicos existen como conformadores sin y anti Elobstéculoestérico por el heterocclo dicta que no hay ibertad Ae rotacisn alrededor del enlace B-N-glucosidico denuclessidos CUADRO 32-1 Bases purina, ribonucleésides y ribonucles x=H Tening Sanna tosis ele 325 FIGURA 32-5 diieren respectoa Neglucosiies © nuelebtides. En consecuencia, ambos existen como confor adores sin o anti no interconvertibles (figura 32-5), Al con trario de los tautémeros, los conformadores sin y anti sélo se pueden inlerconvertir por divisiin y relormacién del enlace gl cosidico, Los conformadores tanto si como ant se encuentran, nla naturalera, pero predominan los conformadores ant El euadeo 32-1 lista las principales purinasy pirimidinas, y sus derivados nucledsido y nucledtido, Se usan abreviaturas de una sola Jera para identificar ala adenina (A), guanina (G), ci fosina (C), timina (7) y uracilo (U), sean libres o presentes en eros Xeribosafestate ‘eesina___Adsnosna nontotate (NP) Guanosina__Guanesina menaostato (SMP) cd ‘iiina monetostt CM ana Uridins menototte UMP) ‘Tmina “Tiina monafosat (TMP)