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Las biomolculas utilizadas como marcadores moleculares son protenas y ADN. Las
primeras se usan desde finales de los 70 y han permitido alcanzar logros importantes en
el mejoramiento, pero debido a que ellas son el producto de la expresin gnica,
presentan variaciones entre diferentes tejidos de un mismo individuo, entre poblaciones
y tambin en diferentes pocas del ao.
El descubrimiento de las enzimas de restriccin y de la reaccin en cadena de la
polimerasa (PCR) hicieron posible utilizar marcadores basados en el ADN.
La seleccin asistida por marcadores es el resultado de la combinacin entre las tcnicas
del mejoramiento tradicional y la biologa molecular y permite escoger directamente los
individuos portadores de los genes de inters. Combinada con las tcnicas tradicionales
de seleccin, la SAM es una valiosa herramienta para seleccionar por caracteres de
inters, tales como color, calidad de grano o resistencia a enfermedades, entre otras.
Todos los marcadores moleculares descritos a continuacin son tiles en la SAM y se
utilizan de acuerdo al organismo que se desea estudiar, el carcter involucrado en la
seleccin y el equipamiento del laboratorio donde se realizar el trabajo.
Con la ayuda de la SAM es posible reducir el nmero de retrocruzas de siete a cuatro
para obtener un 97% del padre recurrente, ya que es posible elegir las plantas que llevan
el menor segmento cromosmico del padre donador.
Adems de la introgresin de caracteres por retrocruza, los cuales estn generalmente
controlados por uno o pocos genes, la SAM es utilizada para acumular QTL (loci de
caracteres cuantitativos) y realizar mejoramiento gentico en caractersticas codificadas
por varios loci. Para ello, se utilizan marcadores que bordean a los QTL de inters y por
ellos se selecciona.
Marcadores bioqumicos
Se utilizan las protenas e isoenzimas, ya que pueden ser fcilmente extradas
y analizadas. Las isoenzimas representan diferentes formas moleculares de
una misma enzima que muestran especificidad por el mismo sustrato. Por
ejemplo, las distintas formas moleculares de la enzima alcohol deshidrogenasa
(ADH) se diferencian por la carga elctrica neta o el peso molecular, pero todas
deshidrogenan el alcohol (sustrato) para convertirlo en aldehdo.
migrarn menos hacia el ctodo, al igual que aquellas que tengan baja carga
positiva.
Enzimas de restriccin
Son tambin llamadas endonucleasas de restriccin. Se aislaron por primera
vez a partir de bacterias, organismos que las utilizan como defensa ante el
ataque de bacterifagos. Actan cortando el ADN viral en varios trozos de
manera que ste no pueda reproducirse.
Las tcnicas empleadas para la seleccin dependern del tipo de reproduccin del
cultivo, es decir si es autgamo, algamo o de reproduccin vegetativa, y de las
caractersticas que se quieran mejorar; aunque existen tres pasos generales que se deben
seguir:
1. Desnaturalizacin (94-95C): con el aumento de la temperatura las cadenas de ADN
se separan permitiendo la accin de la ADN polimerasa.
2. Hibridacin (45-65C): al bajar la temperatura los cebadores, tambin llamados
primers, se unen a la cadena molde. Estos cebadores son secuencias cortas de ADN
complementario a las secuencias ubicadas al comienzo y al final del fragmento que se
quiere multiplicar.
3. Elongacin (72C): es la sntesis de la cadena complementaria por la ADN
polimerasa, la cual comienza a trabajar a partir de los cebadores.
Toda la reaccin ocurre en un termociclador, aparato que permite programar los
cambios de temperatura. Un ciclo de PCR permite obtener el doble de
fragmentos de ADN de los cuales se parti; de esta manera, a partir de una
cadena se obtienen dos, luego cuatro, ocho, etc.
Para estudiar genes o fragmentos de ADN con ms detalle, puede realizarse un southern
blotting, tcnica que aprovecha los resultados de los RFLP.
4. Transferencia por capilaridad del ADN desnaturalizado (cadena sencilla) a una
membrana de nylon para observar la posicin relativa de los fragmentos.
5. Hibridacin de los fragmentos con una sonda marcada radiactivamente. En ella se
pone la secuencia complementaria al fragmento que se est buscando.
6. Revelacin de la hibridacin por una reaccin de color.
Microsatlites
En el genoma existen secuencias de 1-4 nucletidos que se repiten varias
veces, los microsatlites, las cuales presentan un elevado polimorfismo de
acuerdo al nmero de repeticiones.
Los AFLP se fundamentan en la evidencia otorgada por los polimorfismos de los sitios
de restriccin y la hibridacin de un cebador de secuencia arbitraria. Primero debe
digerirse el ADN a estudiar con enzimas de restriccin, para luego aadir a los extremos
de los fragmentos secuencias especficas llamadas adaptadores nucleotdicos. Por
ltimo, los fragmentos son amplificados mediante dos reacciones de PCR; la primera
llamada preamplificacin, en la cual los cebadores son la secuencia complementaria de
los adaptadores ms una base (se selecciona el 25% de los fragmentos) y la segunda,
selectiva, donde los cebadores son una secuencia complementaria de los adaptadores
ms dos o tres bases o nucletidos y las bandas visualizadas por electroforesis.
La combinacin enzima de restriccin/cebador es la que permite revelar el
polimorfismo y constituye el marcador AFLP.
Los AFLP son utilizados para evaluar diversidad gentica, seleccionar lneas,
variedades, razas, etc por alguna caracterstica especfica de inters agronmico y como
marcadores en regiones prximas a un gen que se desea clonar.
Por ltimo, se realiza una visualizacin por excitacin y cuantificacin de las molculas
fluorescentes a una determinada longitud de onda. Si dos individuos, A y B, no revelan
la misma fluorescencia es que presentan polimorfismo en un nucletido.
Es una tcnica muy til en etapas de seleccin fina, para detectar diferencias allicas
entre individuos.
Cartografas genticas
Las cartas o mapas genticos se realizan para determinar la posicin de un
gen en un cromosoma. Hasta la utilizacin de los marcadores moleculares para
ayudar en esta tarea, las mismas se realizaban con marcadores morfolgicos
(fenotipo) y se calculaban las distancias de ligamiento entre el marcador y el
carcter
de
inters,
que
tambin
deba
ser
fcilmente
identificable
fenotpicamente.
Con marcadores moleculares ligados a genes mayores, por ejemplo genes de resistencia
a enfermedades, puede estudiarse su ubicacin en el genoma para la realizacin de
seleccin o trabajos de ingeniera gentica.
Ingeniera gentica
La revelacin de la estructura del ADN y el descubrimiento de las enzimas de
restriccin originaron una de las herramientas ms poderosas de la
biotecnologa moderna, la ingeniera gentica; tambin llamada tecnologa del
Con las mismas enzimas se cortan los plsmidos que se van a mezclar con los
segmentos de ADN del organismo en estudio para que se unan y formen plsmidos
recombinantes. En este paso suele ocurrir la unin de plsmidos entre s, stos deben ser
desechados ya que no llevan fragmentos de ADN del organismo de inters.
Los plsmidos recombinantes deben ser introducidos en bacterias para que los genes
expresen las protenas que codifican. Este proceso se realiza generalmente mediante
impulsos elctricos que abren poros en las membranas bacterianas. Las bacterias que
han incorporado los plsmidos son consideradas modificadas genticamente o
transgnicas, las que se seleccionarn por medio de la resistencia al antibitico que
naturalmente lleva el plsmido usado. Aquellas bacterias que no hayan incorporado el
plsmido no poseern dicha resistencia y, por lo tanto, morirn. Las bacterias
transformadas crecern y formarn colonias.
Debido a que los organismos poseen miles de genes, se necesitan muchas colonias
bacterianas para su estudio. A toda esa coleccin se la denomina biblioteca de genes y
los cientficos deben buscar en ella el gen de inters.
Los mtodos ms utilizados para evaluar los genes de inters son evaluacin fenotpica,
evaluacin con anticuerpos e hibridacin del ADN. En el primer caso se estudia el
resultado de la expresin del gen, es decir la protena que reaccionar con ciertos
qumicos y cambiar de color si se ha traducido de manera correcta.
Por ltimo, puede utilizarse una sonda complementaria al segmento que se desea
identificar en el cultivo bacteriano. Esta sonda est marcada radiactivamente y con
iluminacin ultravioleta revelar la colonia en la cual hibrid.
Para identificar un gen especfico, realizar mapeos genticos y estudios evolutivos se
utiliza la prueba de Southern blot. En el caso de los organismos genticamente
modificados se usa como prueba definitiva para determinar la incorporacin del
transgn al organismo.
El segmento de ADN que lleva el gen que se desea identificar es digerido con enzimas
de restriccin y los fragmentos resultantes son separados por electroforesis. stos son
luego desnaturalizados y transferidos a un filtro de nitrocelulosa o membrana de nylon,
proceso que preserva la distribucin de los fragmentos del gel creando una rplica. Con
una sonda marcada radiactivamente se detectar la presencia del gen de inters, el cual
ser revelado mediante una autorradiografa que indicar el sitio de hibridacin de la
misma.
Por otra parte, si lo que se desea estudiar es el ARN resultante de la transcripcin y sus
patrones de expresin se usa la tcnica de Northern blot. Es similar a la anterior, aunque
requiere ms cuidado, ya que el ARN es ms susceptible a la degradacin que el ADN.
Para crear una planta transgnica primero debe identificarse y aislarse el gen que
produce la caracterstica que se desea incorporar en la misma, luego el gen de inters es
clonado en un organismo vector (bacteria) para obtener muchas copias.
El tercer paso de la transformacin consiste en disear el gen que se va a introducir. Los
genes necesitan para expresarse una secuencia promotora y una terminadora, adems de
la regin codificante, la cual lleva las instrucciones para la fabricacin de la protena.
Como los promotores son especficos para cada organismo hay que reemplazarlos por
otros que se expresen en la planta, como por ejemplo el promotor del virus del mosaico
de la coliflor, que se expresa en todos los tejidos del vegetal o el promotor de la
fosfoenolpiruvato carboxilasa, que pertenece a una enzima fotosntetica y slo se
expresa en los tejidos verdes de la misma. Tambin debe incorporarse una secuencia de
ADN que permita identificar las clulas que han sido transformadas. Para ello se
utilizan genes de resistencia a antibiticos, herbicidas u otros genes marcadores, que
luego se expresarn en el medio adecuado y mostrarn aquellas clulas que han
incorporado exitosamente el transgn.
La ltima etapa de este proceso es la incorporacin del transgn a la planta.
Para ello existen diversas metodologas, aunque son solamente dos las ms
utilizadas: transferencia directa o mtodo de biobalstica y transferencia
mediada por un vector.
La obtencin de una planta transgnica por cualquiera de estos dos mtodos depender
de la insercin del gen de inters en el genoma de la misma, de su expresin y de la
transmisin del mismo a su descendencia como si fuera propio, adems de la posibilidad
de regenerar la planta in Vitro.
Luego de la transformacin los tejidos vegetales deben transferirse a un medio
de cultivo selectivo que contiene el antibitico o herbicida cuya resistencia
codifica el gen marcador, para que solamente crezcan las plantas que han sido
transformadas.
Desde hace mucho tiempo se conoce que la bacteria Bacillus thuringiensis produce una
toxina letal para lepidpteros que acta paralizando los msculos del intestino y la boca
del insecto, por lo cual muere de hambre. Por medio de ingeniera gentica se pudo
aislar la toxina y transferirla al maz para obtener plantas transgnicas que la expresan y
se protegen del ataque del barrenador. Este maz es llamado Bt por llevar incorporado
en su genoma el gen de la bacteria.
De manera similar al maz se han producido otras plantas modificadas
genticamente resistentes a virus, hongos y otros patgenos.
Maz, arroz, remolacha azucarera y canola, entre muchos otros cultivos, han
sido modificados genticamente para tolerar numerosos herbicidas.
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