Control de Lectura N 3

El genoma desconocido
Fuente: laverdad.es
El Universo est constituido esencialmente por una materia de naturaleza
desconocida, la materia oscura o negra. Un 90-95% de nuestro genoma
contiene
regiones no codificantes, igualmente de funcin desconocida. Estas regiones
son
las que se han denominado despectivamente ADN basura, porque sus
secuencias
no contienen la informacin para hacer protenas
Dos de las grandes preguntas de la ciencia actual son comprender el
significado y la
funcin de la materia negra del Universo as como de las regiones no
codificantes del
genoma. El final oficial del Proyecto Genoma Humano, destinado
primordialmente a
conocer la secuencia del ADN informativo, traducible en forma de
protenas, ha sido el
pistoletazo de salida de la investigacin de cmo la mayora del ADN, el no
informativo,
juega un papel regulador esencial sobre la expresin del ADN informativo y,
ms
concretamente, sobre los genes ms relacionados con el desarrollo, la
evolucin y las
enfermedades gnicas.
GENES
Qu es un gen? Clsicamente, sera una regin codificante de ADN que se
transcribe
generando un ARN mensajero (ARNm) que, a su vez, se traduce como
protena. La
secuenciacin de genomas ha permitido comprobar que los animales
comparten en gran

medida el conjunto de regiones codificantes (5-10% del genoma) tanto en

nmero como
en funcin. Esto indica que todos los animales se construyen, ms o menos,
con el mismo
tipo de genes y protenas.
Todas las clula de un organismo contienen el mismo genoma, pero no
todas transcriben
los mismos genes. Eso las diferencia en clulas hepticas, renales,
musculares,
cardacas, etc. Por ejemplo, durante el desarrollo embrionario, los genes
necesarios para generar el rin se
activan (transcriben) en aquellas regiones donde se van a formar los riones
y no en otros lugares. En ranas,
si se fuerza la expresin de estos genes en otros sitios, podemos encontrar
riones en el cerebro. Esto
demuestra cmo es esencial controlar finamente cundo y dnde se
transcribe una regin codificante.
El proceso de transcripcin est altamente regulado. Cmo?. A travs de
protenas, denominadas factores
de transcripcin, que se unen a regiones de ADN no codificantes (regiones
reguladoras) y favorecen la
transcripcin desde el ADN codificante al correspondiente ARNm. Esas
secuencias reguladoras de ADN no
codificantes son pequeas regiones distribuidas en distintos lugares, a
diferentes dis tancias de la regin
codificante. En funcin de la complejidad de transcripcin de un ARNm, ste
tendr ms o menos regiones
reguladoras. Por ello, hay que cambiar el concepto de gen y considerar que
es no slo la regin codificante
sino tambin el conjunto de regiones reguladoras que controlan cundo,
dnde y cunto ARNm se transcribe.ASOCIACIN
UNIVERSIDAD PRIVADA SAN JUAN BAUTISTA
FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD
ESCUELA PROFESIONAL DE MEDICINA HUMANA

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El gran problema es que, a diferencia de las regiones codificantes (5-10%
del genoma) cuyo cdigo se conoce
y por lo tanto podemos leer a partir de la secuencia de un genoma, el
lenguaje y funcin de las regiones
reguladoras (90-95% del genoma) se desconoce.
DESARROLLO Y EVOLUCIN
Cmo se explica la gran diversidad de forma que existen en el reino
animal? Actualmente, pensamos que el
motor esencial que ha operado durante la evolucin para generar distintas
formas radica en la variacin de las
regiones reguladoras no codificantes. El smil podra ser: las protenas son
como los materiales (ladrillos,
vigas, cables, etc) de una construccin; las regiones reguladoras seran los
planos cuyas instrucciones hay
que seguir. En funcin del conjunto de instrucciones los mismos materiales
pueden construir un adosado o el
museo Guggenheim de Bilbao. Por lo tanto, la evolucin ha ido variando el
nmero y tipo de rdenes que
operan sobre las mismas regiones codificantes y ha generado la inmensa
variedad de formas del reino animal.
El desafo cientfico de este siglo es el de conocer y comprender el lenguaje
de estas rdenes.
Comenzamos a saber algo. As, todos los vertebrados tenemos estructuras
comunes y, de hecho, durante el
desarrollo embrionario existe un estadio, denominado filotpico, en el que
todos los embriones de los distintos
vertebrados son muy parecidos. Este estadio, cuando se manifiesta el plan
corporal de los vertebrados, es el
resultado de una regulacin similar de los mismos genes. Posteriormente en
el desarrollo, la regulacin
diferencial de los mismos genes, generar las diferencias morfolgicas. La
comparacin de los genomas
completos de varios vertebrados ha permitido descubrir que existe una serie
de regiones no codificantes

conservadas RNCs en todos los vertebrados.. Puesto que la conservacin

evolutiva implica funcin, es lgico
pensar que parte de estas RNCs contengan elementos reguladores. Ensayos
realizados por diversos
laboratorios, entre ellos el nuestro, lo han demostrado. Curiosamente, los
distintos linajes animales contienen
un conjunto diferente de RNCs. As, las moscas y los gusanos tienen un
conjunto independiente de RNCs
diferente entre ellos y al de los vertebrados. Una posibilidad es que cada
grupo de RNCs contenga el conjunto
de instrucciones para construir un plan corporal distinto.
ENFERMEDADES
Las enfermedades gnicas son debidas a un mal funcionamiento de un
determinado gen durante el desarrollo
embrionario o adulto de un individuo. Cuando se estudia una enfermedad
gnica, en la mayor parte de los
casos, se intenta correlacionar dicha enfermedad con una mutacin en la
regin codificante de un gen. Sin
embargo, existen mltiples enfermedades hereditarias en las que no se ha
establecido dicha correlacin.
Posiblemente, en tales casos, las enfermedades no son causadas por
alteraciones en las regiones
codificantes sino en las reguladoras.
Durante el desarrollo embrionario, las protenas se utilizan multitud de
veces en distintos procesos. Por ello,
los correspondientes ARNm se transcriben en distintos momentos en
distintos lugares. Esto est controlado
por diferentes regiones reguladoras. Una mutacin que afecte a la
generacin de la protena (una mutacin en
la regin codificante) va a suponer una alteracin de mltiples procesos. Por
el contrario, una mutacin en una
regin reguladora va a afectar solo el proceso en el cual la protena est
implicada en un momento y lugar
concreto. Siguiendo con el simil anterior, un edificio no es funcional sin el
tendido elctrico. Sin embargo, si la

orden para que se instale un enchufe en el bao no funciona, el edificio ser

deficiente, pero se podr utilizar.
Puesto que estas regiones son en la inmensa mayora de los casos
desconocidas y aun no sabemos
encontrarlas a partir de la secuencia del genoma, es muy difcil determinar
si una enfermedad est causada
por alteraciones en regiones reguladoras.
Nuestro laboratorio pretende identificar el conjunto de regiones reguladoras
necesarias para generar un
vertebrado, conocimiento esencial para entender no solo los procesos de
desarrollo y evolucin, sino para
identificar regiones candidatas a estar mutadas en enfermedades gnicas.
El anlisis de dichas regiones nos
permitir descifrar el lenguaje que opera en la regulacin de la expresin
gnica, y por lo tanto descifrar el 9095% del genoma que an no sabemos interpretar.