Genoma Humano y su estudio

Dra. Tatiana Pardo G.

Laboratorio de Gentica Molecular
Unidad de Gentica Mdica
Fac. de Medicina, LUZ

Estructura del ADN

Estructura propuesta por Watson y Crick (1953).

El esqueleto de la cadena est formado por las pentosas y los fosfatos
de manera alterna.
Las bases nitrogenadas se unen a los azcares y se proyectan hacia
fuera de la cadena.
Los nucletidos se unen covalentemente a travs de enlaces
fosfodiester entre el azcar de un nucletido y el fosfato del siguiente.
El enlace fosfodiester se refiere a las uniones formadas por la reaccin
entre el grupo hidroxilo (-OH) del carbono 5 y 3 de la ribosa con el grupo
fosfato.
Una caracterstica muy importante de las bases nitrogenadas se ve
reflejada en la estructura de doble hlice del ADN, ya que las dos
cadenas polinucleotdicas permanecen juntas por la accin de puentes
de hidrgeno que se forman entre bases nitrogenadas
complementarias.

Restricciones estructurales

La complementariedad entre las

obedece a las siguientes razones:

bases

Las purinas siempre se enfrentan a las

pirimidinas. El emparejamiento entre los dos
anillos fusionados de una purina con el anillo
sencillo
de
una
pirimidina
aseguran
dimensiones estables en la doble hlice de la
molcula de ADN.
El tamao molecular de las bases.
La ubicacin de los extremos en donde se
establecen los puentes de hidrgeno.
Las dos cadenas de ADN estn en disposicin
antiparalela, es decir que van en direcciones
opuestas y de esta manera se pueden
mantener las hebras juntas.

ADN

ARN

PROTEINA

ARN
CAP

AAAAA
CAP

AAAAAAA

AAAAAA

A RN m

GENOMA HUMANO
TRADUCCIN

GENOMA HUMANO
CODIGO GENTICO

GENOMA HUMANO
LOCALIZACIN

Ncleo

Mitocondria

Clula

Diferencias entre G. Nuclear y G. Mitocondrial

G Nuclear

G Mitocondrial

Tamao

3000 Mb

16,6 Kb

N de Mol Dif.

22 (XX) o 23 (XY)

Forma

Lineal

Circular

N total de Mol

23 en haploides
46 en diploides

Miles

Protenas
asociadas

Histonas

Ninguna

N de genes

30.000

1 Molcula

37

Diferencias entre G. Nuclear y G. Mitocondrial

G Nuclear

G Mitocondrial

Densidad

1/30 1/60 Kb

1/0,45 Kb

ADN repetitivo

Abundante

Escaso

Transcripcin

Individual

Policistrnica

Intrones

Presentes

Ausentes

ADN Codificante

1,5 %

95 %

Recombinacin

Presente

Ausente

Mendeliana

Materna

Herencia

GENOMA HUMANO
FUNCION

CODIFICADOR
GENES
NO CODIFICADOR

1,5 %
EXONES
98,5 %

SEC EXTRAGNICAS
INTRONES

GENOMA HUMANO
ORGANIZACIN

ADN COPIA NICA

GENES

60% del GH

ADN COPIA REPETITIVA

40% GH

DISPERSO
30%

SINEs (SEC Alu)

LINEs (SEC Kpn)

ADN SATLITE

ALFA SATLITE

10%

MINISATLITE

(14-500 pb/VNTRs)

MICROSATLITE

(1-13 pb/STRs)

Variaciones en el Genoma
Mutaciones o polimorfismos
Puntuales

RFLPs (SNPs)

Deleciones

De longitud

Inserciones
Inversiones
Expansiones

Mutaciones

Mutaciones

Mutaciones
Transicin: es la sustitucin de una purina por una

purina o de una pirimidina por otra pirimidina.

Transversin: es la sustitucin de una purina por
una pirimidina o viceversa.

Mutaciones
Silenciosa: No hay alteracin de la funcin o de la

cantidad. Cambio de un aminocido por otro de igual

naturaleza o por el mismo aminocido.

Mutaciones
Sin sentido: producto inactivo o incompleto. Codn
de terminacin prematuro.

Prdida del sentido: Producto defectuoso, Sentido

errado, cambio de un aminocido por otro.

Mutaciones
Error en el marco de lectura: se agregan o se

elimina una base o un grupo de bases que no es

mltiplo de 3.

Mutacin Puntual
5

A:

S:

C:

pro
CCT

glu
glu
GAG GAG

CCT
pro

GTG
val

CCT
pro

AAG GAG
lys
glu

GAG
glu

Gen del FVIII: Deleciones

Mutacin: Inversin de Secuencia

AATCCGATGCCGGAATATGACTCT
TTAGGCTACGGCCTTATACTGAGA
AATAGGCCGTAGCCATATGACTCT
TTATCCGGCATCGGTACTGAGAGA

Mutacin tipo Inversin

1

F8A F8A

qter

22

FVIII

100 Kb

1Mb

FVIII

F8A F8A

qter

22
23 26

23 26

Mutacin: Expansin
FMR1

FMR2

Genes: FRAXA FRAXE

Xq27.3
Xq27
CGG
GCC
N: 6 56 CGG

N: 6-25 GCC

Polimorfismos

RFLPs

Polimorfismos

De longitud

FUNDAMENTO DEL ANLISIS DE ADN

La reaccin en cadena de la polimerasa

(PCR)
Obtencin millones de copias de un fragmento mediante la
amplificacin selectiva in vitro de ADN, basada en las propiedades
de desnaturalizacin, renaturalizacin e hibridacin del ADN.

FUENTES DE OBTENCIN DE ADN

Sangre
Manchas
Mdula sea
Piel
Tejidos congelados.
Tejidos cultivados.
Pulpa dental
Apndices pilosos con o sin bulbo
Uas, Cutculas
Orina, Heces
Hisopado bucal, saliva
Hisopados vaginales, rectales
Lquido amnitico
Lquido seminal
Restos seos
Restos calcinados
Biopsias, Tumores

DIAGNSTICO MOLECULAR
(a travs de la vida)

Pre-concepcin
Portadores

Fecundacin

Pre-implantacin

Durante la vida
Neonatal Pre-sintomtico Post-sintomtico

Prenatal

Muerte
Post-mortem

Diagnstico Molecular
de Enfermedades Hereditarias
Anlisis Directo
(Mutaciones especficas)

Diagnstico Molecular
de Enfermedades Hereditarias
Anlisis Directo
(Mutaciones especficas)

Diagnstico Molecular
de Enfermedades Hereditarias
Anlisis Directo
(Mutaciones especficas)

Diagnstico Molecular
de Enfermedades Hereditarias
Anlisis Indirecto
(polimorfismos asociados)

Determinacin de vnculo biolgico

Paternidad*
Maternidad*
Hermandad
To-sobrino
Abuelo-nieto
Entre primos hermanos
Entre primos segundos
Entre dobles primos segundos
Gemelos idnticos

* Casos de Deficiencias

CASO DE PATERNIDAD: D1S80

Gracias.