ESTRUCTURA DE PROTENAS

Protenas:
Biopolmeros
50% peso seco de la > de organismos. Versatilidad de funciones.

Expresan la informacin gentica.

Secuenciacin Const. de aa.

Clasificacin:
Enzimas

Enzimtica

Son las ms numerosas y especializadas. Actan como biocatalizadores de las reacciones qumicas.

ENZIMA-SUSTRATO

SITIO ACTIVO DE LA CARBOXILASA

PROTEASA DE ADENOVIRUS

Clasificacin:
Enzimas Transporte

Transporte

Hemoglobina Citocromos

Hemocianina Canales inicos

CITOCROMOS

Clasificacin:
Enzimas Transporte Defensa

Defensa

Inmunoglobulinas Trombina y fibringeno

ANTICUERPOS

Clasificacin:
Enzimas Transporte Defensa

Reserva o Nutritivas

FUNCIONES DE PROTENAS Y EJEMPLOS

Reserva
Ovoalbmina, de la clara de huevo Gliadina, del grano de trigo Lactoalbmina, de la leche Transferrina
TRANSFERRINA ALBMINA

Clasificacin:
Enzimas Transporte Defensa

Reserva o Nutritivas
Contrctiles y Mtiles
Actina

Clasificacin:
Enzimas Transporte Defensa

Reserva o Nutritivas
Contrctiles y Mtiles Estructurales

Estructural

Como las glucoprotenas que forman parte de las membranas. Las histonas que forman parte de los cromosomas El colgeno, del tejido conjuntivo fibroso. La elastina, del tejido conjuntivo elstico. La queratina de la epidermis.

Receptor de LH

GLUCOPROTENAS MEMBRANALES

COLGENO

Clasificacin:
Enzimas Transporte Defensa

Reserva o Nutritivas
Contrctiles y Mtiles

Estructurales
Reguladoras

Hormonal

Insulina y glucagn Hormona del crecimiento Calcitonina Hormonas troficas (LH, FSH, TSH)

FSH

TRANSDUCCIN DE SEALES

AMINOCIDOS
ANFTERO:
presentar una base y un cido al mismo tiempo (pH fisiolgico).

ZWITTERION:
Molcula con igual nmero de cargas positivas que nagativas.

C O + H3N C H R

aC

1806
1938

Asparagna
Treonina Ac. Glutmico Glicina

Esprrago

Glten del trigo Por su sabor dulce

20 aa

Diferentes, Estndar,
Primarios o Normales

HIDROFBICOS

HIDROFLICOS

Aminocidos modificados
Fosfoserna
4-hidroxiprolina d-hidroxilisina Colgeno Miosina Protrombina

N-metil-lisina
Ac. g carboxiglutamina

ENANTIMEROS
IMGENES ESPECULARES

O C H3 N
Carbn a
L- aa

O H

O H

O C C R1
D- aa

C R1

NH3

Aminocido L-Alanina L-Arginina L-Isoleucina L-Fenilalanina cido L-glutmico L-Histidina L-Lisina L-Serina L-Prolina L-Treonina

Rotacin [a]D25 oC Especfica

+ 1.8 + 12.5 + 12.4 - 34.5 + 12.0 - 38.5 + 13.5 - 7.5 - 86.2 - 28.5

Curva de Valoracin de la Glicina

H2N-CHR-COO9.6 H3+N-CHR-COO- H2N-CHR-COO-

5.97

H3+N-CHR-COO-

2.34 H3+N-CHR-COOH H3+N-CHR-COO-

H3+N-CHR-COOH
www.um.es/.../Quimica/Practica01/Practica01.htm

TITULACIN DEL CIDO GLUTMICO

Glu

pKCOOH=2.19 pKR =4.25 pKNH2 =9.67

Equivalentes de NaOH

pKs DE AMINOCIDOS

ESPECIALES CIDOS BASICOS

ENLACE PEPTDICO

Enlace AMIDA
C a O H C N Ca

+ H C N Ca - O

C a

H2N- C- COOH +
R

H2N- C- COOH R H2O

H2N- CR

N- C- COOH

Enlace R peptdico

Dipptido Tripptido Tetrapptido

Oligopptido

Ionizacin de: Gpo. N terminal Gpo. C Terminal Gpo. R de los aa

Polipptido

ESTRUCTURA DE PROTENAS
La variedad de secuencias de aminocidos (protenas) es infinita Una protena de 100 aa puede tener 10020 secuencias diferentes. En promedio, una protena de 300-400 aa tiene un peso molecular de 30-45 Kda (30,000 45,000 Da)

Estructura Tridimensional de las Protenas

Hsp 70

1er. Nivel de organizacin

TRANSCRIPCIN
Aminocidos

Anticodn Nucletidos de RNA

Cadena de polipeptdos

Membrana nuclear

codn

Ribosoma

TRADUCCI N

SNTESIS DE PROTENAS

Estructura

Primaria

N-

-C

Secuencia de aminocidos especificada por la informacin gentica.

ESTRUCTURAS SECUNDARIAS

EXTREMO -N AMINO (N)

-C

EXTREMO CARBOXILO (C)

N-

Plegamiento de la cadena polipeptdica formando arreglos.

ESTRUCTURAS SECUNDARIAS Estructura Secundaria

Hlice a

Lmina b

-C

-N
GiroHlice-Giro Lmina b

-C
Hlice-Giro Hlice

Estructura
TERCIARIA: Forma globular Funcionalidad.

Estructura
N-

ESTRUCTURAS SECUNDARIAS

Cuaternaria

Uniones de 2 o ms subunidades,

monmeros o protmeros).
-C

-N

-C

CLASIFICACIN DE PROTENAS
1.HOLOPROTENAS
Formadas solamente por aminocidos

2.HETEROPROTENAS o Protenas Conjugadas

Formadas por una fraccin protica y por un grupo no protico, que se denomina "grupo prosttico

Protenas Conjugadas
Protena Glucoprotenas Lipoprotenas Fosfoprotenas Hemoprotena Flavoprotena Metaloprotena Gpo.Prosttico / Caracterstico Carbohidratos Lpidos Grupo fosfato Hemo Ncleo de Flavina Fe, Zn Ejemplo g-Globulina de la sangre b-Lipoprotena de la sangre Casena de la leche Hemoglobina Succinato Deshidrogenasa Ferritina Alcohol Deshidrogenasa

Descubrimiento de las Estructuras Polippt. Regulares

S. XX 1930. Quim. Linus Pauling

Difraccin de Rayos X.
De aa. y pptidos

1950s Principios:
1. La longitud y ngulos de enlace deberan desviarse lo menos posible de los hallados por DRX.

2. Dos tomo no pueden hacercarse uno al otro a una distancia menor de la que les permiten sus radios de Van der Waals.

Enlace peptdico

Plano Amida

Gpo. pptido trans

3. El gpo. Amida debe permanecer en un plano de conf. Trans, as es posible la rotacin alrededor de los 2 enlaces adyacentes al C-a de cada residuo de aa.

4. Es preciso algn tipo de enlace no covalente para estabilizar un plegado regular

Fig 6.3

Hlice a

Lmina b

Fif. 6.4

Hlice 310

Hlice p

Fig 6.5

Anillo

Hlice (a derechas)

Hlice (a derechas)

Cinta plana

Hlice (a izquierdas)

Fig 6.3

Hlice a

Fig 6.6

Representaciones de Ramachandran

A Ramachandran plot of Ala-Ala-Ala is nearly identical to the plot for Phe-Phe-Phe (which is unbranched at the beta carbon (the

Fig 6.8

employees.csbsju.edu/.../olunderstandconfo.html

2 Clases de Protenas:

Fibrosas Globulares:

Fibrosas: materiales estructurales de clulas y tejidos. Forma filamentosa o alargada La > su funcin: estructural. El % en: Piel Tej. Conjuntivo Fibras animales: pelo, seda

Queratina Fibroina Colgeno Elastina

A.A.

a-Queratina
(lana)

Fibroina
(Seda)

Colgeno
(Tendn de Bovino)

Elastina
(Aorta Porcina)

Queratinas
a -Queratina

b -Queratina
Estructura de lmina b

Plumas de Aves

Escamas de Reptiles

Fibrona

Colgeno

Fig.: Osteoblastos sobre un ribete de osteoide. El osteoide se observa como un material finamente fibrilar de color gris y por debajo del mismo se situa el hueso mineralizado en color negro (Microscopa electrnica x 3400).

Colgeno
Tropocolgeno

Elastina
Ligamentos
Edo. Relajado

Vasos Sanguneos

Estiramiento
Monmero de elastina Entrecruzamiento

Actina y Miosina Tubulina

Globulares:.
La cadena se encuentra plegada localmente formando una estructura secundaria (helice a, lmina b, etc.), a su vez estas regiones se pliegan unas sobre otras, para formar la estructura terciaria.

ESTRUCTURA TERCIARIA
ADENILATO CINASA

Modelo de Relleno

Modelo de cintas

Modelo esqueltico

Modelo de cintas

Modelo de Relleno

Miohemeritrina

Prealbmina

Piruvato quinasa, dominio 1

Protena de la cubierta del virus del mosaico de tabaco a) Predominantemente hlice a

Inmunoglobulina, dominio V2 b) Predominantemente lmina b

Hexoquinasa, dominio 2 c) Hlice a y lmina b mezcladas

Variedades de la estructura de las protenas

La > formadas por mas de un Dominio
Regin compacta, plegada localmente, de la estructura 3aria.

Conectados entre s. C/u realiza una funcin diferente. Un tipo puede reconocerse en dif. protenas

Miohemeritrina

Prealbmina

Sandwich b

Piruvato quinasa, dominio 1

Cilindro b antiparalelo
Protena de la cubierta del virus del mosaico de tabaco a) Predominantemente hlice a Inmunoglobulina, dominio V2 b) Predominantemente lmina b Hexoquinasa, dominio 2 c) Hlice a y lmina b mezcladas

ESTRUCTURA TERCIARIA

Reglas generales que rigen el plegado terciario

Prots. Glob. poseen interior y exterior definidos

Cit.c corazn de caballo

Reglas generales que rigen el plegado terciario

Prots. Glob. poseen interior y exterior definidos. Las lminas b gral. Enrrolladas en estruct. Cilndrica. Con enrollamiento a izquierda. (aa L).

Cadena polipept. Con doblamiento en esquinas de dif. Formas (usa 4 residuos)

Prot. Glob., No todas las partes se pueden clasificar, hlice a o lmina b

Ribonucleasa

Qu es lo que determina la estructura 2aria y 3aria? Expont.

Molcula Nativa

La secuencia aa
Fraccin desplegada

Renaturalizacin

Desnaturalizacin

Temperatura pH extremo

Disolv. Org.

Molcula Desnaturalizada

Temperatura oC

Favor Termodinmico

PUENTES DISULFURO

Estado nativo

Estado desnaturalizado

ESTRUCTURA CUATERNARIA
HEMOGLOBINA

OXIHEMOGLOBINA

Protenas Oligomricas
Protena
Insulina (bovina)
Ribonucleasa (pncreas de bovino) Lisozima (clara de huevo) Mioglobina (corazn de caballo) Quimotripsina (pncreas de bovino) Hemoglobina (humano) Seroalbmina (humano)

P.M.
5 733
12640 13930 16890 22600 64500 68500

No. de Residuos
51
124 129 153 241 574 550

No. de Cadenas
2
1 1 1 3 4 1

Hexoquinasa (levadura)
g-Globulina (caballo)

96000
149900

800
1250

4
4

Glutamato deshidrogenasa (hgado de buey)

1000000

8300

40

Organizacin Cuaternaria
Homotpica:
Asociacin entre cadenas polipeptdicas idnticas o casi idnticas

Mltiples subunidades

Heterotpica:
Interaccin entre subunidades con estructura muy distinta.

Motivo asimtrico

Simetra C2

Simetra C3

Simetra helicoidal

Simetra C4

Simetra D2

Simetra cbica

Simetra icosadrica

Actina

Virus del mosaico de tabaco.

Dimero de prealbmina 2 monomros forman el sandwich b completo

ASOCIACIONES ENTRE PROTENAS

Tubulina

Polimerizacin de la fibrina

Cogulo sanguneo

ASOCIACIONES ENTRE PROTENAS Y LPIDOS

Lipoprotena del plasma sanguneo

Membrana biolgica

ASOCIACIONES ENTRE PROTENAS Y CIDOS NUCLEICOS

Ribosomas

Nucleosoma

Virus HIV (SIDA)

Proteoglicano de tipo muy grande

Peptidoglicano de la pared celular bacteriana

ANLOGO

REPRESOR NATURAL

ESTRUCTURA TERCIARIA

ESTRUCTURA SECUNDARIA

REPRESENTACIONES GRGICAS DE LAS PROTENAS

ENTRAR EN LA SIGUIENTE PGINA PARA VER UNA PROTENA TRIDIMENSIONAL (Se abre en una pgina diferente) http://www.mgh.harvard.edu/labm ed/res/reslab/album.swf

ALBMINA HUMANA

PROPIEDADES DE PROTEINAS ESPECIFICIDAD

Funcin determinada debido a que posee una estructura primaria y una conformacin espacial propia. Cambio en la estructura genera una prdida de la funcin. Diferentes en todos los organismos. Cada individuo posee protenas especficas (rechazo de rganos transplantados). La semejanza entre protenas son un grado de parentesco entre individuos (construccin de "rboles filogenticos" )