Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
Apunte - Apoyo - para - TrabajoPracticos - Demicrobiologia PDF
Apunte - Apoyo - para - TrabajoPracticos - Demicrobiologia PDF
2013
© Verónica Madrid Valdebenito
Facultad de Ciencias Biológicas. Universidad de Concepción (Chile)
2013
2
ÍNDICE
BIBLIOGRAFÍA ............................................................................................... 35
3
Anexos Unidad de Microbiología
4
II.- Materiales y equipos de uso habitual
Mechero de Bunsen
Este sirve para esterilizar la boca de tubos de ensayo, pipetas, portaobjetos,
etc. (flameando suavemente), asas (calentando al rojo).
Placas de Petri
Recipientes de vidrio en los cuales se coloca una determinada cantidad de
medio de cultivo sólido (con agar-agar) hasta completar una altura aproximada de
4 mm. Consta de una base y una tapa. Debe mantenerse cerrada, excepto en los
breves momentos en que debe sembrarse el medio de cultivo.
Pipetas Pasteur
Están formadas por un tubo angosto (5-6 mm) de vidrio esterilizado y
estirado hasta sellar la punta. Sirve para trasladar material líquido (gotas), o bien
para diseminar siembras (acodando el extremo, o formando un “rastrillo” con
éste). Se debe romper la punta y luego flamearla, antes de ser utilizada.
Pipetas graduadas
Son las pipetas corrientes utilizadas en química que se envuelven en papel
y se esterilizan en el horno Pasteur. Al desenvolverse, deben flamearse al
mechero antes de su uso.
Tubos de ensayo
Se encuentran taponados con algodón no hidrófilo o con tapas especiales
(metálicas o de plástico). Debe flamearse la boca del tubo después de sacar la
tapa y antes de volverla a poner en posición.
Matraces
Son los matraces habituales que se encuentran taponados con algodón no
hidrófilo y esterilizados en el Horno Pasteur. Se debe flamear la boca del matraz
después de sacar la tapa y antes de volverla a poner en posición.
Asas
Instrumentos que tienen alambre (nicrom) en la punta, en forma de aguja
(asa recta) o con un pequeño círculo en el extremo (asa circular). Sirven para
efectuar siembras bacterianas desde muestras sólidas o líquidas.
Microscopio
En bacteriología se emplea el objetivo 40x para observaciones sin tinción (a
fresco) y el objetivo 100x para observaciones por inmersión (colocando una gota
de aceite de cedro sobre la preparación teñida.
5
Estufa de cultivo
Las siembras efectuadas con bacterias o productos biológicos en medios de
cultivo deben cultivarse en estufas que se encuentran a la temperatura apropiada
(ej. 25, 35, 37ºC). Esta temperatura depende del tipo de microorganismo
investigado.
Baño María
Consiste en un receptáculo con agua de la llave y que tiene una fuente de
calor para mantener una determinada temperatura. Generalmente se hace hervir
el agua, por ejemplo, para fundir el agar en los tubos con medios de cultivo sólido.
6
III.- MEDIOS DE CULTIVO
7
Entre los medios diferenciales de uso más corriente se encuentran:
8
Indicador de pH: azul de bromotimol
Interpretación: (+) se torna azul oscuro
(-) se mantiene el color verde
9
IV.- TÉCNICAS DE SIEMBRA
Siembra en placa por diseminación (agotamiento): se usa para obtener
colonias aisladas. Se puede diseminar por cuadrantes: En el primer cuadrante se
siembra la muestra clínica directamente, con la tórula; luego con un asa se
disemina desde el primero hacia el segundo cuadrante. Se esteriliza el asa. Se
procede a diseminar desde el segundo hacia el tercer cuadrante. Se esteriliza el
asa. Por último en el cuarto cuadrante se disemina en estría (Fig 1). También se
puede diseminar en superficie colocándo el inoculo en el borde de la placa y
procediendo a recorrer el agar describiendo un zigzag lo más amplio y numeroso
posible con el fin de agotar las bacterias presentes en el asa y así obtener
colonias separadas (Fig 2)
1 2
4 3
Fig 1 Fig 2
10
V.- Identificación de bacterias
1b.- A partir de un medio líquido: Coloque una gota del cultivo en caldo. Extienda
aproximadamente 1 cm2. Agite el tubo antes de sacar su muestra
Tinciones:
Se denominan tinciones simples aquellas que usan un solo colorante, ejemplo:
azul de metileno, permitiendo observar forma u agrupación. Las tinciones
diferenciales en cambio, usan varios colorantes en forma secuencial y permiten
una primera clasificación en base al comportamiento de la bacteria frente a esa
tinción.
11
La tinción de Gram es muy importante, pues es la base para clasificar las
bacterias. Con esta tinción se diferencian:
a) Bacterias Gram positivas, que retiene el primer colorante usado que es el
cristal violeta y aparecen azules. Esto se debe a que su gruesa capa de
peptidoglicán no permite la salida del cristal violeta.
b) Bacterias Gram negativas que no retienen el cristal violeta, porque el alcohol
acetona forma poros en su pared que tiene alto contenido lipídico, de este modo,
se tiñen con el segundo colorante que es la fucsina o safranina y por lo tanto se
ven de color rosado.
c) La tinción de Gram permite además apreciar la forma y agrupación de las
bacterias.
Por tanto, para encontrar el agente etiológico de una determinada enfermedad que
afecta a un paciente o para conocer el estado sanitario de alguna muestra, es
necesario aislar el agente y a veces, además de aislarlo se necesita cuantificar su
presencia en la muestra. Cuando el aislamiento no es posible se recurre a
indicadores indirectos de su presencia. Por ejemplo: detección de componentes
estructurales como: cápsula, fimbrias, flagelos, toxinas, glicoproteínas o productos
del agente infecciosos como: enzimas, toxinas o metabolitos). Por ejemplo:
detección en alimentos de nucleasa termoestable (DNasa) de Staphylococcus
aureus. Las técnicas más usadas son los inmunoensayos: ELISA,
Inmunofluorescencia, aglutinación con látex
12
Los avances tecnológicos han permitido incorporar al laboratorio de rutina, las
herramientas de la biología molecular, es así, como cada día se incrementa la
disponibilidad de técnicas para detección de segmentos de ácidos nucléicos que
son específicos de cada agente. Entre ellas podemos citar: Hibridización mediante
sondas, Reacción en cadena de la polimerasa (PCR).
13
VI.- Métodos para el estudio de la susceptibilidad antimicrobiana
Principios y definiciones:
Es deseable que un agente antimicrobiano ideal sea selectivamente tóxico, es
decir actúe sobre el patógeno más que sobre el hospedador. En base a su sitio de
acción, los antimicrobianos se pueden agrupar en:
- Inhibidores de la síntesis de la pared bacteriana
- Inhibidores de la síntesis proteica
- Inhibición de la síntesis de ácidos nucléicos
- Antimetabolitos
Espectro antibacteriano:
Es el rango de actividad de cada antimicrobiano
14
- Reducido espectro: son restringidos en su acción. Ej Penicilina es muy efectiva
contra cocos Gram positivos y negativos, pero tiene poca actividad contra bacilos
Gram negativos entéricos.
- Con una regla, se mide (en mm), los halos de inhibición alrededor de cada
sensidisco.
- El CLS (Clinical and Laboratories Standards), publica tablas donde aparecen
los diámetros de los halos, los que han sido obtenidos correlacionándolos con
las CMI. Los resultados se catalogan como: susceptible, intermedio y
resistente.
15
Halo de
inhibicion
Disco con
Fig 3 antibacteriano
16
TABLA DE INTERPRETACION DE LOS HALOS DE INHIBICION
17
VII.- Efecto de los agentes físicos, químicos y mecánicos sobre
bacterias
DEFINICIONES:
1) Agentes Físicos
2) Agentes Químicos
3) Agentes Mecánicos
18
1.- Agentes físicos
Calor húmedo
3.- Congelación
4.- Liofilización
19
Radiaciones
Radiaciones ultravioleta (UV): es una radiación electromagnética. Su longitud
de onda varía entre 15 y 400nm. Los rayos UV inciden en los ácidos nucleicos,
produciendo modificaciones químicas (dímeros de timina). Hay desprendimiento
de peróxido que también pueden jugar algún rol en su efecto bactericida. Una de
sus aplicaciones es la esterilización de ambientes y superficies, la radiación UV,
no tiene poder de penetración.
Radiaciones gamma : este tipo de radiación es letal a toda célula viva, debido a
su alta energía es capaz de penetrar la materia e interaccionar con los átomos de
las moléculas liberando electrones, es decir es una radiación ionizante. Entre
otros, es utilizada para esterilizar alimentos, material de usos médico (plástico
desechable).
Agentes mecánicos
Antisépticos
Clorhexidina 2%:
Actúa dañando la membrana celular. Este detergente posee una afinidad alta por
la piel, por lo que su acción se puede prolongar hasta 6 horas después de su uso
20
y además el efecto es acumulativo si se usa periódicamente. Su espectro de
acción incluye bacterias Gram positivas y negativas, virus con envoltura, pero su
acción es débil frente a hongos y nula frente a Mycobacterium tubeculosis
Triclosan 0,5 y 1%
Produce daño a nivel de la pared de microorganismos. Actúa sobre formas
vegetativas de bacterias. Su actividad es poco afectada por la presencia de
materia orgánica. Uso para el lavado de manos de tipo clínico.
Desinfectantes
Cloro 10% solución madre (0,5% sol de uso): desinfección de pisos y baños.
Espectro de acción amplio
Esterilización
21
VIII.- Microbiota Normal
22
Microbiota Normal
1.- Piel 6.- Intestino delgado
Staphylococcus epidermidis Lactobacilos
Difteroides Enterococcus
Propionibacterium acnes Bacteroides
Staphylococcus aureus E. coli
Streptococcus (incluye grupo A)
Peptococcus (micrococos anaeróbicos)
Candida spp.
Bacilos Gram negativos
2.- Boca y faringe 7.- Intestino grueso (90-95% son
anaerobios obligados existen > 300
Streptococcus
Pneumococcus (20-40%) especies).
Peptostreptococcus
Enterococcus Bacteroides spp.
E. coli
Abiotrophia
Enterococcus
Stomacoccus
Staphylococcus Lactobacilos
Klebsiella spp.
Moraxella catarrhalis
Neisseria Actinomycetes
Fusobacterium spp.
Veillonella
Difteroides
Actinomyces spp Clostridium perfringens
Candida albicans
Bifidobacterium
Pseudomonas aeruginosa
Corynebacterium
Proteus mirabilis
Eubacterium
Alcaligenes faecalis
Lactobacilo spp
Staphylococcus epidermidis y S. aureus
Propionibacterium
Rothia
23
Espiroquetas
4.- Senos nasales, laringe, tráquea,
bronquios y pulmones:
Generalmente estériles
5.- Fosas nasales 9.- Tracto genitourinario
Staphylococcus epidermidis Staphylococcus epidermidis
Staphylococcus aureus (20-50%) Enterococcus faecalis
Moraxella catarrhalis E. coli
Streptococcus pneumoniae Lactobacilos
(neumococos) Candida albicans
Haemophilus spp. Bacteroides
Micrococcus spp. Clostridium spp.
NOTA: Este listado no incluye todos los microorganismos presentes o que pueden formar parte de
la microbiota del cuerpo humano.
24
IX MICROBIOLOGIA DE LAS IAAS
25
Factores del ambiente: Aire, agua, superficies, objetos, desechos hospitalarios.
Protocolos de procedimientos del establecimiento de atención.
Los agentes exógenos: provienen desde fuera del paciente, es decir, provienen
del ambiente o de de otras personas.
Agentes endógenos: provienen de la microbiota del paciente que ha perdido el
equilibrio con su hospedador y por tanto pueden comportarse como “agentes
oportunistas” y causar enfermedad. Es importante recordar que un paciente
hospitalizado puede incorporar a su microbiota agentes que estén presentes
dentro del ambiente hospitalario (agentes ”exo-endógenos”).
Algunas definiciones
AGENTE PATOGENO: Aquellos que causan las enfermedades infecciosas
PATOGENESIS: Cómo puede causar daño
PATOGENICIDAD: Capacidad para causar daño
VIRULENCIA: Expresión cuantitativa de la patogenicidad (expresión cuantitativa
de la capacidad para ocasionar daño). Es una propiedad característica de cada
cepa bacteriana
DOSIS INFECTANTE: número de microorganismos necesarios para causar una
infección
TROPISMO: (del griego trope=giro), ilustra como el agente es “atraído” por el
tejido donde encontrará los receptores para adherirse e iniciar su proceso de
colonización.
COLONIZACIÓN: Presencia de microorganismos en la piel o en mucosas, sin
evidencias de respuesta específica clínica o inmunológica.
INFECCIÓN: Respuesta específica del organismo frente a la presencia de agentes
biológicos, hay desarrollo de respuesta inmune. Una infección puede ser
localizada o generalizada y puede cursar en forma subclínica o asintomática ó
como Enfermedad Infecciosa, es decir con presencia de signos y síntomas
atribuibles a la presencia de un agente infeccioso.
26
Principales IIAS
La frecuencia varía según el centro hospitalario y la complejidad del servicio
Infección del Torrente Sanguíneo (ITS) (relacionada a CVC): entre los factores
de riesgo detectados se puede citar: los concernientes al paciente: ingreso en UCI,
ingreso en Neonatología, Recién nacido de bajo peso, Inmunodeprimidos, Enf de
base y a la atención hospitalaria: Cateterización (CVC). Agentes causales
implicados: Staphylococcus aureus, Stafilococcus coagulasa (-), Klebsiella,
Acinetobacter, E. coli, Pseudomonas, Cándida sp.
Infección del tracto urinario (ITU): entre los factores de riesgo detectados se
puede citar: los concernientes al paciente y a la atención hospitalaria. Agentes
etiológicos: E. coli, K. pneumoniae, Proteus, P. aeruginosa, A. baumannii, Cándida
albicans, Enterobacter sp.
Endometritis puerperal: entre los factores de riesgo que se postula pueden jugar
un rol se puede citar: De la paciente: Obesidad. Pobreza. Tiempo de membranas
rotas. Tiempo de trabajo de parto. De la atención hospitalaria: Parto por cesárea,
número de tactos vaginales, profilaxis antibiótica. Agentes etiológicos: el
diagnóstico etiológico sólo se logra en 25 % de los casos, en general son
infecciones endógenas (microbiota anaerobia y aerobia de la vagina), E. coli,
S. aureus, Estafilococos coagulasa (-), Enterococcus, S. pyogenes.
27
antimicrobianos que suprimen la microbiota normal. Lactantes y niños menores
(SPEE).
Se puede agrupar las cepas de S. aureus, según los patrones de resistencia que
presentan:
8Cepas β- lactamasa (+): es frecuente y está asociada a la presencia de un
plásmido. Confiere resistencia a muchos betalactámicos, por ejemplo: penicilina G,
ampicilina, piperaciclina.
8 Cepas MRSA: resistentes a meticilina. La resistencia a meticilina se debe a la
síntesis de una PBP distinta que está codificada por una serie de genes que se
encuentran en el cromosoma en los denominados “casette cromosómico
estafilocócico mec” (SCCmec). Se describen cuatro, siendo los SCCmec I, II yIII,
los que están asociados a infecciones intrahospitalarias.
8 Cepas VISA : han sido aisladas en Japón y USA, en pacientes sometidos a
tratamiento antimicrobianos muy prolongados. Para estas cepas el tratamiento con
vancomicina no ha sido eficaz. Se ha detectado en estas cepas un aumento en la
síntesis pared y alteraciones de ella.
8 Cepas VRSA: aisladas en el 2002, estas cepas poseian el gen vanA de los
Enterococos y eran resistentes a meticilina, pero presentaban susceptibilidad a
otros antimicrobianos.
Además las cepas de S. aureus pueden poseer otros plásmidos que les confieren
resistencia a tetraciclina, eritriomicina, aminoglicósidos y otros.
Profilaxis
Lavado de manos minucioso y cobertura de las superficies cutáneas expuestas
Aseo prolijo de habitaciones y fomites dentro del hospital
Desinfección y limpieza de heridas
Control de manipuladores de alimentos
Tratamiento o cambio de lugar de trabajo de personal hospitalario portador
28
Forma parte de la microbiota normal de individuos (nariz, piel, cuero cabelludo,
orofarínge y tracto urogenital)
Transmisión de persona a persona por contacto directo ó exposición a fomites
contaminados.
Infecciones de origen endógeno.
Grupo de riesgo: pacientes hospitalizados portadores de catéteres o prótesis.
Relativamente avirulentos. Gran capacidad de formar biopelícula
Causan: Endocarditis, Sepsis, ITU, Infecciones de catéteres, cortocircuitos y
prótesis, IHO
29
Características de Rotavirus
Virus ARN, desnudos
Cosmopolitas
Se transmiten por vía fecal-oral y posiblemente respiratorios
Causan diarrea y deshidratación en lactantes
Durante la fase diarreica se elimina gran cantidad de virus
Características de Adenovirus
Virus ADN, desnudos
Se transmiten por contacto (gotitas, deposición, piscinas), fomites
Pacientes en riesgo: niños menores de 14años. Residentes de lugares cerrados
Causan: laringotraqueobronquitis, fiebre faringoconjuntival. Algunos biotipos
causan gastroenteritis
Cryptococcus neoformans
Ampliamente distribuido a nivel mundial. Frecuentemente se aisla de heces secas
de palomas.
Se adquieren por inhalación. Es una levadura neurotrópica, por lo que desde el
plumón migra al sistema nervioso central causando meningoencefalitis
Factores de riesgo: cuadros inmunodepresores como cánceres hematógenos,
VIH/SIDA.
30
Hongos filamentosos
Aspergillus spp.
Las infecciones se adquieren de fuentes exógenas, por inhalación
Las infecciones localizadas no invasoras (colonización) pueden afectar los senos
paranasales, el conducto auditivo. Se puede presentar colonización fúngica de
una cavidad preexistente (ej: absceso pulmonar) sin invasión a tejidos contiguos.
La enfermedad sistémica en que afecta tracto gastrointestinal, riñón, hígado, etc.,
es rara
Factores de riesgo: pacientes que sufren tuberculosis, sarcoidosis o enfisemas
(patologías cavitarias), inmunodepresión.
Fusarium sp.
Son hongos saprofitos, abundantes en la naturaleza.
Las infecciones por este tipo de agentes son poco frecuentes y afectan a personan
con inmunodepresión profunda.
31
X.- ESQUEMAS PARA LA IDENTIFICACION DE BACTERIAS, EN
LABORATORIO
Catalasa Positiva
Staphylococcus, Micrococcus, Stomatococcus, Alloiococcus
Test Bacitracina
Resistente Susceptible
Staphylococcus Micrococcus
Test coagulasa
Positiva Negativa
S. aureus
Test Novobiocina
S R
S. coagulasa (-) Staphylococcus
No saprophyticus saprophyticus
Catalasa Negativa
Streptococcus, Enterococcus
Streptococcus
Alfa Beta Gamma
Bacitracina Test látex:
S
S. grupo A Streptococcus
Grupos
A,B,C,D,F,G
Optoquin Bilis esculina
Resistente: NaCl 6,5%:
Grupo
viridans Enterococcus
Optoquin susceptible:
S. pneumoniae
Bilis(+)
NaCl (+):
Enterococcus
32
BACTERIAS GRAM NEGATIVAS BACILOS
Fermentan Glucosa No Fermentan Glucosa Crecimiento lento
Test oxidasa (-) Test oxidasa (+) Requieren suplementos
Crecen en Mc Conkey Crecen en Mc Conkey No crecen en Mc Conkey
Enterobacteriaceae Bacilos no fermentadores Fastidiosos
Identificación Bioquímica Identificación Bioquímica Pruebas especiales
Ej: Pseudomonas, Acinetobacter, Ej: Brucella, Bordetella,
Lactosa (+) Lactosa (-) Legionella, Bartonella
E. coli Salmonella
Klebsiella Shigella
Enterobacter Proteus
Citrobacter
Crecimiento lento
Requieren suplementos
No crecen en McConkey
Fastidiosos
Requieren pruebas especiales para su identificación
Ej: Haemophilus, Klingella, Eikenella
33
ANEXOS DEL MODULO PARASITOLOGIA
34
Las técnicas de uso más corriente para la realización de un PSD, son:
2.- Para obtener la muestra, usted debe indicar a la madre o al paciente que
despegue la cinta adhesiva desde el portaobjetos y aplique la cinta por su lado
engomado, varias veces en la zona que rodea el orificio anal. A continuación
vuelva a pegar la cinta en el portaobjeto de vidrio, presionando suavemente.
Después de haber tomado la muestra, la persona debe lavarse muy bien las
manos con abundante agua y jabón, escobillándose bien las uñas.
Esta operación debe repetirla por 6 mañanas consecutivas, utilizando un
portaobjeto diferente cada vez, luego de lo cual deberá envolverlos, para llevarlos
al laboratorio.
35
Bibliografía
1.- Forbes, Sahm, Weissfeld. Bayley & Scott Diagnóstico Microbiológico, 11ª Edición,
Buenos Aires, Médica Panamericana 2004
2.- Abarca K., García P., Vial P. Microbiología Clínica. Ediciones U. Católica de Chile.
2001
3.- Kenneth J.R., Ray C. G., Ahmand N., Drew W.L., Plorde J. Sherris Microbiología
Médica. 5º Ed. McGrawHill, 2010
5.- Patrick R. Murray, Ken S. Rosenthal, Michael A. Pfaller. Microbiología Médica 6º Ed.
Madrid: Elsevier Mosby, 2009
6.- Brooks G., Carroll K., Butel J., Morse S., Mietzner T. Jawetz, Melnick y Adelberg
Microbiología Médica. 25ª Ed. McGrawHill, 2010
7.- Martín Yagui Moscoso. Las infecciones intrahospitalarias en Perú. Disponible en:
http://www.epiredperu.net/epired/cursos/epidemiologia_res-mh-06II/epires_15.pdf
9.- Susan S. Huang, M.D., et al. Targeted versus Universal Decolonization to Prevent ICU
Infection
Disponible en: http://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa1207290
36