Aminocidos y protenas

Las protenas tienen muchas formas, resultando

en una amplia variedad de funciones

Las protenas constituyen ms del 50% de la

masa seca de las clulas
Las protenas incluyen soporte estructural,
almacenamiento, transporte, comunicacin
celular, movimiento y defensa
 Las Enzimas son un tipo de protenas que
actan como catalizadores, acelerando la
velocidad de la reaccin qumica
Las enzimas pueden realizar sus funciones
reiteradamente, funciones que son vitales para
el proceso de la vida
 Substrate
(sucrose)

Glucose
Enzyme
(sucrase)
OH
H2O
Fructose

HO
Polipptidos

Los polipptidos son polmeros construidos a

travs de un juego de 20 aminocidos
Una protena consiste de uno o ms
polipptidos
Aminocidos

Los Aminocidos son molculas orgnicas

que presentan grupos carboxilo y amino
Los aminocidos difieren en sus propiedades
debido a sus distintas cadenas laterales,
llamados grupos R
 carbon

Amino Carboxyl
group group
 Nonpolar

Glycine Alanine Valine Leucine Isoleucine

(Gly or G) (Ala or A) (Val or V) (Leu or L) (Ile or I)

Methionine Phenylalanine Trypotphan Proline

(Met or M) (Phe or F) (Trp or W) (Pro or P)

Polar

Serine Threonine Cysteine Tyrosine Asparagine Glutamine

(Ser or S) (Thr or T) (Cys or C) (Tyr or Y) (Asn or N) (Gln or Q)

Electrically
charged
Acidic Basic

Aspartic acid Glutamic acid Lysine Arginine Histidine

(Asp or D) (Glu or E) (Lys or K) (Arg or R) (His or H)
 Nonpolar

Glycine Alanine Valine Leucine Isoleucine

(Gly or G) (Ala or A) (Val or V) (Leu or L) (Ile or I)

Methionine Phenylalanine Tryptophan Proline

(Met or M) (Phe or F) (Trp or W) (Pro or P)
 Polar

Serine Threonine Cysteine Tyrosine Asparagine Glutamine

(Ser or S) (Thr or T) (Cys or C) (Tyr or Y) (Asn or N) (Gln or Q)
 Electrically
charged
Acidic Basic

Aspartic acid Glutamic acid Lysine Arginine Histidine

(Asp or D) (Glu or E) (Lys or K) (Arg or R) (His or H)
Polmeros de aminocidos

Los aminocidos estn unidos por enlaces

peptdicos
Un polipptido es un polmero de aminocidos
Los polipptidos varan en su longitud desde
pocos a miles de monmeros
Cada polipptido tiene una secuencia lineal
nica de aminocidos
 Peptide
bond

(a)

Side chains
Peptide
bond

Backbone

Amino end Carboxyl end

(b) (N-terminus) (C-terminus)
Funcin y estructura de protenas

Una protena funcional constiste de uno o ms

polipptidos plegados y enrollados en una
forma nica
 Groove
Groove

(a) A ribbon model of lysozyme (b) A space-filling model of lysozyme

 Groove

(a) A ribbon model of lysozyme

 Groove

(b) A space-filling model of lysozyme

 La secuencia de aminocidos determina la
estructura tridimensional de la protena
La estructura de la protena determina su
funcin
Antibody protein Protein from flu virus
Cuatro niveles de estructura

La estructura primaria de una protena es su

secuencia nica de aminocidos
La estructura secundaria, que se encuentra en la
mayora de las protenas, consiste en los
enrollamientos y pliegues de la cadena polipeptdica
La estructura terciaria est determinada por la
interaccin entre las diferentes cadenas laterales
(grupos R)
La estructura cuaternaria de una protena se compone
de varias cadenas de polipptidos
 La estructura primaria est determinada por la
informacin gentica heredada
 Primary Secondary Tertiary Quaternary
Structure Structure Structure Structure

pleated sheet
+H N
3
Amino end
Examples of
amino acid
subunits

helix
 Primary Structure
1

+H 5
3N
Amino end

10

15 Amino acid
subunits

20

25
 1

+H
5
3N
Amino end

10

15 Amino acid
subunits

20

25

75

80

85 90

95

105
100
110

115

120

125
Carboxyl end
 Los enrollamientos y pliegues de la estructura
secundaria resultan de los puentes de
hidrgeno entre constituyentes repetitivos del
esqueleto polipeptdico
Una estructura secundaria tpica es la hlice
y la hoja o lmina
 Secondary Structure
pleated sheet

Examples of
amino acid
subunits

helix
 Las glndulas abdominales
de la araa secretan fibras de
seda, que contienen protenas
de lmina .
Los filamentos de seda
mantiene la forma de la
telaraa.

Las hebras en espiral son

elsticas, y se estrechan
en respuesta al viento, lluvia
e insectos.
 La estructura terciaria est determinada por
la interaccin entre grupos R, ms que por las
interacciones entre los constituyentes del
esqueleto
Esta interaccin entre grupos R, incluyen
puentes de hidrgeno, enlaces inicos,
interacciones hidrofbicas y de van der Waals i
Los enlaces covelentes del tipo puente
disulfuro pueden reforzar la estructura de la
protena
Tertiary Structure Quaternary Structure
 Hydrophobic
interactions and
van der Waals
interactions

Polypeptide
backbone
Hydrogen
bond

Disulfide bridge

Ionic bond
Polypeptide Chains
chain

Iron
Heme

Chains
Hemoglobin
Collagen
 La estructura cuaternaria resulta cuando dos
o ms cadenas polipeptdicas forman una
macromolcula
El colgeno es una protena fibrosa
constistente de tres polipptidos enrollados
como una soga
La hemoglobina es una protena consistente
de cuatro polipptidos: dos cadenas alfa y dos
cadenas beta
Anemia falciforme: un cambio en la estructura
primaria

Un pequeo cambio en la estructura primaria

puede afectar la estructura y funcin de la
protena
La anemia falciforme, un desorden sanguneo
hereditario, resulta de un solo cambio por
sustitucin de un aminocido de la
hemoglobina
 Normal hemoglobin Sickle-cell hemoglobin
Val His Leu Thr Pro Glu Glu
Primary
Primary Val His Leu Thr Pro Val Glu
structure
structure 1 2 3 4 5 6 7 1 2 3 4 5 6 7

Exposed
Secondary Secondary hydrophobic
and tertiary subunit and tertiary region subunit
structures structures

Quaternary Normal Quaternary Sickle-cell

structure hemoglobin structure hemoglobin
(top view)

Function Molecules do Function Molecules

not associate interact with
with one one another and
another; each crystallize into
carries oxygen. a fiber; capacity
to carry oxygen
is greatly reduced.

10 m 10 m

Red blood Normal red blood Red blood Fibers of abnormal

cell shape cells are full of cell shape hemoglobin deform
individual red blood cell into
hemoglobin sickle shape.
moledules, each
carrying oxygen.
 Normal hemoglobin
Primary Val His Leu Thr Pro Glu Glu
structure 1 2 3 4 5 6 7

Secondary
and tertiary subunit
structures

Quaternary Normal
structure hemoglobin
(top view)

Function Molecules do
not associate
with one
another; each
carries oxygen.
 Sickle-cell hemoglobin
Primary Val His Leu Thr Pro Val Glu
structure
1 2 3 4 5 6 7

Exposed
Secondary hydrophobic
and tertiary region subunit
structures

Quaternary Sickle-cell
structure hemoglobin

Function Molecules
interact with
one another and
crystallize into
a fiber; capacity
to carry oxygen
is greatly reduced.
 10 m 10 m

Normal red blood Fibers of abnormal

cells are full of hemoglobin deform
individual red blood cell into
hemoglobin sickle shape.
molecules, each
carrying oxygen.
Qu determina la estructura de una protena?

Adems de la estructura primaria, las

condiciones fsicas y qumicas pueden afectar
la estructura
Alteraciones en el pH, concentraciones de sal,
temperatura u otros factores pueden causar la
desestructuracin de la protena
Esta prdida de la estructura nativa de la
protena es denominada denaturacin
Una protena denaturada es biolgicamente
inactiva
 Denaturation

Normal protein Renaturation Denatured protein

Plegamiento de la protena en la clula

Es difcil predecir la estructura a partir de su

estructura primaria
Probablemente la mayora de las protenas
deben probar varios estados de plegamiento
antes de encontrar la estructura ms estable
Las Chaperoninas son protenas que asisten
a otras protenas en su propio plegamiento
 Correctly
folded
protein
Polypeptide
Cap

Hollow
cylinder

Chaperonin Steps of Chaperonin 2 The cap attaches, causing the 3 The cap comes
(fully assembled) Action: cylinder to change shape in off, and the properly
1 An unfolded poly- such a way that it creates a folded protein is
peptide enters the hydrophilic environment for released.
cylinder from one end. the folding of the polypeptide.
 Cap

Hollow
cylinder

Chaperonin
(fully assembled)
 Correctly
folded
protein
Polypeptide

Steps of Chaperonin 2 The cap attaches, causing the 3 The cap comes
Action: cylinder to change shape in off, and the properly
1 An unfolded poly- such a way that it creates a folded protein is
peptide enters the hydrophilic environment for released.
cylinder from one end. the folding of the polypeptide.
 Los cientficos utilizan la cristalografa de
rayos-X para determinar la estructura de
protenas
Otro mtodo es la espectroscopa de
resonancia magntica nuclear (NMR), la cual
no requiere la cristalizacin de protenas
Los bioinformaticos utilizan programas
computacionales para predecir la estructura a
partir de las secuencias de aminocidos