TEMA 9: PPTIDOS

PPTIDOS: ASPECTOS GENERALES

La unin de dos o ms aminocidos (AA)
mediante enlaces amida origina los pptidos.
En los pptidos y en las protenas, estos enlaces
amida reciben el nombre de enlaces peptdicos
y son el resultado de la reaccin del grupo
carboxilo de un AA con el grupo amino de otro,
con eliminacin de una molcula de agua
(Figura de la izquierda). Cuando los AA se
encuentran formando parte de una cadena
polipeptdica se suelen denominar residuos,
para diferenciarlos de su forma libre.


Formacin de un enlace peptdico

Cuando el pptido est formado por menos de 15 AA se trata de un oligopptido (dipptido, tripptido, etc.).
Cuando contiene entre 15 y 50 AA se trata de un polipptido y si el nmero de AA es mayor, se habla de
protenas. En los seres vivos se pueden encontrar protenas formadas por ms de 1000 AA.
Independientemente de la longitud de la cadena
polipeptdica, siempre habr un grupo NH
2
que
no ha reaccionado (el extremo amino) y un
grupo COOH que tampoco ha reaccionado (el
extremo carboxilo).
La formacin de los enlaces peptdicos da lugar
a la cadena principal o esqueleto de la
protena, en la que la unidad repetitiva bsica
est formada por el -NH- (del grupo amino), el
C
o
(con su hidrgeno y su cadena lateral) y el -
CO- del grupo carboxilo (recuadro de color
morado en la figura superior). A partir del
esqueleto se proyectan las cadenas laterales,
responsables de sus propiedades qumicas.
A la hora de nombrar un oligopptido se considera como AA principal al que conserva el grupo
carboxilo. El resto de los AA se nombran como sustituyentes, comenzando por el AA que ocupa el extremo
amino. Por ejemplo, el tripptido de la figura
superior es Ser-Tyr-Cys se denominar seril-tirosil-
cistena.
Para nombrar polipptidos y protenas, se recurre a
nombres triviales que, en la mayora de los casos,
hacen referencia a su funcin.
Se denomina secuencia de un pptido o de una
protena al orden de los AA que lo integran. La
secuencia viene determinada por:
1.- qu AA forman del pptido o protena
2.- el orden en que estn ensamblados
Los trminos polipptido y protena no siempre son
equivalentes, puesto que algunas protenas estn formadas por
ms de una cadena polipeptdica. Es el caso de la hemoglobina
(Figura de la izquierda). En este caso:
- cada polipeptdo no se considera como una protena, sino
como una subunidad de una protena, y est representado de un
color distinto en la figura
- el trmino protena se refiere a la asociacin funcional de
las 4 subunidades


EL ENLACE PEPTDICO
La unin de dos o ms aminocidos (AA)
mediante enlaces amida origina los pptidos. En
los pptidos y en las protenas, estos enlaces
amida reciben el nombre de enlaces peptdicos y
son el resultado de la reaccin del grupo
carboxilo de un AA con el grupo amino de otro,
con eliminacin de una molcula de agua (Figura
de la derecha).

El enlace peptdico (-CO-NH-) se representa normalmente como un enlace sencillo. Sin embargo, posee una
serie de caractersticas que lo aproximan ms a un doble enlace. Como el nitrgeno es menos
electronegativo que el oxgeno, el enlace C-O tiene un 60% de carcter de doble enlace mientras que el
enlace C-N tiene un 40%. Por tanto, los enlaces C-O y N-C del enlace peptdico tienen caractersticas
intermedias entre el enlace sencillo y el enlace doble. De hecho, las distancias interatmicas medidas en los
enlaces C-O y C-N son intermedias entre las del enlace sencillo y el doble enlace. Esta disposicin atmica
est estabilizada por resonancia (Figura de la derecha), de forma que los seis tomos implicados en la
formacin del enlace peptdico estn contenidos en el mismo plano (Figura izquierda de la tabla inferior).
Dipptido Ala-Ser: los tomos que
participan en el enlace peptdico se
representan como bolas y son coplanares
Momento dipolar del enlace peptdico





Otra consecuencia importante de la resonancia es que incrementa la polaridad del enlace peptdico y se
establece un momento dipolar (Figura derecha de la tabla superior). Por este motivo, cada enlace peptdico
puede participar en dos puentes de hidrgeno. En uno de ellos, el grupo -NH- acta como donador de
hidrgeno y en el otro, el grupo -CO- acta como receptor de hidrgeno. Esta propiedad contribuye
notablemente al plegamiento tridimensional de las protenas, tal y como veremos ms adelante.
El carcter parcial de doble enlace impide la libre rotacin del enlace que une los tomos de C y N en el
enlace peptdico (Figuras central e izquierda de la tabla inferior). Esta rigidez del doble enlace limita las
posibilidades conformacionales de los pptidos. Existen dos configuraciones posibles (Figura derecha de la
tabla inferior):
- Configuracin cis: los dos Co se sitan del mismo lado del doble enlace
- Configuracin trans: los dos Co se sitan a distinto lado del doble enlace



Normalmente, la configuracin trans est favorecida. Slo en el caso de que el segundo AA del enlace
peptdico sea la prolina puede resultar favorecida la configuracin cis.
Los pptidos slo podrn cambiar de conformacin mediante el giro
en torno a los enlaces sencillos en los que intervienen los Co
tetradricos (Figura de la derecha).
En cada AA, el Co puede establecer dos ngulos de torsin con los
planos de los dos enlaces peptdicos contiguos: los llamados | (phi) y
(psi) (Figura de la derecha):
- el ngulo phi (|) es la rotacin en torno al enlace CoN
- el ngulo psi () es la rotacin en torno al enlace C-Co
Como estos son los nicos grados de libertad que presenta la
estructura, la conformacin de la cadena polipptdica queda
completamente definida cuando se conocen los valores de y de |
para cada AA.
En la estructura de un pptido o de una protena, cada AA presenta un
valor de | y otro de determinados. Es el tamao fsico de los
tomos o grupos de tomos presentes en las cadenas laterales el que
determina los posibles valores que pueden adoptar los ngulos phi (|)
y psi ().
Cuando se representan los
valores de phi (|) y psi ()
de cada AA se obtiene la
grfica de Ramachandran
(Figura de la izquierda), en
la que se distinguen tres
regiones con valores
"permitidos" de los ngulos de torsin ya que no dan lugar a
impedimentos estricos en la estructura.
Estas regiones corresponden a los dos tipos de elementos
estructurales mayoritarios presentes en las protenas: la estructura
| y la o-hlice.
















PROPIEDADES DE LOS PPTIDOS
Los pptidos son estructuras intermedias
entre los AA y las protenas. Sus
propiedades fsicas y qumicas suelen
reflejar en mayor o menor medida las de
los AA que lo componen. Sin embargo,
al enmascararse mutuamente los grupos
hidroflicos (carboxilo y amina) que
forman parte de los enlaces peptdicos, el
carcter polar o apolar de los pptidos
depende de la naturaleza de los grupos
de las cadenas laterales de los AA que
lo integran (Figura de la derecha).
Anlogamente, los valores de pK de los
grupos ionizables a menudo se ven
alterados por la proximidad de otros
grupos polares.

Los pptidos presentan a menudo ciertas peculiaridades estructurales
que no aparecen en las protenas. Los grupos NH
2
y COOH
terminales pueden encontrarse bloqueados. As, es frecuente
encontrar grupos amino terminales que estn acetilados o en forma de
cido piroglutmico (un residuo de Glu N-sustitudo por su propia
cadena lateral) y grupos carboxilo terminales en forma de amidas. Este
bloqueo de los grupos terminales confiere al pptido resistencia frente a
exopeptidasas. Un ejemplo de pptido que presenta estas
modificaciones es la hormona liberadora de tirotropina (TRH):
piroglutamil-histidil-prolinamida (Figura de la izquierda).












FUNCIONES DE LOS PPTIDOS
En los animales superiores llama la atencin el hecho de cmo unos pocos AA que no presentan
actividad alguna en forma aislada son capaces de desencadenar respuestas biolgicas tan intensas.
Los pptidos se producen generalmente mediante la hidrlisis de protenas precursoras, aunque en
hongos y bacterias existen sistemas de sntesis peptdica no ribosmica, en los cuales los AA son
activados a travs de una va diferente.
Entre las funciones biolgicas ms importantes que realizan los pptidos podemos destacar las
siguientes:
- AGENTES VASOACTIVOS
- HORMONAS
- NEUROTRANSMISORES
- ANTIBITICOS
- ANTIOXIDANTES
AGENTES VASOACTIVOS

El agente hipertensor ms potente que se conoce es la angiotensina II, un octapptido que se origina
mediante la hidrlisis de una protena precursora que se llama angiotensingeno, y que no tiene
actividad vasopresora.
Otros pptidos son agentes hipotensores (tienen actividad vasodilatadora). Uno de los mejor conocidos
es la bradiquinina, un nonapptido que se origina mediante la hidrlisis de una protena precursora
que se llama quiningeno. En la figura inferior se omiten los dobles enlaces de la bradiquinina.
Angiotensina II bradiquinina



HORMONAS
Las hormonas son seales qumicas que ejercen su accin sobre rganos y tejidos situados lejos del
lugar donde se han sintetizado. Muchas hormonas tienen estructura peptdica, como por ejemplo:
- Oxitocina: nonapptido (CYIQNCPLG) segregado por la hipfisis. Provoca la contraccin
uterina y la secrecin de leche por la glndula mamaria, facilitando el parto y la alimentacin
del recin nacido
- Vasopresina: nonapptido (CYFQNCPRG) que induce la reabsorcin de agua en el rin
(tambin se llama hormona antidiurtica)
- Somatostatina: tetradecapptido que inhibe la liberacin de la hormona del crecimiento
- Insulina: Hormona compuesta por 51 AA sintetizada en el pncreas. Estimula la aborcin de
glucosa por parte de las clulas. Su ausencia es causa de diabetes. La insulina fue el primer
pptido que se secuenci por mtodos qumicos. Por ese trabajo, Frederick Sanger recibi el
Nobel de Qumica en 1958. Est formada por dos cadenas polipeptdicas unidas entre s
mediante tres puentes disulfuro (en color amarillo en la figura de la tabla inferior)
- Glucagn: Hormona compuesta por 29 AA liberada por el pncreas cuando los niveles de
azcar en sangre son altos. Hace que en el hgado, el glucgeno se hidrolice para generar
glucosa. Sus efectos son los contrarios a los de la insulina
Oxitocina Insulina Glucagn Vasopresina




NEUROTRANSMISORES
Los neurotransmisores son seales qumicas producidas en un terminal nervioso
presinptico, y que a travs de un receptor especfico ejercen su accin sobre la
neurona post-sinptica (figura de la derecha). Son neurotransmisores peptdicos las
encefalinas (pentapptidos), la |- endorfina (de 31 aminocidos) y la sustancia P
(undecapptido):
Leucn-Encefalina
(YGGFL)
Metionn-Encefalina (YGGFM)
Sustancia P
(RPKPQQFFGLM)




ANTIBITICOS

La valinomicina y la gramicidina S son dos pptidos cclicos con accin antibitica. Los dos
contienen aminocidos de la serie D, adems de otros aminocidos no proteicos.
La valinomicina es un ionforo: es capaz de transportar iones potasio (en color verde en la figura) a
travs de las membrana biolgicas.
Valinomicina
unida al ion
potasio
Transporte de K
+
por la
valinomicina
Gramicidina S






ANTIOXIDANTES

El glutation (H--Glu-Cys-Gly-OH) es un tripptido que acta como antioxidante celular. Reduce las
especies reactivas del oxgeno (como el perxido de H) gracias a la enzima glutatin peroxidasa, la
cual cataliza la siguiente reaccin:
H
2
O
2
+ 2GSH GSSG + 2 H
2
O
Glutatin oxidado (forma un
puente disulfuro)
Glutation reducido (-SH)