Ferrie : diac came il :
EDICION
FUNDAMENTOS DE
BIOQUIMICA
LA VIDA A NIVEL MOLECULAR CAPITULO
a Tiara primera, un pequeo punto en fo gala,
cantena
axquireron la capecitod de autooganicarse y
autorepicase, para termina por generar ls formas de
collars. (Lynette CookPhoto Researchers.)
1. El origen de la vida 4.
‘A. El mundo prebistico
B. Evci
2. Arquitectura celular
A. La eolciin de las clas
1B. Procaints yeucarintes
3. Evolucién de los organismos
‘A. Taxonomy filogenia
BB Los oigenes de a complejdad
CC. Cémo evolocinan los oranismas?
lculas ings sinples que deen orgen
«las primeras macromoliculs biogas. Estas, a su vez,
Introduccion a la
quimica de la vida
Termodindmica
‘A. Primera ley de la termadinmica: leer se consena
1B. Segunde ley dela teodindmica: a entopiatende a aumentar
. Enagia live
.
Equilivis quimies y estado estindar
La via obedee las lye dla temodindica Secolin I-1 Elorigen de ta vida 3
La Bioquimica es, iteralmente, el estudio de la quimica de la vida, Aunque
se superpone con otras disciplinas, como la biologia celular, la genética, la in-
munologéa, la microbiologéa, la farmacologia y la fisiologia, la Bioquimica se
dedica principalmente a un niimero limitado de temas:
1. {Cues son las estructuras quimicas y tridimensionales de las moléculas
biolégicas?
{.Cémo interactian las moléculas biol6gicas entre sf?
{.Cémo sintetizan y degradan las células las moléculas biolbgicas?
{.Cémo conservan y utilizan la energfa las eélulas?
{Cules son los mecanismos que organizan las moléculas biolégicas y
coordinan sus actividades?
66. {Cémo se almacena, transmite y expresa Ia informacién genética?
yee
La Bioquimica, como otras ciencias modernas, se apoya en instrumentos com-
plicados para investigar la arquitectura y el funcionamiento de los sistemas
accesibles para los sentides humanos, Ademas de las herramientas del quimico
para separar, cuantificar y analizar de otras maneras los materiales biol6gicos,
los bioquimicos aprovechan los aspectos biol6gicos distintivos de sus sujetos y
‘examinan las historia evolutivas de los organismos, los sistemas metablicos y las,
‘moléculas individuales. Ademés de sus consecuencias obvins para la salud hu
‘mana, la Bioguimica revela el funcionamiento del mundo natural, y nos permite
conocer y apreciar el estado tinico y misterioso que llamamos vida
ia El origen de la vida
Ciertas caracteristicas bioquimicas son comunes para todos los organismos;
por ejemplo, la forma en que se codifica y expresa la informacién hereditaria, y
Ja manera en que las moléculas biol6gicas se construyen y degradan para obte~
ner energia. La unidad subyacente genética y bioquimica de los organismos mo-
ddernos indica que son descendientes de un solo ancestro. Aunque es imposible
describir exactamente emo surgié la vida, os estudios paleontolégicos y de la-
boratorio dan algunos indicios sobre el origen de Ia vida.
A El mundo prebiético
La materia viva esté formada por un niimero relativamente pequeno de elementos
(cuadro 1-1), Por ejemplo, C, H, 0, N, P, Ca y S forman ~97% del peso seco del
‘cuerpo humano (los seres humanos y la mayorfa de los dems organismos son ~70%%
agua). Los onganismos vivos pueden contener, adem, trazas de muchos otros ele~
‘mentos, incluidos B, F, Al, Si, V, Cr, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, As, Se, Br, Mo,
Cd, Ty W, aunque no todos hacen uso de la totalidad de estas sustancias,
La evidencia fésil de vida més temprana conocida tiene unos ~3,5 mil millo-
nes de aflos (fig. 1-1). La era prel anterior, que comenz6 con Ta forma-
cin de la Tierra hace ~4,6 mil millones de afios, no dejé registro directo alguno,
pero los cientficos pueden duplicar experimentalmente el tipo de reacciones qui
‘micas que pueden haber dado origen a los organismos vivos durante ese perfodo
de mil millones de aii.
La atmésfera de 1a Tierra en-los primeros das probablemente estaba forma-
dda por compuestos pequefios y simples como HO, No, CO» y cantidades meno-
res de CH, y NH, En la década de 1930, Alexander Oparin y J. B. S. Haldane
‘de manera independiente sugirieron que la radiacién ultravioleta del solo las des-
ceargas de los relmpagos habfan causado que las moléculas de Ia atmosfera pri
‘mordial reaccionaran para formar compuestos organicos simples (compuestos de
carbono). Este proceso fue replicado en 1953 por Stanley Miller y Harold Urey,
Cuadro 1-1 Elementos més abundantes en el
‘cuerpo human”
Peso se00
Elemento @
617
no
93
37
50.
33.
13
10
7
07
03
‘lala de Frieden F, Sef Am 1972; 2270), 54-3
JERQeR OQ zOZO
5
-20
Figura 1-1 Mirotsils de clas bactrianas
flamentosas. Est fil stad con un dibujo
interpretative) se hall en una roca de ~3,4 mil millones
de afos de antiguedod en Australia Occidental. (Catsia
de J. Willa Schopt, UCLA) 4 copitlo | Inroduesin ala quimica de la vida
Figura 1-2 Chimeneahidrteral Estas frmaciones del
fondo aceénica se conocen cara “fumarlas negras™
porque os sufues medics que enitendisuets en agua
‘muy caliente prciitan al encontrar el agua mucho més
‘fa del mr. (© 1. Edmond. Ctesia de Woods Hole
Oceanographic Institution.
°
i HL
R-C-0n + NER
i
condensacn itis
u,0+—|— 1,0
Figura 1-3 Reaccién de un did cabutico con ura
amin, Durante a cndensacin se bean los elements
el agua. Ene proceso inversa hil se azega agua
xa coca el enlace amid, nls sistemas vis ls
reaccones de condensacién no son ibremente reverses
quienes someteron a una mezcla de H,O, CH, NHs y Hy descargas eléetricas
durante casi una semana, La solucién que obtuvieron contenia compuestos orgd-
nicos solubles en agus, incluidos varios amiodcidos (que son ls componentes
de las proteinas) yotos compuestos de imporanciabioguimica
Las suposiciones en que se base exptimenta de Milley Urey, espcialmen-
tes composicin del gas utlizado como material inca, fueron cuesionads por
algunos cintfcos, que sugireron qu las primeras moléculas biolGpicas se ge-
neraron de una manera bastante diferente: en la oscuridad y bajo el agua. Las
fumarolas hidrotermales del fondo oceénico, que emitensoluciones de sulfur
reicos a temperatura de aproximadamente 400 °C (ig. 1-2), podran haber
trindado ls condiciones apropiadas para la formaciGn de los aminocdos yotas
molculas orgnicas pequeta a partir de compuestos simple presents en el agua
det mat.
Custiquiera que haya sido su orgen as moléculas organics se transformaron
en los precursors de uta enorme variedad de moléculas biolégicas. Estas pue-
den clasfcarse de muchas manera, seg su composiién y reactivided quin
a En est punto es sl repasar los grupos funcionalesy lo enlaces (disposi
Gin de uniones © puentes) que en dima instancia deteminan I actividad
biolbgica de esas molulas (cuadro 1-2),
B Evolucién quimica
Durante un perfodo de evolucién quimica, las moléculas orgénicas simples
se condensaron para formar otras més complejas, 0 se combinaron por sus ex:
tremos y generaron polimeros de unidades repetidas. En una reaccién de con-
densacién se pierden los elementos del agua, Por lo tanto, Ia tasa de condensa-
cin de los compuestos simples para formar polimeros estables debe ser mayor
‘que su tasa de hidrétisis (ruptura mediante ef agregado de los elementos del
‘agua, fig. 1-3), En el entomo prebistico, los minerales como la arcilla pueden
hhaber catalizado las reacciones de polimerizacién y atrapado los productos de
reacci6n del agua. El tamaiio y la composicién de las macromoléculas prebig-
ticas podrian haberse limitado por la disponibilidad de los pequefios materiales
moleculares iniciales, la eficacia con la que éstos se unieran y su resistencia a
Ia degradacién,
‘Obviamente, la combinacién de diferentes grupos funcionales en una sola mo-
lécula de gran tamaiio aumenta su versatilidad quimica, la que le permite real
zr proezas quimicas que estin lejos del alcance de las moléculas mis simples.
(Este principio de propiedades emergentes puede expresarse como “el todo es
ayor que la suma de las partes”.) Las diferentes macromoléculas con disposi
jones complementarias de grupos funcionales pueden asociarse entre sf (fig. 1-4)
¥y dar origen a configuraciones moleculares més complejas con un nimero mayor
de posibilidades funcionales.
Figura 1-4 Asociacin de molécuas canplemestaris. £1 gupo amina con cate postive interactla
jectrostticamente con el grupo earborlato de carga negtva Secolin I-1_ El orgen de la vida
El apareamiento especifico entre grupos funcionales complementarios permi-
te que un miembro del par determine la identidad y ta orientacién del otro. Es-
a complementariedad hace posible que las macromoléculas se repliquen, 0 ha:
‘gan copias desi, ydirijan el ensamble de una molécula nueva a partir de unidades
Cuado 1-2 Clave para la estructura. Grupos funcionales comunes y uniones en bioguimica
5
‘Nombre del compuesto Earns” ‘Grupo funcional o enlace
Amina RNH: 0 R*NH,
R.NH 0 R,*NH, ° (grupo amino)
RN 0 Ry'NH
Alcohol ROH OH (grupo hidroxilo)
Tiol RSH SH (grupo sulfhidrito)
Bier ROR —0- (enlace cer)
i i
Aldehido RoC C= (grupo carbonilo)
i i
Cetona R-C—R C= (grupo carbonilo)
i i
Acido carboxiiea" R—C—OH oR—C—0-
i
Ester R—C—OR
i
Tioster R—C—SR
5
i
‘Amida R-C—NHy
°
i
R—C—NHR
Imina (base de Sehitt?
Disultaro
ster de fostato”
i
Ester ditostato” R-0-F—0-F—-0"
(erage 3!
i
osfato digster® Ro0-F-0-8
o
=C—OH (grupo carboril) 0
9
i
C—O" (grupo earboxiato)
i i
=C—0~ (enlace ér) R=C— (grupo aco)”
i i
—C—S— (enlace tiogster) R—-C— (grupo acitoy®
9 oO
ai
eas i
NS (grupo amida) RC (grupo aciloy”
ccm)
=S—S— (enlace o puente disulfuro)
3
Ds
Po" (en oso
ou
Teo.
P0-F—0" (gnpo fv
& oa
°
i
—0-P—0~ (enlace fostodiéster)
o
“representa cualquier grupo con crbono, En una moléeua con més de un grupo étos pueden se gules o diferentes
“En condiciones fisoiyicas, estos grupos se fnizan y, por lo tam, Ivan ergs poitivas 0 neat
“Si et undo aun some diferente de un carbon, 6
Capitulo 1 Introduce ala quimica de la vida
a eee asf
Figura 1-5 Replcacién mediante conplementaidad. En este cas siple, un polimera sive como
olde para el ensamble de una molécula complementria, que, debido ala compementaiedad
intramolecular, es una copia exact de! original
‘complementarias mas pequefas, En la figura 1-5 se ilustra la replicacién de un
polimero simple con complementariedad intramolecular. Un fenémeno similar es
Ja base del funcionamiento del DNA, en el que la secuencia de bases de una ca
dena (p. ej. A-C-G-T) especifica de manera absoluta la secuencia de bases de la
ceadena con Ia que se aparea (T-G-C-A), Cuando el DNA se replica, las dos ca
denas se separan y dirigen la sintesis de cadenas hijas complementarias. La com-
plementariedad también es la base de la transcripci6n del DNA para formar RNA
y traducir éste a protefnas.
‘Un momento clave de la evolucién quimica fue ta transicién de los sistemas
de moléeulas generadas al azar a sistemas en los cuales las moléculas estuvie-
sen organizadas y se replicaran de manera espeeifica. Una vez que las molécu~
las adquirieron la capacidad de autoperpetuarse, el entorno primordial debe ha-
berse enriquecido con las moléculas que resultaron més capaces de sobrevivir y
‘multiplicarse, Los primeros sistemas de replicacién fueron sin duda de alguna
forma burdos, con moléculas de la progenie, complementarias de manera im-
perfecta de sus moléculas madres. Con el tiempo, la seleccién natural debe ha-
ber favorecido las moléculas que hacfan copias mas exactas de si
Ba Arquitectura celular
Los tipos de sistemas descritos hasta ahora deben haber tenido que com-
petir con todos los dems componentes primordiales de la Tierra por el uso de
Jos recursos disponibles. Una ventaja selectiva hubiese sido tener un sistema
rodeado y protegido de alguna forma por fronteras. Cémo surgieron estas fron-
teras por primera vez, o incluso de qué estuvieron hechas, es poco claro. Una
teoria es que las vesiculas membranosas (sacos Henos de Iiquido) primero se
tunieron y luego se incluyeron en sistemas autorreplicantes. Estas vesiculas pue-
den haberse transformado en las primeras células.
A La evolucién de las células
Las ventajas de Ia compartimentacién son muchas. Ademés de recibir cierta
proteccién de los efectos adversos del entorno, un sistema cerrado puede mante~
ner concentraciones locales elevadas de componentes que de otra forma se difun-
dirfan y alejarfan. Las sustancias més concentradas pueden reaccionar mas ripido
y aumentar Ia eficacia de la polimerizacién y otros tipos de reacciones quimicas.
‘Un compartimiento rodeado por una membrana que protege su contenido
puede hacerse gradualmente diferente en su composicidn respecto de su entorno.
Las eélulas modemas contienen altas concentraciones de jones, moléculas pe-
{quefias y grandes agregados moleculares que se encuentran s6lo en trazas si es
que se encuentran fuera de ellas. Por ejemplo, la célula de Escherichia coli
. coli) comtiene millones de moléculas que representan unos 3 000 a 6 000
‘compuestos diferentes (fig. 1-6). Una eétula animal tipiea puede contener 100 000
tipos diversos de moléculas,
Las células primitivas dependfan del entorno para obtener materiales de sfn-
tesis. Como algunos de los componentes esenciales se hicieron escasos en la sopa
prebistica, la seleccién natural favoreci6 los organismos que desarrollaron me Secolin 1-2 Arquitectura celular 7
rons 8 6 & LUpopolisactrido
k
mRNA RNA DNA Foefopho
° XX Livonia
~ peta
Figura 1-6 Corte longttial de una clade Ecol El lado derecho dela muestan las macraroéculas més andes y ls agregados molecules. En une
figura mvesira a pred cellar de varias capa y la membrana, El citoplasma cul via, el espacio restate del citoplsma esta repleto de mléculas més
ela pare central ext lena de ribosomas que trabean en la sintesis de equetis y de agua as molculas de agua sean spoximadamente de
proteines.E ado iaquierd dela figura conten un count densa de ONA. _tamafo del punto que fnalza esta fae. (A part de una ilustracion de David
sta iustacén conesponde a une amplaién de millones ce veces. Sl se Goodsell, UCLA)
canismos para sintetizar los compuestos necesarios a partir de precursores sim-
ples pero més abundantes. Las primeras reacciones metabslicas pueden haber
uusado catalizadores metilicos o de arcilla obtenidos de los entornos inorgé-
nicos (un eatalizador es una sustancia que promueve una reaceién quimica sin
‘modificarse en sf). De hecho, los iones metilicos atin son el centro de muchas
reacciones quimicas en las células modernas. Algunos catalizadores pueden
hhaber surgido también de las moléculas poliméricas que tenfan los grupos fun-
cionales adecuados.
En general, las reacciones de biosintesis requieren energia; por ende, las pri
eras reacciones celulares también necesitaron una fuente energética. La even-
tual falta de sustancias preexistentes ricas en energia en el entorno prebidtico debe
haber estimulado el desarrollo de vias metabélicas productoras de energfa. Por
‘ejemplo, la fotostntesis evolucion6 relativamente temprano para aprovechar una
fuente de energia pricticamente inagotable, el sol. Sin embargo, la acumulacién
«de O, generado a partir del HO en la fotosintesis (la atmésfera moderna contiene
tun 21% de O,) represent6 un desaffo més para los organismos adaptados ala vida
en una atmésfera deficiente en oxigeno. Los cambios metabsiicos Finalmente per~
‘mitieron que los organismos no solamente eviten el dafio oxidativo sino que, ade
‘mds, utiicen el O, para el metabolismo oxidativo, una forma mucho més eficiente
dde metabolismo de la energia que la anaerObica, Pueden verse vestigios de la vida
antigua en el metabolismo anaerdbico de ciertos organismos modernos, 8 _Copiulo | dnroduccn ala quinica de la vita
Spit
‘Anabaena (una canobsctria)
Escherichia col
‘Bacillus grande -
@ siepryiceecue
© Ritetie wes
Nocona
+10 »m +
Figua 1-7 ibjoenescala de alma culos
caine,
Los primeros organismos que desarvollaron estrategias metabélicas para sin-
tetizar moléculas orgdnicas, conservar y utilizar la energia en una forma con-
tolada y replicarse dentro de un compartimiento protector fueron capaces de
ropagarse en un nimero creciente de hdbitais. La adaptacién de las células a
diferentes condiciones externas en dltima instancia Ilev6 a la actual diversidad
de las especies. La especializacién de las c&lulas individuales también hizo po-
sible que grupos de células diferenciadas trabajaran juntas en organismos multi-
cclulares.
B Procariontes y eucariontes
‘Todos los onganismos modermos se basan en la misma. unidad morfol6giea, la
célula. Hay dos grupos principales de eélulas: ls eucariontes (lel griego: eu,
bueno 0 verdadero + karion, grano o nue), que tienen un mcleo rodeado por
tuna membrana que contiene su DNA, y los procariontes (del griego: pro, an-
tes), que carecen de nicleo. Los procariontes, que comprenden varios tipas de
bacteras, tienen estructuras relativamente simples y son casi todos unicelulares
(aunque pueden formar filamentos 0 colonas de eélulas independientes). Los eu
cariontes, que pueden ser tanto multicelulares como unicelulares, son mucho mds
complejos que los procariones. (Los virus son entidades mucho més simples
‘que las células y no se clasifican como vivientes porque carecen del aparato me-
tabélico para reproducirse fuera de sus células huésped.)
Los procariontes son los organismos més numerosos y difundidos de la Tie-
ra, Esto se debe a que sus metabolismos variados y a menudo altamente adap-
tables les permiten vivir en una enorme variedad de habitats. Los procariontes
tienen tamaiios que van desde 1 hasta 10 um y una de tres formas bésica (fig
1-7): esférica (cocos), alargada (bacilos) y helicoidal (espirilos). Excepto por
‘una membrana celular extema, que en la mayor de los casos estérodeada por una
pared celular protectora, casi todos Tos procariontes earecen de membranas celu-
lares, Sin embargo, el eitoplasma de los procariontes (su contenido celular) no
€s una sopa homogénea. Se cree que las diferentes funciones metabslicas se le~
van a cabo en distintas egiones del citoplasma (fig. 1-6). El procarionte mejor
caracterizado es Escherichia coli, una bacteria con forma de bastén de 2 pm por
1 jum que habita en el colon de los mamiteros
Las células eucariontes generalmente tienen un digmetro de 10.2 100 jum y,
por lo tanto, presentan un volumen mil a un millén de veces més grande que
los procariontes. Sin embargo, no es el tamafio sino una profusidn de orgénu-
los rodeados por membranas lo que caracteriza mejor a ls células eueariontes
(fig. 1-8). Ademés de un nicleo, las eucariontes tienen un reticulo endoplas-
miatico, el lugar de sintesis de muchos componentes celulares, algunos de los
cuales luego se modifican en el aparato de Golgi. La mayor parte del meta-
bolismo aerdbico tiene lugar en Ia mitocondria en la mayoria de las eélulas
‘eucarionts, y las células que fotosintetzan contienen cloroplastos. Otros or-
_gdnulos, como Tos lisosomas y los peroxisomas, llevan a cabo funciones es-
pecializadas. Las vaeuolas, que son més importantes en las células vegetales,
funcionan en general como depésitos de almacenamiento, El citosol (el cito-
plasma sin los orgdnulos Iimitados por membranas) esté organizado por el el-
toesqueleto, un retculo extenso de filamentos que también confiere ata célula
su forma y Ia capacidad de moverse
Los diversos orgsnulos que compartimentan la lula eucarionte representan
un nivel de complejidad ausente en los procariontes. Sin embargo, é5tos son més
eficientes que los eucariontes en muchos aspectos. Por ejemplo, explotarn las
‘ventajas de la simplicidad y la miniaturizacidn, Sus tasas elevadas de crecimiento
les permiten ocuparnichos ecol6gicos en los que puede haber fluctuaciones dris-
ticas en la disponibildad de nutrentes. Por el contraro, la complejidad de los
ceariontes, que los hace ms grandes y de crecimiento més lento, les brinda una Secolin 1-9. Evolueién de os organisms
9
Membrana nuclear
Figura 1-8 Diagrama de una cua aninal tice acompaada con ajuda organiza ls elementos del citesquleto. Une clula vegeta pica
icaatopraiselecrnicas de sus orginlos. Los organulosrodeados por ‘diferencia prncpamente por la presencia de una pared celular etetory
‘membrana abarcan el nice, el retculo endoplasmic, el sosma, e Clorplsts ene itosl.(Niclen:Tektof-RM, CNRIPhoto Researches;
perorsoa (no ltr), la itocondia, la vacuola ye aparato de Golg. £1 reicula endoplasmic rugoso y aparto de Golgi: Secchi-LecaqueRousse
Imideonai
Lsogoma Membrane cold |
Retulo endoplasmatico liso a
rien contiene cromatna (un complejo de DNA y protein) y el nucléoio fe! UCLAFICNRPhoto Researchers; retculo endoplasmic liso: David M.
sitio de sintess de los bosomas). El retcuo endplasmticarugoso ests PhilipsVisuals Unlimited; mitoconra: CNRUPhoto Researchers isosoma
rodeedo por ribasomas; ereticulo endplasmatca liso, no, Un par de centrilosBiopoo AssociateyPhato Researches.)
ventaja competitiva en entomos estables con recursos limitados. Por lo tanto, es,
erréneo considerar que los procariontes son evolutivamente més primitivos en
‘comparacién con los eucariontes. Ambos tipos de organismos estan bien adapta-
dos a sus respectivos estilos de vida.
[3] Evolucion de los organismos
Es de gran valor rastrear los origenes de las diferentes especies, esto es, de-
finir su historia evolutiva probable, porque el objetivo biolégico de una adaptacién
Dioguimica en especial a menudo se aprecia mejor si se examina cémo evolucion6.
Esta informacién evolutiva frecuentemente es tan Gtil como Ta informaci6n sobre
estructura y quimica para comprender cémo opera la vida en el nivel molecular.
A Taxonomia y filogenia
La prictica de agrupar todos los procariontes en una sola categoria basada en
lo que les falta -un nicleo oculta su diversidad metabstica y su historia evolutiva,
Por el contrario, la diversidad morfol6gica marcada de los organismos eucarion-
tes (considérense las diferencias anatmicas entre, por ejemplo, una ameba, un
roble y un ser humano) enmascara su similitud fundamental en el nivel celular 10 Capitulo 1 Intaduecién a la quimica de la vida
Eukarya Se comprobé que Ios esquemas taxondmicos tradicio-
‘Animales nales (la taxonomia es Ia ciencia de la clasificacién
Archaea biolégica), que se basan en la morfologfa gruesa, son
Hongos inadecuadlos para describ las relaciones reales en-
Bacteria Motos del odo 7 antes ‘re los organismos que se revelan en su histo-
Ciiados ria evolutiva (filogenia).
Hatofos Fragelados Los esquemas de clasificaciGn biolégica
mean basados en las estrategias reproductivas 0 del
Bocterias parpuras
Methanococcus.
‘Thermopraveus
Meossordios desarrollo reflejan de manera més exacta la
historia evolutiva que los basados solamente
en la morfologia de los individuos adultos.
No obstante, las relaciones filogenéticas se deducen
‘mejor al comparar las moléculas poliméricas ~RNA, DNA o prote-
{nas de los diferentes organismos. Por ejemplo, el anilisis del RNA llev6
‘2 Carl Woese a agrupar todos los organismos en tres dominios (fig. 1-9.
‘Archaea (también conocido como Archaeabaeteria) es un grupo de proca-
riontes relacionados lejanamente con otros procariontes (dominio Baeteria, Ila-
Figura 1-9 ho fogendtco que muesta as tes donitios mado a veces Eubacteria), asi como ambos grupos lo est respecto de los eu-
els organisms. Las ames inican el pan de cariontes (Eukarya). Entre las archaea se incluyen algunos organismos poco
legencia a pat de un ancesto comin. Las achaee = comunes: los metandgenos («ue producen CH,), las halobacterias (que pro-
Serene ee ee ‘hes boli liferan en soluciones salinas concentradas) y ciertas terméfilas (que habitan en
ies cccriascon sexs nxt, aguas clientes). La evdenca de que las archaea no son simplemente bacte-
nosey sates rias extrafas estd en su material genético, parte del cual es mis estrechamente
similar al de los eucariontes que al de las bacteria.
EI patrén de las ramas en el diagrama de Woese indica la divergencia entre
los diferentes tipos de organismos (el nacimiento de cada rama representa un an-
‘estro comin). El esquema de tres dominios muestra también que los animales,
Jas plantas y Jos hongos son solamente una pequefia porcién de todas las formas
de Vida, Estos drboes filogenéticos complementan Ios restos files, que brin-
0 (1-6)
todos los procesos inerementan la entropia esto es, el desonden- del universo.
En los sistemas quiimicos y bioldgicos es poco prictico, si no imposible, de-
terminar la entropfa contando todos los arreglos equivalentes de sus componentes,
(W), Sin embargo, hay una expresi6n enteramente equivalente para la entropia que
se aplica a las condiciones de temperatura constante tipicas de los sistemas bio-
lgicos: para un proceso espontineo,
4a
aset 17
Tr 0-7]
Asi, el cambio de entropfa de un proceso puede determinarse experimental-
‘mente a partir de medidas de temperatura
© Energia libre
La espontaneidad de un proceso no puede predecirse a partir del conocimiento
del cambio de entropia solamente. Por ejemplo, 2 mol de Hz y 1 mol de O2,
‘cuando se encienden, reaccionan para formar 2 mol de HO. Aun asf, dos molé-
cculas de agua, cada una de las cuales contiene tres stomos forzados a mantenerse
juntos, son mas ordenadas que las tres moléculas biat6micas a partir de las que
se formaron,
{.Cusl es, entonces, el criterio termodinamico para un proceso espontneo? En
las ecuaciones 1-4 y 1-7 se indica que a temperatura y presién constantes
ae M
AS T T [L-8]
Por lo tanto,
an Tas=0 9}
Este es el verdadero criterio de espontaneidad como fue formulado, en 1878,
por J. Willard Gibbs, que definis la energia libre de Gibbs (G, llamada en ge~
neral simplemente energia libre), como
G=H-TS [1-10]
En consecuencia, los procesos espontincos a temperatura y presién constan-
tes tienen
AG = A= TAS <0
uy
‘Se afirma que estos procesos son exergénicos (del griego: ergon, trabajo). Los
pprocesos que no son espontineos tienen valores de AG positivos (AG > 0) y se
indica que son endergénicos; deben forzarse mediante el ingreso de energia
bre. Si un proceso es exergdnico, su forma inversa es endergénica y viceversa.
Los procesos en equilibrio, aquellos en los que las reacciones directa e inversa
estén exactamente equilibradas, se caracterizan por un AG = 0. Para la mayoria
de los casos, s6lo pueden medirse Ios cambios de Ia energfa libre, Ia entalpia y
Ia entropia (AG, AH y AS), no sus valores absolutos.
Un proceso que se acompaiia por un aumento de la entalpia (A>), To que
se opone a él, puede desarrollarse de manera espontiinea si el cambio de entro-
pfa es suficientemente positivo (AS > 0; cuadro 1-3). Por el contrario, un pro- Secclén 1-4 Termodindmica
15
Cuatro 1-3 Variacién de la espontaneidad de una reacci6n (signo de AG) con los
signos de AH y AS
aH as. AG = aH Tas
= = La reaceidin es favorecda tanto por la entalpia
(es exotérmica) como por la entropia. Es espontinea
(exergénica) a todas las temperatura.
- - La raceisin es favorecida por la entalpia pero
Aesfavorecida por la entropia. Es espontinea solo
a temperatura inferiones a T = AH/AS.
+ + La reaccidn se ve desfavorecida por la entalpia (es
bbendotérmica) pero favorecida por laentropia
[Es espontinea sélo a temperauras superiones
aT = AH/As.
+ - [La reaccidn est desfavorecid tanto por Ia ental como
or la entropia, No es espontinea (es endergsiica)
8 todas las temperatura.
‘ces0 que se acompaiia por una disminucién de Ia entropia (AS < 0) puede ge-
nerarse si el cambio de entalpfa es suficientemente negativo (AH <0). Es im-
portante destacar que un valor negativo elevado de AG no asegura que un pro
eso, como una reaceién quimica, se desarrollard a una velocidad observable.
La velocidad depende de los mecanismos en particular de la reaccién, que son
independientes de AG.
‘La energia libre asf como 1a energfa, Ia entalpfa y la entropia son funciones
de estado, En otras palabras, sus valores dependen solamente del estado actual
© de las propiedades del sistema, no de cmo el sistema lleg6 a ese estado. Por
1 tanto, as medidas termodindmicas pueden realizarse considerando sélo el es-
tado inicial y el final del sistema e ignorando todos los cambios de entalpia y
entropia que se produjeron entre ellos. Por ejemplo, es imposible medir directa
‘mente el cambio de energfa de la reaccién de la glucosa con el O3 en un orga
rismo vivo porque hay numerosas reacciones quimicas que se desarrollan de ma-
nera simultinea. No obstante, como AG depende sdlo de los estados inicial y
final, la combustién de la glucosa puede analizarse en cualquier aparato ade-
cuado, utilizando los mismos materiales (glucosa y 0.) y productos finales (CO,
y HO) que se obtendrian in vivo.
D Equilibrios quimicos y estado estandar
La entropia (desorden) de una sustancia aumenta con su volumen, Por ejem-
plo, un conjunto de moléculas de gas, que ocupan todo el volumen disponible,
Teva su entropfa al maximo. De la misma forma, las moléculas disueltas se dis-
tribuyen uniformemente por todo el volumen de la soluciGn, La entropia es en-
tonces una funcién de la concentracién,
‘i Ia entropfa varia con la concentraci6n, también debe hacerlo la energia
libre. Asf, el cambio de energia libre de una reaceién quimica depende de la
‘concentracién tanto de reactivos como de productos. Este fenémeno tiene gran
importancia porque muchas reacciones bioguimicas se producen en cualquier
direecién en funcién de las concentraciones relativas de los reactivos y los
productos,
Las constantes de equilibrio se relacionan con AG. La relacidn entre la con-
ccontracién y la energia libre de una sustancia A es aproximadamente
Ga=
R= RT Inf] 0-12) 16 Caplio 1 Introducién ata guimica de a vida
CALCULOS ILUSTRATIVOS 1-1
El cambio de enerpia libre de una reaccién es
=15KJ-mol~', Cudl es la constante de
ccquilbrio dela reaccién?
Como AG? es un dato conocide, se puede
ublizar la Ee. 1-17 para caleular Kg
Supuesta una temperatura de 25 °C
(098K):
Kea e8r
(180005 ma 'Yh3 14" mel 998K)
donde Gy se conoce como la energia libre molar parcial o el potencial qui-
rico de A (la barra indica la cantidad por mol); GR es la energia libre molar
parcial de A en su estado estindar; Xs la constante de los gases y [A] es la
concentracién molar de A. Asi, para la reaccién general
aA +bB == cC + dD
cl cambio de energia libre es
AG = ce + dip ~ aGy - 6a 1-13)
AG? = Ge + dG aGy— 8G, (144)
porque las enengias libres son aditivas, y el cambio de energia libre de una re
acci6n es la Suma de las energias libres de los productos menos las de los reac
livos, Reemplazando estas relaciones en la Be. 1-12, obtenemos
sG= AG + Rr et)
donde AG? es el cambio de energia libre de Ia reaccién cuando todos los reacti~
vos y los productos estan en sus estados estindares (véase més adelante). Asf, la
cexpresién del cambio de energia libre de una reaccién esté formada por dos par-
tes: 1) un término constante cuyo valor depende solamente de la reaccién que
tiene Iugar y 2) un término variable que depende de las concentraciones de los
reactivos y los productos, la estequiometria de la reaccién y la temperatura,
Para una reaccién en equilibrio no hay una variacién neta porque el cambio
de energfa libre de la reaccién en un sentido cancela exactamente el de la reac
(11s)
AG [1-16]
RT INK,
cin inversa. En consecuencia, AG = 0, por lo que la Ee. 1-15 se transforma en
donde Kay es la ya conocida constante de equilibrio de la reacci6n:
x, - Eide
ARSE
El subsndice “eq” denota las concentraciones de reactivos y productos en el
equilibrio (la condicién de equilibrio generalmente es clara en el contexto de
Ia situaci6n, por lo que las concentraciones en el equilibrio se expresan sin este
subindice). Por lo tanto, la constante de equilibrio de una reaccién puede tanto
ccalcularse a partir del dato de la energia libre estindar y viceversa (véase Céleu-
los ilustrativos 1-1),
-scyer
0-7)
K depende de la temperatura. La dependencia de la constante de equilibrio con
respecto a Ia temperatura puede verse al reemplazar la Be. 1-11 en la Be. 1-16 y rear
dense
ky=— 3
donde Hy 5° representan Ia ental y la entropia en el estado estindar La Be
1-18 tene la forma y = mx +, la ecuacién de una recta. El gréfico de In Ky en
funcién de I/F, conocido como grfiea de van’t Hoff, permite determiner los
valores de AH* y AS* (y, por lo tanto, AG*) a partir de Ia medida de Kuga dos
(© més) temperaturas diferentes Este metodo a menudo es mas prictico que Ia
mediciin directa de AH y AS por elorimetria (que mide el calor, gy del proceso),
1-18] Seccldn 1-4 Termodindmica
17
Convenciones del estado estindar en bioquimica. Con el fin de comparar los
cambios de energia libre de distntas reacciones, es necesario expresar Ios valo-
res de AG en relacién con algn estado estindar (de la misma forma en que las
clevaciones geogrificas se refieren al nivel del mar, al que se le asigna arbitra-
Samet me abr ro), Dear con con iz nua
fisica, un soluo esté en su estado estindar cuando la temperatura es de 25,
Ja presin es de I atm y el soluto tiene una actividad de 1 (la actividad de una
sustancia es su eoncentracin corregida por su comportamiento no ideal a con-
centraciones mayores que una dilucininfinita
En la mayoria de las reaeciones quimieas, la concentracién de eaetivos y pro-
ductos es en general tan baja (en el orden de milimolar © menos) que sus acti
vidades son aproximadamente equvalentes asus concentraciones molares. Ade
mis, como las reaeciones bioquimicas se producen a un potencal de hidrégeno
(pH) cereano a la neutralidad, los bioguimicos adoptaron una convencién algo
diferente para el estado esténdar
1. A Ia actividad del agua pura se Ie asigna un valor de 1, aunque su con
centracidn es de 55,5 M. Esta préctica simplifica las expresiones de la ener-
fa libre para las reacciones en soluciones diluidas que involucran agua
‘como reactivo, ya que el término [HO] entonces puede ignorarse.
A Ia actividad del i6n hidrégeno se le asigna un valor de 1 al pH fisiol6-
gicamente relevante de 7. Asi, el pH del estado estindar bioquimico es 7
(PH neutro, donde [H"] = 10°? M), en lugar de pH 0 ({H"] = 1 M), el
estado estindar fisicoquimico, frente al cual muchas sustancias biolbgi-
‘eas se vuelven inestables.
3. El estado esténdar de una sustancia que puede suftir una reaccién dcido-
base se define en términos de la concentracién total de su mezcla de iones
4que aparece naturalmente a pH 7. Por el contrario, la convencién fisico-
4quimica se refiere a la especie pura, exista o no a pH 0. La ventaja de Ia
cconvencién bioguimica es que la concentracién total de una sustancia con
numerosos estados de ionizacién, como la mayoria de las moléculas bio-
logicas, en general, es més fécil de medir que la concentracién de sus es-
pecies iGnicas. Sin embargo, dado que la composicién inica de un écido
‘6 uma base varia con cl pH, las energias libres estandares calculadas de
acuerdo con la convenci6n bioguimica son vélidas s6lo a pH 7.
2
Bajo Ia convencién biogutimica, los cambios de energi libre estindar de las
reacciones se simbolizan como AG" para distinguirlas de los cambios de ener-
sia libre estindar fisicoquimicos, AG. Si una reaccién no incluye HO, H* ai
tuna especie ionizable, entonces AG"'=AG*
E La vida obedece las leyes de la termodinamica
En una época, muchos cientificos erefan que a vida, con su complejidad y
orden inherentes, eludia de alguna forma las leyes de la termodinémica. Sin em-
bargo, las elaboradas mediciones en los animales vivos coinciden con la conser-
vacién de la energia que predice la primera ley, Lamentablemente, la verifica-
cin experimental de la segunda ley no es posible, ya que requerirfa desarmar un
‘organismo en sus moléculas constituyentes, lo que provocarfa su muerte. En con-
secuencia, es factible aseverar solamente que la entropfa de la materi
menor que la de los productos en los que se degrada. Sin embargo, la vida per-
siste porque un sistema (un organismo vivo) puede ordenarse a expensas de des-
‘ordenar su entorno en una medida aun mayor. En otras palabras, la entropfa to-
tal del sistema mas su entorno aumenta, como lo exige 1a segunda ley. Los
‘organismos vivos aleanzan el orden al desordenar (degradat) los nutrientes que 18 Capitulo | Intoduecién ala quimica de fa vida
Figura 1-11 Flijo de enegia en a basta
Las plantas utlizan le enegia radiant de sol para
sintetizarcarbohotates a partir de CO, yH.0. Las plantas
6 ls animales que se alimentan de elas finalmente
‘metaolzan les carohiratos para iter la eer libre
(que almacenany, por lo tanto, dewehen CO y HO al
enter,
consumen. Asf, el contenido de entropfa de los alimentos es tan importante como
su contenido de energfa,
Los organismos vivos son sistemas abiertos. 2 termodinamica clisica se aplica
en principio a los procesos reversibles en sistemas aislados (que no pueden in-
tereambiar materia o energia con su entorno) 0 en sistemas cerrados (que sola
‘mente pueden intercambiar energfa). Un sistema aislado siempre al-
‘canza el equilibrio, Por ejemplo, si sus reactivos estén en exceso, la
reaccién directa procedera mis répidamente que la inversa, hasta que
se logra el equilibrio (AG = 0), en el que las teacciones directa ei
versa igualan exactamente una a la otra. Por el contrario, los sistemas.
‘abiertos, que intercambian tanto materia como energfa con su en-
tomo, s6lo pueden aleanzar el equilibrio luego de que el flujo de ma-
teria y energia se detuvo,
Los organismos vives, que ingieren nutrientes, liberan productos
de desecho y generan trabajo y calor, son sistemas abiertos y por
cende nunca pueden estar en equilibrio. Continuamente ingieren nu-
irientes de elevada entalpia y baja entropfa, a los que convierten en
productos de desecho de baja entalpia y alta entropia. La energia li
bre generada en este proceso impulsa las actividades celulares que
producen el grado elevado de organizacién caracteristico de la vida.
Si este proceso se interrumpe, el sistema termina por alcanzar el
‘equilibrio, el que para los sistemas vivos es sinénimo de muerte. En
Ja figura I-11 se ilustra un ejemplo del flujo de la energéa en un sis-
tema abierto, Por medio de fotosintesis, las plantas convierten la energia radiante
del sol, la fuente primaria de energfa para la vida en la Tierra, en la energia qt
‘mica de los carbohidratos y otras sustancias orgénicas. Las plantas, 0 los an
‘males que se alimentan de ellas, metabolizan luego esas sustancias y obtienen
cnergfa para funciones como a sintesis de biomoléculas, el mantenimiento de la
concentracién intracelular de iones y el movimiento celular.
Los seres vivos mantienen un estado estacionario. Aun en un sistema que no
esté en equilibrio, la materia y la energéa fluyen de acuerdo con las leyes de la
termodindmica. Por ejemplo, los materiales tienden a moverse desde las areas
con mayor concentracién hacia las que presentan concentracién baja. Por este
‘motivo, la sangre toma O; en los pulmones, donde éste es abundante, y lo libera
en Tos tejidos, donde es escaso.
Los sistemas vivos se caracterizan por hallarse en un estado estacionario. Es-
{o significa que todos los flujos en el sistema son constantes, de manera que el
sistema no cambia en el tiempo. EI flujo de energia en la biosfera (fig. 1-11) es
tun ejemplo de sistema en estado estacionario, Perturbaciones leves del estado es-
tacionario originan cambios en el flujo que lo restablecen. En todos los sistemas
vivos el flujo de energia es exclusivamente “cuesta abajo” (AG <0). Ademés, la
naturaleza es inherentemente disipativa, por lo que la recuperacién de energfa li-
bre de un proceso bioquimico nunca es total, y algo de energia se pierde siem-
pre en el entorno.
Las enzimas catalizan las reacciones quimicas. Casi todos los componentes
moleculares de un organismo pueden reaccionar con los dems, y muchas de es-
tas reacciones estin favorecidas termodindmicamente (son espontdneas). Aun asf,
sélo un grupo de las posibles reacciones se produce en realidad en una medida
significativa en los organismos vivos. La velocidad de una reaccién en especial
no depend de la diferencia de eneria libre entre los estadosinicialy final, sino
0,
7. La constante de equilibro de un proceso se relaciona con el cam-
bio de energia libre estindar de ese proceso
8. Los organisms vives son sistemas abertos que mantienen un es-
tad estacionatio,
BenjamivCumsmings (1999). (Estey otros textos extensos de bio
login general orecen detalles sobre las estuctras de procarontes
Y evcarontes).
Goodsell, D.., A look inside the living cel, Am. Scien 8, 457-465
(1902); and Inside a living el, Trends Biochem. Sci. 16, 203-206
(99,
Lodish, H., Bek, A, Zipusky, Si, Matsuda, P, Bukimore, D.,
and Darnell J, Moleewar Cell Biology (A ed). Chapter 3, WH
Freeman (2000). (Este texto y otto similares de biologi celular
contin revisiones dtalladas sobre la estructura celular.
Pace, NRA molecular view of microbial diversity andthe biosphere,
Science 276, 734-740 (1997), (Descrben los tes dominios de ta
vida y sus eswategias metabslicas generals).
Termodindmica
‘Tinoco, L, Jr, Sauer, K., Wang, LC., and Puglisi, .C., Physical Che-
‘misiry Principles and Applications in Biological Sciences 4thed.),
‘Chapters 2-5, Prentice-Hall (2002). (La mayoria de los textos de
fisico-quimica desarollan la temalica termodinamiea con algtin
detalle.)
van Holde, K.E., Johnson, W.C., and Hu, PS., Principles of Physical
CChemisory, Chapters 2 and 3, Prentice-Hall (1998), 20 Caplio | Inreduecién ata
Oo TERMINOS CLAVE
‘compuesto orginico reticulo endoplasmatico
polimero aparato de Golgi
reaccién de condensacién mitocondria
hidesiss cloroplasto
replicacion Hisosoma
seleceién natural peroxisoma
vesicula vacuola
ccompartimentacion citosol
catalizador citoesqueleto
cucarionte ‘axonomia
scleo filogenia
procarionte Archaea
virus Bacteria
citoplasma Bucarya
orginulo ‘metan6genos
[[] BERCICIOS DE REPASO
1. Resuma los pasos principales de la evolucién qui
‘organises.
a y de los
2. Deseriba el proceso de evoluciéa por seleceién natural
3. Qué tipos de onganismos se encuentran en cada uno de los tres
{dominios evoluivos principales?
4. Explique la primera y la segunda ley de la temodindmica,
(7 PROBLEMAS
haobacterias ke
termfilos G
simbiosis exergénico
mutacién endergénico
termodindmica cequilibrio
sistema funcidn de estado
‘entorno Gq
U a
4 ‘estado estindar
w constante de equilibrio
H sistema aislado
ae sistema cerrado
proceso espontineo sistema abierto
w estado estacionario
s cenzima
{{Cémo depende el cambio de enerpia libre de un proceso de sus
Cambios de entropiay ental?
6. {Qué es el estado estandar en bioguimica?
{Cémo persise la vida a pesar de la segunda ley de Ia termo~
indmica?
1. dentitigue los grupos funcionales marcados con ci
‘uniones entre fos compuestos que se muestran,
oven
wa dovonl-o\e Fen
is ry
ba €
a
x
2, ¢Por qué la membrana celular no es una barrera absolua entre el,
Citoplasma y el entorna?
3, Una bacteria esfétiea con un didmetro de 1 um contiene dos mo-
cul de una proteina en especial. ;Cual es la concentracién mo:
lar de la protena?
{Cintas moléculas de glucosa contiene Ia eélula del problema 3
‘evando su concentracién interna de glucosa es 1,0 mM?
(@) {Cual tiene mayor entropfa, el agua iquida a 0 °C o el hielo
20°C? (b) {En qué se diferencia, si es que lo hace, la entropta
del hielo a5 °C de su entropia a 50 °C?
{Aumenta o disminaye la entropia en los siguientes procesos?
(a) N. #3 Hy —>2.NH,
°
i
(©) H,N—C—NHy
Urea
©
IM Nac —- Fp oosmma
+ HO — C0;
@® — coo- coo-
He-on = He— oro}
6 0703- He-on
Musogicerio ———-2fsugcrnto
Cams una ci on A = 1S y AS = 501- Ka
espontnea esta reaccién (a) a 10 °C; () a 80 °C?
Calcule la constante de equilibri de la reaccién
slucosaI-fosfato + HO —> glucosa + HPO,
1 pl 70 y 25 °C (AG*" = ~20,9 kl-mol”), Problemas 21
9.
Caleule AG” paraareaccién A + B—= C+ Da 25°C cuando
Jas concetraciones en equlbrio son [A] = 10 aM; (B] = 15 wM;
(C)= 3 uM, y [D] = 5 uM. La reacci ex exergénca 0 en
dergénica en condiciones esindares?
1 AG para la reac deisomerizacin
lucos-t-fostato (GIP) — glucose--fosato (GOP)
5 “7.1 KJ + mol, Caoule la relacién de concentraciones en
‘euilitrio ene (GIP] y [GP] a 25°C.
Para la eacci6n A —> B a 298 K, el cambio de entalpa es de
=7 kJ mot y el cambio de entropia es de ~25 J » K
smol ZEs espontines la reaccidn? Sino lo es, la temperatura
‘eberia aumento disminuir para que la reaccin fuese cs
pontinea?
n.
Para convert el reactive Aen el producto B, el cambio de entalpia
esde7kI- mot y el eambio de entropia es de 20.J-K-" « mol
{Por encima de qué temperatura la reaccién se hace espon-
tinea?
Indique silos enuneiados siguientes son verdaderos 0 falsos:
(@) Se afirma que una reacci es espontinea cuando puede pro-
‘ucitseen sentido directo 0 inverso.
(©) Un proceso espontineo siempre se deserolla muy ripida-
(©) Una reaccién no espontinea se producirs esponténeamente
cen el sentido inverso.
(@) Un proceso espontineo puede generarse con una gran dis
rminucidn de a entopfa. CAPITULO
Los arecites de coral abergan
meses verebrades e ierttrads.
Et agua que os rode es necesaria
para su ensterla, ya que acta
camo solvent para ls resciones
biogiica yen mayor medi,
determina las estructura de las
‘macromotéulas que lean a cabo
estas reacciones. (Geargete
Dounmaaxitety Images)
1. Propiedades fisicas del agua
‘A. Estructura del agua
1B. agua com solente
El efecto hitb
D. Osmosis y itso
22
2. Propiedades quimicas del agua
‘A, lonizacién del agua
B. Quimica dcido-base
CC. Solciones amrtiuadas tutes) En cualquier estudio de la quimica de la vida se debe incluir un estudio del
agua. Las moléculas bioldgicas y las reacciones que éstas Tleven a eabo pueden
ccomprenderse mejor en el contexto de su entorno acuoso. No s6lo Ios organis-
‘mos estin formados sobre todo por agua (alrededor del 70% de Ia masa del cuerpo
‘humano es agua), sino que, ademés, ella los rodea en ést, el “planeta azul”. Ade
‘mas de esta gran abundancia, el agua es central para la bioguimica por las razo-
nes siguientes:
1. Pricticamente todas las moléculas biolégicas toman su forma (y, por lo
tanto, asumen su funcién) en respuesta a las propiedades fisicas y quimi-
cas del agua que las rodea.
2. El medio para la mayor de las reacciones bioguimicas es el agua. Los
activos y los productos de las reacciones metablicas, los nutrientes, asf
como los productos de desecho, dependen del agua para transportarse den-
tro de las eélulas y entre elas.
EE agua participa activamente en muchas reacciones quimicas que sostie-
nen la vida. Con frecuencia, sus componentes ifnicos, los iones H* y OH",
son los verdaderos reactivos. De hecho, la capacidad de reaccién de mu-
chos grupos funcionales en las moléculas biolégicas depende de las con-
centraciones relativas de los iones H* y OH” en el medio que los rodea,
3
“Todos los organismos necesitan agua, desde las eriaturas marinas que pasan su
vida entera en un entomo acuoso hasta las terrestres que deben resguardar sus in-
teriores acuosos con pieles que las protejan, No es sorprendente que puedan hallarse
‘organismes vivos en cualquier lugar donde haya agua Mguida, en manantiales de
hasta 105 °C y en las grietas y las rupturas entre las rocas a cientos de metros por
bajo de la superficie de la Tiera, Los organismos que sobreviven a la desecacién
lo hacen solamente si se vuelven inactivos, como las semillas © las esporas.
El estudio del agua desde el punto de vista bioguimico requiere que observemos
las propiedades fisicas del agua, sus poderes como solvente y su comportamiento
quimico; esto es, la naturaleza de los dcidos y las bases acuosas,
fo Propiedades fisicas del agua
La naturaleza incolora, inodora e insfpida del agua subyace a su importan-
cia fundamental para los organismos vivos. A pesar de su apariencia insulsa para
‘nuestros sentidos, el agua es cualquier cosa menos inerte. Sus propiedades fisicas
~tinicas entre las moléculas de tamafo similar~ le brindan una fuerza sin igual
‘como solvente, ¢ incluso sus limitaciones como tal tienen consecuencias de sua
importancia para las estructuras y las funciones de las moléculas biol6gicas.
A Estructura del agua
‘Una molécula de agua esté formada por dos dtomos de hidrégeno unidos
‘uno de oxigeno. La distancia del enlace O—H es de 0,958 A (1 A= 10" m) y
el dngulo formado por los tres stomos es de 104,5° (fig. 2-1). Los dtomos de hi-
Ty as solucanes en ls cuales [H'] =
[OH] = 107 M son netas (= 7) Nese la escala
legartica parla concentra de ines.
‘és de la masa de agua y Hevar con ellos sus aguas de hidrataci6n El salto de tos
‘protones es también responsable de la observacidn de que las reacciones dcido-
hase estén enire las reacciones mas rpidas que tienen lugar en solucion acuosa.
La ionizacign (disociacién) del agua se describe con una expresién de equi
Librio en Ia que la concentracidn de la sustaneia madre esté en el denomina-
ddr y las concentraciones de los productos disociados se encuentran en el nu-
merador:
_ fH y}0H1
1H.0] ey
Kes la constante de disociaetén (aqui y a lo largo del texto, las cantidades
centre corchetes simbolizan las concentraciones molares de las sustancias indica
das, que en muchos casos difieren sélo en cantidad despreciable de sus activi-
dads; véase la seccién I-4D). Dado que Ia concentracién de HO sin disociar
((H.0)}) es mucho mayor que las concentraciones de los iones que la componen,
puede considerarse constante e incorporarse en K para obtener una expresién para
Ia ionizacién del agua
K, = [HOH] 22
Et valor de K, la constante de ionizacidn de agua, es 10°" a 25 °C.
ET agua pura debe contener cantidades equimolares de H” y OH, por Io tanto,
{H*] = [OH = (K,)! = 107M. Dado que [H*] y [OF] estin relacionadas en
forma reciproca por la Ec. -2, cuando [Hes mayor de 10-7 M, {OH debe ser
correspondientemente menor y viceversa. Se afirma que las soluciones con (H"] =
107M son neutras, 1as que tienen (H*] > 10-7M son decidas y las que presentan
[H"] < 10M son bfsieas. La mayoria de las soluciones fisiolgicas tienen con-
centraciones de iones hidrgenos cercanas a la neutral. Por ejemplo, en con
ciones normals, la sangre humana es ligeramente bisica con [H"] = 4 x 10 M.
Los valores de [H"] para la mayoria de las soluciones son pequetios ¥, por 10
tanto, no son pricticos para establecer comparaciones. Una cantidad mas prctica,
‘que fue ideada en 1909 por Séren Sorenson, se conoce como pH
1
)
pH
log(H*] = log: R3]
‘A mayor pH, més baja es la concentracién de H*; cuanto ms bajo es el pH,
mayor es la concentracién de H* (fig. 2-16). El pH del agua pura es 7, mientras
aldo Neuro Basico
— st)
1
- ta (om
2 104
8
5 so
$102
Ai of Baebairous na Thoeta WA a4 gia
eH Secon 22 Propiedades quimicas del agua 33
que las soluciones dcidas tienen pH <7 y las bésicas, pH > 7 (véase Céleulos CALCULOS ILUSTRATIVOS 2-1
ilustrativos 2-1), Notese que las soluciones que ifieren en ns unidad de pH ti
nen (H' que difierenen un factor de 10, Enel euadro 2-3 se dan los valores de
DH de algunas sustancias comunes.
En 1 L de agua pura se agregan 10 moles de
H’ (como HCl), Determine el pH final dela
solic,
B duimica acido-base El agua para tene un pH de 7, por Io tanto,
{H] = 107 M. Los Ht agregados tienen una
Los iones H* y OH derivados del agua son fundamentales para las reaccio- —_concentracién de 10-* M, que supera a la [H"]
nes bioquimicas que encontraremos més adelante en este libro. Las moléculas presente.
biotégicas, como las protenas y los dcidos nucleicos, tienen numeros0s g7UPO fy consecuencia la [H*] ttl es 1x 10~* M.
funcionales que actéan como écidos o bases, por ejemplo, 10s grupos earboxilo oro que el pH es igual alos] =
yy amino. Estas moléculas se incluyen en el pH del medio acuoso que las rodea, y —Phog (tc 10") = 4
‘us estructuras y reactividades estin ala ver incluidas por el pH del entorno. Por
lo tanto, para comprender el papel bioldgico de muchas moléculas, es necesaria,
‘una apreciacién de la quimica dcido-bésica,
Un dcido puede ceder un prot6n. De acuerdo con Ia definicién acuftada en la
década de 1880 por Svante Arrhenius, un decido es una sustancia que puede ce-
der un protén y una base es una sustancia que puede ceder un ién hidr6xido,
Esta definici6n es bastante limitada. Por ejemplo, no toma en cuenta la obser
vacién de que el NHs, que carece de un grupo OH, tiene propicdades basicas.
En una definicién més general, formulada por Johannes Bronsted y Thomas
Lowry en 1923, un dcido es una sustancia que puede ceder un proién (como
cen la definicién de Arrhenius) y una base es una sustancia que puede aceptarlo,
Seguin la definicién de Bronsted-Lowry, una reaccién sicido-base puede eseri-
birse como
HA +H,0—=H,0" + A~
Ccuadro 23 Valores de pl de algunas sustancias,
Un cido (HA) reacciona con una base (HO) para formar Ia base conjugada comunes
del cid (A°) y el cido eonjugado de la base (H,0"). De la misma forma, el
i6n acetato (CHyCOO”) es la base conjugada del fcido acético (CH;COOH) y —_Sustancia a
el i6n amonio (NH,") es el décido conjugado del amoniaco (NH;). La reaccién 1 M NaOH 4
Scio-bae ecnentemone se abeevia eee b
eaee ;
HA =H" +a- ce an
donde particpactin de H,O et implci, Una expen alemaiva pra una HE e
stsancn bss B es ee @
HBY =H" +B Vinaare 3
eae 3
tari 3
La fuerza de un dcido esta especificada en su constante de disociacién. La
cconstante de equilibrio para una reaccidn dcido-base se expresa como una cons:
tante de disociacién con las concentraciones de los “reactivos” en el denomina-
dor y las de los “productos” en el numerador:
[H,0"}[A7]
(HAJIH,O}
4
En soluciones diluidas, 1a concentracién de agua es précticamente cons-
tante, 55,5 M (1 000 g - L-/18,015 g- mol = $5,5 M), Por lo tanto, se acos-
tumbra a combinar el término [HO] con la constante de disociaeién, que toma
ta forma
_ (HA)
y= KUO) = “Tig Rs
Sin embargo, para abreviar, de ahora en més omitiremos el subindice “a”. 34 capitulo? El agua
CALCULOS ILUSTRATIVOS 2-2
CCaleule el pH de 2 L de solucién que contienen
10 mL de dcido acético $ My 10 ml. de acetato
de sodio 1 M.
Primero, calcue las eoncentraciones del deido y
la base conjugada, y exprese todas las
‘concentraciones en unidades de moles por lito
Acido acético: (0,01 LS My L)
= 0,025M
Acetato de soo: (0,01 1}(1 My(2 L)
= 0,005 M.
Sustituya ls eoncentraciones del sido y Ia base
‘conjugada en la ecuacién de Henderson-
Hasselbalch, Halle el pK del dcido actico en et
cero 2-4,
pH = pK + log{lacetatolicido acético))
pH = 4.76 + lox(0,005/0.025)
pH = 4,76 0,70
pH = 406
Cuadro 2-4 Constantes de disociacin y valores de pX a 25 °C de algunos acitos
—e————=—ere'rer
cS cases saline apiece one en ses ¢ Se
Acido oxéilico 5,37 x 1077 1,27 (pK)
HPO, 7o8x 10? 215 (6K)
Acido fomico lex 10! 35,
‘cio suction 617x108 421 pK)
Oxalato 5,37 x 1075 4,27 (pK)
Acido acético 1,74 x 1075 4,76
‘Suceinato” 2,29 x 10° 5,64 (pK),
Acido 2-(N-morfolino}etanosulfénico (MES) 813 x 1077 6,09
H,COy 447x107 635 0K)"
Piperazina-N,! 1,74 x 10-7 6,16
(PIPES)
HPO; 1,51 x 1077 6,82 (pK)
‘Acido 3(W-morfotino)propanosuénico (MOPS) 708x 10" 7,15
Acido N-2-hidroxictilpiperazina-N'-2-ctanosul- 3,39 x 10°* 7A
fénico (HEPES)
‘Tilhidroximet)aminometano Ts) 832 10% 808
NHS 5,62 x 107° 925
Glicina (grupo amino) 1,66 x 107" 9,78
H1COy 46810-1033 KY
Piperidina 7,58 x 107? 11,12
Senn eT
8 (PK)
FFuene: Dawson RMC, Eliot DC, Eliot WH y Jones KM. Data for Biochemical Research 3rd
‘ed Onford Seience Pbliations 1986; pp. 424825, y Good NE, Winget GD, Winter W, Connolly
‘TN, lama S,y Singh RMM. Biochemistry 1966 5,467
“EL pK dela eacin completa CO, + 10 == HCO, =H" + HCOs: véase el redo 22.
Las constantes de disociacién de algunos dcidos comunes se detallan en el
cuadro 2-4, Dado que a veces es engorroso trabajar con las constantes de diso-
ciacién de los dcidos, al igual que con los valores de (Hse transforman en va
lores de pK segdin la formula
pk = ~log K [2-6]
que es andloga a la Ee. 2-3,
Los fcidos pueden clasificarse de acuerdo con su fuerza relativa, 0 sea, su ca-
pacidad de transferir un protén al agua. Los dcidos de la lista del cuadro 2-4 se
conocen como sieidos déhiles porque se ionizan s6lo parcialmente en solucién
‘acuosa (K’< 1). Muchos de los llamados dcidos minerales, como HCIO,, HNOs
¥y HCI, son dcidas fuertes (K >> 1). Dado que los dcidos fuertes transfieren con
‘apidez todos sus protones al HO, el dcido mds fuerte que puede estar presente
‘en soluciones acuosas es H,O*. De la misma manera, no puede haber base ms
fuerte en soluciones acuosas que OH. Précticamente todas las reacciones écido-
‘base que se producen en los sistemas biol6gicos involucran Hs0* (y OH) y éci-
dos débiles (y sus bases conjugadas).
EI pH de una solucién esté determinado por las concentraciones relativas de dci-
dos y bases. La relacién entre el pH de una solucién y la concentracién de un éido
{y su base conjugada se calcula ficilmente. La Ec. 2-5 puede reordenarse como
[HA]
[a]
Si se toma el logaritmo negativo de cada término (y se sabe que pH = —log
IH"]; Ec. 2-3) se obtiene
ty =« en
tay
[HA]
pH = —logk + log: 2-8] Seocién 22 Propiedades qunicas del agua 35,
Si se constituye ~log K por pk (Ee, 2-6) se obtiene
icy
PH = pk lary (29)
Esta relacién se conoce como la eeuacién de Henderson-Hasselbalch,
Cuando las concentraciones molares de un cido (HA) y su base conjugada (4°)
son iguales, og (A]/ [HA]) = log 1 = 0 y el pH de la soluciin es numérica-
‘mente equivalente al pK del dcido, La ecuacién de Henderson-Hasselbalch es de
ran valor para calculat, por ejemplo, el pH de una solucién que contiene una
cantidad conocida de un feido dil y su base conjugada (véase Cal
culos ilustrativos 2-2), Sin embargo, dado que la ecuacién de Hen- Punto medio
derson-Hasselbalch no toma en cuenta la ionizacién de agua en sf, Punto ‘oH-ph) Punto
‘no es titil para calcular el pH de soluciones de dcidos o bases fuer- 4 inicio {HAl= ta) on
tes. Por ejemplo, en una solucién 1M de un écido fuerte, [H*] = 1 { { {
M y el pH es 0. En una solucién 1 M de base fuerte, (OH"] = 1 M,
por ende [H*] = [OHVK,, = I x 1" M, entonces, el pH es 14. 14
wa)» >| $a <
Soluciones amortiguadoras (buffers) °s
El agregado de una gota de 0,01 mL de HCI MalLdeagua 12
pura cambia el pH de ésa de 7 a5, lo que representa un ineremento
de 100 veces en la [H*]. Este cambio enorme en el pH seria into- e
lerable para la mayoria de los sistemas biolégicos, dado que incliso 4
cambios de pH pequeiios pueden afectar en gran medida las es-
tructurasy las funciones de las moléculas biolégicas. Por lo tanto, 9
el mantenimiento de un pH relativamente constante es de impor-
tancia extrema para los sistemas vivos. Para entender c6mo es por
sible esto, considérese la ttlaciGn de un éeido débil con una base 9H
fuerte.
En Ia figura 2-17 se muestra emo varian los valores de pH de
las soluciones de scido acético, HyPO,” y i6n amonio (NH,") a me-
dida que se agrega OH". Las eurvas de titulacién como éstas pue-
den construirse a partir de observaciones experimentales 0 utilizando
la ecuacién de Henderson-Hasselbalch para caleular los puntos @ Io
largo de su trazado (vase Célculos ilustrativos 2-3), Cuando el OH
reacciona con HA, los productos son A” y agua:
HA + OH” == A> +H,0
eben notarse varios detalles sobre las curvas de ttulacién de ta fi-
gura 2-17;
Las curvas tienen formas similares pero estin corridas en
forma vertical alo largo del eje del pH.
2. El pen el punto medio de cada ttulacién es numéricamente
cquivalente al pk’ de su écido correspondiente; en este punto,
(HA) = [7.
La pendiente de cada curva de titulacién es mucho menor
cerca de su punto medio que en los extromos. Esto indica que
cuando [HA] = [A] el pH de la solucién es relativamente
insensible al agregado de una base fuerte o un dcido fuerte
Esta solucién, ue se conoce como solucién amortiguadora
© buffer ‘cido-base, resste los cambios de pH porque can-
tidades pequeitas de H u OH agregados reaccionan con A~
HA, respectivamente, sin cambiar en gran medida el valor
de log((A THAD).
3
°
© 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10
Jones H’ cisociados/mol6cula
Figura 2-17 Cas detain dl deta actin, ef
fost y el amoniaco. En e! punto iii, predoina la
forma dcida, A medida que se agrega una base fuerte
(p., NaOH) el deido se conve en su base conjugada
En el punto madia dela ttulacién, donde pH = pK, las
oncenzaiones del cio yl base conjugada son igual.
Enel punto final (punto de equiralenca, predomi la
tase conugada la cantidad total de OM” que se agregs
es equivalent ala catidad de dcido que estaba
presente enol punto incl, Las zona sombreadas
indian los rangos de pH en los que la slucién
carespondiente puede funciona como amortiguador
2 Veanse figuras anima. 36 copiulo 2 Blagua
CALCULOS ILUSTRATIVOS 2-3
Calcule el pH de 1 L de solucién que contiene
0,1 M de deido férmico y 0,1 M de formato de
sodio antes y después del agregado de 1 mL.
de NOH 5 M. ;Cusnto cambiaria el pH si el
[NaOH se agregara a una solucién de agua pura?
De acuerdo con el cuadro 2-4, el pK del écido
férmieo es 375. Dado que [Formato] = [écido
frmico, el trmino log(A- VIHA) dela
ecuacign de Henderson-Hasselbalch es 0 y el pH
= pk'= 3,75. El agregado de I mL de NaOH no
‘cambia signifcativamente el volumen de la
soluci, por lo tanto [NaOH] es (0,001 LS
MYL) = 0,005 M.
Dado que el NaOH es na base fuerte, se
dlisocia por completo y [OH] = INsOH}
0,005 M. Estos OH reaccionan con el écido
fico para produci formato y HO. En
‘consecuencia, la concentracién de dcidoférmico
disminuye y la concentracién de formato
sumenta en 0,05 M.
[La nueva concentracion de dd frmico es 0,1
M.~0,005 M = 0,095 My la concentracin de
formato nueva es 0,1 M+ 0,005 M = 0.105 M.
Si se susituye con estos valores ln ecuscién de
enderson-Hasselhaleh se btiene
pH = pX+ log formato)éeidoférmico))
pH = 3,75 + lot0,1050,095)
pH =3,75 +004
pH =3,79
En ausencia del sistema amortiguador dl cido
{rmico, la (Hy, por lo tanto, el pH pueden
caleularsedirectamente a partir de Ky. Dado
due Ky = (HOH = 10",
iota vas
TOHT ~ (0.005)
loglH¥"] = ~log(2 x 10°") = 11,7
iH) x10 M
pil=
Primer Segundo Teroer
Puno puto do puro de punto de
de nico etutaercia equate euiatenia
Punto meso wes
(HPOS) = [PO
1 |
2
” Punto medio dos,
| CHRP; | = [HPO]
a
pe
6
Punto medio uno
([H1.PO4] = [POF
4
2
°
05 10 45 20 28 3.0
lones Ht elsociados/motécula
Figura 2-18 Thuacin de n Sid plptca. £1 primer ye segundo punto de equivalencia de
la itulacén del HsPO, se presentan en las partes més empinadas de a cura, El pH en el puto
medio de cada elap brinda el valor de pK dela enizacién corespandente, © Véansefiguas
Las sustancias que pueden perder mas de un prot6n o sufi mss de una foni-
zacién, como H;PO, 0 H;COs, se conocen como écidos polipréticos. Las cur-
vas de titulacién de estas moléculas, como se ilustra en la figura 2-18 para el
HPO,, son més complicadas que las de los dcidos monopréticos, como el écido
acético. Un écido poliprotico tiene numerosos valores de pK, uno para cada paso
de ionizacién. El HsPO,, por ejemplo, tiene tres constantes de disociaciGn por
ue la carga iénica que resulta de la disociacién de un protén inhibe por via elec
trostitica las disociaciones posteriores,e incrementa, por lo tanto, los valores de
los pK correspondientes. De manera similar, una molécula con més de un grupo
jonizable tiene un valor de pX determinado para cada grupo. En una biomolé-
cula que contiene miltiples grupos ionizables con valores diferentes de pK, los,
numerosos pasos de disociacién pueden generar una curva de ttulacién sin me-
seta clara alguna,
Los liquids biolégicos, tanto intracetulares como extracelulares, estin muy
amortiguados. Por ejemplo, el pH de la sangre en un individuo sano estécontrolado
estrechamente a pH 7,4 (véase recuadro 2-2). Los iones fosfato y bicarbonato en la
‘mayoria de lo liquidos biol6gieos son agentes amortiguadores importantes porque
tienen valores de pX cercanos a este rango (cuadro 2-4). Es més, muchas molécu-
Jas biol6gicas, como las proteinas y algunos lipidos, asi como numerosas mo-
Iéculas ongénicas pequeiias, tienen varios grupos dcido-base que son componentes.
amortiguadores eficaces en el rango de pH fisiolégico.
El concepto de que las propiedades de las moléeulas biolGgicas varian con la
acider. de la solucién en que estin disueltas no se aprecis por completo antes del RECUADRO 2-2
EI sistema amortiguador de la sangre
El bicarbonato es el compuesto amortiguador més importan-
te en la sangre del ser humano; otros agentes amortiguado-
res, entre ellos las proteinas y los acidos orgénicos, estan
presentes en concentraciones mucho menores. La capacidad
amortiguadora de la sangre depende principaimente de dos
equilibrios: 1) entre el COp gaseoso disuelto en la sangre y
el acido carbénico formado en la reaccién
1.003
y 2) entre el écido carbénico y el bicarbonato formado en la
disociacion de H”
CO, + HO
H2COy == H* + HCOs
El pk general para estas dos reacciones en secuencia es
6,35. (La disociacién posterior del HCO3 a CO3-, p= 10,33,
no es significativa a pH fisiol6gico).
Cuando el pH de la sangre cae como consecuencia de la pro-
duccién metabélica de H”, el equilibrio entre bicarbonato y
cido carbénico se desplaza en favor de! ultimo. Al mismo
tiempo, el acido carbénico pierde agua para transformarse en
C0z, que se elimina por los pulmones en forma gaseosa. Por
el contrario, cuando el pH de la sangre aumenta, se forma
relativamente més HCO5, La respiracién se ajusta de manera
‘que en los pulmones se introducen cantidades mayores de
Secclin 2.2 Propedades quimicas del agua 37
Bioquimica en a Salud y ia enfermedad
C02 en la sangre para converts en acido carbénico. Asi, se
puede mantener una concentracién casi constante de fones
hidr6geno. Los rifiones también tienen un papel en el equil
brio dcido-base, que excretan HCO” y NH".
Las alteraciones del sistema amortiguador de la sangre pue-
den dar origen a enfermedades conocidas como acidosis, con
un pH tan bajo como 7,1, 0 alealasis, con un pH de hasta
7,6. (Las desviaciones de menos de 0,05 unidades de pH
del valor “normal” de 7,4 no son significativas.) Por ejem:
plo, las enfermedades obstructivas del pulmén pueden im-
pedir la espiracién eficiente de CO2 y causar acidosis respi
ratoria, La hiperventilacién acelera la pérdida de C02 y causa
alcalosis respiratoria. La produccién excesiva de cidos or-
génicos a partir de precursores de la dieta o los cambios re-
ppentinos en los niveles de Acido léctico durante el ejercicio
fisico pueden llevar a la acidosis metabélica.
Los desequilibrias del estado acid-base se corrigen mejor si
se resuelve el problema fisioldgico subyacente. A corto plazo,
la acidosis se trata generalmente administrando NaHCO por
Via intravenosa, La alcalosis es més dificil de tratar. La al-
calosis metabélica a veces responde al KC! o el NaCl (el Cl
adicional ayuda a reducir al minimo la secrecién de H* en
los riflones) y la alcalosis respiratoria puede aliviarse mediante
la respiracién en una atmésfera enriquecida en CO>.
siglo XX. Muchos de los primeros experimentos bioguimicos se llevaron adelan-
te sin controlar Ia acidez. de la muestra, por lo tanto, los resultados a menudo fue~
ron poco reproducibles. En la actualidad, las preparaciones bioguimicas llevan
amortiguadores para simular las propiedades de los liquidos biol6gicos naturales.
Algunos compuestos sintéticos se desarrollaron para usarse como buffers; una.
parte de ellos esti incluida en el cuadro 2-4. La eapacidad amortiguadora de
‘estos deidos débiles (su capacidad para resistir cambios de pH al agregarse un
fcido 0 una base) es maxima cuando pH = pK. Es necesario recordar que un éci-
do débil est en su rango stil como amortiguador cuando el pH differe en una
tunidad de su pK (p. cj. las regiones sombreadas en la fig. 2-17), Por encima de
‘este rango, cuando a relacién [A"]/ [HA] > 10, el pH de la soluci6n cambia ré-
pidamente con el agregado de una base fuerte. Una solucién amortiguadora es
también poco til frente al agregado de un Scido fuerte cuando su pK supera al
pH en mis de una unidad.
En el laboratorio, el pH deseado de una solucién amortiguadora determina
‘qué compuesto buffer debers elegirse. Tipicamente, la forma dcida del compuesto
¥y una de sus sales solubles se disuelven en la (casi igual) relacién molar nece-
Saria para obtener el pH deseado y, con la ayuda de un pHimetro, la solucién re-
sultante se ajusta mediante la titulacién con un cido o una base fuerte. 38 capitulo 2 El agua
(Oy RESUMEN
1. El agua es necesaria para todos los organisms vivos.
2, Las moléculas de agua pueden formar puentes de hidrégeno con
otras moléeulas porgue tienen dos étomos de H que pueden ce
dersey dos pares de eletrones no compartidos que pueden actuar
como aceptores.
3, En su estado guido el agua es un retieulo inregular de moléeu-
Jas que forman hasta cuatro puentes de hidrégeno cada una con
Jas moléculas de agua vecina.
4. Las sustancias hidrilas como los iones y las moléculas polares
se disvelven répidamente en agua,
5. El efecto hidréfobo es la tendencia del agua de redueir al mimo
si contacto con sustancias no pores.
6, Las moléculas de agua se mueven de las regiones de concentra-
cin eleva alas regiones de concentracin baja por ésmosis; los
o BIBLIOGRAFIA
Gerstein, M, and Levit, M., Simulating water and the molecules of
life, Sei Am. 279(11), 101-105 (1998), (Describe la estructura del
‘agua y c6mo ésta imeractéa con otras moléculss.)
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Jeftey, G.A. and Saenger, W., Hydrogen Bonding in Biological Struc
sures, Chaps. 1,2, and 21, Springer (1994). Revision quimica so
[Eu TERMINOS CLAVE
solutos se mueven desde las zonas con concentraciOn alta 8 las
zonas con concentracia baja por dfusién
7. EL agua se ioniza a H* (que representa el i6n hidronio, HO") y
on,
8, La concentracn de H” en las soluciones se expresa como un va-
Jor de pH; en las soluciones cidas, pH < 7; en las bésicas, pH >
‘T.y en las neutras, pH = 7.
9, Los feidos pueden ceden protones y las bases, aceptarlos. La
fuerza de un deido se expresa como su pK.
10, La ecuacién de Henderson-Hasselbaleh relaciona el pl¥ de una
solucién con el pk y las concentraciones de un écido y su base
conjugada,
1, Las soluciones amortiguadas ressten los cambios de pH cuando
ste difiere en una unidad del pK de las especies buffer,
bre los puentes de hidrégeno y su importancia en las moléculas pe-
quefis y las macromoléculas.)
Kropman, M.F. and Bakker, H.1, Dynamics of water molecules,
Science 291, 2118-2120 (2001). (Describe cémo las moléculas de
agua de las capas de solvatacién se mueven més lentamente que
las moléculas de las masas de agua.)
Segel, LH., Biochemical Calculations (2nd ed), Chap. 1, Wiley
(1976). (Trata acerca del equlibro écido-base con un nivel de com-
plejidad intermedio, e incluye ejercicios desarollados.)
‘Tanford, C. The Hydrophobic Eifect: Formation of Micelles and Bio-
logical Membranes (2nd ed.) Chaps. $ and 6, Wiley-Interscience
(1980), (Describe as estructuras del agua y las micelas.)
polar efecto hidifobo
puente de hideégeno anfitilo.
distancia de Van der Waals anfiptico
fucrzas de Van der Waals ricela
fuerzas de dispersin de bicapa
London propiedades coligativas
hidesito Samosis
hidrfobo presin osmética
solataciéa difusioa
hidratacion Aislisis
‘aguas de hidratacion én hidronio
salto de protones pK
constante de disociacién feido debi
fcido fuerte
ceuacién de Henderson-Hassel-
baleh
solucign basica curva de titlacin
pt solucin smortiguadora (buffers)
fcido fcido poliprético
base acidosis
base conjugada alealosis
eido conjugado ‘copacidad amortiguadora
(DU BERCICIOS DE REPASO
1. Compare los puentes de hidrigeno en el hielo can los correspon-
lentes en el agua lguida
2. Explique por qué las sustancias polares se disvelven en el agua
‘mientras que as no polares nolo hacen,
3. Deseriba Ia contribucién de la entropia al efecto hidéfobo
4. {Por qué las sustancias anfiflas Forman micelas en el agua?
5. {Bin qué se diferencian la ésmosisy la difusién?
6. Compare las definiciones de scidos y bases de Arthenius y de
Bronsted-Lowry.
7. Expligue por qué una solucién 1 M de HCI tiene un pH de 0. Problemas 39
(70) PROBLEMAS
1, Tdeniique los posibles danadores y aceptores de puentes de hi-
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