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La Analizar partculas... comando en ImageJ a veces puede ser un poco confuso, y hay que
mirar los resultados con mucho cuidado para asegurarse de que est haciendo lo que creo
que est haciendo.
Sospecho que, en su caso ImageJ es la medicin de las regiones * * blancas y no las
regiones negras. Para estar seguro, seleccione 'Imagen -> Ajustar -> Umbral...'. Si usted
tiene la opcin 'Red' por debajo del histograma, entonces la regin que la orden de umbral
se vuelve roja es la regin que ser analizada. Si eso no es lo que desea, haga clic en la
casilla 'Fondo oscuro' para cambiarlo. Me gusta poner siempre un umbral como esto antes
de ejecutar Analizar partculas... ya que de lo contrario veces ImageJ medir las regiones
negras y algunas veces las regiones blancas... *
El un mtodo simple usando los mnimos locales. Parece que en virtud de estimar algunas
de las dimensiones de las partculas, pero se puede jugar con la tolerancia de ruido para
conseguir un mejor ajuste. El siguiente cdigo se puede pegar en el editor de macros y
ejecutar o, alternativamente, he adjuntado como archivo .ijm.
del ttulo // apropiacin de la imagen original para redireccin de las medidas de intensidad
origTitle = getTitle ();
Bsicamente, ImageJ podra ser la medicin de la superficie de tan slo las partculas (slo los pxeles
negros, en su caso), o podra ser la medicin de la zona de los pxeles negros + Los agujeros
totalmente equipados (pxeles blancos). Esto depender de exactamente qu ajustes que est
utilizando, as que lo mejor es comprobar hasta que est satisfecho. Esperamos que algunos de los
siguientes podran ayudar:
- I * * pensar que ImageJ de 'Analizar partculas' mide generalmente lo que debera de acuerdo con
la opcin 'incluir agujeros', tal como se describe aqu:
http://imagej.nih.gov/ij/docs /menus/analyze.html#ap
En otras palabras, se puede elegir con este ajuste si ImageJ mide el rea de la partcula + el rea del
agujero en el interior, o el rea de la partcula solo. * * Sin embargo (y por desgracia) el retorno de
la inversin que se crea es siempre slo el lmite exterior. Por lo tanto si se mide el retorno de la
inversin despus, el rea del agujero siempre se incluir en el resultado. A menos, eso es ...
- Bajo 'Analizar -> Definicin de Medidas ...' puede elegir el 'lmite de umbral' opcin. Esto significa
que, cuando se miden reas, los pxeles deben contarse slo por encima del umbral. En
consecuencia, si se mide zonas en una imagen en la que se establece el umbral (es decir, se puede
ver las regiones rojas), entonces sern incluidos slo los pxeles que se muestran en rojo. Esto le
permite utilizar las regiones de inters proporcionados por analizar partculas presentes para medir
reas sin agujeros.
Pete
* -Will, son reas nmero de pxeles * El rea de un solo pxel ... encontrado en la imagen ->
Propiedades ... No estoy seguro de si tiene el tamao de pxel disponible para sus imgenes.
Cmo puedo hacer el anlisis de las partculas de la imagen dada?. Available from:
https://www.researchgate.net/post/How_can_I_do_particles_analysis_for_the_given_picture
[accessed Jun 5, 2017].
Otra cosa que puede que desee tener en cuenta es cmo una 'partcula' se define en el primer lugar
... que implica la idea de 'conectividad'.
La cuestin principal es si dos pxeles se consideran parte de la misma partcula si son solamente
diagonal adyacentes entre s .... si no, deben ser vertical u horizontalmente adyacente. He adjuntado
2 imgenes para mostrar lo que quiero decir - partculas distintas se muestran en diferentes colores.
Si las conexiones diagonales se les permite ( '8-conectividad', porque hay 8 pxeles vecinos) a
continuacin, la imagen contiene slo 1 de partculas. Si no, la imagen contiene 3 partculas ( '4-
conectividad'). reas tambin se ven afectados.
Creo Analizar partculas ... usa 8-conectividad, es decir, un menor nmero de partculas con
superficies ms grandes. Si quieres 4-conectividad en cambio, me temo que tendr que utilizar otro
comando.
Una opcin es instalar Fiji - www.fiji.sc - que es bsicamente ImageJ con muchas caractersticas
adicionales y plugins aaden. Esto proporciona una Complementos -> Proceso -> comando Buscar
regiones conectadas, lo que le permite decidir si cuentan o no conexiones diagonales:
http://www.longair.net/edinburgh/imagej/find-connected-regions/
Esta es realmente la intencin para los datos 3D, pero funciona para imgenes 2D tambin. Es
posible que tenga que ejecutar Editar -> Invertir primero cambio de sus pxeles blancos y negros.
Desafortunadamente no lo hace de salida para muchas mediciones, pero puede recuentos de salida
de pxeles (es decir, zonas, tipo de) y una imagen etiquetada (es decir, cada regin tiene su propio
valor entero nico). Para visualizar esta imagen ms bien, trata de la imagen -> tablas de bsqueda
-> glasbey.
Si esto no es suficiente para separar las partculas conectados, entonces el comando de cuencas
puede ser muy til, ya que sugiere Kristopher. Tenga en cuenta que Proceso -> Binario -> Cuencas
tiene una preferencia por el ao * * partculas, por lo que si sus partculas no son necesariamente
redonda, entonces esto podra causar demasiada divisin. En ese caso, la Fiji puede instalar el
BioVoxxel Caja de herramientas, que tiene un buen comando 'cuencas estructuras irregulares':
Cmo puedo hacer el anlisis de las partculas de la imagen dada?. Available from:
https://www.researchgate.net/post/How_can_I_do_particles_analysis_for_the_given_picture
[accessed Jun 5, 2017].
REVISAR
http://imagej.net/BioVoxxel_Toolbox