El genoma Humano

MSc. Csar Guzmn Vigo

cguzmanvigo@gmail.com

Genoma humano

Se llama genoma a la totalidad del material gentico de un organismo. El genoma humano tiene unos 31.000 genes distribuidos en los 23 pares de cromosomas de la clula (el nmero de genes vara en los diferentes libros, algunos dicen que de 80.000 a 100.000 ). Un cromosoma humano puede contener ms de 250 millones de pares de bases de ADN, y se estima que el genoma humano est compuesto por unos 3.000 millones de pares de bases.

Proyecto Genoma Humano

El Proyecto Genoma Humano, es un programa internacional de colaboracin cientfica, cuyo objetivo es obtener un conocimiento bsico de la dotacin gentica humana completa. Esta informacin se encuentra en todas las clulas del cuerpo, codificada en el cido desoxirribonucleico (ADN).

Mapa gentico.

Proyecto Genoma Humano

El Proyecto Genoma Humano ha identificado los aproximadamente 31.000 genes presentes en el ncleo de las clulas humanas y ha establecido la localizacin que ocupan estos genes en los 23 pares de cromosomas del ncleo. La idea de iniciar un estudio coordinado del genoma humano surgi de una serie de conferencias cientficas celebradas entre 1985 y 1987. Varios pases pusieron en marcha programas oficiales de investigacin como parte de esta colaboracin, entre ellos Francia, Alemania, Japn, Reino Unido y otros miembros de la Unin Europea. El proyecto en general esta coordinado por el Departamento de Energia y el Instituto Nacional de Salud de Estados Unidos.

Proyecto Genoma Humano

En 1990 se inici oficialmente el proyecto como un programa de quince aos con el que se pretenda registrar todos los genes que codifican la informacin necesaria para construir y mantener la vida. En abril de 2003, cientficos del consorcio pblico completaron el 90% de la secuenciacin del genoma humano.
Francis Collins (director del Proyecto Genoma Humano) y Craig Venter (gerente de Celera Genomics)

El genoma humano es patentable?

El 11 de Noviembre de 1997, la UNESCO aprob la DECLARACIN UNIVERSAL SOBRE GENOMA HUMANO Y LOS DERECHOS DEL HOMBRE, fijando tres principios: La dignidad del individuo cualesquiera sean sus caractersticas genticas. Rechazo al determinismo gentico. El Genoma Humano es PATRIMONIO DE LA HUMANIDAD.

Controversias ticas
El conocimiento del genoma humano tiene tambin diversas implicaciones ticas, jurdicas y sociales, estimulando un debate internacional sobre algunos aspectos : Patentar secuencias de genes humanos para uso comercial.

Confidencialidad en la informacin obtenida, como por ejemplo, poner la informacin sobre gentica humana a disposicin de empresas de seguros. La libertad a no saber si se es o no portador de una enfermedad gentica.

Controversias ticas
Corregir los defectos genticos de forma que podran transmitirse de generacin en generacin (clulas germinativas). Modificar la base gentica de las clulas somticas (generales) responsables de determinadas enfermedades. Sera posible la modificacin del vulo, del huevo (cigoto) o del embrin de pocas clulas. El diagnstico prenatal ser ms certero y alcanzar un nmero muy amplio de enfermedades. Esto agudizar la discusin tica sobre el aborto y el derecho a la vida del no nacido Creacin de estructuras jurdicas, administrativas, sanitarias y sociales adecuadas para evitar abusos discriminatorios a portadores de enfermedades genticas por parte de empresas laborales o de salud.

El

DNA es una hlice doble

Las dos clases de cidos nucleicos: DNA y RNA, son polmeros de nucletidos Un nucletido tiene tres componentes: Base prica Adenina (A), Guanina (G) o pirimdica Citosina (C), Timina (T) y Uracilo (U) ; un azcar de 5 carbonos y un fosfato
NUCLEOTIDO + NUCLEOTIDO+ ... + NUCLEOTIDO = CADENA POLINUCLEOTIDICA

MSc. Csar Base ligadaGuzmn Vigo por enlace N-glicsido al azcar Azcar ligada al fosfato por enlace fosfodiester
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ESTRUCTURA DE LOS ACIDOS NUCLEICOS: Estructura primaria

SEGMENTO DE UN DNA DUPLEX MOSTRANDO LA ORIENTACION ANTIPARALELA

P
5 5 5 3 5 3 3 5 3 5 OH 3

OH

A C T

T G A

3 3

5 5 5

3 5 3 5 3 P 5

G
A

C
T

PROPIEDADES DEL CODIGO GENETICO

REDUNDANCIA : Hay 64 codones y slo 20 aminocidos DEGENERACION: Significa que cada aminocido esta codificado para ms de un codn SUPERPOSICION : El cdigo no se superpone UNIVERSALIDAD: Se observa el mismo cdigo gentico en casi todos los organismos
(La excepcin lo constituye el DNA mitocondrial de ciliados, all UGA es ledo como seal para tiptofano, que como seal de terminacin; AGA y AGG son ledos como seales de terminacin en lugar de arginina y AUA como codn para metionina en lugar de isoleucina.)

CODONES SIN SENTIDO: Marcan el final de un polipptido. Indican al ribosoma que debe parar la sntesis de la protena ( UAG, UAA, UGA )

FUNCIONES DEL DNA

REPLICACION TRANSCRIPCION

TRANSCRIPCION INVERSA

REPARACION

RNA

HIBRIDO

DNA RECOMBINACION

a+

b-

c+

a-

b+

c-

ESTRUCTURA DE LA CROMATINA
Empaquetado del DNA en el ncleo: 46 cromosomas, cada uno de los cuales tiene 48 y 240 millones de bases de DNA. Segn el modelo de Watson y CricK cada cromosoma tendra 1,6 - 8,2 cm. Este puede describirse en varios niveles : NUCLEOSOMAS: Octmero proteico CROMATINA: Es el complejo de ADN, ARN y protenas HISTONAS :Protenas (+),que forman enlaces inicos con P04 (-), octmero con capacidad

de autoensamblaje de H1, H2A,H2B, H3 y H4 por la presencia de NUCLEOPLASMINA(Histonas y DNA) y DNA TOPOISOMERASA I (Superhlice). H1(166 pb)y DNA conexin (8-114 pb.) FORMACION DEL BUCLE: Tercer nivel de organizacin. SOLENOIDE con 6 nucleosomas/vuelta CROMOSOMAS: Cromatina condensada durante la divisin celular

Empaquetamiento del DNA

Doble hlice
Nucleosoma (Octmero de Histonas)

Solenoide (Histona H1)

Composicin del Cromosoma (Cromatina)

Protenas : bsicas -> histonas cidas -> no histonas (~30%)

DNA RNA (1%)

Tasa de empaquetamiento: 1:50.000-100.000

ESTRUCTURA DE LOS GENES

Promotores y potenciadores: Reguladores de transcripccin.

Secuencia promotora (Prometer), inicio de transcripcin. RNA polimerasa II, se une a los secuencias promotoras, localizadas a varios cientos de bases del inicio. Las ms frecuentes : GC, TATA y CCAAT. En DMD, existe varios promotores, localizados en diferentes lugares, y la transcripcin empieza en diferentes lugares, produciendo protenas diferentes. Los potenciadores (ENHANCER), segundo tipo de regulador, son secuencias intensificadoras situadas a miles de pares de bases del inicio. Inter actan con las promotoras aumentando la actividad de transcripcin La mutacin de estas secuencias, suele originar niveles reducidos de transcripcin.

Intrones y exones
La estructura INTRON - EXON descubierta en 1977, es un atributo que diferencia eucariotas de procariotas. Los intrones son eliminados del RNAm antes de que este salga del ncleo. El ensamblaje esta controlado por las denominadas SECUENCIAS CONSENSO (comunes en eucariotas y situadas en posicin adyacente a cada exon. La funcin de los intrones es desconocida. Se cree que su presencia aumenta la longitud del gen, facilitando la mezcla de genes cuando los homlogos intercambian material. Tambin se dice que modifican la cantidad de tiempo necesario para la replicacin y la transcripcin del DNA.

CLASES DE DNA EN EL GENOMA HUMANO

DNA de copia nica: secuencias mayores a 25 Kb., constituye el 75% e incluye genes codificadores de
protenas.

DNA repetitivo disperso. Secuencias de tamao medio, cada una repetida hasta 104 - 105 . Son conocidas
como unidades de repeticin - Repeat unites. FAMILIA ALU: Los miembros de esta familia tienen cerca de 300 pb.; existen cerca de 500,000 miembros. Constituye el 3% del genoma humano. FAMILIA L1: Los elementos L1 son secuencias repetidas largas - hasta 6Kb -encontradas en cerca de 10,000 copias por genoma.

DNA SATELITE. Llamado altamente repetitivo, consta de una o pocas unidades de repeticin cortas, una de
las cuales esta repetida 106 o ms. Se encuentra en regiones de heterocromatina constitutiva o intercalada. FAMILIA ALFA SATELITE: Copias de una unidad de 171 pb. localizadas en el centrmero, un sub grupo son las secuencias MINISATELITE, importantes como instrumentos moleculares utilizados en anlisis de DNA para paternidad y forense.

DNA fold back : Son dos secuencias cortas complementarias una a la otra. se denominan
repeticiones invertidas -inverted repeats -. El segmento de DNA entre la primera base de la primera secuencia y la ltima base de su secuencia complementaria es lo que se denomina fold back. Se cre que hay 104 - 105 secuencias en el genoma de mamferos . ATCGCGAT TAGCGCTA

Algo de historia J.H.Tjio

(1956)

Lejeune

(1966)

primer mapa de los patrones de bandas G de cromosomas humanos publicado (1971)

Pateau (1961)

grupos cromosmicos

Dotacin cromosmica humana

Cariotipo humano: 46 XY

Cariotipo humano

Los nmeros del genoma humano

Total de genes estimado
Genes identificados
Genes secuencia conocida Descripcin fenotpica Otros

20.000-25.000

19073
12527 374 6172 Genes mitocondriales 37

Genes localizados por cromosoma

Genes con localizacin fsica

1097 717 617 429

11419

532

683

508

406

427

413

717

601

206

641 356 328 443 664 160 727 277 139 286 45

23

Los cromosomas humanos Las clulas somticas contienen el complemento diploide (2n) constituido por 23 pares de cromosomas

Las clulas reproductivas (gametos) contienen el complemento haploide (n) constituido por 23 cromosomas, un representante de cada pareja

Elementos caractersticos del cromosoma (metafsico)

Clases de cromosomas por la posicin del centrmero

Obtencin de un cariotipo

tipos de clulas
Leucocitos fibroblastos mdula sea fetales HELA

Bandeo de alta resolucin

Bandeo 550 bandas

Bandeo 650 bandas

Nomenclatura cromosomas

Idiograma

La densidad gnica se correlaciona con el bandeo cromosmico

6p21.3

Xp21

BANDAS G
Claras Comparativamente ricas en GC Sensibles a la DNAsa Condensacin tarda en el ciclo celular Replicacin temprana Alta densidad gnica Pobres en secuencias repetidas

oscuras
Comparativamente ricas en AT Insensibles a la DNAsa Condensacin temprana en el ciclo celular Replicacin tarda Baja densidad gnica Ricas en secuencias repetidas