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DEPARTAMENTO DE BIOQUMICA HUMANA
MATERIA QUMICA BIOLGICA - CICLO LECTIVO 2017
SEMINARIO 4
BIOENERGTICA
Objetivos de aprendizaje
1) Entender los conceptos de espontaneidad y velocidad de una reaccin, como

determinantes de los procesos bioqumicos.
2) Entender los conceptos de cambio de entalpa y entropa en una reaccin qumica.
3) Entender la relacin entre entropa y energa libre.
4) Describir la conexin entre cambios de entalpa y entropa de una reaccin y la

variacin de energa libre.
5) Calcular la variacin de energa libre para una reaccin a partir de las variaciones
estndar.
6) Relacionar la variacin de energa libre con la constante de equilibrio de la misma

reaccin y ser capaz de calcular una a partir de la otra.
7) Describir cmo un sistema puede acoplarse a otro para que una determinada
reaccin pueda ocurrir. Comprender el papel del ATP en el acoplamiento entre
procesos endergnicos y exergnicos.
8) Relacionar la denominacin de compuesto de alta energa con la estructura qumica

de estos compuestos.
9) Calcular la variacin de energa libre para una reaccin de xido-reduccin a partir

de los potenciales de reduccin tabulados.
BIOENERGTICA
La produccin, el almacenamiento y el uso de la energa son tan importantes para

la economa de la clula como lo son para el manejo de los recursos mundiales. Las
clulas requieren energa para realizar trabajo, y en ese trmino incluimos la sntesis de
azcares a partir de dixido de carbono y agua (fotosntesis), la contraccin muscular y la
replicacin del ADN, entre otros. Por lo tanto, se puede definir energa como la capacidad
de realizar trabajo, un concepto fcil de entender cuando se aplica a motores de
automviles y a usinas elctricas. Sin embargo, cuando se trata de energa asociada con
enlaces y reacciones qumicas dentro de las clulas, el concepto se hace menos intuitivo.
En particular, la energa qumica, que es la energa almacenada en un dado material
est relacionada con las energas potencial y cintica, que definiremos a continuacin.
Las interacciones entre tomos son las protagonistas principales de la qumica y se
manifiestan en la energa potencial del sistema. Sin embargo, a pesar de que estas
interacciones son cruciales en las propiedades qumicas de las molculas, hay un
coprotagonista de la misma importancia, que es el movimiento de los tomos que
componen el sistema. Los movimientos de los tomos del sistema determinan la
denominada energa cintica del mismo. La energa cintica est relacionada con la
temperatura del sistema.
Las interacciones entre tomos en el rea de la bioqumica se pueden clasificar en 2

tipos fundamentales:
1) Se entiende por enlace o unin covalente a la interaccin que mantiene
firmemente unidos a los tomos en una molcula y se caracteriza por la existencia de una
densidad electrnica significativa entre los tomos unidos (alta probabilidad de encontrar
electrones en la regin internuclear). A modo de ejemplo, podemos mencionar el enlace
entre los tomos de N en la molcula de N2 o el enlace C-O en una molcula de glucosa.
2) Uniones intermoleculares son las interacciones entre molculas, de magnitud

menor que las que mantienen unidos a los tomos dentro de una molcula (covalentes) o
bien las interacciones que se establecen entre partes alejadas de una macromolcula de
gran tamao, como una protena. Permiten explicar la existencia de distintos estados de
agregacin (slido, lquido, gaseoso) de una sustancia, el plegado de las protenas, y la
interaccin de protenas con medicamentos y con membranas biolgicas.
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Hay fenmenos qumicos que ocurren espontneamente en ciertas condiciones y
otros que no. Todos sabemos, por ejemplo, que el gas de la hornalla se quema en
presencia de oxgeno, o que los cubitos de hielo sacados del congelador se funden a
temperatura ambiente. Poder predecir qu fenmenos ocurren espontneamente y cules
no, es el mbito de estudio de la termodinmica. La factibilidad estar fuertemente influida
por los cambios energticos que ocurren en el proceso, relacionados a su vez con las
uniones qumicas que se forman o se rompen. Sin embargo, como se ver a continuacin,
los cambios energticos no son el nico protagonista.
Los estados estables de un sistema macroscpico se denominan estados de

equilibrio. Los estados de equilibrio comprenden: equilibrio trmico (relacionado con la
temperatura del sistema), equilibrio mecnico (relacionado con la presin del sistema), y
equilibrio qumico (relacionado con la composicin del sistema).
Por otro lado, aun cuando un proceso sea espontneo, el mismo puede ocurrir muy
lentamente. Las velocidades a las que ocurren las reacciones qumicas son el rea de
estudio de la cintica qumica. Las velocidades de reaccin tambin estn determinadas
por los cambios energticos que ocurren en una reaccin, pero dependen de otros
factores, como, por ejemplo, de la presencia de especies que aceleran el proceso
denominados catalizadores, como las enzimas.
En el estudio de la qumica, y en especial de la bioqumica, es habitual alternar

entre descripciones y explicaciones microscpicas de los fenmenos con descripciones
macroscpicas. Por ejemplo, se puede estudiar el fenmeno de la fusin de un cubito de
hielo cuando se lo saca del congelador, en base a cmo interactan las molculas de
agua que lo componen (mirada microscpica) o analizarlo con herramientas de la
termodinmica (mirada macroscpica) o bien es posible caracterizar la reaccin de
hidrlisis del ATP mediante su constante de equilibrio (mirada macroscpica), o bien
analizando el balance entre uniones qumicas que se forman y que se rompen (mirada
microscpica).
La naturaleza altamente estructurada y organizada de los organismos vivos es

sorprendente. Esta organizacin se extiende hasta el nivel celular y molecular. De hecho,
los procesos biolgicos pueden parecer mgicos dado que estas estructuras altamente
ordenadas emergen de un mundo catico y desordenado de objetos inanimados. Sin
embargo, la organizacin visible en una clula o una molcula es el resultado de eventos
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biolgicos que estn sometidos a las mismas leyes fsico-qumicas que gobiernan todos
los procesos, en particular, las leyes de la termodinmica y de la cintica qumica.
Cmo entendemos la creacin de orden a partir del caos? Empecemos diciendo

que las leyes de la termodinmica hacen una distincin entre el sistema y su entorno. Un
sistema se define como la materia dentro de una regin definida del espacio. La materia
en el resto del universo se denomina entorno. Por ejemplo, el sistema puede ser una
solucin dentro de un frasco en un bao termostatizado. Para especificar el estado
diramos si es slido puro, lquido o gas, o una solucin de determinada composicin y
daramos la temperatura y presin. El frasco, el bao y todo lo dems es lo que
denominamos entorno, y el sistema con su entorno es lo que se conoce como universo.
sistema + entorno (ambiente) = universo

sistemas abiertos: intercambian materia y energa con el entorno
La bioenergtica es el estudio cuantitativo de las transformaciones de energa que

ocurren en las clulas vivas y de la naturaleza y funcin de los procesos qumicos
involucrados.
Muchas observaciones cuantitativas sobre la interconversin entre las diferentes
formas de energa llevaron a enunciar dos leyes fundamentales de la termodinmica.
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Primera ley de la Termodinmica
La primera ley es el principio de conservacin de la energa: Para cualquier
cambio fsico o qumico, la cantidad total de energa del universo permanece constante; la
energa puede cambiar de forma o puede transportarse de una regin a otra, pero no
puede ni ser creada ni ser destruida
Como se mencion previamente, hay dos formas principales de energa: cintica y
potencial. La energa cintica es la energa del movimiento, por ejemplo, la que se
encuentra asociada al movimiento de las molculas. La segunda forma de energa es la
potencial o almacenada, crucial en el estudio de sistemas biolgicos y qumicos.
Mquinas Trabajo
hidrulicas til
calor calor
(A) Energa cintica transformada en (B) Parte de la energa cintica es utilizada para levantar un (C) La energa potencial almacenada en el
calor solamente. balde de agua y una pequea parte es transformada en balde puede ser usada para mover mquinas
calor. hidrulicas para llevar a cabo diversos
trabajos.
Formas de intercambio de energa

El calor, o la energa trmica, es una de las maneras en las cuales los sistemas
pueden intercambiar energa. Fenmenos espontneos ocurren con un pasaje de una
zona de mayor temperatura, donde la velocidad promedio del movimiento molecular es
mayor, a una de menor temperatura. Existen diferencias de temperatura entre los
ambientes interno y externo de las clulas, sin embargo, las clulas no pueden utilizar
estas diferencias de energa. An los animales de sangre caliente han desarrollado
mecanismos de termorregulacin. La energa cintica de las molculas es utilizada
normalmente para mantener constante la temperatura del organismo.
Otra forma de intercambiar energa es la realizacin de trabajo. El trabajo puede
ser trabajo mecnico, o trabajo elctrico.
Por ltimo, la energa radiante es la energa cintica de los fotones, u ondas de luz,
y es fundamental en biologa. La energa radiante puede ser convertida en energa
trmica, por ejemplo, cuando las molculas absorben luz y la energa se utiliza para el
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movimiento molecular. En la fotosntesis, la clorofila absorbe energa luminosa y se
convierte en otros tipos de energa, tal como en la energa almacenada en enlaces
qumicos.
Energa potencial
Esta denominacin hace referencia a la capacidad de liberar este tipo de energa
cuando ocurre algn proceso. Consideremos, por ejemplo, una pelota sostenida en la
punta de una torre. La pelota tiene considerable energa potencial (mecnica) porque,
cuando se suelte, la pelota desarrollar energa cintica asociada con su movimiento de
cada. Dentro de los sistemas qumicos la energa potencial se relaciona con las
interacciones, covalentes y/o intermoleculares. Por ejemplo, una mezcla de nafta y
oxgeno tiene mucha energa potencial porque estos compuestos reaccionarn para
formar dixido de carbono y liberarn energa como calor.
Varias formas de energa potencial son importantes en biologa. La principal es la
energa potencial almacenada en los enlaces que conectan los tomos en las molculas.
De hecho, la mayor parte de las reacciones que describiremos a lo largo de la materia
involucran la formacin o ruptura de al menos un enlace covalente. Reconocemos esta
energa cuando los compuestos participan en reacciones que liberan energa. El azcar
glucosa, por ejemplo, tiene alta energa potencial qumica. Las clulas degradan glucosa
continuamente y la energa liberada cuando se metaboliza es utilizada para realizar
muchos tipos de trabajo.
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Otra forma biolgicamente importante de energa potencial es la energa

almacenada en un gradiente de concentracin. Cuando la concentracin de una sustancia
de un lado de una barrera permeable, como una membrana, es diferente de la del otro
lado, el resultado es un gradiente de concentracin. Todas las clulas forman gradientes
de concentracin entre su interior y los fluidos que las rodean, intercambiando nutrientes,
productos de desecho y iones con su entorno. Los compartimientos dentro de la clula
contienen frecuentemente diferentes concentraciones de iones y de otras molculas, por
ejemplo, la concentracin de protones dentro de los lisosomas es unas 500 veces mayor
que la del citosol.
Una tercera forma de energa potencial es el potencial elctrico, la energa de la
separacin de cargas. Por ejemplo, existe un gradiente elctrico de carga de
aproximadamente 200000 volts/cm en la membrana externa de casi todas las clulas.
Interconvertibilidad
De acuerdo al primer principio de la termodinmica, la energa ni se crea ni se
destruye, pero puede convertirse de una forma en otra. En la fotosntesis, por ejemplo, la
energa radiante de la luz se transforma en la energa qumica potencial de enlaces
covalentes entre los tomos de la sacarosa o del almidn. En los msculos y nervios, la
energa qumica potencial almacenada en los enlaces se transforma, respectivamente en
energa cintica y en energa elctrica. En todas las clulas, la energa qumica potencial,
liberada por la ruptura de ciertos enlaces es utilizada para generar energa potencial en
forma de un gradiente de concentracin y elctrico. Esta energa es utilizada para
sintetizar enlaces qumicos o para transportar molculas en contra de su gradiente de
concentracin. Este ltimo proceso ocurre durante el transporte de nutrientes como la
glucosa a ciertas clulas y el transporte de muchos productos de desecho fuera de las
clulas. Dado que todas las formas de energa son interconvertibles la energa puede
expresarse con la misma unidad de medida, la calora o la kilocalora.
Segunda ley de la Termodinmica

Como dijimos anteriormente, los cambios energticos son cruciales para predecir el
comportamiento de los sistemas. Uno tendera a decir que siempre se tiende a llegar a
estados de menor energa. Sin embargo, esto no siempre es as. Por ejemplo, si ponemos
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agua lquida en el freezer, pasar a un estado de ms energa, que es el hielo. Por tal
razn, los termodinmicos, introdujeron la segunda ley de la termodinmica, que requiere
de la introduccin de una nueva funcin de estado de los sistemas, que se denomina
entropa, y tpicamente se denota con la letra S. La termodinmica no puede determinar
valores absolutos de entropa, pero si sus cambios. En un proceso a temperatura
constante el cambio de entropa es S= Q/T, donde Q es el calor intercambiado en el
proceso. La segunda ley de la termodinmica dice que la entropa del universo (un
sistema y su entorno) siempre aumenta en un proceso espontneo, es decir, que el
universo siempre evoluciona hacia el incremento de entropa.
La entropa se puede analizar micrscopicamente y est relacionada con el nmero
de microestados o configuraciones que puede asumir un dado sistema para un estado
macrscopico dado. Esto es una medida del nivel de azar o desorden de un sistema, a
mayor nmero de microestados mayor desorden, por lo cual se podra pensar que la
segunda ley requiere que el desorden del universo siempre aumente. Esta ley parecera
contradecir la experiencia diaria, particularmente en los sistemas biolgicos. Muchos
procesos biolgicos, como la generacin de estructuras bien definidas como una hoja de
un rbol a partir de dixido de carbono y otros nutrientes, claramente aumentan el nivel de
orden y por lo tanto disminuyen la entropa. La entropa puede disminuir localmente en la
formacin de estructuras ordenadas slo si la entropa de otras partes del universo
aumenta una cantidad igual o mayor.
SISTEMAS BIOLGICOS: PRESIN Y TEMPERATURA CONSTANTES
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Un ejemplo puede ayudar a clarificar las leyes de la termodinmica en un sistema

qumico. Consideremos un contenedor con 2 moles de H2 gaseoso de un lado de una
divisin y 1 mol de O2 gaseoso del otro. Si se retira la divisin, los gases se mezclarn
espontneamente para formar una mezcla uniforme. En la mezcla la entropa es mayor
porque un arreglo ordenado (las molculas de H2 por un lado y las de O2 por el otro) se
reemplaza por una mezcla distribuida al azar.
Otros procesos dentro de este sistema pueden disminuir la entropa localmente

mientras aumentan la entropa del universo. Una chispa aplicada a la mezcla inicia una
reaccin qumica en la cual se combinan los gases para formar agua:
2 H2 + O2 2 H2O
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Si la temperatura del sistema se mantiene constante, la entropa disminuye porque
3 moles de dos reactivos diferentes se combinan para formar 2 moles de un nico
producto, por lo que habra menos microestados accesibles. El gas ahora consiste de un
grupo de molculas indistinguibles. Sin embargo, la reaccin libera una cantidad
significativa de calor a su entorno y este calor aumentar la entropa de las molculas del
entorno aumentando sus movimientos al azar. El aumento de entropa en el entorno es
suficiente para permitir que se forme espontneamente el agua a partir de hidrgeno y
oxgeno.
H= Variacin de entalpa
A temperatura y presin constantes es
la variacin en la energa qumica de enlace entre productos y reactantes
H= Hp-Hs < 0 exotrmica

H > 0 endotrmica
S= Variacin de entropa.
Si el desorden aumenta la variacin de entropa es positiva.
Como dijimos, el cambio en la entropa del entorno ser proporcional a la cantidad

de calor liberado por el sistema e inversamente proporcional a la temperatura del entorno.
En los sistemas biolgicos la temperatura (T, temperatura en grados K, Kelvin) se supone
constante. A temperatura y presin constantes se puede demostrar (no lo haremos), que
el cambio de entalpa de un sistema es igual al calor intercambiado por el mismo. De
acuerdo con la definicin macroscpica de entropa, podemos expresar la relacin entre la
entropa (S) del entorno con el calor transferido y la temperatura como:
S entorno = - H sistema/ T
El cambio total de entropa ser: S total = S sistema + S entorno
Sustituyendo: *S total = S sistema - H sistema/ T
y multiplicando por T
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-TS total = -TS sistema + H sistema
La funcin H -TS, es una nueva funcin de estado, tiene unidades de energa y

se conoce como Energa libre de Gibbs y se puede demostrar que es la energa
disponible para realizar trabajo.
G = H sistema -TS sistema
Recordemos que la segunda ley de la termodinmica establece que para que una
reaccin sea espontnea, la entropa del universo debe aumentar.
Si miramos la ecuacin *, entonces la entropa del universo aumentar si y slo si:
S sistema >H sistema/ T o T S sistema >H sistema, o si
G= H sistema -TS sistema < 0
En otras palabras, el cambio en la energa libre debe ser negativo para que una
reaccin sea espontnea en condiciones de temperatura y presin constantes. Un cambio
negativo en G ocurre con un aumento en la entropa del universo, a temperatura y
presin constantes. De esa forma slo debemos considerar la energa libre del sistema
para decidir si una reaccin puede ocurrir espontneamente, dado que la mayora de los
procesos bioqumicos ocurren en esas condiciones.
Pasando a la mirada microscpica, el cambio en entalpa H para pasar de los

reactivos a los productos est dado principalmente por el balance de la energa total de
los enlaces que se forman y/o rompen en la reaccin, dado que la componente de energa
cintica en general juega un rol secundario.
En una reaccin exotrmica, los productos contienen, en general, menos energa
de enlace que los reactivos, la energa liberada es usualmente convertida en calor
(energa del movimiento molecular) y H es negativo.
En una reaccin endotrmica, los productos, en general, contienen ms energa
de enlace que los reactivos, se absorbe calor y el H es positivo.
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Como dijimos anteriormente, las reacciones tienden a proceder pasando a estados
de menor energa, es decir, liberando energa (H < 0), pero hay que considerar tambin
la entropa por el segundo principio de la termodinmica.
Consideremos por ejemplo la difusin de solutos entre una solucin de

determinada concentracin y otra, en la que su concentracin sea menor. Esta reaccin
ocurre porque hay un incremento de entropa. En este proceso el H es casi cero. Por
ejemplo, supongamos una solucin de glucosa 0,1 M separada de un gran volumen de
agua por una membrana a travs de la cual puede difundir. La difusin de la glucosa entre
ambos compartimientos produce un aumento de entropa. La entropa mxima se logra
cuando todas las molculas pueden distribuirse libremente en el mayor volumen posible,
dado que, de esa manera, el nmero de microestados posibles es mximo. Si el grado de
hidratacin de la glucosa (interacciones intermoleculares glucosa agua) no cambia
significativamente por dilucin entonces H ser cero y la variacin de energa libre se
deber solamente a la entropa.
Como se mencion antes, la formacin de interacciones hidrofbicas se produce

con un cambio en la entropa. Esto es, si una molcula hidrofbica como el heptano o la
triestearina se disuelve en agua, las molculas de agua se fuerzan a interactuar con ella
restringiendo su libertad de movimiento. Esto produce un alto grado de orden en su
arreglo que disminuye la entropa del sistema. Dado que hay una disminucin de la
entropa global, las molculas hidrofbicas no se disuelven bien en soluciones acuosas y
tienden a asociarse unas con otras.
El problema del plegado de las protenas ilustra el concepto de energa libre.
Considere que el sistema es una solucin de una protena desnaturalizada en agua. Cada
molcula de protena puede adoptar distintas conformaciones desplegadas, de modo que
el sistema es bastante desordenado y la entropa de las molculas es relativamente alta.
Sin embargo, en condiciones adecuadas, el plegado de la protena ocurre
espontneamente. Por lo tanto, la entropa debe aumentar en algn lugar del sistema o
del entorno. La disminucin de entropa en el sistema no es tan grande cuando se pliega
la protena debido a las propiedades del agua. Las protenas en solucin acuosa
interactan con molculas de agua mediante la formacin de puentes de hidrgeno o por
interacciones inicas. Algunas molculas (no polares) no pueden formar puentes de
hidrgeno o uniones inicas. Las interacciones de las molculas no polares con el agua
no son tan favorables como las interacciones entre las molculas de agua. Las molculas
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de agua en contacto con las superficies no polares envuelven a la molcula no polar,
ordenndose ms que si estuvieran libres en solucin.
Cuando se juntan dos molculas no polares, algunas molculas de agua se liberan

de modo que pueden interactuar libremente con el resto de las molculas de agua. Por lo
tanto, las molculas no polares tienen tendencia a agregarse en agua porque la entropa
del agua aumenta por la liberacin de estas molculas de agua. Este fenmeno,
denominado efecto hidrofbico promueve muchos procesos bioqumicos. Cmo se
favorece el plegado? Algunos aminocidos tienen grupos no polares. Estos tienen una
gran tendencia a asociarse con otros dentro de la protena plegada. El aumento en la
entropa del agua resultante de la interaccin de estos aminocidos hidrofbicos ayuda a
compensar las prdidas de entropa inherentes al plegamiento.
Las interacciones hidrofbicas no son la nica forma de estabilizar una estructura.
Muchos enlaces dbiles, incluyendo el puente de hidrgeno y las interacciones de Van
der Waals se forman durante el plegado. Aunque estas interacciones reemplazan
interacciones con agua que ocurren en la protena desplegada, el resultado neto es un
cambio favorable de entalpa del sistema.
El proceso de plegado puede ocurrir cuando la combinacin de entropa asociada
con el efecto hidrofbico y cambio de entalpa debido a puentes de hidrgeno e
interacciones de Van der Waals hace que la energa libre total disminuya. Cabe destacar
que la resultante de estas mltiples interacciones (favorables y desfavorables) da lugar a
cambios netos de energa libre que en general son muy pequeos, ilustrando la sutileza
con la cual la naturaleza modula las propiedades de las biomolculas.
Dado que los sistemas biolgicos generalmente se mantienen a presin y

temperatura constantes es posible predecir la direccin de una reaccin qumica
utilizando la energa libre como criterio de espontaneidad. Todos los sistemas evolucionan
de forma tal de minimizar su energa libre. En general nos interesa lo que ocurre con la
energa libre cuando una molcula o configuracin molecular cambia a otra. Nuestro
inters es ms con los cambios relativos de energa, en particular con la diferencia entre
los valores de antes y despus del cambio. Este cambio de energa libre est dado por
G= G productos G reactivos
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En conclusin (a temperatura y presin constantes):
Si G es negativo para una reaccin qumica o proceso mecnico, la
reaccin o proceso ocurrir espontneamente
Si G es positivo, ocurrir la reaccin inversa
Si G = 0 ambas reacciones (directa e inversa) ocurrirn a la misma
velocidad, y la reaccin estar en equilibrio.
Muchas reacciones biolgicas producen un aumento en el orden, y por lo tanto una

disminucin de entropa. Un ejemplo obvio es la formacin de protenas. Una solucin de
molculas de protena tiene una menor entropa que una solucin de aminocidos libres
porque el movimiento libre de los aminocidos en una protena est restringido cuando
estn formando parte de una cadena. Para que ocurra la unin de los aminocidos tiene
que haber una disminucin compensatoria en energa libre en algn lugar del sistema.
El G de una reaccin es la diferencia de energa libre de los productos (estado

final) menos la energa libre de los reactivos (estado inicial). Dado que G es una funcin
de estado, el G es independiente del camino (o mecanismo molecular) de la
transformacin. El mecanismo de la reaccin no tiene efecto en el G. El G para la
oxidacin de la glucosa a dixido de carbono y agua es el mismo si ocurre por combustin
en un tubo de ensayo o por una serie de pasos catalizados por enzimas. El G no provee
informacin sobre la velocidad de una reaccin. Un G negativo indica que la reaccin
puede ocurrir espontneamente pero no significa que ocurrir a una velocidad
apreciable. Eso depende de la cintica de la reaccin, por ejemplo, de la presencia o
ausencia de catalizadores que puedan modificar lo que se conoce como energa de
activacin, que est directamente relacionada con la velocidad de la misma.
La variacin de energa libre de una reaccin depende de la temperatura, presin y

concentracin inicial de sustratos y productos. La mayora de las reacciones biolgicas,
como otras que ocurren en soluciones acuosas tambin son afectadas por el pH de la
solucin.
El G es el cambio de energa libre a 298 K (25C), 1 atm, pH 7 (en agua pura) y
cuando las concentraciones de todos los compuestos, excepto los protones son 1M y se
est a pH 7. Estas condiciones se conocen como condiciones estndar. El signo depende
de la direccin en la cual se escribe la reaccin. Si de A a B es positivo entonces de B a A
ser de igual valor, pero signo opuesto.
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La mayor parte de las reacciones difieren de las condiciones estndar,

especialmente en las concentraciones. Sin embargo, se puede deducir en base a
argumentos termodinmicos, que los cambios de energa libre tienen la siguiente
dependencia con las concentraciones iniciales:
G = G + RT ln (productos)
(reactivos)
donde R es la constante de los gases = 1,987 cal/mol K y T es la temperatura (K).
Consideremos la siguiente reaccin:
Gliceraldehdo-3-P Dihidroxiacetona fosfato
G = -1840 cal/mol + 1,987 cal/mol K x 298 K x ln (DHAP)

(G3P)
De esta expresin se puede calcular G para cualquier concentracin de reactivos

y productos.
Si ambas concentraciones son 1M entonces

G = G = -1840 cal/mol
porque RT ln 1= 0
Gliceraldehdo-3-P Dihidroxiacetona fosfato
La reaccin proceder de izquierda a derecha, es decir, en la direccin de

formacin de DHAP.
Si la concentracin inicial de DHAP es 0,1 M y la de G3P es 0,001 M manteniendo

las otras condiciones, entonces el cociente es 100 y el G = + 887 cal/mol y la reaccin
proceder hacia la formacin de G3P.
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En la reaccin donde A + B C entonces el
G = G + RT ln (C)
(A)(B)
Unidades
Calora es la cantidad equivalente de calor requerida para elevar la temperatura del
agua de 14,5 C a 15,5C
1 kilocalora = 1000 caloras
1 Joule, es la cantidad de energa necesaria para aplicar una fuerza de 1 Newton
en una distancia de 1 m
1 kilojoule = 1000 joules
1 kcal = 4,184 kJ
Cuando una mezcla qumica est en equilibrio qumico, est en el estado de

energa libre mnima: no se genera ni se libera energa libre. De esa forma en el equilibrio
podemos escribir:
0= G = G + RT ln C
C en el equilibrio es la constante de equilibrio Keq, y entonces
G = - RT ln Keq
G = -2,3 RT log Keq= -1362 log Keq en condiciones estndar.
Por lo tanto, si se conocen las concentraciones en el equilibrio, se puede calcular el

G. Por ejemplo, la Keq en la reaccin anterior es 22,2. Sustituyendo se calcula el G
= -1840 cal /mol.
La ecuacin tambin puede escribirse como Keq= 10(-G/2,3RT), de lo que se

deduce que, si el G es negativo, el exponente ser positivo y entonces Keq ser mayor
que 1, o sea que se favorece la formacin de productos. En cambio, si G es positivo,
entonces el exponente ser negativo y la Keq ser menor que 1.
Aunque el equilibrio qumico parece estable y esttico, en realidad es un estado
dinmico. Las reacciones directa e inversa proceden a exactamente la misma velocidad,
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cancelndose. Cuando una enzima y otro catalizador aumentan la velocidad de una
reaccin tambin aumentan la de la reaccin inversa, por lo tanto, el equilibrio se alcanza
antes que cuando no hay catalizador. Sin embargo, la constante de equilibrio y el G
son los mismos en presencia de catalizadores.
Es importante indicar que el G puede ser grande, chico o el mismo que el G y

esto depende de las concentraciones de reactivos y productos. El criterio de
espontaneidad de la reaccin es G. Reacciones que no son espontneas cuando se
utiliza el G pueden serlo ajustando las concentraciones de reactivos y productos.
Gradiente de concentracin
Una clula a menudo acumula sustancias como la glucosa en mayores
concentraciones que las que existen en el entorno. En consecuencia, las clulas deben
transportar estas sustancias en contra de un gradiente de concentracin. Calculemos la
cantidad de energa necesaria para transferir 1 mol de sustancia desde afuera de la clula
al interior.
Dado que esta reaccin simple de transporte no involucra la formacin ni la ruptura
de enlaces covalentes y que no se libera ni se toma calor entonces el G = 0.
Por lo tanto, el G = G + RT lnC = RT ln (C2/C1) donde C2 es la concentracin
inicial de la sustancia en el interior de la clula y C1 es su concentracin fuera de la
clula. Si la relacin C2/C1 es 10, entonces a 25C: G = RT ln 10 = + 1,36 kcal por mol
de sustancia transportada.
Se supone que la sustancia es idntica dentro y fuera de la clula y que la
sustancia no sufre ningn cambio qumico por el transporte. Dado que el transporte en
contra de gradiente tiene un G positivo (C2 es mayor que C1) claramente no ocurre en
forma espontnea. Para que ocurra el transporte se requiere un aporte de energa, que a
menudo proviene de la hidrlisis del ATP. En cambio, cuando una sustancia se mueve a
favor de su gradiente, el G es negativo y el transporte puede acoplarse a una reaccin
donde el G es positivo, por ejemplo, el transporte de una sustancia en contra de su
gradiente.
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Metabolismo
Cmo obtiene una clula poder reductor y energa de su entorno? Cmo
sintetiza los bloques que formarn sus macromolculas y luego stas?
Estos procesos constituyen una red de reacciones qumicas muy integradas
conocidas como metabolismo. El metabolismo tiene un diseo coherente que contiene
muchos motivos comunes. Estos incluyen el uso de una moneda corriente y la aparicin
de un nmero limitado de intermediarios activos. De hecho, alrededor de 100 molculas
son comunes a todas las formas de vida. Adems, si bien el nmero de reacciones del
metabolismo es enorme, el nmero de tipos de reacciones es pequeo y sus mecanismos
son generalmente muy simples. Las vas metablicas tambin se regulan en forma
semejante.
Los organismos vivos requieren un aporte continuo de energa libre con tres
propsitos principales
a) realizar trabajo mecnico en la contraccin muscular y otros movimientos
celulares
b) transporte activo de molculas e iones
c) sntesis de macromolculas y de otras biomolculas
La energa necesaria para realizar estos procesos que mantienen el organismo en

un estado alejado del equilibrio proviene del entorno.
La primera ley de la termodinmica dice que la energa no puede ser ni creada ni
destruida. La cantidad de energa del universo es constante. Sin embargo, puede
convertirse de una forma a otra.
Los organismos fotosintticos, o fototrofos, usan la energa del sol para convertir
molculas simples, pobres en energa en molculas ms complejas, ricas en energa que
17
sirven como combustibles. En otras palabras, transforman la energa luminosa en energa
qumica. Los quimiotrofos obtienen energa qumica de la oxidacin (reaccin con
oxgeno) de los alimentos generados por los fototrofos.
La energa qumica obtenida de la oxidacin de compuestos carbonados puede ser
utilizada para lograr una distribucin desigual de iones a travs de una membrana,
resultando un gradiente inico. Este gradiente es una fuente de energa que puede usarse
para mover molculas a travs de las membranas, puede convertirse en otros tipos de
energa qumica o puede transformarse en informacin en forma de impulsos nerviosos.
Adems, la energa qumica puede transformarse en energa mecnica. Convertimos la
energa qumica de un combustible en cambios en la estructura de protenas contrctiles
lo que resulta en la contraccin muscular y en el movimiento. Finalmente, la energa
qumica impulsa las reacciones de biosntesis.
El metabolismo es esencialmente una serie de reacciones enlazadas que
comienzan con una molcula en particular y la convierten en otra u otras en forma
cuidadosamente definida. Estas vas son interdependientes y su actividad est coordinada
por mecanismos muy sensibles.
Podemos dividir el metabolismo en dos clases:
1) CATABOLISMO: Reacciones que convierten energa en formas biolgicamente
tiles
2) ANABOLISMO: Reacciones que requieren del aporte de energa para ocurrir.
Algunas reacciones son anfiblicas, o sea que participan tanto del catabolismo
como del anabolismo.
Una va metablica debe satisfacer mnimamente 2 criterios: ser especfica y ser
termodinmicamente favorable.
La especificidad es provista por las enzimas, que modulan la velocidad a la cual el
proceso ocurre. La termodinmica depende del G.
Una reaccin puede ocurrir espontneamente slo si el G, el cambio de energa
libre es negativo. Depende de la naturaleza de los reactivos y de los productos
(expresado en el G) y de sus concentraciones.
Una caracterstica termodinmica importante es que el G total de una serie de
reacciones acopladas es igual a la suma de los cambios de los pasos individuales, dado
que al ser G funcin de estado, sus cambios no dependen del camino elegido.
18
Considere
A B+C G = 5 kcal/mol
B D G= - 8 kcal/mol
A C+D G= - 3 kcal/mol
En condiciones estndar, A no se puede convertir espontneamente en B y C

porque su G es positivo. Sin embargo, la conversin de B a D es termodinmicamente
posible. Dado que los cambios en energa libre son aditivos la conversin de A a C y D
puede ser espontnea. Por lo tanto, una reaccin termodinmicamente no favorable
puede ser impulsada por una favorable acoplada. En este ejemplo el intermediario comn
B acopla ambas reacciones. Las vas metablicas estn formadas por el acoplamiento de
reacciones de forma tal que la energa libre de la va es negativa.
El metabolismo celular se facilita por el uso de una moneda corriente de

intercambio energtico, el ATP. Parte de la energa libre producida de la oxidacin de los
alimentos y de la luz se transforma en ATP que acta como dador de energa libre en
procesos como movimiento, transporte activo o biosntesis.
El ATP es una molcula rica en energa potencial qumica porque contiene dos
enlaces fosfoanhidrido. Una gran cantidad de energa libre se libera cuando el ATP se
hidroliza (reacciona con una molcula de agua rompindose) a ADP y Pi (G= - 7,3
kcal/mol) o cuando el ATP se hidroliza a AMP y PPi (G= -10,9 kcal/mol). El valor real
del G depende de la fuerza inica del medio y de la concentracin de magnesio. En
condiciones tpicas el valor es aproximadamente de 12 kcal/mol.
19
La energa libre producida en la hidrlisis de ATP es utilizada para impulsar
reacciones que requieren un aporte de energa libre, como la contraccin muscular. A su
vez, el ATP se forma a partir de ADP y Pi cuando el combustible se oxida en los
quimiotrofos o cuando los fototrofos atrapan la luz. El ciclo de ATP/ADP es una forma
fundamental de intercambio de energa en los sistemas biolgicos.
Supongamos que el G para la conversin de A B es + 4 kcal/mol. La Keq a

25C se puede calcular y ser de:
Keq= 1,16 10-3 = (B)

(A)
O sea que si la relacin molar B/A es igual o mayor que ese nmero entonces A no
puede transformarse en B. Sin embargo, A puede convertirse en B en estas condiciones
si la reaccin se acopla a la hidrlisis de ATP.
A + ATP + H2O B + ADP + Pi + H+ G= -3,3 kcal/mol,
que es la suma de los valores para la conversin de A a B y para la hidrlisis de

ATP.
A pH 7 la constante de equilibrio ser:
Keq= (B) (ADP) (Pi) = 2,67 102

(A) (ATP)
(B)eq= Keq x (ATP)

(A) (ADP) (Pi)
El sistema generador de ATP de las clulas mantiene la relacin (ATP)/(ADP).(Pi)

en niveles de aproximadamente 500 M-1. Para esa relacin:
(B)eq = 2,67 102 x 500 = 1,34 105,
(A)
20
lo que significa que la hidrlisis de ATP permite que A se convierta en B. Esto ocurrir
hasta que la relacin (B)/(A) alcance el valor de 1,34 105, que es cuando se alcanza el
equilibrio.
Las clulas mantienen un alto nivel de ATP utilizando sustratos oxidables o luz
como fuente de energa libre. La hidrlisis de una molcula de ATP cambia la relacin de
equilibrio por un factor de 108. En forma general, un nmero n de molculas de ATP
cambian la relacin en un factor de 108n.
En general A y B pueden considerarse no slo como especies qumicas diferentes
sino tambin pueden representar conformaciones activadas e inactivadas de una
protena. A travs de tales cambios en la conformacin, un motor molecular como la
miosina, la quinesina o la dinena convierten energa qumica del ATP en energa
mecnica.
Alternativamente A y B podran representar concentraciones de iones o molculas
afuera y adentro de una clula como ocurre en el transporte activo de un nutriente.
Comparando el G para la hidrlisis del ATP (-7,3 kcal/mol) con el de la hidrlisis

de glicerol-3-P (-2,2 kcal/mol) se deduce que el ATP tiene una mayor tendencia a
transferir su fosfato terminal al agua que el glicerol-3-P. Dado que el G depende de la
diferencia en las energas libres de los productos y de los reactantes, deben analizarse las
estructuras del ATP y del ADP y Pi.
Pasando a un anlisis microscpico del proceso, podemos considerar tres factores:

a) estabilizacin por resonancia (a mayor deslocalizacin de la carga se espera que
la especie sea ms estable): el ADP y particularmente el Pi se estabilizan ms por
resonancia que el ATP (tiene menos estructuras posibles de resonancia, y por ende
menos capacidad de delocalizar la carga).
b) repulsin electrosttica: el ATP tiene mucha repulsin electrosttica -cuatro
cargas negativas a pH 7- que se reduce cuando la molcula se hidroliza.
c) estabilizacin debida a la hidratacin: el agua se une ms eficientemente al ADP
y Pi que a la parte fosfoanhidrido del ATP y por lo tanto el ADP y el Pi se estabilizan por
hidratacin.
21
Rib Adenina
Hidrlisis con disminucin

de la repulsin de cargas
Rib Adenina
Estabilizacin por
Ionizacin
resonancia
Rib Adenina
Hidrlisis del ATP
Formas de resonancia para el grupo fosfato
Variacin de energa libre en reacciones de oxidacin y reduccin (redox)
En una reaccin redox se transfieren electrones entre los reactantes, una sustancia
se oxida (pierde electrones, o ms precisamente equivalentes de reduccin) mientras otra
se reduce (gana electrones). Cualquier reaccin redox se puede considerar como la suma
de dos hemirreacciones, la oxidacin y la reduccin. Por ejemplo, la siguiente reaccin:
22
Fe2+ + Cu2+ Fe3+ + Cu+
se puede considerar como la suma de:

Fe2+ Fe3+ + 1 e-, donde se oxida el Fe2+ y pierde 1 electrn
Cu2+ + 1 e- Cu+, donde se reduce el Cu2+ y gana 1 electrn
Donde Fe2+ y Fe3+ constituyen lo que se denomina un par redox (al igual que Cu2+ y
Cu+).
Cuando dos pares redox se encuentran juntos en solucin puede ocurrir
espontneamente la transferencia de electrones entre el dador de electrones de un par y
el aceptor de electrones del otro. La tendencia a ocurrir de esta reaccin depender de la
afinidad relativa por los electrones del aceptor de electrones de cada par. El potencial de
reduccin estndar (E) es una medida (en Volts) de esta afinidad y se puede determinar
experimentalmente de manera sencilla (segn se explicar en prximas clases) mediante
dispositivos experimentales denominados pilas o celdas galvnicas. Los potenciales redox
de algunos sistemas de inters biolgico se muestran en la siguiente Tabla.
Las posiciones relativas de cada par redox en la tabla permiten predecir la

direccin en la que circularn los electrones cuando se coloquen los dos pares en la
misma solucin. Los electrones fluirn hacia el par con potencial de reduccin ms
positivo, y esta tendencia ser proporcional a la diferencia entre los potenciales de
reduccin (E). Es posible demostrar en base a argumentos termodinmicos (no lo
haremos en este curso) que la variacin de energa libre en las reacciones redox (G) es
proporcional a E.
23
G= -nE o G= -nE,
donde n es el nmero de electrones transferidos en la reaccin y es la constante de

Faraday (23062 cal/volt.mol). Con esta ecuacin podemos calcular la variacin de energa
libre conociendo los E (de las tablas correspondientes). En sntesis, cuando se trabaja con
reacciones redox, se puede contar con los potenciales estndar de reduccin como
herramienta para predecir el G, lo que resulta muy ventajoso.
BIBLIOGRAFA RECOMENDADA
Lehninger Principios de Bioqumica
Harper Bioqumica
Stryer Bioqumica
Devlin Bioqumica (con aplicaciones clnicas)
24

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DEPARTAMENTO DE BIOQUMICA HUMANA

MATERIA QUMICA BIOLGICA - CICLO LECTIVO 2017

1) Entender los conceptos de espontaneidad y velocidad de una reaccin, como

2) Entender los conceptos de cambio de entalpa y entropa en una reaccin qumica.

3) Entender la relacin entre entropa y energa libre.

4) Describir la conexin entre cambios de entalpa y entropa de una reaccin y la

6) Relacionar la variacin de energa libre con la constante de equilibrio de la misma

8) Relacionar la denominacin de compuesto de alta energa con la estructura qumica

9) Calcular la variacin de energa libre para una reaccin de xido-reduccin a partir

La produccin, el almacenamiento y el uso de la energa son tan importantes para

Las interacciones entre tomos en el rea de la bioqumica se pueden clasificar en 2

2) Uniones intermoleculares son las interacciones entre molculas, de magnitud

Los estados estables de un sistema macroscpico se denominan estados de

En el estudio de la qumica, y en especial de la bioqumica, es habitual alternar

La naturaleza altamente estructurada y organizada de los organismos vivos es

Cmo entendemos la creacin de orden a partir del caos? Empecemos diciendo

sistema + entorno (ambiente) = universo

La bioenergtica es el estudio cuantitativo de las transformaciones de energa que

Formas de intercambio de energa

Otra forma biolgicamente importante de energa potencial es la energa

Segunda ley de la Termodinmica

SISTEMAS BIOLGICOS: PRESIN Y TEMPERATURA CONSTANTES

Un ejemplo puede ayudar a clarificar las leyes de la termodinmica en un sistema

Otros procesos dentro de este sistema pueden disminuir la entropa localmente

H= Hp-Hs < 0 exotrmica

Como dijimos, el cambio en la entropa del entorno ser proporcional a la cantidad

El cambio total de entropa ser: S total = S sistema + S entorno

Sustituyendo: *S total = S sistema - H sistema/ T

-TS total = -TS sistema + H sistema

La funcin H -TS, es una nueva funcin de estado, tiene unidades de energa y

G = H sistema -TS sistema

S sistema >H sistema/ T o T S sistema >H sistema, o si

G= H sistema -TS sistema < 0

Pasando a la mirada microscpica, el cambio en entalpa H para pasar de los

Consideremos por ejemplo la difusin de solutos entre una solucin de

Como se mencion antes, la formacin de interacciones hidrofbicas se produce

Cuando se juntan dos molculas no polares, algunas molculas de agua se liberan

Dado que los sistemas biolgicos generalmente se mantienen a presin y

Muchas reacciones biolgicas producen un aumento en el orden, y por lo tanto una

El G de una reaccin es la diferencia de energa libre de los productos (estado

La variacin de energa libre de una reaccin depende de la temperatura, presin y

La mayor parte de las reacciones difieren de las condiciones estndar,

donde R es la constante de los gases = 1,987 cal/mol K y T es la temperatura (K).

Consideremos la siguiente reaccin:

Gliceraldehdo-3-P Dihidroxiacetona fosfato

G = -1840 cal/mol + 1,987 cal/mol K x 298 K x ln (DHAP)

De esta expresin se puede calcular G para cualquier concentracin de reactivos

Si ambas concentraciones son 1M entonces

Gliceraldehdo-3-P Dihidroxiacetona fosfato

La reaccin proceder de izquierda a derecha, es decir, en la direccin de

Si la concentracin inicial de DHAP es 0,1 M y la de G3P es 0,001 M manteniendo

Cuando una mezcla qumica est en equilibrio qumico, est en el estado de

C en el equilibrio es la constante de equilibrio Keq, y entonces

Por lo tanto, si se conocen las concentraciones en el equilibrio, se puede calcular el

La ecuacin tambin puede escribirse como Keq= 10(-G/2,3RT), de lo que se

Es importante indicar que el G puede ser grande, chico o el mismo que el G y

La energa necesaria para realizar estos procesos que mantienen el organismo en

En condiciones estndar, A no se puede convertir espontneamente en B y C

El metabolismo celular se facilita por el uso de una moneda corriente de

Supongamos que el G para la conversin de A B es + 4 kcal/mol. La Keq a

Keq= 1,16 10-3 = (B)

A + ATP + H2O B + ADP + Pi + H+ G= -3,3 kcal/mol,

que es la suma de los valores para la conversin de A a B y para la hidrlisis de