QTLS

DIAP 3
En los diversos sistemas de producción animal se han establecido programas de
selección con el objetivo de mejorar la productividad y la composición de la canal.
Sin embargo, no se ha realizado selección para características que son costosas de
medir ó que tienen una baja heredabilidad, por lo cual es necesario el desarrollo de
herramientas que faciliten el mejoramiento de este tipo de características

Desde hace algún tiempo se ha planteado que los marcadores genéticos, cambiarán
la forma en que se selecciona a los animales. Algunas pruebas basadas en estos
marcadores ya están disponibles y se usan en forma comercial. Los marcadores
genéticos tienen diferentes aplicaciones potenciales como es el establecimiento de
paternidades (Heaton et al., 2002; Salazar-Marroquín et al., 2004), para determinar
si los progenitores son portadores de enfermedades genéticas ó algún defecto ó
para establecer la presencia de características cualitativas como sería la presencia
de cuernos ó color del pelaje. La mayoría de las características económicamente
importantes se encuentran controladas por muchos genes, cuya identidad por lo
general se desconoce. Sin embargo, se conoce su localización aproximada en el
genoma a través del uso de marcadores genéticos desarrollados en estas regiones.
Esto ha dado lugar a la posibilidad de usarlas para mejorar características
cuantitativas.

DIAP 4
El impresionante desarrollo que ha tenido la biología molecular y la ciencia
genómica alimentó la idea de caracterizar el genoma de las especies domesticas
con el fin de identificar el número, posición y función y viabilidad de cada uno de los
genes involucrados en el control de fenotipos cuantitativos de interés productivo
Mapas De ligamiento: Fueron las primeras descripciones del genoma que dispuso
la biología. Se trata de esquemas que muestran la disposición lineal de los genes
en los cromosomas, y sus distancias relativas. Orden y distancia qué pueden
calcularse a partir de la frecuencia de recombinación observada en cruzamientos o
pedigrís, o a través de otras técnicas más restringidas en cuanto al tipo de
organismos a las que pueden aplicarse, como el mapeo hibrido por radiación en
vertebrados. Utilizando un número suficientemente grande de marcadores
moleculares, y estudiando su segregación conjunta en cruces de individuos,
variedades o líneas, pueden ordenarse en un mapa genético.
(LEE LA PAG 195)
DIAP 5
Ejemplo de mapa genético y citogenetico del cromosoma 25 del bovino el mapa
muestra el orden y la distancia relativa de marcadores moleculares a lo largo de un
cromosoma
DIAP 6
Clasificación De los marcadores moleculares

TPO 1- secuencias expresadas o que corresponden a verdaderos genes, aunque

sea sorprendente los genes corresponden a un porcentaje pequeño del cromosoma
TIPO2- Secuencias anónimas de función desconocida elegidas por su alto alto
grado de polimorfismos, como los microsatelites.
Tipo 3- Son sustituciones puntuales de bases en la secuencia de adn como los SNP

DIAP 7.
El principio básico para la construcción de mapas genéticos es la ocurrencia de
distorciones en la segregación independiente. Que corresponde a la segunda ley de
Mendel.
Esta ley indica que si existe una generación parental cuyos genotipos en dos
loci/locus son respectivamente Aa y Bb (Heterocigotos para ambos marcadores)
habrá igual probabilidad de encontrar todas las posibles combinaciones en los
gametos y en la progenie (AB, Ab, aB y ab).
DIAP 8
Sin embargo, si esos marcadores están en el mismo cromosoma y con cierta
proximidad habrá un impedimento físico para la segregación independiente
predicha por Mendel. En ese caso, la progenie mostrará en mayor abundancia las
combinaciones originales de los parentales.

La aplicación de este concepto a un número grande de marcadores permite

posicionarlos en forma relativa sobre un cromosoma y determinar su orden y
distancia
Diseño de la retrocruza. El denominado ‘’de medios hermanos’’ muy utilizado en
animales domésticos es muy similar. Uno de los progenitores produce gametos
recombinantes mientras qué el otro no puede verse que el cromosoma
recombinante produce variabilidad genética que se expresa en la variación del
fenotipo o característica estudiada.
Esta variación fenotípica se vincula con los genotipos del marcador. Una diferencia
significativa para estas clases genotípicas indica la proximidad del qtl.

DIAP 9.
Por la propia naturaleza del calculo de estas distancias entre marcadores estas no
se presentan distancias físicas reales. La unidad de los mapas genéticos es el
centiMorgan que representan la probabilidad de una recombianción cada 100
meiosis

DIAP 10
Una vez se dispone de un mapa de ligamiento, se puede utilizar para detectar la
localización en el genoma de los genes responsables de un carácter de interés para
el cultivo. Normalmente se trata de caracteres cuantitativos que están determinados
por varios genes en interacción con el ambiente, como la tasa de crecimiento o la
resistencia a determinadas enfermedades.

DIAP 12
La aplicabilidad del mejoramiento genético aistido a pesar de su potencial teorico
requiere de la identificación del polimorfismo, variantes génicas o loci de las
características cuantitativas (qtl) que hayan probado su asociación significativa con
las características productivas de interés, para lo cual se pueden utilizar enfoques
de búsqueda o escaneo del genoma completo y de los genes candidatos
DIAP 13
Fue hasta que se desarrollaron los mapas de ligamiento que se pudo hacer una
búsqueda a través de todo el genoma para encontrar los QTL. La contribución de
los genes que están involucrados en la expresión de un carácter se puede evaluar
seleccionando genes candidatos. Los genes candidatos son aquellos involucrados
en la fisiología del carácter. Como ejemplo, la hormona del crecimiento es un gen
candidato para la tasa de crecimiento, o peso al destete. La secuencia de ADN del
gen candidato permite identificar marcadores que se encuentran en el gen, o cerca
de éste. Estos marcadores son entonces utilizados para posicionar al gen en el
mapa de ligamiento, y para establecer su asociación con el carácter de interés.
Como ejemplo, si un marcador se identifica en la hormona del crecimiento, las
diferentes formas del marcador (conocidos como alelos) se utilizarían para
establecer si un alelo del marcador genético está asociado a crecimiento lento (ó
pesos al destete ligeros), mientras el otro alelo está asociado con crecimiento rápido
(ó pesos al destete mayores). Esta estrategia permite establecer el efecto de un gen
en la expresión de un carácter productivo.

Los genes responsables de la variación cuantitativa se llaman ‘’loci de caracteres

cuantitativos’’ o QTL. (Por sus iniciales en inglés).

Los métodos tradicionales de mejora genética en las especies bovinas se

han basado hasta ahora únicamente en el fenotipo y la información del
pedigrí. El descubrimiento de los marcadores genéticos ha hecho posible
la detección de Loci de Rasgos Cuantificables (QTL por Quantitative Trait
Loci). Un QTL es una región del genoma (locus) cuya variación alélica está
asociada con la expresión/variación de un rasgo (fenotipo) cuantitativo
dado (por ejemplo, producción de leche). Los QTL se utilizan para
genotipificar a los individuos y detectar a los animales que son portadores
de rasgos específicos.

DIAP 14

Esquema de las principales alternativas para la identificación de genes de

importancia económica en animales domésticos. Las mismas también han
sido denominadas estrategia bioquímica o de ‘’fenotipo hacia abajo’’ y de
estrategia genética o de ‘’genotipo hacia arriba’’respectivamente.
 En la primera un gen de función conocida es considerado candidato para
el control de un fenotipo de interés y su efecto es validado mediante un
estudio de asociación. El gen puede ser conocido porque ya ha sido
caracterizada la proteína respectiva en su especie.

Alternativamente, los genes a un desconocidos que controlan a un fenotipo

determinado son rastreos sobre la base de su posición en el genoma
mediante la identificación de regiones cromosómicas que se cosegregan
con el fenotipo estudiado

DIAP 15
Varios grupos alrededor del mundo han realizado estudios para identificar
QTLs que afecten rasgos de importancia económica en el ganado bovino
lechero y cárnico, como pueden ser incremento de peso, producción y
propiedades de la leche, eficiencia alimenticia, terneza y marmoleo.

DIAP 16
La detección de los QTL se realiza estudiando la segregación conjunta de los
marcadores moleculares y los valores del carácter de interés e cruzamientos o
pedigrís.
Entre los diseños más populares para la detección de QTL en poblaciones comerciales se encuentran
dos que han sido particularmente utilizados en el vacuno de leche: -

El diseño de medio hermanos (denominado “Diseño Hijas” en vacuno de leche), en el que se analiza
la presencia de QTL a partir de las diferencias fenotípicas entre los grupos de descendientes (medio-
hermanos entre ellos) que han heredado alelos alternativos de un padre común heterocigoto para
el/los marcadores (Giovambattista, 1998). –

El “Diseño Nietos”, aplicado específicamente en vacuno de leche, en el que se analizan las

diferencias entre los descendientes machos que han heredado alelos alternativos 8 del padre
común, pero en términos de valor genético predicho mediante un test de progenie (i.e. a partir de
los fenotipos medidos en las nietas) (Giovambattista, 1998).

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Un objetivo importante de los estudios de QTL es encontrar
genes o marcadores genéticos que pueden ser utilizados en la Selección Asistida
por Marcadores (MAS por Marked-Assisted Selection). Este método de selección
combina datos de pedigrí, fenotípicos y genotípicos para identificar a los animales
portadores de rasgos económicamente importantes, los cuales son elegidos para
ser utilizados en programas de crianza. El uso de estrategias MAS permite aumentar
la eficiencia de la selección, mejorar la tasa de ganancia genética (en especial si la
selección tradicional es menos eficaz) y acortar los tiempos generacionales, todo lo
cual se traduce en beneficios económicos para los criadores y ganaderos.
DIAP 18
Uso comercial de marcadores genéticos en especies animales de interés pecuario
En la actualidad se cuenta con marcadores genéticos confiables que son útiles para
la genotipificación y la detección de los individuos que son portadores de genes para
producir, con predisposición para desarrollar algún proceso patológico, o genes que
confieren resistencia a ciertas enfermedades. Al identificar a los individuos
poseedores de estos marcadores se pueden comenzar a diseñar cruzamientos,
sistemas de mejora genética o planear la producción con objetivos de producción
bien definidos.

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La grasa dorsal, el área del ojo lomo y el Color de la carne-L son los tres caracteres
principales del cerdo con mayor número de QTL reportados. El peso corporal en el
pollo tiene un número dominante de QTL más que otros rasgos. El rendimiento de
grasa, el rendimiento de la leche y el hermanamiento son los tres rasgos principales
del ganado en los que se miden los QTL

Articulo

El objetivo de este estudio fue asignar por mapa ligamiento el gen Endotelina-1 (END1) al
cromosoma 2 del pollo (GGA2). Los microsatélites MCW0314, MCW0245, ADL0164, MCW0264 y el
diseño de cebadores fueron usados para la amplificación de secuencias específicas de END1. La
técnica PCR-SSCP y el uso de geles denaturantes permitió la tipificación de los genotipos. Para la
construcción del mapa se usaron los genotipos identificados en una población de 200 pollos
Cobb500 utilizando el programa Mapmaker® version 3.0b. El resultado es un mapa del GGA2 donde
END1 está ligado a los microsatélites reportados en un locus de un carácter cuantitativo (QTL) para
susceptibilidad de los pollos de engorde a desarrollar el síndrome de hipertensión pulmonar.