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UNIVERSIDAD TECNOLOGICA DE PEREIRA
PROGRAMA DE INGENIERIA FÍSICA
NOMBRE : BIOFÍSICA
CODIGO : IF624
REQUISITO : CB334 – IF523
INTENSIDAD HORARIA : CUATRO (4) HORAS SEMANALES
OBJETIVOS
OBJETIVOS GENERALES
- Mejorar y ampliar los conocimientos de física de los procesos biológicos
- Aplicar los conceptos físicos a la fisiología celular y procesos vivos.
- Analizar los fenómenos celulares y de tejidos empleando teoría de sistemas dinámicos
y herramientas no lineales de modelamiento.
OBJETIVOS ESPECÍFICOS
- Fundamentar al estudiante en análisis de sistemas dinámicos para abordar
físicamente fenómenos celulares.
- Estudiar fenómenos energéticos celulares y las bases moleculares de la vida.
- Estudiar la arquitectura celular, sus diferentes procesos metabólicos y las estructuras
proteicas en la membrana.
- Estudiar las bases fisicoquímicas de la membrana celular y su proceso de
modelamiento.
- Establecer las bases del transporte de sustancia a través de membranas celulares y su
modelo de circuito equivalente.
- Estudiar sistemas de reacción difusión y su papel en la excitabilidad y la
electrofisiología celular.
CONTENIDO
Sistemas dinámicos
Estructura de un sistema dinámico y su modelo matemático.
Excitación y respuesta de un sistema dinámico
Análisis de estabilidad de un sistema dinámico y sus puntos críticos.
Plano de fase y representación vectorial de sistemas dinámicos.
Análisis de estado estacionario y bifurcación de sistemas dinámicos [Hirsch et al. 2004].
Bases moleculares de la vida
Moléculas polares y aminoácidos cíclicos
Fuerzas de Van der Vals y fuerzas de London
Ciclo molecular del agua y su importancia en el ser vivo
Principios de entropía y entalpía en los procesos celulares.
Moléculas hidrofóbicas y moléculas amfifelicis [Meierhenrich 2008].
Arquitectura celular
La célula y sus organelas
Metabolismo celular (alimentación, energía, respiración)
Ciclo de Krebs, y Fosforilación de Adenosin tri‐fosfato (ATP)
Proteínas y sus diferentes estructuras conformacionales.
Acido dexociribonucleico (ADN), ribonucleico (ARN) y genómica celular.
[Vollskentein 1965].
Electrofisiología de la membrana celular
Formación de la membrana celular y su importancia en la vida.
Composición molecular del plasma de membrana.
Características eléctricas y cargas de membrana (efecto capacitor).
Teoría de Guy‐Chapman de la doble capa de la membrana.
Parámetros eléctricos (Impedancia, Conductancia, Admitancia, Polarización) de la
membrana celular [Keener et al. 1998].
Transporte de sustancia
Leyes de difusión en sistemas biológicos
Ley de Fick y Ley de Ohm aplicada a sustancias biológicas.
Ecuación de Goldman de campo constante.
Ecuación de Nerst‐Planck‐Einstein y potencial de reposo iónico.
Electrodifusión y ecuación de Goldman‐Hodgkin‐Katz
Transporte osmótico, ley de Vant’ Hoff y transporte facilitado [Raicu et al. 2008]
Ecuación de reacción‐difusión y modelo matemático de Hodgkin‐Huxley
Modelo de reacción‐difusión y su relación con ondas de materia.
Modelo de un canal iónico y su equivalente circuital.
Activación, desactivación y fenómenos de compuertas en un canal iónico.
Modelo de Hodgkin‐Huxley para el axón de calamar [Hodgkin et al. 1952]
Modelo de Fitzhug‐Nagumo como simplificación del HH, análisis de plano de fase y puntos
críticos.
Modelo de Winfree de excitabilidad celular y su análisis de plano de fase [Cole
1968;Winfree 2002;Winfree 2001;Winfree 1997].
Bibliografía
1. Cole, K. 1968, "Electric properties of squid membranes," in Membranaes,ions and
impulses: a chapter of classical biophysics, first edn, Univ of California Press, pp. 115‐239.
2. Hirsch, M., Smale, S., & Devaney, R. 2004, Differential equations, dynamical system and
Introduction to chaos, Second edn, Academic Press.
3. Hodgkin, A. L. & Huxley, A. F. 1952, "A quantitative description of membrane current
and its application to conduction and excitation in nerve", J.Physiol, vol. 117, no. 4, pp.
500‐544.
4. Keener, J. & Sneyd, J. 1998, "Cardiac Propagation," in Mathematical Physiology, 1 edn,
Springer, pp. 313‐332.
5. Meierhenrich, U. 2008, Amino Acid and Asymmetry of Life: Caught in the act formation,
First edn, Springer‐Verlag.
6. Raicu, V. & Popescu, A. 2008, Integrated Molecular and cellular biophysics, firts edn,
Springer.
7. Vollskentein, V. 1965, Biofisica Celular, First edn, Mir.
8. Winfree, A. T. 1997, "Rotors, Fibrillation, and Dimensionality," in Computational Biology
of heart, firts edition edn, A. V. Panfilov & A. V. Holden, eds., Wiley, Chichister, pp. 101‐
135.
9. Winfree, A. T. 2001, "Electrical singular filaments in the heart wall," in The Geometry of
Biological Time, 2nd edn, J. Marsden, L. Sirovich, & S. Wiggins, eds., Springer Verlag, pp.
455‐526.
10. Winfree, A. T. 2002, "A prime number of prime questions about vortex dynamics in
nonlinear media," in Nonlinear dynamics and chaos: where do we go from here?, first edn,
J. Hogan et al., eds., Institute of Physics Publishing, pp. 229‐267.