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Biofísica – IF624 

UNIVERSIDAD TECNOLOGICA DE PEREIRA 
PROGRAMA DE INGENIERIA FÍSICA 
 
NOMBRE      : BIOFÍSICA       
CODIGO      : IF624 
REQUISITO      : CB334 – IF523 
INTENSIDAD HORARIA  : CUATRO (4) HORAS SEMANALES 
 
OBJETIVOS 
 
OBJETIVOS GENERALES 
 
- Mejorar y ampliar los conocimientos de física de los procesos biológicos 
- Aplicar los conceptos físicos a la fisiología celular y procesos vivos. 
- Analizar los fenómenos celulares y de tejidos empleando teoría de sistemas dinámicos 
y herramientas no lineales de modelamiento. 
 
OBJETIVOS ESPECÍFICOS 
 
- Fundamentar  al  estudiante  en  análisis  de  sistemas  dinámicos    para  abordar 
físicamente fenómenos celulares. 
- Estudiar fenómenos energéticos celulares y las bases moleculares de la vida. 
- Estudiar la arquitectura celular, sus diferentes procesos metabólicos y las estructuras 
proteicas en la membrana.  
- Estudiar  las  bases  fisicoquímicas  de  la  membrana  celular  y  su  proceso  de 
modelamiento. 
- Establecer las bases del transporte de sustancia a través de membranas celulares y su 
modelo de circuito equivalente. 
- Estudiar  sistemas  de  reacción  difusión  y  su  papel  en  la  excitabilidad  y  la 
electrofisiología celular. 
 
CONTENIDO 
 
Sistemas dinámicos 
 
Estructura de un sistema dinámico y su modelo matemático. 
Excitación y respuesta de un sistema dinámico  
Análisis de estabilidad de un sistema dinámico y sus puntos críticos. 
Plano de fase y representación vectorial de sistemas dinámicos. 
Análisis de estado estacionario y bifurcación de sistemas dinámicos [Hirsch et al. 2004].  
 
Bases moleculares de la vida 
 
Moléculas polares y aminoácidos cíclicos 
Fuerzas de Van der Vals y fuerzas de London 
Ciclo molecular del agua y su importancia en el ser vivo 
Principios de entropía y entalpía en los procesos celulares. 
Moléculas hidrofóbicas y moléculas amfifelicis [Meierhenrich 2008]. 
 
Arquitectura celular 
 
La célula y sus organelas 
Metabolismo celular (alimentación, energía, respiración) 
Ciclo de Krebs, y Fosforilación de  Adenosin tri‐fosfato (ATP) 
Proteínas y sus diferentes estructuras conformacionales. 
Acido dexociribonucleico (ADN), ribonucleico (ARN) y genómica celular. 
[Vollskentein 1965]. 
 
Electrofisiología de la membrana celular  
 
Formación de la membrana celular y su importancia en la vida.  
Composición molecular del plasma de membrana. 
Características eléctricas y cargas de membrana (efecto capacitor). 
Teoría de Guy‐Chapman de la doble capa de la membrana. 
Parámetros  eléctricos  (Impedancia,  Conductancia,  Admitancia,  Polarización)  de  la 
membrana celular [Keener et al. 1998]. 
 
Transporte de sustancia 
 
Leyes de difusión en  sistemas biológicos 
Ley de Fick y Ley de Ohm aplicada a sustancias biológicas. 
Ecuación de Goldman de campo constante. 
Ecuación de Nerst‐Planck‐Einstein y potencial de reposo iónico. 
Electrodifusión y ecuación de Goldman‐Hodgkin‐Katz 
Transporte osmótico,  ley de Vant’ Hoff y transporte facilitado [Raicu et al. 2008] 
 
Ecuación de reacción‐difusión y modelo matemático de Hodgkin‐Huxley 
 
Modelo de reacción‐difusión y su relación con ondas de materia. 
Modelo de un canal iónico y su equivalente circuital. 
Activación, desactivación y fenómenos de compuertas en un canal iónico. 
Modelo de Hodgkin‐Huxley para el axón de calamar [Hodgkin et al. 1952] 
Modelo de Fitzhug‐Nagumo como simplificación del HH, análisis de plano de fase y puntos 
críticos. 
Modelo  de  Winfree  de  excitabilidad  celular  y  su  análisis  de  plano  de  fase  [Cole 
1968;Winfree 2002;Winfree 2001;Winfree 1997]. 

Bibliografía 
 
1.  Cole,  K.  1968,  "Electric  properties  of  squid  membranes,"  in  Membranaes,ions  and 
impulses: a chapter of classical biophysics, first edn, Univ of California Press, pp. 115‐239. 

2. Hirsch, M., Smale, S., & Devaney, R. 2004, Differential equations, dynamical system and 
Introduction to chaos, Second edn, Academic Press. 

3.  Hodgkin,  A.  L.  &  Huxley,  A.  F.  1952,  "A  quantitative  description  of  membrane  current 
and  its  application  to  conduction  and  excitation  in  nerve",  J.Physiol,  vol.  117,  no.  4,  pp. 
500‐544. 

4. Keener, J. & Sneyd, J. 1998, "Cardiac Propagation," in Mathematical Physiology, 1 edn, 
Springer, pp. 313‐332. 

5. Meierhenrich, U. 2008, Amino Acid and Asymmetry of Life: Caught in the act formation, 
First edn, Springer‐Verlag. 

6.  Raicu,  V.  &  Popescu,  A.  2008,  Integrated  Molecular  and  cellular  biophysics,  firts  edn, 
Springer. 

7. Vollskentein, V. 1965, Biofisica Celular, First edn, Mir. 

8. Winfree, A. T. 1997, "Rotors, Fibrillation, and Dimensionality," in Computational Biology 
of heart, firts edition edn, A. V. Panfilov & A. V. Holden, eds., Wiley, Chichister, pp. 101‐
135. 

9. Winfree, A. T. 2001, "Electrical singular filaments in the heart wall," in The Geometry of 
Biological Time, 2nd edn, J. Marsden, L. Sirovich, & S. Wiggins, eds., Springer Verlag, pp. 
455‐526. 

10.  Winfree,  A.  T.  2002,  "A  prime  number  of  prime  questions  about  vortex  dynamics  in 
nonlinear media," in Nonlinear dynamics and chaos: where do we go from here?, first edn, 
J. Hogan et al., eds., Institute of Physics Publishing, pp. 229‐267. 
 

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