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BIOLOGIA

 MOLECULAR  Y  
GENETICA  
UNIDAD  III:  GENETICA  POBLACIONAL  
Clase  1  
Octubre  2017  

Profesora:  CECILIA  BUCHANAN  


CONTENIDOS  
•  Definiciones  
•  La  población  humana  
•  Ley  de  Hardy-­‐Weinberg  
•  Factores  que  modifican  el  EHW  y  
consecuencias  
•  Aplicaciones  de  la  ley  de  HW.  
•  Cálculo  de  riesgos  

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POBLACION  
-­‐Ecológicamente   como:   Un   grupo   de   individuos   de   la   misma   especie   que  
habitan   dentro   de   una   zona   geográfica   restringida   que   permite   el  
apareamiento  de  dos  individuos  cualquiera    (implicaciones  demográficas)  
 
-­‐Gené@camente   como:   Un   grupo   de   individuos   que   comparten   un   acervo  
gené@co  común  (todos  los  alelos  que  están  presentes  en  el  material  gené4co  
de  la  totalidad  de  los  individuos  de  una  población)  y  Venen  la  posibilidad  de  
aparearse    (implicaciones  genéVcas)  
 
-­‐Una  población  puede  ser  considerada  como  una  unidad.    
 
-­‐Sin   embargo,   en   muchas   especies   y   en   numerosas   circunstancias,   las  
poblaciones  se  subdividen  en  unidades  de  menor  tamaño.  Dicha  subdivisión  
puede  ser  el  resultado  de  factores  ecológicos  (los  hábitats  no  son  con4nuos)  
o  de  comportamiento  (reubicación  consciente  o  inconsciente).    
GENETICA  DE  POBLACIONES  
 
Es  el  estudio  cuanVtaVvo  de  la  distribución  de  
las  variaciones  genéVcas  en  las  poblaciones  y  de  
la  manera  en  que  las  frecuencias  alélicas  (de  los  
genes)  y  los  genoVpos  se  manVenen  o  cambian  
a  través  del  Vempo.  
 
Análisis  de  Causas  de  estos  cambios.  

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-­‐La  genéVca  de  poblaciones  es  el  estudio  de  la  aplicación  de  las  leyes  
de  Mendel  y  otros  principios  genéVcos  a  poblaciones  completas  de  
organismos  en  vez  de  aplicarlas  solamente  a  individuos.    
 
-­‐En  
  otras   palabras:   estudia   la   variación   gené@ca   dentro   y   entre  
poblaciones  y  su  cambio  en  el  @empo  y  en  el  espacio.    
-­‐Puede  estudiar:  
 
 1.Cons@tución  gené@ca.  Tipos  de  alelos  que  portan  los  individuos.    
  2.Frecuencias   genoQpicas.   Frecuencias   de   los   geno@pos  
resultantes  de  la  combinación  de  los  alelos  de  cada  locus.    
 3.Frecuencias  génicas  o  alélicas.  Frecuencias  de  cada  alelo  
en  la  población.    
 4.Pool  o  acervo  génico.  Es  la  suma  de  todos  los  geno@pos  
de  los  individuos  de  una  población.    
DE  QUE  SE  OCUPA?  
Se  ocupa  de:  
•  Factores  gené@cos  (mutaciones  y  
reproducción)  
•  Factores  ambientales  y  sociales  (selección  y  
migración)  

Determinan  frecuencia  y  distribución  de  alelos  y  


genoVpos  en  las  familias  y  comunidades  
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PARA  QUE?  
•  Historia  
•  Estructura  génica  de  poblaciones  humanas  
•  Flujo  de  genes  entre  poblaciones  y  
generaciones  
•  Predicción  de  enfermedades  
•  DiagnósVco  clínico  y  consejo  genéVco  

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CONCEPTOS  PREVIOS  
•  FenoVpo   •  Codominancia  
•  Gen     •  GenoVpo  
•  Alelo   •  Variación  GenéVca  
•  Alelo  Dominante   •  Polimorfismos  
•  Alelo  Recesivo  
 

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DEFINICIONES  
•  POBLACION…  
•  Ecológicamente  como:  
Un  grupo  de  individuos  de  la  misma  especie  que  
habitan  dentro  de  una  zona  geográfica  restringida  
que  permite  el  apareamiento  de  dos  individuos  
cualquiera    
 
•  Gené4camente  como:  
Un  grupo  de  individuos  que  comparten  un  acervo  
gené@co  común  y  Venen  la  posibilidad  de  aparearse    

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EJEMPLO  

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Cons@tución  Gené@ca  

En  una  población  existe  un  gen  con  2  alelos  


 A    A  
 A    a   Geno@po  más  abundante  
 a    a  
Distribución  alelos  en  población  según  los  loci  afectados  
Variación  gené@ca:  polimorfismos  
-­‐Polimorfismo  se  define  como  ‘La  presencia  de  muchas  formas’    
-­‐En   términos   genéVcos,   se   refiere   a   la   coexistencia   de   dos   o   más  
feno@pos  alternos  en  una  misma  población  y  entre  poblaciones.  
-­‐Por  lo  general,  los  diversos  fenoVpos  son  originados  por  los  alelos  
alternos  de  un  gen.  
 
-­‐Tipos  de  variación:    
 -­‐Variación  morfológica  
  -­‐Variación   cromosómica.   Translocaciones   recíprocas,  
inversiones,  cromosomas  supernumerarios,  etc  
 -­‐Polimorfismos  inmunológicos.  ABO,  Rh+,  etc,  
  -­‐Variación   proteica.   Hemoglobina,   enzimas   (esterasa-­‐5,  
xanVna  oxidasa,  etc).  
 -­‐Polimorfismos  de  ADN.  RFLPs,  repeVciones  en  tándem  de  
tamaño  variable  (VNTRs),  SNPs.  
 
DEFINICIONES  
 
•  Acervo  Gené@co:  Todos  los  alelos  comparVdos  por  estos  
individuos  consVtuyen  el  acervo  gené@co  (conjunto  de  genes)  
de  la  población.    
 
•  Pool  génico  es  la  combinación  de  todos  los  alelos  para  todos  
los  rasgos  que  exhiben  los  miembros  de  una  población.  
También  puede  considerarse  como  la  suma  total  de  los  
gametos  de  una  población  a  parVr  de  los  cuales  se  toman  
muestras  al  azar  para  formar  los  cigotos  de  la  generación  
siguiente.    

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DEFINICIONES  (Cont.)  
•  Frecuencias  GenoQpicas:  proporción  relaVva  
de  los  genoVpos  existentes  en  una  población  
para  el  locus  en  cuesVón  (es  la  canVdad  de  
veces  que  aparece  el  genoVpo  en  una  
población).  
Nomenclatura  de  las  frecuencias  genoQpicas:    
•  f(A1  A1)=  P    
•  f(A1  A2)=  H    
•  f(A2  A2)=  Q    
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DEFINICIONES  (Cont.)  
•  Frecuencias  alélicas:  proporción  de  alelos  de  cada  
locus  parVcular;  definen  la  consVtución  genéVca  de  
una  población,  su  suma  es  1  y  los  valores  pueden  
variar  entre  0  (alelo  ausente)  y  1  (alelo  fijado).    

•  f(A1)=  p    
•  f(A2)=  q    
 
El  cálculo  de  las  frecuencias  alélicas  de  una  población  se  
hace  teniendo  en  cuenta  que  los  homocigotas  4enen  dos  
alelos  idén4cos  y  los  heterocigotas  dos  alelos  diferentes.    
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Para  NO  OLVIDAR  
FRECUENCIAS   FRECUENCIAS    
GENOTIPICAS   ALELICAS  
   
•  P   •  p  
•  Q   •  q  
•  H  

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EJEMPLO  
Población  N=200  individuos:    
60  A1  A1    
120  A1  A2    
20  A2  A2  
 
Frecuencias  genoQpicas  :    
 
f(A1  A1)=  60/200  =  0,3  =  P    
f(A1  A2)=  120/200  =  0,6  =  H    
f(A2  A2)=  20/200  =  0,1  =  Q    
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EJEMPLO  (Cont.)  
NUMERO  DE   FREQ  GENOTIPICA   ALELOS  A1   ALELOS  A2  
INDIVIDUOS  
A1A1   60   P=60/200=0,3   120   0  
A1A2   120   H=120/200=0,6   120   120  
A2A2   20   Q=20/200=0,1   0   40  
TOTAL   200   240   160  
FREQ  ALELICA   p=240/400=0,6   q=160/400=0,4  
     

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Frecuencias  GenoQpicas  y  Alélicas  
En  una  población  diploide  cada  individuo  Vene  
dos  copias  alélicas  para  cada  locus  

40  alelos  (bolitas)  
20  individuos  en  la  
población  

Para  cálculo  FRECUENCIA  ALELICAS:    


P  (A)=  [2(  AA)  +  (Aa)]/2n                    ;  P  (A)=  [2(  11)  +  (6)]/2*20        ;  P(A)=28/40  
P  (a)=  [2(  aa)  +  (Aa)]/2n                      ;  P  (a)=  [2(  3)  +  (6)]/2*20        ;  P(A)=12/40  
P+q=1;  p=  1-­‐q;    q=1-­‐p  
Ejercicio  de  Frecuencias    
GenoQpicas  y  Alélicas  
Ejercicio  de  Frecuencias    
GenoQpicas  y  Alélicas  

M  
N  
A   medida   que   aumenta   la   frecuencia   del   alelo   1,  
aumenta   la   frecuencia   del   geno@po   A1A1   (línea   azul).  
Simultáneamente,   si   ese   alelo   1   esta   aumentando,   el  
alelo  2  en  la  población  esta  disminuyendo  (línea  verde).  
La   línea   rosa,   geno@po   heterocigó@co,   va   aumentar   al  
principio,  porque  está  aumentando  el  alelo  1,  pero  luego  
disminuye,  porque  el  alelo  2  esta  disminuyendo.    
-­‐Las  poblaciones  naturales  son  fenoQpicamente  diversas.    
-­‐La  genéVca  de  poblaciones  trata  la  diversidad  fenoQpica  y  genoQpica  de  los  
individuos.  
El  principio  de  Hardy-­‐Weinberg  (1908)  
“Una   población   cuyo   apareamiento   se   realice   al   azar   da   lugar   a   una  
distribución   en   equilibrio   de   geno@pos   después   de   tan   solo   una   generación,  
de  manera  que  se  conserva  la  variación  gené@ca”  

Si  ocurre  algún  cambio  en  la  frecuencia  indica  que  ha  ocurrido  evolución.  
EQUILIBRIO  DE  HARDY-­‐WEINBERG  

Inferir  
Frecuencias  
Genómicas  a  
través  de  las  
Frecuencias  
alélicas  

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EQUILIBRIO  DE  H-­‐W  
•  SUPUESTOS:  
ü El  organismo  es  diploide    
ü La  reproducción  es  sexual    
ü Las  generaciones  no  se  superponen  entre  sí    
ü El  apareamiento  ocurre  al  azar  (Panmixia)  
ü El  tamaño  de  la  población  es  muy  grande    
ü La  migración  es  mínima    
ü Las  mutaciones  pueden  ignorarse    
ü La  selección  natural  no  afecta  los  alelos  que  se  están  
considerando     GENETICA  CLINICA-­‐  UNIDAD  III-­‐  CLASE  1   30  
EQUILIBRIO  DE  H-­‐W  
•  Existe  una  relación  SIMPLE  entre  frecuencias  
alélicas  y  genotpicas  de  una  población  
 
•  Si  las  frecuencias  alélicas  NO  cambian  de  
generación  en  generación  las  frecuencias  de  
los  genoVpos  permanecerán  constantes  y  en  
equilibrio  

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EQUILIBRIO  H-­‐W  
Las  frecuencias  genoQpicas  de  equilibrio  están  
dadas  por  el  desarrollo  del  binomio:    
Siendo:    
² p2  =  f(A1  A1)    
² 2pq  =  f(A1  A2)    
² q2  =  f(A2  A2)    
Entonces,  si  la  población  está  en  equilibrio:    
² p2=P                        2pq=H                                q2=Q    
² (p+q)2=p2  +2pq+q2    
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EQUILIBRIO  DE  H-­‐W  

(p  +  q) =p  +  2pq  +  q    
2 2 2

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EJEMPLO  
•  GEN  CCR5:  receptor  de  citocina  de  la  membrana  
celular,  entrada  para  virus  de  VIH  

•  Deleción=>  ΔCCR5  proteína  no  funcional  


•  Individuos  homocigotos:  resistentes  al  virus!  

•  788  individuos  
•  p=0,906  (alelo  normal  CCR5)  
•  q=0,094  (para  ΔCCR5)  
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EJEMPLO  (Cont.)  

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EJEMPLO  (Cont.)  
p2:2pq:q2  
 

⇒ p2=0,906x0,906=0,821  
⇒ 2pq=(0,906x0,094)+(0,906x0,094)=0,17  
⇒ q2=0,094x0,094=0,009  

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EJEMPLO  (Cont.)  
GENOTIPOS   N  DE   FRECUENCIA   ALELO   FRECUENCIA  
PERSONAS   GENOTIPICA   ALELICA  
OBSERVADA  
CCR5/CCR5   647   0,821   CCR5   0,906  
CCR5/ΔCCR5   134   0,168   ΔCCR5   0,094  
ΔCCR5/ΔCCR5   7   0,011  
TOTAL   788   1  

FRECUENCIA  ALELICA  CCR5=  (2X  CCR5/CCR5)+  (1X  CCR5/ΔCCR5)  


                                               (NX2)    

FRECUENCIA  ALELICA  CCR5=  (2X  647)+  (1X  134)=  0,906  


                       (788X2)    

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CALCULO  DE  FRECUENCIAS  ALELICAS  
•  p=  #Observados  de  AA+  (#Observados  de  Aa/2)  
       #total  
•  q=  #Observados  de  aa+  (#Observados  de  Aa/2)  
       #total  

•  p+q=1  

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FRECUENCIAS  GENOTIPICAS  
ESPERADAS  
•  AA  
•  p2=((  #Observados  de  AA+  (#Observados  de  Aa/2)/#total)2  
 
•  Aa  
•  2pq=2((  #Observados  de  AA+  (#Observados  de  Aa/2)  +  aa+Aa/2/
#total)  
 

•  aa    
•  q2=((  #Observados  de  aa+  (#Observados  de  Aa/2)/#total)2  
     

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NUMERO  ESPERADO  POR  GENOTIPO  
•  AA  
 p2n=frecuencia  genotpica  esperada  x  total  
•  Aa  
 2pqn=frecuencia  genotpica  esperada  x  total  
•  aa  
 q2n=frecuencia  genotpica  esperada  x  total  

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ESTRATIFICACION  
•  La  población  Vene  SUBGRUPOS  
•  Elección  de  la  pareja  dentro  de  subgrupos  
⇒ Exceso  de  Homocigotas  
⇒ Déficit  de  heterocigotas  
⇒ Frecuencias  alélicas  NO  se  cumplen  

No  hay  efecto  sobre  enfermedades  autosómicas  


dominantes  

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ESTRATIFICACION  (Ejemplo)  
•  Subgrupo  10%  de  la  población  general  
•  Alelo  Mutante:  enfermedad  autosómica  
recesiva  qmn=0,05  

•  90%  de  la  población  qmn=0  

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UNION  DIRIGIDA  
•  Elección  de  determinados  carateres  para  
escoger  una  pareja…  generalmente  es  
POSITIVO  
⇒ Exceso  de  Homocigotas  
⇒ Déficit  de  heterocigotas  
⇒ Frecuencias  alélicas  NO  se  cumplen  

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CONSANGUINIDAD  Y  ENDOGAMIA  
•  Aumento  de  enfermedades  autosómicas  
recesivas  
•  Porque  aumenta  la  frecuencia  de  
emparejamiento  de  portadores  de  trastornos  
autosómicos  recesivos  
 

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FACTORES  QUE  AFECTAN    
EL  EQ.  H-­‐W  
Ø Población  Pequeña  
Ø Mutación  
Ø Migración  
Ø Recombinación    
Ø Selección  
Ø Deriva  genéVca    

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LA  POBLACION,  
 ESTA  EN  EQUILIBRIO?  
•  Los  genoVpos,  están  equilibrados?  

1-­‐  Calcular  frecuencias  genotpicas  


2-­‐  Se  calculan  frecuencias  p  y  q  a  parVr  e  las  
frecuencias  genotpicas  
3-­‐  Si  la  Frecuencia  Observada  se  corresponde  
con  p2  y  q2  la  población  está  en  equilibrio  de  H-­‐
W  
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