UNIVERSIDAD ANHUAC MAYAB

ESCUELA DE MEDICINA
MATERIA
Biologa molecularNRC:
50589
PRCTICA No. 3
Introduccin a las bases de datos de Bioinformtica
PROFESORA
Dra. Ins Maldonado Borges
Equipo 1
Sidney Rangel Alpuche
Dulce Lindero Snchez
Daniel Caufield Tenorio
Sebastian Labrousse
Emilio Lpez Celis
Mrida Yucatn, Febrero 2016

Introduccin
Cuando se trata de un trabajo de investigacin gentico no podemos nicamente valernos de las
herramientas humanas, ya que la variedad de posibilidades es tan grande que es imposible para
un humano aprenderlas todas, por esta razn es importante el uso de bases de datos que tengan el
registro de diferentes secuencias, como lo son las que presentaremos en esta prctica.
Es posible hacer uso de literatura en el momento de localizar una secuencia, pero, como sabemos,
los descubrimientos cientficos avanzan de manera creciente, lo que crea la necesidad de hacer
uso de estas bases de datos, que si bien, no avanzan de la misma manera que los organismos, si lo
hacen al mismo ritmo que los descubrimientos, ya que estas son ms fcilmente actualizadas
comparadas con las herramientas impresas.
Hoy en da podemos encontrar muchas bases de datos dedicadas al registro gentico, las cuales
cuentan con un idioma universal para que podamos acceder a todas ellas sin la necesidad de
aprender un idioma distinto de codificacin, como lo que sucede en el lenguaje de la
programacin al tratar de cambiar de un programa a otro.
Estas herramientas son altamente didcticas, lo que hace que personas de conocimiento reducido
en el tema, hasta profesionales en ello, puedan usarlas de manera prctica.
En la ltima sesin tuvimos la oportunidad de experimentar con estas bases de datos, y aprender
cmo es que las utilizaremos en prcticas futuras.

Definiciones
NCBI (National Center for Biotechnology Information)
Sitio que apoya el avance cientfico al dar acceso a fuentes de informacin biomdica y
genmica.
ExPASy (Expert Protein Analysis System)
Es un portal que provee acceso a bases de datos cientficos y herramientas de software y
diferentes reas de ciencias de la vida.
Objetivo: Los alumnos tendrn un acercamiento a las bases de datos del NCBI y al EXPASY y se
examinarn algunas de las caractersticas de las secuencias requeridas.

Procedimiento
NCBI
1. Entrar al sitio NCBI.
2. Teclear en el sitio de bsqueda, el nombre de la protena a investigar (la entrada tiene que ser en
ingls).
3. Entrar a la opcin de Nucleotide.
4. Localizar la opcin buscada (si es necesario, refinar la bsqueda).
5. Localizar un hiperlink abreviado como CCDS.
6. Localizar las secuencias nucleotdicas y la traduccin de la protena en cuestin.

EXPASY
1. Entrar al sitio ExPASy.
2. Entrar a la opcin proteomics UniProtKB
3. Teclear en el sitio de bsqueda la misma protena del caso anterior.
4. Entrar al hiperlink del nmero de acceso (Entry).
5. Entrar a la opcin Structure, localizar la estructura tridimensional
6. Copiar la informacin recibida.

Resultados

Conclusin
Mediante esta prctica de laboratorio, pudimos concluir que es importante conocer, entender y
analizar la informacin de sitios que proveen herramientas y datos que son esenciales en el
estudio y la investigacin de las ramas de las ciencias biolgicas como la genmica, protemica,
biomdica, entre otras; esto con el fin de poder encontrar material de apoyo de confianza que nos
pueda servir en nuestro mbito.
Referencias bibliogrficas
ExPASy. (2016). Genomics. 2/18/16, de ExPASy: SIB Bioinformatic Resource
Portal Sitio web: http://www.expasy.org/
NCBI. (2016). Biomedic and genomic. 2/18/15, de National Center for
Biotechnology Information Sitio web: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/