UNIVERSIDAD PRIVADA SAN JUAN BAUTISTA

FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD

ESCUELA PROFESIONAL DE MEDICINA HUMANA
CURSO DE BIOLOGÍA MOLECULAR

SEMINARIO # 1

ENLACES QUE GOBIERNAN LA MATERIA VIVA

Las actividades de las células se derivan directamente de la actividad de las
moléculas que las constituyen. Es imposible entender las funciones de las células
sin un conocimiento adecuado de la estructura y las propiedades de los principales
tipos de moléculas que forman parte de ellas.
Uno de los objetivos de este tema es suministrar la información esencial acerca de
los aspectos químicos de la materia para poder comprender las bases de la vida.
Una breve exposición de las bases atómicas y moleculares de los seres vivos resulta
una necesidad para poder comprender los siguientes niveles de organización de la
materia viva.
Las bacterias, las levaduras los hongos, los gatos, los perros, los monos, los
elefantes, en fin todos los seres vivos tienen una gran similitud en su composición
elemental. Si se analizan las membranas de todos ellos se
encontrarán moléculas muy semejantes y hasta idénticas que son parte integrante
de las mismas, por solo citar un ejemplo. A continuación se iniciará el estudio de los
aspectos elementales esenciales de la química que permitan comprender los
mecanismos moleculares de organización de los seres vivos:
Entre los elementos más abundantes presentes en los seres vivos están los átomos
de carbono (C), hidrógeno (H), oxígeno (O) y nitrógeno (N), que llegan a representar
más del 99 % de la composición del organismo humano
Con tan solo esos cuatro bioelementos, existen biomoléculas tales como
monosacáridos, polisacáridos, ácidos orgánicos y ácidos grasos, alcoholes, aminas,
triglicéridos, colesterol y esteres del colesterol, además de hormonas esteroides, la
mayoría de los aminoácidos (sin los dos azufrados), algunas proteínas que estén
libres de aminoácidos azufrados, y una infinidad de metabolitos intracelulares y
extracelulares.
La formación de ácidos nucleicos y sus precursores requiere de otro
bioelemento: el fósforo (P). El P forma parte de aproximadamente el 0,5% de los
restantes bioelementos destacados en la composición de nuestro cuerpo

De todo lo anterior se puede destacar que los componentes orgánicos mayoritarios

de los seres vivos requieren de los elementos C, H, 0, N, S y P; para constituir los
lípidos, los glúcidos o carbohidratos, las proteínas y los ácidos nucleicos, son
necesarios estos seis elementos químicos. El resto de los elementos químicos,
aunque pueden estar formando parte de algunas de esas moléculas, presentan
destacadas funciones como iones en las células. El cloruro (Cl ), el potasio (K), el
sodio (Na), el calcio (Ca), el magnesio (Mg), etc, son componentes electrolíticos de
importancia capital para la regulación. del equilibrio hidro-mineral. No menos
importantes se presentan otros en tan ínfimas cantidades que se les consideran
oligoelementos, más adelante se encontrarán algunos ejemplos de su importancia
para nuestro organismo .
La inadecuada ingestión en la dieta de algunos de los oligoelementos puede tener
serias consecuencias sobre la salud humana. La anemia (condición en la cual la
sangre contiene menor concentración de hemoglobina que la normal) microcítica es
la más común de las anemias nutricionales y su causa es la falta de hierro. También
la falta de cobre puede provocar este tipo de anemia.
La deficiencia de zinc ocasiona severos trastornos en la piel entre otros

Pero también los excesos nutricionales en bioelementos son dañinos a la salud. El

fluoruro, un elemento tan renombrado para proteger las caries dentales y que se
utiliza como aditivo a las cremas dentales para prevenir las caries, es causante de
tina enfermedad dental que motea los dientes de forma desagradable. La fluorosis
dental es una condición que es provocada por el consumo excesivo de fluor durante
el periodo de desarrollo dentario, desde el nacimiento hasta los 6-8 años de edad

Concepto DE BIOMOLÉCULAS
Las biomoléculas son las moléculas orgánicas que forman parte de los seres vivos,
con diversos grados de complejidad, desde muy simples hasta muy complejas. Una
característica esencial de las biomoléculas orgánicas es su gran diversidad, a pesar
de tener es su composición un número relativamente pequeño de elementos
químicos (más frecuentes C, H, 0, N, y otros dos en menor proporción, el P y el S).
Estos elementos químicos integran la mayoría de los compuestos orgánicos al
unirse entre sí mediante uniones que se estudiarán a continuación.

LA COMBINACIÓN DE ÁTOMOS Y LAS FUENTES DE ESTABILIDAD

A) El enlace covalente
Los átomos que constituyen una molécula se mantienen unidos por enlaces
covalentes. Este tipo de enlace se genera cuando ¡os pares de átomos que se
unen comparten pares de electrones. Las biomoléculas deben su estabilidad a los
enlaces covalentes que mantienen los átomos adyacentes unidos. Pero además,
muchos de los procesos biológicos que ocurren en la célula viva se producen por
ruptura o formación de algunos de estos enlaces covalentes.
Los átomos de cada elemento químico tienen un número de protones en el núcleo,
lo cual se corresponde con su número atómico, y un número equivalente de
electrones en la envoltura. Estos electrones ocupan los orbitales, que se
caracterizan por un estado energético permitido, que se señala con un número, el
número cuántico principal, y con una letra (s, p, d) que corresponde al orbital.
En cada orbital pueden estar sólo 2 electrones de spin opuesto. En el caso de!
átomo de carbono, que tiene número atómico 6, existen 6 electrones que deberían
ocupar esos orbitales con una distribución 1s2, 2s.2p2.
Pero en el caso particular del C no ocurre así y se originan 4 orbitales híbridos entre
el 2s y los 2p, denominados sp3, que se dirigen hacia los vértices de un tetraedro
Cada uno de estos orbitales sp3 contiene ahora un electrón que puede ser
compartido por ejemplo con un orbital 1s de un átomo de hidrógeno, y formar el
metano CH4, mediante enlaces covalentes sencillos o simples,
Asimismo, en el caso del C se pueden hibridizar los orbitales 2s con sólo dos de los
2p y dar lugar a un orbital híbrido sp2.

El enlace covalente es un enlace fuerte, estable en medio acuoso. Un enlace C-C

simple, donde se comparten 2 electrones, uno por cada átomo de carbono, tiene una
energía de enlace de 85.kcal/mol (356 KJ/mol), lo que significa que una alta cantidad
de energía debe ser suministrada para romper esa unión.
Un enlace covalente doble, por ejemplo C=O, tiene una energía dé 175 kcal/ mol
(732 Kj/mol). Entre los enlaces covalentes que se pueden presentar se destacan los
siguientes:

EnIace Energía k/Imol

H-H 436
C-H 414
C-C 343
C-O 351
C-N 292
O-H 460
N-H 393
C=O 686

Como resultado de la formación de enlaces covalentes entre los átomos surgen los
grupos funcionales que caracterizan a familias de sustancias. A continuación se
estudiarán las agrupaciones atómicas más frecuentes encontradas en las
biomoléculas y que se denominan grupos funcionales

Los principales grupos funcionales:

Las biomóléculas se caracterizan por presentar agrupaciones atómicas o grupos
funcionales, de los cuales dependen muchas de sus propiedades fisicoquímicas.
Entre estos grupos funcionales se pueden distinguir los que se muestran en la tabla

. Principales grupos funcionales presentes en las biomoléculas.

Grupo
Represent. Principales propiedades
funcional

Grupo funcional característico de los alcoholes. En forma

Hidroxilo -OH abreviada R-OH. Puede aparecer en otras biomoléculas
diferentes de los alcoholes.

Si la función carbonilo se encuentra

Carbonilo en un carbono primario es un aldehído R-CHO; si en
C=O
carbono secundario (carbono unido a otros 2 carbonos) el
.
compuesto es una cetona (R-CO-R’).

Grupo que caracteriza a los ácidos orgánicos. Este grupo

Carboxilo -COOH le confiere carácter ácido a las biomoléculas que lo
.
poseen al disociarse.
R-COOH <>R-COO-+H+
Se comporta este grupo corno una base, aceptando con
facilidad H+ del medio. R-NH2 + H+<-> R-NH3+ Amida -
Amino - NH2
CONH2. El grupo hidroxilo de los ácidos carboxílicos es
desplazado por un amino.

Se conoce también como tiol. Dos grupos sulfhidrilo

Sulfhídrilo -SH pueden reaccionar entre sí para formar un enlace
disulfuro, frecuente en las proteínas.
Agrupaciones atómicas derivadas. Los grupos funcionales son capaces de
reaccionar entre sí y originar nuevas agrupaciones atómicas, las cuales tienen
mayor complejidad. Algunas biomoléculas presentan estos tipos de agrupaciones:
Hemiacetales. En la formación de este enlace se produce una reorganización de los
átomos. A los hemiacetales (o hemicetales si el carbonilo era de una cetona)
pertenecen por ejemplo las formas cíclicas de los monosacáridos.
Acetales. Se forman al reaccionar el hidroxilo de los hemiacetales (o. hemicetales) y
otro OH, con formación de una molécula de agua. También el hidroxilo de un
hemiacetal puede reaccionar con un amino (o imino) y formar un enlace N-acetal,
como es por ejemplo el enlace N-glicosídico que une a las bases nitrogenadas con
el azúcar en el caso de los nucleótidos y nucleósidos.

Esteres. Los ésteres se forman al reaccionar un ácido con un alcohol, con pérdida
de una molécula de agua. Se analizarán dos tipos de ésteres por su importancia en
la constitución de algunas biomoléculas.

Éster carboxílico. Formado entre un grupo COOH y un OH. :

Éster fosfórico. Se forma al reaccionar un ácido fosfórico con un alcohol.

Es posible que un éster fosfórico ya formado reaccione con otro grupo OH para
formar un enlace fosfodiéster, como es por ejemplo el que une a los nucleótidos para
formar las moléculas de los ácidos nucleicos.

Tioéster. Un tioéster se forman cuando reacciona un grupo carboxilo con un grupó

sulfhidrilo SH. Algunas biomoléculas con enlace tioéster son compuestos muy
importantes en el metabolismo celular. Este enlace es también importante porque al
hidrolizarse libera gran cantidad de energía útil para muchos procesos.

Amidas. Se forman al reaccionar un grupo carboxilo (COOH) con un amino

(NH2). Este tipo de enlace químico para formar esta agrupación atómica es el que
permite la unión de los aminoácidos para formar los péptidos y las proteínas

Anhídrido de ácido. Un anhídrido de ácido se forma cuando reaccionan ácidos

que pueden ser iguales o diferentes, con pérdida de una molécula de agua Los
anhídridos del ácido fosfórico desempeñan un papel extraordinario en la
conservación y liberación de la energía química en la célula.

La multifuncionalidad. Resulta un hecho notable que en una misma biomolécula se

pueden encontrar varios grupos funcionales, en ocasiones el mismo tipo de grupo
funcional y otras veces grupos funcionales distintos. Más adelante se verá cómo los
monosacáridos, Los nucleótidos, Los aminoácidos y los ácidos grasos presentan
este fenómeno de la multifuncionalidad. Esta propiedad de la mayoría de las
biomoléculas hace mucho más diversa la existencia de la materia orgánica, así
como la forma en que muchas partes de ellas pue4en interactuar por medio de
atracciones o repulsiones. Así por ejemplo un alcohol importante en el metabolismo
de los lípidos (un polialcohol) como es el. Glicerol o glicerina (propanotriol) presenta
tres grupos hidroxílos:

La molécula del aminoácido glicina presenta dos grupos funcionales diferentes,

presentando la siguiente fórmula molecular, en la que puede observarse la presencia
de un grupo amino y otro carboxilo:
Polaridad del enlace covalente. En las moléculas formadas por átomos iguales
unidos a grupos similares los electrones se comparten de manera simétrica, pero en
moléculas cómo el H20, con átomos que poseen diferente
electronegatividad, o en moléculas con átomos iguales pero unidos a grupos
diferentes, El compartimiento del par electrónico es desigual y un átomo, el más
electronegativo, atrae más fuertemente el par electrónico que el otro átomo,
adquiriendo el primero una fracción de carga negativa y el segundo positiva.

Un enlace de este tipo es polar, para distinguirlo del enlace, por ejemplo la molécula
de H2 que es apolar.
En el caso más simple, una molécula ’formada por 2 átomos y un enlace polar, esa
molécula constituye un dipolo eléctrico, con un momento dipolo u (u = q X 4 donde q
es la carga y d la distancia entre los centros de carga opuesta). A consecuencia del
momento dipolo las moléculas tienden a orientarse en un campo eléctrico y a
interactuar favorablemente unas con otras sin ambas son polares. Por el contrario
estas moléculas no interactúan bien con las apolares; Esa es la razón por ejemplo
de que el etanol, que es una sustancia. formada por moléculas polares se disuelve
bien en agua que también es polar mientras que las grasas (triacilglicéridos) que es
una sustancia apolar no. Una regla muy simple es que lo polar tiene afinidad por
lo polar y lo apolar por lo apolar.

Características compuestos
covalentes.

B) La interacciones débiles.
Entre las biomoléculas se pueden establecer interacciones débiles o fuerzas
covalentes que desempeñan un papel muy importante en numerosos e importantes
fenómenos que ocurren en las distintas formas de materia viva. Ejemplo de esto se
pueden encontrar en los procesos de reconocimiento molecular, en la morfo-
estructuración de las macromoléculas, en los proceso de flujo de la información
genética, en la transmisión de señales entre las células y otras:
La interacción eIectrostática o unión salina. Esta interacción se establece
entre átomos con carga eléctrica. Si son de la misma carga se repelen y si son de
carga contraria se atraen. Muchas biomoléculas poseen agrupaciones atómicas que
pueden ionizarse en el medio acuoso de la célula y adquirir carga positiva o
negativa, y es posible así que se establezcan interacciones electrostáticas entre
partes de la misma biomolécula o entre biomoléculas diferentes. La energía de este
tipo de interacción esta dada por la ley de Coulomb.
Donde E es la energía, q1 y q2 son las cargas sobre los dos átomos, r la
distancia entre esos átomos, D la constante dieléctrica del medio y k una constante
de proporcionalidad. Como la constante dieléctrica del H2O es
muy elevada, tiene un valor de 80, la energía de la interacción electrostática de 2
átomos que estén a una distancia de 0.3 nm (3 Ángstrom) es, aplicando esta
fórmula, solamente de 1.4 kcal/mol (5.9 kJ/mol).
El puente de hidrógeno. Aunque también es una interacción débil, el puente de
hidrógeno es crucial en el mantenimiento de la estructura espacial de
macromoléculas como las proteínas y el ADN. Esta interacción además es
responsable de muchas de las propiedades del H20 como solvente. En realidad el
puente de hidrógeno también se establece por una interacción electrostática. En un
enlace covalente entre un átomo de H y otro muy electronegativo, como el O o el N,
los electrones no se comparten equitativamente y son más atraídos hacia el átomo
electronegativo. Se crea así una pequeña carga negativa sobre el O2 o el N, y una
pequeña carga positiva sobre el H. Esta carga positiva pequeña puede a su vez
interactuar con otro átomo electronegativo de otra molécula o de la misma molécula
y así formarse el puente de H.

De igual forma, esta interacción es mucho más débil que un enlace covalente. La
energía de esta interacción es de sólo 1.3 kcal/mol (4.13 kJ/mol), comparada con
unas 100 kcal/mol aproximadamente del enlace covalente. Los puentes de
hidrógeno más fuertes se establecen cuando los 3 átomos se encuentran en una
línea recta. Téngase en cuenta que en una macromolécula como el ADN se
establecen miles de estas interacciones, de ahí su importancia
como fuerza estabilizadora en ésta y otras biomoléculas.
Las interacciones de Van der Waals. Denominadas así en honor del científico que
las descubrió, las interacciones de Van der Waals se originan porque la distribución
electrónica alrededor de los átomos varía con el tiempo. En cada instante la
distribución electrónica alrededor de un átomo no es simétricamente perfecta y,
como los electrones tienen una pequeña carga negativa, se puede originar alrededor
del átomo un pequeño dipolo eléctrico y esta asimetría eléctrica puede inducir en
átomos vecinos una asimetría complementaria, de tal manera entonces que los
átomos se atraen. La atracción entre los dos átomos aumenta a medida que estos
se acercan, hasta una cierta distancia llamada distancia de Van der Waals, si se
acercan más se genera entonces una fuerte repulsión entre esos átomos porque los
orbitales electrónicos se solapan. La energía asociada con esta interacción es muy
pequeña, entre 0.5 a 1.0 kcal/mol por par de átomos. Si las superficies de contacto
entre 2 biomoléculas son extensas la fuerza neta de este tipo de interacción puede
ser significativa.

Las interacciones hidrofóbicas. Estas interacciones se producen cuando

moléculas apolares se encuentran disueltas en un medio acuoso, es decir, rodeadas
de moléculas polares como el H2O. En esas condiciones las moléculas apolares
tienden a agruparse entre sí, separándose del H2O, cumpliéndose así la segunda ley
de la termodinámica, que establece que la entropía total de un sistema más su
entorno siempre tiende a aumentar en los procesos espontáneos. Al agregarse las
moléculas apolares y separarse de las moléculas de agua, estas últimas adquieren
una mayor libertad de movimiento y un mayor desorden o entropía.

--------------------------------------
ENLACE IONICO
Las fuerzas de atracción que mantienen juntos a los átomos en los compuestos son
visibles en los enlaces de tipo iónico, siendo el resultado de la transferencia neta de
uno o más electrones de un átomo o grupo de átomos a otro.

Es necesario que para que pueda darse un enlace iónico uno se los átomos pueda
ceder electrones y por el contrario el otro pueda ganar electrones, es decir, se
produce la unión entre átomos que pasan a ser cationes y aniones. Este tipo de
enlace generalmente se produce entre un elemento metálico (electropositivo) y
elemento no metálico (electronegativo).

La existencia de enlaces iónicos dará formación a compuestos iónicos.

Los iones al poseer cargas eléctricas pueden:

 poseer más electrones que protones, estár cargados negativamente: son aniones.

 tener menos electrones que protones, estar cargados positivamente: son catión.

IONES MONOATOMICOS IONES POLIATOMICOS

CATIONES ANIONES ANIONES
Zn2+ Br- NO2-
Mg2+ O2- SO42-
K+ N3- MnO4-
Ca2+ S2- HPO42

Tabla. Iones monoatómicos y poliatómicos.

Características de compuestos iónicos.

Fuente dateka.unad