EVOLUCIN DE PATRONES EPIGENTICOS

METILACIN DEL ADN

Evolucin Molecular http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol/

Guillermo Barturen gbarturen@ugr.es

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METILACIN DEL ADN

BASE BIOQUMICA DE LA METILACIN

PROCARIOTAS EUCARIOTAS
Metil-Citosina Metil-Adenina

Grupo Metilo Unin covalente Mediada por DNMTs Evolucin Molecular http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol/ Guillermo Barturen gbarturen@ugr.es

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METILACIN DEL ADN

CONTEXTOS DE METILACIN
Arabidopsis thaliana
Datos Capullos inmaduros

Homo sapiens
Datos H1: Clulas Madre IMR90: Fibroblasto de pulmn

Lister et al. (2008) Evolucin Molecular http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol/

Lister et al. (2009) Guillermo Barturen gbarturen@ugr.es

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METILACIN DEL ADN

DISTRIBUCIN DE LA METILACIN

f Species without methylation (Saccharomyces cerevisiae or Caenorhabditis elegans)

Elementos transponibles

Zonas metiladas

TSSs

Zonas no metiladas

Suzuki et al. (2008) Guillermo Barturen gbarturen@ugr.es

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METILACIN DEL ADN

EVOLUCIN DE LA DISTRIBUCIN

MOSAICO GLOBAL (Toll-like Receptor 9?) Suzuki et al. (2008) Evolucin Molecular http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol/ Guillermo Barturen gbarturen@ugr.es

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METILACIN DEL ADN

ISLAS CpGs (CGIs)

CARACTERSTICAS Regiones con alta densidad de CpGs Regiones libres de metilacin en algn tejido o condicin CLASIFICACIN Constitutivamente no metiladas Diferencialmente metiladas Intermediamente metiladas

TIPOS DE GENES

Illinworth et al. (2009) Evolucin Molecular http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol/ Guillermo Barturen gbarturen@ugr.es

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METILACIN DEL ADN

HIPTESIS DE LA FORMACIN DE CGIs

Illinworth et al. (2009) Evolucin Molecular http://bioinfo2.ugr.es/EvolMol/ Guillermo Barturen gbarturen@ugr.es

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METILACIN DEL ADN

CONSERVACIN DE LAS PROTENAS IMPLICADAS EN LA METILACIN

Law et al. (2010)

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METILACIN DEL ADN

METILACIN DE NOVO (Mamferos)

Smallwood et al. (2012)

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METILACIN DEL ADN

METILACIN MANTENIMIENTO (Mamferos)

Law et al. (2010)

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METILACIN DEL ADN

METILACIN E INHIBICIN DE LA TRANSCRIPCIN

Bell et al. (2011)

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METILACIN DEL ADN

HIPTESIS DE INHIBICIN DE LA TRANSCRIPCIN

a. Evitando la unin de TFs b. MBPs (Methyl-Binding Proteins) reclutan co-represores c. Represin de la transcripcin por modificacin de histonas

Klose et al. (2006)

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METILACIN DEL ADN

ANATOMA MOLECULAR DE SITIOS CpG

Jones (2012)

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METILACIN DEL ADN

FUNCIONES DE LA METILACIN (Diferenciacin Tisular)

Laurent et al. (2010)

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METILACIN DEL ADN

FUNCIONES DE LA METILACIN (Diferenciacin Tisular)

Laurent et al. (2010)

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METILACIN DEL ADN

FUNCIONES DE LA METILACIN (Impronta Gnica e Inactivacin del cromosoma X)

Bell et al. (2011)

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METILACIN DEL ADN

METILACIN Y ENFERMEDAD
Desrdenes de Impronta BeckwithWiedemann syndrome (BWS) PraderWilli syndrome (PWS) Angelman syndrome (AS) Transient neonatal diabetes mellitus (TNDM)

Inestabilidad de elementos repetidos Fragile X syndrome (FRAXA) Facioscapulohumeral muscular dystrophy (FSHD)

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METILACIN DEL ADN

METILACIN Y ENFERMEDAD
Cncer

Robertson et al. (2005)

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METILACIN DEL ADN

EVOLUCIN DE LOS PATRONES DE METILACIN

Valores de metilacin y rboles filogenticos

Feng et al. (2010)

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METILACIN DEL ADN

EVOLUCIN DE LOS PATRONES DE METILACIN

Metilacin en genes codificantes
Incremento de Metilacin en el Cuerpo Gnico Animales metilacin CG mayoritaria Mayor metilacin cuanta mayor diferenciacin tisular Excepcin A.mellifera Feng et al. (2010)

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METILACIN DEL ADN

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Metilacin en ADN repetido
Alta metilacin en elementos repetidos

Mayor metilacin cuanto mayor diferenciacin tisular Excepcin A.mellifera

Feng et al. (2010)

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METILACIN DEL ADN

EVOLUCIN DE LOS PATRONES DE METILACIN

Metilacin en exones e intrones
Mayor metilacin en exones que intrones Plantas cae metilacin en no-CpGs Mayor metilacin cuanto mayor diferenciacin tisular Mayor metilacin en animales Excepcin A.mellifera Feng et al. (2010)

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METILACIN DEL ADN

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Resumiendo
Animales metilacin mayoritaria en CG Plantas CG, CHG & CHH TEs & Cuerpo Gnico metilacin conservada Metilacin reducida o ausente en: - S. cerevisae - S. pombe - D. melanogaster - C. elegans Exones mayor metilacin que intrones Extremos de genes cada de metilacin - Regin promotora - Extremos 3 Organismos con gran desarrollo multicelular, mayor metilacin

Lee et al. (2010)

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Conclusiones Metilacin en transposones, cuerpo gnico y falta de metilacin en promotores (Conservado Plantas y Animales) IMPORTANCIA INICIO TRANSCRIPCIN Y PROTECCIN Alta conservacin de DNMTs (Diferencias generan variacin en patrones) ANCESTRO COMN METILACIN FUNCIONAL Algunas especies no muestran metilacin (No es fundamental) PERDIDA POR DESAMINACIN DE PATRONES Metilacin diferencial entre exones e intrones y cada en extremo 3 IMPORTANCIA EN ELONGACIN, TERMINACIN Y SPLICING ALTERNATIVO Alta diferenciacin tisular mayor metilacin y variacin entre tejidos IMPORTANCIA EN LA DIFERENCIACIN TISULAR Y EN EL DESARROLLO
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