Se requieren grandes cantidades de DNA para codificar toda la informacin necesaria para producir solo una bacteria unicelular, y se necesita mucho ms DNA para codificar las instrucciones que dirigen el desarrollo de los organismos multicelulares, como el del ser humano. Cada clula humana contiene cerca de 2 m de DNA, aunque el ncleo celular tiene solamente un dimetro de 5 a 8 m. Intentar introducir todo este material en un espacio tan pequeo es equivalente a tratar de plegar 40 Km. de hebras extremadamente finas en una pelota de tenis. En las clulas eucariontes, las molculas bicatenarias enormemente largas estn contenidas en los cromosomas, que no solo ocupan cmodamente el interior del ncleo, sino que pueden ser distribuidos con facilidad entre las dos clulas hijas en cada divisin celular. Como se ver en esta seccin, la tarea compleja de compactar el DNA es llevada a cabo por protenas especializadas que se unen a ste y lo pliega, lo cual genera una serie de enrollamientos y asas que proporcionan niveles cada vez ms altos de organizacin y que evitan que el DNA se transforme en una maraa difcil de controlar. Asombrosamente, el DNA est compactado de un modo tan ordenado que puede llegar a ser accesible a todas las enzimas y a otras protenas que lo replican, lo reparan y utilizan sus genes para producir protenas. Las bacterias tpicamente transportan sus genes en una nica molcula de DNA circular. Este DNA tambin se asocia con protenas que lo condensan, pero que difieren de las protenas que hacen lo propio en tas clulas eucariontes. Aunque es denominado con frecuencia un "cromosoma" bacteriano, este DNA procarionte no tiene la misma estructura que la de los cromosomas eucariontes, y se sabe menos acerca de cmo se condensan. Nuestra explicacin de la estructura cromosmica estar centrada enteramente en los cromosomas eucariontes.
El DNA eucarionte est condensado en los cromosomas En los eucariontes, como el ser humano, el DNA se distribuye en un grupo de diferentes cromosomas en el ncleo. El genoma humano, por ejemplo, contiene aproximadamente 3,2 x 10 9
nucletidos distribuidos en 24 cromosomas. Cada cromosoma consiste de una nica molcula de DNA lineal muy larga asociada a protenas que pliegan la fina hebra de DNA en una estructura ms compacta. El complejo de DNA y protena se denomina cromatina (del griego chroma, "color," 2 a causa de sus propiedades de tincin). Adems de las protenas involucradas en la condensacin del DNA, los cromosomas tambin se asocian con otras protenas que intervienen en la expresin gnica, la replicacin del DNA y reparacin de ste. Con la excepcin de las clulas germinales (espermatozoides y vulos) y de las clulas muy especializadas que carecen de la totalidad del DNA (como los glbulos rojos sanguneos), cada clula humana contiene dos copias de cada cromosoma, una heredada de la madre y otra del padre; los cromosomas maternos y paternos de un par se denominan cromosomas homlogos (homlogos). El nico par de cromosomas no homlogo es el par sexual en los hombres, donde un cromosoma Y es heredado del padre y un cromosoma X de la madre. Los cromosomas humanos pueden individualizarse por hibridacin del DNA (tcnica que se describe en detalle en cap. 10); la tcnica utiliza un grupo de molculas de DNA unidas a molculas fluorescentes para "pintar" cada cromosoma de un color distinto (fig. 5-12).
Fig. 5-12. Cada cromosoma humano puede "pintarse" con un color diferente para permitir su identificacin precisa con el microscopio ptico. Los cromosomas de un hombre fueron aislados de una clula en divisin nuclear (mitosis) y por ello se encontraban en un estado altamente compacto. El color de los cromosomas se obtiene mediante su exposicin a un conjunto de molculas de DNA humano que se acoplaron a una combinacin de marcadores fluorescentes. Por ejemplo, las molculas de DNA derivadas del cromosoma 1 estn marcadas con una combinacin especfica, las del cromosoma 2 con otra y as sucesivamente. Como el DNA marcado puede formar apareamiento de bases, o hibridar solamente a su cromosoma de origen (vase el cap. 10), cada cromosoma est marcado de modo diferente. Para estos experimentos, los cromosomas se someten a tratamientos que separan la doble hlice de DNA en cadenas individuales, lo cual permite e) apareamiento de bases con el DNA marcado de cadena simple, al tiempo que se mantiene la estructura cromosmica relativamente intacta. (A) Los cromosomas se visualizan en su distribucin original a partir del lisado celular- (B) Los mismos cromosomas alineados artificialmente en orden. En este cariotipo, los cromosomas homlogos estn numerados y dispuestos en pares: la presencia del cromosoma Y indica que el DNA fue aislado de un hombre. (De E. Schrck y col., Soence 273:494-497, 1996.QAAAS.
3 Pero el modo ms tradicional para distinguir un cromosoma de otro es teirlos con marcadores que se unen a determinados tipos de secuencias de DNA. Estos marcadores diferencian principalmente entre el DNA que es rico en los pares de nucletidos A-T y el DNA que es rico en G-C, y producen un sorprendente y confiable patrn de bandas a lo largo de cada cromosoma (fig. 5-13). La disposicin en bandas en cada tipo de cromosomas es nica y permite identificar y numerar cada cromosoma.
Fig. 5-13. Los patrones de bandeo nico permiten la identificacin de cada cromosoma humano. Los cromosomas 1 a 22 son enumerados en el orden aproximado en relacin con su tamao. Una clula somtica (es decir, no germinal) humana tpica contiene dos de cada uno de estos cromosomas ms dos cromosomas sexuales: dos cromosomas X en la mujer y un cromosoma X y uno Y en el hombre. Los cromosomas utilizados para hacer estos mapas se tieron en un estadio temprano de la mitosis, cuando el DNA est compactado. La lnea horizontal representa la posicin del centrmero, que aparece como una constriccin en los cromosomas mitticos; las prominencias en los cromosomas 13,14,15.21 y 22 indican las posiciones de los genes que codifican para los RNA ribosmicos de mayor tamao (vase cap. 7). Estos patrones son obtenidos mediante tincin de los cromosomas con el mtodo de Giemsa, que produce bandas oscuras en regiones ricas en los pares de nucletidos A-T. (Adaptado de U. Franke, Cytogenet. Ce// Genet-31:24-32, 1981.)
Una muestra del grupo completo de 46 cromosomas se denomina cariotipo humano. Si se pierden partes de un cromosoma, o se intercambian entre los cromosomas, estos cambios pueden detectarse por las modificaciones en el patrn de las bandas. Los citogenetistas utilizan las alteraciones en el patrn de las bandas para detectar anomalas cromosmicas que se asocian con algunos defectos heredados (fig. 5-14) y con ciertos tipos de cncer.
4 Fig. 5-14. Los cromosomas anormales se asocian con algunos defectos genticos hereditarios. (A) Un par de cromosomas de un paciente con ataxia hereditaria, enfermedad caracterizada por el deterioro progresivo de las habilidades motoras. Los pacientes tienen un cromosoma 12 normal (izquierda) y un cromosoma 12 aberrante, como se aprecia por su mayor longitud. A partir de este patrn de bandas el material adicional contenido en el cromosoma 12 aberrante se dedujo que era una pieza del cromosoma 4 que se haba adherido de forma inadecuada al cromosoma 12, (B) Los cromosomas se muestran aqu con el segmento que corresponde al DNA del cromosoma 4 de color azul y las partes que corresponden al DNA del cromosoma 12 de color rojo. (De E, Schrck y col., Science 273:294-497,1996. AAAS.) Los cromosomas contienen largas hileras de genes La funcin ms importante de los cromosomas es transportar a los genes, que son las unidades funcionales de la herencia (fig. 5-15). Un gen se define en general como un segmento de DNA que contiene las instrucciones para producir una protena particular (o, en algunos casos, una grupo de protenas estrechamente relacionadas). Aunque esta definicin se ajusta a la mayor parte de los genes, algunos dirigen la produccin de una molcula de RNA, en lugar de una protena, como su producto final. Al igual que las protenas, las molculas de RNA llevan a cabo diversas funciones catalticas y estructurales en la clula, segn se describir en captulos posteriores. Como puede preverse, existe una correlacin entre la complejidad de un organismo y el nmero de genes en su genoma. Por ejemplo, el nmero total de genes es menor de 500 para una bacteria simple y cerca de 30 000 en el hombre. Las bacterias y algunos eucariontes unicelulares tienen genomas especialmente compactos: las molculas de DNA que forman parte de sus cromosomas son poco ms que filamentos o genes estrechamente agrupados. Sin embargo, los cromosomas de muchos eucariontes (incluidos los humanos) contienen, adems de los genes, gran cantidad de DNA intercalado que no parece transportar informacin crtica. A veces se lo denomina DNA "basura", en la medida que su utilidad para la clula todava no ha sido claramente demostrada. Aunque la secuencia de nucletidos particulares de este DNA podra no ser importante, el DNA mismo -que acta como material espaciador- podra ser significativo para la evolucin a largo plazo de la especies y para la propia actividad de los genes.
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Fig. 5-15. Se muestran los genes localizados en una porcin del cromosoma 2 de la mosca de la fruta Drosophila melanogaster. Esta figura representa aproximadamente el 3% del total del genoma de la Drosophila, dispuesto como seis segmentos contiguos. Como se resume en tas claves, las representaciones simblicas son barras horizontales con los colores del arco iris para el contenido de pares de bases de G-C; barras verticales coloreadas, los genes (conocidos y predecidos) codificados en una de las cadenas del DNA (por arriba de la lnea media) y los genes codificados en la otra cadena (barras por debajo de la lnea media). Como se indica en la clave, la altura de la barra de cada gen indica la certeza con la cual representa a un gen verdadero: la altura de confianza. El color de la barra de cada gen (vase cdigo de color en la clave) seala si un gen ntimamente relacionado se halla en otros organismos. Por ejemplo, MWY significa que el gen tiene correspondencia estrecha en mamferos, en el gusano nematodo Caenorhabditis elegans y en la levadura Saccharomyces cerevisiae. MW denota que se encuentra en mamferos y el gusano, pero no en la levadura. (De Mark D. Adams y col., Science 287:2185-2195. 2000. AAAS.)
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En general, cuanto ms complejo es un organismo, ms grande es su genoma. Pero esta relacin no siempre se cumple. El genoma humano, por ejemplo, es unas 200 veces ms grande que el de la levadura S. cerevisiae, pero unas 30 veces ms pequeo que el de algunos vegetales y 200 veces ms pequeo que el de algunas especies de amebas. Adems, tambin difiere de una especie a la otra en cmo se distribuye el DNA en los cromosomas. Los seres humanos tienen 46 cromosomas, pero una especie de ciervos pequeos tiene solamente 6, mientras que ciertas especies de carpas tienen ms de 100. Incluso especies estrechamente relacionadas con tamaos de genomas similares pueden tener cromosomas con un nmero y tamao distintos (fig. 5-16). Por lo tanto, aunque el nmero de genes est casi correlacionado con la complejidad de las especies, no mantiene una relacin simple con el nmero de cromosomas y el tamao total del genoma. Los genomas y los cromosomas de las especies actuales fueron modelados por una serie de acontecimientos genticos aparentemente al azar en respuesta a una presin de seleccin.
Fig. 5-16. Las especies estrechamente relacionadas pueden tener un nmero de cromosomas muy diferente. En la evolucin del ciervo mutiaco de la India, los cromosomas que se separaron al inicio se fusionaron sin tener un efecto significativo sobre el animal. Las dos especies muestran tener aproximadamente el mismo nmero de genes. (Adaptado de M.W. Strickberger, Evolution, 3 ed. Sudbury. MA; Jones & Bartlett Publishers, 2000.)
Pregunta 5-2 En una doble hlice de DNA, los pares de nucletidos adyacentes estn a 0,34 nm de distancia. Utilice la figura 5-13 para estimar la longitud del DNA en el cromosoma humano 1 si ste estuviera desenrollado y estirado. Si la longitud real del cromosoma 1 en este estadio de la mitosis es aproximadamente de 10 m, cul sera el grado de compactacin del DNA? 7 Los cromosomas existen en diferentes estados durante la vida de la clula Para formar un cromosoma funcional, una molcula de DNA debe hacer algo ms que transportar genes: necesita replicarse y las copias deben separarse y distribuirse con exactitud entre las clulas hijas en cada divisin celular. Estos procesos se producen a travs de una serie ordenada de estadios, conocidos en conjunto como ciclo celular. Este ciclo de crecimiento celular se resume brevemente en la figura 5-17 y se examina en detalle en el captulo 19. Solamente dos de estos estadios requieren nuestro inters en este capitulo: la interfase, cuando los cromosomas se duplican; y la mitosis, cuando se distribuyen en los ncleos de las dos clulas hijas.
Fig. 5-17. La replicacin y la segregacin de los cromosomas tienen lugar a travs de una serie de estadios, denominados ciclo celular. Durante la interfase, la clula expresa activamente sus genes. Todava durante la interfase y antes de la divisin celular, el DNA es replicado y los cromosomas se duplican. Una vez que se completa la replicacin del DNA, la clula puede entrar en la fase M, cuando se produce la mitosis. La mitosis es la divisin del ncleo. Durante este estadio, los cromosomas se condensan, la expresin gnica cesa en su mayor parte, la envoltura nuclear se fragmenta y se forma el huso mittico a partir de los microtbulos y de otras protenas. El huso mittico captura los cromosomas condensados y lleva un grupo completo de cromosomas hasta cada extremo de la clula. Se forma una envoltura nuclear alrededor de cada grupo de cromosomas, y en la etapa final de la fase M, la clula se divide y forma dos clulas hijas.
8 Durante la interfase, los cromosomas estn extendidos como hebras largas, finas y entrelazadas en el ncleo y no pueden distinguirse fcilmente con el microscopio ptico. Los cromosomas en este estado extendido se denominan como cromosomas en interfase. Las secuencias de DNA especializadas que se hallan en todos los eucariontes garantizan que los cromosomas en interfase se repliquen en forma enciente (Fig. 5-18). Un tipo secuencia de nucletidos acta como el origen de la replicacin, la localizacin en la cual comienza la duplicacin del DNA, como se ver en el captulo 6. Los cromosomas eucariontes contienen muchos orgenes de replicacin para asegurar que la totalidad del cromosoma pueda replicarse rpidamente. Otra secuencia de DNA forma los telmeros, que se hallan en cada uno de los dos extremos del cromosoma. Los telmeros contienen secuencias de nucletidos repetidas que permiten que los extremos de los cromosomas se repliquen. Tambin protegen al extremo del cromosoma de ser confundido por la clula con una molcula de DNA rota que necesita de reparacin. La replicacin y la funcin de los telmeros se analizan en captulos posteriores. Fig. 5-18. Tres elementos de la secuencia de DNA son necesarios para producir un cromosoma eucarionte que pueda replicarse y luego segregarse en la mitosis. Cada cromosoma tiene mltiples orgenes de replicacin, un centrmero y dos telmeros. Se muestra esquemticamente la secuencia de procesos que experimenta un cromosoma tpico durante el ciclo celular- En la interfase comienza la replicacin del DNA en los orgenes de replicacin y avanza bidireccionalmente a lo largo del cromosoma. En la fase M, el centrmero une a los cromosomas duplicados en el huso mittico de modo que durante la mitosis ser distribuida una copia a cada clula hija. Los centrmeros tambin contribuyen a mantener juntos a los cromosomas duplicados hasta que estn listos para su separacin. Los telmeros forman capuchones especiales en cada extremo del cromosoma.
9 A medida que avanza el ciclo celular, el DNA se enrolla y adopta una estructura cada vez ms compacta, hasta que se forman cromosomas mitticos muy condensados. Esta es la forma en la cual se visualizan con mayor facilidad; en efecto, todas las imgenes de los cromosomas mostradas hasta ahora en el captulo son de cromosomas mitticos. En este estado condensado, los cromosomas duplicados pueden separarse fcilmente cuando la clula se divide. Es la presencia de una tercera secuencia de DNA especializada, el centrmero, la que permite que una copia de cada cromosoma duplicado se distribuya en cada clula hija (vase fig. 5-17). Los cromosomas en interfase estn organizados dentro del ncleo A pesar de que los cromosomas de las clulas en interfase son mucho ms largos y finos que los cromosomas mitticos, se piensa que estn bien organizados dentro del ncleo. El ncleo se halla delimitado por una envoltura nuclear formada por dos membranas concntricas. La envoltura nuclear est sostenida por dos redes de filamentos proteicos (vase cap. 17): una, denominada la lmina nuclear, forma una capa delgada subyacente que sostiene a la membrana nuclear interna; mientras que la otra, con una organizacin menos regular, rodea a la membrana nuclear externa (fig. 5-19). Las dos membranas estn horadadas a intervalos por los poros nucleares, que trans- portan en forma activa ciertas molculas hacia el citosol y desde ste. El interior del ncleo no es una mezcla al azar de muchos componentes de DNA, RNA y protenas. Cada cromosoma en interfase probablemente ocupa una regin particular del ncleo de modo que diferentes cromosomas no se llegan a enredar entre s. Se piensa que esta organizacin se alcanza al menos en parte mediante la adherencia de partes de los cromosomas a sitios de la envoltura nuclear o de la lmina nuclear. El ejemplo ms obvio de la organizacin de los cromosomas en el ncleo en interfase es el nuclolo, la estructura ms destacada en ese estado con el microscopio ptico. Esta es una regin donde las partes de los diferentes cromosomas que transportan genes para el RNA ribosmico estn agrupados entre s (vase figs. 5-13 y 5-19). Aqu, los RNA ribosmicos se sintetizan y combinan con protenas para formar ribosomas, la maquinaria celular que sintetiza protenas (vase cap. 7).
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Fig. 5-19. Los cromosomas interfsicos estn organizados dentro del ncleo. (A) Micrografa electrnica de una seccin delgada a travs del ncleo de un fibroblasto humano, El ncleo est rodeado por la envoltura nuclear, que consta de una membrana doble, perforada por poros nucleares. Dentro del ncleo, la cromatina aparece como una masa abigarrada difusa, con regiones cromosmicas especialmente densas, denominadas heterocromatina (tincin oscura), que se localizan sobre todo alrededor de la periferia, inmediatamente por debajo de la envoltura nuclear. La regin oscura de gran tamao es el nuclolo. (B) Representacin esquemtica de la seccin transversal de un ncleo celular tpico. La envoltura nuclear consiste en dos membranas, de las cuales la externa se contina con el retculo endoplasmtico. Dos redes de filamentos de citoesqueleto (verde) proporcionan sostn mecnico a la envoltura nuclear: los del interior del ncleo forman la lmina nuclear, que reviste la cara interna de la membrana nuclear Interna. El nuclolo (gris) es el sitio de la sntesis de RNA ribosmico. (A. cortesa de E. G. Jordn y J. Mc Govern.)
El DNA en los cromosomas se halla muy condensado Como se ha visto, en todas las clulas eucariontes, estn en interfase o en mitosis, el DNA est condensado en los cromosomas. El cromosoma 22 humano, por ejemplo, presenta cerca de 48 millones de pares de nucletidos; estirado de un extremo al otro, su DNA podra extenderse cerca de 1,5cm. Sin embargo, durante la mitosis, el cromosoma 22 mide solamente cerca de 2 m de longitud, lo cual indica que es casi 10 000 veces ms compacto que su forma extendida. Este fenmeno de condensacin lo llevan a cabo protenas que enrollan y pliegan el DNA en niveles cada vez ms altos de organizacin. El DNA de los cromosomas en interfase, aunque menos condensado que el de los cromosomas mitticos (fig. 5-20), todava est muy condensado. en una proporcin de cerca de 1000 veces.
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Fig. 5-20. El DNA en los cromosomas en interfase es menos compacto que el de los cromosomas mitticos. (A) Micrografa electrnica que muestra una enorme maraa de DNA cromosmico que se vuelca de un ncleo en interfase lisado. (B) Micrografa electrnica de barrido de un cromosoma mittico; el cromosoma se ha duplicado, pero los dos cromosomas nuevos todava estn unidos entre si (vase fig. 5-18). La regin de la constriccin indica la posicin del centrmero. Obsrvese la diferencia en las escalas. (A, cortesa de Victoria Foe; B, cortesa de Terry D. Alien.)
En las siguientes secciones se considerarn las protenas especializadas que hacen posible esta compresin. Tngase en mente, sin embargo, que el cromosoma es una estructura dinmica. Los cromosomas no se condensan y relajan solamente en relacin con el ciclo celular, sino que diferentes regiones de los cromosomas en interfase deben desplegarse para permitirle a las clulas el acceso a secuencias de DNA especificas para la replicacin, reparacin o expresin gnica. La condensacin de los cromosomas, por lo tanto, debe ser lo bastante flexible como para hacer posible un acceso rpido y localizado al DNA segn la necesidad. Los nucleosomas son las unidades bsicas de la estructura de la cromatina Las protenas que se unen al DNA para formar los cromosomas eucariontes tradicionalmente se dividen en dos clases generales: histonas y protenas cromosmicas no histnicas. Las histonas estn presentes en enormes cantidades (cerca de 60 millones de molculas de varios tipos di- ferentes en cada clula), y su masa total en los cromosomas es casi igual a la del DNA mismo. El complejo que forman ambas clases de protenas con el DNA nuclear se denomina cromatina.
12 Las histonas son responsables del primero y ms esencial nivel de condensacin de la cromatina, el nucleosoma, descubierto en 1974. Cuando los ncleos en interfase se fragmentan cuidadosamente y su contenido se examina con el microscopio electrnico, la mayor parte de la cromatina tiene la forma de una hebra de un dimetro cercano a 30 nm (fig. 5-21A). Si se somete esta cromatina a tratamientos que la descondensan parcialmente, puede observarse como una serie de "perlas o cuentas en un collar" (fig. 5-21B). El collar es el DNA, y cada cuenta es el ncleo de una partcula nucleosmica que consiste en DNA enrollado alrededor de un ncleo de protenas formado por histonas.
Fig. 5-21- Los nucleosomas pueden ser vistos con el microscopio electrnico. (A) La cromatina aislada directamente de un ncleo en Interfase aparece en el microscopio electrnico como una hebra de 30 nm de grosor. (B) Esta micrografa electrnica muestra una parte de la cromatina que se descondens en forma experimental, despus del aislamiento para mostrar los nucleosomas, (A, cortesa de Barbara Hamkalo; B, cortesa de Victoria Foe.)
La estructura de los nucleosomas se determin despus de aislarlos por primera vez a partir de la cromatina descondensada mediante digestin con enzimas especficas (denominadas nucleasas) que fragmentan el DNA al cortarlo entre los nucletidos. Tras un breve periodo de digestin, el DNA expuesto entre los ncleos de las partculas nucleosmicas, el DNA espaciador, se degrada. Cada partcula nucleosmica est constituida por un complejo de ocho histonas -dos molculas de cada histona H2A, H2B, H3 y H4, y una cadena doble de DNA de cerca de 146 pares de nucletidos que se enrollan alrededor de este octmero de histonas (fig. 5-22). La estructura de alta resolucin del ncleo de una partcula nucleosmica fue resuelta en 1997 y revel en el detalle atmico el complejo de histonas con forma de disco alrededor del cual el DNA esta muy enrollado y da 1,65 vueltas que giran hacia la izquierda (fig. 5-23). 13
Fig. 5-22. Los nucleosomas contienen DNA enrollado alrededor de un ncleo proteico de ocho molculas de histonas. El ncleo de la partcula nucleosmica se libera de la cromatina mediante digestin del DNA espaciador con una nucleasa, enzima que fragmenta el DNA, (la nucleasa puede degradar al DNA expuesto, pero no puede atacar al DNA unido fuertemente alrededor del ncleo del nucleosoma). Despus de la disociacin de los nucleosomas aislados en su ncleo de protenas y DNA, puede determinarse la longitud del DNA que estaba enrollado alrededor del ncleo proteico. Su longitud de 146 pares de nucletidos es suficiente para enrollarse casi dos veces alrededor del ncleo de histonas.
Fig. 5-23. La estructura del ncleo de la partcula nucleosmica, determinada por el anlisis de difraccin de rayos X, revela cmo el DNA est enrollado apretadamente alrededor de un ncleo de histona de forma discoidal. Cada histona se colorea de acuerdo con el esquema que se muestra la figura 5-22; la hlice de DNA es gris. Se puede ver una parte de la cola de la histona H3 extendindose desde el nucleosoma, pero las colas de las otras histonas no se muestran, (Reproducido con autorizacin de K. Luger y col. .Nature 389:251-260. 1997. Macmillan Magazines Ltd.)
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Cada ncleo de una partcula nucleosmica se separa del siguiente mediante una regin de DNA espaciador, que puede variar en longitud desde unos pocos pares de nucletidos hasta cerca de 80. (el trmino "nucleosoma" tcnicamente se refiere a un ncleo de una partcula nucleosmica ms uno de sus DNA espaciadores adyacentes, pero a menudo se lo utiliza como sinnimo de "ncleo de una partcula nucleosmica"). La formacin de los nucleosomas convierte a la molcula de DNA en una hebra de cromatina aproximadamente de un tercio de su longitud inicial y proporciona el primer nivel de condensacin del DNA. Las cuatro histonas que forman el ncleo del nucleosoma son protenas relativamente pequeas con una alta proporcin de aminocidos de carga positiva (lisina y arginina). Las cargas positivas ayudan a las histonas a unirse apretadamente al esqueleto azcar-fosfato del DNA con carga negativa. Estas interacciones numerosas explican en parte por qu el DNA prcticamente de cualquier secuencia puede unirse a un ncleo de histonas. Cada uno de estos ncleos de histonas tambin tiene una larga "cola" del aminocido N-terminal que se extiende hacia fuera desde su ADN. Las colas de histonas estn sometidas a varios tipos de modificaciones covalentes que controlan muchos aspectos de la estructura de la cromatina, como se ver en breve. Las histonas que forman el ncleo del nucleosoma se hallan entre las ms conservadas de todas las protenas eucariontes conocidas; por ejemplo, hay solo dos diferencias entre las secuencias de aminocidos de la histona H4 de los guisantes y de las vacas. Recientemente, se descubrieron histonas en Archaea, procariontes que forman un reino filogentico distinto del de los eucariontes y las eubacterias (vase cap. 1). Este extremo de conservacin evolutiva refleja el papel vital de las histonas en la formacin de la cromatina.
15 Los cromosomas tienen varios niveles de condensacin del DNA
Aunque se forman largas cadenas de nucleosomas sobre la mayor parte del DNA cromosmico, la cromatina en las clulas vivas adopta en raras ocasiones la forma extendida en collar de perlas ilustrada en la figura 5-21B. En lugar de ello, los nucleosomas se renen luego uno sobre el otro para generar una estructura ms compacta, la fibra de 30 nm (vase fig. 5-21A). La compactacin de los nucleosomas en la fibra de 30 nm depende de una quinta histona denominada H1, que agrupara a los nucleosomas en una disposicin regularmente repetida. La estructura que resulta se muestra en la figura 5-24 como parte de un esquema ms grande de varios niveles de condensacin del cromosoma. Se han propuesto distintos modelos para explicar de qu manera los nucleosomas son contenidos en la fibra de cromatina de 30 nm; uno de los ms concordantes con los datos disponibles es una serie de variaciones conocidas en conjunto como el modelo en zigzag (fig. 5-25). Es probable que la estructura de 30 nm hallada en los cromosomas sea un mosaico fluido de diferentes variaciones de zigzag.
Fig. 5-24. La condensacin de la cromatina se produce a varios niveles. Este dibujo esquemtico muestra algunos de los rdenes de la cromatina que daran origen al cromosoma mittico muy condensado.
16 Fig. 5-25. Las fibras de cromatina pueden ser condensadas de acuerdo con un modelo en zigzag. (A y B) Microscopa electrnica que sustenta las estructuras de los modelos que se muestran arriba y abajo a la izquierda en (C). La estructura de la fibra de cromatina de 30 nm puede ser una combinacin de estas variaciones de zigzag. Puede producirse una interconversin entre las tres variantes mediante la expansin y la contraccin en acorden de la fibra. Obsrvese que los ncleos de histona no figuran en los esquemas en (C). (De J. Vendar y col., Proc. Nati. Acad. Sci. U.S.A. 95:14173- 14178,1998. @ National Academy of Sciences.)
Se sabe que la fibra de cromatina de 30 nm puede condenarse todava ms. Se vio al comienzo de este captulo que durante la mitosis la cromatina llega a estar tan condensada que los cromosomas pueden verse con el microscopio ptico. Cmo se pliega la fibra de 30 nm para producir los cromosomas mitticos? La respuesta a esta pregunta todava no se conoce en detalle, pero se piensa que la fibra de 30 nm se organiza en bucles que proceden de un eje central (figs. 5- 24 y 5-26). Finalmente, este filamento de bucles experimenta al menos un nivel ms de condensacin para formar el cromosoma mittico (vase fig. 5-24).
Fig. 5-26. Los cromosomas mitticos se forman a partir de cromatina muy condensada. Esta micrografa electrnica de barrido muestra una regin prxima al extremo de un cromosoma mittico tpico. Cada proyeccin observada como una prominencia se piensa que representa el extremo de un bucle de cromatina separado. El cromosoma en esta foto se duplic, pero los dos nuevos cromosomas (tambin denominados cromtidas) todava se mantienen unidos (vase fig. 5-20B). Los extremos de los dos cromosomas pueden distinguirse fcilmente en esta micrografa- (De M.P, Marsden y U.K. Laemmii. Ce// 17:849-858,1989. Elsevier.
17 Los cromosomas en inferfase contienen tanto formas de cromatina condensada como de cromatina ms extendida
Cuando las clulas hijas completan su separacin despus de la mitosis, los cromosomas mitticos se descondensan y se despliegan, son los cromosomas de interfase (vase fig. 5-18). Sin embargo, la cromatina en un cromosoma en interfase no est en el mismo estado de condensacin en todas las partes del cromosoma. En general, las regiones del cromosoma que contienen genes que se expresan se hallan ms desplegadas, mientras que las que contienen genes inactivos son ms compactas. Por lo tanto, la estructura detallada de un cromosoma en interfase puede diferir de un tipo celular a otro, segn qu genes se expresen. La forma de mayor grado de condensacin de la cromatina en interfase se denomina heterocromatina (del griego heteros, que significa "diferente," ms cromatina). Se observ primero con el microscopio ptico en la dcada de 1930 como regiones fuertemente teidas dentro de la masa de cromatina. La heterocromatina tpicamente forma cerca del 10 % del cromosoma en interfase. y en los cromosomas de mamferos se concentra de manera caracterstica alrededor de la regin del centrmero y en los telmeros de los extremos de los cromosomas. La mayor parte del DNA que se condensa en heterocromatina no contiene genes. Sin embargo, los genes que llegan a ser contenidos en la heterocromatina son en general resistentes a la expresin porque la heterocromatina es extraordinariamente compacta (fig. 5-27). El resto de la cromatina en interfase, que est en una variedad de estados ms extendidos, se denomina eucromatina (del griego eu, que significa "verdadero" o "normal," ms cromatina). Todava no se comprende cul de estos niveles de condensacin de los cromosomas mostrados en la figura 5-24 describen mejor a la eucromatina y a la heterocromatina; es probable que ambas presenten mezclas de varios estados de condensacin.
18 Fig. 5-27. La expresin de un gen puede alterarse por el desplazamiento a otra localizacin en el genoma. Se muestran dos ejemplos de efectos de posicin, en los que la actividad de un gen depende de su posicin a lo largo del cromosoma. (A) El gen ADE2 de la levadura en su localizacin normal se expresa en todas la clulas. Cuando se lo sita cerca del extremo del cromosoma de una levadura, que se pliega en una forma particularmente compacta de cromatina, el gen no se expresa ms en la mayor parte de las clulas de la poblacin, ADE2 codifica una de las enzimas de biosntesis de adenina, y la ausencia del producto del gen ADE2 lleva a la acumulacin de un pigmento rojo. Por tal razn, una colonia de clulas que expresa ADE2 es blanca, y una constituida por clulas donde el gen ADE2 no se expresa es roja. Los sectores blancos alrededor de la colonia roja representan las clulas donde el gen ADE2 se ha vuelto espontneamente activo. Esto es el resultado de un cambio heredable en el estado de condensacin de la cromatina cerca del gen ADE2 en estas clulas, (B) Los efectos de posicin tambin pueden observarse para el gen white en la mosca de la fruta Drosophila. El gen white controla la produccin de pigmento ocular y su nombre surge despus de la mutacin que lo identific por primera vez. Las moscas de tipo salvaje con un gen white normal (white + ) tienen una produccin normal de pigmento, que les da a aquellas los ojos rojos, pero si el gen white es mutado e inactivado, en las moscas mutantes (white - ) no se forma pigmento y tienen los ojos blancos. En las moscas en las que se desplaz un gen white + normal cerca de una regln de heterocromatina. los ojos son moteados con parches rojos y blancos. Los parches blancos representan a las clulas donde el gen white + es silenciado por los efectos de la heterocromatina y los parches rojos representan a las clulas que expresan al gen white + . Las motas se producen porque el silenciamiento del gen white + por la heterocromatina no es completo. Como para las levaduras, la presencia de parches de gran tamao de clulas rojas y blancas Indica que el estado del gen es heredado (activo o silenciado).
19 Aunque la mayor parte de los cromosomas eucariontes contienen regiones de eucromatina y de heterocromatina, existen algunas excepciones importantes. Tal vez el ejemplo ms notable se halle en los cromosomas X en interfase de las hembras de mamferos. Las clulas femeninas contienen dos cromosomas X, mientras que las clulas masculinas contienen un X y un Y. Como una dosis doble de cromosomas X sera letal, las hembras de los mamferos desarrollaron un mecanismo para inactivar permanentemente a uno de los dos cromosomas X en cada clula: al azar, uno u otro de los dos cromosomas X en cada clula llega a estar muy condensado en heterocromatina en el desarrollo embrionario temprano. Despus de esto, en todas de las numerosas progenies de las clulas se heredan los estados condensado e inactivo del cromosoma X (fig. 5-28).
Fig. 5-28. Un cromosoma X puede inactivarse por completo por la formacin de heterocromatina. Las clulas en un embrin de mamfero hembra contienen dos cromosomas X, uno de la madre (X) y el otro del padre (X). En un estadio temprano del desarrollo, uno de estos dos cromosomas en cada clula se condensa en heterocromatina, aparentemente al azar. En cada divisin celular despus de este estadio, el mismo cromosoma se vuelve condensado en todos los descendientes de la clula original. En ratones, la Inactivacin del cromosoma X se produce entre el tercero y el sexto da de desarrollo. En los seres humanos, tambin tiene lugar la inactivacin del X muy tempranamente en el desarrollo, antes de que las clulas hayan sido asignadas a una va particular de desarrollo, Por lo tanto, las hembras terminan con un mosaico de clulas que llevan al cromosoma X paterno o materno inactivado. En la mayor parte de los tejidos y rganos, cerca de la mitad de las clulas ser de un tipo y la mitad restante del otro.
Pregunta 5-3 20 Las mutaciones en un gen particular del cromosoma X causan ceguera para el color. Todos los hombres portadores de un gen mutante son ciegos para el color- La mayor parte de las mujeres portadoras de un gen mutan-te tienen una visin adecuada para el color, pero ven imgenes en color con una resolucin reducida, por lo cual se piensa que las clulas funcionales de los conos (las clulas que contienen a los fotorreceptores del color) se encuentran mucho ms espaciadas entre s que en la retina normal. Podra dar una explicacin convincente de esta observacin? Si una mujer es ciega para el color, qu podra decir acerca de su padre? Acerca de su madre? Explique sus respuestas.
Los cambios en la estructura del nucleosoma permiten el acceso al DNA Hasta ahora se analiz cmo el DNA se condensa cuidadosa y estrechamente en la cromatina; ahora se estudiar cmo esta condensacin puede ser dinmica y permitir el rpido acceso al DNA subyacente. Se expres que el DNA en las clulas transporta una enorme cantidad de informacin codificada, y es especialmente importante que las clulas tengan acceso a ella segn la necesidad. Como se ver, el acceso directo al DNA es tpicamente localizado y solo se exponen aquellas regiones del genoma que las clulas necesitan en un momento particular. Las clulas eucariontes tienen varias maneras de ajustar rpidamente la estructura local de su cromatina. Una forma utiliza la ventaja de los complejos de remodelacin de la cromatina, mquinas proteicas que emplean la energa de la hidrlisis del ATP para cambiar la estructura de los nucleosomas (fig. 5-29). Estos complejos permiten que el DNA subyacente sea ms accesible a otras protenas en la clula, sobre todo las que participan en la replicacin, reparacin y expresin gnica del DNA. Durante la mitosis, al menos algunos de los complejos de remodelacin de la cromatina se inactivan, lo cual podra ayudar a los cromosomas mitticos a mantener su estructura intensamente condensada.
21 Fig. 5-29. El complejo de remodelacin de la cromatina altera la estructura del nucleosoma. De acuerdo con este modelo, distintos complejos que remodelan la cromatina alteran y vuelven a formar a los nucleosomas, aunque, en principio, el mismo complejo podra catalizar ambas reacciones. La protena de unin al DNA podra estar involucrada en la expresin gnica, la replicacin del DNA o la reparacin del DNA.
Otro modo de obtener un cambio en la estructura de la cromatina depende de la modificacin reversible de las colas de histonas. Las colas N-terminal de cada una de las cuatro protenas del ncleo de histonas llevan a cabo funciones decisivas en la regulacin de la estructura de la cromatina. Cada cola esta sujeta a varios tipos de modificaciones covalentes. que se agregan y eliminan despus que los nucleosomas se ensamblan por la actividad de enzimas que residen en el ncleo. Aunque las modificaciones de las colas de histonas tienen poco efecto directo sobre la estabilidad de un nucleosoma, algunas parecen afectar directamente la estabilidad de la fibra de cromatina de 30 nm y de algunas de las estructuras de orden superior mencionadas antes. Sin embargo, los efectos ms profundos de las colas de histonas modificadas parecen ser la capacidad para unirse y de este modo atraer a protenas especficas a regiones de la cromatina. Diferentes patrones de modificaciones de la cola de histona atraen a diferentes protenas; algunas 22 de estas protenas generan condensaciones posteriores de la cromatina y otras facilitan el acceso al DNA. En conjunto, las diferentes combinaciones de modificaciones de la cola y los distintos grupos de protenas que se unen a la histona pueden indicarle a la clula cosas diferentes: un patrn podra indicar que un tramo determinado de la cromatina ha sido recin replicado; otro que la expresin gnica debera tener lugar (fig. 5-30).
Fig. 5-30. El patrn de modificacin de las colas de las histonas puede establecer cmo la clula trata un tramo de cromatina. (A) Cada histona puede modificarse por la unin covalente de diferentes molculas. La histona H3, por ejemplo, puede recibir un grupo acetilo (Ac), un grupo metilo (Me) o un fosfato (P). Obsrvese que algunas posiciones (p. ej, lisina 9 y 27) pueden ser modificadas de ms de un modo- (B) Diferentes combinaciones de las colas de histonas pueden constituir un tipo de "cdigo de histona." De acuerdo con la hiptesis del cdigo de histona, cada marca transporta un significado especfico al tramo de cromatina en el que esto se produce. Solamente se conocen unos pocos significados de las modificaciones.
Como es vlido para los complejos de remodelacin de la cromatina, las enzimas que modifican a las colas de histonas estn estrechamente reguladas. Son conducidas a una regin particular de la cromatina por otras seales, en especial por sus interacciones con las protenas que se unen a secuencias especficas del DNA, un aspecto que se examinar en el captulo 8. Es probable que estas enzimas que modifican histonas funcionen en concierto con el complejo que remodela la cromatina para condensar y relajar tramos de sta y permitir que la estructura de la cromatina local cambie rpidamente de acuerdo con las necesidades de la clula.
Tomado de ALBERTS. B., et alt, 2006, Introduccin a la Biologa Celular, 2 edicin, Editorial Mdica Panamericana.