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PRINCIPIOS BÁSICOS DE

BIOQUÍMICA Y
METABOLISMO
BACTERIANO APLICADO
AL PROCESO.

Digestión
PTAR Juan Díaz Panamá 2016
OBJETIVOS DE LA FORMACIÓN
Al final de la formación, usted:

• Estará en capacidad de identificar la


estructura química de los 4 grupos
principales de biomoléculas que forman
parte de los sistemas biológicos.
• Comprenderá la función biológica de los 4
grupos principales de biomoléculas que
forman parte de los seres vivos.
OBJETIVOS DE LA FORMACIÓN
Al final de la formación, usted:

• Conocerá los grupos de microorganismos que


participan en el proceso de la Digestión
Anaerobia.
• Conocerá 6 principios básicos que gobiernan
todas las reacciones bioquímicas.
• Conocerá paso a paso los principales procesos
biológicos que ocurren en la Digestión
Anaerobia.
• Comprenderá las implicaciones bioquímicas de
los parámetros controlados en el proceso de la
Digestión Anaerobia.
I MÓDULO
BIOMOLÉCULAS

Puntos claves a recordar en este módulo:


•Monómero del cual esta constituido cada Biomolécula.
•Función Biológica de cada tipo de Biomolécula.
RAZONES PARA CONOCER SOBRE LAS
BIOMOLÉCULAS, SU ESTRUCTURA Y SU FUNCIÓN
BIOLÓGICA EN NUESTRO TRABAJO ¿Porqué debo
aprender
 Los microorganismos que esto? ¿Para
participan en diferentes que me sirve
esto como
etapas del proceso de operador?
tratamiento (al igual que
nosotros) están formados
por biomoléculas.
 Los microorganismos que
participan en diferentes
etapas del proceso de
tratamiento (al igual que
nosotros) consumen y
transforman las
biomoléculas como parte
de su metabolismo.
INTRODUCCIÓN
¿DE QUE ESTA HECHA LA VIDA?

La vida esta hecha


de CHONPS

Carbono
Hidrógeno
Oxigeno
Nitrógeno
Fósforo
Azufre
SIENDO EL CARBONO EL ELEMENTO PRINCIPAL DE
TODAS LAS FORMAS DE VIDA EN ESTE PLANETA

Características del Carbono


* Permiten la formación de enlaces covalentes entre ellos,
compartiendo electrones, debido a su pequeña diferencia
de electronegatividad. Estos enlaces son muy estables, la fuerza de enlace es
directamente proporcional a las masas de los átomos unidos.
* Permiten a los átomos de carbono la posibilidad de formar esqueletos
tridimensionales –C-C-C- para formar compuestos con número variable de
carbonos.
* Permiten la formación de enlaces múltiples (dobles y triples) entre C y C; C y
O; C y N. Así como estructuras lineales, ramificadas, cíclicas, heterocíclicas,
etc.
* Permiten la posibilidad de que con pocos elementos se den una enorme
variedad de grupos funcionales (alcoholes, aldehídos, cetonas, ácidos, aminas,
etc.) con propiedades químicas y físicas diferentes.
BIOMOLÉCULA
DEFINIENDO EL CONCEPTO
Las Biomoléculas (también
llamadas Macromoléculas
orgánicas son moléculas
grandes formadas a partir
 Polímero (del griego: poly:
de la unión repetitiva de «muchos» y mero: «parte»,
moléculas mas pequeñas «segmento»).
idénticas o muy similares.
Un
 monómero (del griego mon
A las moléculas grandes o, ‘uno’, y meros, ‘parte’) 
se les llama polímeros, y
las moléculas chicas de
las cuales están formadas
se llaman monómeros
LOS 4 GRUPOS DE BIOMOLÉCULAS

* Glúcidos ( Carbohidratos ).
* Proteínas
* Lípidos
* Ácidos Nucleícos
BIOMOLÉCULAS
LOS GLÚCIDOS
Son biomoléculas
constituidas por C, H, y O (a
veces tienen N, S, o P)

El nombre de glúcido deriva


de la palabra "glucosa" que
proviene del vocablo
griego glykys que significa
dulce, aunque solamente lo
son algunos monosacáridos y
disacáridos.
FUNCIÓN DE LOS GLÚCIDOS
Glúcidos energéticos:
Los monosacáridos y los disacáridos, como la glucosa, actúan como combustibles
biológicos, aportando energía inmediata a las células; es la responsable de mantener
la actividad de los músculos, la temperatura corporal, la presión arterial, el correcto
funcionamiento del intestino y la actividad de las neuronas. Los glúcidos aparte de
tener la función de aportar energía inmediata a las células, también proporcionan
energía de reserva a las células.
Glúcidos estructurales:
Algunos polisacáridos forman estructuras esqueléticas muy resistentes
-Mureína o Peptidoglicano: Componente de las paredes celulares de bacterias.
-Lipopolisacáridos: Componente de la membrana externa de bacterias Gram (-).
-Celulosa: Componente de la pared celular vegetal.
-Quitina: Compone el exo-esqueleto de artrópodos como los insectos y crustáceos y la
pared de células de hongos.
-Mucopolisacáridos: Forman parte de la matriz de tejidos conectivos.
- Además podemos encontrar glúcidos formando parte de la estructura de otras
biomoléculas como protéinas, lípidos, y ácidos nucleicos.
CLASIFICACIÓN DE LOS GLÚSIDOS
LOS MONOSÁCARIDOS
 Monosacáridos: Los glúcidos
más simples, están formados
por una sola molécula; no
pueden ser hidrolizados a
glúcidos más pequeños. La
fórmula química general de un
monosacáridos no modificado
es (CH2O)n, donde n es
cualquier número igual o
mayor a tres, su límite es de 7
carbonos.
CLASIFICACIÓN DE LOS GLÚSIDOS
LOS DISACÁRIDOS
 Disacáridos: son glúcidos
formados por dos moléculas de
monosacáridos y, por tanto, al
hidrolizarse producen dos
monosacáridos libres. Los dos
monosacáridos se unen mediante
un enlace covalente conocido
como enlace glucosídico, tras
una reacción de
deshidratación que implica la
pérdida de un átomo de hidrógeno
de un monosacárido y un grupo
hidroxilo del otro monosacárido,
con la consecuente formación de
una molécula de H2O, de manera
que la fórmula de los disacáridos
no modificados es C12H22O11
CLASIFICACIÓN DE LOS GLÚSIDOS
LOS OLIGOSACÁRIDOS
 Oligosacáridos: están compuestos por tres a nueve moléculas de
monosacáridos que al hidrolizarse se liberan. Los oligosacáridos se
encuentran con frecuencia unidos a proteínas, formando
las glucoproteínas, como una forma común de modificación tras la
síntesis proteica.
CLASIFICACIÓN DE LOS GLÚSIDOS
LOS POLISACÁRIDOS
 Los polisacáridos son cadenas, ramificadas o no, de más de diez
monosacáridos, resultan de la condensación de muchas moléculas de
monosacáridos con la pérdida de varias moléculas de agua. Su fórmula
empírica es: (C6 H10 O5)n. Los polisacáridos representan una clase
importante de polímeros biológicos y su función en los organismos vivos
está relacionada usualmente con estructura o almacenamiento.
AMINOÁCIDOS Y PROTEÍNAS
Un aminoácido es una molécula orgánica con
un Carbono central enlazado a un grupo amino (-NH2) y
un grupo carboxilo (-COOH), un átomo de hidrogeno y
una cadena lateral R, quien es quien le confiere su
identidad.
AMINOÁCIDOS Y PROTEÍNAS
Las proteínas son moléculas
grandes, de alto peso
molecular, formadas de
cadenas de aminoácidos, unidos
por enlaces peptídicos. Las
proteínas se forman en los
ribosomas. Mediante el proceso
de la traducción (Síntesis
proteica)

Nota importante: En la
naturaleza hay ciento de miles
de aminoácidos, pero solo 20
aminoácidos son los que están
presente en las proteínas. A
estos 20 aminoácidos se les
llama los 20 aminoácidos
esenciales.
NIVEL DE ORGANIZACIÓN DE LAS
PROTEÍNAS
LAS PROTEÍNAS Y SU FUNCIÓN
BIOLÓGICA
Las proteínas ocupan un lugar de máxima importancia
entre las moléculas constituyentes de los seres vivos
(biomoléculas). Prácticamente todos los procesos
biológicos dependen de la presencia o la actividad de
este tipo de moléculas. Bastan algunos ejemplos para dar
idea de la variedad y trascendencia de las funciones que
desempeñan.
LAS PROTEÍNAS Y SU FUNCIÓN
BIOLÓGICA
1. Catálisis: Está formado por enzimas proteicas que se encargan de realizar reacciones
químicas de una manera más rápida y eficiente. Procesos que resultan de suma importancia
para el organismo. Por ejemplo la pepsina, ésta enzima se encuentra en el sistema digestivo y
se encarga de degradar los alimentos.
2. Reguladoras: Las hormonas son un tipo de proteínas las cuales ayudan a que exista un
equilibrio entre las funciones que realiza el cuerpo. Tal es el caso de la insulina que se encarga
de regular la glucosa que se encuentra en la sangre.
3. Estructural: Este tipo de proteínas tienen la función de dar resistencia y elasticidad que
permite formar tejidos así como la de dar soporte a otras estructuras. Este es el caso de
la tubulina que se encuentra en el citoesqueleto.
4. Defensiva: Son las encargadas de defender el organismo. Glicoproteínas que se encargan de
producir inmunoglobulinas que defienden al organismo contra cuerpos extraños, o
la queratina que protege la piel, así como el fibrinógeno y protrombina que forman coágulos.
5. Transporte: La función de estas proteínas es llevar sustancias a través del organismo a donde
sean requeridas. Proteínas como la hemoglobina que lleva el oxígeno por medio de la sangre.
6. Receptoras: Este tipo de proteínas se encuentran en la membrana celular y llevan a cabo la
función de recibir señales para que la célula pueda realizar su función, como acetilcolina que
recibe señales para producir la contracción.
LOS LÍPIDOS
 Los lípidos son un conjunto
de moléculas orgánicas que
están constituidas
principalmente por carbono e
hidrógeno y en menor medida
por oxígeno. También pueden
contener fósforo, azufre y nitróg
eno. Debido a su estructura, son
moléculas hidrófobas (insoluble
s en agua. A los lípidos también
se les llama
incorrectamente grasas, ya que
las grasas son solo un tipo de
lípidos procedentes
de animales.
LOS LÍPIDOS Y SU FUNCIÓN BIOLÓGICA
 Los lípidos desempeñan diferentes tipos de funciones biológicas:
 Función de reserva energética. Los triglicéridos son la principal reserva de energía de los
animales ya que un gramo de grasa produce 9,4 kilocalorías en las reacciones metabólicas de
oxidación, mientras que las proteínas y los glúcidos solo producen 4,1 kilocalorías por gramo.
 Función estructural. Los fosfolípidos, los glucolípidos y el colesterol forman las bicapas
lipídicas de las membranas celulares. Los triglicéridos del tejido adiposo recubren y
proporcionan consistencia a los órganos y protegen mecánicamente estructuras o son aislantes
térmicos.
 Función reguladora, hormonal o de comunicación celular. Las vitaminas liposolubles son de
naturaleza lipídica (terpenos, esteroides); las hormonas esteroides regulan el metabolismo y las
funciones de reproducción; los glucolípidos actúan como receptores de membrana; los
eicosanoides poseen un papel destacado en la comunicación celular, inflamación, respuesta
inmune, etc.
 Función transportadora. El transporte de lípidos desde el intestino hasta su lugar de destino se
realiza mediante su emulsión gracias a los ácidos biliares y a las lipoproteínas.
 Función biocatalizadora. En este papel los lípidos favorecen o facilitan las reacciones
químicas que se producen en los seres vivos. Cumplen esta función las vitaminas lipídicas, las
hormonas esteroideas y las prostaglandinas.
 Función térmica. En este papel los lípidos se desempeñan como reguladores térmicos del
organismo, evitando que este pierda calor.
NUCLEÓTIDOS Y ÁCIDOS NUCLEÍCOS

Los nucleótidos son molé
culas orgánicas formadas
por:
• Monosacárido de
cinco carbonos (pentosa)
Ribosa o Desoxiribosa
• Una base nitrogenada. 
• Grupo fosfato.
NUCLEÓTIDOS Y SUS PARTES
Monosacárido
Grupo Fosfato

Bases Nitrogenadas
LOS NUCLEÓTIDOS Y SU FUNCIÓN
BIOLÓGICA
 Los nucleótidos son
los monómeros (bloques
fundamentales) de los ácidos
nucleícos (ADN y ARN) en los
cuales forman cadenas lineales
de miles o millones de
nucleótidos.
  Los ácidos nucleícos
almacenan la información
genética de los organismos
vivos y son los responsables de
la transmisión hereditaria.
Existen dos tipos básicos,
el ADN y el ARN.
II MÓDULO
LEYES Y PRINCIPIOS QUE
RIGEN LAS REACCIONES
BIOQUÍMICAS.
LEYES Y PRINCIPIOS QUE RIGEN LAS
REACCIONES BIOQUÍMICAS.

* Primera ley de la Termodinámica. Ley de la


conservación de la materia y la energía.
* La Entropía.
* Dogma Central de la Biología.
* Modelos de Actividad Enzimática.
LEY DE LA CONSERVACIÓN DE LA
MATERIA Y LA ENERGÍA
La ley de conservación de la masa, ley de
conservación de la materia o ley de
Lomonósov-Lavoisier es una de las leyes
fundamentales en todas las ciencias
naturales. Fue elaborada
independientemente por Mijaíl
Lomonósov en 1745 y por Antoine
Lavoisier en 1785.

Se puede enunciar como «En una reacción


química ordinaria, la masa permanece
constante, es decir, la masa consumida de
los reactivos es igual a la masa obtenida de
los productos»
En palabras simples esta ley dice: “ la
materia y la energía no se crea ni se
Cuando se enunció la ley de la conservación de destruye, solo se transforma…”
la materia no se conocía el átomo, pero, con
los conocimientos actuales es obvio: puesto
que en la reacción química no aparecen ni
destruyen átomos, sino que solo se forman o
rompen enlaces (hay un reordenamiento de
átomos), la masa no puede variar.
ANÉCDOTA GRACIOSA DE LA HISTORIA DE LA
LEY DE LA CONSERVACIÓN DE LA MATERIA Y LA
ENERGÍA
Los ensayos preliminares hechos por Robert Boyle en 1673 parecían indicar lo
contrario: pesada meticulosa de varios metales antes y después de su oxidación
mostraba un notable aumento de peso. Estos experimentos, por supuesto, se
llevaban a cabo en recipientes abiertos.
La combustión, uno de los grandes problemas que tuvo la química del siglo XVIII,
despertó el interés de Antoine Lavoisier porque éste trabajaba en un ensayo sobre
la mejora de las técnicas del alumbrado público de París. Comprobó que al
calentar metales como el estaño y el plomo en recipientes cerrados con una
cantidad limitada de aire, estos se recubrían con una capa de calcinado hasta un
momento determinado del calentamiento, el resultado era igual a la masa antes de
comenzar el proceso. Si el metal había ganado masa al calcinarse, era evidente que
algo del recipiente debía haber perdido la misma cantidad de masa. Ese algo era el
aire. Por tanto, Lavoisier demostró que la calcinación de un metal no era el
resultado de la pérdida del misterioso flogisto, sino la ganancia de algún material:
una parte de aire. La experiencia anterior y otras más realizadas por Lavoisier
pusieron de manifiesto que si se tiene en cuenta todas las sustancias que forman
parte en una reacción química y todos los productos formados, nunca varía la
masa.
SEGUNDA LEY DE LA TERMODINÁMICA
Y LA ENTROPÍA EXPLICADA EN 3
PUNTOS
* 1 Este principio marca la dirección en la
que deben llevarse a cabo los procesos que
involucran transformación energética y, por
lo tanto, la imposibilidad de que ocurran en
el sentido contrario.
Ejemplo una vez que se quema la gasolina se
produce gases y agua, estos gases y agua no
se pueden volver a unir para formar gasolina.
SEGUNDA LEY DE LA TERMODINÁMICA.
LA ENTROPÍA.
* 2 También establece, en algunos casos, la
imposibilidad de convertir completamente toda la
energía de un tipo a otro sin pérdida de energía.

 Ejemplo la Cogeneración: La combustión del biogás


para nuestros fines prácticos es la transformación
de la energía química almacenada en el biogás y
transformarla a energía mecánica (mover los
pistones del cogenerador). Y luego esa energía
mecánica se transforma en energía eléctrica en los
dínamos del cogenerador. En cada paso hay
perdida de energía.
 Nota: este proceso no es totalmente reversible.
Pues respeta el punto anterior.
SEGUNDA LEY DE LA TERMODINÁMICA.
LA ENTROPÍA.

Se almacena
Calor Calor en el agua
caliente que se
re circula

Biogás Movimiento
Electricidad
SEGUNDA LEY DE LA TERMODINÁMICA.
LA ENTROPÍA.
* 3 En los años 1890 - 1900 el físico austríaco Ludwig
Boltzmann  estudio a fondo la entropía, postulando el
tercer punto de la ley de la termodinámica.
Cuando la energía es degradada, los átomos asumen un
estado más desordenado. Y la entropía es un parámetro
del desorden.

Ejemplo:
DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR

El dogma central de la biología molecular es un concepto


que ilustra los mecanismos de transmisión y expresión de
la herencia genética tras el descubrimiento de la
codificación de ésta en la doble hélice del ADN. Esto nos
propone que existe una unidireccionalidad en la expresión
de la información contenida en los genes de una célula, es
decir, que el ADN es transcrito a ARN mensajero y que
éste es traducido a proteína, elemento que finalmente
realiza la acción celular
VIH EXCEPCIÓN AL DOGMA CENTRAL
DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR
PRIONES EXCEPCIÓN AL DOGMA
CENTRAL DE LA BIOLOGÍA
MOLECULAR
Definición: Los priones operan al margen del dogma
central de la biología molecular (un gen se transcribe a
ARNm y se traduce en una proteína). En realidad son
elementos heredables basados en proteínas: los priones
no se perpetúan mediante el cambio de la manera en que
la información genética se transcribe o traduce, sino más
bien actuando directamente en el paso final en la
decodificación de la información genética: el
plegamiento de las proteínas. 

http://medmol.es/glosario/prion/
PRIONES EXCEPCIÓN AL DOGMA
CENTRAL DE LA BIOLOGÍA
MOLECULAR
DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA
MOLECULAR
MODELOS DE ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
Modelo de llave y cerradura
El primer modelo sugerido para explicar la interacción
enzima-sustrato fue propuesto por el químico Emil
Fisher, denominado modelo llave-cerradura, que supone
que la estructura del sustrato y la del sitio activo son
exactamente complementarias, de la misma forma que
una llave encaja en una cerradura.
MODELO DE ENCAJE INDUCIDO
Estudios posteriores
sugirieron que el sitio
activo es mucho más
flexible que una cerradura.
La interacción física entre
las moléculas de enzima y
sustrato produce un cambio
en la geometría del centro
activo, mediante la
distorsión de las superficies
moleculares. Este modelo
llamado encaje
inducido impondría cierta
tensión a las moléculas
reaccionantes, facilitando
aún más la reacción

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