BIOTECNOLOGA

FUNDAMENTOS DE GENTICA MOLECULAR

Unidad1

Bqco.AlonsoR.PugaYung
alonso.puga@gmail.com

ProyectoGenomaHumano
Comienza en 1990
Determinar el orden
relativo de todos los
nucletidos presentes
en el genoma
Es solo el principio

Finaldelproyectodel
genomahumano
comienzodelaera
de la genmica
delagenmica

1erbosquejo,Febrero2001

FinalizacindelPGH,Abril2003

Historia delsecuenciamiento delADNseencuentra relacionada alas nuevas tecnologas.

Messing J , Llaca V PNAS 1998;95:2017-2020

1998 by The National Academy of Sciences

1999

2000

2007

2008

2008

2009

2010

2009

2007

2009

2010
2011

Caracterstica

Levadura

Mosca delafruta

Humano

Densidadgnica
(promedio degenespor
de genes por
Mb)

479

76

11

Intronesporgenes
(promedio)

0,04

3,00

9,00

Cantidaddel genoma
quecorrespondeaADN
repetido

3,4%

12,0%

44,0%

G
Genomes.
2 d edition.
2nd
diti
B
Brown
TA Oxford:
TA.
O f d WileyLiss;
Wil Li 2002.
2002

>180especieshansidosecuenciadasdesde1995

http://www.genomenewsnetwork.org/resources/sequenced_geno
mes/genome_guide_index.shtml

GenomaHumano
3,3 x 109 pares de bases (pb)
Codifica aproximadamente
genes

para

~20
20.000
000

Existeunarelacinentreelcontenidode
ADNycomplejidaddelorganismo?

Escalaevolutiva

Existeunarelacinentreelcontenidode
ADNycomplejidaddelorganismo?

Tamaodelgenoma

yelnmerodegenesylacomplejidaddel
organismo?
Tamaodel
genoma(Mb)
genoma
(Mb)

Nmerode
genes

Mycoplasma genitalium

0,58

500

Escherichia coli

4,6

4.400

Saccharomycescervisiae

12

5.800

Caenorhabditiselegans

97

19.000

Arabidopsisthaliana

125

25.000

Drosophilamelanogaster
hl
l

180

13.000

Oryzasativa(arroz)

466

4555.000

Musmusculus(ratn)

2.500

29.000

Homosapiens(humano)

3.300

2025.000

Especie

GenomaHumano
El 99,5% corresponde al genoma nuclear
y el 0,5% corresponde al genoma mitocondrial.
La mayor parte del ADN es no codificante.

25%

4% (1,5%)

75%

96%

Genes
Los genes se pueden clasificar como:
1) De Copia nica
La mayora de nuestros genes.
Ej: enzimas, hormonas, receptores,
protenas estructurales, etc.

2) Familias Multignicas
Genes con funciones similares y/o
secuencias parecidas.
Pueden estar juntos en un cromosoma o
separados en varios.

FamiliasGnicas:
EvolucindelasGlobinas

El genoma humano contiene ~20.000

genes que codifican para protenas. Sin
embargo,
b
se ha
h estimado
i d que ell proteoma
humano contiene ~500.000 protenas.
Cmo explicara Ud esta diferencia?

Splicing alternativo

10

25%

4%(1,5%)

75%

96%

ADNNoCodificante
4% (1,5%)

ADN codificante
ADN no codificante

(23,5%)
96% (36%)

Est compuesto por:

1. FUNCIONALES: Intrones, fragmentos no transcritos
(UTR), etctera
2. NO FUNCIONALES: Seudogenes y fragmentos gnicos

11

25%

4%(1,5%)

75%

96%

ADNRepetitivoNoCodificante
1. Repeticionesentndem
a)) Satlite
S tlit
b) Minisatlite
c) Microsatlite

2. Repeticionesdispersas(interspersed)
a) Cortas(SINEs)
b) Largas(LINEs)

12

1.RepeticionesenTndem
a) ADNsatlite
Regiones repetidas de varios cientos de Kb,
compuestos por unidades de 5170 pb. En los
centrmeros de los cromosomas
ATTXX ATTXX

ATTXX

(5170pb)
100KbMb

1.RepeticionesenTndem
1.
RepeticionesenTndem
b) ADN minisatlite
Regiones repetidas de un tamao de 0,120 Kb,
compuestas por unidades de 660 pb
TTAGGG TTAGGG

TTAGGG

(6
((660pb)
b)
0,120Kb
0,1

13

Un tipo de ADN minisatlite se distribuye en los

extremos de los cromosomas:
En
E las
l
regiones
i
t l i
telomricas
d los
de
l
cromosomas
(TTAGGG)n, protegen a los extremos de los
cromosomas de degradacin

1.RepeticionesenTndem
c) ADN microsatlite
Mltiples copias de secuencias repetidas
simples (generalmente 14 pb), repetidas a lo
largo del genoma.
Mononucletidos. grupos de (A)n o (T)n
Dinucletidos: (CA)
( )n, tri y tetra
nucletidos
Pueden ser intergnicos o estar
contenidos dentro de intrones

14

2.Repeticionesdispersas
Representan entre el 15
1520%
20% del genoma
humano, pueden ser:
a) SINEs (short interspersed nuclear elements).
Elementos entremezclados nucleares cortos, de ~300 pb,
repitindose cada 310 Kb . Existen unas 1.500.000 copias en
el genoma.

b) LINEs (Long interspersed nuclear elements).

Elementos entremezclados nucleares largos, de ~6000 pb.
Existen aproximadamente 1.000.000 copias en el genoma.

LocalizacindeADNrepetitivo

15

Deque sirve elADNrepetitivo?

FuncionesdeADNrepetitivos
Desconocida
Involucrados en
Recombinacin entre homlogos
Recombinacin desigual (causa de mutaciones o
duplicaciones)

Usos
en
biotecnologa
y
medicina
(particularmente los microsatlites) como
marcadores.

16

AnlisisdemarcadorSTM_1016en
Papas Nativas

0,5%

99,5%

25%

4%(1,5%)

75%

96%

~60%

~40%

17

Mitocondria

Genomamitocondrial(ADNmt)
Molcula circular de ADN doble hebra
Tamao de 16,6 Kb
Decenas a centenas de copias del genoma por
mitocondria
Varias mitocondrias por clula
Por lo tanto, corresponde al 0,5% del genoma
humano

18

Codifica para:
13 protenas de la
cadena transportadora
de
22 ARNt
2 ARNr

ComplejoI
C
ComplejoIII
l j III
ComplejoIV
ComplejoV
ARNr
ARNt

93% codificante
No contiene intrones
La transcripcin es policistrnica , es decir, el producto de
transcripcin es un ARNm nico, el cual se cortan originando
los ARNt, c/u de los ARNm y ARNr.
ARNm
(mit)

+22ARNt
+2ARNr

19

Diferencias entre cdigo universal y cdigo

mitocondrial.
Codn

Cdigo nuclear

UGA

STOP

Cdigo
mitocondrial
triptofano

AUA

Isoleucina

metionina

AGA

Arginina

STOP

AGG

Arginina

STOP

La simbiosis bacteriana con un eucariota primitivo sera la

principal etapa en la evolucin de la clula eucariota.
1980, Lynn Margulis,
Teora de la Endosimbiosis:
Hace 1.500 700 x106 de
aos, un procariota grande o
quizs un primitivo eucariota
englob
a
un
pequeo
procariota.
El organismo grande y el
pequeo entraron en una
simbiosis en la cual ambos se
beneficiaron.

20

El organismo grande pudo

haber ganado un excedente de
ATP,
provisto
por
la
"protomitocondria"
o
un
excedente de azcar provisto por
el "protocloroplasto", y haber
provisto
al
endosimbionte
pequeo de un medio ambiente
estable con nutrientes.

Origen de las mitocondrias y cloroplastos: Teora

de endosimbitica.

21

El origen de la mitocondria. Una clula eucarionte

ancestral ingiri una ancestro bacteriano de la
mitocondria, iniciando una relacin simbitica.

Cloroplastos. Esos organelos capturan la energa de la luz

solar en las plantas y en algunos eucariontes unicelulares

22

El origen de los cloroplastos. Una clula eucarionte

ancestral que ya posea mitocondrias, ingiere una
bacteria fotosinttica (una cianobacteria) y es retenida
de manera simbionte.

Resumen:
Organismos
Tamao celular
Metabolismo
Organelos

Procariontes

Eucariontes

bacterias y cianobacterias

protistas,
hongos,
plantas
animales
generalmente de 5 a 100 m

generalmente de 1 a 10 m
anaerbica aerbico
pocos o ninguno

aerbico
ncleo, mitocondria, cloroplasto,
retculo endoplsmico, etc.

ADN circular en el citoplasma

molculas de ADN lineal muy

largas
con
regiones
no
codificantes y envoltura

ARN y protenas

sntesis del ARN y la protena en

el mismo compartimiento

el ARN se sintetiza en el ncleo y

las protenas en el citoplasma

Citoplasma

sin citoesqueleto: ausencia de

movimientos
i i t
citoplasmticos,
it l
ti
endocitosis y exocitosis

Divisin celular

cromosomas son separados por

su unin a la membrana
plasmtica

citoesqueleto compuesto de
fil
filamentos
t
proteicos;
t i
presentan
t
movimientos
citoplasmticos,
endocitosis y exocitosis
los cromosomas son separados
por traccin del huso mittico
(citoesqueleto)

ADN

Organizacin celular principalmente unicelular

principalmente multicelular con

diferenciacin en muchos tipos
celulares

23

Bibliografa
Klug WS,
WS Cummings MR,
MR y Spencer C.
C 8a
edicin (2006). Conceptos de Gentica.
Pearson: Prentice Hall, Madrid.
Griffiths AJF. 9a edicin (2008). Gnetica.
McGrawHill, Madrid.

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/.Seccin Books
Human MolecularGenetics.Strachan.(2edicin)
Molecular Genetics Strachan (2 edicin)
Introduction to Genetic Analysis.Griffith,Suzuki
etal.(7edicin)
MolecularBiology ofthe Cell.Alberts.(4edicin)

24