Protenas I.

Estructura de protenas.
Facultad de Ciencias Biolgicas
BIO162
Bioqumica General
Profesor:
Dra. Estela Prez Palma
Estructura de las protenas
El enlace peptdico es planar
plano
rotacin
rotacin
Pptidos.
El enlace peptdico tiene carcter de doble enlace y una rotacin restringida.
Estructura de las protenas: Estructura primaria
1. La estructura primaria determina la estructura
tridimensional de la protena
2. La funcin de la protena depende de la estructura
3. Una protena determinada normalmente existe en una o
en unas pocas formas estables
4. Las fuerzas ms importantes que mantienen la estructura
de una protena son interacciones dbiles
5. Podemos reconocer slo algunas estructuras que nos
permiten relacionar a las protenas con su funcin
Estructura de las protenas: Estructura secundaria
Hlice
Cada vuelta de una hlice-alfa contiene 3,6 residuos
Estructura de las protenas: Estructura secundaria
Hlice
Factores que afectan la estabilidad de una hlice
1. La repulsin (o atraccin electrosttica) entre residuos con R cargada.
2. El impedimento estrico de las cadenas laterales adyacentes.
3. Presencia de residuos de prolina o glicina.
4. Interaccin de residuos cargados en los extremos de la hlice .
Estructura de las protenas: Estructura secundaria
Conformacin : Hoja
cuando el sentido (N-terminal a C-terminal)
es el mismo en ambas cadenas. Los
ngulos son = -119 y = +113
cuando el sentido (N-terminal a C-terminal)
es diferente en ambas cadenas. Los
ngulos son = -139 y = +135
Estructura de las protenas: Estructura secundaria
Vueltas en
Abundancia de aminocidos en estructuras secundarias
Resumen. Estructuras secundarias
La estructura secundaria es una disposicin regular de los aminocidos en un
segmento de la cadena polipetdica, en la que cada residuo se relaciona
espacialmente con sus vecinos de la misma manera.
Las estructuras secuandarias ms comunes son la hlice , la conformacin
y los giros .
Las estructuras secuandarias de un segmento polipeptdico pueden defiirse
completamente si se conocen los valores de los ngulos y para todos los
aminocidos del segmento.
Se encuentra estabilizada por:
-Puentes de hidrgeno
- Interacciones hidrofbicas
- Interacciones electrostticas
- Fuerzas de van der Waals
- Puentes disulfuro
La estructura terciaria se refiere al plegamiento global de la cadena polipeptdica
completa, que da lugar a una forma tridimensional especfica.
Estructura terciaria.
Es la distribucin espacial de los distintos segmentos de una protena.
Son protenas que poseen, adems de su cadena aminoacdica, otros compuestos qumicos
asociados a ellas.
GRUPO PROSTTICO: Parte no aminoacdica de una protena conjugada. El grupo
prosttico cumple un papel importante en la funcin biolgica
que posee la protena
Protenas conjugadas
Protenas conjugadas y grupos prostticos
Son clasificadas de acuerdo al grupo prosttico que ellas poseen:
Estructura cuaternaria.
Algunas protenas estn constituidas por dos o ms cadenas polipeptdicas o
subunidades, las cuales pueden ser idnticas o diferentes.
La disposicin de estas subunidades proteicas en complejos tridimensionales
constituye la estructura cuaternaria.
Al considerar estos niveles superiores de estructuras, se hace necesario clasificar las
protenas en dos grupos principales: protenas fibrosas, que presentan cadenas
polipeptdicas dispuestas en largas hebras u hojas, y protenas globulares, son las
cadenas polipeptdicas plegadas en formas globulares o esfricas.
Protenas - Estructura.
Tambin se puede clasificar las protenas de acuerdo a su conformacin, la estructura
tridimensional caracterstica que adquiere en estado nativo.
Se clasifican en dos grupos:
A) Fibrosas: son aquellas que estn constituidas por cadenas polipeptdicas ordenadas,
formando fibras o lminas largas. Son insolubles en agua, resistentes, actan dando
soporte, forma y proteccin externa.
Forman parte del tejido conjuntivo de los animales superiores:
Colgeno: tendones o matriz de los huesos
Elastina: tejido conjuntivo elstico (ligamentos)
Queratinas: cabello, cuerno, uas, plumas y pelos.
B. Globulares: Estn constituidas por cadenas polipeptdicas plegadas estructuralmente,
de modo que adoptan formas esfricas o globulares compactas. Son solubles el agua, y
tienen diversas funciones en la clula.
Entre ellas tenemos:
Enzimas (la mayor parte)
Anticuerpos
Protenas de transporte: albmina y hemoglobina.
Protenas. Estructura
-QUERATINA
Entrecruzamiento por puentes de azufre.
Fuerte, estructuras insolubles que protegen y vara su flexibilidad y dureza. Ej. pelo,
plumas y uas.
Estructura terciaria simple caracterizada por hlice como estructura secundaria. Varias
unidades forman estructura cuaternaria (pelo).
A) PROTEINAS FIBROSAS.
Protenas. Estructura
COLAGENO
Provee fortaleza en tendones, cartlagos, matriz del hueso y cornea del ojo.
No se estira.
Triple hlice: gira a la izquierda, tiene tres aminocidos por vuelta, son tres cadenas
enrolladas.
Contiene un 35%Gly, 11%Ala y 21%Pro e HyPro.
A) PROTEINAS FIBROSAS.
Protenas. Estructura
FIBROINA (Protena de la seda).
Suave, flexible pero no se estira.
Conformacin beta.
Rica en alanina y glicina.
A) PROTEINAS FIBROSAS.
Protenas. Estructura
A) Protenas fibrosas: Estructura y propiedades
Protenas fibrilares
Protenas. Estructura
Los aminocidos en la cadena se enrollan a modo de mejorar la solubilidad de la protena en agua
al situar los grupos polares hacia la superficie de la protena.
B) PROTEINAS GLOBULARES.
Protenas. Estructura
B) Las protenas globulares tienen estructura variada
Protenas. Estructura
Las estructuras supersecundarias tambin denominadas motivos o plegamientos, son
disposiciones muy estables de varios elementos de estructura secundaria y las conexiones entre
ellos.

Horquilla beta
Hlice giro -
hlice
barril beta
B) Estructuras supersecundarias.
Protenas. Estructura
Determinando la presencia de motivos
Los polipptidos con ms de unos pocos cientos de residuos a meudo se pliegan en dos o ms
unidades globulares estables denominadas dominios. En muchos casos un dominio de una
protenas grande mantendr su estructura tridimensional correcta incluso cuando se separa del
resto de la cadena polipeptdica.
Protenas. Estructura
Dominios de protenas
Troponina C
Dominio de unin a Ca
2+
Dominio de unin a Ca
2+
Protenas. Estructura
Gracias a su heterogeneidad estructural, las protenas pueden llevar a cabo funciones
muy diversas. Entre ellas estn:
a) funcin enzimtica
b) funcin hormonal
c) funcin de reconocimiento de seales
d) funcin de transporte
e) funcin estructural
f) funcin de defensa
g) funcin contrctil
h) funcin de reserva
i) transduccin de seales
j) funcin reguladora
Hay protenas que ejercen ms de una funcin, por ejemplo, las protenas de
membrana tienen tanto funcin estructural como enzimtica; la ferritina es una
protena que transporta y, a la vez, almacena el hierro; la miosina interviene en la
contraccin muscular, pero tambin funciona como un enzima capaz de hidrolizar el
ATP.
Funcin de protenas.
Las funciones de muchas protenas involucran la unin reversible de otras molculas. Una
molcula que se une reversiblemente a una protena es llamada ligando, ste puede ser
cualquier tipo de molcula incluyendo otra protena.
El sitio en la protena al que se une el ligando se denomina sitio de unin, el cual es
complementario al ligando en tamao, carga y carcter hidrofbico o hidroflico.
Guanosina Monofosfato reductasa (humana)
mioglobina
Funcin de protenas.
La estructura terciaria es la estructura tridimensional completa de una cadena
polipetdica. Existen dos clases generales de protenas a partir de la estructura terciaria:
fibrosas y globulares.
Las protenas fibrosas, desempean funciones estructurales.
Las protenas globulares tienen estructuras terciarias mpas complejas que a menudo
contienen varios tipos de estructura secundaria en la misma cadena polipetdica.
Las estructuras complejas de las protenas globulares pueden analizarse examinado las
subestructuras estables denominadas estructuras supersecundarias.
La estructura cuaternaria se debe a interacciones entre las subunidades de protenas
multimricas o de grandes complejos proteicos.
Resumen. Estructuras terciarias y cuaternarias.