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REVISTA DE
GASTROENTEROLOGIA
DE MEXICO
www.elsevier.es/rgmx
CARTAS AL EDITOR
Microbiota gastrointestinal y
sndrome de intestino irritable
Gastrointestinal microbiota and irritable
bowel syndrome
El tracto digestivo de humanos y otros mamferos se
encuentra habitado por millones de microorganismos, especialmente bacterias. Esta microbiota gastrointestinal es
necesaria para el buen funcionamiento del proceso digestivo
en el hospedero. Recientemente, Schmulson et al.1 publicaron un artculo de revisin acerca del sndrome de intestino
irritable (SII) y su relacin con la microbiota intestinal as
como con otros aspectos clinicoteraputicos. Nos gustara
ofrecer algunos comentarios acerca de este artculo que
pueden ser de utilidad para la comunidad mdica.
Primero, el trmino ora es utilizado en varias ocasiones para referirse a la microbiota productora de metano,
colnica y fecal. Sin embargo, este trmino es incorrecto,
a pesar de su uso comn en medicina humana y veterinaria.
Segundo, la tabla 3 no solo contiene una descripcin de
mtodos moleculares para caracterizar a la microbiota
intestinal (ttulo de la tabla) sino tambin una descripcin
de la subunidad 16S del ARN ribosomal y del gen que la
codica, lo cual puede resultar confuso para los lectores
ajenos al tema. En esta misma tabla se omite el signicando
de las iniciales RRS, y el enunciado acerca del uso de la
variabilidad en la 16S para distinguir organismos prximos
y distantes es parcialmente vlido, en parte debido a la
incertidumbre en la taxonoma molecular bacteriana de
hoy en da2 . Adicionalmente, la Tabla 3 solo menciona una
(pirosecuenciacin) de varias tcnicas de secuenciacin
masiva. Esto es importante de mencionar debido a que
esta tcnica desaparecer pronto del mercado, y por lo
tanto muchos investigadores han migrado a otras tcnicas, como la de Illumina3 . Tercero, la heterogeneidad
clnica del SII y el empleo de diferentes mtodos para el
estudio de la microbiota intestinal son sin duda algunas
razones detrs de nuestra incapacidad para establecer una
composicin microbiana propia del SII. Sin embargo, es
necesario resaltar que nuestro principal problema radica
en que cada individuo posee una composicin basal nica
de microorganismos, los cuales tambin poseen variaciones
cualitativas y cuantitativas especcas a cada individuo4 .
Cuarto, los trminos bidobacterias, lactobacilos,
Financiacin
No recibimos ninguna clase de nanciacin.
Conicto de intereses
Los autores declaran no tener ningn conicto de intereses.
Bibliografa
1. Schmulson M, Bielsa MV, Carmona- Snchez R, et al. Microbiota,
infecciones gastrointestinales, inamacin de bajo grado y antibioticoterapia en el sndrome de intestino irritable. Una revisin
basada en evidencias. Rev Gastroenterol Mex. 2014;79:96---134.
2. Achtman M, Wagner M. Microbial diversity and the genetic nature
of microbial species. Nature Rev. 2008;6:431---40.
3. Caporaso JG, Lauber CL, Walters WA, et al. Ultra-high-throughput
microbial community analysis on the Illumina HiSeq and MiSeq
platforms. ISME J. 2012;6:1621---4.
4. Costello EK, Lauber CL, Hamady M, et al. Bacterial community
variation in human body habitats across space and time. Science.
2009;326:1694---7.
5. Ligaarden SC, Axelsson L, Naterstad K, et al. A candidate probiotic with unfavourable effects in subjects with irritable bowel
syndrome: A randomized controlled trial. BMC Gastroenterol.
2010;10:16.
0375-0906/ 2014 Asociacin Mexicana de Gastroenterologa. Publicado por Masson Doyma Mxico S.A. Todos los derechos reservados.
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CARTAS AL EDITOR
J.F. Garca-Mazcorro a,b, , J.C. Cruz-Valdz a,b ,
A.G. Marroqun-Cardona a,b,c y R.M. Snchez-Casas a,b,d
a
Microbiota gastrointestinal y
sndrome de intestino irritable.
Respuesta a Garca-Mazcorro
Gastrointestinal microbiota and irritable
bowel syndrome; response to Garca-Mazcorro
Sr. Editor:
Agradecemos a Garca-Mazcorro et al.1 su inters en
nuestra revisin2 y nos permitimos enviar nuestra respuesta. En primer lugar, debemos anotar que estamos
totalmente de acuerdo con sus comentarios respecto al trmino oraintestinal. El trmino correcto es microbiota,
denida como la comunidad de microorganismos vivos residentes en un nicho ecolgico determinado. Sin embargo, hay
que anotar que microbiota no solo es la palabra con la cual
inicia el ttulo del artculo, sino que se menciona 79 veces
a lo largo del mismo, mientras que ora solo se mencion 5
veces2 .
Segundo, el gen 16S ribosomal (rARN) es uno de los componentes de la subunidad peque
na (30S) del ribosoma y se
encuentra presente en todas las bacterias y archaea. Es el
marcador gentico que se utiliza en el anlisis logentico
bacteriano y es ampliamente utilizado en un sinnmero de
estudios. Este gen es de aproximadamente 1,550 bp y est
compuesto de 9 regiones de alta variabilidad o regiones
hipervariables anqueadas por regiones estables. Las diferencias en la secuenciacin de estas regiones hipervariables
permiten la identicacin taxonmica de las bacterias presentes en las muestras de estudio (p. ej., heces, mucosa
intestino)3 . El gen rrs, tambin denominado ADN ribosomal 16S o 16S rADN, como se menciona en la tabla 3
de nuestro artculo, codica el 16S rARN. Si bien existen
limitantes en la secuenciacin basada en el 16S rARN, esta
contina siendo el estndar de oro debido a lo extenso de las
bases de datos basadas en este marcador. El Illumina hace
parte de las tecnologas de secuenciacin de la prxima
generacin (next generation) que estn limitadas por la
longitud de las secuencias que pueden proveer y, por lo
tanto, se deben seleccionar regiones especcas del 16S
rARN en el anlisis3 . Existen en la actualidad algunas otras
estrategias y equipos de secuenciacin que se dise
naron para
la complementacin y correccin.
215
d
Unidad de Patgenos Emergentes, Centro de Investigacin
y Desarrollo en Ciencias de la Salud, Universidad
Autnoma de Nuevo Len, Monterrey, Nuevo Len, Mxico
Financiamiento
El documento Microbiota, infecciones gastrointestinales,
inamacin de bajo grado y antibioticoterapia en el