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Enzimas

Ing. C. Mabel Luna


Sistema digestivo
Digestión bucal
Digestión estomacal
Enzimas pancreáticas
Clasificación

1. Oxidorreductasas

2. Transferasas

3. Hidrolasas

4. Liasas

5. Isomerasas

6. Ligasas
Clasificación de enzimas: Grupos
1. Oxidorreductasas: catalizan Rx Redox
2. Transferasas: transfieren grupos funcionales
•grupos aldehidos
•grupos acilos
•grupos glucosilos
•grupos fosfatos (kinasas)

3. Hidrolasas: catalizan Rx. De hidrólisis


•Transforman polímeros en monómeros.
Actuan sobre:
•enlace éster
•enlace glucosídico
•enlace peptídico
•enlace C-N
4. Liasas: rompen enlaces por adición a los dobles
enlaces
•Entre C y C
•Entre C y O
•Entre C y N

5. Isomerasas: reagrupan grupos funcionales

6. Ligasas: Formación de enlaces, con aporte de ATP)


Entre C y O
•Entre C y S
•Entre C y N
•Entre C y C
Clasificación y nomenclatura

Clasificación de enzimas por Grupos

EC 1.x  Oxidorreductasas
EC 2.x  Transferasas
EC 3.x  Hidrolasas
EC 4.x  Liasas
EC 5.x  Isomerasas
EC 6.x  Ligasas
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreducción, en que átomos de
oxigeno ó hidrogeno son trasladados entre moléculas:

Ared + Box Aox + Bred

AH2 + B A + BH2

En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a


la vez el aceptor y el dador electrónico.
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas

Nombre: Dador:Aceptor oxidorreductasa

b-D-Glucosa : O2 1-oxidorreductasa EC 1.1.3.4


Dador Aceptor

Nombre común:
Glucosa oxidasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas:
EC 1.1.x - Deshidrogenasas
EC 1.2.x - Oxidasas
EC 1.3.x - Peroxidasas
EC 1.4.x - Oxigenasas
EC 1.5.x - Hidroxilasas
EC 1.6.x - Reductasas
etc.
Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clínico (glucosa oxidasa y colesterol oxidasa
Deslignificación ó Bioblanqueamiento
Clasificación y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Catalizan reacciones de transferencia de átomos ó
grupo de átomos entre moléculas:

A-X + B A + B-X

Dador: Aceptor Grupo transferido - transferasa

ATP: D-Hexosa Fosfotransferasa EC 2.7.1.1


Nombre común: hexokinasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Clasificación de subgrupo de las transferasas:
EC 2.1.x - Grupos monocarbonados
EC 2.2.x - Grupos aldehido o ceto
EC 2.3.x - Aciltransferasas
EC 2.4.x - Glicosiltransferasas
EC 2.5.x - Alquil- o Ariltransferasas
EC 2.6.x - Grupos nitrogenados
EC 2.7.x - Grupos fosfato
EC 2.8.x - Grupos sulfato
EC 2.9.x - Grupos selenio
Aplicaciones: Síntesis de oligosacáridos
Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Catalizan reacciones de hidrólisis y también su reverso. Son
las más comunes en el dominio de la tecnología enzimática:

A-B + H2O A-OH + H-B

No se suelen utilizar nombres sistemáticos en las


hidrolasas. Muchas de ellas conservan el nombre
Primitivo. Ejemplo: Quimosina EC 3.4.23.4.
Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Clasificación de las hidrolasas:
3.1.-.- Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas)
3.2.-.- Glicosidasas
3.3.-.- Éter hidrolasas
3.4.-.- Péptido hidrolasas
3.5.-.- Acil anhídrido hidrolasas
etc.
Aplicaciones: Lipasas → Síntesis de tensioactivos
Proteasas → Fabrico de quesos
Glicosidasas → Clarificación de jugos; liberación de aromas en los
vinos; aplicaciones textiles
Clasificación y nomenclatura
Grupo 3: Hidrolasas
Caso particular  Péptido hidrolasas: clasificación común (no
sistemática)

I. Según la situación del enlace atacado:


- Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas)
- Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas)
II. Según el mecanismo catalítico:
- Serin proteinasas
- Tiol proteinasas
- Aspartil proteinasas
- Metaloproteinasas
Clasificación y nomenclatura
Grupo 4: Liasas
Catalizan reacciones reversibles de remoción de grupo de
átomos del sustrato (este grupo no incluye las hidrolasas):

A-B A+B
Ejemplo
Nombre sistemático:
Histidina amonio-liasa (EC 4.3.1.3)

Nombre común:
Histidasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 4: Liasas
Clasificación de las liasas:
4.1.x - Actúan sobre enlaces C-C
4.2.x - Actúan sobre enlaces C-O
4.3.x - Actúan sobre enlaces C-N
4.4.x - Actúan sobre enlaces C-S
4.5.x - Actúan sobre enlaces C-Haluro (S-, Cl-, Br-, I- At-)
4.6.x - Actúan sobre enlaces P-O
4.99.x - Otras liases
Aplicaciones: Pectato liasa – Remueve los compuestos indeseables (ceras,
pectinas, proteínas) en fibras en la industria textil – “bioscouring”
Clasificación y nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Catalizan reacciones de isomerización moleculares

A B
Ejemplo:
Glucosa isomerasa (EC 5.3.1.5)
Clasificación y nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Clasificación de las isomerasas:

5.1.x - Rasemasas y Epimerasas


5.2.x - cis-Trans-Isomerasas
5.3.x - Oxidoreductasas Intramolecular
5.4.x - Transferasas Intramoleculares (mutases)
5.5.x - Liasas Intramoleculares
5.99.x - Otras Isomerasas
Clasificación y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Catalizan la unión de dos grupos químicos a expensas
de la hidrólisis de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.).

A + B + ATP A-B + ADP + Pi


Ejemplo: Glutationa sintasa (EC 6.2.2.3)

Nombre sistémico:
G-L-glutamilo-L-cisteina:glicina ligase
Clasificación y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Clasificación de las ligasas:

6.1.x - Forman enlaces C-O


6.2.x - Forman enlaces C-S
6.3.x - Forman enlaces C-N
6.4.x - Forman enlaces C-C
6.5.x - Forman enlaces ésteres fosfóricos
6.6.x - Actúan sobre enlaces N-metal
Reacciones endergónicas y exergónicas
 Una reacción endergónica es una reacción química que necesita o utiliza
energía.
 Fotosíntesis.
 Una reacción que libera energía se conoce como una reacción exergónica.
 Respiración celular.
Energía de activación
 Muchas reacciones exergónicas necesitan calor
(energía) para comenzar.
 Ej.: Combustión de madera.
 Esta energía se conoce como energía de
activación.
 La cantidad de energía de activación es,
generalmente, mucho menor que la energía que libera
la reacción.
 ¿Las células realizan reacciones exergónicas?
 ¿Cómo lo hacen sin sufrir daños?
catalizadores
 Hacen posibles las reacciones,
disminuyendo la cantidad de energía
de activación que se necesita.
 Controlan la velocidad a la que ocurre
la reacción.
 Permiten que las reacciones ocurran a
unas temperaturas que no hagan daño
al organismo.
Enzimas
 Hacen posibles las reacciones,
disminuyendo la cantidad de energía
de activación que se necesita.
 Controlan la velocidad a la que ocurre
la reacción.
 Permiten que las reacciones ocurran a
unas temperaturas que no hagan daño
al organismo.
Enzimas
• Para que ocurra una reacción, además de contar con energía de
activación, ésta debe tener una orientación adecuada.
• Las enzimas poseen un punto específico de unión llamado sitio activo,
que permite la orientación exacta, y un sitio catalítico, que debilita
enlaces existentes o facilita la formación de otros nuevos, según
corresponda.
• Las enzimas son muy sensibles a cambios de factores como pH,
temperatura o concentración de sustrato y operan en márgenes
bastante estrechos.
sustrato

Complejo
enzima-sustrato

productos
ACTIVIDAD ENZIMATICA
Teorías de la Acción Enzimática
Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer)
Substrato y enzima se acoplan de
forma estereospecífica, de la misma
manera que una llave se ajusta a su
cerradura.
Modelo aceptado durante mucho
tiempo; hoy se considera
insuficiente al no explicar algunos
fenómenos de la inhibición
enzimática.
Modelo de Ajuste Inducido (Koshland)

Tanto la enzima como el


substrato sufren una alteración
en su estructura por el hecho
físico de la unión.

Está mucho más de acuerdo


con todos los datos
experimentales conocidos hasta
el momento.
Ejemplo de estructura de una enzima: la quimotripsina , una enzima
digestiva que hidroliza proteínas.

• La estructura primaria de esta enzima


consta de 245 aminoácidos.
• La estructura cuaternaria de consta de
tres cadenas polipeptídicas: a, b y c.
• Los enlaces disulfuro unen las cadenas
a,b y c entre sí.
• Los aminoácidos del Sitio Activo son
tres: His, Asp y Ser.
• De 245 aminoácidos totales, solamente
los grupos R de tres de ellos conforman
el sitio activo de esta enzima.
Modelo espacial de la Quimotripsina
• La enzima tiene un
aspecto globular,
dado por el
plegamiento de las
subunidades a,b y
c.
• El S.A se muestra
en naranja.
• Esta enzima tiene
un solo S.A.
• Las enzimas
pueden tener un
S.A por subunidad.
Un acercamiento al sitio activo
• En detalle pueden
verse los grupos
funcionales de la
enzima que toman
contacto con el
sustrato de la
reacción
PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS
• Las propiedades de las enzimas derivan del hecho de ser proteínas.
• Cambios en la conformación suelen ir asociados en cambios en la
actividad catalítica.
• Los factores que influyen de manera más directa sobre la actividad de un
enzima son:
• pH
• Temperatura
• Concentración de sustrato
• Cofactores
• inhibidores
pH SOBRE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA

• Las enzimas poseen grupos químicos ionizables (carboxilos -COOH;


amino -NH2; tiol -SH, etc.) en las cadenas laterales de sus aminoácidos.
• Según el pH del medio, estos grupos pueden tener carga eléctrica
positiva, negativa o neutra.
• Como la conformación de las proteínas depende, en parte, de sus cargas
eléctricas, habrá un pH en el cual la conformación será la más adecuada
para la actividad catalítica. Este es el llamado pH óptimo.
TEMPERATURA SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
• La temperatura a la cual la actividad catalítica es máxima se llama
temperatura óptima. Por encima de esta temperatura, el aumento de
velocidad de la reacción (actividad enzimática) decrece rápidamente hasta
anularse.
COFACTORES SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA
• Cofactores:
Sustancias no proteicas que colaboran en la catálisis.
• Pueden ser iones inorgánicos como el Fe++, Mg++, Mn++,
Zn++, etc. Cuando el cofactor es una molécula orgánica se
llama coenzima.
CONCENTRACIONES SOBRE LA
ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
• La Figura muestra la velocidad de una reacción enzimática a 6
concentraciones distintas de sustrato.
• Además, la presencia de los productos finales puede hacer que la
reacción sea más lenta, o incluso invertir su sentido
INHIBIDORES SOBRE LA ACTIVIDAD
ENZIMÁTICA

• Estos inhibidores bien pueden ocupar temporalmente el centro


activo por semejanza estructural con el sustrato original
(inhibidor competitivo) o bien alteran la conformación espacial
del enzima, impidiendo su unión al sustrato (inhibidor no
competitivo) .
Inhibidor:
Efector que hace disminuir la actividad enzimática, a través de
interacciones con el centro activo u otros centros específicos
(alostéricos).

Esta definición excluye todos aquellos agentes que inactivan a


la enzima a través de desnaturalización de la molécula enzimática

De esta forma, habrá dos tipos de inhibidores:

I. Isostéricos: ejercen su acción sobre el centro activo

II. Alostéricos: ejercen su acción sobre otra parte de la


molécula, causando un cambio conformacional con
repercusión negativa en la actividad enzimática.
Los inhibidores isostéricos pueden ser de dos tipos:

1. Inhibidor reversible: establece un equilibrio con la enzima libre,


con el complejo enzima-substrato o con ambos:

E+I EI

ES + I ESI

2. Inhibidor irreversible: modifica químicamente a la enzima:


E+I E’
Inhibición reversible

(a) El inhibidor se fija al centro activo de la enzima libre,


impidiendo la fijación del substrato: Inhibición Competitiva

(b) El inhibidor se fija a la enzima independientemente de que lo


haga o no el substrato; el inhibidor, por tanto, no impide la
fijación del substrato a la enzima, pero sí impide la acción
catalítica: Inhibición No Competitiva

(c) El inhibidor se fija únicamente al complejo enzima-substrato


una vez formado, impidindo la acción catalítica; este tipo
se conoce como Inhibición Anticompetitiva
Inhibición competitiva
Al aumentar la cantidad
de SUSTRATO el
inhibidor competitivo es
desplazado y se forma
producto
Inhibidor No Competitivo
• Se une a un lugar diferente del sitio activo la enzima
• Se une a la enzima libre y también al complejo enzima-sustrato
• Por acción del inhibidor disminuye la Vm pero el valor de Km no se
altera
Inhibidor Incompetitivo
• Se une a un lugar diferente del sitio activo de la enzima
• Se une sólo al complejo enzima-sustrato
• Los efectos que tiene: disminuye el valor de Km y también el de Vmáx
S
E ES E+P
I
Inhibición
Anticompetitiva
ESI

El inhibidor sólo puede fijarse al complejo ES;


el complejo ESI no es productivo
Inhibidores Irreversibles
• Producen inactivación permanente de la actividad enzimática
• Se interfiere con el normal desarrollo de una reacción o vía
metabólica
• Ejemplos:p-cloromercuribenzoato,yodoacetato, iisopropilfluorfosfato
Algunos tipos de inhibidores irreversibles

1. Reactivos de grupos -SH

2. Organofosfóricos

3. Ligandos de metales

4. Metales pesados
Enzimas alostéricas
• Las enzimas alostéricas presentan
estructura cuaternaria.
• Tienen diferentes sitios activos,
unen mas de una molécula de
sustrato
• La unión del sustrato es
cooperativa
• la curva de velocidad presenta
una forma sigmoidal
Desnaturalización de una Proteína

Estado Nativo Estado Desnaturalizado


Se llama desnaturalización de las proteínas a la pérdida de las
estructuras de orden superior (secundaria, terciaria y
cuaternaria), quedando la cadena polipeptídica reducida a un
polímero estadístico sin ninguna estructura tridimensional fija
Desnaturalización de la
ribonucleasa. En general, la
desnaturalización fuerte produce
una destrucción permanente de
la molécula

Agentes desnaturalizantes: Se distinguen


agentes físicos (calor) y químicos
(detergentes, disolventes orgánicos, pH,
fuerza iónica).
Enzimas y coenzimas
• Una enzima recibe el nombre del sustrato sobre el cual actúa.
• A una parte del nombre del sustrato se le añade el sufijo –asa. ¿Cuál será el
sustrato de una proteasa?
• En algunas reacciones, pequeñas moléculas, llamadas coenzimas, se unen a las
enzimas para controlar las reacciones.
• Las coenzimas no son proteínas y no sufren cambios durante las reacciones.
• Algunas vitaminas son coenzimas. B1, B2, B6, K.
• Una reacción no ocurrirá si la coenzima no está presente.
Cofactores enzimáticos
Algunas enzimas necesitan para llevar a cabo su actividad catalítica de la
concurrencia de una o más sustancias de naturaleza no proteica que reciben el
nombre de cofactores.
En ausencia de cofactor el enzima resulta catalíticamente inactivo y recibe el nombre
de apoenzima; la combinación de apoenzima y cofactor da el holoenzima
catalíticamente activo. Existen dos tipos de cofactores enzimáticos: los iones metálicos
y los coenzimas.
Coenzimas
• Las coenzimas son pequeñas moléculas orgánicas, que se unen a la
enzima.
• Las coenzimas colaboran en la reacción enzimática recibiendo
transitoriamente algún grupo químico: H+ , OH, CH3 .
• La enzima sin la coenzima recibe el nombre de APOENZIMA
El NAD es una coenzima aceptora de H

Sustrato
oxidado
Aproximadamente 1/3 enzimas requiere algún
ión metálico para catalizar
Algunas enzimas requieren metales para mejorar su actividad
Algunas aplicaciones
Otros procesos biológicos

► Biogénesis o biomineralización.

Es la formación de minerales en suelos


a partir de sus componentes por acción
bacteriana
► Biocorrosión.

Es la degradación de metales y
materiales por acción bacteriana.
Drenajes ácidos de minas
En el futuro……………..
• Es claro que la amplia variedad de reacciones que pueden
catalizar las enzimas prevé un panorama prometedor para
la biocatálisis en el sector de la síntesis orgánica,
calculándose que en los próximos años su impacto en este
sector industrial se verá incrementado de manera
significativa.
• Sin embargo, un factor clave a considerar en la
consolidación de los biocatalizadores como herramientas
de síntesis, es un aumento considerable en su eficiencia y
disponibilidad. Para esto, el uso de las herramientas
modernas de la biología molecular y de la ingeniería de
proteínas deberá jugar un papel preponderante en la
obtención de nuevos y más eficientes biocatalizadores.

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